2DIYA

The solution structure of the thioredoxin domain of human thioredoxin-like protein 2
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
GSSGSSGMAAGAAEAAVAAVEEVGSAGQFEELLRLKAKSLLVVHFWAPWAPQCAQMNEVMAELAKELPQVSFVKLEAEGVPEVSEKYEISSVPTFLFFKNSQKIDRLDGAHAPELTKKVQRHASSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The solution structure of the thioredoxin domain of human Thioredoxin-like protein 2
rcsb
molecule keywords Thioredoxin-like protein 2
molecule tags Protein binding
source organism Homo sapiens
total genus 27
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2diyA01
1MD3A 4KDYA 5DQSA 3F63A 3HDCA 5H5SA 5ECQB 3LGCA 1Z6MA 4IHUA 2KOKA 3H8QA 3UJ1A 5IMAA 1TI1A 3C71A 4TXOB 2OADA 3G9BA 1SL0B 3HVXA 3O6TA 3FHKA 3LFLA 2RM6A 1FG4A 2YPMA 4LA1A 2OBIA 4TRXA 1GSEA 1MEKA 2VM1A 4IS0A 3F4SA 2GS3A 4PGTA 2LS5A 4GQFA 5EL8A 1PX6A 4EE0A 2FNOA 1O7UA 3L9VA 3KGKA 2I81A 3VK9A 4X1UA 3VPTA 2WCIA 1V2AA 1S3AA 3LJRA 5D8IA 3UL3A 2YV9A 10GSA 4I5QA 3GX8A 3ME8A 4TOPA 5ELAA 2P31A 4O92A 3UAPA 2K8SA 3QFBC 2ZNMA 2JZRA 4EXJA 1VF2A 3K8NA 1QGVA 4HU9A 2JSYA 4V2NA 4ECIA 4OD7A 1SD8A 1MDJA 4X43A 1XBSA 3IPZA 5A4VA 3RHCA 4NHZA 1WP0A 4KDUA 4NHWA 4GCIA 3ZREA 2C4JA 3IR4A 4DEJA 3F4TA 4GTUA 3D5JA 2NBSA 3DKSA 4OMVA 1GSQA 3G7IA 1V98A 4MZBA 3PINA 3L9SA 4K7NA 4ACSA 4AJ7A 5ECRB 1SJZA 4H86A 3RPNA 4MH3A 3KM6A 4WBJA 2ZUPA 1OC9B 4L5OA 4Q5FA 2TIRA 3CTFA 3M3MA 5IO0A 2X99A 4XCSA 1DE2A 1ERWA 4CW9A 2AYTA 4KW6A 1FAAA 3DD3A 4MJBA 3MWHA 2PGTA 4PXOA 1PKZA 3IBHA 5D73A 3IK7A 5ID2B 2MBSA 4YAPA 5J5NA 3VWVA 3O76A 4GLTA 3HXSA 1G6YA 13GSA 4MDCA 5J41A 1EV4A 3IAM2 3FR3A 3GSTA 4IQ1A 5ECHB 3TDGA 1VF4A 2IJYA 3M8NA 3KEBA 5JWOB 1OKTA 1PX7A 1SD9A 2R6KA 4MJEA 3U5RE 2FWHA 3H79A 3EVIA 2VL2C 1TOFA 4E8EA 2C0FA 1M0UA 3GIXA 3GA4A 3ZVJA 2GQMA 1URMA 1Z5YE 2VD1A 2YV7A 3GTUA 2X8GA 3APSA 2D2ZA 2LJRA 5F05A 4AJ8A 2YWOA 4ECCA 4HQZA 4WXTA 4NV2A 3C73A 1FVJA 1GUMA 1NSWA 4OFMA 4J2FA 1OC3A 4OFTA 1DE1A 5A5KA 3KP8A 1SJIA 2V32A 4OWYA 3GKXA 3HVVA 3R2QA 1RQMA 1O81A 1SJ6A 1SK0A 2H19A 4O5RA 6GSXA 2VUPA 4E8HA 1V58A 2VCQA 3GN3A 1A2LA 4K0NA 3ZFLA 2I1UA 2B1LA 4LMWA 3BCKA 4PQ1A 3F4RA 3ED3A 5E59A 1ERTA 1G6WA 1GSFA 1XW5A 3TKSE 2KP2A 6GSUA 2YNXA 1DBYA 2PVQA 2B7KA 5CRWA 3WYWA 4HJ2A 4KUNA 2MMZA 2X8CA 1S3DA 3KZQA 5ECNB 1TU8A 3U6VA 2TRXA 5CRGA 2HRNA 3D4TA 1AQWA 2VCVA 4I97A 2R5GA 18GSA 3GMFA 2P5QA 3DXBA 2MMNA 1LJRA 4XTSA 3BCIA 5CO3A 1B4QA 4YQUA 2GDRA 1ZMAA 2B5XA 1YF1A 3HY2A 1X5EA 2NDOA 3KH9A 3MAKA 1TK0B 3VWUA 2CVDA 3EC3A 2AAWA 3D21A 2YWMA 2FGXA 3EU4A 4AJ6A 3JCML 2I3YA 3APQA 2R37A 1BQ7A 1YKCA 1U87A 1EOHA 5AISA 4HOJA 2IMDA 4YH2A 2EIRA 4EC0A 2WULA 1EV9A 5IOWA 2H6YA 2C80A 2VO4A 2K6VA 4YAVA 1K0BA 5KN3A 5CP1A 2PMTA 2DJ1A 6GSWA 4HDEA 2VD0A 2AV4A 3LYPA 1SENA 1K3YA 3GX0A 3TB2A 2DIYA 5ECMB 4NPBA 2PU9C 3CSHA 4V2LA 4MZWA 2JACA 1K3OA 3LWAA 4DSSA 1SYRA 2XPEA 3OR5A 2CQ9A 1NM3A 1OYJA 3EMPA 5D9XA 2XC2A 2FY6A 6GSSA 3H1NA 2DJ3A 3LEFA 1T1VA 2BJXA 3A2VA 2H8LA 1XOAA 2XBQA 4ECJA 3A5WA 3IV4A 1ILOA 2C3QA 3S9FA 4GSNA 3TJKA 2JADA 3F9UA 4N10A 3ZTLA 1F3BA 2LRCA 1KBNA 1WIKA 5DVBA 4KSOA 4XS4B 12GSA 1M2DA 5B8AA 2F8AA 3TKSA 2DIZA 4QL9A 4KE3A 3FRCA 4IJ3A 4ZB9A 3FK8A 5EY6A 1QFNA 4BVYA 2V1MA 1FVKA 3KIJA 1XXUA 4KGIA 5DAKA 1AQXA 5HR2A 1EGOA 5JWRB 2V41A 4DVCA 2RUFA 3FKFA 1SKRB 3SBCA 1TW9A 1YJ6A 1USBA 1A0FA 4ML6A 1O85A 2JZSA 3NOFA 4DSQA 5ECSA 5COHA 4EKZA 1YEXA 2LV3A 3GH9A 3IE3A 1J0FA 4Q5RA 1E6BA 5CRHA 1GUKA 2IWTA 2GZYA 3APOA 3VWWA 4TR3A 4NMUA 3KP9A 2REMA 4WR5A 4RUVA 1XOBA 2K8VA 1T4YA 1IYIA 1N8JA 2LUSA 3CRUA 1FW1A 2HLSA 4FYUA 1SK2A 2VL3A 2PERA 4IP6A 1X0RA 3US3A 2PN8A 1I5GA 2CAQA 1JZDA 2KP1A 1PQNA 1ZCPA 2L5LA 3M9KA 1ERUA 4JBBA 2L4CA 4ZXGA 3CMIA 3WGEA 4LL1B 2OKAA 4FO5A 5D93A 1PGTA 2YP6A 1TRWA 1MD4A 3ZMLA 2PUKC 3ZLPA 3UIWA 3WD6A 3GKMA 2H1GA 2N5BA 1NHOA 1JZOA 1XWBA 3UVHA 3ZFBA 2C1YA 1WWJA 2C8UA 3L4NA 4IJIA 2WDUA 1QK8A 2YOIA 2GSSA 3CSJA 3HZ4A 1KNGA 1V9WA 1Z9HA 1TP9A 4F2IA 3LSZA 3F3QA 4PURA 5ECLB 4MP4A 4G2EA 5IM9A 2WZ9A 1C72A 4JU5A 3W6GA 1X9MB 2CT6A 5J3RA 2DJJA 4HEA2 3SWLA 1AQVA 4QQ7A 1BAYA 4PNFA 5HR0A 3BD2A 4KAEA 4CHSA 1XWCA 2QSIA 3HD5A 1RW1A 1R7HA 3I43A 3UOMA 1X5DA 3VFIA 1EEMA 3BOAA 1OVNA 5G5FA 4I2TA 3TKRA 1VRSD 2QC7A 1PL1A 1F9MA 3PGTA 1O8WA 3KD0A 3F6DA 4LL4B 4X0XA 2I4AA 2HZFA 9GSSA 3RHBA 2H75A 4MF6A 1XW6A 2YJ7A 2GQLA 5CYYA 2AUVA 3TOUA 3RAZA 1TXXA 2HZEA 3KMOA 1XVQA 4HJMA 3TGZA 4GF0A 3UARA 2CX3A 4G9HA 3RDWA 2LTKA 3E3EA 2O85A 2IN3A 3DIEA 2N5FA 3A2WA 3TJJA 1JZRA 3A3TA 2H73A 5HFGA 3VI5A 4OO5A 5HR3A 1THOA 2ALBA 3O3TA 3HKRA 1EWXA 1TRSA 1G0TA 1B48A 4XIHA 1MTCA 3HJPA 3KTBA 1GTUA 3CBUA 4JE1A 3QD9A 3EMXA 2R2JA 1K0OA 4HS1A 1WPIA 4K2DA 3TKPA 5G1LA 1JLVA 3KMNA 2C0GA 3EU3A 4DSRA 4NWYA 1ZZYA 1VF1A 2XBIA 2J23A 2O7KA 4O32A 5AIVA 1YDKA 3ZVJD 5DALA 2VLTA 1HNCA 3KTLA 3IRAA 1PL2A 1TDIA 2YZUA 3GNJA 2RLIA 1OC9A 2IL3A 2H6XA 2IFQB 4HU7A 5ELGA 3E9JB 4WEYA 2L6DA 1A8LA 1BYEA 3FY7A 2FA8A 1U6TA 1VF3A 3WT2A 1GSYA 4TR1A 4I6XA 4BWQA 2NPBA 2VM2A 4N0VA 3P7XA 2GT5A 1GULA 5GZZB 5ID2A 2X8HA 5D9WA 1F3AA 3NIVA 2LQQA 2PVOC 2F9SA 1K0MA 5F07A 2RIIA 2FWEA 3TJFA 1YEPA 2LEGA 2YJHA 2WJUA 4TR0A 1HNAA 2HYXA 3UEMA 3FEUA 4K9ZA 2HSHA 1XWKA 1Z6NA 1FO5A 2ON7A 4MH2A 3LG6A 5FWGA 2VAFA 4HZ4A 4K7IA 1CQHA 2PWJA 2WRTA 2R3XA 4L0UA 1G7OA 3GRXA 3IAS2 2N5AA 2H01A 4FYBA 1QQ2A 3I69A 2Z9SA 1GSUA 4IGJA 3DEXA 19GSA 1WMJA 3IDVA 1JHBA 4QL7A 3PH9A 2JL4A 2YN1A 4OCEA 1I9DA 1K0CA 2VCWA 1PKWA 4ZL9A 4L8EA 2GSTA 4Q5QA 4FH8A 4FYCA 5IMCA 1GNEA 1THXA 2B5YA 5C04A 3ZITA 3CRTA 2VL2A 2YWIA 1LU4A 2VLUA 2CVBA 1W4VA 4D73B 5H5RA 2C3NA 2M80A 4AF2A 4ID0A 4IKHA 2OBKA 3M9JA 1EZKA 5G1KA 4HZ2A 2AB6A 1PSQA 2IMFA 1XWAA 2C0DA 4WF4A 4POBA 4WBRD 3QDNA 2C3TA 1T00A 4WR4A 5HFKA 2OJLA 5CREA 2MYGA 1ZYQB 2O8VB 5FT3A 2E7PA 11GSA 1F2EA 2GZPA 5D9TA 4BPYA 1X5CA 2VIMA 3ISOA 1RK4A 2YWNA 4F0CA 4ZIJA 3QPMA 3NZNA 3QAWA 2DJKA 3RBTA 3GURA 3KXOA 4JR6A 3GHAA 2F8FA 3TRQA 3HVSA 1TU7A 4IP1A 2H0GA 5DJLA 2ZCTA 1GUHA 5ENUA 4DSSB 2H0HA 4POLA 2VL9A 1O8XA 1OC8A 2H6ZA 1XZOA 3M1GA 5GAPD 3A2XA 4NAXA 5GSTA 4TN8A 2DMLA 4K7OA 20GSA 5J9BA 1Z3EA 1OE8A 4MF7A 5JWQB 1ON4A 1QMVA 3LXTA 3QOUA 1EGRA 3BJ5A 4JZQA 4POMA 17GSA 5IMZA 4HI7A 3C1SA 4PNGA 2F3MA 4KH7A 1UA5A 1ZL9A 3P90A 4WETA 4IVFA 4MLYA 2DMMA 1A23A 1T7PB 3LQ7A 5DBQA 3EINA 4ZBAA 3DMLA 3DRNA 3E0UA 1GTAA 1Z7RA 2H72A 5D9VA 1XFLA 4ML1A 2LKUA 3M0FA 5DDLA 1BEDA 2IIYA 4I2UA 2YZHA 3GFKA 1K3LA 2E0QA 4XS1A 1UN2A 1MDIA 3WT1A 2LNSA 3GYKA 3QAGA 4V1Ap 5JCUA 2H1BA 4MA9A 4PUAA 2JZTA 3QR6A 4MJAA 3GL3A 4PQHA 2FWFA 1XW9A 3VLNA 4J56E 3GV1A 2B5EA 2O87A 4KA0A 1SU9A 4POKA 5F0GA 2EC4A 1WRYA 4GXZA 1TK8B 3ZIJA 6GSYA 1WJKA 1WOUA 3ZZXA 3C7MA 4KCAA 2OE1A 3F8UA 5INYA 2YANA 1KTEA 2L6CA 2IPAA 2DLXA 2L57A 1BJXA 2M46A 4TW5A 1M9BA 1LBKA 3N5OA 1N2AA 1AAZA 2FLSA 3FR6A 3IHQA 1O6JA 4RQXA 2G2QA 1ACVA 3Q74A 2V2GA 4Q5NA 2PBJA 3CYNA 3AY8A 1JFUA 4WKWA 4YQMA 5E4WA 4Z7XA 3FYGA 2V6OA 5ABRA 2A2RA 3VI7A 1M7TA 5KN0A 5B7CA 2OACA 1M99A 1VGLA 2A2SA 2EIQA 4GRFA 1T3BA 1TKDB 1EOGA 4N30A 5C00A 1SL2B 1Q4JA 2WB9A 1TRVA 2GTUA 1EP7A 2AHEA 4KCEA 2GZZA 4GSTA 1GLPA 4CDOA 3D0ZA 4JEDA 4NV5A 3Q18A 4KNDA 4N0ZA 3LORA 2DJ0A 4KB3A 4EL1A 1SYXA 2VLVA 4RI7A 1XIYA 1ML6A 1V40A 1M2AA 4F03A 2QKEA 1J9BA 2CX4A 1X9SB 4I8BA 4ZL7A 1JLWA 3TOTA 2ES7A 1AW9A 3LYKA 2NVLA 5JCWA 2GVPA 3CSIA 3F0IA 2EIOA 3MNGA 5F06A 3W8SA 3QCPA 3HYPA 3H4KA 3CXGA 4JR4A 5LCZA 2HT9A 1Z7PA 1ST9A 3KJYA 3P2AA 5A4UA 4TKYA 5IMVA 5GAND 2H71A 4G10A 3TRXA 1OE7A 3I6AA 16GSA 5CAXA 2DSAA 3ZIVA 1QUWA 2CAIA 1M2BA 3J7Yb 2FUG2 4G19A 3KCMA 3G7JA 3TJBA 4IELA 1YKAA 3IK9A 1JZWA 4TXOA 3HCZA 7GSSA 2VCZA 1S3CA 1K0AA 2J9HA 2HZEB 4FIWA 1Q98A 5IPGA 2IMKA 2HNLA 3D6IA 2XHFA 1J08A 1FB6A 1SK1A 5DJMA 1O73A 5AN1A 3WGXA 3GUSA 4MK3A 2HI7A 1GH2A 1GP1A 4BVXA 3HHVA 4BA7A 2E2MA 1GRXA 2DJ2A 3G7YA 4F9ZA 1HQOA 3GKKA 1K0DA 3KH7A 1PRXA 1A8YA 4K1FA 5LNKe 5JCGA 5J4UA 3ME7A 5HQPA 1DSBA 1YQ1A 5DALB 2AJQB 5G31A 3MSZA 2CA8A 2DBCA 4ZB8A 1R5PA 2ON5A 3UMAA 3HZ8A 2C0EA 1T4ZA 1GLQA 1EP8A 1TK5B 4WF5A 1SKSB 5FHIA 4TR1B 1U88A 2L5OA 2H30A 3D4MA 3FZ4A 4KX4A 2H0IA 2KHPA 1G7EA 3F6FA 3UBLA 1KEBA 2L4QA 2B6MA 3GTUB 4GSSA 1ZOFA 3LXZA 3DWVA 4MMMA 2LJAA 2MZCA 2FCHA 3ZYWA 4F0BA 5J9CA 3GKNA 5KN1A 1XWGA 1R4WA 1H4OA 4BL7A 1U3IA 4EF0A 5IIZA 4K6XA 3TRPA 2H76A 5CRDA 1TRUA 5B6NA 3GL5A 2G0FA 1XVWA 1GSDA 1GTIA 2MMAA 4EDYA 5H5QA 5HFIA 3UVTA 1W89A 1B4PA 2BMXA 2H1DA 2JSZA 5EPFA 3PR8A 3QAVA 3DYRA 4L5LA 5CNWA 1XCCA 4XRDA 4MPFA 1EEJA 3IC4A 2M72A 2GT6A 1MDKA 3GH6A 3CTGA 1Y6EA 2HRFA 2QGVA 4IBPA 22GSA 2H66A 1A0RP 14GSA 2IFQA 4O7HA 1AUCA 4BWSA 5B6MA 3VPQA 5IMFA 2O89A 3HA9A 1Y25A 4IN0A 5IO2A 1GSSA 4IW9A 2H74A 3ERWA 2WS2A 1X9WB 3QFAC 3W8JA 4J57E 2H1AA 5EVOA 2R4VA 1GTBA 1T8EB 2LSTA 2V6KA 2HSYA 3Q19A 2LRNA 4IQAA 4EDZA 3EWLA 3L78A 1TTZA 2OE3A 2VCTA 4N11A 3L9UA 2B7JA 1GL8A 3FZAA 3TJGA 1AC1A 1NW2A 4XHMA 1F37A 4ZBBA 2HXKA 2K18A 3ERFA 1B8XA 4LMVA 1FB0A 3ERGA 4XS6A 2OE0A 3MDKA 2KUCA 4RI6A 4ULXA 1ZYEA 2GSRA 2GLRA 3ZMKA 1GWCA 1DUGA 5IMDA 3TCOA 1HYUA 3FZ9A 2VOCA 3C1RA 4EUYA 4P3YB 2H70A 2HFDA 2CVKA 5ECIB 2BTOT 2MMOA 5AGYA 5B8BA 1H75A 1FHEA 1NHYA 5ECPB 5A4WA 2I9HA 3VURA 3HJOA 1R5AA 3IA1A 2TRCP 1FOVA 4D73A 4MPGA 4OO4A 1U3AA 4GQCA 1K0NA 4ILFA 1SKWB 5IOXA 4MABA 1SL1B 4K8MA 4L0WA 1ZGNA 2LRTA 2FD3A 1BG5A 4KDXA 4ZB6A 2PPTA 3IXRA 4XRAA 3TKSC 4F82A 2P5RA 4GWRA 1PN9A 5L71A 4OFNA 4PUFC 2FA4A 4MZCA 5GSSA 1AIUA 5G30A 2VCXA 2WFCA 5HR1A 1GNWA 3QMXA 2LNTA 3UBKA 3Q6OA 1YZXA 5ECKB 3RPPA 2F51A 2RM5A 4RQRA 1M9AA 4AGSA 3FZ5A 3V1WA 5G2ZA 3IOSA 4ZBDA 2HE3A 3H93A 1TJDA 5F8BA 1E2YA 1HD2A 1V57A 1OAZA 3ZRDA 2K9FA 4HUAA 2OA7A 1YF0A 3DGQA 1PMTA 2IMEA 1XPVA 8GSSA 2B3SA 5AIXA 3GSSA 2WGRA 3FW2A 3EYTA 5LD0A 1F6MC 5DAKB 1B9XC 3P8WA 3BBYA 2GQKA 1BX9A 4KSMA 3J7Yk 2LQOA 2P0GA 1YY7A 2JU5A 1A24A 4JRRA 4LLRA 1R26A 3HJMA 3WGDA 4PX1A 6GSTA 3D22A 4TVEA 1UVZA 1CQGA 4YQVA 3C8EA 1A2MA 2FHEA 5KEJA 5DCHA 2GSQA 1OKDA 3N9JA 4ZL8A 3I9V2 4ISDA 4TXVA 1IYHA 4MF5A 2L59A 1AXDA 4PQIA 5D96A 5DCGA 1ABAA 3DVWA 3EURA 4EO3A 3ZL5A 5ECOB 4ZILA 6GSVA 2MBTA 4V1Ag 4TR4A 3VWXA 2E2GA 3FR9A 2LJKA 4EVMA 4ECBA 4OCFA 2CZ2A 5IPHA 2RUEA 4XS4A 1WE0A 4MJCA 2X64A 3F3RA 2YCDA 1B9YC 2CV4A 5DQYA 1QXHA 3TUEA 1PA3A 4NXIA 1UC7A 4K0GA 2A4VA 2CZ3A 5IQYA 4HQSA 3TKQA 1HNBA 1A2JA 2XPDA 2GGTA 3EE2A 3L0HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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