2DMLA

The solution structure of the first thioredoxin domain of mouse protein disulfide-isomerase a6
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
GSSGSSGAVSGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDGLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKAATALKDVVKVGAVNADKHQSLGGQYGVQGFPTIKIFGANKNKPEDYQGGRTGEAIVDAALSALRSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The solution structure of the first thioredoxin domain of mouse Protein disulfide-isomerase A6
rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A6
molecule tags Isomerase
source organism Mus musculus
total genus 24
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2006-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2dmlA01
1DE1A 1ZOFA 1ML6A 2FCHA 4KX4A 3TRXA 2IFQA 5A4UA 1HNCA 3ZMKA 1U6TA 4HUAA 2CX3A 5CRHA 3KD0A 1GULA 1LBKA 4Q5NA 1B9XC 5CRWA 7GSSA 2R37A 3KGKA 5LNKe 4MABA 2X8CA 1TOFA 3KTBA 3TJFA 3IHQA 1G6WA 4NAXA 3VWUA 3HKRA 3D22A 2WGRA 3HVXA 4HQZA 4MH3A 2C1YA 4IELA 2H1DA 3HDCA 2LTKA 5CRDA 4EDYA 1OYJA 4WBRD 1XBSA 1X9MB 4KDXA 3MWHA 3J7Yb 1HQOA 2HSHA 1GSUA 5J5NA 3L9UA 4YAVA 3P90A 3GURA 3NZNA 3FK8A 2AB6A 3F8UA 4IHUA 1A24A 2C80A 2E2GA 3UVTA 4V2MA 1A2JA 5DQYA 1M9AA 4J57E 4TXVA 4ZBDA 2YANA 3CYNA 3O76A 4WEYA 4HJMA 5AN1A 2DJ3A 1B4QA 4K1FA 4XS6A 2LNSA 3LSZA 1JZWA 2RLIA 3G7IA 1OE8A 4O5RA 2YNXA 4EF0A 1FAAA 5ECQB 4ECJA 3L78A 4ZB6A 1EP7A 2RUFA 1X5EA 2PUKC 1M9BA 2H6YA 5AIVA 5HFIA 3UL3A 2ON5A 5G2ZA 4MH2A 5IOWA 2H6ZA 2RUEA 2O85A 2TRXA 1JFUA 1K0NA 1GLQA 16GSA 2FUG2 1Z6MA 2HRNA 1SJZA 4EUYA 2MBSA 3VK9A 3F9UA 1GSSA 3M3MA 4Z7XA 5ID2A 4AF2A 1XCCA 5A4VA 3M1GA 4WKWA 6GSYA 5B7CA 2JADA 2FWGA 1K3YA 2H1AA 3C7MA 5B8BA 4FIWA 1K0DA 5JCUA 1DUGA 5ECPB 5G5EA 2YPMA 2XPEA 4IS0A 4V2NA 1WE0A 3GA4A 3RHBA 1ILOA 4O32A 3EVIA 4LL4B 2H72A 1G7EA 2N5AA 6GSXA 3LORA 3W8JA 4MJAA 4NV2A 2YWIA 5INYA 4MF7A 2IWTA 2E2MA 1OC9B 2WDUA 3QAVA 1K0OA 4MJEA 3ZFBA 4WF4A 4NWYA 3GNJA 2DLXA 5EL8A 4K0GA 2DJKA 2VL2A 2LUSA 4DSSB 3WGEA 2KOKA 1XOAA 3RBTA 4G2EA 4K7IA 5JWRB 4EE0A 3FR9A 4O7HA 4O92A 3BCKA 4GTUA 3D6IA 3GHAA 3NIVA 3H1NA 2J23A 4TR4A 4ILFA 3F3RA 5HFKA 4XCSA 3IAM2 1U87A 2PWJA 4MLYA 4YAPA 4Q5FA 2NDOA 3ZIVA 1O81A 4BL7A 1PN9A 1ACVA 2ZCTA 1PGTA 4I6XA 5DCGA 1ZL9A 5H5QA 3S9FA 4MF5A 1XW9A 4PUAA 1A0RP 3ZL5A 1YF1A 2B3SA 2FA8A 3TJJA 5HR0A 2BJXA 2M72A 3SBCA 1V98A 4JZQA 2B1KA 4N0VA 2JL4A 1THXA 2P5RA 1GL8A 3LYKA 3FRCA 3KXOA 2H6XA 3TRQA 2L6DA 4RI6A 4ACSA 2AV4A 2G0FA 3LQ7A 4KCAA 3ISOA 4DVCA 1Z6NA 3CSHA 3KP9A 2K18A 2FD3A 1U88A 3HY2A 4EDZA 2H73A 3GX8A 1AAZA 1KEBA 5JCGA 1VRSD 2ES7A 1TK5B 1QUWA 4ML6A 3IR4A 2HE3A 1OKDA 2CAQA 3D4TA 1JHBA 2EIQA 1GWCA 4V1Ag 1MDJA 3KMNA 4K6XA 3N5OA 1DBYA 4TKYA 3DKSA 2C0FA 1TU8A 5IMFA 4F2IA 2I3YA 1URMA 4PNGA 1PQNA 1RQMA 2L4QA 2DIYA 3C1RA 1JZOA 2YZUA 5EY6A 1B4PA 2IMDA 4TXOA 4EC0A 3ME8A 2VCZA 3P2AA 4KH7A 1A2MA 3GYKA 1W89A 3U5RE 5JCWA 4MK3A 2F8FA 4F82A 2HSYA 5AISA 1O8XA 2I4AA 3E9JB 3Q18A 2L4CA 2P0GA 3EYTA 4TR1A 3RDWA 2PVQA 1BEDA 20GSA 8GSSA 1GUMA 2IMFA 1M0UA 4IP1A 3GSTA 2YV9A 5GAPD 4OCEA 1FOVA 2LV3A 3IRAA 2H1BA 3DVXA 4EO3A 2RM5A 4KAEA 1KNGA 2REMA 3TJBA 3GRXA 2VCWA 3F63A 1PA3A 2VAFA 2CAIA 2IL3A 3I43A 2DJ2A 1F9MA 4HZ4A 2F8AA 3BD2A 3HVVA 4KW6A 5J41A 2V32A 5DAKA 2CX4A 6GSWA 2OE3A 3UVHA 1E2YA 4K0NA 1AQXA 2L5OA 2P5QA 1A2LA 5IMAA 3Q74A 1ST9A 2C0GA 4IQ1A 1UN2A 3HJOA 6GSSA 4OCFA 5IMCA 3LFLA 2LS5A 1YKAA 2VCVA 1QMVA 5AGYA 1YEPA 3CSIA 2FY6A 1SJ6A 2MZCA 1HNBA 5DJMA 4AJ8A 1XW6A 4XS4A 1N2AA 5L71A 2K8SA 4KA0A 5IMDA 3I9V2 1M2AA 2YWOA 3C71A 3TKQA 2F51A 4K7NA 3P7XA 3GH9A 1SENA 2ZUPA 3UEMA 1NM3A 4MJCA 3UOMA 2HZEB 2VUPA 3NOFA 4KNDA 2V2GA 2B5EA 1PD21 3HD5A 5ECRB 1G7OA 4X43A 3F4TA 4P3YB 4AJ7A 2IMIA 4KDYA 4KUNA 2L57A 3TKSE 3HJPA 3EWLA 2VCXA 2GQMA 3O6TA 3FR3A 2WFCA 1O8WA 4CDOA 3QAWA 2M46A 5GZZB 2YWMA 4I2UA 2XHFA 3BOAA 2JSZA 1GTIA 3ZREA 3PH9A 3GH6A 3GKKA 1X9SB 1J0FA 4GXZA 5ECSA 5KN2A 4PGTA 2HXKA 2VM1A 1I5GA 5FT3A 2VOCA 3V1WA 2H8LA 4KB3A 2FWEA 2GQLA 4QL7A 2KHPA 2IPAA 3UBLA 3HVSA 3F3QA 1G0TA 3EE2A 4FO5A 4FYBA 3UARA 3A2XA 4IKHA 2C4JA 4MDCA 1RW1A 1HD2A 1FO5A 3G9BA 3ZVJD 4KSMA 2IJYA 3MSZA 5DQSA 3IDVA 4OFTA 1FVKA 1WMJA 1SYXA 1TTZA 4ISDA 4HI7A 5CAXA 3MAKA 3M9JA 1WIKA 1THOA 4I8BA 2YN1A 2HNLA 3HZ8A 1X0RA 1S3AA 2MYGA 1K3OA 2K6VA 1SL2B 4TW5A 1QK8A 1BQ7A 4N11A 3ZITA 3CMIA 2K9FA 1LU4A 1GP1A 3BCIA 4FYCA 2HT9A 4MPFA 5G31A 1RK4A 5A4WA 4H86A 1GTUA 1XWCA 2HLSA 5DBQA 5ABRA 1TK8B 3ED3A 4HU9A 1XW5A 2HRFA 2R3XA 3IXRA 4WR5A 1QXHA 4NHWA 3TGZA 1Z5YE 3A2WA 3APSA 2QSIA 2NVLA 1R26A 1YQ1A 1F2EA 1XWAA 1KTEA 2L5LA 5D8IA 3WD6A 3KZQA 3HZ4A 3WGDA 1X5DA 1T4ZA 2VLTA 3ZRDA 2GDRA 4I2TA 5KN0A 4AJ6A 3HHVA 1EEJA 1PX7A 1CQGA 6GSVA 4MPGA 2X99A 4XRDA 3GKNA 2EC4A 2CQ9A 3KM6A 2FWFA 2IN3A 2H76A 4EL1A 2H75A 1FG4A 2YZHA 1M99A 5KN3A 5GSSA 3M0FA 1TRSA 1ERVA 4JBBA 4Q5RA 22GSA 3EU3A 2DC5A 1SU9A 5E4WA 4OO5A 2J9HA 3L9SA 1N8JA 1GTAA 1SK2A 2VL2C 5IQYA 3GTUA 2XBIA 3R2QA 4RI7A 1AXDA 1MD3A 1F6MC 5J3RA 5DALB 4CHSA 4TOPA 3FW2A 4BVYA 4ZL8A 1OE7A 1BJXA 1A0FA 3A2VA 4IP6A 2LJAA 2V6OA 2OACA 5KEJA 1R5AA 2QC7A 3QPMA 4ZXGA 3VFIA 3TOTA 2CVKA 5HR2A 2YP6A 2MMOA 1ERTA 4TR3A 4F03A 3L9VA 5H5RA 3GV1A 3HCZA 1T7PB 2M80A 1XXUA 4YQUA 1ERWA 3APOA 4ECBA 4GRFA 4RQRA 1XVQA 4HS1A 2GT5A 3FEUA 3VPTA 1VF1A 5DJLA 3KTLA 4EVMA 3L4NA 4KSOA 3WYWA 1ZYQB 1WJKA 12GSA 5J9BA 3TKSA 5DDLA 1TJDA 2YV7A 1PSQA 1YEXA 2CVDA 1QFNA 2LKUA 1TK0B 4GWRA 5GAND 3LWAA 2PN8A 2H1GA 3LXZA 3IE3A 3O3TA 2IFQB 3KH9A 3GKXA 4KGIA 5ECOB 4KCEA 3TCOA 5ECNB 1DE2A 1GUKA 3GN3A 2PBJA 2AHEA 2GLRA 2JSYA 2YWNA 3Q6OA 1A8LA 4JRRA 3IAS2 1Z9HA 1CQHA 4XIHA 4IN0A 3J7Yk 3VWVA 4ECIA 4XRAA 4MMMA 4GQFA 2GTUA 2JZSA 4D73A 1Z7RA 1OAZA 3QFAC 3TOUA 4K7OA 1T8EB 1SK0A 1GSFA 4GSSA 4PNFA 5IO2A 3WGXA 2DSAA 2H30A 1XFLA 4OWYA 4QQ7A 4IJIA 2WB9A 3ZMLA 3ZIJA 2C0EA 2CA8A 5FHIA 2B1LA 5D9VA 3Q19A 1HNAA 4MCUA 5CREA 3DWVA 2ALBA 4TVEA 3LYPA 4FYUA 2OADA 1GNWA 2OKAA 3FZ4A 2H70A 3PR8A 2FA4A 4Q5QA 1BG5A 1OKTA 3LXTA 1SK1A 3EURA 4ZL9A 3DGQA 2XPDA 4PUFC 5G30A 3RPNA 3C73A 4MF6A 4IBPA 3W6GA 3VWWA 2LJRA 1V9WA 2HYXA 2VCTA 1XZOA 2VLUA 3F6DA 3GKMA 2RM6A 1A23A 2H19A 4WR4A 4XHMA 4GSTA 3OR5A 1XWGA 4TRXA 2E7PA 3GIXA 4ID0A 1Z7PA 2YCDA 4DSQA 1YZXA 3TRPA 4IJ3A 1U3AA 3PGTA 2YJ7A 4JR4A 1NHOA 2TIRA 3UJ1A 1Z3EA 1XPVA 2E0QA 4I5QA 2JU5A 4X0XA 2KLXA 1TRVA 5ELAA 2OBIA 5ECIB 1U3IA 5ID2B 1GLPA 1AW9A 2I81A 3I6AA 2GSRA 1IYHA 2BTOT 4MZBA 2IIYA 3IA1A 3A3TA 3IOSA 2LJKA 2LQQA 3FHKA 3D5JA 4OO4A 3GFKA 4BA7A 3VWXA 3VI7A 1F37A 5IM9A 3M8NA 4L0WA 1WPIA 1YKCA 3CRUA 1JZRA 1VF3A 2KUCA 4NHZA 3EMXA 1X5CA 4K8MA 4RUVA 5CO3A 4EXJA 1HYUA 5D73A 1EV4A 5EVOA 5CYYA 3KEBA 4PQ1A 1H4OA 2WCIA 2EIRA 1K0MA 4MJBA 5ECKB 2JZTA 1T00A 4HEA2 3F6FA 2JZRA 2L59A 1GSQA 4HDEA 2NBSA 2AYTA 3CSJA 2OJLA 1GUHA 2DBCA 3ME7A 4ZILA 4LLRA 5F0GA 3A5WA 1OVNA 4MZCA 3C1SA 4MP4A 2C3NA 3QFBC 3G7YA 4XTSA 3ZYWA 1ZMAA 3H93A 2IMKA 1I9DA 4ZBBA 1IYIA 1AUCA 1OC3A 4PURA 2D2ZA 2GSTA 3ERGA 5HR1A 2GS3A 1K0BA 2YJHA 1EEMA 2MMZA 2WJUA 1NW2A 4OD7A 1OC9A 3VI5A 2DJJA 2GGTA 1EP8A 3DRNA 1GNEA 2OBKA 2B7JA 5B6NA 2MBTA 1O6JA 4K9ZA 5CNWA 1FW1A 4DSSA 1UC7A 4XS1A 1M7TA 1MD4A 3FZ5A 5D93A 2VL3A 5H5SA 6GSTA 1EOHA 1W4VA 3DEXA 2DIZA 2GZYA 4BPYA 2LSTA 5G5FA 1QGVA 2QGVA 1O85A 1ERUA 1SYRA 5IPGA 4IVFA 1MTCA 9GSSA 5JWQB 4F0CA 1SL1B 4GCIA 4ZL7A 5IIZA 1EGOA 2R4VA 4NPBA 3KMOA 1DSBA 3JCML 3E0UA 5GSTA 1F3AA 2GT6A 5F07A 1O73A 5JWOB 4BVXA 5ECMB 3QMXA 1SJIA 2H0GA 3VLNA 2CV4A 2H0IA 1USBA 2C3TA 2K8VA 3M9KA 3KJYA 1M2DA 2A4VA 4GSNA 2OE1A 3HA9A 3BJ5A 3QR6A 4TXOB 4POMA 3FKFA 1EWXA 4DEJA 2FHEA 3VPQA 4X1UA 1PKZA 3W8SA 2A2SA 1GRXA 2DJ0A 3FZ9A 5C00A 4BWQA 3AY8A 4PQHA 1Y6EA 4TR1B 1R4WA 2AJQB 1X9WB 1V2AA 2OE0A 5DCHA 2PPTA 3F4SA 5AIXA 1SL0B 1TKDB 2GVPA 3G7JA 2LRCA 2R5GA 3FR6A 4L8EA 1SKWB 3LGCA 2N5BA 3US3A 5IOXA 2HI7A 2MMNA 5COHA 2F9SA 3D21A 3GL3A 5HR3A 1AQVA 1ZGNA 1WOUA 2BMXA 4KDUA 3MDKA 3HYPA 2Z9SA 2B6MA 5E59A 1F3BA 4MA9A 5DAKB 4OFMA 1K0AA 2PVOC 4L5OA 1BAYA 3IBHA 3TJKA 2CZ2A 2OA7A 4L0UA 4CW9A 2F3MA 4RQXA 2RIIA 1YF0A 1GSDA 3TUEA 2H74A 1SD8A 2LEGA 5D9WA 4JR6A 1WP0A 4V2LA 3IK7A 4L5LA 5B8AA 3HXSA 3UBKA 4GQCA 6GSUA 2VM2A 4HJ2A 2V1MA 4GLTA 4XS4B 4G10A 2I1UA 1VGLA 1R7HA 4LL1B 1SKSB 4LA1A 3WT1A 2C8UA 4PX1A 3TKSC 1H75A 2XBQA 1T1VA 4WF5A 3WT2A 2A2RA 2LQOA 1XIYA 2PMTA 5G1LA 1A8YA 1PX6A 2C0DA 2C3QA 1GSEA 4EKZA 5G1KA 3P8WA 1AQWA 4JU5A 5F05A 1K0CA 2H0HA 1V57A 3QCPA 4G19A 3N9JA 1EV9A 3QD9A 1YY7A 5IPHA 2O89A 1XWKA 3FYGA 3H8QA 4IW9A 2H71A 5EPFA 3ERFA 4IQAA 3RPPA 1TDIA 1B48A 1PKWA 1XVWA 2WS2A 4NV5A 1QQ2A 2MMAA 3SWLA 5ELGA 3APQA 3ZTLA 2QKEA 1FVJA 2H66A 4ZBAA 1ON4A 2DMLA 5LD0A 1E6BA 5DVBA 4LMWA 1MEKA 2HZFA 2PERA 3IC4A 2HZEA 1O7UA 2V6KA 1AIUA 4YQMA 2O7KA 2FNOA 2TRCP 1R5PA 2DJ1A 1EGRA 4MZWA 3D4MA 3GUSA 2WRTA 4V1Ap 3ZFLA 3ZVJA 3DD3A 2EIOA 1SD9A 2DMMA 5C04A 1Q98A 1MDIA 5F06A 3UAPA 11GSA 5FWGA 2B5XA 4GF0A 3UIWA 1TP9A 2JACA 1LJRA 3EC3A 1TI3A 13GSA 1B8XA 4PXOA 1XWBA 4BWSA 1NSWA 1UVZA 2P31A 3U6VA 2WZ9A 3TB2A 1TRWA 5IMVA 2VCQA 4QL9A 1C72A 2WULA 3GX0A 3IPZA 5CP1A 1EOGA 4J2FA 4POLA 3TKRA 1S3CA 5A5KA 2V41A 1ZCPA 3KIJA 2VO4A 1OC8A 4WXTA 5IMZA 1WWJA 1PL2A 2VD1A 18GSA 3F0IA 5F8BA 2VLVA 1ZZYA 4NXIA 3QDNA 3DIEA 3FZAA 1B9YC 2B5YA 3RHCA 3DVWA 2AAWA 5J4UA 1GTBA 3VURA 4TR0A 4N10A 3GL5A 3H79A 5CRGA 2LRNA 4ECCA 4POKA 5IO0A 3TKPA 2B7KA 2LNTA 3LG6A 3EMPA 2XC2A 2VD0A 3KCMA 2NTOA 5J9CA 1VF4A 4ZB9A 4HQSA 3CRTA 1TRUA 4DSRA 2O8VB 3QAGA 2GSSA 2KP2A 2ZNMA 4G9HA 1K3LA 3GTUB 1Y25A 3IK9A 2NPBA 3DMLA 3PINA 1ZYEA 4F9ZA 17GSA 1NHYA 1JLWA 1YJ6A 5HFGA 1PL1A 4HZ2A 4F0BA 2FGXA 5ECHB 1FB0A 4HOJA 3QOUA 2X8HA 2VL9A 1BX9A 3UMAA 1PRXA 4LMVA 3IV4A 4KE3A 2PU9C 3ZLPA 3TDGA 2GZPA 3DXBA 3TJGA 1FHEA 3CXGA 3H4KA 2VIMA 2R2JA 3RAZA 2ON7A 4AGSA 1J08A 2KP1A 3CTGA 3E3EA 1XOBA 2X8GA 3CBUA 3EINA 4I97A 2CVBA 1KBNA 2GSQA 3K8NA 1VF2A 1G6YA 3GSSA 4JE1A 1BYEA 3L0HA 5D96A 1M2BA 4JEDA 4E8HA 3LEFA 1PMTA 2O87A 1WRYA 5B6MA 1V40A 1T4YA 19GSA 1JLVA 4NMUA 5DALA 4IGJA 4E8EA 4K2DA 4YQVA 1YDKA 4PQIA 2I9HA 1V58A 1FB6A 2FLSA 1TU7A 10GSA 5D9TA 1S3DA 2X64A 1J9BA 5ECLB 3EU4A 3I69A 4N30A 3FY7A 4ZB8A 4TN8A 5ENUA 1TXXA 1GSYA 1ABAA 4POBA 4OMVA 2R6KA 2CT6A 4ULXA 1UA5A 3D0ZA 2YOIA 4N0ZA 1JZDA 4WETA 3KP8A 5KN1A 2IMEA 2GZZA 1T3BA 3HJMA 5D9XA 4OFNA 2H01A 3ERWA 2AUVA 2HFDA 1GH2A 2GQKA 5LCZA 3MNGA 1MDKA 2CZ3A 2PGTA 3GMFA 3BBYA 2N5FA 4FH8A 3CTFA 3KH7A 3F4RA 14GSA 4D73B 4ML1A 5HQPA 4YH2A 4J56E 1TW9A 2L6CA 4WBJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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