The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
24
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sequence length |
130
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structure length |
130
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Chain Sequence |
GSSGSSGAVSGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDGLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKAATALKDVVKVGAVNADKHQSLGGQYGVQGFPTIKIFGANKNKPEDYQGGRTGEAIVDAALSALRSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
The solution structure of the first thioredoxin domain of mouse Protein disulfide-isomerase A6
rcsb |
| molecule keywords |
Protein disulfide-isomerase A6
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| molecule tags |
Isomerase
|
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
24
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| structure length |
130
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| sequence length |
130
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| ec nomenclature |
ec
5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase. |
| pdb deposition date | 2006-04-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00085 | Thioredoxin | Thioredoxin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Glutaredoxin | Glutaredoxin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3I69 A; 2KUC A; 3WGX A; 4JZQ A; 2GS3 A; 5J3R A; 4WF5 A; 3C71 A; 2I3Y A; 1R5P A; 1M99 A; 2QGV A; 4Q5F A; 2O87 A; 4X43 A; 2HLS A; 3ZL5 A; 4JR6 A; 1K0B A; 2YCD A; 3ME8 A; 6GSU A; 3LFL A; 1FHE A; 5IMZ A; 1OE8 A; 3ERF A; 3HYP A; 2LJR A; 2JAD A; 3VUR A; 1VF2 A; 3DD3 A; 4PUF C; 2YWI A; 4AF2 A; 5IO2 A; 1EV9 A; 5L71 A; 4G2E A; 1OC9 B; 4JU5 A; 3IAS 2; 2YP6 A; 1GTU A; 1Z5Y E; 5HR0 A; 1GH2 A; 2C0D A; 2FD3 A; 4EKZ A; 4MDC A; 3UVH A; 3PH9 A; 5CO3 A; 1IYH A; 2YJH A; 2HRF A; 1HNA A; 5CRW A; 3HVS A; 2IMK A; 1RQM A; 3UVT A; 4N11 A; 3ZLP A; 2Z9S A; 3FZ9 A; 2ES7 A; 1AIU A; 4EF0 A; 2H1D A; 4KH7 A; 4V2N A; 3C73 A; 2L4C A; 2K8S A; 4XS6 A; 5ECQ B; 3ZIV A; 6GST A; 2FA8 A; 3FR9 A; 2A2S A; 1TDI A; 5E4W A; 6GSW A; 5JWR B; 5CRD A; 5CAX A; 2PN8 A; 18GS A; 1TK8 B; 4WET A; 1TU7 A; 1E6B A; 3GKK A; 4N0V A; 4V1A g; 5IO0 A; 3LXT A; 4HS1 A; 4I6X A; 3KTL A; 1HYU A; 1ML6 A; 4K2D A; 2F8A A; 4AJ8 A; 1TP9 A; 1KTE A; 2H6Z A; 1VF4 A; 1ABA A; 4D73 B; 4OFN A; 5G2Z A; 1J08 A; 2K9F A; 4GST A; 2FWH A; 1TK0 B; 2A2R A; 2ALB A; 4WF4 A; 1ZMA A; 1XWG A; 2WZ9 A; 2X8C A; 3VWV A; 3PR8 A; 3WT2 A; 3GH9 A; 3WYW A; 2M80 A; 5KN0 A; 4TR1 B; 2NBS A; 2LRN A; 5CRE A; 3UBL A; 3QAG A; 3TB2 A; 1OC3 A; 3EMX A; 2C0G A; 4IP6 A; 1Z6M A; 3TKS C; 3Q18 A; 2O7K A; 1WMJ A; 3LEF A; 3EU3 A; 1O7U A; 2HI7 A; 5DVB A; 2HRN A; 7GSS A; 1PMT A; 6GSS A; 2DIY A; 2VCW A; 1AXD A; 2L59 A; 3HHV A; 1O6J A; 4OO5 A; 1RW1 A; 3F4S A; 3EIN A; 5IOX A; 4KA0 A; 1EEM A; 4ML1 A; 4PGT A; 5FT3 A; 1ZL9 A; 3QMX A; 3A3T A; 5ELA A; 5AIS A; 2DJ3 A; 4O32 A; 4GTU A; 1F9M A; 3EU4 A; 4ISD A; 1EOG A; 4EE0 A; 1OAZ A; 3FYG A; 2L6C A; 12GS A; 1SYR A; 2L5L A; 2GQL A; 4J56 E; 4IN0 A; 5HR3 A; 1CQH A; 5HR1 A; 4FYC A; 4IJI A; 5ECM B; 5A4U A; 1DUG A; 1SEN A; 3D4M A; 4QL7 A; 4EDY A; 3RPN A; 2AJQ B; 3LYK A; 5DQS A; 4PNG A; 4WXT A; 4TXO B; 3C7M A; 4XS4 A; 11GS A; 3U5R E; 4EDZ A; 1EGR A; 4IEL A; 1QMV A; 1HQO A; 4EUY A; 5KEJ A; 2C3Q A; 3VPT A; 2E2M A; 3GNJ A; 5IMD A; 1FVK A; 2VO4 A; 3K8N A; 3P2A A; 2YZH A; 1H4O A; 1FW1 A; 4TKY A; 4V2L A; 3D21 A; 2VCZ A; 3P8W A; 2CVK A; 2C80 A; 4MJE A; 1WP0 A; 2AB6 A; 1EOH A; 4PUR A; 2IME A; 5D9T A; 3Q19 A; 5JWQ B; 5JCU A; 5AN1 A; 3IRA A; 5D9W A; 3HKR A; 3ZRD A; 1M2D A; 4PX1 A; 2LNT A; 3P7X A; 1GUM A; 5IMV A; 2HZE B; 3H4K A; 2VLV A; 4BA7 A; 3S9F A; 4HEA 2; 3DKS A; 5KN3 A; 1S3D A; 3FR3 A; 3W8J A; 3RDW A; 2AYT A; 2C3N A; 4ZBA A; 4KE3 A; 5F05 A; 5CRG A; 1JLW A; 1B48 A; 1VF1 A; 4EVM A; 1QGV A; 2B1K A; 1MDI A; 3CSJ A; 3L78 A; 1VGL A; 2G0F A; 1KNG A; 1GP1 A; 1HNB A; 2LUS A; 1VRS D; 2BTO T; 3TRQ A; 3L9V A; 1OKD A; 4AJ6 A; 4ZB9 A; 1Q4J A; 3C1R A; 4NAX A; 2X8G A; 1EZK A; 2MMA A; 5ECS A; 4F82 A; 1THO A; 2F9S A; 3LQ7 A; 1NHO A; 3CRT A; 1U6T A; 4NWY A; 1WOU A; 4F2I A; 13GS A; 2VCX A; 1H75 A; 4OO4 A; 2H72 A; 4ZIJ A; 1N2A A; 3RBT A; 5ECP B; 1O85 A; 3ZMK A; 3G9B A; 1O73 A; 5INY A; 1U88 A; 3TRX A; 4O5R A; 3LGC A; 5JCW A; 9GSS A; 5ECI B; 3GL5 A; 3GFK A; 3ZIT A; 1YKA A; 1YY7 A; 3UOM A; 2LJA A; 4GSS A; 1R5A A; 3J7Y k; 2L5O A; 2GSQ A; 3L9U A; 3RPP A; 1SKR B; 2PUK C; 4K0G A; 3NIV A; 1ACV A; 2WB9 A; 2FWF A; 2LEG A; 3QR6 A; 2KOK A; 1R26 A; 4OD7 A; 2ZUP A; 4K0N A; 3IDV A; 1GSS A; 3KIJ A; 1LU4 A; 1XZO A; 2J23 A; 5J5N A; 2VLT A; 4LMW A; 3HD5 A; 2H1G A; 3ZVJ D; 2CAQ A; 2GDR A; 5H5R A; 4KAE A; 4DSQ A; 3QD9 A; 2H70 A; 4HQZ A; 4MPF A; 2RM5 A; 2FA4 A; 1PD2 1; 1X9S B; 3I43 A; 1MDJ A; 3F4R A; 3EC3 A; 2CQ9 A; 1ERV A; 1JLV A; 3GL3 A; 4HU9 A; 2XPD A; 3MDK A; 1URM A; 3FZ4 A; 3D22 A; 1E2Y A; 2YZU A; 4CW9 A; 2AV4 A; 3ZZX A; 2GLR A; 2K18 A; 2WRT A; 3CXG A; 4ZBB A; 5JWO B; 4POB A; 1M2A A; 2P5R A; 3CSH A; 3C8E A; 2VAF A; 5G5E A; 3F3R A; 5DBQ A; 4JE1 A; 3GX8 A; 2HT9 A; 2H74 A; 4RUV A; 4ECJ A; 3F3Q A; 4MJA A; 4MJC A; 1FB0 A; 1T4Y A; 2JSZ A; 1ERT A; 2AHE A; 1M7T A; 4GWR A; 4TN8 A; 1SKW B; 5ECK B; 4LL4 B; 5FHI A; 3W6G A; 3NZN A; 3HA9 A; 4TOP A; 4HI7 A; 5DAL A; 4Q5R A; 5IQY A; 2F3M A; 1IYI A; 4X0X A; 5B7C A; 3ISO A; 2N5F A; 2LNS A; 3BBY A; 2IMI A; 3DVW A; 4ZB6 A; 4TR3 A; 1PN9 A; 2B5E A; 3BD2 A; 2GQK A; 4DSS B; 1TJD A; 2IL3 A; 3D4T A; 4ZL8 A; 1PKW A; 1XW9 A; 3GST A; 4PXO A; 1ZYQ B; 4N0Z A; 3OR5 A; 2DML A; 2JL4 A; 3CTF A; 1M2B A; 2TRC P; 2E0Q A; 4Z7X A; 2OE1 A; 3HZ8 A; 1F3A A; 2PMT A; 3CTG A; 2YWO A; 1BYE A; 2YOI A; 1TI1 A; 3GRX A; 3WD6 A; 3WGD A; 3QPM A; 1B4Q A; 3F9U A; 2RII A; 4XS1 A; 1PGT A; 4IJ3 A; 5KN1 A; 5IPG A; 1K0D A; 3GA4 A; 4ZL7 A; 2LST A; 4RI6 A; 4ZBD A; 2H75 A; 1MDK A; 4ECI A; 3TJJ A; 1ST9 A; 4BVY A; 2BMX A; 6GSY A; 3DGQ A; 2HE3 A; 2BJX A; 3O6T A; 2KLX A; 2PGT A; 4KND A; 3KJY A; 2VD0 A; 3TKQ A; 3ZTL A; 1PKZ A; 4IW9 A; 1EWX A; 4EO3 A; 4GSN A; 1LBK A; 4POL A; 2CX3 A; 2JAC A; 2CV4 A; 1A0R P; 3GKN A; 1XWC A; 1K3L A; 1FOV A; 3BCK A; 4YQU A; 1UA5 A; 2X8H A; 1X5C A; 5ID2 A; 5C00 A; 4OMV A; 3CMI A; 4KX4 A; 3TGZ A; 1WPI A; 2XPE A; 1K0M A; 3JCM L; 2GST A; 1XBS A; 3HDC A; 1QQ2 A; 4HJ2 A; 8GSS A; 1PA3 A; 2H1A A; 4HU7 A; 1SD8 A; 4J2F A; 1JZO A; 3G7J A; 2YV9 A; 5B8A A; 4N10 A; 1TRV A; 4PUA A; 1YJ6 A; 5J9B A; 1ERW A; 1T00 A; 2C3T A; 4NMU A; 3J7Y b; 3FW2 A; 3F8U A; 1A0F A; 1DSB A; 4GXZ A; 3APQ A; 3TJG A; 3FR6 A; 2YPM A; 2B7K A; 1SL1 B; 3N5O A; 2GT6 A; 3F4T A; 2O89 A; 1TRS A; 3UEM A; 1FVJ A; 3ERW A; 2EIR A; 1PRX A; 1ZGN A; 2ZCT A; 4ILF A; 1YQ1 A; 3TKP A; 3TCO A; 4MLY A; 4BVX A; 1GWC A; 1A2J A; 4JED A; 1K0C A; 1GSE A; 1XPV A; 3KGK A; 3GTU B; 4HZ2 A; 2PVO C; 4OFT A; 3GX0 A; 3LSZ A; 5H5Q A; 5IIZ A; 1MTC A; 5EVO A; 1Z3E A; 2V1M A; 2VM1 A; 4XHM A; 3IPZ A; 5ENU A; 2GVP A; 2E2G A; 4K7N A; 1G6W A; 2MBS A; 1U3A A; 3LG6 A; 2IFQ A; 1ZCP A; 2VIM A; 5B6M A; 3ZRE A; 5DAK A; 4NHZ A; 3UMA A; 1NSW A; 3M0F A; 1DBY A; 2VL9 A; 1AAZ A; 3P90 A; 1XFL A; 1EP7 A; 5F8B A; 3ERG A; 1X5D A; 4K7O A; 1ZYE A; 4KW6 A; 1FB6 A; 2DJ1 A; 3IA1 A; 4JRR A; 4NHW A; 3TUE A; 1FO5 A; 5G30 A; 4WBJ A; 3H1N A; 2B5X A; 1B9Y C; 5IPH A; 3QOU A; 3QAW A; 4I2T A; 1TTZ A; 1TW9 A; 2OBI A; 2XC2 A; 2N5B A; 2QSI A; 5EPF A; 1PX6 A; 3AY8 A; 2FGX A; 2FCH A; 1UN2 A; 5E59 A; 2YJ7 A; 1V98 A; 2IPA A; 2V32 A; 2VL2 C; 1TRU A; 3EYT A; 4MAB A; 2WFC A; 5HFK A; 5IMA A; 2EC4 A; 4F03 A; 2TIR A; 4OFM A; 4MZB A; 2VCQ A; 2RUE A; 2DJK A; 1Z7R A; 1M9B A; 1XVQ A; 2HZF A; 2LTK A; 2GSR A; 19GS A; 1MD3 A; 2VD1 A; 1SL0 B; 3E0U A; 1Z6N A; 4L5O A; 2R4V A; 1YEX A; 4YAP A; 3IOS A; 4ULX A; 3TOT A; 2FLS A; 4MP4 A; 2P5Q A; 2MMZ A; 4PQH A; 4TR4 A; 2OE3 A; 1R4W A; 4HDE A; 2XHF A; 1X9M B; 1F37 A; 2G2Q A; 3UL3 A; 2IMF A; 3HJO A; 2VCT A; 5B6N A; 4CDO A; 1F6M C; 1YDK A; 1JZR A; 2HSY A; 5F06 A; 4BWS A; 2H6X A; 1QK8 A; 3QDN A; 3ZML A; 5J41 A; 2FWG A; 3EMP A; 3H8Q A; 1A24 A; 1VF3 A; 3MWH A; 1A8L A; 1GSY A; 5ECL B; 2CZ3 A; 3G7Y A; 1BX9 A; 1SL2 B; 2LQQ A; 1J9B A; 4F0C A; 3DIE A; 1T8E B; 4LA1 A; 3WGE A; 3MAK A; 17GS A; 2N5A A; 3ZFL A; 1FG4 A; 1F3B A; 5F07 A; 4KB3 A; 2OBK A; 1XWK A; 2GGT A; 3IE3 A; 2JZR A; 4NV2 A; 4WKW A; 5CYY A; 2NVL A; 1TOF A; 2B7J A; 3VWW A; 3TJK A; 2VLU A; 3BOA A; 5JCG A; 2H71 A; 3PIN A; 2I1U A; 3KXO A; 6GSV A; 3IK7 A; 4I5Q A; 4GQF A; 3CRU A; 3BCI A; 1QUW A; 4TXV A; 4MH2 A; 4HOJ A; 5GAP D; 5IOW A; 1XCC A; 3KCM A; 1KEB A; 2H19 A; 3VK9 A; 2H0G A; 4KSO A; 4ML6 A; 2ON7 A; 1J0F A; 2PBJ A; 2ZNM A; 3E3E A; 4LMV A; 4MH3 A; 1O81 A; 4MZW A; 4IS0 A; 4MK3 A; 3IBH A; 2WDU A; 2DJ2 A; 2H73 A; 1M9A A; 5CRH A; 4XRA A; 5G31 A; 5IMF A; 5D73 A; 4IKH A; 1BQ7 A; 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1GNW A; 2X64 A; 3TKS E; 2J9H A; 1OYJ A; 4TR1 A; 4F9Z A; 4ZL9 A; 3QFB C; 4FH8 A; 3LWA A; 1K0O A; 2DC5 A; 2JSY A; 4KDX A; 1Z9H A; 1AUC A; 1GUK A; 2D2Z A; 1XW6 A; 4AGS A; 4MF6 A; 2YWN A; 3DEX A; 1XOA A; 1AC1 A; 3US3 A; 4XCS A; 5ECO B; 1UVZ A; 2H76 A; 3SBC A; 4XTS A; 2YV7 A; 3LYP A; 2H66 A; 4PNF A; 3QAV A; 1SD9 A; 2K6V A; 4I97 A; 1EEJ A; 2PER A; 1V58 A; 4POK A; 3FZA A; 4L0W A; 2PWJ A; 3HJM A; 5GST A; 2IMD A; 1PQN A; 4OCF A; 2C4J A; 3CSI A; 3RHC A; 3HY2 A; 4YH2 A; 4IGJ A; 3VWX A; 1YZX A; 1B4P A; 5J9C A; 3GKM A; 4MF5 A; 3DVX A; 3EVI A; 4KCE A; 5ECN B; 3TKR A; 4XRD A; 5LD0 A; 4IHU A; 1YKC A; 2M46 A; 4FYB A; 2C1Y A; 4HUA A; 4HJM A; 3RAZ A; 2FUG 2; 2DSA A; 1G6Y A; 1G0T A; 3QCP A; 2KHP A; 3GUS A; 4TXO A; 2AAW A; 2CT6 A; 2CZ2 A; 1GSD A; 4WBR D; 2L57 A; 4O7H A; 1AW9 A; 3TJF A; 5ECH B; 4P3Y B; 2HXK A; 5ELG A; 5KN2 A; 4MMM A; 2GZY A; 3IR4 A; 10GS A; 3FY7 A; 4MJB A; 2LRT A; 3GMF A; 2F8F A; 4ID0 A; 3O3T A; 3I9V 2; 3L0H A; 1B8X A; 2B3S A; 4G10 A; 4LL1 B; 5CP1 A; 2H01 A; 1PSQ A; 3UJ1 A; 1GL8 A; 2WCI A; 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