2DMLA

The solution structure of the first thioredoxin domain of mouse protein disulfide-isomerase a6
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
GSSGSSGAVSGLYSSSDDVIELTPSNFNREVIQSDGLWLVEFYAPWCGHCQRLTPEWKKAATALKDVVKVGAVNADKHQSLGGQYGVQGFPTIKIFGANKNKPEDYQGGRTGEAIVDAALSALRSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The solution structure of the first thioredoxin domain of mouse Protein disulfide-isomerase A6
rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A6
molecule tags Isomerase
source organism Mus musculus
total genus 24
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2006-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2dmlA01
16GSA 1XWBA 2AB6A 2FNOA 2GZZA 1U87A 1G7EA 2H19A 4X0XA 4F2IA 1PX6A 4EE0A 2R3XA 1XW6A 2YPMA 3PR8A 2CT6A 3BCIA 3QCPA 3RAZA 5DALA 5IO0A 4POBA 4KA0A 4PNFA 1BX9A 4MA9A 5EPFA 2IMEA 5C00A 3D22A 1USBA 2GQMA 2R6KA 2GZPA 3C1SA 3FZ5A 1X9SB 3P7XA 3ZL5A 4HU7A 3GIXA 4POLA 1Z7PA 3HJMA 2V41A 5G2ZA 3GMFA 4F0BA 3UVTA 3GX8A 4X43A 3VWVA 1ST9A 4F03A 1R5PA 3GRXA 2HE3A 1GSYA 5JWOB 2IMFA 1GTUA 3R2QA 2V6OA 2REMA 4K1FA 3Q74A 3ZZXA 3GH6A 2LNTA 1VGLA 2PBJA 3IDVA 4GRFA 3CBUA 4XS1A 5KEJA 3TKPA 2LNSA 3EE2A 1X5EA 3KEBA 3VPTA 2L4QA 3D21A 1S3AA 4RQXA 2O85A 3H1NA 1SKWB 2K8SA 2J23A 4TR1A 1EZKA 4LMWA 4CW9A 1XVWA 2PPTA 4F82A 1G6WA 3HVSA 3M1GA 1PKWA 4IJ3A 1KEBA 3UL3A 1SL1B 2I1UA 1M0UA 2CZ3A 2VL9A 2LUSA 1GUMA 4K2DA 4XS4A 2I4AA 1MDJA 1K0CA 4L5OA 1UN2A 5AIXA 1A0RP 3LYKA 2F8AA 2V6KA 1SJIA 6GSTA 4XHMA 3HKRA 5ENUA 2B5YA 3FYGA 5ELGA 3ZLPA 3DRNA 4NV2A 5EL8A 4PNGA 4CDOA 3F8UA 3TKQA 3FR3A 1TOFA 3Q19A 3CTFA 1ERTA 1J08A 3TUEA 1EV4A 1PA3A 4EF0A 2DBCA 2J9HA 3GL3A 3FW2A 1K0MA 5D8IA 5ECKB 1GP1A 2CVDA 1A2MA 10GSA 1OYJA 1T3BA 2ON5A 2L6CA 1EGRA 4OFMA 2R37A 5JWQB 1THOA 3UAPA 3M8NA 1A2LA 2YWIA 2GSRA 3PGTA 2OADA 1PGTA 1Z7RA 2C0GA 5B6MA 3EWLA 2P5RA 2P31A 2JL4A 3FY7A 2LTKA 4F0CA 4DSSA 5A4VA 1JZOA 2HSHA 2WDUA 1BG5A 3KXOA 1X5DA 4IHUA 4ZILA 3HZ8A 2FUG2 4P3YB 4PQIA 5COHA 2K18A 2QSIA 4K0NA 2IFQB 4KX4A 1TRUA 3TJJA 4PUFC 2IMDA 2HYXA 5D93A 5F07A 2VCQA 4MJAA 4HJMA 4EL1A 1MDKA 19GSA 2A2RA 1WIKA 2FD3A 4ILFA 1ZZYA 3A2WA 3NIVA 4ECIA 1G0TA 3KJYA 4BWQA 4BWSA 2VCZA 12GSA 3CYNA 1V2AA 3DXBA 3L9UA 4YQUA 3HD5A 5HQPA 1SU9A 4OFNA 1SJ6A 3WYWA 3ZVJD 2FHEA 1Z6MA 5B7CA 1SKRB 1YEXA 2VL2C 4HJ2A 2EC4A 5CRDA 2NDOA 5ID2B 3UJ1A 3GYKA 1ML6A 2YNXA 4K6XA 4L8EA 1EWXA 3P90A 1F3AA 3G7JA 2O89A 3TKSA 1F3BA 1ZGNA 2WCIA 20GSA 4K7NA 4JR6A 3D4MA 4O92A 3HDCA 2HXKA 5D9XA 1TDIA 1TW9A 1U3AA 2I81A 2LRTA 3J7Yk 2H1BA 3D6IA 4HUAA 4WF4A 2M80A 2H73A 2L4CA 4QQ7A 3FZ4A 3KH9A 2X8CA 22GSA 1NM3A 2LS5A 3EU4A 5HR2A 2XBIA 4GLTA 2G2QA 4Z7XA 3LGCA 1PRXA 5A4WA 5LD0A 4KCEA 3OR5A 3W8SA 2RM5A 3DGQA 2HRFA 3A2XA 1YY7A 1FOVA 3J7Yb 1WJKA 2PN8A 3UMAA 1YZXA 4KB3A 3VWUA 5J4UA 3WGXA 1TP9A 4FYBA 1M2AA 3KD0A 1RQMA 1NHYA 3LXZA 3L9SA 1WRYA 4GSSA 1AQVA 3F4TA 5LCZA 2HZEB 3FZAA 4IELA 4GSTA 1SYXA 2K9FA 2B7JA 3M0FA 1VF4A 5ECIB 2PVQA 1M7TA 2YOIA 1JFUA 3ERGA 1WPIA 4GCIA 4Q5NA 2GT6A 4WBJA 5IMCA 4I2UA 1SD9A 4TW5A 5DQYA 1R5AA 3KMOA 2L5OA 3ME7A 3GHAA 5KN3A 5LNKe 2LJKA 1EGOA 4I6XA 3KH7A 3D4TA 1IYHA 2HLSA 1PN9A 3CRUA 2O87A 5H5RA 3CSIA 2KHPA 3FR6A 2VIMA 5DALB 4O5RA 4MPFA 3LSZA 4ZB8A 3DYRA 4TR3A 4TVEA 4IQ1A 3WGDA 5DJLA 4IW9A 3FZ9A 4K0GA 2WGRA 1FAAA 2BTOT 2PUKC 1AAZA 4OD7A 6GSWA 5A4UA 1BYEA 1K0AA 4Q5FA 5G31A 1QFNA 1UC7A 2R5GA 4RI6A 1SENA 4PUAA 2G0FA 2CQ9A 3HYPA 2VLVA 3MNGA 1GLQA 1YEPA 4XS6A 2R4VA 4D73A 4JR4A 1K0OA 1TI1A 1OE8A 4KAEA 2WFCA 5J3RA 2GGTA 5HFKA 4ZB9A 1SD8A 2WZ9A 3I69A 1JLVA 4WETA 2DJ0A 1HD2A 4G2EA 1GL8A 4HZ4A 4MF5A 2PWJA 4TR1B 1MTCA 1Q98A 2H1AA 4HI7A 4TOPA 1XWAA 2LRNA 4YQVA 3C7MA 3O6TA 1YDKA 2ZNMA 3A5WA 1V9WA 3I6AA 4I8BA 3IHQA 1DUGA 2C1YA 1YF0A 4XS4B 3ZFBA 4E8EA 5IMAA 2FWHA 3C73A 2DJ2A 1ZL9A 4XTSA 2OA7A 2H30A 3P2AA 4YQMA 4MJCA 3ZYWA 1T4ZA 1T8EB 1S3CA 1X9WB 3ZMLA 5ECMB 3HY2A 4JRRA 1SL2B 1G6YA 5G5EA 3O76A 3F4SA 4GF0A 4QL9A 3GKXA 1TXXA 1O73A 3RHBA 2GDRA 2B5XA 1M9AA 2VCWA 5JCGA 2FWFA 1XWCA 1HQOA 1Z3EA 4TR0A 4Q5QA 4ISDA 1OC8A 1GULA 2FCHA 2WS2A 2O7KA 1GRXA 1TU7A 1XPVA 2F9SA 4WEYA 4IVFA 3TRPA 2LV3A 2LQQA 3F4RA 1DBYA 1LU4A 3ZMKA 1THXA 3KCMA 4KH7A 2H72A 2HRNA 1C72A 3HA9A 3DKSA 3TRQA 2B7KA 1HYUA 5DBQA 3F3RA 4J2FA 1U6TA 1B8XA 4YAPA 2VCXA 2WULA 2DJ1A 3CXGA 1DE2A 2HNLA 3HJPA 4ECBA 2ZUPA 2HI7A 1AQXA 4EKZA 1GNWA 4KDUA 2F3MA 4IP1A 3LWAA 4K8MA 4BA7A 3DEXA 3HXSA 1A2JA 3KGKA 3HJOA 2A2SA 4JE1A 1KTEA 1OC9B 2GSSA 2EIOA 4MH2A 4NHZA 4IQAA 2VUPA 4NHWA 5JCUA 3GTUA 5IOWA 1I5GA 3D0ZA 3IC4A 5ECHB 3QAVA 2KP2A 3A3TA 4GXZA 2ALBA 5GZZB 5IIZA 3APOA 2PGTA 1W4VA 2VCTA 3ZFLA 3GKKA 3C1RA 4L0WA 4IS0A 1TRVA 5G1LA 3PH9A 4MP4A 1Y6EA 2Z9SA 4MPGA 1VF2A 5ECRB 2L57A 4DSQA 2BMXA 5J41A 3UVHA 5DCHA 5HR3A 1AUCA 3GKMA 5DJMA 3EC3A 1MD4A 3I9V2 4LLRA 1ACVA 4F9ZA 1FB6A 1SJZA 5A5KA 3JCML 2XBQA 1TU8A 2LEGA 4MMMA 2KUCA 5ECLB 3APSA 3FK8A 5E59A 3M9KA 2K8VA 4EDZA 2QC7A 3F3QA 4TR4A 1Z9HA 1K0DA 3HVVA 2VLUA 1I9DA 3LG6A 3WGEA 1OVNA 4N0VA 1EEJA 4LMVA 5E4WA 3KZQA 1YKAA 2FWGA 1GTAA 3U5RE 2YWMA 3TJKA 3ZIJA 2H6YA 1HNCA 3QPMA 5DDLA 1B4QA 1MEKA 3CTGA 5EY6A 3ZREA 5DAKB 1QXHA 1NW2A 2PMTA 3VLNA 2AAWA 3HZ4A 4G10A 4N10A 1ABAA 2JADA 1FO5A 1NSWA 4O32A 4WBRD 2H8LA 4NWYA 3CRTA 3RPPA 3LXTA 2TIRA 1DSBA 5CRHA 2MZCA 4N11A 3M9JA 3KTBA 2X99A 4FO5A 2EIRA 2VM1A 1J0FA 5IMDA 3IK7A 2QKEA 2YANA 2C8UA 4PURA 4ZIJA 4WR4A 2VL2A 2IL3A 1B9YC 5D96A 4V1Ag 1JLWA 2CA8A 2P5QA 2F51A 2JACA 4N0ZA 4QL7A 3C71A 1OKDA 2FY6A 4ZXGA 4KCAA 3FR9A 1PL1A 2QGVA 5AGYA 1FVKA 4KUNA 4ULXA 3WD6A 1OC3A 1ZOFA 5ECSA 4ZL8A 3L0HA 1FVJA 2TRCP 1EP8A 2B5EA 4V2NA 1V57A 5CNWA 5CRGA 4ECJA 4GQFA 1M99A 3GSTA 3GX0A 2FA4A 4G9HA 1ZMAA 3E9JB 1O7UA 3EVIA 4E8HA 3Q6OA 1AQWA 4HZ2A 3TKSC 2AV4A 5L71A 1WMJA 5FWGA 3RDWA 3QFAC 2DJJA 4PXOA 5CP1A 3KIJA 1KBNA 3C8EA 2N5FA 1PMTA 1XWGA 2DJKA 5F05A 2CVBA 2X8HA 4EC0A 1GSUA 2L6DA 3ZITA 2VL3A 1FW1A 2RLIA 4AF2A 4ZL7A 2DMLA 4GSNA 3UBKA 3QAGA 4PX1A 2AYTA 4MH3A 3Q18A 2MMAA 2IWTA 2DIYA 1JZDA 4HOJA 3W8JA 3G9BA 4ZBBA 1ERUA 3E3EA 2VOCA 1O8XA 3TKRA 4FYCA 2H6ZA 1KNGA 2JSZA 1WOUA 3MSZA 4OO5A 1X9MB 3F9UA 2YJ7A 2X64A 2EIQA 1Y25A 2OKAA 4HQZA 2E2MA 1G7OA 2O8VB 4KGIA 3SBCA 1EV9A 1B9XC 2ES7A 4OMVA 2OBIA 3DVWA 1CQHA 1AW9A 4TRXA 3ED3A 2E0QA 5AISA 4BVXA 2HSYA 2E2GA 3GL5A 3N9JA 2MBSA 3W6GA 2B1KA 1OE7A 2IN3A 2C3QA 4BL7A 1QGVA 2GQLA 4DSRA 1XW5A 3APQA 4RQRA 1PKZA 2ZCTA 5CREA 2LJRA 3F6FA 4J57E 2HT9A 5HFGA 5CO3A 5IMZA 4IJIA 1O81A 3LORA 4TXOA 4DEJA 5IO2A 1PQNA 1BQ7A 1TRSA 2OBKA 4ML1A 3KMNA 1GNEA 3TB2A 1H75A 1A0FA 4MF6A 3BJ5A 2R2JA 5J5NA 2CV4A 3E0UA 3IR4A 4BPYA 2MMOA 4L0UA 2L5LA 3G7IA 1AXDA 1QUWA 3QAWA 1R26A 18GSA 2H1GA 2P0GA 1AC1A 1EEMA 4RI7A 4CHSA 1M2DA 5G30A 2X8GA 4KSOA 3BBYA 1TKDB 1TK8B 1CQGA 3N5OA 5B8BA 2L59A 3TOTA 3VK9A 3VI5A 1VF1A 2CAIA 4PQ1A 2OE3A 1XXUA 3F6DA 3LEFA 1U3IA 2YWNA 4EUYA 2GLRA 3ERFA 2A4VA 1BEDA 3GFKA 3K8NA 4MZWA 2ON7A 1T1VA 3LJRA 2GTUA 1M2BA 3H79A 6GSYA 1R4WA 3VI7A 5HR0A 3D5JA 5IMFA 3DMLA 3EINA 4K7IA 2NPBA 5AN1A 4EDYA 1PSQA 4GQCA 1MDIA 1XIYA 1N8JA 2MBTA 2GS3A 3UEMA 2YJHA 2H0IA 2LSTA 2DJ3A 4N30A 5CRWA 3GNJA 3IK9A 1SK2A 2KLXA 3LQ7A 2C3TA 1A24A 2VCVA 4EVMA 2NBSA 1WWJA 2OE1A 1TTZA 3GH9A 3EMPA 4HU9A 1YF1A 1XW9A 2CZ2A 5G1KA 3MAKA 4I2TA 3GA4A 1Z6NA 5CAXA 1TK5B 1RK4A 2CAQA 2YZUA 5KN1A 5ECPB 1EOGA 4MZBA 4XCSA 1GLPA 1XZOA 5IOXA 2FLSA 2JU5A 5EVOA 1TJDA 5CYYA 2V2GA 4ML6A 2OACA 3IPZA 3UBLA 1VRSD 1FG4A 1U88A 1WP0A 3FKFA 4DSSB 4HEA2 3GKNA 3KTLA 2YN1A 1FHEA 3G7YA 4J56E 5C04A 3BOAA 4LL4B 2GSQA 1F37A 2MYGA 3VFIA 2DMMA 2RM6A 3H4KA 1W89A 1GTBA 5GAPD 1O6JA 4FH8A 4ZBAA 4MZCA 2AUVA 2WRTA 1V40A 1JHBA 1TK0B 1EP7A 1ERWA 1JZWA 5KN0A 4KE3A 1GWCA 3RPNA 4XRAA 1SK1A 4K9ZA 3QDNA 2HFDA 4AJ8A 2V32A 3LYPA 1PL2A 2H6XA 1ZYEA 1QQ2A 4OCFA 4PGTA 3CSHA 1FB0A 1GTIA 5DVBA 13GSA 2GQKA 3ME8A 1O85A 1AIUA 3FEUA 1PX7A 3S9FA 1XOBA 3HVXA 4AGSA 5J9BA 1GUKA 4FYUA 3BD2A 3DD3A 8GSSA 1S3DA 3IAS2 3KM6A 2H66A 3I43A 4G19A 4DVCA 5GSSA 17GSA 4OWYA 3RHCA 2E7PA 2VAFA 1HNBA 2IJYA 1XWKA 4IP6A 14GSA 1QMVA 2RIIA 2H76A 2C0DA 7GSSA 1ZCPA 3GUSA 1H4OA 4IBPA 4LA1A 3TDGA 2YWOA 3FHKA 1JZRA 3U6VA 1GSEA 2DIZA 2KP1A 4EO3A 3IE3A 3MWHA 1M9BA 2K6VA 2B3SA 4OCEA 3TRXA 2C4JA 4H86A 2H01A 2M46A 4GWRA 1T7PB 3IA1A 3IV4A 6GSUA 3UOMA 4IGJA 1F6MC 2PVOC 5D73A 3DVXA 2PU9C 1ON4A 2B6MA 2OJLA 1URMA 2JZRA 1BJXA 1PD21 2JZTA 3QMXA 1O8WA 2D2ZA 3EYTA 1ZYQB 5F06A 4KW6A 1OC9A 3RBTA 2VD0A 4MABA 2VD1A 1NHOA 2FA8A 2YP6A 3UIWA 4HS1A 4MDCA 3ZIVA 1A8LA 1WE0A 5IM9A 3L78A 3VPQA 3IRAA 2RUEA 1VF3A 1J9BA 1XCCA 4V2LA 1SL0B 1SYRA 2TRXA 3H8QA 3ZTLA 3GSSA 4HQSA 5JCWA 2NTOA 3VWXA 1GH2A 5ECOB 1R7HA 2DLXA 3EU3A 2MMNA 1XVQA 11GSA 4TXVA 5D9VA 4NMUA 5ELAA 1GUHA 5B6NA 4YH2A 3QFBC 1GSDA 3QOUA 2PERA 2JSYA 2IMKA 1ILOA 4K7OA 1V58A 4MJBA 2WJUA 4I5QA 1Q4JA 3CSJA 2GT5A 1GSSA 3ZVJA 4JZQA 4JEDA 1B48A 6GSVA 4KDXA 3ERWA 4WKWA 3EMXA 2KOKA 3TCOA 3KP8A 2NVLA 2YV9A 3DIEA 4TXOB 5F8BA 5AIVA 2I9HA 2YV7A 5INYA 3ISOA 4IN0A 4WXTA 3F0IA 2AHEA 3GV1A 1TI3A 2IPAA 5ECNB 4RUVA 4ECCA 1XOAA 6GSSA 4AJ6A 9GSSA 2M72A 3NOFA 2IFQA 1K3LA 5DAKA 3H93A 1K0BA 4D73B 1IYIA 3NZNA 2IIYA 1OKTA 2BJXA 2H0HA 3A2VA 2H75A 2GSTA 2VLTA 5B8AA 4KNDA 4POKA 2GVPA 3IOSA 2LKUA 3L9VA 3AY8A 4XIHA 5GSTA 2DC5A 3PINA 1DE1A 2FWEA 2RUFA 5FT3A 3TJFA 2MMZA 1V98A 2C3NA 5FHIA 3HHVA 5IQYA 2C80A 2N5AA 1XBSA 2I3YA 4FIWA 3IAM2 1E6BA 5HFIA 5G5FA 1QK8A 2H1DA 1K3YA 1LBKA 1T4YA 5ID2A 1Z5YE 6GSXA 2B1LA 4OO4A 2CVKA 2N5BA 4ID0A 4AJ7A 1EOHA 1GSFA 4NV5A 4JU5A 2H71A 1TRWA 3GN3A 1YJ6A 3SWLA 3EURA 1YKCA 4ZB6A 3F63A 4NAXA 1MD3A 1F9MA 4GTUA 5KN2A 1XFLA 4MF7A 1BAYA 2V1MA 3UARA 3CMIA 1GSQA 4XRDA 5GAND 4NXIA 4WF5A 4OFTA 4EXJA 1X5CA 5HR1A 1UVZA 2WB9A 3US3A 2FGXA 1K0NA 3QR6A 4IKHA 1SK0A 4BVYA 4MCUA 1A8YA 1UA5A 3KP9A 2OE0A 5D9WA 4Q5RA 4YAVA 3P8WA 4ACSA 4O7HA 3WT1A 1OAZA 5ECQB 2LJAA 2XPDA 4ZBDA 3L4NA 2C0FA 5DCGA 2IMIA 4X1UA 3WT2A 4PQHA 4ZL9A 3V1WA 3TOUA 4L5LA 3GURA 2XHFA 5D9TA 2GZYA 2CX4A 1ERVA 4TKYA 2HZFA 5ABRA 2JZSA 4MLYA 2H70A 2VM2A 3VWWA 3LFLA 4MK3A 3VURA 3M3MA 1LJRA 1B4PA 3FRCA 4MJEA 1K3OA 4TN8A 1YQ1A 4I97A 5IMVA 3TKSE 5DQSA 1A23A 3ZRDA 1E2YA 2DSAA 4POMA 3MDKA 5H5QA 2VO4A 1T00A 2YCDA 4JBBA 3IBHA 1HNAA 2H74A 2LQOA 4V1Ap 1SKSB 1X0RA 4NPBA 2XPEA 4HDEA 4LL1B 2HZEA 4KSMA 5J9CA 5IPGA 3HCZA 3O3TA 5JWRB 2YZHA 3TJGA 3GTUB 3IXRA 3TJBA 3BCKA 1RW1A 4V2MA 2LRCA 3TGZA 3QD9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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