2DMMA

The solution structure of the second thioredoxin domain of human protein disulfide-isomerase a3
Total Genus 18
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
18
sequence length
142
structure length
142
Chain Sequence
GSSGSSGFDGNLKRYLKSEPIPESNDGPVKVVVAENFDEIVNNENKDVLIEFYAPWCGHCKNLEPKYKELGEKLSKDPNIVIAKMDATANDVPSPYEVRGFPTIYFSPANKKLNPKKYEGGRELSDFISYLQREATSGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The solution structure of the second thioredoxin domain of human Protein disulfide-isomerase A3
rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A3
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
total genus 18
structure length 142
sequence length 142
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2006-04-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2dmmA01
2QC7A 4D73A 2WZ9A 1AQXA 4FO5A 4Q5FA 4GSTA 2C3TA 5EVOA 3V1WA 4RQXA 1BYEA 2H8LA 2RM6A 2FCHA 3DKSA 3GTUA 5HR1A 2VO4A 4QL7A 2BTOT 3APSA 3W8SA 3MNGA 5IMCA 5DCGA 4NHZA 1V40A 5IPGA 3FZ4A 2REMA 4MDCA 2O8VB 3TRQA 1GSEA 3W6GA 5IO2A 3QR6A 2P0GA 1WJKA 2JACA 4EF0A 4KW6A 2C3NA 2D2ZA 3IRAA 1SD8A 5ABRA 5DQYA 2HFDA 4LL4B 2YZHA 2L4CA 1BX9A 2TRXA 1B4PA 10GSA 2FY6A 5IMFA 4PURA 1O85A 1CQHA 3GYKA 2FHEA 4IGJA 3EMXA 4TXOA 5GSSA 4OMVA 2O89A 1EOGA 2VCTA 4MF5A 4GRFA 13GSA 2VOCA 1XBSA 4NWYA 2GT5A 3AY8A 5HR3A 2AB6A 3GNJA 3VFIA 4WKWA 1A0FA 4OO4A 2WB9A 3H93A 4NXIA 2HZFA 5HFGA 2K18A 2GTUA 2GLRA 5C00A 4O92A 1VF2A 3I43A 4MZWA 2XC2A 5CREA 4IQAA 3HVSA 2KP2A 3BCIA 2V2GA 3DEXA 3TKRA 4ZILA 4F03A 3Q74A 2IMDA 2GT6A 5D9TA 1MEKA 4X1UA 1IYHA 4X43A 1XIYA 1MDIA 1WMJA 2B7KA 3ZL5A 3M1GA 5G5EA 1JLWA 1XVQA 1EV4A 1OE7A 2E7PA 3P2AA 4BWSA 2LKUA 5KN1A 4TRXA 3N9JA 4KH7A 3F8UA 1AW9A 2RUEA 5D9XA 4YQUA 3CTFA 2WULA 1Y25A 2OADA 3M8NA 3KGKA 5IQYA 3MDKA 2YOIA 5D96A 1MD3A 1EWXA 2O87A 4O7HA 3DWVA 1J9BA 4EL1A 2LSTA 3LXTA 3GIXA 4NPBA 1GTAA 2C0DA 1F6MC 2IFQA 2HI7A 1ON4A 6GSTA 5IOXA 5CO3A 4XS4B 2DIYA 1JZOA 4IVFA 4IW9A 3NZNA 2C8UA 4I6XA 4YH2A 3CRUA 3RHCA 1KTEA 4OCFA 3LYKA 4DSSA 2QKEA 2WCIA 3I69A 1YJ6A 1K3OA 2WFCA 3KIJA 3QPMA 1V58A 2GVPA 2L6DA 1XOBA 2YCDA 4GLTA 1GSYA 2DMLA 1GLQA 3F6DA 5ECNB 3FYGA 4MK3A 5ID2A 5C04A 3D6IA 3PH9A 5J5NA 4PQIA 1HNCA 1JZWA 4K8MA 3O76A 4AJ8A 3F3QA 3DGQA 1WWJA 1ZZYA 3KH7A 1JLVA 3F6FA 3G7YA 4WR4A 4KUNA 3LWAA 2OE0A 2V41A 3QFBC 2IN3A 3GX0A 4WF5A 2HXKA 3EWLA 5H5QA 4D73B 2DJ2A 4FH8A 2KOKA 2YWOA 4ZB9A 1TP9A 5IIZA 2R2JA 2YNXA 2N5AA 1DE2A 2IMEA 5G2ZA 1JZDA 2JL4A 3BBYA 3SBCA 2OE3A 2MYGA 4IJ3A 1R4WA 19GSA 3GURA 4GSSA 2DIZA 5A4UA 2VM2A 2LQQA 2H0HA 4PXOA 2AV4A 4N10A 3U6VA 3GKXA 3ZRDA 5ECPB 2JZSA 3M3MA 4TR1B 4J57E 5IM9A 1J0FA 4F9ZA 2HRNA 1U3IA 1LU4A 4MJAA 2VCVA 2HZEA 1I5GA 1WPIA 3RHBA 3BD2A 1A2MA 2AUVA 1EP7A 1H75A 3OR5A 3D4MA 3C8EA 3UAPA 2PPTA 5GAPD 5D9VA 3QCPA 2I3YA 1ERWA 4MLYA 4YQVA 1O6JA 1Q4JA 1QGVA 5AISA 3VWUA 2LJKA 3IA1A 6GSVA 4Z7XA 2FWGA 2CQ9A 1PKZA 1OC9B 3IK7A 4PQHA 3MAKA 3QAVA 3FW2A 2VLUA 4IELA 4CDOA 1F3AA 3KMOA 4ID0A 5CRHA 1K3LA 4BA7A 2MBSA 1OYJA 2CZ3A 4P3YB 1F2EA 2IL3A 3APOA 1GSQA 4MF6A 4LL1B 4BVXA 4KB3A 3F9UA 4L0WA 2H30A 5GAND 4GQFA 3L9VA 2H72A 8GSSA 3GX8A 3FZ9A 4MJEA 1M7TA 1TI3A 1A0RP 1SU9A 3VK9A 4WEYA 4TR4A 4IBPA 4ZBAA 3FR9A 5LNKe 3W8JA 5AIVA 3Q6OA 1T1VA 2YPMA 3IAM2 3I9V2 2V1MA 3BOAA 4OD7A 4XS1A 2QGVA 1YF0A 2EC4A 5H5RA 3HCZA 2A2RA 4IJIA 1VF1A 1NHYA 2TIRA 3G7JA 1SKSB 5AIXA 1V9WA 3DVXA 3H8QA 3HXSA 5HQPA 4WBRD 5KN3A 1M9BA 2GZYA 2IFQB 2CT6A 2HSYA 1V98A 4J56E 1GP1A 3TGZA 2XBQA 6GSSA 2PU9C 3BCKA 1SL1B 1XWGA 2DBCA 1BEDA 3TKSA 4DSSB 2EIRA 3KP9A 4OCEA 3PGTA 5COHA 2GSSA 5F8BA 4MPGA 1J08A 2X99A 2JSYA 4YAPA 3LQ7A 2B1LA 1SENA 3FHKA 5JWQB 5D8IA 4X0XA 3VWVA 4MP4A 2HSHA 3UVHA 5ID2B 3IPZA 3KD0A 3APQA 3L9SA 4LA1A 3GHAA 4Q5RA 2GS3A 2I4AA 4RUVA 3HVVA 3KP8A 1AQWA 3WYWA 3N5OA 4N0ZA 1EGRA 2FLSA 4ISDA 1DBYA 3IV4A 1E6BA 4WR5A 2PN8A 5F07A 2DJ3A 2VL9A 2MZCA 3KTLA 4PNFA 1FVJA 5KN0A 1OVNA 2LS5A 4ZB6A 2L57A 4PUAA 3GKMA 1TU7A 2RUFA 3GN3A 2VAFA 2ALBA 1ZL9A 2IMKA 1TRUA 3EINA 5DALB 3VI7A 4I8BA 3EURA 3G9BA 1FOVA 3UOMA 3VURA 4ML1A 4ZIJA 3H4KA 1THXA 2IWTA 3DD3A 5B6NA 2FNOA 3TJKA 4J2FA 4ZXGA 2YANA 1B48A 2L5OA 3KCMA 3GUSA 1PGTA 3ZLPA 2JZTA 3EVIA 3TRPA 3TKPA 3J7Yk 1EGOA 4CW9A 3C73A 4HZ2A 3M9KA 1AC1A 2C1YA 1PRXA 2C80A 2CV4A 20GSA 4ZL8A 2K6VA 1OC8A 1GULA 1V2AA 4WETA 2CX4A 2R3XA 1W4VA 2BMXA 3HJOA 3GV1A 5HFKA 5EPFA 1GUHA 1QUWA 3LSZA 4POLA 4GF0A 1ZGNA 4NV2A 3D0ZA 1VGLA 2K8SA 1EEJA 2RM5A 2WRTA 1HYUA 3IAS2 2HE3A 2M80A 5G1LA 3A2VA 3WT2A 3F4SA 2FWFA 2VM1A 4HQSA 2YJHA 2K9FA 2FWHA 3GSTA 4V1Ag 3ZFBA 5AN1A 3GL3A 2LNSA 2M72A 4ECJA 1OC3A 5EY6A 5ECMB 2DJJA 4MZBA 5INYA 4I97A 1B9YC 4GQCA 4AGSA 1A8LA 2WDUA 2DC5A 5CYYA 1TRVA 1WRYA 1PD21 4G2EA 3ZYWA 4MJBA 2K8VA 3UMAA 2JU5A 2KP1A 3Q18A 1N2AA 2H1DA 2ES7A 2LJRA 1F9MA 3MWHA 4ACSA 2C0FA 5DAKB 4IQ1A 1O8WA 1RW1A 4V2LA 4GWRA 3VPTA 1HNBA 1VF3A 1X5EA 4GCIA 2H70A 1PA3A 1PQNA 6GSUA 2CVBA 2VL2C 1PSQA 2B5EA 1R5PA 1JHBA 3ZVJA 1F37A 1HQOA 5FWGA 3MSZA 1A24A 2B7JA 1HNAA 3LJRA 1EZKA 4KCEA 1ERTA 3K8NA 3EE2A 1M9AA 4Q5QA 3C71A 3QOUA 4ECBA 2AJQB 2YV7A 2GSRA 5ENUA 4MABA 1TJDA 4ZBDA 1VF4A 2L6CA 1S3DA 1ERUA 2WGRA 3D21A 1GTBA 3O6TA 2QSIA 4XS6A 5JWOB 4F0BA 5DDLA 2J23A 14GSA 3DMLA 1FW1A 3A5WA 2AHEA 4HUAA 5CNWA 1TK5B 1NM3A 1O8XA 1OAZA 1WE0A 1Q98A 3ZMKA 4F0CA 2F3MA 3HZ8A 3IOSA 3TB2A 3IR4A 3M0FA 1GH2A 3FRCA 1ACVA 2HRFA 3J7Yb 4TVEA 5A4WA 1QQ2A 5CRGA 3TCOA 3UIWA 2LQOA 2RIIA 4TW5A 5IOWA 3E9JB 1EV9A 3P7XA 1K0OA 5IO0A 1XZOA 4JRRA 2YWMA 5GSTA 3GFKA 2AYTA 3VI5A 2A4VA 2CZ2A 4FYUA 4K9ZA 1KBNA 5F05A 2H75A 3IDVA 4EVMA 2NDOA 3HYPA 1FHEA 2RLIA 3D22A 2R5GA 3Q19A 1ZYQB 3GTUB 3ERWA 4PGTA 4V2MA 4WF4A 4XTSA 2NBSA 5IMVA 4I5QA 5ELGA 1YKCA 1K3YA 1URMA 1Z7PA 3ZREA 4YAVA 1EP8A 2CVKA 12GSA 1USBA 4OFTA 6GSXA 1FB6A 3LFLA 2H01A 1QMVA 5FT3A 1S3CA 2DMMA 5F06A 1DE1A 2IJYA 2B5YA 2FD3A 3S9FA 3M9JA 3HVXA 1G7EA 3RAZA 5IMDA 2LUSA 3KMNA 2PVOC 2H66A 4CHSA 1PL2A 3U5RE 4F82A 4NMUA 4TXOB 1GUKA 2YN1A 5E4WA 4HI7A 3TKSE 2H6XA 2E0QA 3HJMA 2OJLA 4L0UA 3IK9A 1YKAA 4FYCA 3CSHA 4ECCA 3TJFA 2VIMA 1GUMA 1N8JA 4HJ2A 2C0EA 3LGCA 1ZCPA 2GZPA 1R26A 3VWXA 16GSA 1Z3EA 2G0FA 4HZ4A 1DUGA 1BG5A 2B3SA 5KEJA 2LNTA 3QDNA 3VPQA 5A4VA 2O7KA 1T4ZA 3H1NA 4EDYA 3HHVA 4K2DA 18GSA 2O85A 4EC0A 4N0VA 4IS0A 1MD4A 3FEUA 4EUYA 3IE3A 4XRAA 3ISOA 3FKFA 4H86A 5B8AA 1MDKA 2H6ZA 1SYXA 3DXBA 5G5FA 1SJ6A 2WS2A 1GL8A 1AAZA 5ECLB 4Q5NA 4MMMA 2H0IA 3KTBA 4KX4A 1T00A 1A2JA 1G0TA 7GSSA 4POMA 6GSYA 4HU7A 2GQKA 2ZCTA 1Z6MA 1O81A 3GKKA 2IMIA 5KN2A 1JZRA 1G6YA 3F0IA 1H4OA 4KNDA 1SD9A 2HYXA 2X8CA 2B5XA 3FZ5A 4I2TA 1B4QA 4N11A 1CQGA 2R6KA 2GQLA 2DSAA 2EIOA 2DJKA 1X9WB 4K6XA 1SL2B 3NOFA 4LMWA 2YP6A 2AAWA 2KLXA 3RDWA 5LCZA 3H79A 3ZIVA 1U6TA 5ECRB 2OE1A 5IPHA 2N5FA 2X64A 4PQ1A 2PMTA 1LBKA 1QFNA 2X8GA 1DSBA 3F4TA 4XRDA 3CTGA 3A2XA 2LRNA 1O73A 4EDZA 4KGIA 4HDEA 1QK8A 3TJJA 1MDJA 1GNEA 1X0RA 2VD0A 5CP1A 3FR3A 2CVDA 2V32A 5JWRB 4TXVA 1R5AA 4L5LA 4HS1A 3C7MA 3LEFA 2FA4A 1XFLA 1VRSD 2NTOA 3DVWA 3QMXA 4FYBA 4IHUA 3LORA 3PR8A 1GSFA 2H76A 4XS4A 1PMTA 2ZUPA 5HR0A 2MBTA 3GMFA 4TOPA 3IBHA 2YJ7A 5J9BA 5ECOB 2VCZA 3IXRA 3EU3A 1GSSA 3ED3A 4HU9A 9GSSA 2XPDA 1K0BA 2DLXA 1MTCA 2VCXA 3NIVA 3P8WA 1S3AA 2PWJA 2Z9SA 2YZUA 1X9SB 4TR0A 2LTKA 3EC3A 2FWEA 2H74A 2MMZA 4GTUA 5AGYA 3L4NA 3ZIJA 3UBLA 1ZYEA 4PX1A 1M0UA 4DEJA 1U87A 1QXHA 1XWBA 1ZMAA 2EIQA 3F3RA 4DSQA 3KM6A 4EXJA 3HY2A 3UJ1A 4HJMA 4KCAA 2G2QA 3FK8A 3HZ4A 3TDGA 1T4YA 2N5BA 3US3A 4JEDA 2GGTA 3QD9A 2LV3A 2OBKA 2LRCA 4EE0A 4KAEA 1YF1A 1THOA 3L78A 4JR6A 1Z9HA 4RI6A 5D93A 2HZEB 4K7IA 5D73A 2J9HA 4BWQA 1TRWA 4TR3A 5B8BA 3F4RA 1FG4A 3WGXA 3UVTA 1GSDA 2CAQA 3KXOA 2H71A 1XW5A 4E8HA 17GSA 1X5DA 3IC4A 1WP0A 2GSTA 1FO5A 2VD1A 1G6WA 2C4JA 5IMZA 4NAXA 3ZITA 3JCML 4O5RA 2JADA 2ZNMA 4TR1A 3CSJA 4LMVA 1Z6NA 2LEGA 3CRTA 4HOJA 4GXZA 3TUEA 5J9CA 1TRSA 4IKHA 4KDUA 3HDCA 4BL7A 1IYIA 2A2SA 3TRXA 4PUFC 1ABAA 4ECIA 3KZQA 2H1AA 2IPAA 1X5CA 1A2LA 3G7IA 2E2GA 1T7PB 2L59A 1BQ7A 3VLNA 3GKNA 1SYRA 1TKDB 4XCSA 2NVLA 3GSSA 4ZB8A 3ZFLA 1T3BA 1XWAA 5DBQA 1OC9A 2M46A 2JZRA 4RI7A 2VLTA 2R4VA 1ILOA 3GH6A 5ECKB 4JE1A 3UL3A 1OKDA 3D4TA 4DVCA 1GTUA 5H5SA 3UARA 11GSA 2VLVA 2FUG2 4JR4A 1SJZA 3O3TA 4AJ6A 4DSRA 3CXGA 5DQSA 3GA4A 3E3EA 1YQ1A 2F8AA 3KJYA 2VCWA 3HA9A 3L0HA 3KH9A 2YWIA 1G7OA 4V2NA 1XPVA 5CRWA 1K0MA 4POKA 1GWCA 2B6MA 2IMFA 4QL9A 1E2YA 4GSNA 5J41A 5J3RA 5DCHA 3QFAC 5G1KA 4WXTA 3RPPA 2R37A 1AQVA 5JCWA 3DYRA 3EU4A 1YY7A 5ECQB 2JSZA 1GRXA 4ILFA 1BAYA 5J4UA 3CBUA 1K0AA 1TOFA 5G31A 5DJMA 4RQRA 1GNWA 2BJXA 4KSOA 4ULXA 2B1KA 4LLRA 2MMAA 4IP1A 1EEMA 2MMNA 3D5JA 4BVYA 4MH3A 2CAIA 1PX7A 2ON7A 1C72A 1YZXA 3C1RA 3LXZA 1K0DA 5HFIA 1A8YA 4KDYA 1GTIA 2V6OA 4OO5A 2KUCA 1WIKA 2H6YA 1YEXA 1SK2A 2MMOA 4TN8A 1I9DA 4BPYA 2LRTA 1TK8B 1PKWA 2I9HA 3L9UA 2GQMA 3A3TA 2VL3A 4K0NA 1XOAA 2H19A 3TOTA 1A23A 5HR2A 22GSA 1U88A 4ZBBA 1W89A 3TKSC 2HT9A 1BJXA 2OA7A 2GSQA 4ML6A 3DIEA 3EMPA 5B7CA 2F8FA 4O32A 1O7UA 1K0CA 1LJRA 5GZZB 3GRXA 3ZZXA 5DVBA 1ZOFA 1UC7A 4MPFA 3UEMA 4NV5A 1ST9A 2I81A 4JU5A 5LD0A 2ON5A 2HLSA 2X8HA 4MH2A 3FY7A 4G19A 1SK1A 4IN0A 3F63A 5ECIB 1HD2A 4YQMA 1RQMA 1NW2A 4AJ7A 5DALA 5B6MA 5JCUA 3FZAA 4L5OA 4KSMA 1K0NA 3WD6A 3IHQA 1F3BA 5L71A 5D9WA 1KNGA 4E8EA 4NHWA 1UA5A 2YV9A 1OE8A 1TDIA 3SWLA 5F0GA 4OWYA 2XHFA 2P31A 3WT1A 2WJUA 1XW6A 2DJ1A 4EKZA 1R7HA 3HJPA 2H1GA 4MA9A 4TKYA 1M2DA 1XCCA 2C3QA 3DRNA 1TK0B 1TTZA 6GSWA 1PX6A 5ECSA 5CRDA 3QAWA 2FA8A 4AF2A 1GSUA 1M2AA 3TOUA 4WBJA 4JZQA 2P5QA 4K7OA 4K0GA 2CA8A 4XIHA 3GH9A 3GL5A 5JCGA 2PERA 4MJCA 2H73A 2NPBA 3ZMLA 3HKRA 1UN2A 2TRCP 1FVKA 2VL2A 1AXDA 3KEBA 1Z5YE 3CYNA 1NHOA 3CMIA 3FR6A 1ERVA 1TW9A 3A2WA 1FAAA 4G10A 2CX3A 1YDKA 3PINA 3ME8A 1SL0B 2PBJA 4KDXA 2VCQA 2F9SA 4K7NA 2KHPA 1EOHA 1Z7RA 3WGEA 4G9HA 4IP6A 1U3AA 4ZL7A 4OFMA 1SKWB 1M99A 5DJLA 1X9MB 4QQ7A 2C0GA 5G30A 3HD5A 3P90A 3ZTLA 2OBIA 1PL1A 2PVQA 4PNGA 5E59A 5DAKA 3ERFA 2P5RA 4N30A 1TXXA 3QAGA 4JBBA 1ML6A 4L8EA 1SKRB 4MCUA 4HEA2 1SK0A 1WOUA 4MZCA 1SJIA 1FB0A 1NSWA 2OACA 3UBKA 2VUPA 4MF7A 2PGTA 3R2QA 4V1Ap 1AUCA 1XWKA 2DJ0A 5CAXA 2F51A 1TU8A 5IMAA 3LYPA 2V6KA 4POBA 2YWNA 3E0UA 1PN9A 1V57A 5FHIA 3RBTA 1M2BA 2GZZA 3CSIA 3EYTA 3LG6A 3BJ5A 3ZVJD 2L4QA 2LJAA 2IIYA 4I2UA 3TJBA 1T8EB 1JFUA 1XW9A 1XWCA 3WGDA 5A5KA 4HQZA 4F2IA 3RPNA 2H0GA 2XBIA 2GDRA 1B9XC 2XPEA 4OFNA 3C1SA 4XHMA 2HNLA 5EL8A 4KA0A 1XXUA 2PUKC 1TI1A 2H1BA 1YEPA 1RK4A 1UVZA 1B8XA 1KEBA 1AIUA 1GLPA 5ELAA 5ECHB 1OKTA 2E2MA 3TJGA 4K1FA 4FIWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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