2EIOA

Design of disulfide-linked thioredoxin dimers and multimers through analysis of crystal contacts
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKCFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin 1
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 26
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2eioA00
1U3AA 2FD3A 4XS6A 2G2QA 1MDKA 2GT5A 5EY6A 3VWWA 1DSBA 2B5YA 5G31A 3HHVA 5IO0A 2B5EA 2H1GA 3L0HA 4CHSA 2J23A 2OBIA 3GURA 2WULA 1KNGA 4HJ2A 3L9UA 3MDKA 3W8SA 2WDUA 3GH9A 2RLIA 4RI7A 3RPPA 3DVWA 4NAXA 2ON7A 2FWFA 3LQ7A 3OR5A 3GA4A 4BL7A 5B6NA 5AIVA 2OBKA 2NVLA 1M2AA 2HYXA 4QL7A 4D73B 1R5AA 1ILOA 5CRGA 5DBQA 1ZCPA 1O73A 1EOHA 1J08A 3EMPA 2YZUA 5KN2A 3O76A 1DUGA 3F63A 6GSUA 4MF6A 1T3BA 1XPVA 2NTOA 2C1YA 1YF1A 1NSWA 3KZQA 1S3DA 1M0UA 3UVTA 2JZTA 1IYIA 1Y25A 1SK0A 4LMVA 3ZTLA 1V98A 1F3BA 3GFKA 5ECPB 1GSYA 3GRXA 5L71A 2IMIA 1TW9A 4GWRA 2K8VA 1PL2A 3QOUA 1GWCA 3CRUA 4K8MA 1XWKA 2C80A 4MJEA 1TTZA 2EIRA 2PVQA 4X0XA 1K0AA 2FCHA 2V2GA 1GLPA 3APOA 3IRAA 4L8EA 1B4QA 1ERWA 4ZXGA 5F0GA 2DC5A 2B3SA 4E8HA 5J9CA 2J9HA 1K0DA 2K8SA 3I43A 1Q98A 2C8UA 1Z6NA 3UVHA 3EURA 3ZVJD 2AJQB 2F3MA 5ID2A 3FR9A 2IJYA 5C04A 2LJRA 1XFLA 4MLYA 3UJ1A 4HDEA 1NW2A 4MF5A 2H1BA 1Z3EA 1XWCA 2HFDA 1EEMA 1MTCA 1O7UA 5D8IA 2P5RA 1A2MA 2GTUA 3TKQA 2BMXA 3ERWA 2BJXA 1A8YA 16GSA 4O5RA 4K0GA 5HFGA 3L4NA 3F0IA 3ERFA 3CSJA 1TI1A 4KSMA 4L5OA 5HR3A 2ZCTA 4WBRD 1NM3A 3LFLA 3ZRDA 2R2JA 1ZL9A 3TRXA 4IBPA 5B7CA 3JCML 1G7OA 3Q18A 2WRTA 2D2ZA 3LYPA 5DCHA 1V58A 2PUKC 1ZMAA 1MDJA 2YJ7A 3APQA 5F05A 5G2ZA 2X8HA 4NV5A 3F4SA 1A2JA 1U87A 4Z7XA 4I2UA 4ZL9A 3DEXA 1Q4JA 3GHAA 4OCFA 2H76A 8GSSA 1M7TA 2LUSA 17GSA 3TUEA 1OC8A 4G10A 3CXGA 2GZZA 5FHIA 4ZBAA 2HRNA 1SYRA 3GX8A 2EIQA 3O3TA 3TCOA 1GNWA 4ZB8A 4HS1A 4V1Ag 2O89A 2YPMA 3S9FA 2H75A 4XRDA 3DKSA 3I9V2 3QR6A 2YV9A 4MZCA 4POBA 1OAZA 1THOA 3RAZA 4MA9A 5EVOA 4J56E 4KB3A 5JWRB 1MEKA 2GSSA 5GSTA 5D96A 2F51A 4K0NA 4FYUA 2JZRA 3EINA 3VWXA 5DDLA 2E0QA 2NBSA 4X43A 4PUFC 4TR0A 1GUMA 3IC4A 2H8LA 3H8QA 4CW9A 1FB6A 3GH6A 5GSSA 3HCZA 3HJOA 3UIWA 1K0CA 2MMNA 4PGTA 1HNBA 5CRHA 5JWQB 2PMTA 4OCEA 4XHMA 5ECLB 4PQ1A 6GSSA 3MWHA 1B8XA 3WGDA 5HR0A 2MYGA 4WKWA 4ZB9A 1WIKA 4EF0A 3IK9A 4TW5A 4ECBA 5DJMA 1BAYA 5ID2B 3GKMA 1SJ6A 2RIIA 2GSRA 4DEJA 5LNKe 2CX4A 3EU3A 2B6MA 4YQVA 2HI7A 3C1RA 4RUVA 3WT1A 3KP9A 2DJ1A 2YWOA 4ML6A 2O87A 2HE3A 1ST9A 2XPEA 2V41A 4K2DA 4DVCA 2DLXA 4YAPA 4ACSA 1BEDA 1O81A 2RM5A 3ZFBA 1R5PA 1JLVA 4RI6A 1UA5A 2XHFA 5ECOB 4KNDA 2L4CA 2YNXA 4FO5A 3P8WA 4JEDA 4XCSA 1R7HA 3KGKA 5FWGA 2L59A 4EUYA 2JZSA 4ZB6A 2HNLA 1XIYA 4EO3A 1YJ6A 4LA1A 2QGVA 4YQUA 4OFNA 4TOPA 1K3LA 2O7KA 4BVXA 1TDIA 1YEXA 2IN3A 4O92A 4XS4B 3GMFA 2R5GA 3HKRA 2X8CA 2C0FA 4F9ZA 2PBJA 4PUAA 4D73A 1YDKA 1S3AA 4WETA 2C3QA 4ZIJA 1TRVA 1PSQA 2V1MA 1KEBA 1RK4A 2OA7A 4MK3A 2P5QA 5KN0A 2FHEA 2C4JA 2ZNMA 1HYUA 2GSTA 3CSIA 1NHOA 2H6YA 2MMAA 3P7XA 3TOUA 1GULA 3H93A 2HSHA 4OWYA 3GX0A 3TJKA 4NHZA 1GSDA 1EV4A 1VF4A 3RDWA 3IR4A 3KTLA 2CV4A 1QMVA 1OE7A 3F9UA 1QK8A 1WOUA 1RW1A 2HZFA 6GSYA 3KCMA 1A23A 2OE3A 1X9WB 10GSA 1G6YA 5IPHA 3GYKA 1EZKA 2KUCA 2RUEA 1XVQA 2RUFA 4TR3A 3IAS2 3FR6A 1PA3A 4V1Ap 4IELA 2WB9A 3KJYA 1URMA 2ES7A 1N2AA 3PH9A 3ZYWA 2GGTA 4TXVA 4I6XA 3TJGA 1YF0A 4MZWA 4IP6A 2O85A 2C0DA 2V6KA 3HY2A 4Q5QA 4JR6A 1HNCA 4IKHA 2XBIA 4MJBA 3GV1A 1C72A 3HVXA 5A4UA 3DVXA 2I3YA 5ENUA 3TKSE 3ZVJA 3ME8A 1ERTA 2CT6A 5IMDA 3QFAC 2X64A 1SJIA 4KDUA 4GXZA 3O6TA 2M46A 1AQVA 4WBJA 1CQHA 3GSSA 1NHYA 5D73A 1FOVA 2VCTA 2DMLA 4JU5A 2FGXA 2GSQA 3VURA 3CTFA 1M2BA 1T8EB 3FR3A 2H6XA 3J7Yk 4TR1B 1J0FA 1THXA 1WE0A 1O8XA 3EMXA 4POLA 4OFTA 3TJJA 3UEMA 4IP1A 2DMMA 3TJBA 2TRCP 2WFCA 3ZIVA 2H72A 3GL5A 1SKSB 4XS1A 5F8BA 2VL2C 3GIXA 5CRWA 3M3MA 1V57A 1OC3A 2MBTA 3Q19A 4GCIA 1OVNA 4K7NA 3IA1A 2BTOT 4NV2A 1XW9A 2GT6A 3G9BA 2JL4A 9GSSA 3UBKA 4WF5A 2DIYA 4ZBBA 2JU5A 1SK2A 1SJZA 4EKZA 3KP8A 1GSEA 3HD5A 5H5SA 4PQIA 2LRNA 1O8WA 2VLUA 2H30A 4V2NA 1PRXA 5KN3A 3DIEA 1B9XC 3ZLPA 5GZZB 1K0MA 2CVBA 2ZUPA 4TVEA 5CO3A 2R3XA 2B7JA 3KIJA 1TRWA 3BJ5A 1T00A 3QPMA 1TJDA 3TKSA 3UL3A 3D0ZA 1LU4A 2H74A 1TU8A 4IQ1A 1GSFA 2E7PA 5JCWA 1AW9A 3E0UA 5EPFA 1K0OA 3BOAA 2OE0A 2IWTA 1RQMA 2I9HA 5D9XA 4ZL7A 1TKDB 2H1AA 5G30A 4I8BA 4KDYA 1GSSA 5G1LA 1M2DA 5LCZA 4HJMA 4GSTA 4GSNA 3TRQA 3EWLA 4AJ6A 1XW5A 1R4WA 4MF7A 4EVMA 1YEPA 4GF0A 3D22A 2DSAA 1ERUA 2HRFA 5DALB 4KX4A 6GSXA 2LTKA 2YWNA 4G19A 4IS0A 1CQGA 5AN1A 4IGJA 3FRCA 4JE1A 3GTUA 2HZEB 1TK5B 4PNFA 4DSQA 2I4AA 3TKRA 5IMAA 2CVDA 5F06A 2C3TA 1ACVA 3F6FA 3GKKA 4AJ7A 4LL1B 4MPGA 3L78A 3IV4A 4OFMA 1GUKA 2L57A 3ZMKA 5IMVA 1ON4A 2H66A 4NXIA 3ED3A 5HQPA 3HA9A 2L5OA 3DRNA 2KLXA 1F9MA 1QFNA 1XWGA 2OE1A 2K9FA 5CRDA 1MD3A 5J9BA 2H70A 2B1LA 11GSA 1B9YC 4XS4A 3C8EA 2VCVA 3HVVA 3QMXA 3LXTA 2L4QA 2OKAA 4L0WA 3D21A 1DBYA 4BWSA 4PQHA 1UN2A 1AXDA 3QD9A 2H0HA 3HJPA 5J3RA 2H0GA 5D9TA 1SD8A 3U5RE 3KM6A 5DAKA 4IJ3A 2QC7A 3KMOA 1ERVA 2VD0A 1GH2A 1GNEA 1MDIA 4HU7A 1TRSA 1IYHA 5INYA 5A4VA 1XXUA 1GLQA 1X5EA 3QAVA 5HR2A 3GUSA 3VLNA 1GTBA 4GRFA 1SL2B 2VCZA 3M8NA 6GSWA 2LSTA 3I69A 2A4VA 3ZREA 5CAXA 5IMFA 1SYXA 2YN1A 2PN8A 2YWIA 4IN0A 4Q5FA 1F37A 4WR4A 4LL4B 4RQXA 4OMVA 1QGVA 19GSA 2LKUA 1GTAA 1JLWA 4ZBDA 3EE2A 1H4OA 1WMJA 3IDVA 3BBYA 2MMZA 2GQLA 4FYBA 2YWMA 3D6IA 2F8FA 3H4KA 3WYWA 3ERGA 4CDOA 1TXXA 1W89A 1USBA 3UOMA 3MAKA 3VK9A 2GQMA 4WEYA 3BD2A 1PL1A 5B8AA 2LV3A 1KTEA 4IJIA 1DE2A 3D5JA 3V1WA 3Q74A 1LBKA 2IMDA 1WP0A 1T7PB 3P90A 4KUNA 1Y6EA 4YH2A 4JBBA 3GTUB 1AQWA 2LEGA 3AY8A 5IO2A 1EOGA 4MJAA 2FNOA 1SKRB 4GTUA 3A3TA 3IHQA 3KMNA 1FO5A 1V2AA 4EL1A 1AUCA 3N9JA 2LS5A 5FT3A 2VCQA 5E4WA 3RHBA 2PPTA 1OKDA 3HDCA 3PINA 2PGTA 3QAGA 4TXOA 3CBUA 3QCPA 1AC1A 3HZ4A 2PU9C 2CQ9A 4PX1A 3N5OA 1JZDA 1YZXA 4GQCA 4TR4A 4K6XA 1HD2A 4TR1A 5A5KA 1YQ1A 3EVIA 1VGLA 4MP4A 4LMWA 3TJFA 3KTBA 1E6BA 2MZCA 5JWOB 1A24A 4OD7A 2YZHA 2MBSA 5J5NA 2HT9A 4V2LA 1X5CA 4V2MA 3KH7A 5ECRB 2YP6A 1FW1A 4N11A 2TIRA 1UVZA 5CREA 3H79A 2L5LA 5DAKB 4MZBA 4N30A 2N5AA 1J9BA 4HQZA 2WS2A 3M9JA 2LJAA 3L9SA 2X8GA 2LNSA 2AYTA 2XC2A 4AGSA 4J2FA 3M1GA 1PGTA 1K3OA 4L0UA 5DJLA 3G7JA 2CAQA 4MCUA 2PERA 2C3NA 5ABRA 3GSTA 3F3RA 2IFQB 3TB2A 5IOXA 4FIWA 2P0GA 2REMA 3EU4A 1EP8A 3FZAA 2DIZA 2F9SA 4HEA2 5DCGA 4ILFA 4GSSA 3LEFA 3VFIA 2NDOA 2QKEA 2KOKA 2TRXA 6GSTA 4N0VA 1SD9A 5CNWA 5LD0A 1PX7A 1HQOA 5A4WA 1I5GA 3J7Yb 4LLRA 4MMMA 1XCCA 3ZMLA 3VPTA 1FVJA 3E9JB 4KA0A 1EEJA 1BQ7A 1K3YA 1XW6A 3H1NA 5DALA 3LGCA 3UAPA 4IHUA 2WJUA 2KP2A 4KDXA 1S3CA 2HZEA 5ECKB 1A0RP 2LRTA 2YCDA 5DVBA 3LORA 4HI7A 3D4MA 1EGOA 2C0EA 1K0NA 2HLSA 1G7EA 5B6MA 5C00A 1VF1A 2N5FA 4NPBA 2XPDA 4MDCA 2CAIA 2VCXA 3DXBA 1MD4A 3ISOA 2AV4A 2EC4A 4BPYA 3KD0A 3MSZA 5ECIB 2FWHA 5J4UA 5E59A 5HR1A 3CYNA 1TOFA 2CZ3A 3GNJA 4TXOB 2E2GA 1M9BA 3IAM2 3C7MA 3ZZXA 4G2EA 4JRRA 5GAND 5ELGA 1R26A 1TK8B 3LXZA 3MNGA 2VCWA 3FEUA 3F8UA 5H5QA 5IMCA 1XWBA 1O6JA 1JHBA 4I5QA 4TN8A 4IVFA 5KEJA 5IIZA 2FLSA 4NMUA 2H01A 1E2YA 1SKWB 3FK8A 2IMFA 5IM9A 3TOTA 4JZQA 4ID0A 3UMAA 1ZOFA 1GUHA 3WGEA 3CRTA 2O8VB 2N5BA 1TP9A 2OADA 3W8JA 1YKAA 2F8AA 4K7IA 5ECHB 2VLTA 3A5WA 2H71A 1GTUA 3ZITA 5DQSA 1GTIA 1DE1A 1OE8A 2B7KA 5IMZA 4GLTA 2I1UA 1OC9A 1T4ZA 3E3EA 3R2QA 1LJRA 4POMA 3PR8A 5F07A 4EC0A 2KP1A 1H75A 4QQ7A 4KSOA 2P31A 2JACA 2FA4A 3GN3A 2JSYA 1BG5A 3A2XA 1FHEA 5COHA 4EXJA 4HOJA 3HZ8A 1EGRA 4KCAA 1ZZYA 1KBNA 2LRCA 1I9DA 5B8BA 3RHCA 3NIVA 5HFIA 4N10A 1EP7A 1XOAA 2K18A 2FUG2 3VI5A 5IOWA 2C0GA 2A2SA 3GKNA 2V6OA 3UARA 2NPBA 3A2VA 4WXTA 1GP1A 3KH9A 3LWAA 1BJXA 2KHPA 1HNAA 3HXSA 5AISA 3ZIJA 1TK0B 4KCEA 3L9VA 2G0FA 1V9WA 3KXOA 2AHEA 3I6AA 2Z9SA 3IXRA 1BX9A 4PXOA 4NWYA 1TRUA 4ULXA 5CP1A 4G9HA 2LNTA 4KGIA 2GQKA 3WT2A 2R6KA 1JZOA 3VI7A 2VOCA 2WZ9A 4POKA 2DJ3A 1PMTA 1AAZA 1A8LA 4GQFA 3FKFA 5DQYA 4WR5A 4XTSA 3FHKA 3WGXA 2YJHA 3W6GA 1GRXA 4I97A 1ZYEA 2WCIA 4EDYA 3FZ4A 1T4YA 3D4TA 3QDNA 2DJ2A 2H19A 4NHWA 18GSA 1EV9A 1M9AA 1GSQA 1SENA 2VD1A 2VLVA 2VO4A 4FH8A 4WF4A 4ISDA 1VF3A 2IIYA 2H6ZA 20GSA 3HYPA 2FA8A 2M80A 2AAWA 3VWUA 1F6MC 2HSYA 2YOIA 2DJJA 4K7OA 5J41A 2HXKA 5D9WA 4HZ4A 3IOSA 4EDZA 1M99A 3SWLA 4J57E 3FYGA 4BA7A 4TRXA 5D9VA 4KAEA 4IW9A 5JCGA 1QXHA 3LYKA 2YV7A 3BCIA 4F0BA 1A2LA 2R4VA 2IMEA 2AB6A 2YANA 4AF2A 2V32A 1SK1A 2FWGA 4MABA 4RQRA 1WWJA 3FY7A 2IFQA 6GSVA 3EC3A 2LJKA 3FW2A 4X1UA 1OC9B 2XBQA 1X0RA 2GZYA 2GDRA 3DWVA 4XIHA 3TKSC 3SBCA 1O85A 4PURA 4OO4A 2I81A 5G1KA 4FYCA 3F4RA 1EWXA 1TU7A 2DJ0A 1WRYA 1XBSA 3EYTA 5HFKA 5H5RA 2FY6A 2QSIA 3UBLA 2CZ2A 5AGYA 2VL9A 1T1VA 1PN9A 3F3QA 3FZ9A 1X5DA 2VM1A 1ZYQB 1YY7A 4K1FA 3TRPA 4ECIA 2FWEA 3KEBA 2MMOA 2DJKA 4MPFA 1ZGNA 3DD3A 3CSHA 3RBTA 4ZILA 2E2MA 3US3A 4DSSA 2OACA 1G6WA 2K6VA 3ZFLA 3K8NA 4MH2A 4H86A 3TGZA 1Z7PA 3U6VA 5G5EA 5ECNB 2IMKA 2VM2A 2CA8A 2JADA 1U6TA 4F2IA 3IPZA 5D93A 3F6DA 1SL0B 3VWVA 1SU9A 1JFUA 1W4VA 4JR4A 1A0FA 22GSA 4HU9A 1XZOA 4L5LA 5ECMB 1X9SB 3DMLA 4HZ2A 4MH3A 5GAPD 3GL3A 2GLRA 1VRSD 1FVKA 2H73A 1QQ2A 1N8JA 3M0FA 1JZWA 2A2RA 2AUVA 2VAFA 1XVWA 3ME7A 1JZRA 5IQYA 2L6DA 1OKTA 1FAAA 1WPIA 1FG4A 2GVPA 4OO5A 4YAVA 4O32A 4K9ZA 4F0CA 2LQOA 4Q5NA 5IPGA 2PVOC 1AIUA 1F3AA 3A2WA 2RM6A 1PQNA 5AIXA 1K0BA 5EL8A 4E8EA 2OJLA 2R37A 1Z6MA 4O7HA 3DGQA 4ML1A 3P2AA 4KE3A 2JSZA 2VL3A 5CYYA 2VL2A 1UC7A 4P3YB 1Z9HA 3Q6OA 4BWQA 3BCKA 3FZ5A 2B1KA 3G7YA 3WD6A 1QUWA 4IQAA 4KH7A 1TI3A 2IPAA 5KN1A 5ELAA 2H1DA 1SL1B 4XRAA 3DYRA 3PGTA 1PD21 12GSA 3QFBC 4HQSA 4N0ZA 4HUAA 1F2EA 4BVYA 2DBCA 1X9MB 1U88A 3GKXA 4PNGA 2PWJA 1YKCA 5ECSA 1PX6A 2GZPA 3VPQA 1OYJA 4EE0A 1VF2A 3TDGA 1B4PA 1FB0A 4MJCA 1XOBA 3IK7A 4ECJA 3M9KA 4I2TA 1Z7RA 1PKWA 3HVSA 5JCUA 2X99A 3G7IA 4ZL8A 4KW6A 4F82A 13GSA 3IE3A 2CVKA 1GSUA 4AJ8A 2L6CA 4ECCA 2LQQA 1BYEA 4TKYA 3C71A 1Z5YE 2EIOA 3ZL5A 3NZNA 3LG6A 4DSSB 2ALBA 1ABAA 1U3IA 2WGRA 7GSSA 5G5FA 4F03A 3C73A 2VIMA 1WJKA 2M72A 1AQXA 1PKZA 3CMIA 3APSA 3TKPA 2CX3A 2ON5A 3F4TA 3RPNA 2B5XA 3CTGA 3LJRA 3NOFA 4QL9A 1B48A 3HJMA 4YQMA 3LSZA 1GL8A 3C1SA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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