2EIOA

Design of disulfide-linked thioredoxin dimers and multimers through analysis of crystal contacts
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKCFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
publication title Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin 1
total genus 26
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2eioA00
1JZRA 4YQMA 2JU5A 4HQSA 1EEJA 4XS4A 1M0UA 5JCWA 3EU3A 4GWRA 3IK9A 5CREA 1F2EA 4F2IA 3HVSA 1OYJA 1J08A 4TXOA 4BL7A 2C3NA 2VUPA 1OAZA 3CRUA 4JEDA 3UARA 4WXTA 1DBYA 3KGKA 5HR3A 2LJAA 1OKTA 1QFNA 4J56E 2VO4A 2HYXA 4ILFA 5CP1A 4F0CA 3F4RA 2IPAA 2O7KA 3BCIA 3US3A 3HKRA 1K0NA 1MD4A 2C3QA 2I81A 3RHBA 4POLA 1KBNA 1WWJA 2L4QA 4TN8A 1QMVA 1PRXA 2IMIA 3QPMA 3F0IA 2DC5A 2C0FA 3ZIJA 2N5FA 1UA5A 3TKSC 3GTUA 4V1Ag 2GT5A 2M72A 3G7YA 5LCZA 2IWTA 3M9JA 2LRTA 5DALB 2VCWA 3ZRDA 2CAQA 1DUGA 2RM6A 1ZZYA 3VI7A 3DRNA 1SK1A 4HQZA 3A5WA 1MDKA 1MTCA 1BYEA 3L78A 1E6BA 1C72A 3KMOA 1GSFA 4XTSA 2XPDA 2E2GA 3E9JB 4WKWA 5F0GA 2OE0A 4ECBA 3N5OA 5F8BA 4CW9A 4D73A 3EWLA 2FUG2 2GQKA 4ZIJA 4HEA2 4MDCA 2FA8A 2H6YA 1WOUA 5ELGA 1AW9A 4BVXA 4G9HA 3VFIA 4X43A 4GRFA 2GGTA 3I43A 1NSWA 4NV2A 3UBKA 2OKAA 2NVLA 4Q5NA 3D4MA 1TU7A 2ZCTA 1O73A 3LFLA 2C3TA 3L9SA 3HJMA 1XW9A 2CX4A 2PVOC 3JCML 1V2AA 2G0FA 4OWYA 1BEDA 3C1RA 4IGJA 1TKDB 3F8UA 3EURA 2RLIA 1TK0B 3P8WA 2ON7A 1FVJA 4K7NA 4MZBA 2L5LA 1M2DA 3IV4A 1YF0A 4JR4A 2AV4A 3GKXA 3NZNA 2JACA 2XPEA 1YY7A 3KH7A 2LQQA 2GSQA 3GL3A 2X8CA 1M99A 3F6DA 5G5EA 2B5EA 3FZ5A 2WULA 3H4KA 3MDKA 1R5PA 3DWVA 3GFKA 3HVXA 1TDIA 2DJ2A 4LL1B 4F82A 2M46A 2M80A 1B4PA 4FYCA 1VF1A 2ALBA 4PQHA 4DSQA 4ZBAA 4HU9A 1TRVA 1T4YA 3HDCA 5ECMB 1HNAA 5LD0A 5F07A 4GXZA 3ED3A 2ZUPA 4MABA 3VWVA 2H0IA 1YZXA 1YEXA 22GSA 2OBIA 5IMVA 3W6GA 2YJ7A 5D9WA 3TOUA 1V57A 1SYXA 2LKUA 2WCIA 4AJ8A 4XIHA 4QQ7A 3CMIA 2WJUA 1AAZA 3E0UA 2YPMA 5IPHA 1GSQA 2GQMA 3VWXA 2IJYA 3GUSA 3D22A 3ZFLA 1JLWA 3ISOA 3F63A 3M0FA 1JZWA 1U88A 4PX1A 2J23A 3ZTLA 1V58A 4OFMA 5CNWA 1JFUA 5DVBA 1SKRB 4ULXA 2L59A 3ZMLA 2YNXA 17GSA 2H30A 2E0QA 1AIUA 2E2MA 2YZHA 4ZL8A 1JLVA 4OO5A 1J0FA 2LRCA 2E7PA 2GT6A 5DALA 1ERWA 5G30A 1TOFA 3H1NA 4IQAA 4ID0A 2JZSA 3GHAA 2PBJA 5B8AA 5B7CA 2B7JA 5IMCA 3RPNA 2L6CA 3GKMA 1DSBA 2VOCA 1SK0A 4MA9A 1G6WA 5J5NA 2YV7A 2YOIA 2HZEB 3KZQA 5B6NA 1RQMA 2VCQA 4LMVA 5DQYA 3G7JA 1TJDA 3APOA 1T1VA 4XS4B 2B5YA 4KDXA 3BOAA 4YAPA 3H79A 2FGXA 1S3CA 2VL3A 4MP4A 1F9MA 4HI7A 4OMVA 4XS6A 4J57E 3FW2A 4TXOB 6GSXA 3FR9A 2HE3A 3QDNA 1R5AA 2GVPA 1XWKA 1KEBA 2B1LA 3HHVA 1HNBA 4PQIA 4RI7A 3KJYA 3QAVA 4EF0A 1TRUA 1B9XC 4JZQA 3WT1A 4EUYA 2MMOA 5A4UA 4CHSA 1T3BA 4JU5A 3KEBA 3UL3A 2OBKA 4GQFA 5IMFA 1XBSA 2LUSA 4MF6A 3E3EA 2GLRA 2VD1A 5CAXA 3V1WA 3GKKA 2MMZA 3QOUA 5L71A 2CVKA 4HJ2A 1GUHA 2CAIA 1H4OA 4MJBA 1XPVA 1CQGA 1Z9HA 4KSOA 3GRXA 2DJJA 1M7TA 5E59A 1ILOA 1GSSA 3TOTA 1X5DA 3TKSA 4OFNA 1SENA 4PNGA 1XOBA 2WS2A 1V98A 3L4NA 19GSA 2PGTA 5D73A 1FAAA 5G1KA 3RDWA 3IXRA 2VM1A 4D73B 2G2QA 3L9VA 2IL3A 2YWOA 3AY8A 3GH6A 2HT9A 4F9ZA 5EPFA 3DVXA 4AJ7A 4NXIA 4OFTA 3UEMA 2TRCP 4GF0A 1B9YC 4E8EA 1URMA 2DJ1A 2IMEA 2GDRA 3PH9A 1PA3A 3ZFBA 2HI7A 3F9UA 5INYA 4IJIA 4I5QA 3HCZA 4ML6A 5F05A 2PU9C 2PWJA 2OA7A 4K8MA 3ERGA 2DJKA 4JR6A 3EC3A 3VPTA 4ZB6A 1UVZA 3EVIA 4GSSA 4IVFA 2VAFA 2A4VA 1YDKA 3IBHA 2KP1A 1TRWA 1IYIA 1Z5YE 1H75A 2LNSA 3ME8A 4KCEA 3CYNA 4BWQA 1KNGA 2NDOA 2Z9SA 4KDUA 4KE3A 3Q74A 4L5LA 2MZCA 4IBPA 1FG4A 3UBLA 4LLRA 4ZL7A 1AC1A 1TTZA 3O3TA 1GNEA 4MZWA 1EZKA 3KXOA 1FO5A 3DVWA 5E4WA 4QL9A 2EC4A 3D0ZA 5IQYA 3K8NA 3BD2A 3HJOA 4KA0A 3R2QA 4I97A 2H66A 2H6XA 3FEUA 1JZOA 3TRXA 4YH2A 2WFCA 3H8QA 2FWEA 3QAWA 5JWRB 1OC3A 4HOJA 4WETA 4LA1A 6GSVA 2LTKA 3FZAA 5KN0A 1AQWA 1PD21 3BBYA 1G6YA 11GSA 2IIYA 3G7IA 1W4VA 3GN3A 1I5GA 4I2TA 5IMZA 3RPPA 2V6KA 3WGEA 4QL7A 2VLTA 2FWFA 3CBUA 4O5RA 3QFAC 1GSEA 3FR6A 4OD7A 1GLPA 1SL1B 4IS0A 2KUCA 1FVKA 3MWHA 1NW2A 1YF1A 2RUEA 1JHBA 2X8GA 1O81A 3U6VA 3A3TA 3IR4A 5IO2A 3VWWA 2JL4A 1WJKA 3N9JA 2HFDA 3CSHA 3A2VA 1EOHA 2QSIA 3M3MA 4I8BA 1GTIA 3J7Yk 1ERUA 2VL9A 2B3SA 1PN9A 2FWGA 4KB3A 2AYTA 2DBCA 1AUCA 1IYHA 1THOA 1EOGA 1NHOA 3VLNA 4IKHA 2C8UA 1XWCA 2L57A 1T4ZA 4AGSA 2WZ9A 4E8HA 4K9ZA 2O85A 4EL1A 3DXBA 4JRRA 4JBBA 4Q5FA 1SK2A 1XZOA 1MEKA 2PUKC 5AIXA 1TRSA 1SJZA 4WR5A 3G9BA 3NIVA 3HZ4A 2B6MA 2DMLA 4IQ1A 2KP2A 1V9WA 3C1SA 2KOKA 2O8VB 1A0RP 1ACVA 3A2WA 1G7EA 5IIZA 4GQCA 5AGYA 4O32A 2H71A 4WR4A 1EEMA 2C4JA 3RAZA 2K18A 5IO0A 3GNJA 3UVTA 3HJPA 4MJEA 2HSYA 3Q18A 1GRXA 1M2BA 1GH2A 4CDOA 4H86A 3HZ8A 3QR6A 4BPYA 20GSA 4FO5A 5ECLB 3LEFA 5J9CA 1EV9A 2DIZA 2OJLA 1USBA 4EKZA 1K3OA 2DMMA 2HNLA 4X1UA 2AJQB 1K0AA 2C0GA 5DJLA 4ECCA 3MNGA 4MPGA 2LS5A 1XW6A 5ECQB 3CTGA 1TI1A 3KH9A 12GSA 1ZCPA 1X9WB 1XVWA 2V6OA 1Q4JA 2R5GA 4NPBA 1OVNA 1GUMA 4IP6A 1UN2A 1QUWA 4PURA 3IPZA 3RBTA 4NV5A 1A8LA 3F3RA 2YWNA 4F03A 4L8EA 1A23A 3KMNA 4F0BA 2LQOA 1PX6A 3GSTA 3S9FA 1XFLA 4TW5A 4MZCA 3LORA 1XIYA 2CV4A 3IE3A 2XBQA 3TJGA 1ZOFA 3APQA 5FT3A 5HFIA 3CSIA 2ON5A 3TJKA 5J4UA 2REMA 1SYRA 2D2ZA 2VCZA 4FYUA 5DBQA 5ECOB 3EU4A 3H93A 2K8VA 2AAWA 4X0XA 2DSAA 1ERVA 1T00A 3BJ5A 3LXZA 2DIYA 2H01A 3PR8A 3WD6A 1X5EA 2JZTA 4KSMA 1QGVA 4RUVA 2CT6A 3LGCA 3W8SA 2N5BA 4TOPA 1A2MA 2P5QA 4DSSA 1Q98A 3ERFA 2R3XA 2F8FA 3F3QA 2YCDA 4HDEA 2FWHA 5HR1A 4HZ4A 4K7OA 1TW9A 3GH9A 2K6VA 4XCSA 4N0ZA 5FHIA 1F3AA 4HUAA 2H76A 4V1Ap 3WYWA 1ERTA 2RIIA 4MMMA 3IA1A 3TKPA 5D8IA 1BAYA 3VWUA 3TGZA 4BWSA 3I9V2 4MK3A 7GSSA 2HZFA 2H0HA 5IOWA 4AF2A 2QC7A 4HS1A 4ISDA 1BJXA 3HXSA 4ZB9A 1NM3A 1AQVA 3FK8A 3GL5A 2YANA 2BTOT 4MH2A 4V2LA 1O8WA 4TKYA 2P0GA 4TR3A 4TRXA 2TIRA 1YJ6A 3O6TA 3IC4A 6GSYA 1R7HA 1TK8B 3A2XA 1MD3A 3KD0A 6GSUA 2K9FA 5JCGA 2MMNA 1O8XA 1M2AA 4K2DA 3SBCA 5H5RA 4GSNA 2DLXA 1EGOA 3D4TA 1YQ1A 5JWQB 2B1KA 5KN1A 2ZNMA 3J7Yb 1N2AA 3FR3A 3I69A 2MMAA 3FZ9A 5EY6A 3DIEA 5D9XA 3FY7A 2XC2A 2WB9A 3C73A 4DEJA 4WEYA 5ECRB 4AJ6A 1J9BA 3TB2A 5IPGA 3DEXA 2DJ0A 4IJ3A 1GTAA 3M1GA 2R37A 5CO3A 4KW6A 1UC7A 3GX8A 2YWMA 1PGTA 2QGVA 5H5SA 4LL4B 4PNFA 1OE8A 4XS1A 3IOSA 1LJRA 3DMLA 2LJRA 1B48A 3M8NA 2LNTA 4OO4A 2FNOA 5ELAA 1A24A 1Y6EA 4NMUA 3KIJA 13GSA 2L5OA 4MF7A 2MYGA 4YQVA 3D6IA 2C1YA 3UOMA 2X64A 3PGTA 5D93A 1HQOA 2H1DA 3GURA 3KM6A 2R2JA 3QD9A 1U3AA 4O7HA 2HRNA 1F3BA 5B8BA 5HR0A 5AN1A 2IFQA 3DGQA 3I6AA 1BQ7A 1EWXA 2GZPA 2FD3A 1QK8A 1Z6NA 2GZZA 1ZL9A 3HY2A 2YJHA 3L9UA 4YAVA 1PL1A 1ZGNA 1MDIA 3KTBA 1LBKA 4KH7A 2HRFA 1T8EB 4MJAA 2F51A 3GX0A 4KUNA 1K0MA 3KP8A 3GA4A 1U3IA 4POBA 4Z7XA 2GSRA 4EXJA 5ECNB 3D5JA 3P7XA 1LU4A 3DYRA 5DCGA 3UAPA 2L6DA 2PVQA 1EGRA 1AXDA 5A4VA 3GSSA 4IHUA 3ZLPA 4MH3A 4N30A 3TKRA 1M9AA 3IAS2 1PKZA 1DE2A 3L0HA 5ECSA 1WE0A 1Z6MA 6GSWA 4XHMA 5DCHA 2EIOA 1G0TA 4FIWA 5ECIB 3ZZXA 3LYKA 2F3MA 3HA9A 3SWLA 1K3YA 2KHPA 1S3DA 3GKNA 5CRGA 2NBSA 3VK9A 3ZITA 3ZVJA 5IMDA 3VPQA 1HYUA 2PPTA 5A5KA 4PQ1A 4RQRA 1E2YA 5B6MA 5ID2A 2H74A 2J9HA 2RUFA 2X8HA 5KN2A 4G10A 1TP9A 1O85A 4IN0A 1Z7RA 1K3LA 5DQSA 2GS3A 2B7KA 4K0GA 4L5OA 2O87A 4KGIA 5D96A 3LJRA 2WRTA 5CRWA 3TRQA 5HR2A 5CYYA 1XWBA 1TXXA 3HD5A 4ECJA 3TKSE 3C8EA 3TKQA 4YQUA 1X9SB 3WT2A 3MSZA 2O89A 2HLSA 4WBJA 3KP9A 1DE1A 1MDJA 1FOVA 2A2RA 3ZMKA 3F4SA 2VCTA 3IHQA 2VL2C 4TR1B 4NWYA 1A2LA 3CXGA 2QKEA 4DSSB 1SD9A 2LV3A 14GSA 1XVQA 1PSQA 3CSJA 1YKCA 2H1GA 5IOXA 1R4WA 18GSA 2CZ2A 5J41A 1GSUA 4ECIA 4GCIA 4ZXGA 4V2MA 3QCPA 3M9KA 3TCOA 1OC9A 6GSSA 4BA7A 2OE1A 1B4QA 4TXVA 1THXA 1X9MB 1M9BA 4N0VA 2VCXA 4XRAA 1XCCA 2X99A 3ZIVA 1R26A 3FHKA 1FW1A 2YWIA 5H5QA 4DSRA 2C0EA 3DD3A 1GTBA 2H1AA 1EV4A 4Q5RA 2I9HA 5G31A 3KCMA 2LJKA 5D9VA 3C71A 2H70A 5IMAA 5KN3A 4OCEA 4RQXA 5J3RA 1WPIA 4V2NA 1GSDA 3NOFA 3OR5A 1SD8A 1NHYA 5FWGA 4WF4A 2H1BA 4G19A 4PXOA 4GLTA 3WGXA 2R6KA 1AQXA 2P31A 4MPFA 4KNDA 3RHCA 1PQNA 4KAEA 1A8YA 1JZDA 4L0UA 4EDYA 5EL8A 1SKWB 2ES7A 4IELA 1GULA 4MLYA 2P5RA 2H75A 2GZYA 5HFKA 2CQ9A 3GIXA 4JE1A 1U6TA 5IM9A 1PX7A 4IP1A 4GTUA 1Y25A 2YP6A 2H72A 3CRTA 3EMXA 3IAM2 1O6JA 4OCFA 5DAKA 1OC8A 1GWCA 4KCAA 2YZUA 3QMXA 1RK4A 2OACA 1G7OA 4MCUA 2FA4A 3U5RE 3HYPA 4GSTA 2JZRA 2VM2A 4EC0A 4PUFC 4K1FA 4RI6A 2VCVA 1SU9A 4MJCA 2VLVA 2H8LA 4XRDA 2MBSA 2HXKA 1K0BA 1TU8A 3TRPA 2PN8A 1GLQA 5C00A 2YN1A 1GSYA 1V40A 3EINA 5G5FA 4ZBDA 1FHEA 3LYPA 1EP7A 2OE3A 3TJJA 1OKDA 4I6XA 4KDYA 2IFQB 2N5AA 3VURA 4WF5A 3MAKA 1X5CA 1S3AA 2TRXA 1XXUA 1VGLA 3IRAA 1K0OA 5GSSA 3WGDA 3C7MA 2K8SA 3O76A 3BCKA 1ST9A 5AIVA 5J9BA 2GSTA 6GSTA 1QQ2A 3ERWA 2L4CA 16GSA 3ZL5A 5GAND 9GSSA 5G1LA 3GV1A 2BJXA 1F37A 1Z7PA 3QFBC 2B5XA 5CRHA 1F6MC 1TK5B 1ABAA 3IDVA 4TR1A 2NTOA 1U87A 1XOAA 2I1UA 5ABRA 3D21A 2MBTA 1WP0A 3Q19A 1YEPA 1CQHA 1QXHA 1SJ6A 1A2JA 3APSA 2CA8A 5C04A 1WIKA 4Q5QA 3P2AA 1GNWA 3LQ7A 4HU7A 5DJMA 3FYGA 3CTFA 5JWOB 3TJFA 4NHZA 3FRCA 3GMFA 2OADA 3LG6A 2GSSA 2PMTA 4EDZA 5GSTA 4ZL9A 3UIWA 5KEJA 3VI5A 4DVCA 1XWGA 4EO3A 3F6FA 4K6XA 1FB0A 5ID2B 4POKA 3UMAA 3FKFA 3EYTA 1K0DA 4TR0A 4TR4A 2RM5A 4IW9A 5AISA 3ZYWA 1GP1A 1BX9A 1OE7A 2C0DA 3F4TA 3GYKA 3ZVJD 5HQPA 2IMDA 1SL0B 2AB6A 1VF4A 1GTUA 4N11A 5G2ZA 4PUAA 2JSYA 2WDUA 3TDGA 2HSHA 2WGRA 1SL2B 2CX3A 3ME7A 4ACSA 4POMA 1PL2A 1SJIA 2KLXA 4G2EA 1ON4A 2GTUA 2V1MA 2AHEA 4K7IA 1B8XA 1ML6A 5HFGA 2H73A 10GSA 1VRSD 3GTUB 1VF2A 1T7PB 4ML1A 1VF3A 2JADA 1BG5A 2VL2A 4FYBA 1FB6A 3LWAA 4ZILA 5ECKB 1I9DA 1XWAA 2H6ZA 5GAPD 1OC9B 2IMKA 2FCHA 2EIRA 5ENUA 1TI3A 1ZYQB 1HNCA 4L0WA 3W8JA 2AUVA 5EVOA 4I2UA 4HJMA 3TJBA 1KTEA 4J2FA 2V41A 2JSZA 2NPBA 1Z3EA 4ZBBA 4TVEA 8GSSA 3EMPA 2I3YA 2IMFA 2GQLA 2EIQA 1A0FA 2F8AA 2BMXA 1PKWA 4P3YB 1O7UA 4K0NA 3LXTA 1WMJA 5ECHB 5JCUA 2C80A 5GZZB 2LSTA 2CVDA 5DDLA 1WRYA 2XBIA 3FZ4A 5COHA 1W89A 2F9SA 1YKAA 5F06A 1GL8A 1GUKA 2A2SA 2FLSA 3TUEA 4MF5A 4KX4A 2V32A 2CZ3A 1X0RA 3QAGA 4NAXA 2VLUA 1EP8A 3Q6OA 2VD0A 3EE2A 1HD2A 4N10A 5D9TA 4NHWA 4LMWA 3PINA 3DKSA 3ZREA 1N8JA 4ZB8A 2LEGA 1ZYEA 4FH8A 5DAKB 3KTLA 5A4WA 3LSZA 1XW5A 2FY6A 2H0GA 5ECPB 4HZ2A 3P90A 3UVHA 1K0CA 5CRDA 3HVVA 3IK7A 2LRNA 1ZMAA 4O92A 2H19A 2I4AA 4WBRD 2PERA 2VIMA 4EE0A 2CVBA 2IN3A 3UJ1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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