2EIQA

Design of disulfide-linked thioredoxin dimers and multimers through analysis of crystal contacts
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAACKVGALSKGQLKEFLDANL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin 1
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 31
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2eiqA00
1TDIA 3U5RE 1PKWA 4OCFA 3UARA 5HR0A 4F03A 1T00A 4EL1A 4GSSA 1BYEA 4MJAA 1GWCA 4K7IA 3VLNA 4PUFC 2CQ9A 3WGXA 3RPPA 4F2IA 1Z5YE 5JCWA 3APOA 2H8LA 5IO2A 3ERFA 2N5BA 5A4UA 5F07A 3KXOA 5J41A 2XHFA 1WE0A 1X5DA 11GSA 3A3TA 1FB6A 1WRYA 3F9UA 4WR4A 1TRUA 2V6KA 1TK5B 2DC5A 3MAKA 3GUSA 4MZCA 3QMXA 4MH2A 1NW2A 4O92A 1M99A 1TXXA 1ZZYA 2YWNA 4PGTA 1WOUA 4I97A 2O85A 4N11A 4ZL7A 1BQ7A 4ZXGA 4ZL9A 4HS1A 5ECLB 5COHA 5DALB 1NSWA 2YCDA 4MZBA 2X64A 5ECHB 1ILOA 3PINA 4POKA 4TXVA 3HCZA 3QDNA 2C3QA 1PQNA 3F6DA 1R26A 1HNBA 4E8EA 1HD2A 1HNCA 3NOFA 2HFDA 2LKUA 5F05A 4KH7A 1SJIA 3HJPA 2OA7A 4EUYA 2B6MA 2HE3A 2HSYA 4HEA2 4WF4A 2N5FA 3FKFA 3J7Yk 4KX4A 2L57A 1TTZA 4HI7A 1XVWA 2YP6A 5HFIA 3ISOA 1SENA 1K3OA 4WF5A 2XC2A 4POLA 4TXOA 5ECMB 3EU4A 4KGIA 1K0OA 2DJ0A 3QAVA 2IPAA 4Z7XA 1Z9HA 2I1UA 4ID0A 4AF2A 4HJ2A 5DBQA 3A2WA 1OE7A 1Z6NA 1YKAA 2MBSA 4MABA 4N0ZA 6GSSA 3EURA 4GQCA 3W6GA 1PKZA 1V2AA 5ECSA 4NXIA 1V40A 3D21A 3RHCA 4EVMA 5J4UA 2E7PA 4DSSA 4EF0A 1HYUA 2JU5A 3TUEA 3I43A 3CYNA 2GS3A 1F2EA 2O89A 1JZDA 3L9VA 5IMDA 5E4WA 2CA8A 3IHQA 3HYPA 1Y25A 3HZ4A 3GH6A 3ZMKA 3H79A 3KMNA 2WS2A 3H8QA 1MDJA 1LJRA 2C3NA 2X8GA 4GF0A 3CXGA 1G7EA 4ECBA 2VL3A 4MF6A 4XRAA 2H0HA 4MCUA 3Q19A 2JZSA 1WWJA 2CVBA 1JZOA 2NBSA 5ECIB 3SBCA 4PNGA 3HVSA 1XW9A 1VF3A 3QPMA 3GA4A 4Q5NA 4J2FA 2C8UA 4G19A 3VPTA 2G0FA 2XBIA 1Z6MA 3F3QA 4IKHA 3NZNA 3C8EA 1BJXA 3WD6A 4IP1A 3TJGA 1CQGA 3VK9A 5ECPB 1ZGNA 4GRFA 5D9WA 5KN1A 1IYIA 4TR3A 3ZRDA 4JEDA 1OC8A 1Q98A 2GT6A 2LRNA 1V58A 1B9YC 1QMVA 2H0IA 3N5OA 5C00A 1M0UA 4G2EA 4EC0A 18GSA 2H01A 4ML6A 2AYTA 1YKCA 1R7HA 1I9DA 1M2BA 2DSAA 4XIHA 5G1KA 4ECCA 2ZCTA 4PX1A 3QOUA 4DSQA 2YN1A 1M9AA 1OYJA 1X9SB 2C1YA 5IMVA 3O3TA 3ZVJD 1JZWA 4PURA 2KUCA 5D9VA 5KN2A 3US3A 5DJMA 2HYXA 2ZUPA 5D73A 1ERUA 1SL2B 3RAZA 5IMZA 5IO0A 2IMEA 4TR0A 2KP2A 3TKSC 1VF1A 3LXZA 1YY7A 3VWUA 2F8FA 1WJKA 1AIUA 3DGQA 2ON7A 1EGRA 2L59A 2IIYA 2VCZA 3EC3A 4OO5A 3ZMLA 2ZNMA 4KCAA 4IN0A 4JR4A 5G30A 2MBTA 4YH2A 5J3RA 4MMMA 1XW5A 1S3DA 4MJBA 2I4AA 2L6DA 5ABRA 16GSA 5D96A 2VUPA 2GSQA 1ST9A 1YDKA 3LFLA 4KDUA 4FYUA 20GSA 5A4VA 4MH3A 1A8LA 2H76A 2C0FA 2WGRA 4NPBA 2PU9C 3N9JA 4XS4A 2DIZA 4OO4A 1EEMA 5D8IA 4BWSA 4O5RA 2WZ9A 3WYWA 2L5LA 2R2JA 5DQSA 3CSHA 4PQHA 1BX9A 1XOBA 1O81A 3FHKA 1F6MC 1SL0B 5H5RA 2EIOA 1Q4JA 3IV4A 4K9ZA 2YV9A 4KA0A 3O6TA 4PNFA 2D2ZA 1X5CA 3ZREA 3WGDA 1GSQA 2J9HA 4BVXA 2X8HA 2A2RA 3D22A 3C71A 1O73A 2GDRA 3A5WA 3BD2A 3LEFA 2AAWA 1G6WA 4TR4A 5HFGA 3OR5A 2DBCA 2O7KA 4MP4A 1X0RA 2B1LA 1N2AA 2RUFA 4WKWA 4N10A 3HKRA 3VPQA 4HQZA 3EWLA 3LSZA 4KUNA 3FEUA 4GQFA 1NHYA 4HU7A 2XPEA 2C80A 2RLIA 5A4WA 3VI5A 4XS1A 2LRTA 1OC3A 3A2VA 1K0CA 2E2GA 2YJHA 3L0HA 1GSEA 1QK8A 3D0ZA 1LBKA 1G6YA 2E0QA 1B4QA 5LNKe 4WR5A 3GURA 4JU5A 4YQVA 1JFUA 3UAPA 2V32A 4BA7A 2GGTA 2OACA 4I2UA 4FIWA 2DLXA 2P5RA 2CX4A 2FLSA 3TKPA 5DVBA 2HLSA 1SK2A 2IMFA 3FRCA 2VLVA 1EOGA 3GX0A 2GSTA 5G5FA 3GX8A 1JLWA 2GT5A 3FK8A 6GSXA 2F3MA 2RUEA 1PN9A 4V1Ag 1YEXA 4KSMA 5GSSA 4LL4B 1SU9A 1M2DA 8GSSA 2LSTA 2FWGA 2XPDA 4POBA 1U88A 4I8BA 3UIWA 3ZTLA 2GZZA 3IE3A 4XRDA 4GWRA 1A8YA 2BTOT 1ML6A 2VL2C 1UC7A 2GSSA 1JZRA 4MA9A 5EPFA 4V1Ap 1EV9A 17GSA 14GSA 5F8BA 4CDOA 4QL7A 2QKEA 2C0EA 2WFCA 4OWYA 2PBJA 2GZPA 2VAFA 3DYRA 4LA1A 5J5NA 2AUVA 3HDCA 5ECOB 4HUAA 3NIVA 3RPNA 5GAPD 2VOCA 3UBKA 4MF7A 2RIIA 2HNLA 5ECQB 4TVEA 1GTAA 5F0GA 3VWXA 1KNGA 2L6CA 3F4RA 3LORA 3P8WA 1FVKA 3GL5A 3KH9A 3TKQA 4EKZA 3I69A 1TW9A 4NWYA 1QGVA 1XVQA 3P90A 2B7JA 5L71A 1T4YA 1K0NA 3M8NA 3KM6A 4IJ3A 1N8JA 3EINA 2DJJA 3G9BA 2KLXA 3JCML 2LS5A 4EDZA 3MSZA 1QXHA 1GUMA 1MDKA 1GL8A 2LUSA 3QFAC 2GQLA 1W4VA 3FR9A 4HZ2A 5AIXA 1GLPA 1AAZA 3GN3A 3APSA 3RHBA 19GSA 3TKSE 3D4MA 1O6JA 4YQUA 4GSNA 4NV2A 3LG6A 3GHAA 5KN3A 2LJKA 1V57A 2JSYA 4TN8A 5JCGA 3KD0A 5EVOA 1E2YA 3TJKA 1GSDA 2IMKA 3ZYWA 3FZAA 1SKWB 1YQ1A 2AHEA 6GSWA 3KEBA 2K9FA 1ERWA 1K0DA 3PH9A 1B8XA 1V9WA 3KIJA 3GIXA 3IAM2 3I9V2 2VM1A 3LQ7A 3GSSA 5DAKA 4K6XA 1ABAA 4IW9A 1YJ6A 5AN1A 2V6OA 5B8BA 4NV5A 4AGSA 6GSTA 1A23A 3VWVA 1F3BA 4FYBA 1A2LA 2DJ1A 2TRCP 2FNOA 3KTBA 3U6VA 1SYXA 2OBIA 2LV3A 2FGXA 5J9BA 4V2MA 1B4PA 2H72A 4GXZA 1OE8A 2H75A 4KCEA 5F06A 2MMOA 2GSRA 3F4SA 4NAXA 1URMA 2REMA 1KBNA 3L9UA 2E2MA 2A4VA 3ME8A 2WULA 4ACSA 2GVPA 5LCZA 2V2GA 22GSA 2LEGA 3F4TA 1RQMA 1XWGA 1UVZA 3K8NA 2WJUA 2VL2A 3VURA 3RBTA 1UA5A 2HRFA 1WPIA 2YPMA 1K0MA 1AC1A 2WCIA 1GUHA 1RW1A 2CT6A 3CTFA 3H4KA 3MDKA 5H5QA 4JR6A 4F0CA 3FZ5A 1FOVA 1U3AA 1FAAA 3TOUA 3EMPA 4ZIJA 4X1UA 3ME7A 2CVKA 3KCMA 1EGOA 4HOJA 2LNSA 1GNEA 3FR3A 3ZFLA 1YF0A 1K3LA 3P7XA 4OFTA 5HR3A 2GZYA 3AY8A 5E59A 3VFIA 5G1LA 2LRCA 2DIYA 2G2QA 3GTUB 3W8JA 1WIKA 3UJ1A 3HHVA 1X9MB 3HZ8A 2ON5A 3SWLA 2B1KA 3TJJA 4QL9A 1ZYQB 2YV7A 3BCIA 4F0BA 3GKNA 5EY6A 5GSTA 4V2NA 2H1AA 1AQVA 4YAPA 3C1SA 2ALBA 4HZ4A 3GL3A 1DSBA 5CRWA 4OD7A 1A24A 1TP9A 5D93A 4KNDA 4EO3A 1GNWA 2CAQA 3A2XA 5B6NA 4MPGA 1TRSA 1Z7RA 2BJXA 3TCOA 4LL1B 2VCWA 3ZZXA 2IFQA 3Q74A 3J7Yb 5ECRB 3G7IA 4IBPA 5JWRB 1MDIA 1TK8B 2AV4A 1PSQA 3ZIVA 2VIMA 3ZVJA 3HD5A 4GTUA 2LTKA 3F0IA 4L5LA 2XBQA 2GQMA 3DVXA 1H4OA 3TOTA 2YZUA 4LMVA 1EV4A 3Q6OA 1TU7A 1DBYA 1EP8A 5HR2A 3FYGA 2IN3A 2X8CA 1ZCPA 3GV1A 3KTLA 5IQYA 1M7TA 3TB2A 5EL8A 2F8AA 2VCTA 1EWXA 4ZB8A 1XW6A 2A2SA 4N30A 1VF2A 5CNWA 1OKDA 3IRAA 3H93A 3CMIA 2HI7A 3GSTA 1ON4A 5A5KA 5D9TA 3PGTA 2VM2A 2H0GA 4JBBA 2R37A 3EU3A 1ZYEA 2NPBA 1XIYA 2B3SA 2LJAA 3WT1A 4Q5RA 5CREA 2QSIA 2OE1A 3O76A 2KHPA 2V41A 1G7OA 1GLQA 3VI7A 1TI3A 3D5JA 5DJLA 3LJRA 5DALA 2H70A 4TXOB 4RI6A 1RK4A 2RM5A 2C3TA 1EEJA 2YWMA 2B5EA 2LJRA 1PX6A 2FWHA 3IBHA 4MDCA 2IMIA 1T7PB 2F51A 2TIRA 1FHEA 2H6XA 3UEMA 2PMTA 1MD4A 4D73B 4RUVA 4XHMA 2JZRA 4BWQA 2OJLA 1PL2A 1O7UA 1QUWA 4ZILA 1R5PA 2O87A 1ACVA 3IA1A 2AJQB 4KDXA 1S3CA 5FWGA 2C0DA 3IAS2 2DJ3A 1XBSA 5DQYA 1W89A 4WEYA 1TOFA 2B7KA 3DXBA 4IJIA 1WP0A 3FW2A 3M0FA 1IYHA 1AUCA 2YOIA 3G7YA 4LMWA 5LD0A 4ILFA 3F8UA 3FY7A 5ELGA 4FH8A 2MMNA 3W8SA 4NHWA 2CAIA 3BCKA 4TRXA 1TRVA 2YWOA 2OE3A 4O7HA 4K7NA 5INYA 5B7CA 2YANA 2B5YA 4GLTA 1AXDA 4KDYA 4ISDA 2FWEA 4CW9A 2I81A 1B48A 3GNJA 4OFMA 5CP1A 1THOA 1ERVA 2FUG2 1FG4A 4FO5A 1S3AA 1XWCA 4J57E 3FZ4A 3ZITA 4PQ1A 2GLRA 4IELA 2GQKA 2R4VA 4F9ZA 1M9BA 2YNXA 1O8WA 1XWKA 9GSSA 5JWQB 5ELAA 3EMXA 4WXTA 2PPTA 1PX7A 1ERTA 4WBRD 2K8VA 1A2JA 1ZL9A 2H6YA 3Q18A 2C0GA 4L8EA 4KB3A 4XS6A 3TJBA 4YAVA 2VLUA 4CHSA 2IL3A 4H86A 3M9JA 4NHZA 1NHOA 1OVNA 1YZXA 2VL9A 4P3YB 2R5GA 4WBJA 5HR1A 1SL1B 2H19A 3FZ9A 5DCHA 3DMLA 1X9WB 1O8XA 1Z3EA 4L0UA 1C72A 1GSYA 2H1GA 1VF4A 3GTUA 2PVOC 3QAGA 4ZBBA 3M1GA 5C04A 3L4NA 2R6KA 3BJ5A 1OC9B 4HQSA 3UL3A 2JZTA 1VRSD 2VCVA 1LU4A 1SJZA 4HU9A 2H6ZA 3LXTA 3WT2A 3DIEA 4MJEA 2GTUA 3M9KA 5KEJA 5AISA 1A0RP 4DEJA 4K0GA 1SYRA 3IXRA 4G10A 1XWAA 1SJ6A 2HZEB 2R3XA 3CSIA 2CZ3A 3QD9A 2YZHA 2JACA 5G5EA 4JRRA 1SKSB 2K6VA 2L5OA 1Y6EA 5IMFA 3TGZA 2NVLA 4Q5QA 1A2MA 1PRXA 3ERGA 4K7OA 3KZQA 2IMDA 4EE0A 3UVTA 2F9SA 4X43A 2P0GA 5B6MA 5J9CA 4OMVA 1HQOA 5HQPA 2HT9A 2O8VB 1GTIA 3IR4A 1Z7PA 4ZBDA 4XS4B 2B5XA 4G9HA 3VWWA 1GH2A 1K3YA 1OAZA 2HZFA 3V1WA 2JADA 1AW9A 1EOHA 2LQOA 1U6TA 7GSSA 2FA4A 4TR1B 3S9FA 1FO5A 1TKDB 3IDVA 3KH7A 1K0AA 4MF5A 1AQXA 1TRWA 4BPYA 6GSUA 6GSVA 1VGLA 2I3YA 2M72A 3HXSA 3LWAA 4IS0A 4ECIA 1AQWA 3FR6A 2YWIA 4ULXA 4HJMA 4IHUA 2OADA 3F63A 1XCCA 4AJ6A 3IK7A 5HFKA 2PUKC 4QQ7A 3QAWA 3KGKA 5ID2B 5GZZB 2YJ7A 1R5AA 2CZ2A 3HA9A 1F9MA 1GTUA 3F3RA 3UMAA 4I2TA 1SK1A 1KTEA 4TKYA 4V2LA 1O85A 5CYYA 2H30A 4ZB6A 1XZOA 1F3AA 1G0TA 4MJCA 1M2AA 3DKSA 4IVFA 2KOKA 3HJOA 1U3IA 1TK0B 1ZOFA 4D73A 4RQRA 5IPGA 3IK9A 4KAEA 4MLYA 1HNAA 3WGEA 3TKRA 2NDOA 4PQIA 2MYGA 3ZL5A 4O32A 2FHEA 3GKKA 3R2QA 3TJFA 5ECKB 2PN8A 2X99A 1U87A 1TI1A 1USBA 5DDLA 2MMZA 2DMMA 1WMJA 3MNGA 1SKRB 1J0FA 4IP6A 5AGYA 2C4JA 5IMCA 1QFNA 2M46A 3GMFA 3M3MA 3HJMA 2L4CA 3P2AA 3IOSA 4BVYA 1GTBA 2HXKA 4I6XA 3QFBC 3C1RA 6GSYA 5IMAA 5IOWA 4EXJA 2VLTA 4ECJA 2LQQA 4K2DA 1B9XC 1GP1A 1PA3A 3E3EA 2WRTA 2EIQA 2WB9A 2J23A 4L5OA 4PUAA 4JE1A 2PVQA 2QGVA 3ED3A 3ERWA 3C73A 2RM6A 3GKMA 1GRXA 3GFKA 3TRPA 3LYPA 2CV4A 1SD9A 3CSJA 1T3BA 4AJ7A 4PXOA 1JLVA 4HDEA 5GAND 1JHBA 1GSUA 3QCPA 5IPHA 3GRXA 4RI7A 3DVWA 12GSA 1PGTA 2H66A 3CTGA 5G2ZA 5ECNB 1K0BA 4OFNA 3CBUA 5D9XA 2CVDA 3PR8A 4F82A 3BOAA 1DE1A 5CRDA 4OCEA 3HVVA 3UVHA 3KMOA 1R4WA 2IWTA 4XTSA 2WDUA 1I5GA 1KEBA 4IQAA 2IJYA 2N5AA 2V1MA 4Q5FA 1OC9A 2OE0A 3RDWA 5FT3A 2EC4A 2Z9SA 4GSTA 3L9SA 3DRNA 3E0UA 2K8SA 4KSOA 5CRHA 4JZQA 1XXUA 4L0WA 1A0FA 2QC7A 4X0XA 1TU8A 4K1FA 1ZMAA 2JSZA 5ENUA 3UOMA 4MK3A 4ZB9A 1J08A 2KP1A 1EZKA 4NMUA 2HZEA 2H74A 1OKTA 2P31A 3IC4A 2H73A 5CO3A 3HVXA 2MZCA 4DVCA 3EYTA 1QQ2A 1CQHA 4WETA 2DJKA 4IGJA 5DAKB 4MPFA 1YF1A 1YEPA 2FA8A 2P5QA 2FY6A 3APQA 2AB6A 3MWHA 1MTCA 4I5QA 1PMTA 3CRTA 1GSSA 3TRQA 4MZWA 4XCSA 2FD3A 4N0VA 1E6BA 3I6AA 5DCGA 10GSA 2TRXA 2CX3A 4TW5A 3L78A 2K18A 3IPZA 1GULA 1FVJA 3GH9A 4RQXA 1GSFA 4TR1A 3D6IA 5IOXA 5G31A 3CRUA 3E9JB 3G7JA 5CAXA 1SD8A 4K8MA 2MMAA 4EDYA 5IM9A 4TOPA 4KE3A 4DSSB 5B8AA 2DMLA 2VCQA 4E8HA 5JWOB 1X5EA 5CRGA 4ZL8A 3HY2A 4J56E 3KP8A 2M80A 4GCIA 4ML1A 1EP7A 13GSA 2VD0A 3H1NA 3ZFBA 4BL7A 2BMXA 2FCHA 3DWVA 1UN2A 2VO4A 3F6FA 4ZBAA 3LGCA 2H71A 5ID2A 3GYKA 3QR6A 2H1DA 3BBYA 3TRXA 4LLRA 4IQ1A 3KJYA 1BG5A 4K0NA 2VCXA 2HSHA 1XOAA 2EIRA 2PGTA 3EE2A 5KN0A 1XWBA 2OKAA 2PERA 3ZLPA 1T4ZA 1DUGA 3C7MA 2LNTA 1SK0A 1THXA 2VD1A 4YQMA 5IIZA 1BEDA 1FB0A 2L4QA 4FYCA 3TDGA 5FHIA 2ES7A 1PL1A 1F37A 2NTOA 5AIVA 1MD3A 4POMA 2PWJA 4DSRA 1XPVA 3KP9A 3DEXA 5H5SA 2FWFA 2HRNA 2JL4A 1T1VA 4KW6A 1T8EB 1V98A 2I9HA 2IFQB 4AJ8A 3TKSA 1J9BA 1TJDA 3EVIA 2DJ2A 3UBLA 1PD21 3GKXA 1MEKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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