The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
103
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structure length |
103
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Chain Sequence |
GSSGSSGELPSVEELTIILPEDIELKPLGMVSSIIEQLVIIESMTNLPPVNEETVIFKSDRQAAGKIFEIFGPVAHPFYVLRFNSSDHIESKGIKIKETMYFA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution structure of the NAF1 domain of Hypothetical protein BC008207 [Homo sapiens]
rcsb |
| molecule keywords |
Hypothetical protein LOC92345
|
| molecule tags |
Transcription
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
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| structure length |
103
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| sequence length |
103
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-03-30 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Probable tRNA pseudouridine synthase domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2V3M A; 2HVY B; 2EQN A; 2RFK C; 2EY4 C; 3U28 C; 3UAI C; 3MQK C; #chains in the Genus database with same CATH topology 4ABD A; 1SMF E; 2ZU5 A; 1OSS A; 2WV4 A; 4B75 A; 1G3E A; 4HG6 A; 4CRF A; 1SB1 H; 1C5U A; 4TY6 A; 1SOZ A; 1Z8G A; 4MNX A; 2VB0 A; 2ZHD A; 2B7D H; 3LT3 A; 5FXL A; 1K1I A; 2FOD A; 2CF8 H; 5EG4 A; 4SGA E; 1C5O H; 2WYJ A; 1NU7 B; 1QGF A; 1AD8 H; 1NN6 A; 3M7U A; 1RTL A; 3DFL A; 3L6P A; 1EUF A; 4BXS A; 1CHO G; 1RD3 B; 2ULL A; 4RT0 A; 1NFX A; 1DUE A; 1TPS A; 4DG4 A; 3Q77 A; 1DM4 B; 2A7H A; 1ELE E; 1NT1 A; 1VIT H; 1OPH B; 1WU1 A; 1O0D H; 1P2J A; 4E7R G; 3EA9 A; 1DWB H; 2RFK C; 4JZ1 A; 3LJJ A; 1GJ6 A; 3S9A A; 5DP8 A; 3RMM H; 3EYD A; 1GMC G; 1LCY A; 2XNI A; 4Y11 E; 1RXP A; 2HLD D; 1SQO A; 4UFG H; 2QCY A; 3K65 B; 2VIV A; 1C2J A; 2BYA X; 4XBD A; 4OM9 A; 2FM2 A; 1MKX K; 5EOD A; 3P17 H; 3E91 A; 6CHA C; 2WPH S; 1O39 A; 1QBN A; 4BTT B; 2ZFT A; 2AMP A; 1F0R A; 1GJB B; 1TGT A; 1MD7 A; 1MKX H; 1T7C A; 1YKT A; 3O8R A; 3UUZ A; 1K1L A; 3A8B A; 2AMQ A; 1W7G H; 1MTV A; 1FIZ A; 1CQQ A; 3SYJ A; 5HMA A; 4GVU A; 4B73 A; 4TT3 D; 4DJZ B; 1QR3 E; 1NPM A; 1ZJK A; 3K6Z A; 4Y8Z A; 2STB E; 1BRA A; 3QGN B; 3TPI Z; 4BOH A; 1D9I A; 2AGG X; 5EW2 H; 1RTK A; 2SNW A; 6CHA B; 1GI5 A; 2G52 A; 3RXG A; 1C1O A; 4Q2K A; 3RXM A; 4X8T H; 1V2T T; 4ABB A; 2H1U A; 3PTN A; 2J38 A; 3G01 A; 5T3H A; 2F3C E; 2FOB A; 4AFQ A; 4AG2 A; 3EA8 A; 4Q7Z A; 3HAT H; 1PPE E; 5F03 A; 5JB9 S; 2BVS H; 2ZDA H; 1UTN A; 2JJ1 D; 1FQ3 A; 2Z3E A; 2OCV B; 2ZDV H; 3Q00 A; 4YLQ H; 4BAO B; 1NU9 A; 5LPF A; 1O3L A; 2J4I A; 3Q76 A; 1HLT H; 4X2Y A; 1A0L A; 1VKY A; 1YBW A; 3RXO A; 1EZX C; 1O2Q A; 2J34 A; 2LNC A; 4X0W U; 3QZR A; 1P3C A; 1ZHP A; 5K0H A; 2GDD A; 3MO3 A; 3SJK A; 4H42 U; 3PMB B; 3RXQ A; 2Z9L A; 1P9U A; 2G8T A; 3OTJ E; 4A6L A; 1YPJ H; 1XKB C; 2Y82 A; 2A4O A; 2BM2 A; 1S0Q A; 1HB0 B; 1KXC A; 4A1T A; 5A0A E; 3LC3 A; 3MWI U; 1SGE E; 1O2V A; 3GCT F; 4ASU D; 1K1P A; 4ISH H; 4UDW H; 5I46 H; 1VGC B; 1QQU A; 2Z6B D; 2BOH B; 2VGC B; 3MU1 A; 3PB1 E; 1P2O A; 1Z1J A; 1ZMJ A; 2VU8 E; 3F0O A; 4AGJ A; 1ZHM A; 5EIY A; 3BIV H; 1VIT F; 3TU7 H; 1JIR A; 3F1S B; 1NRS H; 1P3E A; 1O2P A; 1MBQ A; 1V2W T; 2HNT E; 1ZGV A; 4AFU A; 5GIB A; 1QHR B; 1XKA C; 1NS3 A; 3VG8 A; 1ETS H; 1GVL A; 3PV2 A; 1LMW B; 1QL8 A; 4UON A; 5F53 A; 2W6J D; 3MFJ A; 1GHV H; 4RI0 A; 1GJ9 B; 3E16 B; 5DP6 A; 2TRM A; 3WY8 A; 1NZQ H; 1GG6 C; 2BD9 A; 1RFN A; 4INK A; 2P95 A; 1GI2 A; 5FAH A; 3SJ9 A; 5EQS A; 1U6Q A; 4CRE A; 2BLW A; 2GCH F; 2JDI D; 1F2S E; 1MU8 B; 4TPI Z; 3ZZD A; 1Z8I B; 3MTY A; 4QT8 C; 1V2K T; 2CV3 A; 1FY4 A; 1ELA A; 5JBA S; 2C93 B; 1KY9 A; 4FUG A; 1MAX A; 1H8D H; 2FI5 E; 2GX4 A; 2IOT A; 3UTU H; 1SQT A; 4ZMA H; 2GDE H; 3AVZ A; 2FDA A; 1O2I A; 4Z6A H; 4Y7A A; 4AB8 A; 1CSO E; 2FOE A; 4YT7 H; 1VJA U; 2GD4 B; 2J98 B; 4FU8 A; 1T31 A; 1ARC A; 1ETR H; 2OC7 A; 1Y5U T; 1YPH E; 1D3Q B; 4K8B A; 1O5G H; 1W0Z U; 4DCD A; 4FUB A; 2WV5 A; 2GGV B; 2P3T B; 1ZSL A; 3VFE A; 4UFF H; 1XUF A; 3ZVD A; 1UTP A; 4WF8 A; 2Y81 A; 1OP0 A; 5FL7 D; 5EOK A; 1W0Y H; 3BTT E; 3RM2 H; 1CBW B; 4CHA C; 1BIT A; 1TA2 A; 4NIV A; 1A5I A; 1KXA A; 2J95 A; 4ZKO U; 1BIO A; 1TNK A; 4KKD A; 3NUM A; 1ANC A; 1F92 A; 1EST A; 1GMH F; 3LGU A; 1THS H; 2QGR A; 1E79 D; 2A7J A; 1TAW A; 2G5N A; 3EAJ A; 2HNT F; 1CGH A; 2DE9 A; 2NU3 E; 3MNC A; 4JK6 A; 1G3D A; 1O30 A; 4I8J A; 4KP0 A; 2PR3 A; 4WY3 A; 3B9F H; 2JKH A; 3KQC A; 1O3A A; 2ZI2 H; 1Y59 T; 1P02 A; 3W1E A; 2CMY A; 3VEQ B; 3QLP H; 1O2Z A; 1PYT D; 2W5E A; 3KQ5 A; 4ACB A; 3BTG E; 1QRW A; 1IAU A; 1WQV H; 3H09 A; 3ATM A; 2RCE A; 3T5F H; 3V0X A; 3EQ0 H; 1C1S A; 1GBD A; 3TNT A; 3ZV9 A; 1FX0 B; 1SQR A; 4OS2 A; 5FCK A; 1S6L A; 2KX4 A; 4TWY A; 3UQO A; 3ZZB A; 1C4V 2; 1SR5 C; 1CHG A; 3TK6 A; 1KXF A; 2LPR A; 2TPI Z; 1IQM A; 3O8C A; 1ORF A; 1O2Y A; 2V6N A; 4YES B; 1YLC A; 3E0N B; 2VJ1 A; 1GDQ A; 1CGI E; 3SU0 A; 2ZPR A; 4H6T A; 1T8M A; 2NU1 E; 4OS5 A; 2XWB I; 3GYL B; 2EA3 A; 3P8G A; 1DIC A; 3FVF B; 3LH1 A; 2BY5 X; 4NA7 A; 3LON A; 2FI3 E; 3A82 A; 2Z9K A; 4NWL A; 1P04 A; 1ELT A; 2XTT B; 4O03 A; 1KSN A; 3ZVE A; 2TGA A; 1SL3 A; 4ZUH A; 4RKO B; 2BD5 A; 1G30 B; 2A45 B; 1G32 B; 1L2E A; 3OY6 U; 3DUX H; 2CGA A; 2V3O H; 2Z7F E; 2ZPQ A; 4YXW D; 4E7N A; 2FOA A; 3STJ A; 3W94 A; 3P92 A; 2A31 A; 1AZZ A; 1GBT A; 1TX8 A; 2CHA B; 2ZA5 A; 4ABI A; 1J17 T; 5L2Y H; 5DO4 H; 3RMN H; 4K3J A; 3SNC A; 2A5I A; 1WOF A; 3K2U A; 2HAL A; 4I8L A; 2WPK S; 1V2S T; 3WWF A; 2H9H A; 2A4R A; 4B6E A; 1A1R A; 3A7W A; 4ISO A; 1LO6 A; 4ABJ A; 4XDE A; 3KHV A; 1EAW A; 5FBE A; 1TNH A; 2ZPS A; 4X2W A; 3ZZ3 A; 1UVT H; 2VID A; 3MU8 A; 3NK8 A; 2V0B A; 4I33 A; 1OS8 A; 2L6O A; 2BD8 A; 2I6Q A; 1Q3X A; 1F7Z A; 2OQ5 A; 1TA6 A; 8GCH G; 1YY3 A; 3PYH A; 1BTZ A; 1AQ7 A; 1XVO A; 2VIO A; 4IC5 A; 3A81 A; 3SNA A; 3F9E A; 1GCT C; 1N8O C; 5EU8 A; 8EST E; 4RSP A; 2Q1J A; 1K22 H; 1LPZ B; 1P2M A; 5FHT A; 1P9S A; 1GPZ A; 4WWY A; 2Y80 A; 1T4U H; 2Q6D A; 1OKX A; 2G4U A; 1VJ9 U; 1UK3 A; 2ZG0 H; 2SGE E; 2OC0 A; 1B5G H; 3T62 A; 1GBL A; 2HLC A; 4Y10 E; 2BLV A; 1AE8 H; 4AYV B; 3V12 A; 3EST A; 3HKI B; 1O2T A; 4WXV A; 1Y3W A; 3TJN A; 3I78 A; 2BD3 A; 3BEU A; 2VIP A; 4NIX A; 1C2L A; 2UUJ B; 4NFF A; 4CBO A; 3EDX B; 2Z9J A; 3QK1 A; 3MH7 A; 2R3Y A; 1O3P B; 1OYQ A; 3TLO A; 1DSU A; 1QJ7 B; 3ZZ6 A; 4XBB A; 1CVW H; 2VIW A; 1A61 H; 3ZZA A; 2Y5G A; 3D62 A; 1SLX B; 1SGT A; 1HUT H; 4WME A; 1QA7 A; 1KXB A; 2ZO3 H; 2ZHE H; 2ZDL A; 1TNI A; 1SGC A; 1QBO A; 3RXE A; 4ZCN A; 2B0F A; 4MPV A; 3TGI E; 1E0F D; 3W95 A; 3AK5 A; 2FOC A; 2HRV A; 2VWN A; 3LGV A; 1IQG A; 1BHX F; 3BTM E; 1C5L H; 3BTW E; 3U28 C; 2CXV A; 4K1E A; 2H5D A; 1BRB E; 9EST A; 2GT7 A; 4M7G A; 1XXF A; 5EPY A; 4ZKN U; 1EJN A; 1SFI A; 1FY5 A; 1Y8T A; 1OWI A; 4E05 H; 1O36 A; 1GBM A; 3PWB A; 4ISL A; 5ABW A; 4LOY H; 1BBR E; 3BTH E; 2BDI A; 1HAV A; 1QBV H; 3MNX A; 1P06 A; 1HXE H; 3EE0 B; 3LGY A; 1TWX B; 2BXU H; 1GI6 A; 1ZR0 A; 4K60 A; 2PP6 A; 4DIH H; 3QN7 A; 4E06 H; 3LOX A; 4NFE A; 2XC4 A; 4DT4 A; 3SUD A; 2R2M B; 4FUH A; 4R8T B; 2ZDM A; 1C2G A; 2ZGC A; 1AI8 H; 2ZFF H; 5GND A; 1QB9 A; 3WW7 A; 5GCH F; 2ODP A; 5B6L A; 3CP7 A; 5TCC A; 2Q6G A; 1HJA C; 4YTA A; 3SUG A; 1O35 A; 4D7F A; 1RGQ A; 1L0Z A; 3V3M A; 1O2G H; 3F68 H; 4P02 A; 1TX6 A; 2QC2 A; 2ZFR H; 4WXI A; 1C5R A; 3PRD A; 5BRR E; 4MDS A; 2ZDK A; 1YGC H; 1FLE E; 1CT2 E; 2HWL B; 1O5B B; 2C8W B; 4A92 A; 1C2K A; 2VWL A; 1MTN C; 3AAS A; 4AYY B; 4Q80 A; 1MKW K; 2W26 A; 4JK5 A; 1AY6 H; 3ZIA D; 5GXP A; 1K28 D; 3DFJ A; 3SZE A; 3BEF B; 2SGF E; 1NTP A; 2STA E; 3AW1 A; 1C5Y B; 2GV7 A; 2CF9 H; 5L30 H; 4I31 A; 1MKW H; 1BTW A; 1G3C A; 1HJA B; 4JZI A; 3SJI A; 2BHG A; 2VVU A; 1MUE B; 4MG3 A; 3SV6 A; 1HGT H; 1BJU A; 2VNT A; 3SJO A; 4O3T A; 1MTU A; 1ZYO A; 1AWH B; 2QE7 D; 5FBI A; 3V13 A; 1NC6 A; 4DGJ A; 1IQL A; 1GBA A; 1ESA A; 3N7E A; 3SV7 A; 3I77 A; 3VXF H; 1LHE H; 4ZKR U; 1M9U A; 2G4T A; 2FZZ A; 1W0K D; 2P8O C; 4JYU H; 1ZOM A; 2FTL E; 4TY7 A; 5I25 A; 1HAO H; 1QUR H; 4Y8Y A; 1UMA H; 3ITI A; 1D4P B; 2ZFP H; 3O8D A; 1ELC A; 1EXF A; 1ZTJ A; 2A4Q A; 2P3U B; 4DVA U; 1FN8 A; 3PLP A; 1L1N A; 1CT0 E; 3ZVA A; 1NRO H; 5LPE A; 1E36 B; 1V2M T; 5DP7 A; 1AFQ C; 1HBT H; 2QF4 A; 1C5W B; 1YPH C; 3FZD A; 5AFZ H; 7LPR A; 4AOR A; 4DUR A; 5DPA A; 1LVB A; 1TFX A; 1C2H A; 1TMT H; 1BRC E; 1GJ5 H; 2HGT H; 1CHO F; 1PPZ A; 4AZ2 B; 1HV7 A; 5EW1 H; 3BTD E; 1EB2 A; 1YPE H; 1LKB A; 1ZRB A; 1KTS B; 1EOJ A; 3GOV B; 4AX9 H; 5EJ1 A; 1EP6 A; 2G55 A; 4Y7B A; 1C1R A; 3RXI A; 1AFQ B; 1H8E D; 1GMC F; 2IPH A; 3KNX A; 2R3U A; 2Y7X A; 4J1Y A; 3JZ2 B; 3SN8 A; 4X1P U; 5A8X A; 3UNR A; 3PV5 A; 4DOQ A; 4JZE H; 5C20 A; 1JIM A; 1KDQ A; 3RXL A; 1NRR H; 1GHX H; 1CA0 C; 1P12 E; 2M5T A; 5E8E H; 2RA3 A; 1A3E H; 3RC6 A; 7KME H; 3DCL A; 1EAS A; 1DPO A; 4INH A; 1UCY E; 4X6N A; 5KED A; 1V2L T; 2QY0 B; 4X1N U; 5KGO A; 5JBB S; 1Z7K A; 1F0U A; 2F9P A; 2ZEB A; 2G51 A; 2ZFS A; 1TPP A; 4XRN A; 4TSF D; 5A09 A; 3C1K A; 3URD A; 1SBW A; 3LU9 B; 1OYT H; 4I7Y H; 3I29 A; 4KTU A; 4HFP B; 4D8N A; 1S85 A; 3UR9 A; 4K69 A; 2PW8 H; 5HIZ A; 3SGB E; 1ZPB A; 2OP9 A; 1HDT H; 1PFX C; 2B8O H; 2ZF0 H; 1HYL A; 1CA0 B; 2FLR H; 3ELA H; 1LHG H; 1BML A; 1TYN A; 2KR7 A; 1JOU B; 5C94 A; 2D26 C; 2HPQ H; 1JXP A; 1ID5 H; 6EST A; 5C5O A; 2R0L A; 2XCN A; 2V3M A; 3LGI A; 4OGX A; 3TJU A; 1BTP A; 4OGY A; 4DW2 U; 1BT7 A; 1OWH A; 3JZ1 B; 3FN8 A; 1UTO A; 3CEN A; 4NZL A; 2PLX A; 2DE8 A; 3RC4 A; 3DA9 B; 2BD7 A; 1MTS A; 1QJ1 B; 5TJX A; 2XBY A; 2GMT C; 2A5A A; 3GIC B; 3LIW A; 4IS5 A; 1OWJ A; 5GJ4 B; 1CO7 E; 2AS9 A; 5IK2 D; 1EFR D; 3VGC C; 4WH8 A; 2ZGX H; 1FY8 E; 2W6I D; 3M5M A; 1K1J A; 2OBO A; 2BQ6 B; 3E0P B; 3SV9 A; 2QXG A; 4RKJ B; 3MMG A; 4Q7Y A; 1GBK A; 4GLY A; 1BMM H; 1HAP H; 1C2I A; 1MQ6 A; 1RIW C; 2BLQ A; 2W7U A; 3SNB A; 4FU9 A; 1IQE A; 1EJA A; 1WV7 H; 2A32 A; 1OXG A; 3KEE A; 1FON A; 2EC9 H; 3FP8 E; 3F0P A; 2Y7Z A; 5C0T A; 1LVY A; 2ZWL H; 3IIT A; 5CMX H; 1TOC B; 1VCQ A; 2P93 A; 3PMH B; 2FMJ A; 2UWO A; 2PV9 B; 2GMT B; 5C17 A; 4TYD A; 1GHA G; 4MPU A; 5EXM A; 1TRN A; 1QB1 A; 5C3N A; 3MNS A; 1ZHR A; 1GJ7 B; 2KCP A; 4NIY A; 3VGC B; 1DWD H; 3F9G A; 1FMG A; 1ZML A; 5G4B A; 1D3D B; 3RLY H; 1V2O T; 5JYI A; 4Q63 A; 1YM0 A; 4D76 A; 3MO6 A; 3GS9 A; 1DOJ A; 1D3P B; 3K6Y A; 4X6O A; 1HFD A; 2BX4 A; 4IW4 E; 4Q7X A; 2FYR A; 2JH0 D; 3A88 A; 4NA9 H; 2ZCK P; 2FIR H; 1G2M A; 3RXT A; 1XVM A; 1ZJD A; 3SI4 H; 2ANK H; 1GWA A; 2UUK B; 1B0F A; 1DY9 A; 4NIW A; 1PYT C; 1SOT A; 7GCH G; 3A80 A; 5T6G A; 1MD8 A; 1PQ7 A; 3RXD A; 1UTJ A; 3RXR A; 2ASU B; 1S6F A; 1J8A A; 4JZD H; 2XBV A; 4ZH8 A; 3L3T A; 3SI3 H; 1O2X A; 3E8L A; 1QZ8 A; 2G81 E; 3Q3K A; 5HXF A; 1C5P A; 1Q2W A; 1ZMN A; 3ZV8 A; 2Y6T A; 3UOP A; 5DKM A; 3RXB A; 4B74 A; 3MU4 A; 2A2Q H; 1GL0 E; 1O38 A; 1V2U T; 2ILN A; 3QZQ A; 4K2Y A; 1Y5B T; 1F5K U; 3GY8 A; 4HZH A; 4ZAE A; 3TJV A; 2B9L A; 4SGB E; 1DXW A; 2ZTX A; 3M3V A; 4FU7 A; 4Q4L A; 4CR9 A; 2ZZU H; 2FLB H; 5F8Z A; 1MU6 B; 2FS9 A; 4HI3 A; 2SNV A; 4UFD H; 1TB6 H; 5GDS H; 3LGW A; 2JIZ D; 1BUI A; 1WTG H; 3LPR A; 1KXD A; 3BN9 A; 1BMF D; 3DSG A; 1C5Q A; 1F5R A; 1YPG H; 2WPJ S; 3OX7 U; 2F9V A; 2ZGH A; 2OXS A; 1HPG A; 1GHZ A; 2FYQ A; 1SC8 U; 1SLU B; 2A0Q B; 2BZA A; 4YZU A; 3SOR A; 1QB6 A; 6LPR A; 1KXE A; 1QJ6 B; 1TOM H; 2K1Q A; 2ZU1 A; 5JBC S; 1TNL A; 2ZNK H; 1TLD A; 1EAU A; 5FX5 A; 1LQE A; 4MPX A; 4NZQ A; 5E2O A; 1GG6 B; 5E0H A; 1YF4 A; 2K0Q A; 2GVF A; 2H9E H; 1UVS H; 1PJP A; 1J15 A; 4H6S B; 3BTE E; 3SU3 A; 1S5S A; 2ZIQ H; 1CA8 B; 2ZGJ A; 2D1J A; 1Z8J B; 1B0E A; 1A7S A; 2CJI A; 7EST E; 1GHB G; 2RG3 A; 3HK6 B; 1JMO H; 4IMQ A; 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