2F51A

Structure of trichomonas vaginalis thioredoxin
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
SDPIVHFNGTHEALLNRIKEAPGLVLVDFFATWCGPCQRLGQILPSIAEANKDVTFIKVDVDKNGNAADAYGVSSIPALFFVKKEGNEIKTLDQFVGADVSRIKADIEKFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title High-resolution structure of recombinant Trichomonas vaginalis thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Trichomonas vaginalis
total genus 29
structure length 111
sequence length 111
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2f51A00
2H70A 1G0TA 1XWCA 3ZL5A 3G9BA 4ID0A 2PGTA 4WKWA 1SL1B 2OA7A 1G7EA 1XFLA 3RHCA 3TRQA 2WDUA 3P8WA 1AQWA 3TKSE 4KSMA 3HA9A 3O76A 1YKAA 1RQMA 1M7TA 3DVWA 4TVEA 4TN8A 5G1KA 4POBA 1IYHA 1TOFA 2H75A 2EIQA 2GZPA 1ILOA 2RUFA 1U3AA 2A2RA 2HZFA 4AJ7A 4KNDA 2WJUA 3G7YA 3HZ8A 4I5QA 1O6JA 4MPGA 2D2ZA 2R37A 2DJ1A 1WE0A 3F4TA 2N5BA 1K0AA 2YPMA 3CSJA 3GKKA 2LQQA 1SL0B 2YJ7A 3HVSA 2GDRA 1TTZA 1VF4A 2QKEA 5LNKe 4G9HA 3RPNA 1XVWA 4GLTA 5ID2A 4WXTA 5G5EA 2RUEA 1Z5YE 1YEPA 5F06A 4BWQA 3M9KA 3TJJA 4YAPA 3UEMA 3J7Yb 1GSSA 3UMAA 4Q5NA 1QUWA 4IJIA 4GSTA 3KJYA 1PX7A 2YZUA 4NAXA 4HZ2A 1F6MC 1GUMA 1OE8A 2VCVA 18GSA 2DIZA 3QCPA 4K6XA 3EINA 1ZMAA 1B4PA 3DEXA 1PQNA 1SYXA 1Y6EA 3H8QA 5H5RA 5GSSA 4V2MA 2CAIA 5J9BA 2OJLA 4TW5A 4EF0A 1GNEA 2VLTA 2ZCTA 4MZBA 4NV5A 3EVIA 9GSSA 3ERWA 5J41A 3FKFA 2LV3A 5ELGA 4JU5A 2TIRA 4LA1A 1OC3A 5JWOB 1SKSB 1ERVA 2H1GA 4PUAA 4IJ3A 4BPYA 3FR6A 4GF0A 2IJYA 2VM1A 5CRWA 4WETA 3W8JA 3CRUA 2HLSA 2DJ0A 1T8EB 4RI6A 2DJKA 3HVVA 4MJAA 2GLRA 3QD9A 2XHFA 1QQ2A 2HZEA 1C72A 3I9V2 3WD6A 1AQXA 3LSZA 1S3CA 3FR3A 1XWKA 3AY8A 1FAAA 2LJAA 4MPFA 4OO4A 1ZYEA 1QFNA 4YQVA 2DJ3A 3ZFBA 4QL7A 3ZVJA 1EV9A 4EDYA 1G7OA 3HJOA 2B1LA 2F8AA 2LTKA 1JZOA 2EIOA 2A4VA 3HCZA 1J0FA 5ECLB 3WGEA 4JEDA 1QMVA 4MJEA 1K0NA 1TW9A 1F3AA 3F4SA 2IWTA 2H74A 1PN9A 4IHUA 1K0CA 5H5SA 4KX4A 4POKA 5JWRB 4DSSA 1WJKA 1SD9A 2C0DA 5ECPB 1ML6A 1MEKA 1EOHA 2CQ9A 3TKSA 2PPTA 4X0XA 5HQPA 2FHEA 2YOIA 3LQ7A 1NM3A 3TJGA 1MDIA 5DCGA 1QGVA 2GSRA 3O6TA 3GL3A 2K6VA 4O5RA 4HJ2A 4D73B 1PGTA 3TRPA 3OR5A 2C0GA 8GSSA 5IIZA 3QAGA 5DAKA 3O3TA 1LU4A 2O89A 5HFIA 3DKSA 2GVPA 4K0GA 2LKUA 2GGTA 5DALA 4HU7A 1QK8A 4GQCA 3HDCA 4HDEA 2AJQB 3BCKA 1FW1A 1TDIA 4NPBA 1DUGA 3KXOA 1UVZA 4MF5A 3IC4A 2IFQA 2JZTA 2A2SA 5JCGA 1MD4A 4O32A 3KZQA 3LORA 1GLQA 2VL2A 2L5LA 5C04A 4ZBBA 2YCDA 2DSAA 3IK7A 2RM6A 2GSTA 3G7JA 5G1LA 3UJ1A 1TP9A 3VWXA 3TJBA 4MZWA 4JBBA 3M0FA 1CQGA 1YKCA 2DMMA 5CP1A 3IAS2 4EKZA 1BAYA 4GSSA 1HQOA 1O73A 3HY2A 4MA9A 3ZMKA 1R26A 1KTEA 2L5OA 4K7NA 4GSNA 3IV4A 2M72A 1CQHA 2M46A 1EGOA 1WMJA 3L9VA 6GSVA 1THXA 1ZL9A 4L0WA 5J9CA 2GQKA 2YWOA 1B4QA 1OKDA 3FYGA 4KDUA 4OCEA 3NIVA 5CREA 1ERUA 3TCOA 1HNBA 2EC4A 1A24A 1GSEA 4ZBAA 3ZITA 4OFMA 5KN1A 4FYCA 3GURA 2L57A 1TK5B 5ECIB 3KMNA 1TRVA 4DSSB 3IBHA 3ME8A 1GSFA 3H93A 2RIIA 1XWGA 3VK9A 2OE0A 6GSSA 1GULA 2H6ZA 4ZB9A 4GRFA 5D9XA 1PA3A 4K7OA 3ZMLA 2JL4A 4MF7A 4KGIA 1JZRA 2WZ9A 4RQXA 1T4ZA 2H6XA 3HD5A 3HZ4A 3M9JA 4N0VA 2H19A 4HUAA 1YEXA 4OCFA 2OKAA 5DJLA 1FVJA 3A5WA 3CXGA 1S3AA 1TK0B 4MMMA 3K8NA 4ZL8A 1O7UA 5J3RA 3LXTA 4XS6A 3TKRA 2B1KA 5DALB 3RBTA 4J2FA 3FRCA 2FNOA 1EZKA 4GQFA 3QOUA 1OKTA 3KH7A 5J4UA 4PXOA 1M9AA 1ABAA 6GSYA 2C4JA 3LXZA 1PMTA 4XRDA 3CBUA 5IOWA 1GH2A 1VGLA 2R2JA 2IFQB 1VRSD 2HFDA 3UIWA 1O8XA 5HR1A 2XC2A 5GAPD 2MZCA 5DQSA 4PX1A 1EWXA 3H1NA 4JZQA 1JFUA 4L0UA 5A4VA 4JR4A 3FW2A 4POMA 2FA8A 3L9UA 1K3LA 2HXKA 3ED3A 4HZ4A 3W8SA 5CRDA 1K3YA 1FO5A 3GH9A 1R5PA 11GSA 4ZB6A 1GUHA 3L0HA 5A4UA 2X8HA 2VO4A 5FHIA 3US3A 1XW9A 2LUSA 2PMTA 2IIYA 1GSUA 1FB6A 2IMDA 5DVBA 4IBPA 2LRCA 2FLSA 4NHWA 3QPMA 3FHKA 1A2LA 3KP9A 4TRXA 4YAVA 5IMFA 4I8BA 3PINA 3APSA 4ECIA 1GNWA 4PQIA 4PNFA 2VCTA 4WR5A 4ML1A 3UARA 4KDYA 2P31A 4WF4A 5GAND 3WYWA 1OYJA 3CTGA 14GSA 1A0RP 5INYA 2PERA 2RM5A 1VF2A 4EO3A 3GHAA 3LGCA 3M8NA 3ZLPA 2E2GA 5ECNB 4YQMA 4RI7A 3ZVJD 1YJ6A 1F9MA 2KOKA 4AF2A 5AISA 2PUKC 1O85A 1TXXA 2HNLA 3GUSA 6GSXA 5IO2A 3I69A 3Q6OA 1OC8A 1LBKA 2B5YA 1I5GA 3ISOA 2L6CA 1ZZYA 1SD8A 2DIYA 5F05A 4ZXGA 1BJXA 2P5RA 2GZZA 5D9WA 5JCWA 2HRNA 4H86A 2CZ2A 5F8BA 3QFBC 2FWGA 4F2IA 3P2AA 5JCUA 1DSBA 2IPAA 3IR4A 5B8BA 1TU8A 1A2MA 2YN1A 3F6FA 4XTSA 1GSQA 5DQYA 4D73A 4MZCA 1WP0A 1PX6A 4WBJA 1A8YA 3EURA 3TGZA 3E3EA 2N5AA 3LEFA 1DE2A 1G6WA 4KCAA 3FZAA 2I1UA 1R7HA 3ZRDA 1LJRA 1Z9HA 2OACA 1JLVA 4JRRA 2JU5A 4IP6A 3MSZA 1R4WA 3ME7A 4QL9A 4KA0A 2FWEA 4TR3A 1U87A 1YZXA 1PL1A 4EXJA 4TR1B 2G2QA 4J57E 1O8WA 5CYYA 4JR6A 4MJCA 4BWSA 2H30A 2VCWA 4KH7A 2BJXA 4HQZA 1AUCA 1K0MA 1T3BA 3CYNA 2WGRA 4WBRD 4ECCA 4F82A 2B3SA 3LWAA 3ERFA 1XOBA 3R2QA 2C0EA 3WT1A 3M3MA 1B8XA 3ERGA 4OD7A 3TJKA 2HI7A 12GSA 5EL8A 1E6BA 3TOUA 3CSIA 4IS0A 3A3TA 3MAKA 2H71A 4ECJA 1Q98A 1H4OA 4EDZA 3APOA 1V98A 2VAFA 4Q5QA 2I3YA 2C3QA 3IOSA 2I4AA 5L71A 5IM9A 1KBNA 3GV1A 3IE3A 3FR9A 3TB2A 3D6IA 3Q19A 3ZREA 2LRTA 2CVKA 4MJBA 3L78A 3ZIVA 4XS1A 3VWVA 5HR2A 2NBSA 1OC9B 4EC0A 3C1RA 1SENA 2YANA 3LJRA 5HR0A 17GSA 2GSSA 2K8VA 5DDLA 4BVXA 3IDVA 4F03A 3LG6A 2ZNMA 4CW9A 2GSQA 2AHEA 1EP7A 3GYKA 1HNCA 4ECBA 3RHBA 4HS1A 4XHMA 3LYPA 2YV7A 3UBKA 1R5AA 2VL9A 4I6XA 4F0BA 4IVFA 2ON5A 3IAM2 1BEDA 4IELA 4YH2A 3EWLA 4GWRA 5AIXA 3HJMA 5H5QA 1TRWA 3UL3A 2YJHA 4K8MA 1J9BA 2MMAA 3RDWA 3IA1A 2H1BA 1XOAA 1M2BA 5D8IA 3DIEA 2V6KA 4EL1A 4WEYA 5E4WA 4IQAA 2O85A 1ACVA 1PD21 4V2NA 3C7MA 6GSTA 3VLNA 4HQSA 1URMA 2FY6A 1H75A 4YQUA 2FA4A 1G6YA 4DSRA 4TR0A 3BOAA 3WT2A 3C8EA 1SJ6A 1T1VA 5D96A 4HJMA 1XCCA 5IMVA 2VD1A 1GTUA 3GSSA 2WS2A 1Y25A 3BJ5A 1XW5A 3UBLA 3HHVA 3RAZA 4EVMA 4PQ1A 3VFIA 4HOJA 2O7KA 1F37A 4L5OA 3N5OA 1V9WA 2H01A 4MF6A 4XS4B 1PKWA 1E2YA 4KSOA 4WR4A 4PUFC 1FG4A 4F9ZA 3KD0A 2JZSA 4MP4A 3CTFA 2VLUA 1V57A 4KUNA 2H72A 5AGYA 1NSWA 5DCHA 2C8UA 2R3XA 2PVOC 3ZIJA 2XPDA 3KM6A 1VF1A 3LYKA 2H6YA 3DWVA 5B6NA 2HSYA 1MD3A 2X8GA 1OE7A 1MTCA 3F0IA 1X5DA 5D9TA 2KP1A 3CMIA 1ZOFA 2KLXA 3SBCA 5HFKA 3VI5A 2H76A 1A2JA 2FCHA 1U88A 4XCSA 13GSA 1AW9A 2CAQA 3DRNA 1V40A 1PL2A 1SK0A 4HU9A 1MDJA 4X43A 5AN1A 2C1YA 3QAWA 5D9VA 5ECHB 2PN8A 2X99A 1FOVA 1YDKA 4XRAA 4ML6A 5IMZA 2VCXA 2IL3A 1J08A 2FUG2 3TKSC 1BQ7A 2VL3A 2JADA 4KDXA 5EPFA 2FD3A 1RK4A 1SK2A 2DJJA 1B9YC 2B5XA 2C3NA 4GCIA 2XBIA 1U6TA 1T4YA 1ST9A 1JZWA 2AB6A 2HE3A 3VI7A 1GSDA 4G19A 4EE0A 3W6GA 3DXBA 3F6DA 3WGDA 4IKHA 5B6MA 3I6AA 1SJIA 3H4KA 5B8AA 4ZBDA 1KNGA 4TXVA 3CSHA 3KTBA 4RUVA 2TRXA 1WIKA 2H0GA 1EP8A 4V2LA 4X1UA 4K7IA 3HYPA 5GZZB 1BYEA 1V2AA 3QR6A 4K2DA 3TDGA 1XW6A 5A5KA 2O87A 1ZYQB 1M2DA 1SL2B 5D73A 2PVQA 3GL5A 3QFAC 1N8JA 2MMOA 3EMXA 2HRFA 3EC3A 4MH3A 1GUKA 2QGVA 2VL2C 5DBQA 1GP1A 2F51A 1S3DA 3Q74A 4I2UA 5IMDA 5ABRA 4TR1A 3FZ5A 4IGJA 5GSTA 20GSA 2GQLA 4L8EA 2P5QA 1X5EA 2REMA 2MMNA 2AV4A 3ZFLA 4MH2A 4IW9A 1ON4A 5ECOB 5HR3A 2R4VA 4BVYA 3P90A 3APQA 3D0ZA 3KIJA 3PR8A 2MYGA 4O92A 4RQRA 4HEA2 1PRXA 2OE3A 4MK3A 2LSTA 3FEUA 3F4RA 3PH9A 3BBYA 5CRGA 2JZRA 4P3YB 1WWJA 2RLIA 2VM2A 3KH9A 2L4CA 2IMEA 1B48A 3C73A 2LS5A 1AAZA 1HD2A 3F8UA 1XVQA 2BMXA 5ECMB 4AJ6A 2JSZA 4MLYA 3QMXA 4OMVA 4OFNA 2WB9A 1MDKA 1K0BA 2YNXA 1A8LA 2FGXA 2L4QA 5CNWA 2VOCA 2LNSA 3G7IA 2HSHA 1OC9A 1JLWA 1XXUA 4LL4B 2X64A 3QAVA 3GKMA 3J7Yk 1EEMA 1YF1A 2J9HA 1X9MB 2V41A 2VCZA 2B7KA 4KE3A 4MCUA 5ECQB 3UVHA 1AXDA 3HJPA 1JZDA 3IK9A 5B7CA 5ECSA 2CT6A 4PGTA 4BA7A 1NHOA 4MABA 3SWLA 3M1GA 2NVLA 1THOA 2P0GA 4CHSA 5ELAA 2H0HA 2MMZA 2ZUPA 1RW1A 4ULXA 3FK8A 2V6OA 3FZ4A 3A2XA 3DGQA 1YQ1A 3E0UA 2QSIA 2R5GA 4IN0A 2GTUA 3GMFA 4TKYA 3F3RA 1BG5A 3QDNA 4OFTA 5FT3A 2G0FA 22GSA 3V1WA 2AAWA 1M2AA 2F3MA 1A23A 2KUCA 5CO3A 7GSSA 5JWQB 5A4WA 1SK1A 1AIUA 1UC7A 2VD0A 2OADA 2VUPA 4PURA 4TXOA 3P7XA 4TR4A 3RPPA 4Q5FA 2V1MA 4IP1A 3TKQA 5DJMA 5F0GA 3VPQA 2OBIA 3GKNA 1TU7A 4E8EA 3UAPA 6GSWA 3MWHA 4NV2A 4ISDA 5LCZA 3DVXA 3GTUA 1GRXA 1YY7A 2LJRA 2JACA 1XPVA 2B6MA 2DBCA 4DVCA 4FYBA 3FY7A 1Z7PA 4KW6A 4FYUA 1GL8A 2FWFA 1T00A 5ENUA 2FWHA 3H79A 3ZZXA 1M9BA 3GX0A 1B9XC 1GTAA 1V58A 2F9SA 2LNTA 3N9JA 4XS4A 2E0QA 3S9FA 3D5JA 4PNGA 4KB3A 1ERWA 2DC5A 1U3IA 2YWIA 2ES7A 3D21A 1WPIA 2N5FA 4ZIJA 3TUEA 1NHYA 1AQVA 2XPEA 3F9UA 2QC7A 4J56E 1TJDA 5IO0A 2H8LA 5KN2A 3PGTA 3MNGA 2GQMA 2L59A 1XZOA 1DBYA 4G2EA 3VWUA 2OE1A 2PBJA 2VCQA 1ERTA 2C0FA 3BCIA 1USBA 3GFKA 4BL7A 1EGRA 3MDKA 1WOUA 4I97A 5EVOA 4K9ZA 3UVTA 1JHBA 16GSA 2HYXA 3ZYWA 3EU3A 3GN3A 1ZGNA 3KMOA 2YP6A 4FH8A 1O81A 2MBTA 1X9SB 4ZL7A 3JCML 3IXRA 1W89A 4POLA 3EU4A 3GIXA 4V1Ap 5LD0A 4DEJA 4LL1B 3U5RE 3DMLA 2H73A 1XBSA 1VF3A 4LMWA 2H1DA 4NMUA 1TI1A 2EIRA 5ID2B 2AYTA 5CAXA 2M80A 1M99A 5G31A 2IMIA 3UOMA 3A2WA 1WRYA 2VIMA 1Z6MA 2R6KA 2AUVA 4I2TA 2GT6A 1N2AA 1QXHA 5IMCA 1GSYA 2K8SA 2X8CA 4QQ7A 1IYIA 1NW2A 2CZ3A 2LQOA 3TJFA 4ZILA 2O8VB 4TXOB 2I9HA 3F63A 3U6VA 3NZNA 3EYTA 1GTIA 5IOXA 1XWAA 1YF0A 5J5NA 4NHZA 1FVKA 1TK8B 4KAEA 5G30A 3GA4A 1X0RA 5IPGA 1Z7RA 3IHQA 5KN3A 4AGSA 4CDOA 3GTUB 3F3QA 2WULA 2V32A 5CRHA 2B5EA 2KHPA 2I81A 3FZ9A 3A2VA 5F07A 4Z7XA 2YWNA 2YZHA 5COHA 1TRSA 3D4TA 2E2MA 4LLRA 2MBSA 3DD3A 4N30A 3D4MA 3GKXA 2CVBA 2C80A 5HFGA 2L6DA 3EMPA 1FHEA 3KEBA 3GSTA 2OBKA 3GX8A 1DE1A 2NPBA 3ZTLA 3HXSA 2PWJA 2XBQA 2B7JA 5EY6A 4ILFA 4GTUA 1HYUA 2WFCA 4KCEA 3EE2A 3TKPA 1X9WB 1GTBA 2VLVA 1SKWB 1X5CA 4G10A 2GS3A 3VPTA 4DSQA 3DYRA 2HZEB 3C71A 1T7PB 2HT9A 19GSA 2WCIA 4N10A 4NXIA 2KP2A 2H0IA 2ALBA 1ZCPA 4FIWA 3CRTA 1PKZA 1Z3EA 2IN3A 3IRAA 1AC1A 3LFLA 4OWYA 1SJZA 2IMFA 1TKDB 3L9SA 1UN2A 5FWGA 4IQ1A 2GT5A 1KEBA 4K1FA 1FB0A 1I9DA 4V1Ag 1F2EA 5C00A 2V2GA 1BX9A 1K0OA 3BD2A 4LMVA 5E59A 1OAZA 3VURA 2C3TA 4AJ8A 2NDOA 5G2ZA 3KCMA 2CX4A 3Q18A 2CV4A 3KTLA 5D93A 2NTOA 2H66A 2K9FA 1HNAA 2IMKA 4XIHA 4WF5A 2CVDA 2DMLA 4O7HA 2H1AA 2ON7A 4GXZA 4OO5A 2LRNA 3HVXA 1TI3A 1TRUA 3HKRA 6GSUA 5KEJA 4ZL9A 4Q5RA 5DAKB 5ECKB 1M0UA 4JE1A 2LJKA 1K0DA 4ZB8A 5KN0A 4MDCA 2YV9A 4K0NA 4NWYA 1F3BA 2CA8A 5IMAA 2F8FA 1SU9A 3GH6A 3E9JB 4E8HA 3KP8A 4N11A 1EV4A 4TOPA 1GWCA 2E7PA 3GRXA 5G5FA 4F0CA 1Q4JA 2GZYA 4PQHA 2TRCP 3GNJA 3KGKA 3TRXA 2BTOT 2DLXA 4N0ZA 2J23A 2K18A 4HI7A 5AIVA 1XWBA 4L5LA 2DJ2A 4FO5A 1Z6NA 3WGXA 5IQYA 1SKRB 4ACSA 5ECRB 1SYRA 1W4VA 3I43A 3L4NA 3VWWA 1A0FA 1K3OA 2WRTA 2JSYA 4EUYA 2CX3A 2Z9SA 1PSQA 1EEJA 5IPHA 2LEGA 1XIYA 2YWMA 1UA5A 1EOGA 3NOFA 2PU9C 10GSA 3C1SA 1GLPA 3IPZA 3TOTA 3D22A 1OVNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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