2FCHA

Crystal structure of thioredoxin mutant g74s
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRSIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S
rcsb
molecule keywords Thioredoxin 1
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 32
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fchA00
4LLRA 5IIZA 1BJXA 1GSSA 2F8FA 1O8WA 5CREA 3IRAA 5B8AA 2FHEA 4I5QA 4HZ4A 2NPBA 2M72A 1K3YA 2VL3A 3QD9A 5CO3A 1TJDA 3QDNA 1ST9A 1SL0B 3D4MA 2MMNA 2RLIA 1GUKA 1EWXA 5DCGA 3TJGA 2E2MA 1XPVA 2H74A 3M9KA 1YY7A 4L5LA 1GRXA 5DALA 1GP1A 3FZ5A 6GSXA 1YKAA 6GSTA 3BJ5A 2CX4A 4EF0A 1XW6A 3KH7A 1WPIA 3F0IA 3W6GA 3KIJA 5B6NA 1XVQA 4ZILA 3QPMA 2R6KA 2RUFA 2YZHA 1SL2B 4HU7A 3LYKA 4NMUA 1VF2A 1K0CA 4MZWA 1GUHA 3IK9A 3TCOA 1FB0A 3FR9A 5JCGA 5DVBA 4ZXGA 1AAZA 1A0FA 2J23A 2K8SA 2BMXA 3WYWA 4ECIA 2HZEB 5HQPA 2PERA 2ON7A 5H5RA 4RI7A 4ZIJA 1AUCA 5ENUA 2B7KA 3MWHA 2OADA 2XBIA 2LRTA 5G5EA 4FYCA 4YH2A 1GH2A 4QL7A 2P0GA 4RQXA 4HEA2 5F05A 1K0AA 2OE0A 3LQ7A 2V2GA 3TKSA 1O6JA 5JCUA 4F03A 4IS0A 6GSVA 2LJAA 3F9UA 3L78A 2Z9SA 4GSNA 2IMKA 1TRUA 2M46A 5IMFA 1X5CA 2XHFA 4FYUA 4L5OA 4CW9A 2H8LA 1XZOA 1H75A 3ZREA 3VK9A 2XBQA 1KBNA 4TR4A 5ECPB 1FHEA 2NDOA 2ZUPA 5DJLA 1A2JA 2H75A 1F37A 4ZBAA 3D5JA 19GSA 1Y25A 1OC3A 4V1Ap 2CZ3A 1ZYEA 4GCIA 2GSRA 2C8UA 4AJ8A 5ECQB 2MBTA 2RM5A 3EVIA 3C7MA 1M2AA 3HCZA 3TOTA 2VL2C 1YEXA 3I43A 4K2DA 4GLTA 1PMTA 3TUEA 2F51A 2JL4A 3KMNA 1ERWA 1JZWA 5DJMA 3Q74A 2IPAA 2H30A 3RPNA 3QAWA 1M99A 2GSTA 3BBYA 2N5FA 2X64A 3J7Yk 1EV9A 1S3AA 5DCHA 2JZTA 3UOMA 1DE1A 2G0FA 1K0DA 1Q4JA 4TN8A 5IO2A 1QGVA 1XVWA 4Q5NA 1U88A 5CAXA 3IHQA 5EY6A 4ECBA 4I2UA 5AIXA 5IMAA 4HS1A 3C71A 5FWGA 2H66A 5IMDA 1CQGA 3UEMA 1DE2A 2LV3A 1B8XA 3CSJA 4LL1B 2WFCA 3KH9A 1GTIA 3IXRA 1V2AA 4PGTA 2GT5A 1F3BA 2AYTA 1JFUA 4ML1A 3EMPA 1JLVA 4KCAA 1THOA 4EUYA 3LJRA 4DVCA 5ELGA 3GV1A 4F82A 4WF4A 3E0UA 3NZNA 5KN3A 3EWLA 4ID0A 2LNTA 2X99A 1EEMA 1XOBA 2YWMA 4GXZA 1X9SB 2L5LA 1Z7RA 4OD7A 1PGTA 3QMXA 3TKSC 1THXA 2LRNA 2X8HA 3O3TA 1EOGA 2VLTA 2CVBA 2VLVA 2YOIA 2C1YA 3UARA 2CA8A 3C1RA 5CRHA 3GL5A 3HA9A 3D0ZA 4YQVA 3EC3A 4ZB6A 5JWQB 3GHAA 5COHA 1TKDB 1U6TA 4MZBA 2BTOT 4E8HA 3CSIA 2H76A 2MMOA 4KA0A 2C3TA 5A4UA 5ECIB 5INYA 4I2TA 4KCEA 2X8GA 3KCMA 4X43A 1FOVA 2WS2A 1GTAA 1O73A 4DSSB 2JSZA 4KUNA 2JACA 1K3OA 2C0DA 1S3CA 1MDIA 2HXKA 2KLXA 4JR4A 1PN9A 2YWIA 2A2RA 3HZ8A 2DBCA 2GZPA 4WF5A 4MPFA 4MDCA 3TJKA 4HDEA 2B5YA 2DJ1A 3EU3A 3A5WA 3FR6A 1WRYA 2GSQA 4MH3A 3E9JB 4POKA 3U6VA 1Z6NA 1I9DA 1JZDA 2CAQA 1TRVA 4WBJA 2I1UA 1PD21 3LFLA 2CQ9A 4BVXA 3DGQA 1BQ7A 4HQZA 2QSIA 2IWTA 2K9FA 1NSWA 2HFDA 1EGRA 3QOUA 1O8XA 4J57E 2PPTA 1X9MB 1OC8A 3SBCA 1O7UA 3ZVJA 4IJ3A 4V2NA 1KEBA 3GSSA 4WR5A 1SU9A 2YCDA 1WJKA 4J56E 3L9UA 3IPZA 4GWRA 1ZZYA 4TOPA 1XBSA 1R4WA 1YQ1A 5HR1A 3N5OA 5J4UA 3QR6A 2K6VA 2KUCA 2YANA 1J08A 5HR0A 1M0UA 3M3MA 3ZITA 3K8NA 5E59A 1HYUA 1WMJA 2DIZA 2MZCA 2F9SA 3M9JA 4ZL9A 2PWJA 5AISA 1LJRA 2GLRA 5FHIA 4MA9A 2H19A 2O89A 4X0XA 4ZBDA 4XRDA 2YJHA 2JSYA 3IE3A 1RQMA 1SD8A 3LG6A 2GGTA 2I9HA 4GSTA 4MF7A 4IP1A 4Z7XA 2WULA 1V9WA 3BCIA 3L0HA 4V2MA 2MMZA 3ZL5A 5DBQA 1Z5YE 2IFQB 1K0BA 1N8JA 2VD0A 1MDJA 1MEKA 4JR6A 3DXBA 4KB3A 3ZIVA 1GULA 2GQKA 4KE3A 1CQHA 1G6YA 4HOJA 1R7HA 1GSFA 4IKHA 2LTKA 2KP2A 5H5SA 3N9JA 4OFNA 4LL4B 5ECHB 3EURA 9GSSA 2ON5A 1G0TA 2R5GA 2DJ0A 3H1NA 1B4PA 22GSA 2EIQA 2DLXA 5JCWA 5CRDA 1XW5A 2ZCTA 1AIUA 1A8YA 3KEBA 2PUKC 2YJ7A 4PNGA 5F8BA 2N5BA 1G6WA 1PKWA 3F4RA 1XWCA 3UAPA 2F8AA 1TI3A 2OKAA 4ZBBA 3RHBA 2P31A 5DQYA 4WBRD 1XWBA 4TW5A 1LU4A 2FLSA 2FWEA 5LCZA 1RK4A 2FNOA 3CYNA 3EE2A 2CZ2A 1SKRB 4AJ6A 3A2VA 3US3A 3J7Yb 1OKTA 3HVVA 5JWRB 1ERUA 2X8CA 1R26A 1MD4A 2LQOA 3IAS2 3QCPA 3VWXA 1OC9A 2PBJA 2PMTA 4O5RA 1TTZA 5IMZA 5G2ZA 4KAEA 3HY2A 5EL8A 1FW1A 4KSMA 1U87A 2CVDA 4ECJA 5J5NA 3IA1A 4XTSA 2IJYA 3ISOA 4MJCA 3M0FA 3TKSE 5ABRA 2HLSA 3CTGA 2B5XA 5DAKB 7GSSA 4XHMA 5IMCA 4QL9A 2L4QA 3IK7A 2P5QA 1TI1A 3ZMLA 2HSHA 3ZTLA 3ERGA 3WT2A 4FO5A 4MJEA 1SK0A 1Z3EA 3F63A 3LORA 2FA8A 1QK8A 1HNAA 4IQ1A 1PX6A 3HZ4A 3LWAA 4EC0A 5GAND 1U3AA 1Z7PA 13GSA 3DEXA 1TXXA 1K0OA 3GH9A 2PVOC 5ECLB 1GUMA 5D9VA 3HJMA 5D73A 4DSQA 2LQQA 3UJ1A 2L5OA 1T4YA 1PQNA 2MMAA 4PQHA 1OAZA 3NIVA 2VIMA 5ID2B 2G2QA 3HJPA 5DQSA 1TRSA 3KGKA 4EE0A 3GMFA 3G7IA 2VL9A 1PA3A 3GKNA 3D21A 2H6ZA 2YNXA 3ZIJA 4K7OA 5CP1A 3PINA 2CVKA 1E2YA 3DIEA 4JE1A 1G7OA 3ZFLA 2GZZA 3UBKA 1T3BA 4NHZA 3TRQA 3ZVJD 1BG5A 3DYRA 1DSBA 1OYJA 2H0GA 2DMMA 4F0BA 3RDWA 5IPGA 1SENA 1O85A 3WT1A 1YZXA 3MNGA 2HNLA 4NAXA 1XW9A 3ED3A 4XCSA 3CRTA 3APSA 1YF0A 5HFIA 1HNBA 3VFIA 1GWCA 1QFNA 4GF0A 1PL2A 3TGZA 3AY8A 2LUSA 5CRWA 1FAAA 1GLQA 2FY6A 2K8VA 1BX9A 2LNSA 1W4VA 3LXZA 3CRUA 4I8BA 1AXDA 1F2EA 4NV5A 2AAWA 1MTCA 2FGXA 2GS3A 3BD2A 5IOWA 1WP0A 4IQAA 4D73A 3H4KA 4EL1A 2H1BA 1OKDA 3GYKA 1A2MA 1DBYA 4JEDA 2YWOA 4XRAA 2YV9A 1RW1A 1X5EA 1V57A 2RIIA 5GSTA 3HKRA 2EC4A 1R5PA 4IGJA 1AQXA 1PRXA 3D22A 17GSA 1KTEA 3DRNA 4FYBA 4PNFA 1YF1A 4ACSA 4AJ7A 2YZUA 4HJMA 4BVYA 4Q5QA 5D96A 2H6XA 18GSA 1ON4A 2PU9C 3HVXA 4IELA 4KNDA 1YDKA 1T1VA 1FO5A 3GTUB 2CV4A 2VCWA 3TRPA 2GTUA 2VD1A 2OE1A 1DUGA 5IM9A 4GSSA 4IW9A 3KMOA 3CBUA 3EU4A 1VF3A 1VF4A 3KD0A 3M1GA 2K18A 4N0VA 3UMAA 2REMA 3FZAA 3SWLA 4ZB9A 1U3IA 1ZL9A 4DSRA 2C0GA 2L4CA 3F6FA 4XS6A 3S9FA 1SJZA 1SK1A 5GSSA 4EVMA 4IBPA 2AHEA 1NM3A 3WGDA 14GSA 2ALBA 1GSUA 2CX3A 4DEJA 4TRXA 5D9TA 4EKZA 2MYGA 1WE0A 1A24A 3I9V2 2VAFA 4HJ2A 4NPBA 1BEDA 3P90A 2FWFA 4TKYA 1ERVA 1TDIA 2LS5A 2RUEA 4ZL8A 4O32A 2C4JA 4OO4A 2VCTA 2E2GA 1SJ6A 1X0RA 4WXTA 2QKEA 4K0GA 1N2AA 3CMIA 4IP6A 2I81A 3KZQA 1V58A 4MF5A 4DSSA 2R4VA 1ZYQB 1PL1A 3ERFA 3KJYA 3UIWA 2LEGA 2AB6A 5IPHA 2O8VB 2VCZA 1MD3A 5AN1A 4JU5A 3PGTA 4XS4A 4TR1B 1GTUA 3VPQA 1SJIA 4MK3A 2LJRA 3ME8A 5F07A 1TU8A 3IV4A 1GLPA 2WGRA 3HXSA 1R5AA 4PQ1A 4GQFA 5F0GA 4RUVA 3Q6OA 3WGEA 2IIYA 1Z9HA 3KM6A 4MF6A 2V6KA 2ZNMA 10GSA 3L9VA 1EOHA 3E3EA 2B1KA 3TKRA 2VLUA 3GSTA 1T00A 3LSZA 4K9ZA 1SD9A 4MJBA 2OBIA 4PURA 4HUAA 5H5QA 4YAPA 1M9AA 4BWQA 4MP4A 5J3RA 3F8UA 2ES7A 4N0ZA 6GSSA 1M2DA 5B6MA 2GQMA 5A5KA 1OE8A 5E4WA 4TXOB 1AQWA 2JU5A 3C8EA 3WGXA 2JADA 3IOSA 2DIYA 4OWYA 5D9WA 4ISDA 6GSUA 2CT6A 3GX8A 11GSA 4GRFA 1IYIA 4P3YB 2QGVA 2DJKA 1ACVA 2HT9A 5HFGA 1H4OA 2WCIA 2WRTA 3PH9A 1E6BA 4I6XA 3FY7A 2NVLA 5IMVA 4NHWA 2AV4A 6GSYA 3GKMA 5KN2A 4K0NA 1J9BA 5GAPD 4F0CA 4GTUA 4TR3A 4MABA 2GZYA 1M7TA 1NW2A 2N5AA 1TRWA 1EGOA 2F3MA 3GX0A 1TU7A 2TRCP 1G7EA 4FH8A 3NOFA 4JBBA 3GURA 1ZMAA 3TKQA 2IFQA 3QFBC 4MMMA 3QAGA 2LSTA 2C0EA 4NWYA 1YKCA 1C72A 1FB6A 1OVNA 5IOXA 3GNJA 2H72A 3C73A 3WD6A 2LRCA 1SYRA 1AW9A 2TRXA 1I5GA 4AGSA 2HI7A 1XIYA 2HZFA 3R2QA 5F06A 2XPEA 3L4NA 1S3DA 5CYYA 1YJ6A 4Q5RA 5ELAA 1GSEA 2O85A 1A2LA 2GVPA 4GQCA 1B9XC 4K6XA 4ECCA 1JZRA 2V32A 4E8EA 2M80A 5J9CA 1K0NA 3TKPA 3FR3A 1WOUA 3RBTA 1NHOA 2H1DA 3QAVA 5J9BA 3A2WA 1TK8B 2VM1A 2KHPA 4PXOA 4QQ7A 2H0HA 3W8SA 4OCEA 2FD3A 2YPMA 5ECSA 4BPYA 5HFKA 2C0FA 1GNWA 2JZRA 2C80A 1GL8A 3UVHA 3UBLA 2VL2A 1FG4A 4G2EA 4N30A 1SKSB 4TR0A 16GSA 2V1MA 4K7NA 3G7JA 2XPDA 3IBHA 2C3QA 2IMDA 5ECNB 5DALB 5B7CA 4EXJA 1F9MA 3KP8A 3P2AA 3GIXA 5D8IA 2H1GA 2QC7A 2YN1A 20GSA 2GDRA 1KNGA 1ZOFA 1ZCPA 1XWKA 2A4VA 4CHSA 3IR4A 3ZYWA 1QXHA 1GTBA 3ZRDA 4MJAA 2L59A 1TOFA 1A0RP 3DD3A 3GN3A 2J9HA 5HR2A 5ECMB 1YEPA 3ZMKA 1VF1A 5DAKA 5AIVA 3F6DA 5LNKe 3VLNA 5A4VA 3F4SA 3D6IA 4TVEA 3ZZXA 3TOUA 4J2FA 4X1UA 5G5FA 1WWJA 1ABAA 4RQRA 3KTBA 4EDZA 3O6TA 1J0FA 5ECKB 3CTFA 1HNCA 1Y6EA 2YP6A 1GNEA 1UC7A 2IMFA 4L0UA 2OJLA 4OCFA 2MBSA 1K3LA 2HZEA 1X5DA 2FCHA 4G10A 4XS1A 2EIRA 2VOCA 1TK0B 4ML6A 2IMEA 3KP9A 6GSWA 2LKUA 2H70A 3ERWA 3GA4A 3DWVA 1T4ZA 2DJ2A 3FRCA 5C04A 3C1SA 4HQSA 3DVXA 1HQOA 5JWOB 4KDYA 4F9ZA 4JZQA 1ILOA 5ID2A 4XIHA 4YQMA 3A3TA 3I6AA 1F6MC 2PN8A 4KSOA 3IC4A 2O7KA 5B8BA 4FIWA 3MDKA 2IMIA 4K8MA 5AGYA 4ZL7A 3APOA 2C3NA 3VWUA 3DVWA 3KXOA 2HRFA 4OFMA 2KP1A 3F4TA 5LD0A 4MPGA 4MH2A 3PR8A 2B6MA 3DKSA 3RHCA 4LMWA 4POMA 4POBA 1B48A 3JCML 3VI7A 2V41A 5KEJA 4KX4A 1M2BA 2FWHA 2H01A 1URMA 3P7XA 5KN1A 2VCQA 3RPPA 4YAVA 3V1WA 3HJOA 2L6CA 3UVTA 1AC1A 1QMVA 4MZCA 4OMVA 2A2SA 3APQA 4PQIA 1NHYA 3HHVA 2R37A 3ME7A 2VCVA 4CDOA 2R2JA 4NXIA 2GSSA 4D73B 2TIRA 5IQYA 3BCKA 3KTLA 4WETA 3EYTA 1OE7A 1Z6MA 2YWNA 3DMLA 1JHBA 4F2IA 2D2ZA 2FWGA 3H93A 2H71A 3TRXA 4IVFA 2WDUA 2DC5A 3F3RA 4L8EA 4EO3A 1XWGA 2OACA 2BJXA 1XOAA 3ZFBA 1VRSD 1EP8A 2VCXA 5G1LA 4KGIA 1PSQA 4HZ2A 5L71A 2I3YA 1V98A 1WIKA 2RM6A 3IAM2 4POLA 3O76A 1EV4A 4ZB8A 2VUPA 3D4TA 2H1AA 2B7JA 1ZGNA 3FYGA 5C00A 1QQ2A 3FW2A 3GTUA 3MSZA 4MLYA 4KW6A 1FVKA 1F3AA 2O87A 3EMXA 3Q19A 1PKZA 3L9SA 4G19A 1BYEA 1GSYA 3TDGA 4PX1A 1LBKA 5G31A 1UVZA 3CSHA 4O7HA 3VURA 2VM2A 2FUG2 5D9XA 3FEUA 2L57A 4HU9A 4V2LA 3HD5A 3FKFA 2V6OA 4NV2A 5ECOB 2H0IA 4O92A 1USBA 3W8JA 3MAKA 1SKWB 1TK5B 3ZLPA 3GFKA 4JRRA 2HE3A 5ECRB 1SYXA 3CXGA 5G30A 4N10A 1XXUA 5HR3A 3FK8A 2OE3A 1HD2A 4H86A 2WJUA 3G9BA 1AQVA 3HDCA 3A2XA 3FZ9A 3P8WA 2E7PA 1B4QA 1JLWA 2JZSA 4XS4B 4HI7A 1XWAA 2H73A 3LYPA 2HYXA 5DDLA 2AJQB 3UL3A 3RAZA 2DMLA 1MDKA 4KDUA 3LEFA 3U5RE 4YQUA 3FZ4A 4TR1A 4ILFA 2OA7A 4K1FA 3LGCA 1FVJA 3BOAA 8GSSA 1A23A 2B5EA 4K7IA 1B9YC 2B3SA 1GSQA 3FHKA 5CNWA 2WB9A 5GZZB 1XCCA 2GQLA 5D93A 3GL3A 3H79A 1M9BA 3GRXA 3Q18A 4G9HA 5KN0A 2FA4A 3VI5A 3TB2A 4BL7A 1TP9A 1IYHA 3I69A 4IN0A 1T7PB 2DJ3A 3LXTA 4TXOA 2OBKA 1JZOA 3GKXA 5G1KA 1TW9A 3VWVA 4I97A 1ERTA 2HSYA 4PUFC 3TJBA 1SL1B 1O81A 1VGLA 2KOKA 3TJFA 4Q5FA 2H6YA 4ULXA 2R3XA 4OFTA 1Q98A 1ML6A 4KH7A 4WEYA 4BA7A 4V1Ag 1EP7A 1UN2A 3G7YA 4TXVA 4RI6A 3EINA 4MCUA 2LJKA 4IHUA 3VWWA 1GSDA 3GH6A 2I4AA 2IN3A 4WR4A 4IJIA 3GUSA 2L6DA 1EEJA 4KDXA 4AF2A 2GT6A 1K0MA 2B1LA 3H8QA 3M8NA 2P5RA 4BWSA 2NBSA 3F3QA 3OR5A 1X9WB 12GSA 5FT3A 3VPTA 2PVQA 2HRNA 2NTOA 2CAIA 2E0QA 1UA5A 2AUVA 1T8EB 5A4WA 2DJJA 5EPFA 2YV7A 1W89A 4OO5A 5CRGA 2XC2A 1A8LA 5IO0A 4L0WA 2PGTA 3HVSA 5J41A 2DSAA 1V40A 2IL3A 3TJJA 2VO4A 2EIOA 1OC9B 5EVOA 2WZ9A 1EZKA 1PX7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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