2FD3A

Crystal structure of thioredoxin mutant p34h
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGHCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant P34H
rcsb
molecule keywords Thioredoxin 1
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 30
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fd3A00
1Z6MA 3MAKA 2O89A 2VM1A 3TOUA 5FT3A 3G7YA 3D6IA 2YCDA 3DXBA 4OCFA 1FO5A 5B6NA 2PVOC 2TRCP 1PL2A 3U5RE 1YKCA 4OWYA 1H4OA 4Z7XA 2L4QA 3WT2A 2VIMA 3QAGA 3L9VA 4MK3A 2B7JA 5CYYA 3A2XA 6GSXA 1K0MA 5A4VA 1XOBA 4IQ1A 4XS4A 5HFKA 1NHYA 2WRTA 3BBYA 2C80A 4XRDA 2TIRA 3GRXA 3ME8A 1XW5A 5IMZA 1SKSB 4J56E 3TKPA 4YAPA 2VLVA 2QGVA 3ZREA 2CQ9A 1ML6A 4JE1A 1FW1A 1TI3A 3OR5A 5B7CA 2VLUA 3UBKA 1K0OA 5G2ZA 4ILFA 2LRTA 2FY6A 1EP8A 2YWNA 3ERGA 4DSQA 1SENA 2O85A 4WXTA 1U3AA 1ST9A 1M99A 1ABAA 2GZPA 4E8HA 3L9SA 3FZAA 2FWHA 4N0ZA 2GZYA 1GWCA 3CRUA 1AXDA 3ZIVA 3L9UA 1CQGA 2L4CA 2VD1A 4TR1A 3ZVJA 4XS6A 4ID0A 4HOJA 4RI7A 3TKSC 2VCZA 10GSA 1YKAA 2CVKA 1N2AA 2YP6A 3GFKA 5DQYA 3IRAA 1FAAA 3NZNA 2J23A 3FZ5A 4JRRA 4TR4A 4K7IA 1TW9A 2KHPA 5IQYA 1T4ZA 5ECRB 3GX0A 3LFLA 1SL0B 5ECQB 1WMJA 4HZ4A 3TGZA 3M0FA 3IV4A 4ACSA 5IPHA 5JCUA 2IN3A 3FRCA 5ELGA 1RQMA 3CMIA 4MZBA 3PR8A 11GSA 3KH7A 1A0RP 1JZWA 5GZZB 3FR9A 3TJGA 3KXOA 1DBYA 3UVTA 1SYXA 4K9ZA 4K0NA 4XTSA 5E59A 5A4WA 1HQOA 3UL3A 4WR5A 1PA3A 3GYKA 5DVBA 3VFIA 3U6VA 2B5XA 2R2JA 1PRXA 5HFGA 4GSNA 1TOFA 2P31A 2DMLA 3HVVA 5KN2A 3G7IA 4KAEA 5B8BA 2YZHA 2ZNMA 3F6DA 1SKWB 1JLWA 1XIYA 4POKA 1M2BA 3MSZA 5EY6A 5JCGA 5ECPB 2VCVA 3D4TA 1JZRA 2AUVA 3GNJA 3RHCA 2JZTA 2O87A 1K3OA 1HNCA 2OADA 4MF6A 5IMCA 5IMDA 2RUFA 2CVDA 2FWGA 1K3YA 3GMFA 1R26A 4MZWA 4WBJA 2GQKA 1AC1A 1B9YC 1OKDA 3US3A 1V2AA 3QAWA 3HJOA 4NHZA 3ISOA 1EV4A 1MDKA 2F8AA 3UARA 5AIXA 1VGLA 3DYRA 4V2NA 1GUHA 3C1SA 1WWJA 1XW6A 3C73A 4N10A 4JU5A 4NPBA 3RAZA 3D5JA 3A3TA 1G6YA 1USBA 5ECOB 1A8YA 3KTBA 1EOHA 1LU4A 3GKXA 3W6GA 4FO5A 5D96A 5F0GA 1O8WA 3IK9A 2NTOA 4HS1A 6GSTA 1EEMA 3F8UA 3TOTA 5IOXA 4AJ8A 1AUCA 2F9SA 2YZUA 1SK0A 4DSSB 1ON4A 3IAS2 3H79A 3F63A 2O8VB 1SJZA 1XWBA 1YQ1A 2B5YA 1O6JA 3HZ8A 2LS5A 2WGRA 4YQMA 2VCQA 3SBCA 2K6VA 2YNXA 1R7HA 14GSA 4CHSA 2H74A 2V32A 3TJJA 1XVQA 3HD5A 3HDCA 5DDLA 2B1LA 4IBPA 1S3AA 1XWAA 4KSMA 1FOVA 3RPNA 4I2TA 1BX9A 1T1VA 1VF2A 2VCWA 3IDVA 2LJRA 4Q5FA 2DJ3A 4I97A 2VL3A 2MMAA 1S3DA 2L59A 2X99A 5AISA 1YZXA 5HR2A 2B5EA 3KEBA 5CO3A 5D9XA 4OFMA 2IMDA 3EC3A 2HT9A 16GSA 1K0NA 3VWUA 4MLYA 2H8LA 3IA1A 1EEJA 3GSTA 3E3EA 3APQA 4JZQA 1BEDA 1XPVA 1MD4A 5EL8A 2K8VA 1VF1A 1QFNA 2NPBA 2VL2C 2L5LA 4NWYA 5GAND 3KM6A 4IS0A 1Y25A 2KP2A 2YWIA 2HLSA 2CA8A 3P8WA 2PBJA 1Z7RA 18GSA 2C0GA 2DIZA 2I1UA 4LLRA 4TXOB 4ISDA 4KE3A 1LBKA 1M2AA 2NDOA 4HU9A 4D73B 4IW9A 2K18A 2L6CA 3H1NA 2RUEA 4PNFA 4DSSA 4QL9A 4XS1A 3DIEA 5FWGA 3KGKA 2ALBA 1TU8A 6GSWA 4JR6A 2H6YA 4EC0A 2LJKA 1FVJA 5G1KA 1Z5YE 2FCHA 4EVMA 3ZIJA 1B4PA 4OD7A 1NW2A 1SKRB 2WCIA 4Q5NA 3L78A 3TJKA 3KD0A 3DMLA 5ELAA 3O6TA 2PMTA 2H71A 2LQOA 3VWVA 3RHBA 1KNGA 2KLXA 3GKNA 3HYPA 3WGEA 1V57A 4FYBA 2YANA 1BQ7A 4ZILA 1OKTA 4NAXA 2CZ2A 4K0GA 3GKKA 2HZFA 3HHVA 1GNWA 1WE0A 5CNWA 2IPAA 3KP8A 5HFIA 2IL3A 4PX1A 1A2JA 1FVKA 20GSA 3GTUB 2MBTA 3HCZA 4F03A 1X0RA 2C0FA 1KBNA 1OC9B 3FW2A 2H0GA 1DE2A 1GSUA 3UEMA 1X5EA 3ZYWA 2M80A 3F3QA 1GSQA 5IMFA 1V9WA 5HR0A 3PGTA 2GT5A 3GA4A 1KEBA 5IMAA 2R5GA 4GSSA 3UIWA 3TDGA 1QGVA 2JSYA 4TXOA 2CVBA 3EYTA 3E9JB 4MZCA 1SJIA 4D73A 4NXIA 1THXA 2LTKA 3F4RA 5AIVA 5IO2A 5D9TA 2H01A 4HZ2A 1BJXA 3N5OA 5IO0A 2FWFA 3LXZA 4DSRA 1YF1A 1K0CA 4MP4A 1JHBA 3I6AA 2WULA 1MD3A 2BMXA 3Q18A 3ZLPA 1H75A 4QQ7A 5DAKB 2DLXA 4X43A 3GKMA 1Z6NA 2HFDA 3VI5A 1SU9A 1YEPA 3LGCA 1O8XA 2NBSA 3BJ5A 5C04A 3M9KA 1CQHA 4HUAA 2H73A 3TKQA 2C1YA 5INYA 3CSIA 1WRYA 4F9ZA 2CX3A 5EPFA 4PQ1A 3VK9A 4K8MA 1Q98A 4G9HA 3GX8A 3VPQA 3QMXA 2VL2A 4LL1B 1J08A 3EMPA 2HXKA 1AAZA 3LWAA 2L6DA 3EU4A 3K8NA 5HR3A 4RQRA 3TRQA 4KB3A 3I9V2 1WJKA 1PKZA 3GTUA 4TW5A 2QKEA 4JR4A 4OCEA 2C3QA 1TK8B 1IYHA 1OC9A 2IFQB 5J9BA 4ZXGA 2LJAA 1YJ6A 5KN1A 2HSHA 2DC5A 1X9MB 3RPPA 4NHWA 22GSA 4GF0A 4TOPA 2DJKA 17GSA 4MPFA 1T3BA 1YF0A 2YOIA 1GUKA 3UVHA 1A0FA 3GV1A 4G2EA 5ABRA 2E0QA 4OMVA 1Z9HA 9GSSA 1TRWA 1SK1A 5IOWA 6GSVA 5LNKe 1QXHA 8GSSA 1R4WA 3UJ1A 1GSFA 1OE7A 5F05A 4HJ2A 1O81A 5D93A 2OA7A 3QOUA 1IYIA 3FK8A 5DAKA 4L8EA 4F0BA 4Q5RA 1QMVA 1ZGNA 4IJ3A 5DALB 1OE8A 3QAVA 3DKSA 4EL1A 3FEUA 1G7EA 1SD9A 2M72A 5CRGA 1ERUA 1FHEA 3DVWA 2K9FA 2DJJA 4AGSA 1F3AA 1SL2B 1GH2A 4K7OA 1ILOA 2VAFA 2LRCA 4WF4A 7GSSA 1Y6EA 4MDCA 2VCTA 5CRHA 4KGIA 4IKHA 4FYUA 5C00A 1JLVA 2HSYA 2HYXA 1R5AA 1UN2A 2FNOA 3D0ZA 5B8AA 2IFQA 3KTLA 4KSOA 3EU3A 4ZL8A 3DGQA 5A5KA 2PN8A 1TXXA 5F06A 5G5FA 3LYPA 4K2DA 2XPEA 4FYCA 1N8JA 2OACA 1A2LA 2WFCA 1JZDA 2DMMA 5COHA 2AJQB 5IM9A 2XHFA 5HQPA 3APOA 4J2FA 2PVQA 3TUEA 5J4UA 3DD3A 2R4VA 3QCPA 5DCGA 2HRFA 5AGYA 4EE0A 1K0AA 3VPTA 1VF3A 1ZOFA 3A2WA 2AB6A 4BVYA 1X5CA 5ECSA 2ES7A 4RI6A 1GTUA 2VLTA 3A5WA 3ZZXA 2C4JA 3TJFA 4AF2A 1PN9A 2QC7A 3IC4A 4IP6A 5DALA 3IXRA 2V6OA 5ECHB 2JACA 4EF0A 1NSWA 3FY7A 3Q6OA 4CDOA 3TB2A 2E2MA 1PSQA 2LSTA 1ZMAA 2BJXA 4I2UA 5ECLB 2ON5A 2GLRA 3VWWA 4X0XA 2E7PA 4RQXA 2H1GA 3CSJA 2H72A 3TRPA 3VWXA 3R2QA 4MPGA 2DJ0A 4OFTA 1VRSD 2HNLA 1EZKA 1XZOA 4KUNA 2A2RA 3LG6A 4POBA 5GAPD 2IWTA 1SYRA 1K0DA 1G0TA 2C0EA 1GTIA 2GSTA 2OE1A 3AY8A 1YY7A 2F8FA 2HRNA 1I5GA 3GIXA 1SD8A 4X1UA 5GSSA 2KP1A 4YH2A 2LEGA 4YAVA 3C71A 2L5OA 5ECMB 1F9MA 4LMVA 6GSSA 4GSTA 1K0BA 1X5DA 2H1BA 2YJ7A 2B6MA 3F3RA 1WP0A 5H5QA 3ZL5A 1GLPA 3D21A 1GP1A 2H75A 2GDRA 2FA4A 2YV7A 5IIZA 4O32A 2GSSA 3TJBA 4MCUA 4BL7A 2VUPA 4TVEA 3HVSA 1EGOA 3A2VA 2WZ9A 1TRVA 5G30A 12GSA 1GLQA 1TK0B 1PL1A 1FB6A 3EURA 1YDKA 1GTAA 4GQFA 5G1LA 2GZZA 3N9JA 3BOAA 3ME7A 5FHIA 5G5EA 1ZYEA 3KMOA 4AJ7A 1WIKA 1PMTA 5CRWA 1V98A 2JZRA 4GCIA 2IMIA 4GWRA 2AAWA 4MJCA 5J3RA 4TRXA 1O73A 4MJBA 4IHUA 2V2GA 2V41A 4V2MA 1MDJA 2HI7A 1LJRA 4IVFA 4ECIA 4WBRD 3DRNA 1TK5B 3Q74A 2B3SA 4N11A 3BCIA 1OC3A 4HI7A 4K7NA 1ERTA 3M8NA 4GTUA 5D9WA 1MEKA 2FWEA 2OKAA 2ZCTA 4MH3A 3G9BA 1C72A 1KTEA 2JADA 1TI1A 1XWKA 2PU9C 1OYJA 1OC8A 3F4TA 2MMNA 2N5BA 1EP7A 1XW9A 4PQHA 2LNSA 2MZCA 1M9BA 5DBQA 2X8CA 4MH2A 4L5OA 4IP1A 3JCML 3HVXA 2B7KA 1RW1A 3S9FA 4GRFA 1TRUA 4IN0A 1O7UA 1ACVA 2ZUPA 1OVNA 2C3NA 3D22A 2H30A 4BA7A 5B6MA 3KCMA 4ML6A 2PGTA 1GTBA 2D2ZA 3PH9A 2G2QA 2LQQA 2IIYA 2N5FA 3NOFA 3GH9A 2PUKC 1AQVA 1V40A 1UVZA 3FHKA 1WOUA 3CXGA 4MABA 4ZB6A 3BD2A 2ON7A 3GSSA 2PPTA 4JEDA 4ZIJA 1GSDA 3ED3A 1B4QA 1PGTA 3UMAA 1PX6A 2VL9A 1BYEA 2RM5A 3I43A 13GSA 1HYUA 5CREA 5DCHA 2A2SA 4MF5A 2XBQA 4RUVA 3CYNA 2I81A 1XVWA 3HJMA 1URMA 2LNTA 1E2YA 1Q4JA 3MWHA 3HZ4A 1JZOA 5ID2B 3GHAA 2DSAA 2R37A 1XBSA 5KN3A 1EV9A 4O92A 4WKWA 2H1AA 4N0VA 3DVXA 2AV4A 2VCXA 2YJHA 3VLNA 1W89A 1J9BA 2XC2A 5HR1A 2FA8A 3O3TA 3MNGA 1YEXA 1TRSA 2DJ1A 5J41A 1V58A 3UBLA 2AYTA 4KDYA 1PQNA 4F0CA 2P0GA 4V2LA 1T00A 3W8SA 5LCZA 1XWCA 2YWMA 2JL4A 1A23A 4YQUA 4NV2A 2H6XA 3KH9A 5ECIB 4KDXA 4FIWA 2K8SA 3QFAC 1GNEA 3G7JA 5CRDA 1GULA 1E6BA 2H6ZA 4KX4A 1U88A 3I69A 2X8HA 4CW9A 1SK2A 5DJLA 3TCOA 3FZ9A 3IHQA 3DWVA 3L0HA 3GN3A 2RIIA 3CRTA 4OFNA 3TKRA 4WR4A 3J7Yk 3KJYA 2OBKA 4L5LA 4EUYA 2QSIA 3DEXA 2H1DA 4BWQA 1UC7A 4BVXA 3WT1A 3M1GA 1BG5A 3HKRA 1A8LA 1ERWA 2HE3A 1B48A 5KEJA 5JWQB 3VURA 3HXSA 1U87A 4Q5QA 1ERVA 1QUWA 1AIUA 3H8QA 3W8JA 2CZ3A 5IMVA 1T4YA 3C7MA 3WD6A 4KDUA 1EWXA 1GRXA 4HQSA 4ZB8A 2WB9A 2FD3A 4PUFC 4QL7A 2MMZA 5ECNB 1VF4A 4MJEA 5ID2A 2YN1A 3GH6A 2FGXA 2H0IA 1B9XC 2RM6A 1XXUA 4MMMA 1A24A 4KA0A 5DJMA 5H5RA 1B8XA 1NM3A 2FLSA 3CTGA 5J5NA 4ZBAA 4G19A 2J9HA 2GGTA 1JFUA 2JU5A 3QDNA 3IBHA 4DEJA 1A2MA 3MDKA 1FB0A 1O85A 3KZQA 2E2GA 1BAYA 2R6KA 3HA9A 4O7HA 1GSSA 5GSTA 2XPDA 3QPMA 2Z9SA 1HNBA 2V6KA 3LJRA 2TRXA 3IAM2 2A4VA 4P3YB 2DBCA 5LD0A 4XIHA 2WS2A 2EIOA 5E4WA 3E0UA 3ZVJD 3LYKA 3WYWA 4GXZA 4KW6A 2RLIA 4ZL7A 4ECCA 2GSRA 1AQXA 3CTFA 1PX7A 5CP1A 2EIQA 3FR6A 1TKDB 2R3XA 1GUMA 3CSHA 1OAZA 1THOA 1UA5A 2VD0A 3KMNA 1K3LA 4POMA 4HU7A 4MA9A 2N5AA 1TTZA 1XOAA 2CV4A 4KCAA 1MDIA 3QFBC 1G6WA 3GURA 3ZMKA 2M46A 3D4MA 2MMOA 4L0WA 4IJIA 4TR3A 2DJ2A 4ZB9A 4ML1A 5ECKB 1R5PA 4OO4A 1SJ6A 4J57E 2YWOA 1HNAA 4ZBDA 3F9UA 3M9JA 2MYGA 3LSZA 3IOSA 2IJYA 4LL4B 4TN8A 2OBIA 4TR0A 4G10A 2X64A 4ECJA 3KP9A 5F8BA 1FG4A 2H66A 4KNDA 5CAXA 1W4VA 4ZL9A 4EKZA 1U3IA 3IPZA 2VM2A 5G31A 3EWLA 1DE1A 1Z7PA 2IMKA 2P5QA 4HQZA 4K1FA 1HD2A 2H19A 4KH7A 2B1KA 2H76A 2LKUA 4V1Ag 2DIYA 3QR6A 1SL1B 2FUG2 2GT6A 4BPYA 2WDUA 1X9WB 2OE0A 4EDZA 4IELA 3J7Yb 3ZFBA 2F51A 4WETA 2KOKA 3BCKA 2JZSA 2GQMA 5J9CA 2HZEB 2YV9A 4ULXA 3SWLA 2KUCA 1WPIA 3HY2A 4IGJA 4GLTA 3ERWA 1NHOA 3TKSA 3GL3A 1I9DA 2G0FA 4HJMA 2LUSA 2X8GA 3ZMLA 1TDIA 5KN0A 4PQIA 1DSBA 2MBSA 4IQAA 3P7XA 4H86A 2AHEA 4YQVA 3FYGA 1AQWA 1EGRA 3APSA 4O5RA 1EOGA 1M2DA 3LORA 4LA1A 1DUGA 3IR4A 3F6FA 4NV5A 2V1MA 3WGXA 1GSEA 3ZFLA 4N30A 2OE3A 2BTOT 4DVCA 4TKYA 2FHEA 2VOCA 5AN1A 4KCEA 2EIRA 3RDWA 6GSUA 3V1WA 2I4AA 2XBIA 2P5RA 2YPMA 3ERFA 2IMEA 5D8IA 4XHMA 3UAPA 1Z3EA 2O7KA 1XFLA 4EDYA 3RBTA 5A4UA 4PUAA 2CX4A 4MJAA 3Q19A 5JWRB 3VI7A 4I8BA 4ECBA 4F2IA 2CAQA 3KIJA 4WF5A 4L0UA 4NMUA 1TU7A 3EINA 3EE2A 4AJ6A 3NIVA 4WEYA 2EC4A 4POLA 5L71A 4HDEA 4PGTA 3H4KA 4PNGA 4HEA2 3P2AA 3M3MA 3WGDA 5EVOA 3FKFA 4BWSA 2PWJA 4F82A 5IPGA 5F07A 3LQ7A 2HZEA 1M9AA 3FZ4A 3P90A 3F4SA 1T8EB 3F0IA 4EO3A 3ZITA 1XCCA 3GL5A 2LRNA 3ZTLA 2LV3A 3TKSE 3PINA 3ZRDA 3LXTA 3CBUA 4PXOA 2GVPA 3UOMA 1J0FA 1S3CA 1GSYA 2IMFA 2C3TA 3EMXA 2GSQA 2NVLA 2H0HA 4XCSA 2I3YA 2JSZA 6GSYA 2C8UA 2I9HA 1AW9A 1PKWA 4E8EA 4OO5A 4MF7A 5JCWA 1M0UA 1F37A 2L57A 2WJUA 3LEFA 5JWOB 2PERA 4XS4B 4I6XA 1RK4A 1X9SB 1ZZYA 4GQCA 4I5QA 2VO4A 3GUSA 3L4NA 4EXJA 2REMA 1T7PB 4LMWA 2CT6A 3TRXA 3C1RA 3EVIA 2OJLA 2GTUA 5DQSA 4PURA 2H70A 4XRAA 1F6MC 4JBBA 1ZL9A 1GL8A 4V1Ap 5D9VA 3C8EA 3H93A 1M7TA 1ZCPA 4TXVA 3O76A 5H5SA 1G7OA 5D73A 1QK8A 1ZYQB 4FH8A 3HJPA 3IE3A 1TP9A 1PD21 2GS3A 1TJDA 2CAIA 2GQLA 4K6XA 1F2EA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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