2FGXA

Solution nmr structure of protein ne2328 from nitrosomonas europaea. northeast structural genomics consortium target net3.
Total Genus 18
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
18
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MNNQVEPRKLVVYGREGCHLCEEMIASLRVLQKKSWFELEVINIDGNEHLTRLYNDRVPVLFAVNEDKELCHYFLDSDVIGAYLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution NMR Structure of Nitrosomonas Europaea Hypothetical Protein Ne2328: Northeast Structural Genomics Consortium Target NeT3
rcsb
molecule keywords putative thioredoxin
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Nitrosomonas europaea
total genus 18
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05768 DUF836 Glutaredoxin-like domain (DUF836)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fgxA00
2V6KA 3UMAA 4TR1A 3N5OA 1N2AA 1MDKA 2ALBA 4XRDA 1EWXA 3W6GA 3FRCA 5IMVA 2D2ZA 1Q4JA 2ON7A 4EVMA 3NIVA 1T1VA 3HZ4A 5CAXA 3KCMA 3L0HA 5ABRA 4J56E 1UN2A 1PX6A 3FEUA 4DSQA 3ZVJA 9GSSA 1T00A 3VWVA 3A2VA 1YY7A 2RUEA 3IOSA 1NM3A 4JRRA 4JEDA 1Y6EA 5A5KA 1F3AA 4K7OA 1PL2A 3HZ8A 4XCSA 2C0EA 3GN3A 4DSSB 2FHEA 2IMEA 2CVKA 1O8WA 1G0TA 2GSSA 3F4TA 4JBBA 4MZCA 4BA7A 3KMOA 4POLA 2B3SA 3IDVA 1FB0A 4IJ3A 1Z9HA 5GAND 4PX1A 1K0MA 5DDLA 1VF4A 1U87A 1HQOA 3E0UA 4I2TA 3QAWA 2AYTA 1T4YA 4TR3A 4O92A 3M1GA 4IQ1A 4Q5RA 1GTBA 3LSZA 1GSYA 2VOCA 3DRNA 1BQ7A 4MJCA 4O7HA 4IVFA 3UOMA 2OE1A 2HLSA 4FIWA 2AHEA 2N5AA 2O7KA 3VLNA 1WE0A 2QKEA 1WPIA 3C71A 2LV3A 1ML6A 4P3YB 5FWGA 1U3AA 3MSZA 2CAQA 1AQXA 1OYJA 1X9MB 1K0DA 1OKDA 5ECMB 2DJKA 2H19A 1K0BA 1F6MC 3EMPA 2PU9C 1M7TA 3IHQA 4QL7A 3P8WA 2RM6A 2DJ1A 4BL7A 4EXJA 3I6AA 1U88A 1WOUA 1SKSB 3F3QA 1GUMA 5IMFA 4G10A 3H79A 4PQ1A 4ZL7A 1BG5A 1NSWA 1TW9A 3EU4A 3M9KA 1SL1B 3FK8A 1JLWA 1M0UA 3TJGA 3A2WA 2F8AA 2KP2A 1ACVA 2O87A 4FYUA 2R37A 5KN2A 5DBQA 3D6IA 2RIIA 2HXKA 3F6DA 1MTCA 3ZREA 2R2JA 1YQ1A 2GZPA 5LCZA 2YJ7A 3IR4A 1O6JA 5D9WA 5CYYA 4YAVA 4ECJA 2LQOA 1ST9A 2X8HA 4NWYA 1YZXA 2E2GA 3ZVJD 3P7XA 3DIEA 4RI7A 3Q6OA 4MLYA 3DGQA 5HFIA 2K8VA 3F4SA 3TOTA 4KDXA 3TKPA 2HRFA 1S3DA 1M9BA 5B8BA 4K2DA 2FY6A 2FWFA 3KXOA 1XBSA 1QK8A 1R5AA 2VM1A 3H4KA 2JSYA 2R3XA 5ENUA 1URMA 5DVBA 2H74A 2GSQA 4MJAA 3IPZA 5F0GA 3DEXA 2WFCA 1M2BA 2GTUA 3EVIA 4OO5A 1U6TA 1XWCA 4GWRA 2RUFA 2GSRA 3I9V2 1OVNA 5ECQB 1TP9A 3EMXA 1EEMA 1B48A 1YJ6A 1V98A 5IMDA 2H70A 3GA4A 2X64A 3EC3A 4LLRA 1EOGA 4XIHA 3C7MA 2IFQB 4L0UA 3A2XA 3UIWA 2CT6A 4V2LA 4NV2A 4K9ZA 4ULXA 3LWAA 1BAYA 4HZ4A 4HQSA 1EP7A 19GSA 1VF3A 2PUKC 4ACSA 1FO5A 1S3CA 4F2IA 1THXA 14GSA 4FO5A 2LSTA 4ZB9A 1TK5B 2OACA 3L9SA 2VL3A 22GSA 4GQFA 2LNTA 1ON4A 4WXTA 1DE1A 5LD0A 3J7Yb 2PPTA 3U6VA 2F3MA 2O85A 2EIQA 4KB3A 3GUSA 3FW2A 5IM9A 2DC5A 2KOKA 2OE0A 2C1YA 4YQVA 1GSQA 1PN9A 3I69A 4ECCA 2VL2A 3LXTA 1A23A 4TN8A 1XVWA 1TK8B 1OE7A 1X5EA 2H6ZA 2H73A 1G7OA 1O85A 1PKZA 2VLUA 3WGDA 5B6NA 1OC9A 4KCEA 3ED3A 1QUWA 4XS6A 1FB6A 2H76A 3ZMLA 2K9FA 3ZIJA 5DJLA 2FCHA 2JZRA 2MMAA 4IGJA 4G2EA 5A4VA 2KP1A 1EV9A 1PMTA 4I6XA 4TVEA 1QQ2A 2YANA 3IBHA 4MPFA 4J2FA 2L59A 5JCGA 1IYIA 2C4JA 2IJYA 3PINA 4WR4A 1A2JA 4IJIA 2E7PA 2WDUA 4F03A 4MP4A 3DVWA 2GQMA 3L9VA 1N8JA 4XS4A 2CZ3A 3ERGA 2GGTA 3QPMA 2FD3A 3QCPA 1GTUA 2YPMA 4Q5NA 4RUVA 2XPDA 1SYXA 4X1UA 1XPVA 5CNWA 1R7HA 3Q74A 2WS2A 5ECLB 1QMVA 2GT5A 5ECHB 4IKHA 1H4OA 5ECOB 4Q5FA 4HOJA 5IMZA 4GSSA 3RPPA 1AIUA 1B9XC 1AQWA 2C3NA 1SKRB 4BVYA 4TR1B 3FZAA 1AUCA 4NHZA 3ZTLA 1EEJA 3CRTA 1TU7A 4K7NA 3CTGA 5CRHA 5IPGA 3ME8A 4AJ6A 1UC7A 4MA9A 1IYHA 4MZWA 4KNDA 5HR2A 1DBYA 1I9DA 2JADA 2LQQA 5EY6A 3HA9A 4MZBA 2WJUA 2OA7A 2OJLA 2CVBA 4PNFA 1GSEA 1ZOFA 5GZZB 3KMNA 2L5LA 2YV7A 5JCWA 2H30A 3DD3A 4NPBA 3UARA 4MH2A 4ZXGA 3APOA 2L57A 2L4CA 2M80A 1USBA 3GTUA 4V2MA 3QMXA 5CP1A 2R6KA 2HT9A 3UVHA 2JZSA 3P2AA 5C00A 1GULA 2N5BA 2DIZA 3E9JB 1QFNA 3VPQA 2CQ9A 3ZRDA 2LJAA 4K6XA 3M3MA 2H1AA 2VCZA 5F05A 4XHMA 2LRNA 1X9WB 5ID2A 2GQKA 4GTUA 1SK0A 1TK0B 4JZQA 4IELA 1K0AA 2H0GA 2A4VA 3GKMA 3H8QA 4PUAA 5D73A 2X8GA 2WGRA 3CSJA 2FLSA 4QL9A 2VM2A 3RHBA 2QSIA 5IO0A 4KDUA 4ZIJA 5EL8A 5IOWA 3LEFA 5HFKA 2MBSA 2C80A 2PVQA 2IMKA 5KN3A 3LGCA 3ERFA 2GVPA 1PKWA 2AAWA 1B9YC 2YP6A 1V57A 1XZOA 4EKZA 1GUHA 3OR5A 4ECIA 2VL9A 4GSTA 5D96A 1M9AA 3F0IA 3TB2A 4ZBAA 2H66A 2A2RA 3EU3A 4KX4A 4FYBA 3EINA 3C1RA 1B4PA 5DCHA 1M2AA 3WD6A 1PRXA 4PURA 4N10A 3ISOA 2B5YA 4V2NA 4HDEA 1ZZYA 2VL2C 3ZIVA 3RHCA 2VD1A 4YQMA 4MJBA 4BVXA 2KUCA 5H5SA 2P31A 3GSSA 3KEBA 5ELGA 1ERTA 2RLIA 5JCUA 4FH8A 2MZCA 2YWIA 3QOUA 3LJRA 4ML1A 2K8SA 3PR8A 1TKDB 3MAKA 4KSOA 4HI7A 2H72A 4RQRA 4TW5A 3US3A 1SD8A 4OFMA 1GSDA 1V9WA 3EE2A 2N5FA 2YCDA 3CSHA 2I4AA 3D22A 1TTZA 1FW1A 1GUKA 3W8JA 3TOUA 1GTIA 4IP1A 17GSA 3KIJA 5CRGA 6GSWA 3TRPA 5F8BA 3O76A 3SWLA 3DMLA 4KSMA 1UVZA 1K0CA 3CTFA 3CMIA 4JU5A 4L8EA 2G0FA 3E3EA 3QFBC 5COHA 3QAGA 1KTEA 3IV4A 4TKYA 1TU8A 4WKWA 2LUSA 3LXZA 3VPTA 2AUVA 4TRXA 4WBJA 4HU9A 3APSA 4O32A 2C3QA 4OO4A 3L9UA 2YV9A 3HXSA 3GH9A 3KP9A 3CRUA 2NDOA 3GMFA 1QGVA 3JCML 1G6WA 4N0VA 3S9FA 3TJKA 1O81A 3HJMA 3ZL5A 2B5EA 2K6VA 3PH9A 2X8CA 4KW6A 1ERUA 3GFKA 1Z6NA 3EWLA 5CO3A 3KZQA 5IMAA 1EZKA 3TKSA 1FOVA 1ERVA 4WF4A 1XXUA 4GQCA 4PUFC 1F2EA 2MBTA 4F9ZA 3KH9A 4TR4A 4ZILA 3WT1A 5B8AA 2DMMA 5DCGA 2LS5A 2IN3A 4XS1A 1F9MA 2IMFA 2P5RA 4POBA 3FR3A 1ILOA 4POKA 3QD9A 1WRYA 5LNKe 1MD3A 1PSQA 2DJJA 1OC9B 2PBJA 5D93A 16GSA 1SD9A 3BOAA 4JR4A 3GKXA 3ZZXA 2VLTA 3IAM2 3Q18A 1A8YA 1GLQA 2B1KA 1J08A 1V58A 3GV1A 3ZLPA 1A0FA 4K1FA 1C72A 5H5RA 2HZFA 4L0WA 3ZFLA 1EV4A 2GQLA 1B4QA 1OKTA 4IN0A 3V1WA 2MMNA 2PMTA 3KP8A 2H0HA 2BTOT 4V1Ap 1GSFA 5JWRB 2CX4A 1JHBA 6GSSA 3KTBA 4XS4B 4TXOA 5E59A 1R26A 1OC8A 4OFTA 1PQNA 4L5LA 1K3YA 3TRXA 3KM6A 1DE2A 2CA8A 3DKSA 4IBPA 5IOXA 2XC2A 3BJ5A 5HFGA 2LEGA 4MABA 4G19A 2HRNA 3D5JA 1S3AA 2VLVA 4LA1A 4X0XA 1SL0B 4GSNA 1K3OA 1PD21 2EIRA 4CHSA 4PGTA 3VWUA 3PGTA 1TJDA 5A4WA 5F06A 5JWQB 1FVKA 2REMA 2HZEA 2QC7A 2H8LA 4XRAA 4EE0A 1THOA 1W89A 3GNJA 1Z7PA 4JE1A 4D73A 3APQA 1GNEA 1J0FA 3IC4A 1ZL9A 2A2SA 3GL5A 2CVDA 1H75A 2CZ2A 4WF5A 4KH7A 2GSTA 1A2MA 2B6MA 1JFUA 4IQAA 4O5RA 4MPGA 3D4MA 3VI5A 1JZDA 2YWMA 4KA0A 3IAS2 3HVVA 3GTUB 4WEYA 1TRWA 2GT6A 3C8EA 3MNGA 3FY7A 1DUGA 1WP0A 4PQHA 2H01A 12GSA 2VCTA 3VWWA 4MDCA 3TRQA 1EGRA 2GS3A 4NMUA 4YH2A 3QR6A 5IQYA 3VURA 5ECPB 3BCIA 1PA3A 4Q5QA 2ZNMA 1AW9A 5H5QA 1OAZA 1AXDA 1RW1A 3G9BA 6GSYA 5ID2B 4BWQA 1R4WA 4NXIA 2GZYA 1CQGA 1VGLA 2CV4A 2EIOA 4AJ8A 4EDZA 4AJ7A 4DVCA 5J9BA 4TXVA 5KN1A 1YF1A 4GF0A 1T8EB 1K0OA 5EVOA 1PGTA 2FWEA 3RPNA 5CREA 5J5NA 13GSA 1XFLA 3HVXA 4MMMA 1ZCPA 3ZYWA 3BCKA 6GSVA 1VF2A 2QGVA 4MCUA 4KE3A 4I5QA 6GSTA 4LL1B 5EPFA 5GAPD 3VFIA 3C1SA 4EF0A 3F9UA 1AC1A 3LQ7A 5G2ZA 4ISDA 5J9CA 1SU9A 2VCVA 2H1BA 3GURA 2H75A 3FHKA 3WT2A 3TKSC 4HZ2A 1JZOA 2IPAA 2GLRA 4DEJA 2DBCA 18GSA 1OC3A 1X5DA 2H0IA 2XBQA 4L5OA 2VCQA 2ON5A 3LORA 1NHYA 4PQIA 4K0GA 1O8XA 3O6TA 4ML6A 3IE3A 5IIZA 2I1UA 2C8UA 3IXRA 3A5WA 1MD4A 1WIKA 5DALB 1LBKA 1MDJA 3DXBA 2LKUA 3UEMA 3A3TA 5J41A 3DWVA 5C04A 1Z7RA 5ECIB 4CDOA 2V6OA 3H1NA 1M99A 2VAFA 4MK3A 2YNXA 2YN1A 4RQXA 2LJKA 3ERWA 2V2GA 3GH6A 4GXZA 20GSA 2RM5A 1GRXA 3C73A 4IW9A 3IK9A 2VD0A 4HUAA 5DQSA 1LU4A 2E0QA 1ZYEA 1WMJA 2DJ3A 1A2LA 1F3BA 2H6YA 1SYRA 3KJYA 2XBIA 2FWHA 4XTSA 2FUG2 3GX0A 3TKQA 3UBKA 1R5PA 2F8FA 5GSTA 2O89A 4X43A 2XHFA 3F6FA 3F8UA 1XOAA 3MDKA 5INYA 1Z6MA 3NOFA 3EYTA 1X0RA 3GL3A 2JU5A 4HJMA 4JR6A 3RAZA 5HR1A 4OD7A 4HJ2A 1GSUA 3F4RA 2LJRA 5DAKA 1KEBA 1B8XA 1WJKA 5DJMA 2WULA 4OFNA 2DMLA 1LJRA 3WGXA 2FNOA 4NV5A 2IMIA 1KBNA 1DSBA 4LMWA 5DALA 4LL4B 4GRFA 2OKAA 2MMZA 2B7KA 3H93A 2JZTA 2LNSA 2H1GA 3LYPA 5E4WA 10GSA 2TIRA 2YZUA 1JLVA 1SJ6A 3QFAC 4EUYA 2C0FA 1HD2A 4QQ7A 2FA4A 4HS1A 1EP8A 2Z9SA 2HI7A 2PN8A 2YWNA 1MDIA 2I9HA 1V40A 2HNLA 3D4TA 3K8NA 3HKRA 1FAAA 1JZRA 1ZGNA 3F3RA 1K0NA 2ZUPA 2L6DA 4IHUA 6GSXA 1WWJA 4K0NA 4MF5A 2JACA 3FR9A 3KGKA 1AAZA 5AGYA 3G7YA 1RK4A 2WZ9A 3RBTA 3GRXA 2PVOC 3I43A 3GYKA 2OADA 4BPYA 4LMVA 4ID0A 2TRCP 4YQUA 4HU7A 4AGSA 5KN0A 1SK1A 2VO4A 1SK2A 4MF6A 1X5CA 3QDNA 3GHAA 3D21A 1ERWA 1A8LA 3LG6A 3KTLA 5HQPA 4MJEA 4TXOB 4F0BA 4DSSA 2YWOA 4KCAA 5L71A 1SENA 3TJFA 3HDCA 4F82A 3FR6A 5IPHA 1YEPA 2J9HA 2V41A 1JZWA 1HNAA 3FKFA 3FZ4A 4HQZA 2H6XA 3UVTA 4OCEA 1M2DA 5F07A 3EURA 2B7JA 2OBIA 5J4UA 3GKNA 1XVQA 4K8MA 1BEDA 1Y25A 2EC4A 3IA1A 3GX8A 3TKSE 1XCCA 2ES7A 3L4NA 4ZBDA 2L4QA 4ZL9A 2VCWA 5AIXA 3G7IA 2YZHA 3M8NA 5AN1A 2HZEB 4ZL8A 1O73A 2ZCTA 1GP1A 1XWGA 3GSTA 3TGZA 2K18A 4D73B 4GCIA 2I3YA 1O7UA 2HYXA 4EO3A 4FYCA 8GSSA 1TRUA 2B1LA 3DVXA 4Z7XA 1Q98A 2DIYA 3ME7A 3RDWA 2J23A 3R2QA 5B7CA 1T4ZA 3L78A 4N11A 1EGOA 1TRVA 2F9SA 2YOIA 2C3TA 4IS0A 2IIYA 2HSHA 3VI7A 5ECRB 3G7JA 2X99A 5D9TA 2WCIA 4WBRD 1TRSA 5ECNB 5DQYA 1EOHA 2H1DA 2L6CA 5G30A 5AISA 1BJXA 1K3LA 5ELAA 1A24A 2C0DA 3TJBA 2BJXA 1CQHA 2FGXA 1BYEA 2DLXA 1AQVA 1XW9A 2VIMA 2DSAA 5JWOB 11GSA 5IO2A 5A4UA 1E6BA 4ZB6A 4F0CA 3HYPA 5D8IA 3BBYA 5ECSA 4J57E 3IK7A 1MEKA 3FYGA 2HSYA 1RQMA 3AY8A 3Q19A 5HR3A 4E8HA 1XWKA 3UAPA 5HR0A 3VWXA 1I5GA 4TOPA 4WR5A 4EDYA 5ECKB 1GLPA 5G1LA 2AJQB 2G2QA 3WYWA 1XW5A 2MYGA 1ZYQB 1VRSD 1SL2B 1G6YA 4ILFA 2PGTA 5CRDA 1BX9A 3GKKA 1SJZA 1T7PB 3VK9A 1XOBA 3TCOA 2JSZA 2VCXA 4ECBA 3SBCA 2DJ0A 1QXHA 2GDRA 4ZBBA 3WGEA 1TDIA 3TUEA 1Z5YE 4K7IA 2VUPA 4MH3A 4OWYA 3O3TA 1HNBA 2H71A 4NHWA 3ZMKA 2GZZA 2OBKA 4H86A 1E2YA 2TRXA 2HFDA 2R4VA 2V32A 3HVSA 2LRTA 5G31A 2AV4A 4MF7A 3TDGA 1ABAA 4N0ZA 1U3IA 4HEA2 3P90A 2NBSA 3HHVA 4WETA 3HJOA 1YEXA 2IFQA 2JL4A 3D0ZA 3M0FA 3FZ5A 4PXOA 1FVJA 4RI6A 3QAVA 1A0RP 2XPEA 3N9JA 4GLTA 3DYRA 4KDYA 2PWJA 1YF0A 2NPBA 3UJ1A 1OE8A 1HNCA 2M72A 2B5XA 3IRAA 1GH2A 4N30A 1TOFA 2M46A 1GWCA 3LFLA 1J9BA 2LRCA 3UBLA 5AIVA 1GSSA 4AF2A 3KD0A 3CBUA 4KAEA 3NZNA 4TR0A 1FG4A 1ZMAA 3LYKA 4POMA 2IWTA 1FHEA 1VF1A 3ZFBA 4IP6A 3GIXA 4I97A 2NTOA 2IMDA 3HD5A 1XW6A 1V2AA 2OE3A 5D9VA 3HJPA 3MWHA 4YAPA 2KLXA 5D9XA 4I2UA 1GNWA 1YDKA 2FWGA 3CSIA 1KNGA 6GSUA 1TXXA 4BWSA 5IMCA 1G7EA 2V1MA 1HYUA 2CX3A 3J7Yk 2BMXA 1SKWB 1UA5A 1YKAA 3TJJA 2HE3A 2R5GA 3ZITA 1NW2A 4CW9A 4NAXA 2I81A 3FZ9A 3U5RE 4OCFA 3F63A 2WRTA 5FT3A 1NHOA 1GTAA 2E2MA 5DAKB 4V1Ag 2O8VB 2P0GA 5GSSA 2WB9A 3CYNA 2YJHA 1GL8A 1W4VA 1T3BA 2LTKA 4KGIA 4EL1A 1XWAA 1F37A 5G5FA 4I8BA 5G1KA 5J3RA 1YKCA 7GSSA 2P5QA 1XWBA 2L5OA 3M9JA 4EC0A 5CRWA 2DJ2A 1PL1A 3CXGA 1XIYA 2AB6A 3W8SA 2NVLA 3TKRA 1Z3EA 4G9HA 4E8EA 5KEJA 3KH7A 2CAIA 4ZB8A 4DSRA 4KUNA 2MMOA 5FHIA 2FA8A 1TI1A 2IL3A 2KHPA 3BD2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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