2FY6A

Structure of the n-terminal domain of neisseria meningitidis pilb
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
143
structure length
143
Chain Sequence
VPHTLSTLKTADNRPASVYLKKDKPTLIKFWASWCPLCLSELGQTEKWAQDAKFSSANLITVASPGFLHEKKDGDFQKWYAGLNYPKLPVVTDNGGTIAQSLNISVYPSWALIGKDGDVQRIVKGSINEAQALALIRDPNADL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The X-ray Structure of the N-terminal Domain of PILB from Neisseria meningitidis Reveals a Thioredoxin-fold
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB
molecule tags Oxidoreductase
source organism Neisseria meningitidis
total genus 44
structure length 143
sequence length 143
ec nomenclature ec 1.8.4.11: Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase.
pdb deposition date 2006-02-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fy6A00
1MDKA 2M46A 2WB9A 1NHOA 1TK8B 3QAVA 3RPPA 2VCZA 2YJ7A 2L4CA 2GVPA 5B8AA 4JEDA 3TDGA 1BAYA 3CSJA 2DBCA 5DALB 2O7KA 2WGRA 4L5OA 3IXRA 4LL1B 5DCGA 1GTUA 3UVHA 4FYCA 3A2XA 5AN1A 4GF0A 1GUKA 4ZB8A 4ID0A 2PN8A 6GSTA 3ZL5A 2C0FA 3L9SA 5CP1A 5ID2B 6GSSA 2GZZA 1E2YA 2LNSA 1AAZA 3C1SA 1JZRA 2C3NA 1I9DA 1OVNA 3C71A 2C0GA 4PX1A 1G0TA 2OADA 1QXHA 4H86A 2DSAA 4Z7XA 3CTGA 1VF2A 3I9V2 2JZSA 4KDXA 1ZCPA 1XCCA 4POLA 3G9BA 1XPVA 3M8NA 4WETA 3W8SA 5GSTA 3CBUA 1XXUA 2H0HA 1XW5A 2PBJA 4MZBA 4KUNA 1V98A 4V1Ag 2FNOA 5D9VA 4NHWA 2C3TA 1X9MB 1MEKA 2N5AA 1JLWA 1O6JA 3KH7A 1FB6A 2XPDA 1Z7PA 5DAKA 3MAKA 4G2EA 3H8QA 2WJUA 4I8BA 1R4WA 1F37A 2L57A 4KH7A 2AHEA 5D9WA 1K0BA 3JCML 2FA4A 4ZBBA 3MNGA 5COHA 1TKDB 4O92A 1OAZA 1YZXA 1XVWA 3C73A 5B6MA 4CDOA 2MZCA 2RUEA 3KD0A 2MMAA 2X64A 4G10A 3W8JA 1UN2A 3VWVA 3ED3A 5JWRB 1SJIA 3CYNA 4NV5A 5IPGA 5ECKB 2IMIA 1DBYA 2HZFA 1TP9A 2BJXA 2H1AA 3BCIA 4DSSA 3GRXA 5C00A 4EL1A 1T1VA 3I6AA 2K18A 4PNFA 3HKRA 2FWHA 3O76A 4RQXA 3KTLA 2B5YA 3EWLA 3ZITA 3FKFA 3M9KA 1S3AA 6GSXA 3EU4A 3L9VA 4N10A 4TXVA 5EL8A 3F4TA 5ECQB 9GSSA 1JZDA 4YQVA 2R2JA 5J4UA 4EE0A 4OMVA 4ZB9A 5ECMB 2P5RA 4NXIA 2FHEA 4WF4A 2PMTA 3C1RA 3QCPA 2JADA 2VUPA 1TI3A 1MDIA 5AIXA 3KMNA 2FWGA 2H76A 4OWYA 3TJJA 2HZEB 3TKPA 4KSMA 5F06A 19GSA 4NWYA 1TK0B 1F9MA 2KP1A 1K0MA 5G30A 3QDNA 1LU4A 4WXTA 4WKWA 5GSSA 1SK0A 1FB0A 1HNCA 2D2ZA 4X43A 3HZ8A 4K1FA 1ZZYA 1XIYA 3IR4A 3WYWA 2LRTA 1M2AA 3FZ4A 3EURA 3GMFA 5H5QA 4G19A 1JLVA 3VWUA 3G7IA 3P7XA 1JFUA 2EC4A 2HYXA 1F3AA 2YP6A 2XHFA 2CZ3A 5JCGA 4DVCA 3VFIA 4QL9A 2K9FA 4F9ZA 2WDUA 5JWQB 5DDLA 4BL7A 1B48A 2G0FA 2H71A 1TOFA 2VLUA 1TU7A 1GNWA 4KX4A 2H1DA 4KDUA 1PKWA 3MWHA 4MCUA 3KEBA 2PPTA 1W4VA 4EDYA 4K6XA 4I6XA 3HJOA 1M0UA 2GSTA 3IK9A 4TOPA 4TXOB 1GTAA 4WR4A 3HVXA 1T4ZA 2X8CA 4OFNA 3D6IA 3N5OA 2DJKA 3U6VA 2YPMA 4X0XA 3CMIA 2OBIA 3LG6A 2VCQA 3KH9A 4MDCA 4JR4A 5G31A 4Q5FA 2H70A 2B1KA 1UC7A 3TKSC 5J41A 3S9FA 3VWWA 2V6OA 5FWGA 3SWLA 3PINA 3IHQA 3H93A 2YZHA 5L71A 4IKHA 1AQVA 2OKAA 2MBTA 1FG4A 1SENA 3L9UA 4IELA 1XWKA 1HQOA 4QL7A 3FW2A 1ST9A 2CVKA 2WS2A 3IDVA 4HJ2A 2ZCTA 2YV9A 4L5LA 5F07A 4BVYA 1Z6MA 2X8GA 3FEUA 1MD4A 3WGEA 1I5GA 1IYIA 11GSA 4GSNA 4TR1B 2AB6A 1AIUA 1JZWA 3RBTA 1AQWA 4KDYA 1XWAA 4K2DA 3GYKA 3APSA 1GTBA 4FYUA 3U5RE 4ECCA 3LXTA 5B7CA 1SU9A 1B4PA 3VI5A 2H6YA 2H72A 1GSUA 2I9HA 2I1UA 3RPNA 2NVLA 4V1Ap 3G7YA 4IGJA 4MF5A 1Z9HA 3R2QA 2V32A 3UBLA 1K0NA 1O7UA 3WGDA 2F8FA 2C8UA 2DLXA 3D22A 1OE7A 2VL2C 2QC7A 2GQKA 3D0ZA 5KN2A 1U6TA 2KUCA 3LYKA 3DVWA 2PVOC 1RK4A 3ZRDA 5CO3A 3A5WA 3NOFA 1YKAA 4KAEA 1QK8A 1E6BA 3G7JA 3ZLPA 1T00A 3FZ5A 5H5RA 2VM1A 5EVOA 4JR6A 2LRNA 4YQMA 2E0QA 5CAXA 3VLNA 4WEYA 3ERFA 2LV3A 4XRAA 2LTKA 1EV9A 1PA3A 3Q74A 4HQSA 2HRNA 3IV4A 3D21A 5G1KA 1GLQA 2OE0A 5IMDA 3HY2A 3QAWA 3LJRA 3DMLA 1O8XA 4PQIA 4XS1A 5DAKB 4K7NA 5HFIA 5JCWA 2FWEA 1FVJA 1GSYA 1PMTA 2GSRA 5GAPD 4XS4A 5FT3A 1K3YA 2CZ2A 4IVFA 2JZRA 3E0UA 2F51A 3BBYA 2MMNA 2O8VB 4GQCA 2VL3A 2WZ9A 3GTUA 4LMVA 3UJ1A 1HD2A 4IHUA 1V40A 3KP8A 1VF4A 2TRXA 2LJAA 1ACVA 1VGLA 2FWFA 4GCIA 1EV4A 3H4KA 3WD6A 3L4NA 1XFLA 5CREA 1ON4A 4KCAA 3GNJA 3LQ7A 2DJ3A 4DSSB 3D4MA 1A8YA 4PUFC 3O6TA 3FZAA 1SL2B 2Z9SA 2PUKC 1YEXA 2CAIA 2H1BA 4HQZA 4QQ7A 4PQ1A 1HNAA 2LUSA 1OC9A 3HVSA 2H66A 2VCXA 3UEMA 5DQSA 3SBCA 4YAVA 3J7Yk 3UOMA 5JWOB 4ILFA 2YJHA 1ZGNA 3EMXA 3WT1A 3PGTA 3ME8A 4MLYA 3DD3A 2OACA 3HD5A 5IO0A 3I69A 4ZBDA 5D9XA 4J57E 4KNDA 14GSA 2GS3A 4ZXGA 1CQHA 3DEXA 4TW5A 2KHPA 6GSVA 20GSA 3QOUA 3ZVJA 4IN0A 4XS6A 4HDEA 5D96A 3TJGA 1TDIA 5IO2A 4OCEA 2VD1A 2O89A 5CNWA 3ERGA 2CX4A 3OR5A 5B6NA 2GLRA 5AIVA 4KW6A 3D5JA 2JU5A 2OA7A 4ZL8A 1FHEA 1F3BA 4PGTA 3MDKA 3FR3A 2MMOA 2EIOA 5D73A 4WBRD 4HJMA 13GSA 5ECNB 4XRDA 1GRXA 2VCTA 1FO5A 1G7OA 1WMJA 4E8EA 1YF1A 3CXGA 4CW9A 2FUG2 3TGZA 3ME7A 2B1LA 2GZPA 3F6DA 4PURA 4MZWA 4ECBA 5IPHA 2GDRA 3DWVA 1DUGA 4ECIA 1AC1A 5HQPA 3KM6A 3EYTA 1CQGA 4KGIA 2L5OA 1HYUA 4ACSA 2YWIA 3DXBA 2V6KA 5CRGA 2GQMA 2IMDA 2A4VA 1Q98A 4N30A 4F03A 1BJXA 4EC0A 4I5QA 1USBA 2YANA 1X9SB 4Q5NA 5KEJA 4O5RA 3RHBA 4D73A 1XW9A 1TRVA 4V2MA 1M99A 1YF0A 4MK3A 4KA0A 3FR6A 2FGXA 1EOGA 2VLTA 1XBSA 2KLXA 2B3SA 5A4UA 4F0CA 1J0FA 3VPTA 2N5BA 5H5SA 3FY7A 1SJ6A 4F0BA 1XWGA 5G1LA 2N5FA 1OYJA 2X99A 3DKSA 1URMA 3H79A 1B9YC 1PRXA 3GKXA 2VM2A 1GH2A 1T4YA 5FHIA 1J9BA 5ECLB 3IAM2 3TJFA 4K0NA 3KP9A 1YKCA 2F9SA 2V2GA 2CQ9A 3HXSA 4MMMA 1FAAA 1N8JA 2REMA 2XPEA 5E4WA 2QKEA 4XHMA 2E7PA 1FW1A 1EGOA 4L0WA 2I3YA 2DMMA 3TOTA 1SYXA 4LLRA 4WR5A 2M80A 2C80A 2NTOA 1SK1A 3F9UA 2IL3A 2NPBA 5E59A 4MP4A 2RM6A 3DVXA 3L78A 2WRTA 3IOSA 3L0HA 7GSSA 1OKDA 5KN3A 1M2DA 1F6MC 3TOUA 5ECPB 4K7OA 5DQYA 5F0GA 1AW9A 3P90A 1PN9A 5IM9A 4NHZA 1WRYA 1O81A 4IJIA 2WCIA 1U88A 2TRCP 3D4TA 2R6KA 1IYHA 4AGSA 2K8VA 1GL8A 4MA9A 3GKNA 2VCVA 1THXA 3E3EA 3F0IA 3KTBA 4P3YB 4MABA 3EC3A 1Z5YE 5J9BA 2BTOT 3DYRA 3RDWA 1DSBA 1ZMAA 5G5FA 3UBKA 1OKTA 1SYRA 5HR1A 2IWTA 1V9WA 1H75A 5DBQA 3MSZA 1TTZA 1V2AA 1OE8A 4FH8A 1GWCA 1KBNA 3VK9A 4EVMA 4OCFA 3A2VA 2HNLA 1R7HA 2VIMA 2I81A 2HRFA 2H01A 2H0IA 3GH6A 2AAWA 2GGTA 2GT6A 1A0FA 4HS1A 2AV4A 1ZOFA 3W6GA 4ZL7A 2XC2A 2LRCA 1EZKA 2AUVA 3P2AA 1U3AA 5A4WA 1XOAA 1G6YA 4LA1A 1KEBA 1N2AA 2H0GA 1GSDA 4LL4B 2GT5A 3DRNA 4XS4B 2YWOA 4ZL9A 2HE3A 3ZZXA 3GTUB 2K8SA 1LJRA 2LJKA 5INYA 2IJYA 1VF3A 4YAPA 3FHKA 4IJ3A 3UL3A 2IPAA 1A2LA 1A2JA 5ABRA 1A2MA 2A2SA 4OFTA 4NPBA 1XW6A 2KOKA 3GV1A 1B4QA 1AXDA 2J9HA 1ERVA 2X8HA 4MJBA 4K8MA 6GSUA 3US3A 4YH2A 3FRCA 3HJMA 4ULXA 1SD8A 3A2WA 3CSHA 3IAS2 3QFBC 2P5QA 3GL5A 1GSEA 1GTIA 1K0DA 3GX8A 4KSOA 2HT9A 4X1UA 1ABAA 3DGQA 4TKYA 2LQQA 4RI7A 2PVQA 3E9JB 3M9JA 1YQ1A 2RUFA 4ISDA 3EVIA 1OC9B 1XOBA 2E2MA 2GSSA 2PGTA 4TR0A 3GN3A 2I4AA 2GSQA 5KN1A 1EOHA 4G9HA 2H73A 3LYPA 4PUAA 4MJCA 2CVDA 4L0UA 2CVBA 2JZTA 1NW2A 5ECIB 3F3QA 1X0RA 4RQRA 3V1WA 1SJZA 3LGCA 1WPIA 4ECJA 5F8BA 3PR8A 3TKSA 6GSWA 3CSIA 2HI7A 2CT6A 4KE3A 5AGYA 4GWRA 3GSSA 5CRHA 1H4OA 4ML6A 3VI7A 4BA7A 2CAQA 2ES7A 1M9AA 5ELAA 3ZIJA 4N0ZA 2WULA 3GL3A 3HDCA 4I2TA 2OBKA 4K9ZA 1WJKA 3IC4A 3TRQA 1FOVA 3GURA 1X5DA 1K3LA 3CRUA 1SL0B 4K0GA 1ERWA 2ON5A 2H19A 5J5NA 4TN8A 1QUWA 3FK8A 1NM3A 1AQXA 2YZUA 1WOUA 2DIYA 3DIEA 5F05A 4POBA 1R26A 5IMZA 1YJ6A 1WIKA 2DJ2A 4HI7A 3BOAA 4D73B 2VAFA 3IA1A 2B5XA 1J08A 4Q5RA 2L59A 1NHYA 2V41A 4NV2A 3GFKA 3QAGA 5LCZA 2FLSA 3APQA 1FVKA 1BYEA 2FA8A 2V1MA 4O7HA 2H6ZA 2HSHA 3FYGA 1SD9A 3HVVA 3CRTA 1SKSB 4MH3A 4EF0A 4KB3A 1KNGA 2VL2A 2GZYA 4AJ7A 1EP8A 1K0OA 3F4RA 3P8WA 2RM5A 1LBKA 3AY8A 5DCHA 3FR9A 1ZYEA 2ALBA 1XVQA 4MJAA 1X5CA 3HA9A 4EO3A 1EEMA 4I2UA 4IQAA 3ZYWA 1W89A 3TB2A 4V2LA 1SKRB 2A2RA 2JACA 2YOIA 4EUYA 4HU9A 2RIIA 1T8EB 1X9WB 4WF5A 3HYPA 2MBSA 3HHVA 1T3BA 1MTCA 4TRXA 5G5EA 2KP2A 2CA8A 1XWBA 3ERWA 1DE2A 4XIHA 1K0AA 5LD0A 2R4VA 3GHAA 5HR3A 2H8LA 3IE3A 1XWCA 3KGKA 2G2QA 3M3MA 1X5EA 1TK5B 5ELGA 3ZFBA 3KMOA 1EP7A 1BX9A 4JBBA 3HZ4A 1PSQA 2H74A 4PNGA 1RQMA 4EKZA 2ON7A 4O32A 3F63A 4L8EA 3VWXA 3RHCA 3TJBA 1MD3A 3LXZA 1KTEA 3KIJA 3GUSA 4ZIJA 3TCOA 1ZYQB 3QMXA 3IBHA 1TRUA 3RAZA 1NSWA 4BVXA 2EIQA 1AUCA 3C7MA 5JCUA 3APOA 2ZUPA 3TKQA 1R5AA 2AYTA 2VCWA 2C3QA 4AJ8A 1R5PA 4IBPA 3BJ5A 4K7IA 4MPGA 1GUMA 5LNKe 2VOCA 2FCHA 2B7JA 1TU8A 1C72A 2L6CA 2IFQA 3VPQA 2DJ0A 3KCMA 3ZVJD 5B8BA 2EIRA 1Z6NA 4AJ6A 4J56E 1UA5A 3QR6A 1EEJA 2VO4A 4N0VA 1MDJA 3NZNA 5C04A 2RLIA 3NIVA 1QMVA 5CRDA 4F2IA 5DJLA 5DALA 1PD21 3HCZA 2FD3A 5J3RA 1M7TA 3IK7A 4GSTA 5IQYA 1U3IA 2YWNA 2H6XA 4OFMA 1Y6EA 5A5KA 3LORA 1Z3EA 4I97A 5ID2A 3A3TA 1JZOA 1Z7RA 12GSA 3TRPA 4MF6A 2DIZA 2C4JA 4BPYA 2LNTA 2YNXA 3KZQA 3EMPA 2IMFA 4PXOA 3UIWA 1TI1A 3ZREA 1GP1A 1B8XA 1PQNA 3BCKA 2PWJA 1GUHA 3UARA 1T7PB 2MYGA 1O73A 4J2FA 2L4QA 3TRXA 1K3OA 3UMAA 2CX3A 3BD2A 1SK2A 5CRWA 6GSYA 2JSZA 3VURA 5D8IA 4GLTA 5GZZB 3TKSE 4OD7A 4JE1A 5CYYA 5J9CA 2YN1A 4IP1A 2PERA 2IMKA 3I43A 3UVTA 4ZILA 2VL9A 4EDZA 4POKA 4HEA2 3N9JA 4JU5A 4RUVA 3PH9A 2L5LA 3GX0A 1BG5A 4TVEA 3ZMKA 3GSTA 3LFLA 1OC3A 2LEGA 5IMCA 3WGXA 2CV4A 3K8NA 4EXJA 3LSZA 2F8AA 3QFAC 5ENUA 3ZIVA 4HUAA 4MJEA 1G6WA 4V2NA 3GIXA 22GSA 4NAXA 4DSQA 2R5GA 4PQHA 4OO5A 1O85A 3Q18A 1PL1A 2PU9C 2O85A 4AF2A 1PX7A 5D9TA 2K6VA 1G7EA 5HFGA 2H1GA 17GSA 2R3XA 4HZ4A 5GAND 2LKUA 2C0DA 4HOJA 4ZBAA 3WT2A 3ZFLA 1U87A 2LSTA 18GSA 2XBIA 1QQ2A 1GSSA 1F2EA 5IOWA 3FZ9A 4GTUA 4BWQA 1V58A 4HU7A 1SL1B 3CTFA 5ECSA 2HSYA 2WFCA 2YV7A 1RW1A 2H30A 2BMXA 5DJMA 2R37A 2IIYA 2HXKA 1ERTA 1K0CA 3EINA 1DE1A 1XZOA 1PX6A 4KCEA 3EE2A 2P0GA 4TR4A 16GSA 1TRSA 4BWSA 4GRFA 2OJLA 2DC5A 5IOXA 2GQLA 1EGRA 5IMVA 2NDOA 1ERUA 2P31A 2B5EA 3M1GA 1A24A 4YQUA 1ML6A 3GKMA 1YDKA 4MH2A 1TXXA 3TUEA 3Q6OA 1A0RP 1WWJA 2FY6A 1B9XC 2GTUA 1Y25A 4GXZA 2HZEA 3F8UA 2QSIA 1BQ7A 4FYBA 1O8WA 4HZ2A 4ZB6A 2LJRA 1WE0A 2DJ1A 1OC8A 4E8HA 3TKRA 1PL2A 1BEDA 1YY7A 3M0FA 2HLSA 1VF1A 4LMWA 3KXOA 1ZL9A 3GA4A 3ZTLA 1HNBA 1TRWA 2VLVA 3ZMLA 3EU3A 2TIRA 2DMLA 2J23A 2B6MA 2JSYA 1TW9A 3J7Yb 3HJPA 1GULA 2DJJA 5KN0A 1ILOA 4GQFA 2QGVA 1Q4JA 3C8EA 2C1YA 3F4SA 2LQOA 5IIZA 2E2GA 3GKKA 2HFDA 3F6FA 1A8LA 2L6DA 2VD0A 4ML1A 2NBSA 1TJDA 1V57A 1JHBA 5IMAA 3GH9A 4JZQA 4TR3A 2IN3A 5G2ZA 4F82A 1VRSD 3O3TA 4CHSA 1WP0A 1EWXA 4TXOA 1S3DA 3IRAA 3KJYA 1QGVA 4MZCA 1PKZA 2F3MA 2OE3A 2H75A 4GSSA 3F3RA 1QFNA 3QPMA 4MPFA 5HR2A 4NMUA 5ECOB 2C0EA 4POMA 2XBQA 5A4VA 1SKWB 2OE1A 4N11A 4IW9A 5HFKA 5AISA 3IPZA 3ISOA 4DEJA 2LS5A 4XTSA 1M2BA 1M9BA 1GLPA 8GSSA 2AJQB 3H1NA 1GSFA 4RI6A 5ECHB 2MMZA 3LEFA 4FIWA 4FO5A 3UAPA 4Q5QA 5DVBA 2B7KA 2JL4A 2ZNMA 10GSA 1S3CA 2YWMA 4JRRA 5EPFA 5HR0A 1A23A 1YEPA 4DSRA 4XCSA 2M72A 4IP6A 3QD9A 2O87A 4TR1A 3TJKA 4OO4A 1THOA 4IQ1A 4IS0A 3Q19A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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