2GGTA

Crystal structure of human sco1 complexed with nickel.
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
LLGGPFSLTTHTGERKTDKDYLGQWLLIYFGFTHCPDVCPEELEKMIQVVDEIDSITTLPDLTPLFISIDPERDTKEAIANYVKEFSPKLVGLTGTREEVDQVARAYRVYYSPGPKDEDEDYIVDHTIIMYLIGPDGEFLDYFGQNKRKGEIAASIATHMRPYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title A hint for the function of human Sco1 from different structures.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO1 protein homolog, mitochondrial
total genus 46
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ggtA00
3WGXA 4MLYA 3EU3A 3TKRA 3KP8A 1VRSD 3KIJA 4WKWA 3ZIVA 3TKPA 1TW9A 13GSA 3FZAA 1BEDA 3UEMA 5JCUA 2RM5A 4X0XA 2JSYA 2CVBA 5D9VA 4MZBA 4I8BA 4FYUA 4GLTA 2F51A 2VCVA 3TJJA 4TR1A 5KN1A 5DQSA 2DJ1A 2N5AA 1SL1B 1IYIA 2QSIA 2QGVA 1GTAA 9GSSA 1SD8A 5CNWA 1FW1A 1KTEA 3ERFA 1R4WA 4ZBDA 8GSSA 3DGQA 1O8XA 3IDVA 1S3AA 2L57A 1FVJA 1MDKA 1OKTA 1T3BA 3UARA 1JLWA 2GLRA 1B4PA 3TKSC 3VI7A 1SK1A 5JWQB 1M9AA 1OKDA 2V2GA 2M46A 1JLVA 1QQ2A 3ZFBA 1MD3A 2YANA 2VLUA 2I81A 3H1NA 4OFNA 2K8VA 3PH9A 3LQ7A 1OVNA 4JEDA 4P3YB 3P2AA 2BMXA 4XRAA 4KA0A 3JCML 1F3AA 3GUSA 3F3RA 1RK4A 4FYCA 2V41A 1YDKA 3VWVA 1JZDA 4QQ7A 1TP9A 3LWAA 2VCTA 4WEYA 2A2RA 4OO5A 4D73B 2K8SA 5D96A 3HJOA 3FRCA 1AXDA 1PRXA 3CXGA 4KX4A 3I9V2 5FHIA 3L4NA 4XHMA 3VK9A 1Z7RA 4MA9A 3G7YA 4RUVA 3C71A 3HVSA 2VCXA 4OMVA 1ZGNA 5GAND 4XTSA 1EP7A 1AC1A 1SJIA 1V57A 22GSA 1VF1A 2P0GA 1GLQA 5J9CA 5DAKB 2X8HA 5IQYA 1HD2A 4HQSA 4GWRA 4PGTA 3N9JA 1Z3EA 4POBA 2R6KA 1XIYA 3DIEA 3UVHA 3L0HA 3QPMA 1AQWA 1SJ6A 2IMEA 1K0BA 2CX3A 2F9SA 1OC9B 5AN1A 2C0FA 4ZL7A 4XIHA 2GT5A 3D21A 2DJ3A 4GSNA 1XW6A 3LXZA 3HD5A 4HUAA 4XS4A 4ZIJA 2KOKA 1XBSA 3EWLA 1B4QA 2DC5A 2OADA 1XW5A 5ECSA 4K1FA 4F2IA 3C8EA 4POLA 2H1BA 2RM6A 1VF2A 4FYBA 1YF0A 3KM6A 1I9DA 1Z5YE 1SK0A 2P5RA 3I6AA 2P31A 1G7OA 3ZIJA 4MK3A 2CZ2A 2XBQA 1SYRA 3QAGA 1TDIA 2FWFA 1TTZA 2YJHA 5G30A 4NAXA 3RPNA 4QL7A 2GSRA 4H86A 5AISA 1K0MA 3MWHA 5KN0A 1M2AA 5DCGA 3GTUA 1K3OA 1J08A 2AAWA 2OE1A 1GRXA 2R4VA 4ILFA 1TK5B 1TRSA 2G0FA 3O3TA 2C80A 3W8JA 2HRFA 5G31A 1ERWA 1T1VA 4EVMA 2V6KA 4LMVA 2M72A 2YPMA 3TRPA 4N11A 4JU5A 5IMZA 1TU8A 3F0IA 1TI3A 2VCWA 1TRUA 2HNLA 2L6CA 1O6JA 5D9TA 3Q74A 4AF2A 1K0AA 2L59A 3UBKA 5B8AA 4EE0A 4K9ZA 1XWKA 2AYTA 3EVIA 5J9BA 4ECJA 5C04A 1F2EA 2C1YA 4GSTA 17GSA 1M0UA 4MF6A 3GN3A 5HFKA 3HJMA 3UJ1A 3F4SA 1SKWB 2GSSA 3LEFA 2C3NA 2R5GA 2L4QA 3DWVA 3HKRA 4JE1A 1PKWA 5HFGA 3VFIA 4EO3A 2WB9A 1AAZA 1OYJA 2MMOA 4F0BA 10GSA 2HSHA 3EYTA 2H30A 2AUVA 1LJRA 1GNEA 5A5KA 1EEJA 2FUG2 4YH2A 3F9UA 4JBBA 1YEPA 3BCIA 4LL1B 3FW2A 3E9JB 1FAAA 3IK9A 4PQIA 3TKSA 1XWGA 2LQQA 2M80A 4XS6A 2H1DA 3PGTA 1E2YA 4PX1A 5CP1A 2KUCA 5EPFA 3WT1A 2PBJA 5CRHA 4D73A 1M9BA 2FWGA 4AGSA 2FGXA 4PQ1A 3DXBA 4ECBA 4AJ6A 4IW9A 1E6BA 1K0NA 1M2BA 4DSQA 4IJ3A 3KH9A 1RW1A 1EZKA 3ZVJD 2LRNA 3A2WA 5DAKA 2DBCA 4QL9A 3ZZXA 2EIOA 3M1GA 3IE3A 4MPFA 2IWTA 2LEGA 5ECRB 5IO0A 1K0OA 1Z6MA 1PMTA 3O6TA 4MJAA 4JR6A 2WZ9A 1N8JA 1OC9A 5F0GA 3PR8A 3CYNA 3NZNA 2L6DA 5D9WA 2HSYA 1AW9A 2EIRA 1GSEA 2HXKA 4NHZA 1A8LA 3KMNA 4LL4B 4CDOA 5E59A 1G0TA 4WBJA 2I4AA 1G7EA 3Q19A 2CVDA 2XBIA 2CT6A 5KN3A 4MZWA 2YWNA 5GAPD 1BJXA 4ECCA 4DSRA 1GSDA 2C3QA 3H4KA 1EV9A 4CW9A 19GSA 2CQ9A 2FLSA 3D22A 4ULXA 3IV4A 1W89A 2YZUA 2FD3A 4OD7A 2FCHA 3ZITA 1CQGA 3IHQA 1XOBA 1S3DA 2IMFA 4G10A 1SKSB 3UL3A 1X9MB 4F03A 4GSSA 1TXXA 2X8GA 4YAPA 3C73A 5ELAA 2DIYA 3GL5A 1SENA 2LS5A 2J23A 2R37A 1GNWA 4GCIA 4GQCA 2YP6A 1FHEA 2GGTA 3F6FA 2E2GA 1R7HA 2JU5A 1EOHA 5IMVA 5IMCA 4V2MA 2HI7A 4JRRA 3GURA 2VL3A 4GF0A 2ES7A 2C0GA 20GSA 4MDCA 1FB6A 3P8WA 3KD0A 1K0CA 4J56E 3FHKA 4NPBA 5HFIA 2V6OA 2WRTA 3IK7A 1WMJA 1TRVA 2E2MA 5H5SA 3HVVA 3BCKA 1A23A 3C7MA 3WT2A 5HR1A 1PD21 3KXOA 4EC0A 5CYYA 2C3TA 4K7IA 2OE0A 2PMTA 1T4YA 2HZFA 3P90A 2K6VA 3DD3A 3EC3A 1EGRA 2LNTA 1AQVA 3HZ4A 1UA5A 1YEXA 4HJMA 5IOXA 2A4VA 1ERTA 2L5LA 4HU7A 5B6NA 2NTOA 4PUAA 2PUKC 4IP6A 4ISDA 4K0GA 5AIVA 2CAQA 4Q5QA 3ME8A 2G2QA 2GVPA 2L4CA 2B6MA 2NDOA 2MZCA 4HEA2 4HZ2A 3IR4A 3L78A 1XZOA 1H4OA 2EIQA 4CHSA 3HVXA 4WR4A 1O73A 2HT9A 3NIVA 5IPGA 5LCZA 2K9FA 2ON7A 2N5FA 1SK2A 5IO2A 4PXOA 3HY2A 4BWSA 5IPHA 1HNCA 2JL4A 4N0VA 4FO5A 1XFLA 1EP8A 1Y6EA 3ZTLA 1KEBA 3TRXA 3IA1A 4WXTA 1GWCA 1U88A 3KTLA 3GL3A 2GSQA 5F07A 1XVWA 5ECHB 2OACA 1QUWA 3RBTA 4IVFA 3EE2A 1TK0B 3BOAA 1ML6A 4POMA 1DBYA 4Q5FA 4NV2A 4ECIA 1JFUA 2GQKA 4MMMA 2I9HA 4NMUA 4OWYA 4EF0A 2L5OA 1SKRB 4XCSA 2LV3A 1WE0A 3IPZA 2FA8A 2HRNA 4G2EA 2H0IA 4ID0A 1GUMA 5ECIB 3F8UA 1F9MA 3ZYWA 4KSOA 4EKZA 3TGZA 1YF1A 5LD0A 5ELGA 2LNSA 5COHA 2PVOC 2JACA 2H1AA 2ZNMA 5HR2A 3ZL5A 3UAPA 1FVKA 2B3SA 2CX4A 2A2SA 5HR3A 1ACVA 1ZL9A 4WR5A 3CSIA 4RQRA 4XRDA 3DVWA 3E3EA 4EL1A 1HNAA 2N5BA 4O7HA 3J7Yk 3P7XA 3GSSA 3OR5A 3GYKA 3BD2A 2VD0A 3FZ5A 3WYWA 5DVBA 2WFCA 1NW2A 1XXUA 2K18A 1GULA 5CREA 3TOTA 4WETA 1YY7A 2IIYA 4X43A 1EV4A 4HJ2A 4G9HA 1A24A 3IC4A 4MCUA 4I6XA 2LTKA 4MF7A 5DCHA 3D4TA 3RPPA 2KHPA 4L5OA 1LBKA 1BX9A 1SD9A 3ME7A 2HE3A 4DVCA 1FO5A 1KNGA 1YQ1A 4KDXA 3FR9A 5JCGA 5IMAA 3U6VA 2PU9C 3CTFA 2YV9A 1Z7PA 7GSSA 1Y25A 3KP9A 3M8NA 3FR3A 4DSSB 1AIUA 3APSA 3KTBA 1WJKA 3F4RA 1TOFA 3TJKA 3RAZA 1AUCA 1I5GA 6GSVA 4KUNA 1SJZA 3SWLA 3CSHA 3TOUA 4DEJA 2DIZA 2GSTA 1U3AA 3AY8A 2IMDA 3CRTA 3IBHA 1JZRA 1ERUA 3R2QA 3FR6A 2REMA 3G7IA 6GSTA 5CRDA 2DJ0A 1U87A 5CRWA 4BWQA 4NHWA 3LSZA 2YZHA 5F06A 4O32A 3ZFLA 4MZCA 2V1MA 3M3MA 3ZMKA 4IQAA 6GSSA 4ZBBA 3TDGA 4JZQA 4BA7A 4HU9A 1MEKA 4I5QA 1V98A 1DSBA 1H75A 4MPGA 3UOMA 4IN0A 3VPTA 2ZUPA 1A2JA 4ZILA 2X99A 3GKXA 4KAEA 1GSFA 2GQMA 1PX7A 4KNDA 3GRXA 4OCFA 4N30A 1JHBA 3LXTA 4GXZA 3GX8A 2NBSA 3W8SA 3APOA 2B5YA 2H0GA 1GTBA 1JZOA 5CAXA 3IOSA 3GNJA 1TKDB 1QFNA 4TRXA 2PPTA 2BTOT 2F3MA 1TK8B 4RI6A 2GDRA 1NSWA 1WPIA 1M99A 2B7KA 3QCPA 2F8AA 2FA4A 4HDEA 4FIWA 2DJJA 4K0NA 3D6IA 5EY6A 1A0RP 2P5QA 3US3A 1YZXA 5IMDA 1THXA 3FZ9A 1O7UA 4L0WA 3HXSA 1O81A 1HNBA 2R3XA 4EDYA 3QOUA 4E8EA 1X5DA 1NM3A 3BBYA 4POKA 4KH7A 4TR3A 3ISOA 5L71A 3UMAA 1GLPA 3EU4A 2RUEA 2VAFA 4IJIA 1XWBA 5D8IA 2VO4A 5ID2B 3IAM2 2J9HA 3HZ8A 3UIWA 3F3QA 4IBPA 3L9SA 5J5NA 2XPDA 4Z7XA 1GTUA 4ML1A 2LSTA 2H01A 4EXJA 2VOCA 3I43A 1ZZYA 1PA3A 1XOAA 1OC8A 3ZRDA 3F6DA 1X5EA 3G7JA 3TJFA 1ABAA 5DBQA 4NV5A 2H72A 3ZVJA 3VI5A 3LGCA 2CV4A 1HYUA 3WD6A 3D4MA 3GKKA 2AHEA 3LYPA 4BVXA 4MF5A 1KBNA 1TU7A 2E0QA 5G2ZA 1WWJA 3KH7A 2HZEB 2NVLA 4KDUA 4ZB6A 5AIXA 5GSTA 2JZSA 5F05A 5H5RA 2VM1A 2IL3A 2XPEA 5DJLA 2VD1A 2H66A 2YOIA 3CMIA 1B9XC 1K0DA 4WF5A 1R5PA 3MDKA 5FT3A 2MYGA 2DMMA 3HDCA 4IGJA 3TCOA 4MABA 1DE2A 3DYRA 4TOPA 2HFDA 2IMIA 4DSSA 5H5QA 4PNGA 5IIZA 4MJCA 3QFBC 2H8LA 3TRQA 1SL2B 1THOA 1VF3A 2GS3A 3C1SA 2OA7A 2HYXA 4V1Ap 4OO4A 6GSYA 4JR4A 5A4UA 2O7KA 1MD4A 1GSSA 1FB0A 1B48A 3I69A 1UVZA 5DDLA 3IXRA 2TIRA 3Q6OA 5JCWA 5JWRB 3ERGA 3QMXA 4PNFA 5ECPB 1GUHA 2LJRA 2MMAA 3VWUA 1BG5A 2LRCA 2YWOA 3H8QA 2BJXA 3LJRA 1FG4A 1V2AA 1OE8A 3DEXA 5J41A 3RDWA 5J3RA 1TI1A 4IELA 1WRYA 5ECMB 1PSQA 3C1RA 2H19A 3VPQA 3G9BA 1W4VA 1G6YA 1UC7A 3QR6A 4HZ4A 3LORA 2FWHA 4MJBA 1J0FA 3MSZA 2CA8A 4N0ZA 2RUFA 2ALBA 5EL8A 1T7PB 12GSA 2VCZA 1ERVA 18GSA 2OJLA 4NXIA 3CBUA 3PINA 2WS2A 4BVYA 3IRAA 1F6MC 4GRFA 4KSMA 4ZB8A 4I97A 2IFQB 2OKAA 1DUGA 1Z9HA 5D93A 1NHOA 1SYXA 5G1KA 2VL9A 5DQYA 5IM9A 2OE3A 2VM2A 5E4WA 3A2VA 3L9UA 1M7TA 1T4ZA 1PGTA 2LKUA 3RHBA 5AGYA 3U5RE 2JSZA 1GTIA 4TXOB 1HQOA 2XHFA 2YWMA 2O87A 4KCAA 5ID2A 2FHEA 4K7OA 5HQPA 1YKCA 2GT6A 2B5XA 2CVKA 2YV7A 2NPBA 3WGDA 1OC3A 4TVEA 1MTCA 3LG6A 2H70A 4IS0A 5D73A 1ZCPA 5C00A 1K3LA 5ECLB 4MH2A 1M2DA 2DJKA 2YNXA 3TUEA 1JZWA 2PWJA 4Q5RA 4LLRA 1J9BA 5ENUA 1QK8A 3EINA 2KP1A 4ZXGA 2GQLA 4HI7A 1EGOA 1TRWA 2H6YA 1BYEA 5CRGA 3GKNA 2MBSA 2GZZA 2IMKA 1V9WA 2O8VB 2O85A 5J4UA 2JADA 2FWEA 1K3YA 4KB3A 1BAYA 3GSTA 1O8WA 1YKAA 2HZEA 3S9FA 3KMOA 4J57E 2B5EA 4HS1A 1SL0B 2IJYA 2H75A 2H76A 5G1LA 2C0DA 2JZTA 4WF4A 3GKMA 1ST9A 2E7PA 3KCMA 4I2UA 1R26A 5DALB 1YJ6A 5D9XA 4N10A 2MMNA 4GTUA 4PUFC 2CAIA 1GSQA 2PVQA 4ZB9A 4G19A 1CQHA 4PQHA 4F0CA 3K8NA 2VCQA 2Z9SA 1GH2A 3CSJA 4TN8A 3HJPA 2YJ7A 1XCCA 3N5OA 4IP1A 4LA1A 3QDNA 4L8EA 4BL7A 5ECQB 2TRCP 2DSAA 2FNOA 4MJEA 3FY7A 3BJ5A 3FYGA 2VL2C 1EWXA 1F3BA 5G5EA 2HLSA 2ZCTA 3APQA 1R5AA 3F4TA 1PL1A 5LNKe 2VIMA 4TR0A 3GA4A 1EEMA 4I2TA 4XS1A 4YQMA 3H79A 2H1GA 1PKZA 4K6XA 5ECOB 2OBIA 4IHUA 1FOVA 2PERA 4LMWA 3GFKA 3GMFA 3IAS2 3TB2A 3KEBA 1GSUA 1V40A 2IN3A 2PGTA 2KP2A 3D5JA 4WBRD 2AV4A 1PN9A 4AJ8A 4EDZA 5F8BA 1A2LA 3GIXA 2B7JA 3ZREA 4RI7A 4K7NA 1XW9A 1TJDA 1ZOFA 3ERWA 3KZQA 3VLNA 2AJQB 2AB6A 2WCIA 3L9VA 4OFTA 2V32A 4TR4A 2IFQA 4AJ7A 1WIKA 4E8HA 1QMVA 3VWWA 1O85A 11GSA 4K2DA 3GHAA 2ON5A 3MNGA 3UBLA 1PQNA 3HHVA 3M0FA 1C72A 3A3TA 2RLIA 1U6TA 2DMLA 3QAVA 2LUSA 2R2JA 5GZZB 1GL8A 3SBCA 2FY6A 1AQXA 5GSSA 2WGRA 2KLXA 4TXOA 3ZLPA 1X0RA 3ED3A 4KGIA 4J2FA 4L5LA 4ZBAA 2VLTA 2X8CA 2XC2A 5KN2A 1QGVA 2GTUA 4F9ZA 1A8YA 3TKQA 4TR1B 3EMXA 3LFLA 4BPYA 4PURA 2DLXA 3HCZA 14GSA 1WOUA 2D2ZA 4KE3A 2O89A 1WP0A 1ZMAA 3LYKA 2LJKA 16GSA 3M9JA 2H6XA 2C0EA 2LRTA 3KGKA 2YWIA 3M9KA 2WDUA 1PX6A 3HYPA 1LU4A 4TXVA 4YQUA 3O76A 2C8UA 3CRUA 3DMLA 5ABRA 2TRXA 3KJYA 5IOWA 3HA9A 4MH3A 2GZYA 4KDYA 5ECKB 5B6MA 2MBTA 2H71A 1ILOA 4HQZA 5CO3A 1GUKA 2C4JA 4GQFA 1IYHA 2MMZA 1Z6NA 1VGLA 3QFAC 3TKSE 6GSXA 4KCEA 4V2LA 2VUPA 3EURA 4ML6A 1X5CA 3FK8A 4FH8A 3DVXA 5IMFA 2H0HA 1F37A 4ZL9A 1GSYA 5DALA 2H74A 2WULA 2I1UA 3GH6A 1ON4A 3FKFA 3J7Yb 2DJ2A 4V1Ag 2H73A 2LJAA 2IPAA 3VWXA 5B7CA 2X64A 2F8FA 3QAWA 1GP1A 3GV1A 3RHCA 4YAVA 1USBA 3TJGA 1G6WA 2CZ3A 3Q18A 4YQVA 1OAZA 2B1LA 5DJMA 1U3IA 4F82A 3W6GA 2PN8A 1URMA 2VLVA 5INYA 1EOGA 1V58A 2JZRA 1PL2A 4TW5A 3TJBA 2WJUA 3A5WA 3ZMLA 1T8EB 2LQOA 3F63A 5KEJA 1NHYA 3EMPA 4K8MA 3GH9A 4RQXA 3CTGA 1UN2A 2H6ZA 1QXHA 1XPVA 2I3YA 4O5RA 2RIIA 3FZ4A 4O92A 4HOJA 1VF4A 1Q4JA 2GZPA 1RQMA 1S3CA 4TKYA 5A4WA 1MDIA 4IQ1A 3QD9A 2VL2A 4XS4B 3H93A 3WGEA 4X1UA 1SU9A 1B9YC 1OE7A 3E0UA 5FWGA 1B8XA 1N2AA 2YCDA 1X9WB 3V1WA 5B8BA 1DE1A 4L0UA 3FEUA 1A2MA 4Q5NA 4KW6A 1ZYQB 3DKSA 5EVOA 3D0ZA 6GSWA 3MAKA 1MDJA 1BQ7A 4MP4A 6GSUA 2QC7A 4EUYA 4ACSA 2OBKA 2EC4A 2QKEA 1Q98A 3DRNA 5G5FA 5A4VA 1XWAA 3UVTA 4V2NA 3GX0A 4OCEA 2YN1A 5JWOB 3NOFA 3GTUB 1A0FA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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