2GQKA

Solution structure of human ni(ii)-sco1
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
173
structure length
173
Chain Sequence
SFTGKPLLGGPFSLTTHTGERKTDKDYLGQWLLIYFGFTHCPDVCPEELEKMIQVVDEIDSITTLPDLTPLFISIDPERDTKEAIANYVKEFSPKLVGLTGTREEVDQVARAYRVYYSPGPKDEDEDYIVDHTIIMYLIGPDGEFLDYFGQNKRKGEIAASIATHMRPYRKKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A hint for the function of human Sco1 from different structures.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO1 protein homolog, mitochondrial
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 49
structure length 173
sequence length 173
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2gqkA00
3UL3A 1ZZYA 1TI1A 3RDWA 1I5GA 1GTUA 2CA8A 2O8VB 5B7CA 3QMXA 4PXOA 1QGVA 1AQWA 4HI7A 2L5OA 1K0BA 4IVFA 4V2NA 1O6JA 1TXXA 1GNEA 5ECIB 2YZUA 1FO5A 5EPFA 4POLA 2P0GA 4K0GA 5A4WA 1Q4JA 1ERWA 4JR6A 3F4TA 5ELGA 5DJMA 1YEXA 3QFBC 1HNCA 4L5LA 2KUCA 2HZEA 4MJAA 1M9AA 2YN1A 1FB0A 2C8UA 3J7Yb 3TCOA 4K0NA 3UARA 1HYUA 2HSHA 4KNDA 4JBBA 3N5OA 3KP8A 5CO3A 2N5AA 5IMFA 1K0CA 2FGXA 4BA7A 2PVQA 4TXOA 3KD0A 3GTUA 5ECRB 3D21A 1RQMA 5B8AA 1K0AA 2VLTA 5F06A 4XRAA 5IM9A 3GSSA 1JHBA 1LU4A 2V32A 3VPQA 2IIYA 4G2EA 1T00A 2H76A 2IPAA 1SK0A 2VCZA 2PU9C 3WT1A 3Q19A 2C0GA 4WXTA 3CTFA 3BCKA 4I2UA 1DE1A 2P31A 1YZXA 1VF3A 1F3AA 3IXRA 3GKKA 3FR6A 3WD6A 3Q74A 4AF2A 4KCEA 3HY2A 2AYTA 12GSA 3TKSC 1JLVA 5ECKB 1V58A 5F07A 4WF5A 2LJAA 2H1AA 3A2XA 1SJZA 3FZ4A 1WOUA 3UBLA 4MDCA 4NHZA 3VWVA 2ZUPA 3L9UA 4LL1B 4KSOA 4Q5RA 4XS4A 3SBCA 2OACA 1XWGA 2WZ9A 3M8NA 2RM5A 2H1GA 3EU3A 2F51A 5GSSA 2RM6A 1J0FA 1XVWA 2TRXA 1AC1A 4IGJA 1AUCA 4GQFA 2C3NA 4AJ7A 1YQ1A 1K3LA 4XHMA 3TOUA 1QFNA 3IK7A 3M9JA 5IMZA 1U87A 2AJQB 2V6OA 5INYA 2HI7A 5H5QA 4JU5A 5DCGA 2FY6A 2GS3A 3G9BA 4FO5A 1FHEA 18GSA 1NHOA 1KTEA 3TJKA 3HZ4A 5EVOA 1PGTA 4F0BA 4MABA 3VI5A 2IFQA 1G6YA 1SD9A 2H75A 2I81A 1OYJA 2HZEB 1QUWA 3GA4A 4IJIA 5D93A 2CX3A 1YY7A 3LXTA 1EP8A 4MF6A 3CXGA 2KP2A 5A4UA 3CRUA 3C8EA 4TXOB 3PR8A 3ZL5A 1A2LA 2GSTA 5J5NA 3GKNA 5IIZA 6GSXA 4OCEA 2VCTA 2LNSA 3EMXA 4PURA 4DSRA 1ZCPA 3DWVA 2AHEA 3A2WA 1SKSB 5G1KA 3C7MA 3TJBA 1Y6EA 3HYPA 3ZMLA 1ZYQB 2K8VA 2Z9SA 2RLIA 1SU9A 2OBKA 2KLXA 2OE3A 3TJGA 4KE3A 1MDJA 3ZVJA 3M9KA 1NM3A 6GSSA 1NW2A 3TUEA 3UOMA 3NOFA 1TKDB 2LRNA 2IN3A 2AUVA 5D73A 3EWLA 4K6XA 3M0FA 1MTCA 3U5RE 4ZL7A 1THXA 1OVNA 1Z9HA 2DBCA 4MF7A 1PL1A 2MMOA 3ERWA 4F2IA 3C71A 4K7NA 4O7HA 3GRXA 4XS4B 1QQ2A 2X8HA 3S9FA 2E2MA 1OAZA 1Y25A 5IOWA 5CREA 1WP0A 3JCML 2H30A 1MDKA 3TOTA 4I6XA 4HS1A 3TRQA 3D6IA 5IO0A 4I5QA 2PPTA 2VLUA 2DMMA 5CRDA 1PA3A 3EURA 4JZQA 1GSEA 3GMFA 3LSZA 3QOUA 1FAAA 2DJ0A 4GTUA 3LQ7A 5AGYA 1JFUA 2LNTA 3LORA 2PMTA 1YF0A 2XBIA 3FR3A 3TB2A 1T7PB 5FWGA 1X9WB 1TJDA 1S3DA 3W8JA 4K9ZA 1OKDA 3QAGA 1QK8A 1M2BA 5J9CA 2MMZA 5LNKe 4OCFA 1UC7A 2I1UA 2K8SA 2FD3A 2IFQB 3ZIVA 3NZNA 5HR2A 1YEPA 1S3CA 5ID2A 2YCDA 2FWEA 3FZAA 2YJHA 3L9VA 1EGRA 3WYWA 2J9HA 1V40A 4WBJA 4YAVA 5CAXA 1TK0B 2E2GA 1GSDA 2LQOA 2VL3A 2LTKA 4ILFA 4KCAA 3KH9A 1GWCA 2DJ3A 1XWAA 2GZYA 3G7JA 1U3IA 4TR4A 4K8MA 4DSSA 2L59A 4IKHA 2C0EA 4BWSA 3QAVA 3K8NA 4XRDA 1A2JA 4MA9A 3D0ZA 1YKCA 2X64A 3GYKA 4GF0A 5HR0A 2CQ9A 1LJRA 4NV5A 1O8WA 2CAQA 1FVJA 5JWRB 4PQIA 1GLPA 2IMIA 3C1RA 5CYYA 2A2RA 2R2JA 3L0HA 1FG4A 2N5BA 3CTGA 5CRWA 4WETA 5G2ZA 2M80A 3G7YA 1AW9A 2H0IA 3H4KA 1K3YA 4MZCA 2A4VA 1V98A 4K7OA 2ON5A 1O81A 3KJYA 1HD2A 1SJ6A 4OD7A 3GKXA 2CVDA 2GQLA 4KX4A 17GSA 2GZPA 3CSJA 1PSQA 3DIEA 5LD0A 1WWJA 1XCCA 3V1WA 1UA5A 1A24A 1OKTA 3W8SA 3WGDA 3EVIA 1TU8A 1RW1A 11GSA 2WGRA 3MWHA 5GAPD 4F9ZA 5CP1A 4V2MA 1B8XA 1GTAA 2AAWA 5GZZB 2LEGA 4PNFA 4DEJA 2H1BA 3KGKA 4JR4A 3GHAA 1H4OA 2LJRA 1B48A 4GQCA 1S3AA 2VO4A 2X8GA 1AIUA 1GNWA 4GXZA 4JRRA 4WR4A 1OC8A 1PX7A 5LCZA 1K0NA 1UVZA 1V2AA 2YWMA 2C80A 2MMNA 4RUVA 2WDUA 5J9BA 2WJUA 3VLNA 1SL0B 5GAND 4OWYA 2LRTA 3P90A 3CRTA 4IELA 3IPZA 2H8LA 2CVBA 2LRCA 4PUFC 2DIYA 4ML1A 2NDOA 3FEUA 2LUSA 2R6KA 1TDIA 2H19A 3LFLA 4TOPA 5IQYA 1H75A 1I9DA 5ID2B 1XFLA 4TN8A 1YDKA 4FYBA 4EUYA 3GFKA 4PQ1A 2E0QA 10GSA 4HJMA 4N0ZA 2DMLA 1Z7PA 5KN0A 4KDUA 3A3TA 3TKPA 4ECBA 4MLYA 2YV7A 5AIXA 2NTOA 1THOA 5ECPB 4DSSB 2FUG2 4LLRA 1EV4A 5HQPA 3HHVA 2LV3A 2B3SA 3C1SA 1T1VA 1EV9A 4ISDA 2WS2A 1JZWA 5DCHA 2C3TA 3KTLA 3F9UA 5J4UA 2H74A 1SJIA 1MD4A 3F6DA 1X5CA 1C72A 4YQVA 4N10A 1UN2A 4RQRA 1JZRA 1O8XA 3DKSA 4MPGA 4O32A 1ZOFA 2GT5A 2C4JA 2FA4A 3IAM2 4ZXGA 3DVXA 3A5WA 5L71A 5HR3A 2P5QA 5F05A 1TOFA 1ZL9A 3HVXA 1SKRB 1TU7A 1XVQA 1EOHA 4PQHA 3ISOA 3RBTA 4ZL9A 3IOSA 2TRCP 1GSQA 1HNBA 1GULA 1HNAA 2JU5A 1K0MA 1VF1A 2O87A 4O92A 4HQZA 2XC2A 2C3QA 2CV4A 3LWAA 1U3AA 2HRNA 2ON7A 5HFKA 4BPYA 4HJ2A 2M46A 1TRUA 2IWTA 5CRHA 3ZRDA 2YWIA 3N9JA 4XIHA 1PQNA 5ENUA 4POBA 3VWWA 1SL1B 1WIKA 3DRNA 2EIOA 1ZMAA 3VPTA 2DC5A 5FT3A 4IS0A 3GIXA 4ML6A 5IOXA 2I4AA 1X5DA 2O89A 4AJ8A 3HJOA 4RI6A 3F3RA 2HFDA 2OE1A 3EC3A 4X43A 1FW1A 4TVEA 4GCIA 5ELAA 5A5KA 6GSTA 1ERUA 2FWHA 1QXHA 2L6CA 4HQSA 3P8WA 4Z7XA 4ZB9A 1JZDA 3F4RA 3P2AA 4I2TA 4YH2A 3ERFA 3H1NA 3MAKA 1OE7A 5DVBA 1KBNA 2JZTA 5D9VA 2V1MA 3EU4A 2REMA 3IRAA 3F0IA 3TKQA 3A2VA 2IMEA 1SENA 2VIMA 1ST9A 1WE0A 2H6XA 3KIJA 1GRXA 4BWQA 4WR5A 2E7PA 2C0DA 4IHUA 3DD3A 1IYIA 4FYCA 3HJMA 1J08A 2I3YA 3ZVJD 1XIYA 4NAXA 3FYGA 2CAIA 1GSSA 3OR5A 1B4PA 1V9WA 2QGVA 4EXJA 2PUKC 2O7KA 3ZMKA 2G2QA 5HFIA 4HOJA 5AIVA 5ECNB 3IE3A 2EC4A 4V1Ap 2VM1A 3HZ8A 3LGCA 4XCSA 1ACVA 4V2LA 1BAYA 4GRFA 2GZZA 5DQSA 4NXIA 5KN1A 3ZYWA 3Q6OA 2H0HA 4TKYA 3KP9A 1EOGA 3F8UA 3I43A 3IR4A 1U88A 4QL7A 2XPDA 2F8FA 2ES7A 1SL2B 4I8BA 3L4NA 2VL2C 2H6ZA 4HDEA 4KGIA 3MDKA 3SWLA 1IYHA 1USBA 2NVLA 1XWBA 3I69A 2PN8A 3MSZA 1GUHA 3US3A 1XXUA 2H73A 4ACSA 2HE3A 2IL3A 1A0RP 2HSYA 4AJ6A 3GKMA 4J2FA 2JZRA 2YOIA 1ERVA 2B7KA 2H71A 2N5FA 1TK8B 2H01A 2NBSA 2HNLA 1JLWA 3M1GA 4NHWA 4MJBA 3KH7A 3O6TA 5B6NA 3PGTA 1WPIA 4DSQA 2BJXA 3FHKA 1SK2A 4MMMA 1BYEA 4EDYA 3ZLPA 1EP7A 4IN0A 1T4ZA 1SYRA 1EEJA 4HEA2 5G5EA 2P5RA 2HLSA 2MBSA 4QQ7A 1TK5B 4ZBDA 1ILOA 4RI7A 2ZCTA 1G7OA 1WRYA 2RUEA 5EL8A 5AISA 4TR1A 5D96A 2PWJA 3IK9A 4L0WA 4CW9A 5JCGA 1PN9A 3BBYA 3DEXA 1SD8A 3GV1A 6GSUA 2O85A 2GT6A 1XOAA 3IBHA 16GSA 3HD5A 3QD9A 1E2YA 3GL3A 2GSSA 2L57A 4ECJA 3W6GA 2B1LA 5COHA 5IMDA 3EYTA 1JZOA 3ME8A 5C00A 4LL4B 4YQUA 2L6DA 3ME7A 2AB6A 1M2DA 4GSSA 4N0VA 3QAWA 3ZZXA 1U6TA 3E3EA 2MYGA 1G6WA 3LEFA 2JADA 3RAZA 2FLSA 1PKZA 4IP1A 5ECSA 2VCWA 3FZ9A 2H0GA 2LS5A 2XBQA 4AGSA 3ZFLA 4MH3A 3HJPA 2F3MA 5KN3A 2YWOA 1Z6NA 4WF4A 3TKSE 4F03A 1R4WA 2FWFA 2WCIA 1V57A 4E8EA 5DAKA 4IW9A 1AQXA 3CBUA 4EDZA 3HXSA 2JACA 4MZBA 5D9XA 4KDXA 1J9BA 2OADA 2JSYA 3TJJA 5B6MA 3BD2A 4KW6A 1M99A 2BTOT 5G31A 2GTUA 1DSBA 2B6MA 2YWNA 1PX6A 3GX8A 2PERA 4X0XA 2QSIA 1PL2A 1BQ7A 4BVXA 1YF1A 4EE0A 2V6KA 3CMIA 4ULXA 4ZB8A 1URMA 1GLQA 1PKWA 3M3MA 1E6BA 2L4QA 1B4QA 4V1Ag 5CNWA 2HZFA 3E9JB 13GSA 3KEBA 2X99A 3TKSA 1CQGA 3WGXA 4TXVA 2LSTA 2K18A 4KB3A 3RPPA 3UEMA 4KDYA 1FB6A 3U6VA 4TR1B 4ZBAA 1X5EA 4P3YB 4N30A 2DSAA 2K9FA 5D9TA 5AN1A 3LXZA 1MEKA 4KA0A 3APSA 3CSHA 3HVVA 5A4VA 4MP4A 5H5SA 3WGEA 5IPGA 3O76A 1ABAA 3F63A 3QPMA 4MJEA 1GTBA 4E8HA 3GN3A 2IMKA 1K0DA 3RHBA 4XS6A 5B8BA 1T3BA 2KOKA 3D5JA 4KH7A 2KP1A 3UVTA 3KM6A 4HU9A 2XPEA 2I9HA 3HDCA 1VRSD 4TR3A 4J57E 3KCMA 4MJCA 3J7Yk 4Q5QA 3LYKA 2HRFA 3UIWA 4POMA 4GSNA 3VFIA 3GX0A 5DBQA 5DJLA 2VD0A 2A2SA 2PBJA 5IMCA 4MK3A 5DAKB 1ZYEA 4ZBBA 2TIRA 5D9WA 4BL7A 1XBSA 7GSSA 3BOAA 2DIZA 3FZ5A 4IBPA 4NMUA 1ZGNA 2FWGA 2IMFA 2VL2A 2GLRA 1Z7RA 4IJ3A 1VF4A 2PVOC 2YPMA 3MNGA 4HZ2A 1B9YC 2RIIA 5DALB 1XPVA 4JE1A 3RHCA 4ECIA 2R3XA 1K3OA 3QCPA 2GSRA 1VGLA 2HT9A 3VI7A 1NSWA 4MZWA 2VUPA 2MBTA 3VK9A 3HVSA 3CYNA 4L8EA 1SYXA 2R4VA 3VWXA 4KUNA 3KTBA 1XW6A 4MF5A 2IJYA 1F6MC 1N2AA 4Q5FA 3KXOA 5E59A 4G9HA 3F6FA 1Z3EA 2V2GA 3DVWA 3I9V2 2YZHA 4EVMA 4X1UA 2H72A 2PGTA 1FVKA 1CQHA 1O7UA 3IDVA 4MH2A 4ZIJA 4F82A 2VD1A 3KMOA 14GSA 2AV4A 3TJFA 3ZITA 3FY7A 1X9MB 4ZB6A 1ERTA 5HR1A 2VCXA 3F4SA 1AXDA 2WB9A 4O5RA 5IO2A 3UVHA 3L78A 4HZ4A 3QDNA 4GWRA 1W4VA 4OFNA 1TP9A 1XWCA 2GVPA 2QKEA 4ECCA 5IPHA 1GP1A 2RUFA 3EMPA 2DJ2A 2WULA 1M7TA 3APQA 1GSUA 2B1KA 2LKUA 2VOCA 2B5YA 4CHSA 1TRVA 3APOA 3EINA 3L9SA 3DXBA 2FA8A 2FHEA 2JZSA 3GURA 3IC4A 20GSA 3R2QA 3TRPA 19GSA 2D2ZA 1YKAA 4D73A 2C0FA 5JCWA 1VF2A 4NWYA 2BMXA 4J56E 4HU7A 3ZIJA 1EZKA 1M9BA 3FKFA 3IV4A 1FOVA 2OJLA 4KSMA 3VURA 4YQMA 1W89A 4OMVA 4XTSA 5J3RA 1M2AA 5G30A 5G1LA 1NHYA 8GSSA 3CSIA 3FK8A 4WKWA 3H93A 1KEBA 2F9SA 2B5EA 4EC0A 5G5FA 2VLVA 3FRCA 3I6AA 2C1YA 2DJ1A 3TKRA 5FHIA 1EEMA 1Z6MA 5ECLB 2GGTA 2CVKA 3F3QA 1KNGA 5ECQB 2YANA 3ZREA 1XOBA 1OC9A 2R37A 3GSTA 4OO4A 1X0RA 2VM2A 3LYPA 1SKWB 4MCUA 1TRWA 2IMDA 3E0UA 2G0FA 3UMAA 5ECMB 3FW2A 4CDOA 4G19A 5KEJA 4GLTA 5IMVA 3GTUB 1WJKA 3AY8A 3HA9A 4HUAA 4NPBA 3HKRA 4JEDA 1GUKA 2HYXA 1A8YA 4TRXA 4BVYA 2MZCA 4WEYA 3DGQA 2DJKA 1LBKA 5KN2A 4EF0A 2ALBA 4DVCA 3O3TA 1TW9A 2H66A 4IP6A 2GQKA 4N11A 3G7IA 5E4WA 2FNOA 1TI3A 5EY6A 4RQXA 3KMNA 1GTIA 4OFMA 4OO5A 2JL4A 2MMAA 2QC7A 1XZOA 1O85A 5H5RA 1F9MA 2JSZA 2DLXA 4LMWA 1TTZA 1BEDA 1ON4A 4WBRD 2H70A 1HQOA 2KHPA 3DMLA 3IHQA 3VWUA 4NV2A 5ABRA 4D73B 3ZTLA 1PMTA 1GSYA 1AQVA 2YV9A 1B9XC 3GH6A 2J23A 5IMAA 2V41A 3ED3A 2H1DA 4PX1A 1N8JA 4KAEA 5F8BA 1SK1A 1A2MA 5D8IA 1F37A 4EL1A 2GQMA 4K1FA 2VCVA 5C04A 1GSFA 1F2EA 2CX4A 4LMVA 1DUGA 4K2DA 2LJKA 1F3BA 1XWKA 1BX9A 1EWXA 4EKZA 3QFAC 3IA1A 1ML6A 4OFTA 2R5GA 5JWOB 3GUSA 1OC3A 1OC9B 4FIWA 4L5OA 4TR0A 1EGOA 3TGZA 1O73A 2NPBA 2WRTA 5F0GA 2CZ3A 4IQAA 6GSVA 3Q18A 1TRSA 2M72A 2GDRA 3FR9A 2GSQA 3C73A 1R5PA 4POKA 1PD21 3HCZA 5ECHB 2OKAA 2X8CA 1G0TA 1QMVA 2VAFA 2EIQA 3TDGA 4QL9A 3GL5A 1A23A 1XW5A 4ZILA 1MDIA 5DQYA 4GSTA 1K0OA 2CT6A 5JCUA 4ZL8A 1R7HA 1R5AA 2OE0A 5DALA 2FCHA 1A0FA 1AAZA 2F8AA 1G7EA 2DJJA 3D4TA 2VL9A 4H86A 2L5LA 5JWQB 3WT2A 3KZQA 1BG5A 5GSTA 1WMJA 2EIRA 4ID0A 4G10A 3LG6A 4IQ1A 1OE8A 2VCQA 5J41A 3UBKA 3H8QA 1BJXA 3D22A 2K6VA 3TRXA 1M0UA 6GSWA 4XS1A 1XW9A 2B5XA 4PNGA 3ERGA 1Q98A 1RK4A 4Q5NA 1YJ6A 3UAPA 2L4CA 3PINA 4FYUA 2LQQA 1DBYA 2OBIA 3BJ5A 4LA1A 4K7IA 2B7JA 5ECOB 3GNJA 1T4YA 2YJ7A 2HXKA 1GL8A 3D4MA 4YAPA 3ZFBA 5CRGA 9GSSA 4I97A 3RPNA 1GUMA 3EE2A 1DE2A 3UJ1A 2OA7A 4EO3A 3P7XA 4PUAA 5DDLA 3PH9A 3LJRA 4F0CA 3QR6A 4L0UA 2H6YA 1X9SB 2YNXA 1R26A 3DYRA 2YP6A 3H79A 1MD3A 1GH2A 4PGTA 1PRXA 3BCIA 3GH9A 3NIVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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