2GQMA

Solution structure of human cu(i)-sco1
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
173
structure length
173
Chain Sequence
SFTGKPLLGGPFSLTTHTGERKTDKDYLGQWLLIYFGFTHCPDVCPEELEKMIQVVDEIDSITTLPDLTPLFISIDPERDTKEAIANYVKEFSPKLVGLTGTREEVDQVARAYRVYYSPGPKDEDEDYIVDHTIIMYLIGPDGEFLDYFGQNKRKGEIAASIATHMRPYRKKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A hint for the function of human Sco1 from different structures.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO1 protein homolog, mitochondrial
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 51
structure length 173
sequence length 173
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2gqmA00
5B8BA 4KCEA 5COHA 2REMA 1AXDA 4TR1A 4DSSA 3UBLA 4N0VA 2WZ9A 2PPTA 1K0OA 4MJAA 3F4TA 5EY6A 4ECJA 1G7EA 2YCDA 2AHEA 5J5NA 1M7TA 5IOXA 4J2FA 3R2QA 4AGSA 4IBPA 4QQ7A 3US3A 12GSA 4YQUA 3GKNA 4L0UA 4MA9A 1HNAA 3C7MA 3L9SA 1FOVA 4NWYA 4K7IA 1WE0A 4MPFA 5HFIA 2CA8A 2GTUA 3DVXA 2VUPA 3GH9A 4ZBAA 2HFDA 3H4KA 4POBA 2VOCA 5ID2B 1SYRA 2LEGA 1TK0B 1TW9A 3M9JA 2H0IA 2R2JA 5B7CA 1F6MC 2DJKA 4GRFA 2QSIA 3CRUA 5DALA 2ZCTA 4PNGA 4LLRA 2GSRA 1KTEA 3DKSA 1Y6EA 3F63A 2GS3A 2B7JA 3DD3A 1OC8A 1XWCA 2G2QA 3ME7A 2C0GA 1GSYA 1ZMAA 4TR3A 3EU4A 2IWTA 3A3TA 1G7OA 2H74A 1PD21 3D4MA 4XRDA 5B8AA 1M2BA 4I97A 4I6XA 2HI7A 2K9FA 4G19A 2OADA 1BX9A 2AYTA 3SWLA 1Q98A 4MH3A 1EGRA 1O8XA 3FZAA 2WDUA 3HD5A 1TRUA 2LQQA 5GAND 1SD9A 3NIVA 1X9SB 3EMXA 2L57A 5D73A 5IQYA 5HFKA 3PR8A 1J9BA 2MMOA 2YP6A 2LNSA 2H72A 3FY7A 4HOJA 5FT3A 3P7XA 2GGTA 2ZNMA 1GWCA 1AIUA 2CAIA 2JZTA 2N5BA 3E0UA 1MTCA 3IA1A 3GSSA 1Z3EA 1X0RA 1OKDA 4ZBDA 1PL2A 1M9AA 18GSA 3RHBA 4ZBBA 4DVCA 1R26A 3LYPA 6GSUA 4MJEA 3EVIA 2VCQA 1B48A 4EE0A 3MNGA 22GSA 2C80A 1TDIA 2KLXA 1EEJA 4XHMA 3LXTA 4GSSA 2IMKA 1KBNA 4L5OA 1QK8A 3DWVA 5IO0A 5G1LA 1X9WB 5HFGA 3GA4A 2LKUA 4JE1A 1WJKA 4TOPA 5ID2A 4MMMA 4K2DA 3DVWA 1R4WA 3VURA 3FEUA 5F8BA 1F3BA 2LRCA 3BCIA 4ZB6A 1NHOA 4PXOA 4IN0A 2WB9A 4FYBA 2LS5A 13GSA 2BJXA 3N5OA 1BEDA 5L71A 1XW9A 3RPNA 1W4VA 3FZ5A 1TRVA 1JZOA 1EV4A 1SJIA 3C73A 4F0BA 4KCAA 4X0XA 1TI3A 3L9VA 3U5RE 3QOUA 2YNXA 2HT9A 2TRCP 1WP0A 4N0ZA 3QCPA 3CSIA 4MK3A 3VWVA 4V1Ap 1ZGNA 3H93A 1T4ZA 4HS1A 2H1GA 1GSSA 3KD0A 5F0GA 4DEJA 3UL3A 2VLTA 19GSA 1EGOA 2NTOA 1S3AA 2H75A 2BTOT 1UC7A 1FVKA 1GUMA 1A8YA 3KH7A 4JR6A 1PX7A 1QGVA 3EWLA 4O5RA 3A2VA 4YQMA 1OKTA 2IFQB 5CRDA 4EO3A 1MDKA 4OD7A 1TKDB 3IC4A 4O32A 3H1NA 3FR3A 3F0IA 3DEXA 2F8AA 3M1GA 4V1Ag 5B6MA 1XZOA 4O7HA 4E8HA 5IPGA 5IPHA 4F0CA 1ML6A 2DC5A 4K9ZA 1SJZA 2XPDA 5B6NA 2IL3A 4GSTA 20GSA 2HZEB 5J3RA 2MZCA 4GWRA 2P0GA 1VF2A 1XXUA 1U6TA 4KDUA 1Q4JA 3D21A 2HZFA 5CREA 3VPQA 1WMJA 5FWGA 1USBA 3RHCA 1PX6A 2VCXA 5JCUA 4IW9A 1K0NA 2RIIA 2IMDA 3VWXA 3LGCA 2F9SA 1T1VA 4ZXGA 2H66A 3D6IA 3CRTA 2YOIA 1NSWA 2M46A 1XCCA 2CX3A 1XWKA 2GT6A 1A2LA 4XS6A 2O7KA 3KP9A 2GSSA 2VCZA 2CAQA 4XIHA 4BPYA 3GKKA 3GUSA 2CZ3A 3O76A 3DMLA 4ZILA 2H1AA 4HJ2A 3IHQA 2ON5A 3GYKA 1YKCA 1ACVA 2VL2C 5HR1A 1LBKA 2RM5A 4TR1B 4KNDA 2GZYA 2B1LA 2NPBA 1YEXA 3APOA 2XC2A 4KW6A 2LRNA 1JZRA 3TRPA 1ZOFA 1JHBA 1M2DA 2DLXA 5LCZA 3ME8A 2GQKA 4G9HA 2O8VB 1DE1A 3QPMA 4L5LA 4K1FA 3H8QA 3GN3A 2EC4A 2B6MA 2H30A 5JCWA 4I8BA 4IGJA 3IK9A 5EVOA 4LMWA 5JWOB 2R4VA 1URMA 3WT1A 1XOAA 4WBRD 2KP2A 3TUEA 4MZBA 1PSQA 2VAFA 5ENUA 1Z6MA 1M99A 4QL9A 1SK1A 2ALBA 1G6WA 2WJUA 3Q74A 2HZEA 2I1UA 1AQXA 5DALB 3PGTA 3CMIA 4ZL8A 2O85A 3HY2A 3QD9A 3EU3A 4KE3A 1QQ2A 3J7Yk 3WGDA 6GSVA 1XWAA 4BWQA 3LYKA 2DSAA 1YJ6A 4AJ7A 2VD1A 2JZSA 1GUKA 2LUSA 2C8UA 6GSXA 5D9VA 2VCWA 3P2AA 4MLYA 1GTUA 2IMFA 1PQNA 3KIJA 2X99A 2P5QA 3GURA 5F07A 2YZUA 3W6GA 1X5EA 2VO4A 4CHSA 3QAGA 5IMAA 1GLQA 2A2SA 2CVDA 3A5WA 1YZXA 3VK9A 3I69A 5KN1A 1VRSD 1E6BA 1XPVA 4EUYA 2VM1A 3F4RA 3HYPA 1THXA 3CBUA 2YZHA 3ZTLA 3A2WA 2DJ2A 3C1SA 4KDXA 5D8IA 4WF5A 1PMTA 2XBIA 3KH9A 3HVSA 3UVTA 1K3YA 1F3AA 2AUVA 1DUGA 5DAKA 2KHPA 1JFUA 3UMAA 4EVMA 3GL5A 2YJHA 2L6DA 2R6KA 3G7JA 4K8MA 3CTFA 5CYYA 1XFLA 3U6VA 3D22A 2N5AA 4PX1A 2DBCA 1HD2A 3ZRDA 4ACSA 2VLVA 1SL0B 3UJ1A 3CXGA 3MWHA 4OO5A 4PURA 5GSTA 4TXVA 5ECRB 4RQXA 1UVZA 3KEBA 4ECBA 4POLA 1TK8B 3DRNA 4K7OA 1Z6NA 1PN9A 2DJ1A 1OC3A 4MP4A 2L59A 1W89A 1BG5A 3O6TA 3MSZA 4KX4A 1T00A 5H5SA 4KB3A 2C0FA 4TKYA 3QMXA 5IIZA 5KN2A 1FB0A 3EYTA 5CRGA 1VF4A 2VCTA 4K6XA 3KP8A 1A8LA 2LRTA 2PN8A 3TGZA 1SENA 1GSEA 1CQHA 4BVXA 2C0DA 4X43A 2KP1A 5ECPB 2YANA 4TN8A 2HRNA 2PERA 3QAVA 4PQ1A 2AB6A 5HR3A 1GULA 3ZMKA 1WPIA 1FO5A 4JZQA 5IMCA 5HR0A 6GSSA 2A4VA 3ZL5A 3FKFA 5LD0A 4IQAA 3E3EA 1ERUA 4ECCA 1O73A 3HVXA 2GZZA 2G0FA 1R7HA 2ES7A 1ILOA 2H76A 4ECIA 3DGQA 5HR2A 1ZL9A 3OR5A 1OVNA 5LNKe 3VI7A 4WKWA 1QFNA 1PRXA 1A0RP 3ZVJA 3GKMA 5ECIB 2EIOA 1J08A 2HSHA 2B5YA 5H5QA 2V1MA 11GSA 3IXRA 2IJYA 1Y25A 3PINA 4LA1A 5F05A 4V2LA 2XPEA 3IRAA 1GRXA 3J7Yb 3M9KA 4F2IA 4D73A 3EMPA 4LL1B 5IM9A 3ZYWA 4Q5FA 2VIMA 4BVYA 1EV9A 2FA4A 3DYRA 2H8LA 5D93A 1GP1A 4PUFC 3FR6A 1U3IA 2QC7A 2TIRA 3KXOA 3TJGA 5ELAA 2PGTA 4IP6A 1TK5B 1A2JA 5D9XA 1YY7A 2XHFA 1RK4A 3ERGA 1B4QA 2WULA 2OBKA 3A2XA 3LSZA 2GSQA 3EC3A 2B3SA 4Q5QA 2H73A 4WR5A 2YPMA 3WGEA 1KNGA 2X8GA 2X8CA 4KUNA 2KOKA 3KGKA 1RQMA 4MPGA 3UEMA 2WS2A 3FZ9A 4LMVA 5ECMB 1X5CA 4K0GA 4DSQA 2CVBA 2C1YA 2IMEA 3E9JB 1YEPA 1DBYA 2GQLA 3WGXA 1XW6A 6GSYA 2N5FA 2CX4A 2FGXA 2L5OA 1PKZA 2V41A 3C1RA 3F3QA 5JCGA 2LSTA 4JBBA 1A2MA 3TKRA 2GT5A 2IIYA 2LTKA 1XIYA 2FWFA 2C0EA 5G5FA 2HRFA 2A2RA 4FYUA 1S3CA 3M3MA 2WFCA 2RUFA 3I6AA 3FR9A 1V58A 1TP9A 3FZ4A 4XS1A 1N2AA 4YAPA 1I9DA 3TCOA 2AAWA 2GDRA 3ZVJD 2VCVA 5AIVA 4V2NA 2H6YA 10GSA 2DJ0A 3GKXA 3VPTA 2HYXA 2H70A 2DIZA 3CTGA 3ZFBA 2M72A 3IOSA 1YQ1A 2JSZA 4NPBA 3UVHA 1WRYA 1UA5A 4F82A 2K18A 4BL7A 5DQSA 4TVEA 1SK0A 1PL1A 2PMTA 3L78A 2MMNA 2FCHA 4JR4A 4F03A 4ULXA 2X8HA 4HQZA 1Z5YE 3UOMA 1VF1A 3KZQA 4Q5RA 5DDLA 1E2YA 2X64A 3RPPA 2OA7A 1ERVA 2H19A 3LG6A 2MMZA 2P31A 1KEBA 3FHKA 3O3TA 4WR4A 2FHEA 2R3XA 4OWYA 1DSBA 5ECQB 2O87A 3ERWA 2NBSA 2QGVA 3N9JA 1TU8A 2FLSA 1QMVA 5CAXA 5GZZB 2FWGA 4Q5NA 3M0FA 2HLSA 4HI7A 2ON7A 3TKSC 4AJ6A 1VGLA 2VL2A 3FW2A 4YQVA 5DBQA 4ZIJA 4F9ZA 4PQHA 4GF0A 4KSMA 5G30A 3APQA 5DAKB 5KN0A 2PVOC 1TTZA 1ZYQB 2WRTA 1X5DA 2PU9C 5E59A 1VF3A 4WEYA 1H75A 2DJJA 4HU9A 1K3LA 2CZ2A 3M8NA 1GSFA 1SL1B 3TKSA 3NZNA 2H1DA 4OMVA 3LEFA 1XWGA 4OO4A 3I9V2 4HJMA 5F06A 3KJYA 4IJIA 2JU5A 1EZKA 3KMNA 1GL8A 4WETA 3VLNA 1G6YA 3Q6OA 4IJ3A 1MDJA 1FVJA 3GIXA 3KTLA 4GTUA 2JSYA 3CYNA 4ZB9A 1XW5A 4HUAA 3GTUB 2I81A 3HA9A 3L0HA 1TU7A 5FHIA 1M9BA 1AQVA 3IE3A 3TB2A 1GLPA 2I3YA 4TR4A 5DCGA 3F6DA 17GSA 1M2AA 1EOHA 2YWOA 4KDYA 1FHEA 1SKSB 1JLVA 4MDCA 2MYGA 5G31A 1HNCA 4H86A 4KA0A 4PGTA 3K8NA 2O89A 3PH9A 3KCMA 1V40A 3HCZA 3VWWA 5J9BA 3BJ5A 3C71A 2V6OA 2F51A 4L8EA 5C04A 4IP1A 3ZLPA 2IN3A 4MF7A 2FUG2 3HZ8A 3TRQA 4TW5A 2B1KA 2I4AA 1BAYA 2C3NA 2HSYA 4FIWA 1O8WA 3UBKA 1GSUA 1PKWA 1HYUA 3HXSA 3VFIA 3KTBA 3BCKA 2MBTA 5A5KA 1B9XC 3QFBC 1V2AA 3D4TA 1SL2B 2V6KA 5D96A 5IMFA 2JADA 4OCEA 4POMA 3MAKA 1JLWA 2B5XA 1X9MB 3GX8A 3LXZA 3KMOA 4EL1A 1C72A 2E2MA 2DJ3A 4GCIA 1PA3A 1ABAA 1QXHA 1ST9A 3G7YA 3HJOA 2RM6A 2I9HA 2VL9A 3F3RA 2CT6A 2PBJA 3IAS2 3TJKA 1GTBA 3F8UA 5GSSA 4MJBA 1Z7PA 4K0NA 3HHVA 4XCSA 2FY6A 4ZL7A 2RUEA 2H6ZA 4BA7A 2ZUPA 2R37A 3I43A 2L4QA 3LQ7A 1U88A 2YV9A 1SJ6A 1GSQA 4EDYA 4TXOB 5CP1A 5INYA 2VM2A 5A4UA 2E7PA 1T7PB 1RW1A 3D0ZA 4ZB8A 4D73B 5DVBA 4N30A 4RI6A 2GLRA 1TRSA 2PUKC 3IV4A 4Z7XA 3HJMA 4V2MA 3GTUA 1XBSA 1K3OA 4ZL9A 4J57E 4JRRA 4K7NA 4XS4B 2LNTA 2TRXA 3JCML 2P5RA 1GNEA 1GUHA 1GTIA 3Q19A 2VLUA 1V98A 1T3BA 5KEJA 3IDVA 3TKQA 1EP7A 2C4JA 4KSOA 2OBIA 2F8FA 2GQMA 2CV4A 4WBJA 3DIEA 4LL4B 4KAEA 4KH7A 2OJLA 3CSJA 3ZIJA 1HNBA 2K8SA 3TJBA 5IO2A 1SU9A 4RUVA 3GSTA 5HQPA 1YDKA 1NW2A 1V9WA 3FYGA 5DCHA 2OACA 3ED3A 1WOUA 3ERFA 1IYIA 4MCUA 1FAAA 2AV4A 5DJLA 1BYEA 2MBSA 4MZWA 4YH2A 4DSRA 4MJCA 4OCFA 1A23A 2LQOA 4MF6A 3F4SA 4JU5A 4E8EA 2Z9SA 3HKRA 3HVVA 3VWUA 5AN1A 1F37A 1H4OA 1OE7A 1TOFA 1T4YA 1TI1A 16GSA 3QDNA 2OE1A 4XTSA 2H6XA 4ML6A 4OFTA 1JZWA 3GH6A 2YWIA 6GSTA 1XOBA 3WD6A 5ECKB 2AJQB 2M80A 5D9TA 1OC9B 1SKWB 2GSTA 5G1KA 2PWJA 4NHWA 1M0UA 2C3TA 1V57A 2C3QA 2OKAA 1J0FA 4I2UA 2HE3A 3TOTA 2QKEA 1EEMA 4IQ1A 5G5EA 3BBYA 1TRWA 5ECOB 4EKZA 4IS0A 4IKHA 4TXOA 4TR0A 1B9YC 3QFAC 2K8VA 3IPZA 4FO5A 2YJ7A 2JACA 3GRXA 1Z9HA 4GQCA 4X1UA 2BMXA 4CDOA 2RLIA 1TJDA 3G7IA 2OE0A 4GSNA 4EXJA 2OE3A 4XS4A 1LJRA 2JZRA 2H0HA 5AIXA 2LJKA 3ISOA 1O7UA 2XBQA 1QUWA 3IBHA 5IMZA 1SYXA 1A0FA 3L4NA 3MDKA 1A24A 1UN2A 1AW9A 4FYCA 1PGTA 1EOGA 5G2ZA 1K0MA 1XWBA 4HDEA 3DXBA 5EPFA 4G10A 2YWMA 5CNWA 1AAZA 2DMLA 2K6VA 4EDZA 3EINA 1CQGA 3L9UA 1ERTA 4CW9A 14GSA 3F9UA 5KN3A 4AJ8A 1K0DA 1YKAA 5IMVA 2L6CA 4JEDA 3D5JA 6GSWA 4OFMA 5ECNB 5CO3A 4HZ4A 3LJRA 3UIWA 5J9CA 2E0QA 3BD2A 5JWQB 2HNLA 4NV5A 3ZREA 1K0BA 4POKA 4AF2A 4I5QA 1FG4A 3FK8A 1O81A 1OC9A 5CRHA 4WF4A 2LV3A 7GSSA 2V2GA 3UARA 5J41A 2V32A 3P8WA 1JZDA 1SK2A 3IR4A 2VL3A 3KM6A 4PQIA 2JL4A 3VI5A 5AISA 4ILFA 4RQRA 4ISDA 1F2EA 2NDOA 5ECLB 3GFKA 4NHZA 4ML1A 3H79A 1MEKA 1HQOA 4NAXA 3LWAA 1U3AA 1O85A 1R5PA 3V1WA 1K0AA 2KUCA 4MH2A 1AQWA 3TJJA 1BQ7A 5J4UA 1G0TA 1K0CA 2FWEA 3GHAA 3QR6A 3TRXA 1O6JA 3TOUA 5DQYA 8GSSA 1N8JA 3TDGA 4G2EA 2H01A 2D2ZA 3W8JA 2HXKA 1F9MA 4GQFA 4WXTA 3ZITA 2GVPA 1YF0A 2YV7A 2MMAA 3UAPA 4KGIA 1ZCPA 4PNFA 1MDIA 1SD8A 2GZPA 1R5AA 2L4CA 3RBTA 5JWRB 4GLTA 5ELGA 2FNOA 3ZZXA 2H1BA 3W8SA 1DE2A 2F3MA 1S3DA 5ABRA 5GAPD 1EP8A 3BOAA 2FA8A 2FD3A 4N11A 1BJXA 5CRWA 4FH8A 5ECSA 9GSSA 4ID0A 5EL8A 3HDCA 1B8XA 1GNWA 4MZCA 2B7KA 4P3YB 1GSDA 4QL7A 1AC1A 4DSSB 3F6FA 3LFLA 2LJAA 1FB6A 3RAZA 1AUCA 3FRCA 4IELA 4XRAA 4HZ2A 3TKPA 3TKSE 1GH2A 2VD0A 4PUAA 1GTAA 5AGYA 5C00A 1ON4A 4IHUA 1NM3A 1ZZYA 4NMUA 5IMDA 4EC0A 1SKRB 1MD4A 1OYJA 1MD3A 4YAVA 3WYWA 1Z7RA 3SBCA 4HEA2 3NOFA 2IFQA 3GX0A 2NVLA 4BWSA 3RDWA 3GMFA 2CQ9A 5A4VA 1IYHA 1YF1A 4MF5A 4O92A 1WWJA 1XVWA 2J23A 3S9FA 3LORA 2IMIA 5ECHB 2PVQA 2LJRA 1FW1A 4OFNA 3EE2A 4L0WA 3IK7A 3QAWA 3Q18A 3GL3A 1THOA 2DIYA 3IAM2 2J9HA 1NHYA 1ERWA 3ZFLA 2DMMA 2FWHA 1T8EB 2IPAA 2WCIA 2H71A 1WIKA 4TRXA 1TXXA 3ZIVA 4RI7A 2EIQA 5IOWA 3C8EA 4N10A 4HQSA 1XVQA 3G9BA 5D9WA 4I2TA 3WT2A 2L5LA 1EWXA 3AY8A 3GNJA 5H5RA 2WGRA 2B5EA 4EF0A 2CVKA 1I5GA 3ZMLA 1ZYEA 4NXIA 1U87A 3APSA 4MABA 3P90A 2YN1A 4J56E 4HU7A 1LU4A 3HZ4A 3HJPA 2H0GA 2R5GA 1OE8A 3EURA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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