2GZYA

Solution structures of the reduced form of thioredoxin from bacillus subtilis
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
104
structure length
104
Chain Sequence
MAIVKATDQSFSAETSEGVVLADFWAPWCGPCKMIAPVLEELDQEMGDKLKIVKIDVDENQETAGKYGVMSIPTLLVLKDGEVVETSVGFKPKEALQELVNKHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conformational fluctuations coupled to the thiol-disulfide transfer between thioredoxin and arsenate reductase in Bacillus subtilis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Bacillus subtilis
total genus 35
structure length 104
sequence length 104
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-05-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2gzyA00
4MZBA 1K0OA 4JR4A 4I2TA 4RI6A 3CYNA 5CYYA 2X8GA 4XTSA 4K8MA 2CAIA 1OKDA 1AW9A 2DBCA 2NDOA 4AJ7A 3HVVA 3GRXA 4IS0A 4ILFA 5IM9A 1ML6A 1VF2A 1SYRA 3IPZA 1BAYA 1C72A 3H93A 3VPTA 4L8EA 4TXOA 1UC7A 2MMOA 2J23A 2CZ3A 4KW6A 3H4KA 1M99A 1GSQA 4N30A 3S9FA 2V1MA 1SL0B 3EMPA 3F8UA 2H1GA 1TRWA 3VK9A 2VLVA 2LJKA 1SJ6A 2DSAA 4DVCA 3EWLA 4POKA 1O73A 1GTBA 2CV4A 1EZKA 1GUMA 3R2QA 1XW6A 3QD9A 3QMXA 1U6TA 3RDWA 1E2YA 1ZMAA 3TRXA 1EGRA 5GZZB 3FW2A 3C71A 1EEJA 5DQSA 3F4RA 1Y6EA 2H76A 5D96A 1JZRA 2VD1A 3LWAA 4GSSA 3RPPA 2C0EA 2YWMA 1N8JA 1PD21 3HHVA 3Q18A 1GNEA 4KX4A 2GQKA 2R37A 5FT3A 5AIVA 1V9WA 3WGXA 1H4OA 2LEGA 3A3TA 1O8WA 3C1RA 1YJ6A 2VM1A 4MLYA 4WR4A 4FIWA 3GKMA 2VCTA 3F6FA 2FWEA 2F3MA 5E59A 1TU8A 3GL3A 2D2ZA 2IFQA 2X99A 2XHFA 4JEDA 2FGXA 2PN8A 5ECPB 1QMVA 4MF6A 3RBTA 2R2JA 2ZUPA 5E4WA 4WEYA 3DVWA 1UN2A 3U6VA 1J0FA 4K2DA 5CO3A 1YEXA 2R4VA 2KUCA 3EC3A 2WJUA 5CREA 4IKHA 2AB6A 3P8WA 2WZ9A 1MDIA 4WR5A 1TU7A 1ACVA 3JCML 3F9UA 2NVLA 2YZUA 1VF3A 3TRPA 1SL2B 2L57A 4NV2A 4O5RA 1GTIA 3KP9A 3GUSA 1NM3A 2VL2C 2PUKC 3TOTA 2H73A 3BBYA 3IAS2 2B7JA 5EVOA 2WB9A 2H19A 3A2WA 1SL1B 1FHEA 5DAKA 2DMLA 1THOA 1WE0A 1XFLA 2C0FA 2VCZA 2HE3A 2FHEA 4KDUA 3GFKA 1NW2A 3D0ZA 4V1Ag 2FY6A 5GAND 1O81A 2L6CA 3J7Yb 3QPMA 4PURA 3WGDA 4EUYA 4GF0A 1X9MB 3IE3A 3GA4A 2KP2A 3O76A 1SKRB 1TKDB 1AC1A 4X0XA 3HY2A 3GKNA 3P7XA 4GXZA 4EKZA 1TDIA 4IBPA 1CQHA 4XS4A 5ECKB 1XOAA 3ERWA 4D73A 1ABAA 1Q4JA 2QKEA 2IMDA 3M8NA 3LGCA 2XC2A 1EV9A 1Y25A 4IVFA 2H74A 4IQ1A 5ECRB 4X43A 3KZQA 5EPFA 1AIUA 5IMCA 1TXXA 4FH8A 1IYHA 3GTUA 2LQQA 3G7IA 4F03A 4N0VA 2B1KA 4FYBA 4KSMA 1AQVA 2GZYA 2HRFA 1JZWA 1GULA 3MNGA 2HI7A 2XPEA 4ZL8A 2RLIA 4NHWA 3TJJA 4TW5A 1KEBA 5J3RA 4ID0A 1XW5A 3F3QA 2QC7A 2HSYA 3E0UA 1A24A 3F63A 2YP6A 1XPVA 3HJMA 2GVPA 2H1DA 3O6TA 1T7PB 2GZZA 1W89A 4FO5A 3UL3A 4PX1A 1IYIA 2MMNA 2YCDA 2LKUA 5G2ZA 2F9SA 1PX7A 3MSZA 5D93A 2R6KA 3W8JA 3LSZA 1AXDA 3C8EA 5CNWA 3TRQA 1PMTA 4XRAA 4PNGA 1WWJA 1R26A 1TJDA 1YF1A 4RUVA 3N5OA 3C7MA 3VWXA 2H6ZA 2VCQA 5JWOB 4POLA 4KE3A 3CRTA 2HZEA 2TRXA 4KCEA 2KOKA 5DALB 3VLNA 3CRUA 4DEJA 1XXUA 3KMNA 1J08A 4OCFA 1AUCA 3RAZA 3FYGA 3HCZA 1GWCA 3KH9A 3UOMA 5IMDA 3QDNA 4OFTA 3D6IA 4GSNA 1A2LA 1ZYQB 4KH7A 2IMFA 3KXOA 4OO5A 3EE2A 4LA1A 2YWNA 1K0DA 8GSSA 5ELAA 2AJQB 1GSFA 4PUAA 2FA4A 3GYKA 3KEBA 2HSHA 4CDOA 3ZFLA 4KNDA 2LRNA 3GH9A 4TVEA 3RHCA 2HXKA 1K0NA 2O85A 6GSTA 2IJYA 2RUEA 3ZYWA 1V40A 2DJ0A 3LJRA 1HNAA 4PQHA 16GSA 5JCWA 2FNOA 2HZFA 2PBJA 4LLRA 2GSRA 3GSTA 3EINA 4HQZA 1Z6MA 4TR1B 2VUPA 3HKRA 4HOJA 3GMFA 2NTOA 5B8AA 4MK3A 3IR4A 3TUEA 1R5AA 2ZCTA 2VOCA 4KCAA 1WIKA 2B5YA 5GSTA 2VLUA 2R5GA 4LMVA 3TOUA 13GSA 1UVZA 2H0IA 2V2GA 2C0GA 4OO4A 3ERFA 1YQ1A 3FY7A 1BQ7A 1T8EB 1XIYA 2MMAA 5ELGA 1GUHA 1PN9A 4BL7A 4KGIA 5G1LA 6GSXA 5ECHB 2H6XA 3E3EA 3P2AA 3D22A 3M0FA 2I4AA 2YWIA 2LNSA 2FWGA 1WP0A 4POMA 2EIOA 4QQ7A 3MAKA 4GQFA 3CBUA 1XWCA 2ALBA 3BCKA 1FB0A 2LRTA 5L71A 4MP4A 1DE1A 3TKQA 2B5XA 3EYTA 2FLSA 3UAPA 1JLWA 3TGZA 2GT6A 3ED3A 2H8LA 4V1Ap 2C0DA 1ZL9A 5ECMB 3UMAA 4HZ4A 5IOWA 2WGRA 2VO4A 4OFMA 2JSZA 4HEA2 4ZBDA 3GX8A 3EURA 1K0MA 3Q6OA 4J56E 2CX4A 3WT2A 4N0ZA 2F8AA 1ILOA 5HR2A 4MJEA 4OMVA 2CVBA 2FWFA 4ZBAA 1X5EA 1HYUA 4Q5QA 1TTZA 2EIRA 2FCHA 2N5FA 5IPHA 1KBNA 1V58A 3D21A 1Z3EA 1J9BA 4XCSA 2E0QA 3ZFBA 4HI7A 2GGTA 1GP1A 2FD3A 2CAQA 4MZCA 2PPTA 4I97A 4DSQA 3CSJA 4MF5A 5KN1A 1BEDA 5FHIA 4NXIA 2K9FA 3UIWA 1EP7A 1GUKA 3RPNA 4PXOA 5D9VA 3LXZA 3IK9A 5D9XA 1VF4A 2VLTA 2HLSA 4MMMA 1R7HA 1F37A 2WDUA 2N5BA 4PUFC 2P31A 2HRNA 3L0HA 1T4ZA 2OBIA 1V2AA 5CRWA 4F2IA 2H70A 3M9JA 14GSA 3BOAA 2O89A 1RQMA 1EEMA 2DJ3A 9GSSA 2H0HA 2I1UA 4TRXA 4EDYA 1HD2A 18GSA 5G1KA 3UBKA 1GLQA 2IMIA 4ZB9A 6GSYA 1M0UA 3DKSA 4IGJA 1TI3A 4L5OA 2BMXA 2L59A 2CA8A 1URMA 3DVXA 1V98A 4QL9A 1BX9A 5D9TA 1OYJA 3FK8A 2X8CA 3HYPA 1M9BA 1RW1A 1SK0A 4ZB6A 2HYXA 4HU7A 2JADA 3IA1A 5H5QA 5JCUA 5D9WA 3IHQA 1FW1A 2O7KA 3HD5A 2E7PA 5JWQB 2P0GA 4GCIA 4FYUA 1G0TA 4JZQA 5IMAA 6GSSA 1XBSA 1E6BA 3FHKA 2VL9A 1G6YA 1VGLA 2VIMA 4RI7A 3WD6A 1XCCA 1S3DA 11GSA 1T00A 1FB6A 4K0GA 1OC8A 4IJ3A 1O8XA 1QQ2A 3V1WA 2OKAA 4KA0A 5IO2A 1Q98A 4AF2A 4F9ZA 5G5EA 2CVDA 4G19A 2V6OA 4G2EA 3PINA 1NHOA 4ML1A 4MJCA 1X5DA 3I43A 3IRAA 2KP1A 4JE1A 2ON5A 4NAXA 1PQNA 1VRSD 2AV4A 2NBSA 4MJAA 4HJ2A 3TJKA 4V2NA 3BD2A 4WKWA 1SK1A 3HDCA 1OC9A 3DWVA 3TDGA 3FEUA 1ON4A 2MBSA 2OACA 1PX6A 4LMWA 1PA3A 3TKSA 5ID2B 1HNCA 2H75A 2V32A 4NHZA 3ZLPA 4QL7A 1O7UA 5B6MA 3KTBA 2GQLA 5DVBA 1MD4A 2WS2A 4Z7XA 5DJMA 2DLXA 3GNJA 4K9ZA 4F82A 3MWHA 2LUSA 4HDEA 3LYKA 1A8LA 4GQCA 1ZOFA 3QOUA 1K0AA 2MBTA 5ECNB 3ZTLA 2RM6A 3US3A 4O92A 2A2SA 2IMEA 2ON7A 4AJ6A 1GSDA 2IWTA 2OA7A 4DSSA 2B1LA 1DSBA 4TXOB 3Q74A 3EU3A 3GKKA 5GAPD 5AN1A 1TRVA 2IN3A 4YAPA 4NMUA 1JHBA 3UARA 5C00A 4IP6A 2H71A 3L9SA 1K0BA 2B6MA 3KH7A 4IW9A 1YY7A 1A0RP 4MZWA 3GN3A 1M2DA 4ZBBA 1G7EA 2Z9SA 3I6AA 3LYPA 2REMA 4K7IA 4MCUA 2C80A 3I9V2 4AJ8A 2IMKA 2P5QA 3ZRDA 3KM6A 1A0FA 5HR3A 1B8XA 2PWJA 1B4PA 2M72A 5CRHA 2XPDA 3E9JB 3FR6A 4IELA 1AQWA 4E8HA 4EXJA 4XRDA 1GSYA 4HZ2A 1WJKA 2L4CA 4JRRA 1TI1A 3GV1A 4Q5RA 1EOGA 1F9MA 2P5RA 2L5OA 2MYGA 1SD9A 2GZPA 2K18A 2LQOA 3ZVJD 1FOVA 1PSQA 2O8VB 4X1UA 3O3TA 3VFIA 2IFQB 4KAEA 1TP9A 1S3AA 4NV5A 1JZDA 3DGQA 2B5EA 4Q5NA 5ECLB 3LEFA 1VF1A 3IAM2 1ERUA 3VI5A 1HNBA 1CQGA 7GSSA 5F8BA 3QFAC 4ZB8A 3FZ5A 4EDZA 5A4WA 2IPAA 5IO0A 20GSA 4G10A 5C04A 5DJLA 3GSSA 3J7Yk 4F0BA 2AAWA 1JLVA 3C73A 1LU4A 1A2JA 5AISA 3DIEA 4WF4A 3U5RE 2M46A 3ZITA 1BYEA 4IP1A 5B7CA 5LNKe 3F3RA 1QFNA 2YJ7A 3QR6A 2J9HA 3HVXA 4MJBA 3F4SA 3HZ4A 4YQVA 2GQMA 5LD0A 2H6YA 2L5LA 2A4VA 3UVTA 3TJFA 3H8QA 4HUAA 2BJXA 5IPGA 1NSWA 4J2FA 3DD3A 3FKFA 2DJ2A 1Z7RA 4K7OA 5DAKB 5EY6A 3EU4A 4KDYA 5F05A 4BWQA 5ENUA 1B4QA 5F06A 2YOIA 1ZYEA 4G9HA 3TKSC 5COHA 1MD3A 3QAWA 3DXBA 1T1VA 4K7NA 4ECJA 5ECOB 1R5PA 3ZMKA 1FVKA 5G31A 1WRYA 2MMZA 4DSRA 4ISDA 22GSA 3IXRA 3ZVJA 1K0CA 5HFIA 1K3LA 2GLRA 2DJ1A 1Z7PA 1EOHA 4ECIA 1N2AA 4XS4B 2CQ9A 2YJHA 2HFDA 3ISOA 4HS1A 4L5LA 2C3NA 3CSHA 2RM5A 4GSTA 1OC3A 2YZHA 2VCWA 1DE2A 2IIYA 1MDKA 1A23A 3GTUB 1MTCA 4MF7A 4EVMA 4P3YB 4ZILA 2N5AA 2X64A 4XIHA 4IN0A 4V2LA 5A4VA 3A2VA 3GH6A 2LV3A 2I9HA 5IMFA 2YV9A 2K6VA 4BVXA 4L0UA 3EMXA 5HFKA 3I69A 5KEJA 4ZIJA 4GWRA 3L4NA 3CTGA 5KN0A 2C3QA 4MH2A 4WBRD 5J41A 1U87A 4NPBA 2FA8A 1WOUA 2OE1A 2LSTA 3W6GA 3GURA 4WF5A 5CAXA 2QGVA 4WETA 1NHYA 4V2MA 3CXGA 1W4VA 3K8NA 2G0FA 1X5CA 5LCZA 4TR3A 1G6WA 5FWGA 3FZAA 5JWRB 4N10A 4JBBA 2E2GA 2B7KA 5F0GA 2PMTA 2TIRA 2WCIA 5G5FA 3ZIJA 3PGTA 1XOBA 5ID2A 3LG6A 4TR4A 2VM2A 1M2BA 1F2EA 1YEPA 2DJKA 4TXVA 1T4YA 4K0NA 4OWYA 1ERTA 1RK4A 2HZEB 1TRUA 2VAFA 1MEKA 4RQXA 3UEMA 2H1BA 3ZL5A 3LORA 1OE7A 1SD8A 1QUWA 5B6NA 3FR9A 3KD0A 3HZ8A 3D5JA 2ZNMA 4IQAA 2JZTA 1FAAA 2OBKA 3M9KA 2ES7A 5DCHA 3N9JA 3KMOA 1ST9A 2YN1A 4TKYA 1JZOA 3VURA 4MPFA 1SKWB 1GSSA 4YQUA 1XWAA 2GSSA 4PQ1A 3KJYA 4O32A 4OFNA 5D73A 5JCGA 1U3AA 1FG4A 2EC4A 4GLTA 1GNWA 2C8UA 2H30A 2LJRA 1QK8A 1I5GA 1GSUA 3APQA 4FYCA 5IMZA 2CZ2A 1PRXA 3NOFA 4HU9A 3TJGA 5IIZA 3KIJA 1OE8A 5HR0A 1ERWA 4K1FA 3IOSA 4OD7A 4N11A 6GSWA 1ZGNA 4LL1B 1F3AA 3D4TA 2H72A 3QAVA 1TW9A 1YZXA 2DJJA 1R4WA 4CW9A 2F51A 4HQSA 3TB2A 4RQRA 3LXTA 4JU5A 2CT6A 2OADA 3GX0A 5DALA 1GSEA 1AQXA 1THXA 1YKAA 2BTOT 3LFLA 3PH9A 1U3IA 2G2QA 5ECIB 4I2UA 2K8SA 1A2MA 1GTAA 3KCMA 17GSA 1DBYA 3QAGA 3DRNA 4TR0A 3VWUA 3F6DA 1ZZYA 4PNFA 6GSVA 2HT9A 1MDJA 1FO5A 3G7JA 4IHUA 4EL1A 4Q5FA 4ULXA 1XWGA 1GTUA 1XZOA 3HJPA 2KLXA 2B3SA 4ECCA 2AUVA 2O87A 4CHSA 1XWBA 2JACA 3ERGA 6GSUA 3GKXA 2FUG2 3QCPA 2LJAA 2YPMA 3VPQA 10GSA 3OR5A 2PERA 3NZNA 1TOFA 5J9BA 1WPIA 2NPBA 3TKSE 2XBIA 3RHBA 3BCIA 2LNTA 1X9WB 4YAVA 3L78A 4GRFA 4OCEA 1OKTA 3IK7A 3H79A 1SU9A 1K3YA 4YH2A 2PGTA 3FRCA 3TKRA 4TR1A 5AIXA 5HR1A 3UBLA 2JZSA 4J57E 4K6XA 4AGSA 2GT5A 2VL3A 1M7TA 3APOA 4TN8A 2DIZA 1LBKA 1LJRA 19GSA 2WULA 3HA9A 1QGVA 4ML6A 2RUFA 1XW9A 1O6JA 2FWHA 4PGTA 5KN2A 2C1YA 1PL2A 2RIIA 3A5WA 3GL5A 4BPYA 3HXSA 5A5KA 3L9VA 1GL8A 2TRCP 3F0IA 3CTFA 4WBJA 4H86A 1YDKA 2PU9C 4KB3A 3ZREA 3KGKA 1B9XC 3C1SA 2I81A 1EGOA 3ZMLA 2PVQA 4F0CA 1SJZA 3SWLA 3PR8A 1XVWA 1KNGA 4ZL7A 2OE3A 3VWWA 2QSIA 3VWVA 4IJIA 3D4MA 1HQOA 1X0RA 4E8EA 3F4TA 4ECBA 4HJMA 3GIXA 1SKSB 5IQYA 1K3OA 1OVNA 3DYRA 2VCVA 5GSSA 3CSIA 1EWXA 2R3XA 1BJXA 1H75A 1M9AA 4KSOA 1GRXA 2H01A 2F8FA 4XS1A 3ME7A 1USBA 5J5NA 1AAZA 2KHPA 2H0GA 3M3MA 3W8SA 1B48A 4L0WA 4ACSA 2E2MA 1FVJA 4EF0A 5DBQA 5CRGA 2GS3A 1OAZA 3M1GA 3HVSA 3Q19A 2CX3A 2OE0A 2DC5A 3HJOA 5H5SA 4I8BA 3UVHA 3QFBC 1TK5B 2YWOA 2HNLA 2YANA 2GSQA 5ECQB 4LL4B 3G9BA 5EL8A 4O7HA 1XWKA 2A2RA 4POBA 3FZ9A 1SK2A 1Z6NA 1U88A 3SBCA 2DMMA 4XS6A 2V41A 1EP8A 2GTUA 2VD0A 3L9UA 3DMLA 4EE0A 1YKCA 5DQYA 5ABRA 5B8BA 2H1AA 1A8YA 4MA9A 1ZCPA 5J9CA 4EO3A 5ECSA 1Z9HA 1DUGA 2DIYA 3DEXA 2YV7A 2JU5A 4I5QA 2V6KA 2GDRA 3P90A 2OJLA 1G7OA 5H5RA 5CP1A 2YNXA 1BG5A 1UA5A 3FR3A 4MH3A 1GH2A 2LTKA 1SENA 1B9YC 2AYTA 1OC9B 2M80A 2VCXA 5G30A 5HQPA 1SJIA 2CVKA 5IOXA 1PKWA 4BWSA 2EIQA 4PQIA 1F6MC 5D8IA 1PKZA 1TK0B 3ME8A 4ZL9A 3NIVA 3EVIA 4ZXGA 4BVYA 4MPGA 5CRDA 3APSA 2L6DA 3MDKA 1KTEA 2WFCA 3UJ1A 3BJ5A 2MZCA 1TK8B 1YF0A 2JSYA 5A4UA 3IBHA 5HFGA 1JFUA 3TJBA 1Z5YE 2LS5A 2H66A 4D73B 3TKPA 4JR6A 5J4UA 1TRSA 1V57A 1T3BA 4DSSB 2C3TA 3WT1A 3CMIA 3IV4A 2JZRA 1S3CA 4EC0A 2IL3A 2L4QA 4YQMA 2K8VA 5INYA 4TOPA 4BA7A 1QXHA 2X8HA 3KTLA 3IC4A 5DDLA 1I9DA 3A2XA 3TCOA 4KUNA 3AY8A 3VI7A 1O85A 5DCGA 1ERVA 2I3YA 2GSTA 1WMJA 2WRTA 4KDXA 3ZIVA 1X9SB 5KN3A 1PL1A 1PGTA 1M2AA 3H1NA 4XHMA 12GSA 3FZ4A 5AGYA 2PVOC 4MABA 4WXTA 1SYXA 3LQ7A 5F07A 2VL2A 3ZZXA 2AHEA 3WYWA 1F3BA 3WGEA 3GHAA 1EV4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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