2H30A

Crystal structure of the n-terminal domain of pilb from neisseria gonorrhoeae
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
151
structure length
151
Chain Sequence
ATVPHTMSTMKTADNRPASVYLKKDKPTLIKFWASWCPLCLSELGQAEKWAQDAKFSSANLITVASPGFLHEKKDGEFQKWYAGLNYPKLPVVTDNGGTIAQNLNISVYPSWALIGKDGDVQRIVKGSINEAQALALIRNPNADLGSLKHS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Thioredoxin Domain of Neisseria gonorrhoeae PilB Can Use Electrons from DsbD to Reduce Downstream Methionine Sulfoxide Reductases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB
molecule tags Oxidoreductase
source organism Neisseria gonorrhoeae
total genus 41
structure length 151
sequence length 151
ec nomenclature ec 1.8.4.11: Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase.
pdb deposition date 2006-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h30A00
1WWJA 3F8UA 1CQGA 4X0XA 3FHKA 4PQIA 2VLTA 1V98A 2RUFA 3G7YA 4ILFA 5CYYA 2R4VA 3BOAA 1USBA 1X9SB 4KCEA 2AV4A 4TXVA 1AQVA 3UEMA 2HXKA 5B6MA 2OADA 2MBSA 3L78A 4V2NA 2LUSA 1A2LA 2XHFA 3L9UA 2O85A 2H1DA 2C1YA 1OC8A 3LYPA 4ID0A 2B6MA 2FWGA 4PQHA 2YWIA 2I3YA 1JZDA 1O6JA 4OFNA 1XIYA 1A24A 1K0AA 4H86A 1PN9A 2L5OA 2FHEA 2WGRA 4K1FA 1UN2A 4ZL7A 1V9WA 4GSSA 4TW5A 1FB6A 5G2ZA 4WETA 4MZWA 1T1VA 1O7UA 3EMPA 3U6VA 1Z5YE 2LRTA 4LLRA 3ZVJD 1ERVA 4K9ZA 2H1GA 3FK8A 3IOSA 4TVEA 3WYWA 3HDCA 3P8WA 4MJAA 1YF1A 2ZUPA 2LJKA 1XVWA 5D9XA 2DBCA 5COHA 2DIZA 4TXOA 4L0WA 3F63A 5JCWA 2MMAA 2CAIA 1OVNA 1YZXA 2G0FA 4N0VA 1TJDA 5IIZA 3PH9A 4K0GA 2CVBA 1XVQA 1XOAA 2FUG2 4TXOB 4V2MA 2YWMA 4ZL8A 1HNCA 3TB2A 1S3CA 2FWEA 1T4ZA 3E9JB 3TOUA 1XW5A 5AIVA 3EU4A 2H70A 5ECPB 1F3AA 2C3TA 1G0TA 3H4KA 4E8HA 2HYXA 3QDNA 4ISDA 3FYGA 1OE7A 3A2WA 4TN8A 5E59A 4BVYA 3RDWA 3C71A 1O85A 1U87A 3IPZA 5G31A 5JWQB 2H0IA 3P7XA 1GSQA 1ABAA 3GN3A 2OBKA 2OACA 3O3TA 2H74A 4N11A 3F4TA 1EWXA 4L5OA 4BPYA 3VPQA 2VM1A 4KDYA 1F3BA 3GFKA 4ECCA 3QAVA 1VF1A 3LWAA 3TCOA 1WPIA 1JLWA 2R3XA 3CBUA 1K0MA 1WE0A 4IBPA 2DIYA 2E2GA 2HI7A 3EE2A 2YOIA 3IE3A 5A4UA 2N5AA 3EMXA 3IXRA 4K2DA 2D2ZA 1ZCPA 2P0GA 5ECNB 1U3IA 1EV9A 4EKZA 3TDGA 1GWCA 1J0FA 2M46A 2GGTA 4I2UA 3D5JA 5LCZA 3DEXA 1WOUA 3UVHA 2GT6A 4OCFA 2C8UA 3CRUA 3H93A 5J9BA 4KCAA 1Y6EA 3P2AA 1THOA 4MF6A 4AJ7A 4HJMA 2VL2A 2VCXA 2XPDA 2YJHA 5IMZA 3H79A 1HNAA 2PGTA 1MEKA 2VLVA 1U88A 2LV3A 1TK8B 2OE1A 2OE3A 2L6DA 2RIIA 2OKAA 4AJ6A 2M80A 2JZSA 4IELA 1TRUA 1GUKA 1HNBA 3KP9A 4EC0A 2KP2A 5C04A 3TGZA 2IMIA 4I2TA 5GZZB 5DQSA 4TR1A 5H5QA 3KD0A 1KTEA 4MF5A 4F82A 2V6KA 4K6XA 1WIKA 6GSVA 4IKHA 4MZCA 5CO3A 3UBLA 1X0RA 4JR6A 2I81A 5F0GA 3APQA 3C1RA 2REMA 1A0RP 1Z6NA 1YEXA 2H8LA 3L9SA 2B5YA 5IOWA 1ERWA 3CMIA 3WT2A 1E2YA 3VWVA 3ZMKA 3D4TA 1TK0B 4DVCA 5J41A 3HYPA 1JZRA 4O5RA 5A5KA 1SJZA 2WS2A 2NBSA 3KMOA 4EDYA 1PGTA 4CDOA 3QAWA 4OO4A 2OBIA 3GKNA 5ELAA 4HS1A 3GSTA 3KP8A 2WZ9A 2H01A 5DALB 1FW1A 1T3BA 2YJ7A 3ZYWA 2VAFA 5D9TA 2MBTA 4KX4A 3UL3A 4PNFA 4GXZA 1V58A 4ML1A 2CVDA 5EL8A 2L6CA 5HQPA 2IMDA 2GT5A 3A2VA 5INYA 1MDJA 1NHOA 2DMLA 4OFTA 2LEGA 2V32A 1V57A 2B5EA 1ERTA 1QMVA 2A2SA 1DUGA 2GSQA 5ECKB 2MMOA 2JU5A 2CX4A 2CVKA 3ZVJA 1SJIA 3NOFA 5H5SA 1A23A 4AGSA 3P90A 4AJ8A 2V2GA 4QL9A 4IGJA 2WFCA 4NV2A 3DKSA 1LJRA 1YY7A 4N0ZA 1ACVA 4AF2A 2LRCA 3H1NA 3UOMA 4DSSA 5DCGA 1F9MA 2YPMA 1JFUA 1GL8A 1BG5A 1HQOA 1MD4A 3RHBA 1T7PB 2KHPA 1TRSA 4PNGA 2VL2C 2B7KA 4DSSB 3O6TA 1HYUA 2H0GA 2L59A 2N5FA 3GSSA 3EURA 3HJMA 1Q4JA 2PBJA 3UJ1A 3ED3A 4FO5A 4HDEA 5LD0A 2CQ9A 3CTGA 2DJ0A 2V6OA 4V2LA 3HKRA 3TKRA 1Z3EA 4FH8A 2GDRA 3D22A 6GSSA 2ZNMA 4PQ1A 3TKSA 5CAXA 1A2MA 3GL3A 1K3LA 2VOCA 5DJLA 4K7OA 1YKCA 3CSHA 1YDKA 2VL9A 3LYKA 3GMFA 3ZMLA 2X8GA 2YV7A 4DEJA 1BQ7A 3C7MA 4NWYA 4KDXA 3VI7A 3FZAA 1B9YC 2IJYA 4F0BA 5CREA 1N8JA 3LFLA 3DMLA 5ECLB 2KUCA 3ZTLA 4EF0A 1GSYA 5ID2B 1K3YA 3GYKA 3C1SA 4GRFA 1ML6A 2WULA 4EL1A 3BBYA 2JZRA 3UBKA 2NPBA 3WT1A 5ABRA 2GLRA 3DXBA 4XCSA 2I1UA 3GUSA 1FOVA 1EZKA 3GX8A 4WEYA 3TRPA 1XWCA 1GTBA 4ZXGA 1J9BA 4GQCA 2H6ZA 3VFIA 2K18A 3Q18A 4P3YB 2X99A 5KN0A 4XS1A 2LSTA 1TRWA 5HFIA 1GP1A 1EOHA 1GNEA 2C0DA 1SD9A 2RUEA 2DLXA 2C3QA 3MAKA 3M9KA 4KW6A 3RPNA 2B3SA 4GLTA 2WB9A 3ERWA 4RI6A 2P5QA 2NTOA 3KTLA 1SKWB 1B9XC 4JBBA 3VWXA 3ZZXA 3GKMA 3W8JA 3FZ5A 4BL7A 5HFGA 3HVXA 4V1Ap 3V1WA 3A2XA 4MJBA 3GA4A 4NAXA 3F4SA 3EVIA 1O8WA 1EP8A 1GUHA 2K6VA 3M3MA 1GTAA 3ZFLA 5G5EA 1K0NA 2AAWA 2X8CA 2A2RA 1U3AA 1R4WA 2O8VB 3VI5A 4EUYA 1SK1A 4TKYA 3TJFA 1GRXA 4XTSA 11GSA 5EY6A 1PA3A 3UAPA 3QMXA 2PUKC 3LJRA 1Z9HA 2BTOT 5J5NA 2JSYA 4WBJA 2XBIA 5EPFA 3TKSC 1FO5A 3D6IA 3IV4A 1X9MB 2HRNA 3M9JA 1ST9A 3WGXA 3TKSE 1EGRA 1G6WA 1XW9A 4GQFA 4MZBA 5IOXA 5B7CA 3HY2A 2J23A 4Q5NA 1RW1A 4I97A 5AIXA 2MZCA 1GSUA 1EGOA 4PURA 1UC7A 3KXOA 4MPGA 1NW2A 4MP4A 3L0HA 2K9FA 1AXDA 3IBHA 5IO0A 5DQYA 3TJJA 1NHYA 1FVKA 3HA9A 1KEBA 3UMAA 5LNKe 2JZTA 1V2AA 5FT3A 6GSWA 1IYHA 2H30A 2G2QA 2H19A 4IW9A 3OR5A 4OO5A 4KB3A 1FAAA 4KGIA 4IJIA 1QUWA 3CSJA 4NPBA 3FZ9A 2B1KA 1O8XA 2KP1A 3KMNA 2H1BA 3FRCA 2L4CA 3GV1A 4MJCA 4MH3A 3Q19A 3F6FA 5G30A 2I4AA 2QGVA 2DSAA 4XRAA 5IMDA 3CYNA 5IPGA 3U5RE 4CHSA 1K3OA 5J9CA 3IDVA 3J7Yb 4WXTA 1SD8A 3HD5A 3SBCA 3F3RA 4POKA 2YWNA 2AJQB 3VURA 3ERFA 13GSA 2HLSA 3KGKA 2GVPA 1A8LA 2ES7A 3KH7A 3IK9A 2I9HA 2H73A 4TRXA 5F07A 1R5PA 1N2AA 3TRQA 5DJMA 1B4PA 3VLNA 4EE0A 4IQAA 4V1Ag 5IM9A 3ZIJA 5J3RA 12GSA 4ZB8A 2IWTA 4EDZA 3LQ7A 1K0OA 4LMWA 5ECHB 1QK8A 4G2EA 3APSA 3QPMA 4PUFC 4K7NA 1SL2B 4DSRA 3K8NA 3W6GA 1K0CA 2YZUA 2GZPA 4N10A 1EEMA 1OC3A 4WBRD 3MDKA 3SWLA 5G1LA 2FCHA 1KNGA 1XXUA 1DBYA 2B5XA 1JZWA 2FNOA 3LXTA 1QQ2A 5IPHA 2YANA 4BWSA 4MLYA 4JZQA 2VCQA 1QXHA 5B8AA 4ZL9A 1THXA 3HHVA 4N30A 3WGDA 2H66A 2V41A 2DMMA 7GSSA 2IMEA 2GS3A 2PERA 4FYUA 3H8QA 2R5GA 2CA8A 3G7IA 2FGXA 1UA5A 1HD2A 3DVWA 4ECBA 5KN3A 4IN0A 1M7TA 4D73A 4KDUA 1PX6A 3S9FA 1PL1A 3CRTA 4WR5A 4X1UA 2XC2A 4I8BA 1ZYQB 5IMCA 4D73B 2QC7A 3RAZA 1XWGA 5IO2A 4TR4A 4K0NA 5DCHA 2L4QA 5HFKA 2FA4A 5DALA 3GL5A 1JLVA 1MDKA 5AISA 1B8XA 2GQMA 3ERGA 3FW2A 3DGQA 1ON4A 2IMFA 1SJ6A 4WF5A 1SK0A 2GQLA 4NMUA 2MMZA 3QFAC 3ZITA 5FWGA 3F4RA 2O7KA 1ILOA 2X8HA 4HZ4A 3ZIVA 2V1MA 1PD21 1GULA 4L5LA 1PQNA 3G9BA 2PPTA 3MWHA 5F05A 3E0UA 3IC4A 2NVLA 3KTBA 1G6YA 2FWHA 1AQWA 4RQRA 2R2JA 1ERUA 4PUAA 1XCCA 4TR0A 1SKRB 2Z9SA 4HU7A 2AYTA 3A5WA 5A4VA 1GUMA 2BMXA 2FLSA 1A0FA 4HJ2A 2PVQA 2VM2A 2HZEA 5IMVA 1G7OA 3MNGA 5ECMB 2HE3A 3CTFA 5B8BA 4F2IA 4KSMA 2HZEB 2PU9C 2VD0A 1PMTA 1EEJA 3TKPA 4HI7A 4IJ3A 1F2EA 1MD3A 5IMFA 2OE0A 5D93A 4PX1A 1OYJA 2AUVA 3ZFBA 4GWRA 1WP0A 4FIWA 1TU7A 1O81A 4I6XA 5E4WA 6GSTA 4ULXA 4HU9A 3GH9A 4Q5RA 1F37A 2IN3A 2IIYA 5ELGA 2GSRA 3N9JA 2HSYA 3D21A 2LKUA 4MH2A 2MMNA 5ID2A 1YKAA 4LA1A 1H75A 4IQ1A 1OKTA 3RPPA 2DJ1A 2VCVA 3BD2A 1KBNA 2GSTA 4XHMA 1R26A 1PKWA 5DBQA 6GSYA 1SL1B 3UARA 3EYTA 5H5RA 3LG6A 2DJ2A 1XOBA 3KM6A 5G5FA 3FR3A 1VF2A 1DE2A 2EIOA 2GSSA 3GKXA 1VF3A 4G19A 3DD3A 1RQMA 4EXJA 4KA0A 3LORA 2PMTA 1ZZYA 3LGCA 4WR4A 2PWJA 2E7PA 5GAND 5GAPD 4JEDA 2LNTA 4XS4A 1PRXA 2KLXA 1UVZA 3IK7A 1TP9A 3KJYA 2F8AA 1BX9A 4XS4B 1PKZA 4ZB9A 5CRHA 4QQ7A 3GH6A 4TR3A 2CT6A 3L4NA 2LQQA 4OFMA 2VLUA 2VCZA 5J4UA 2CAQA 2FD3A 5ECIB 5ENUA 3W8SA 5KEJA 4MJEA 2A4VA 1CQHA 3RHCA 3TJGA 1TW9A 1URMA 3KCMA 3IAM2 5GSSA 4ECJA 3QFBC 3QR6A 1XBSA 2OA7A 4NXIA 4IP1A 5A4WA 4LL4B 2R37A 1S3DA 3EU3A 4GCIA 4HQZA 3AY8A 1GSEA 2XPEA 5EVOA 3UVTA 1WJKA 4GF0A 10GSA 2E0QA 3FEUA 3TRXA 3CXGA 2ON5A 1F6MC 1XZOA 4HOJA 1T00A 3GURA 19GSA 4JE1A 4ZBDA 1FVJA 2C4JA 1TDIA 2RLIA 2CV4A 3QAGA 4O92A 6GSUA 3HZ4A 4K7IA 4QL7A 4IHUA 4XRDA 5CRDA 2YNXA 4POMA 3Q6OA 3PR8A 2EIQA 2O87A 4FYCA 1EV4A 2N5BA 1NM3A 2H72A 1W4VA 3DYRA 3BCKA 1XWKA 2IFQA 3EWLA 3US3A 1GSSA 2H1AA 5IQYA 2HZFA 2H71A 4Q5FA 2BJXA 2H6XA 3TJKA 1M9AA 2DC5A 2IMKA 4HEA2 2IFQB 3LXZA 1XW6A 3D0ZA 2L5LA 3F0IA 5ECSA 4MPFA 1TXXA 1PL2A 5D8IA 3ZL5A 3PINA 4O32A 4HUAA 4GSTA 4NV5A 4OD7A 3GTUA 3APOA 4EVMA 1AQXA 3IA1A 1Q98A 1AW9A 2ZCTA 4YAVA 1SU9A 2F9SA 3GTUB 1AIUA 3IR4A 1FG4A 4OMVA 6GSXA 4NHWA 1MDIA 1YEPA 3M0FA 2XBQA 4IS0A 5CRWA 2JADA 1T4YA 3VWWA 5HR1A 2ALBA 2K8VA 1B4QA 1A8YA 1M2DA 2JSZA 2NDOA 2RM5A 4MDCA 5AGYA 1WMJA 3VPTA 1OKDA 1AUCA 2DJKA 2B1LA 5CRGA 1Z7PA 2AHEA 2WDUA 2P5RA 1ZL9A 20GSA 2WCIA 5D9WA 3FZ4A 2AB6A 4MCUA 1RK4A 2VIMA 4ZILA 1TRVA 1ZYEA 4Z7XA 2PN8A 3MSZA 3FY7A 2R6KA 1M99A 1H4OA 2TRXA 3R2QA 1SYXA 3DRNA 2LJRA 1TTZA 5HR3A 3F9UA 2VL3A 9GSSA 1OE8A 4ACSA 2F51A 1GNWA 1LBKA 1SKSB 1SL0B 3HXSA 4E8EA 5DVBA 2L57A 3IAS2 4FYBA 1GSFA 4OCEA 1DSBA 17GSA 4MF7A 2H0HA 1LU4A 1TU8A 4YQVA 2CZ3A 2LJAA 4KNDA 2FWFA 4XS6A 3ME7A 4J2FA 1SENA 2E2MA 3BCIA 4OWYA 3M8NA 1J08A 3ZREA 3GNJA 2DJJA 1ZMAA 1YF0A 1JHBA 4MABA 4RQXA 4WKWA 1W89A 2QKEA 2DJ3A 1FHEA 3HVVA 4YQUA 5HR0A 3M1GA 2LTKA 1BAYA 2TIRA 1X5DA 1ZGNA 3KIJA 2PVOC 4KH7A 2C0EA 5JCGA 4POBA 3TJBA 1GH2A 4J56E 1VRSD 1PX7A 3GKKA 3O76A 18GSA 3WGEA 1EP7A 2OJLA 4ZB6A 2C3NA 5F8BA 1M9BA 5C00A 2HNLA 5D73A 4RUVA 2P31A 5JCUA 5ECRB 1TKDB 2H6YA 1BYEA 1IYIA 1G7EA 1TI3A 4ML6A 1K0BA 5IMAA 4ZBAA 1TK5B 3QCPA 1XPVA 1S3AA 5D96A 4TR1B 1K0DA 3TOTA 1X5EA 1FB0A 3ME8A 4JU5A 1XWAA 4WF4A 2C0FA 3FR9A 5AN1A 1M2BA 3FR6A 4L0UA 4POLA 5D9VA 2JL4A 2VUPA 4YQMA 3QD9A 4Q5QA 1C72A 3LSZA 4KAEA 2EC4A 2YWOA 3QOUA 4BA7A 4YH2A 4X43A 5JWOB 2F3MA 2F8FA 4ZIJA 3J7Yk 8GSSA 1XFLA 4NHZA 4LL1B 3GRXA 3DIEA 3D4MA 2GZYA 5L71A 3TUEA 1AC1A 4BVXA 3F6DA 3L9VA 1Z6MA 2YZHA 3ISOA 2VCTA 1ZOFA 2JACA 5JWRB 2FY6A 2YP6A 5B6NA 1V40A 4HZ2A 14GSA 1GTUA 2VCWA 4RI7A 4KE3A 3F3QA 1M2AA 1QGVA 2C80A 3WD6A 5F06A 1Z7RA 3HJOA 4F0CA 3JCML 4L8EA 2KOKA 2J9HA 3HVSA 1GSDA 4PGTA 4F9ZA 4ECIA 22GSA 4DSQA 1WRYA 1I5GA 5CP1A 2HT9A 3ZLPA 2LS5A 5CNWA 2HRFA 1GLPA 5G1KA 3LEFA 4JR4A 1GTIA 2RM6A 1OAZA 3HJPA 4ZBBA 3DWVA 1M0UA 1BJXA 2GZZA 4HQSA 1OC9A 1GLQA 1SK2A 3N5OA 2IL3A 2HSHA 1VGLA 4CW9A 3DVXA 16GSA 2HFDA 1OC9B 2H76A 3EINA 1VF4A 3VWUA 1YQ1A 1DE1A 1R7HA 4PXOA 1BEDA 3HCZA 1EOGA 4J57E 1Y25A 1A2JA 3NIVA 2YV9A 2H75A 2LRNA 4LMVA 1JZOA 4KUNA 5KN1A 2FA8A 4EO3A 2WRTA 4JRRA 5DAKA 3ZRDA 1X9WB 5KN2A 3EC3A 4O7HA 2LNSA 3FKFA 2CZ2A 2K8SA 4XIHA 2TRCP 2B7JA 2EIRA 3BJ5A 3GX0A 1TI1A 5DAKB 4K8MA 3I6AA 2GTUA 1NSWA 2YCDA 3IRAA 1MTCA 3KH9A 1YJ6A 4IVFA 2WJUA 3G7JA 4YAPA 3Q74A 5HR2A 2M72A 3I43A 4TOPA 1PSQA 1X5CA 4G10A 1XWBA 4G9HA 2C0GA 5ECQB 5GSTA 3NZNA 1AAZA 2MYGA 4F03A 1QFNA 2ON7A 5FHIA 2X64A 1T8EB 3IHQA 4GSNA 1R5AA 1O73A 3E3EA 3KZQA 1I9DA 3C73A 1B48A 3I69A 3UIWA 4IP6A 1TOFA 4KSOA 3C8EA 3GHAA 4GTUA 2QSIA 3HZ8A 2VD1A 1SYRA 2O89A 3GIXA 3KEBA 1U6TA 4I5QA 3VK9A 3A3TA 3TKQA 3PGTA 2GQKA 3I9V2 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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