2H6YA

Crystal structure of thioredoxin mutant e48d in hexagonal (p61) space group
Total Genus 30

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADDYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS1 (5-6)S3 (54-59)TI1 (8-11)TI4 (59-62)TVIII1 (61-64)TI6 (63-66)AH1 (11-16)TI2 (16-19)S4 (77-82)TIV1 (50-53)S2 (22-28)TIV2 (74-77)TI3 (29-32)AH2 (33-49)AH3 (96-107)3H1 (67-70)S5 (85-91)TIV3 (81-84)TII1 (49-52)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant E48D in Hexagonal (p61) Space Group
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
total genus 30
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h6yA00
3ISOA 4KA0A 1QQ2A 2DIYA 4TOPA 5D9VA 1T8EB 2EC4A 3GKKA 1E2YA 3UBKA 2PGTA 3LG6A 1GUHA 1ABAA 3HA9A 4XS4A 1F3BA 1GULA 1A8YA 3GUSA 4IQ1A 2HZEB 2E0QA 5GSSA 4ML6A 5KEJA 5D8IA 1YEXA 2L57A 3M1GA 4YAPA 2AJQB 5IO2A 1SL0B 5EVOA 5KN0A 5KN1A 3TJFA 1J9BA 2A2SA 2A2RA 5CRHA 2OE1A 4PNGA 1M2AA 3KGKA 3CYNA 4JE1A 3J7Yb 1PX6A 2QGVA 4J56E 3LXZA 4N0ZA 1DE1A 5J9CA 4F82A 1TJDA 1NW2A 1WJKA 5G1KA 4K7NA 1QFNA 1WE0A 5D9TA 3DKSA 3LEFA 1PKWA 3ZIVA 2LNTA 5JWOB 5ECKB 1GP1A 4TVEA 4GQCA 3GTUA 6GSYA 1W4VA 4FYBA 3UEMA 3TOUA 5KN2A 4XS4B 5AISA 1H75A 1PL1A 3P90A 1TOFA 2V2GA 5AIXA 2LV3A 2OE3A 1XPVA 1K0MA 2GSRA 4ZBAA 3HVVA 3H79A 3NZNA 2O8VB 1GSSA 5G2ZA 2MMOA 5EL8A 1K0OA 1SYRA 1IYIA 2HLSA 3ME7A 1OE8A 1NM3A 3E9JB 4PUFC 2YN1A 2X8CA 3LFLA 1XCCA 2GT6A 2MBTA 4TRXA 4PQHA 3FR9A 3KEBA 3FY7A 3A5WA 2MBSA 2IJYA 2H75A 1MD4A 2LKUA 1AUCA 5IPHA 3KM6A 3F63A 4WR4A 1A24A 1EGOA 4HQSA 3GTUB 3UARA 2YWNA 3FR6A 1AXDA 2X8GA 2L6DA 2H0GA 2WS2A 3WGEA 4NMUA 4NHZA 4CW9A 3TRQA 18GSA 2OBKA 2GQLA 4IP6A 3FK8A 3F3QA 3VPQA 1PN9A 5G5FA 4EC0A 2N5FA 1TI1A 4LMWA 2L5LA 2I81A 5IIZA 4XCSA 5ECOB 3IHQA 4DSRA 4EDYA 4OMVA 3MDKA 3Q74A 3U6VA 1Z7RA 3C73A 3UIWA 2E2MA 2CAIA 6GSVA 2D2ZA 1DBYA 3FYGA 2OE0A 3QFAC 1OVNA 2R4VA 3M3MA 3DEXA 3D5JA 4MPGA 3JCML 2YZUA 3MNGA 1TK5B 1A8LA 2VL9A 3G7YA 3RHBA 2JZSA 2HI7A 1GTIA 4TR1A 3Q19A 2GZYA 4X1UA 1U87A 22GSA 1GSUA 2HRNA 2F51A 4IBPA 3QPMA 4HS1A 2YANA 2NBSA 3GIXA 3HXSA 1JLWA 2L4CA 1G6WA 4IHUA 4OFNA 3C1RA 4ML1A 4TXOB 1XOBA 1SENA 1A2MA 3FW2A 1OYJA 2VD0A 3FZ5A 4G10A 4ECIA 4GRFA 3IA1A 5COHA 3QFBC 4NXIA 3LGCA 1THOA 4ZL9A 3WT1A 2LJKA 2HE3A 4RQRA 1F9MA 3APOA 4NHWA 1DUGA 2OBIA 5ABRA 3HKRA 1R26A 2NTOA 3GURA 1GL8A 1MEKA 4GXZA 3TJJA 3GKNA 2XPEA 1VF4A 4K6XA 1KBNA 4NV2A 2GSQA 3H8QA 1AIUA 2VD1A 3ERFA 5CAXA 3DVWA 1K0CA 1KTEA 2DC5A 1FVJA 1XZOA 4L5LA 3KMNA 3VWVA 5J41A 2GLRA 5E4WA 2LRTA 1S3CA 2XHFA 4BVXA 4E8EA 4PQIA 6GSWA 1N8JA 5ENUA 4KCAA 19GSA 3DXBA 1V2AA 3IXRA 2F3MA 2DJKA 1Z7PA 3J7Yk 4KE3A 3RHCA 4TN8A 1EV9A 5IMFA 3VI7A 2GT5A 1T1VA 3BOAA 1AW9A 2YWMA 2QC7A 1LBKA 4V2MA 2GQMA 3H1NA 9GSSA 4G2EA 4ILFA 1EGRA 4FO5A 2HZFA 2FLSA 2K18A 1TDIA 2DIZA 12GSA 1TW9A 1NSWA 2K8VA 3UJ1A 3W8JA 2QKEA 3GL5A 2C3TA 2CV4A 4WF5A 1PA3A 2X8HA 1T4YA 2HRFA 3GX0A 4AF2A 3E0UA 4K2DA 4RQXA 2IMFA 4V1Ag 5LNKe 1DE2A 4LLRA 1HNBA 4K0GA 1SK2A 4ACSA 2RUFA 3UAPA 4K1FA 3US3A 1GSEA 1U88A 1ERWA 4WEYA 4MZBA 1J08A 2C0GA 4ECCA 3EURA 4KUNA 3LYKA 2ZCTA 4IKHA 2HFDA 5CRGA 5ID2A 1RQMA 2R6KA 2R3XA 4PURA 4OFTA 3ZVJA 1R5PA 2J23A 3EU3A 1EWXA 1YEPA 3LORA 5G31A 1Z5YE 4PX1A 4PQ1A 4WBJA 4AJ8A 4KB3A 3TDGA 1MTCA 1I9DA 2LJRA 1XW6A 3UL3A 2HNLA 3ZRDA 3EC3A 3VLNA 3NIVA 4OO5A 4K9ZA 5A4UA 3HY2A 3HYPA 5D9WA 2MMNA 1BJXA 1TK8B 3BBYA 2RUEA 2LS5A 3KXOA 2KLXA 5HQPA 3N5OA 2VCTA 3HDCA 4I97A 1JHBA 2YZHA 4OFMA 5G1LA 3M0FA 3CTGA 3C71A 3BCKA 2M46A 4OCFA 3I6AA 5E59A 5FWGA 2AUVA 4QL7A 4HQZA 3APSA 2FD3A 4ZILA 2AB6A 5IM9A 4IGJA 4NV5A 2CVBA 1UC7A 2WZ9A 2K6VA 1URMA 2GQKA 2H73A 4KH7A 3FKFA 2G2QA 2VCZA 1XOAA 1JZOA 2VLUA 4MH2A 4HU7A 4ZL8A 4WKWA 1M9BA 1SK0A 4HUAA 4KSOA 2F8AA 2LSTA 3KZQA 3HD5A 1H4OA 4IW9A 1SD8A 1WOUA 1AC1A 4GWRA 1S3DA 2EIOA 1GLPA 2C1YA 3G7IA 1WWJA 2VCQA 1GSFA 2FHEA 4IVFA 3LXTA 2X99A 3HJPA 3ZZXA 2REMA 4BL7A 3TB2A 3I9V2 3L9UA 1OKDA 4IN0A 4PNFA 2B1LA 3GA4A 1GLQA 1ST9A 1N2AA 3F8UA 5CRDA 1ERTA 2BJXA 1NHOA 5IMVA 2R37A 5J5NA 1HD2A 3MAKA 4HDEA 4J2FA 1A2JA 5HFKA 1Z3EA 2OKAA 2PWJA 4EL1A 4CHSA 1RK4A 2WB9A 2LTKA 1XVQA 2EIQA 1ILOA 3ZTLA 5DCGA 3PR8A 2IMIA 1TRWA 4EDZA 3KD0A 1GNEA 1ZYQB 1XIYA 5DBQA 3F0IA 2K8SA 3ZLPA 1BEDA 4FIWA 2GS3A 4JBBA 1YJ6A 5ECPB 2CA8A 1OC3A 2P5QA 4MH3A 1GUMA 5F05A 1XWBA 2NVLA 4JU5A 4ZBBA 3P2AA 3H93A 1A0FA 5B6MA 3QR6A 1V9WA 2JSZA 2FCHA 2B7JA 4IELA 4XIHA 3KCMA 1Z6NA 1K0NA 1GSDA 2F8FA 2IFQA 1EP8A 3GRXA 1U6TA 3HHVA 1SD9A 2OACA 1WIKA 3L4NA 4QQ7A 1R4WA 1K0BA 3P8WA 2KHPA 1V58A 5CRWA 1MDIA 1SL1B 3HZ4A 1AQVA 3DWVA 4ULXA 2R2JA 4Z7XA 2I1UA 3GNJA 4Q5FA 4IJ3A 4X43A 3P7XA 3DD3A 1YKAA 2XC2A 1VGLA 2VLTA 3ZIJA 3A2VA 3GSSA 3H4KA 5DVBA 3Q6OA 3GSTA 4ZIJA 3VWXA 4KGIA 3TKSA 2DJJA 5FHIA 3EVIA 2PUKC 2Z9SA 4YQVA 1O73A 1BYEA 1TK0B 2PN8A 2C0FA 3G9BA 4DVCA 2DJ3A 2DSAA 2WGRA 2M80A 1SKRB 4MF5A 1OC9A 1ZCPA 3BJ5A 1E6BA 3TUEA 4TKYA 1B48A 1X0RA 3EU4A 4BWSA 4O32A 1B8XA 5CNWA 4YAVA 1G7EA 1SU9A 4WF4A 1K0AA 1YY7A 2IFQB 5A5KA 1ZZYA 4KNDA 4MK3A 2H74A 1PKZA 3C8EA 4FYCA 3UBLA 2H71A 1QUWA 3LYPA 2K9FA 1KNGA 2GTUA 1T7PB 3TOTA 2VIMA 1V57A 4F0CA 1F37A 5JCGA 3CSHA 2JL4A 1F2EA 2E2GA 1JZWA 4EVMA 2PVQA 5A4WA 2GZPA 3GN3A 4RI7A 1M2DA 1PL2A 2FWHA 2FGXA 2B6MA 1SJZA 2TRXA 3IDVA 2PMTA 3MWHA 5DQSA 2FNOA 3A2XA 3CXGA 4MABA 5ELGA 3L9VA 5D9XA 2YWOA 4K8MA 3EINA 2KP2A 1XXUA 1M99A 3W6GA 3TRPA 5CO3A 4LL4B 3IPZA 2B1KA 3AY8A 2ON5A 2JADA 1JZDA 2HXKA 2VL2A 2C8UA 1EEMA 1TRSA 2GSTA 2XPDA 2VOCA 4I6XA 1OE7A 1RW1A 5AGYA 2X64A 5ECIB 2V6KA 3R2QA 3KIJA 4RUVA 5IOWA 3LJRA 2PERA 5B7CA 4ECJA 7GSSA 2O89A 4YQUA 2N5BA 4PUAA 3U5RE 1IYHA 1WP0A 2FWGA 3C1SA 2VCXA 3TKSE 4GSTA 4V2LA 2XBQA 1ZMAA 4OCEA 2I9HA 4OD7A 4MJCA 4TR1B 1X5EA 5KN3A 1ON4A 2G0FA 3KP8A 1SK1A 5HR1A 2ES7A 6GSTA 2C4JA 2H1GA 3TJGA 1PRXA 5F06A 5F8BA 1C72A 4N11A 4WETA 4ECBA 5AN1A 2LQQA 3RBTA 20GSA 5F07A 3ERWA 2GDRA 2VO4A 3QAGA 6GSXA 4I2UA 4KCEA 2P5RA 2NDOA 4GLTA 4H86A 5JCWA 4AJ6A 3VWWA 1XWCA 2VLVA 3GV1A 4JRRA 3ZL5A 5G30A 3ZFLA 5ECQB 2IN3A 3FHKA 2YCDA 2C3NA 2I4AA 3GKXA 2YJ7A 5DDLA 4OO4A 3SWLA 1W89A 3ME8A 5CREA 3KTBA 2H66A 1ML6A 4GSNA 3F4TA 1PGTA 5F0GA 4HU9A 4HEA2 3A2WA 1XVWA 2P0GA 4MDCA 3IAM2 5DALA 1BX9A 2ON7A 10GSA 5LD0A 4O92A 1GH2A 5IMAA 1FB0A 1FAAA 2N5AA 1M9AA 3TKQA 5JWQB 1XBSA 5IMCA 4MJAA 1O6JA 2IMDA 2MMZA 2CAQA 5GSTA 1THXA 3K8NA 2FWEA 4AGSA 1Z9HA 1X5DA 4BA7A 1B9YC 1FG4A 5D96A 2O87A 3GHAA 1K0DA 4IS0A 1HNAA 1VRSD 2RLIA 3CSJA 1SL2B 2C3QA 1Y6EA 3EE2A 1K3YA 2WDUA 5IPGA 3VI5A 4TXVA 3LSZA 4TR4A 2H6YA 4BWQA 1GSYA 1V40A 4N10A 2B5YA 3HZ8A 5DALB 4NWYA 5G5EA 1OC8A 5DAKA 2DLXA 5HR0A 2OJLA 3F6DA 5DCHA 5C04A 3M9KA 1T3BA 5IMZA 8GSSA 2AYTA 1GNWA 4ZB8A 1B9XC 3SBCA 2RIIA 4V1Ap 3ERGA 1XWGA 4KX4A 3FZ9A 3E3EA 4HZ2A 2VAFA 2FA4A 1Q4JA 5ECNB 4EF0A 1K3LA 4LA1A 2HZEA 1VF1A 1ZGNA 4JR6A 3FZAA 1WMJA 1FVKA 2L4QA 3V1WA 2QSIA 2BMXA 3HJMA 5ID2B 1BG5A 2DMLA 6GSUA 2DBCA 4OWYA 5DJLA 3TKPA 1PSQA 2VCVA 2L6CA 2V1MA 4I8BA 4MF6A 1EOGA 2AAWA 1U3AA 2HYXA 1SYXA 4MPFA 4F9ZA 2MZCA 1YF1A 3L78A 3DYRA 2NPBA 2H8LA 3Q18A 1QMVA 2GVPA 2JZTA 4E8HA 3KP9A 1WRYA 4JEDA 4XS6A 1YQ1A 4PGTA 4XTSA 2YJHA 6GSSA 2VM2A 2H1DA 3IBHA 3QAVA 3I43A 3RPNA 3PINA 3QDNA 4V2NA 1WPIA 5IQYA 5HR2A 1KEBA 3A3TA 1A2LA 2KP1A 2IMKA 2OA7A 3WT2A 3ZMLA 1GUKA 1PX7A 16GSA 5JWRB 1ERUA 1R5AA 3GKMA 3L9SA 3FR3A 4GF0A 2L59A 4GSSA 2V32A 1PD21 1X9WB 1JLVA 4KDUA 4NAXA 4TR0A 1A23A 3WD6A 3RPPA 2B7KA 3ZMKA 3CRTA 1O7UA 5ECMB 3EMPA 1XWAA 4TR3A 2WFCA 2CZ2A 3GH9A 2R5GA 1MDKA 1O8XA 3HJOA 3HVSA 2LNSA 4GQFA 1M0UA 3CTFA 1GSQA 2H0HA 3DVXA 1YF0A 2VCWA 1GWCA 4Q5RA 5INYA 3ZVJD 1ZL9A 2H1BA 2MMAA 4DEJA 2I3YA 4NPBA 5J4UA 3VURA 1SJ6A 3ZREA 3I69A 3RDWA 3IOSA 2FUG2 5ECHB 4JZQA 3TKRA 3GYKA 4O5RA 3IAS2 3BD2A 3TCOA 2F9SA 4L0UA 4F2IA 2PBJA 1USBA 2LQOA 1O81A 3KTLA 4YH2A 3UVHA 2H01A 2H76A 5J9BA 1AAZA 2H1AA 2AHEA 3VWUA 2AV4A 3CMIA 2GZZA 1TKDB 5HFIA 1SKSB 1G0TA 3IK9A 4IP1A 4MCUA 3IRAA 3M9JA 3D22A 3IE3A 1BAYA 1OKTA 1UVZA 5H5SA 1UA5A 4EO3A 11GSA 4GCIA 2ZNMA 2VUPA 2L5OA 3PGTA 1DSBA 5A4VA 2PU9C 1T4ZA 1G6YA 1XW9A 1B4PA 3APQA 4X0XA 1HNCA 4ISDA 4MJEA 4MZWA 2FA8A 1F6MC 4IJIA 1TI3A 1QGVA 3IV4A 3QOUA 4MLYA 1MDJA 1EV4A 2B3SA 2HT9A 4EE0A 3TGZA 1XFLA 3WGDA 2JACA 1FW1A 3G7JA 3MSZA 1B4QA 1AQXA 4P3YB 3EMXA 1S3AA 3CBUA 4HZ4A 4EXJA 3F6FA 3LWAA 2CVDA 1FB6A 3VPTA 3EWLA 3D0ZA 1Y25A 3QMXA 2XBIA 4N0VA 2VL3A 1ZYEA 4TXOA 1CQGA 5ECSA 4BPYA 1TRVA 1HQOA 3N9JA 2M72A 2DJ2A 5HFGA 4RI6A 4DSQA 2RM5A 1X9MB 2ZUPA 2PVOC 1O85A 2IIYA 1GTBA 3M8NA 2H6ZA 3DIEA 1VF3A 2LRNA 2LUSA 3D21A 4Q5NA 4Q5QA 3PH9A 4HOJA 3DRNA 4L5OA 3S9FA 5D73A 4XS1A 1OC9B 1SKWB 1QK8A 3FZ4A 1CQHA 4IQAA 3WYWA 4GTUA 1LJRA 1YZXA 2FY6A 14GSA 4ZBDA 5H5QA 2H6XA 1MD3A 1XWKA 4POLA 3LQ7A 1Z6MA 1ZOFA 3UVTA 3QAWA 2DJ1A 1I5GA 5GZZB 2HSHA 4MJBA 2KUCA 1O8WA 3F3RA 4ZL7A 2IPAA 1YKCA 1EZKA 4YQMA 4MZCA 2IL3A 2C0DA 5FT3A 2KOKA 2JU5A 5C00A 1GTUA 3HVXA 5AIVA 1PQNA 1G7OA 4L8EA 3DGQA 2WCIA 4MA9A 1TRUA 5JCUA 3HCZA 3O76A 3D4TA 1M7TA 4XRAA 3WGXA 1ERVA 2HSYA 3GFKA 4EKZA 3GMFA 3O6TA 3TKSC 1XW5A 3F9UA 5HR3A 2TIRA 4WBRD 3GH6A 2CX3A 3CSIA 3TJBA 1GTAA 1M2BA 3W8SA 3C7MA 3EYTA 2BTOT 2LRCA 2VM1A 4LL1B 13GSA 5GAND 2LJAA 3BCIA 4HJ2A 2A4VA 4J57E 4POBA 2J9HA 4EUYA 3IK7A 4QL9A 2O85A 5ECLB 2DMMA 4JR4A 1EOHA 1FOVA 5ELAA 4D73A 2ALBA 2B5XA 4K0NA 2P31A 4N30A 1U3IA 2TRCP 2YV7A 3UOMA 4F03A 1SJIA 4ZB9A 4TW5A 4AJ7A 2GSSA 5ECRB 3KH7A 4KW6A 2CVKA 1EEJA 5B8AA 1F3AA 3O3TA 1AQWA 4K7OA 1ACVA 4WXTA 4ZXGA 1X5CA 2RM6A 1TXXA 1FO5A 3IR4A 1TU7A 3KMOA 3VK9A 3FRCA 1JZRA 2FWFA 5DJMA 3TRXA 2V6OA 2V41A 2YNXA 3TJKA 5IMDA 1QXHA 2C80A 4XHMA 5EY6A 1JFUA 1OAZA 3KH9A 1EP7A 3ED3A 4G9HA 1NHYA 1T00A 3ZYWA 1BQ7A 1X9SB 2VL2C 3DMLA 4KAEA 1FHEA 4POMA 2LEGA 1HYUA 5IO0A 2B5EA 5GAPD 4ZB6A 4O7HA 5L71A 4D73B 5CYYA 2JSYA 1Q98A 3L0HA 5IOXA 4HI7A 2YV9A 2YWIA 2IMEA 3FEUA 3QD9A 4FH8A 4CDOA 5B6NA 1VF2A 3ZITA 4KDXA 3CRUA 5EPFA 4POKA 2CQ9A 2OADA 5B8BA 4DSSA 4F0BA 2GGTA 1YDKA 3KJYA 4KDYA 3F4RA 1TU8A 3F4SA 1K3OA 4I5QA 5J3RA 5D93A 5H5RA 2H30A 4BVYA 2DJ0A 4WR5A 17GSA 5CP1A 2O7KA 1TP9A 1V98A 4PXOA 1GRXA 1PMTA 2JZRA 2CT6A 4KSMA 1UN2A 3GX8A 2MYGA 3IC4A 3QCPA 2CZ3A 3D6IA 2WRTA 2YPMA 1R7HA 1LU4A 5LCZA 4XRDA 2H72A 4MP4A 4MMMA 2YP6A 2IWTA 3UMAA 4FYUA 2EIRA 4G19A 4HJMA 2H19A 3VFIA 2E7PA 5DQYA 3NOFA 4MF7A 4L0WA 2PPTA 2H70A 4I2TA 2WULA 2H0IA 2WJUA 4DSSB 1A0RP 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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