2H71A

Crystal structure of thioredoxin mutant d47e in hexagonal (p61) space group
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIAEEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant D47E in Hexagonal (p61) Space Group
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 33
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h71A00
3KXOA 4ULXA 2O85A 2FWGA 2RM5A 4JR4A 1JZDA 5G5FA 3FW2A 2LQOA 3FZ4A 3F0IA 3TJKA 2VCZA 3F8UA 3W6GA 5A4VA 4DEJA 2VLTA 3VI5A 2C4JA 3F6FA 1SYRA 2H0HA 1O8WA 3U6VA 3QCPA 1DUGA 2I3YA 1GLQA 5INYA 5JWRB 3TOTA 2DIYA 2GZYA 4FYCA 4V2NA 2GVPA 1FVJA 2CT6A 2F51A 3EYTA 2G0FA 3DD3A 1U88A 5JCGA 3TCOA 2XPDA 2IMFA 3NOFA 1Y25A 1SK2A 2DSAA 3UL3A 3WD6A 1GTBA 2HZEA 20GSA 2VLUA 1EV4A 2ON7A 4XS6A 4EO3A 3GA4A 1TP9A 3D21A 1M0UA 4BWSA 1ZYQB 2AYTA 1XCCA 1GULA 1FAAA 2GSRA 1RW1A 5J4UA 3TDGA 5IMAA 1PKZA 1VF2A 5IMDA 2O8VB 5G30A 1CQHA 4GSSA 4OO4A 3LXZA 4F82A 3GTUA 4GSTA 2K9FA 4WR5A 1BYEA 1YEPA 5IM9A 1IYIA 3ERFA 3HVSA 2WULA 3A2XA 3C1SA 1V57A 4LA1A 1TDIA 4GTUA 8GSSA 3I69A 4MZBA 1SL0B 5DQYA 3KCMA 4JEDA 5AIXA 3ED3A 3GX0A 4CW9A 4WBRD 2OE0A 3QFBC 1GRXA 3HVXA 3F3RA 4F03A 5GZZB 3QPMA 2C3TA 3ZTLA 3FZAA 2FWEA 3VI7A 2H1DA 2HZEB 5JCWA 2H72A 3GUSA 2GDRA 2CX4A 1XW9A 2KHPA 1TW9A 4PUFC 1PQNA 3QFAC 1B4QA 1SD8A 4GQCA 4IP6A 2K18A 5CRDA 3BBYA 2N5AA 2VCVA 3R2QA 3TKRA 2OE3A 2FGXA 5ECIB 2DJ2A 2VCTA 2XHFA 1Q4JA 1YY7A 4L0UA 2TRXA 1GTAA 3GTUB 4MJBA 2REMA 1Z6NA 1GTUA 1W89A 1OE7A 5FWGA 2E0QA 3QDNA 4IN0A 2X99A 2B6MA 22GSA 3TKQA 3I43A 1K3YA 5H5SA 4NXIA 1S3CA 1AAZA 3LSZA 1GNWA 4G2EA 4P3YB 4EE0A 3E9JB 1WMJA 4LMWA 2WJUA 1OC9A 3TUEA 4TR4A 4WR4A 2H6ZA 2CVDA 4QQ7A 4HS1A 2B5XA 4MF5A 3VWUA 3TRXA 4KX4A 4KB3A 1SJZA 3WT1A 5G1LA 5G31A 2HI7A 3G9BA 3QAWA 5CAXA 2PVOC 1I5GA 2HRNA 1Z6MA 4K0GA 4NV2A 1UC7A 3MWHA 5C00A 4IHUA 4ZIJA 5CRGA 1A8YA 2MZCA 1AW9A 2DC5A 5B7CA 3UVTA 1X5EA 2IWTA 18GSA 3DMLA 2WB9A 1TRSA 2HZFA 3E3EA 4YAPA 1YZXA 4MH3A 3UBLA 5G1KA 4AF2A 5DCGA 3FEUA 3KH7A 2EIQA 1FB6A 5EL8A 1WE0A 1WIKA 1VF4A 5D96A 2PGTA 1K0NA 3TRPA 4JE1A 4K7IA 3Q74A 4WF5A 1NHYA 2K8VA 3FYGA 4IW9A 3TKSA 3IPZA 3PINA 1OC9B 2CAIA 4G19A 3J7Yb 2RUEA 5D9WA 3WGDA 2P5RA 3KP9A 4X43A 3P2AA 3L4NA 3ISOA 2XC2A 3GL5A 4OCFA 1S3AA 3FR9A 3BOAA 4ISDA 2CAQA 2I4AA 2JU5A 1B9XC 3GH6A 4WEYA 1JLVA 1E6BA 3EVIA 4K2DA 4LMVA 2ALBA 2ZNMA 3D6IA 2R6KA 3CSHA 1N2AA 5D9TA 3F4TA 2QGVA 2D2ZA 4GXZA 1GSEA 2GLRA 4MJCA 3ZVJD 4TKYA 2NDOA 2AB6A 3ZIVA 1TI3A 2YANA 2VLVA 2ES7A 2HSHA 2F8FA 3CMIA 3ZMLA 2VAFA 4K7OA 4IELA 5IOWA 1GP1A 2JZSA 3ZYWA 11GSA 4HZ4A 2AJQB 4HEA2 1GUKA 3F6DA 4KUNA 1M2AA 4POLA 5KN0A 2N5BA 4TW5A 4NMUA 1ON4A 5D9VA 4IS0A 5DJLA 1BAYA 3C8EA 4L5OA 3CTFA 2L6CA 1SENA 2LRTA 5DCHA 1BJXA 3ERGA 3Q19A 2OJLA 4IJIA 1ACVA 2PPTA 2AAWA 5EVOA 1EEMA 4MJAA 3QAVA 2RM6A 3QOUA 3D4TA 2CV4A 4TR1A 4AJ6A 2JZTA 1J0FA 4TR3A 5LCZA 3F3QA 3HJMA 1KEBA 1GL8A 1A0FA 2B3SA 4LL4B 5LNKe 2DJKA 4MF6A 2GQKA 5ECPB 4G9HA 1A2MA 3HCZA 3ZFBA 2GQLA 1DE1A 4Z7XA 1ERWA 2MBSA 4PQ1A 3IE3A 3DRNA 1ST9A 3M9KA 3FZ5A 1M2DA 4BA7A 5J5NA 2H1AA 3GRXA 3ZZXA 1BX9A 3IR4A 1QQ2A 2LS5A 1G6WA 2X64A 4MCUA 5EPFA 2O7KA 2E2GA 2WRTA 3IBHA 4MMMA 3KP8A 4EUYA 1O73A 2DLXA 2VL2A 2H70A 2R5GA 3IOSA 4OMVA 1TU8A 4L5LA 1C72A 2H73A 2RIIA 1WP0A 4NV5A 4PUAA 4XHMA 2HYXA 3GSTA 2I1UA 4TR1B 1PSQA 3LWAA 4N0VA 2MMNA 3UIWA 1GH2A 2BTOT 4K8MA 4GQFA 2OE1A 2H74A 3EC3A 4ZBBA 3I6AA 2YN1A 5HR0A 2GTUA 2YWNA 4EC0A 4ML6A 1PD21 3IHQA 1X5CA 2H8LA 3G7YA 3VWVA 1O8XA 5E59A 4TXOB 3DVXA 5CNWA 5ID2A 3ZMKA 2RUFA 2HFDA 3TKPA 3CBUA 1TTZA 2P0GA 1USBA 3FHKA 5A4WA 1AC1A 1VRSD 4XRDA 3RBTA 1K3LA 6GSSA 2QKEA 4XCSA 1OE8A 1E2YA 1XVWA 4MLYA 2LTKA 2VD1A 3IAM2 1V98A 3ME8A 2MBTA 2FHEA 1MDJA 5HFKA 1YJ6A 16GSA 3KEBA 1K0DA 2M72A 1Z9HA 1QXHA 4KCAA 4FH8A 4ML1A 5ECMB 5CO3A 4I97A 5CP1A 2FCHA 3UVHA 1EOGA 4MABA 3TJGA 1XXUA 2F3MA 1T00A 3DKSA 1GUMA 5HR1A 4HJ2A 4Q5QA 4AJ7A 5IO2A 5DJMA 4RUVA 1R7HA 1G0TA 3KTLA 1N8JA 4MZCA 3I9V2 5E4WA 4D73A 2FD3A 5A4UA 1G7EA 1XWGA 5ENUA 5CREA 1FOVA 1HQOA 2HXKA 3IK7A 2C8UA 4ZILA 2M80A 1EGRA 4ZB9A 2AHEA 1ABAA 1JZRA 5ELGA 2C0FA 3MAKA 2C0GA 1PMTA 2R3XA 3UBKA 1SKSB 1B4PA 4EF0A 3GKXA 1F6MC 1SKRB 2L5LA 4TVEA 2V2GA 2I81A 1YEXA 2FWHA 1XIYA 4TOPA 2E7PA 1GNEA 2GGTA 5COHA 3IV4A 2VM2A 1GTIA 1U3IA 1QUWA 1A2LA 1JZWA 5ECOB 2H71A 3L78A 3KMNA 4DSRA 3M1GA 3HA9A 4ECIA 2FA8A 3GH9A 2PU9C 1YDKA 3APSA 1XFLA 1ZYEA 3A2VA 2H1GA 3TRQA 4EDZA 3H93A 5IMCA 4K9ZA 5B8AA 1PL2A 2HSYA 2EIOA 4KE3A 1A0RP 2B5YA 3DGQA 4V1Ap 1JLWA 2A4VA 4LL1B 4YH2A 5H5QA 3A3TA 2C80A 4ZBDA 4OFMA 1ERVA 4D73B 3WT2A 5D93A 2OA7A 2B5EA 1F9MA 4PNGA 3D0ZA 3SWLA 2YCDA 2R2JA 3IDVA 1GWCA 2PERA 2YJHA 2X8HA 4I6XA 4RQXA 1JZOA 1FB0A 3LYKA 1HNCA 4QL7A 4NWYA 1QFNA 1O81A 5F05A 5ECLB 1XW6A 4EKZA 1FW1A 3QAGA 1OYJA 3RDWA 4K6XA 5ABRA 1AQXA 4OD7A 1M7TA 4N10A 4F0CA 1BQ7A 5ECNB 3GSSA 1SD9A 1X0RA 2V1MA 1TK5B 4O32A 3UMAA 4KW6A 4AGSA 2IPAA 2YOIA 2L4CA 2P31A 1B9YC 1YF1A 4J56E 3CSIA 1XWKA 3F9UA 4MDCA 1PN9A 3ZVJA 2YWMA 2HNLA 2OADA 2FLSA 3Q6OA 2GT6A 2VCXA 5D9XA 3G7JA 4I2TA 1YKAA 3LGCA 1RK4A 4F2IA 4LLRA 1THOA 1Q98A 3IXRA 3F63A 1U6TA 3O76A 4IP1A 2IL3A 2PVQA 2CA8A 3FZ9A 4IGJA 4E8EA 2VCWA 4ZB8A 1GUHA 2YZUA 3UOMA 3GV1A 3U5RE 2R4VA 2DJ0A 3IK9A 4BVXA 2NBSA 1FO5A 2WGRA 3L9UA 1H4OA 2VD0A 3FR3A 3HYPA 3APQA 3KMOA 4OWYA 1TK0B 4O5RA 2PUKC 3ME7A 3LEFA 4DVCA 2GZZA 3N9JA 3TKSC 1DE2A 1U87A 1EWXA 5GSSA 1OKDA 2E2MA 3GMFA 1ZZYA 4HDEA 1GSYA 2X8GA 4WETA 1PKWA 4KDXA 3MNGA 2B1LA 2BJXA 2RLIA 2VL3A 5ECKB 4POKA 1K0BA 2LJKA 5AN1A 3A5WA 5H5RA 1K0AA 3FY7A 4ZL9A 2N5FA 4K0NA 2IMEA 1M9BA 3LORA 2MMZA 3CTGA 2PBJA 4KDUA 4WF4A 2EIRA 4GCIA 2C0EA 5B6MA 3ZLPA 4IQAA 4OFNA 4I2UA 3DWVA 3TKSE 3GYKA 2HLSA 2K6VA 1VF3A 1K0OA 4F9ZA 5GSTA 1UA5A 3W8JA 2YP6A 1R4WA 1K0MA 4FYBA 4ECCA 2MMAA 2IFQA 2WS2A 1ZOFA 1T8EB 2A2SA 1RQMA 3C1RA 3US3A 2X8CA 1XOAA 5D73A 4PURA 1DSBA 4ID0A 4V2MA 3Q18A 3HY2A 4HI7A 5IQYA 1R5PA 3BJ5A 4YAVA 5JWQB 4ZB6A 2G2QA 3VWWA 3VPTA 3D4MA 2KUCA 2LRCA 3D22A 6GSXA 3DIEA 2YPMA 4MP4A 2CQ9A 7GSSA 4ECJA 5KN2A 3GKMA 2AV4A 1GSDA 2JACA 1GSQA 4H86A 3TB2A 5IOXA 1A8LA 2CVKA 2LSTA 4XRAA 2LV3A 1NSWA 1FHEA 1MD3A 2CZ3A 3VPQA 3JCML 4JZQA 1GSSA 1JHBA 3H4KA 2DIZA 4I5QA 5ECRB 4MK3A 2B7KA 5DVBA 2IIYA 3S9FA 3WGEA 2IN3A 2KP2A 3ZIJA 4WKWA 5KN3A 5F0GA 3GURA 2DMMA 2OKAA 2IFQB 2TIRA 3ZL5A 4XTSA 2DJJA 5IIZA 4EL1A 3H8QA 4XIHA 1TK8B 2PWJA 2BMXA 3GN3A 5D8IA 2H66A 2I9HA 1PX7A 2R37A 4NAXA 2EC4A 2XBIA 3E0UA 4DSQA 2FY6A 3TGZA 1TRWA 1LBKA 3M9JA 1KTEA 3K8NA 4DSSA 5KEJA 4MPFA 4EXJA 1XWAA 2NTOA 2H1BA 2VL2C 2MYGA 1AQWA 1V58A 3L9SA 5ECQB 3IA1A 1SL1B 1X5DA 3P8WA 1MD4A 2H0GA 3ZREA 3O3TA 2V6OA 3C73A 3MDKA 13GSA 2FA4A 4RQRA 5B8BA 5A5KA 3UAPA 3HJOA 1OAZA 5J9CA 5IPGA 4IKHA 3RHBA 1FG4A 2Z9SA 4N0ZA 2VUPA 1TRUA 5J41A 4IBPA 3EU3A 1B48A 2HRFA 3N5OA 3PR8A 4MF7A 4KNDA 4TRXA 1GSUA 1UN2A 3ZITA 2YWIA 14GSA 1HNAA 4F0BA 3RHCA 4YQMA 1G7OA 1SK0A 1CQGA 2LRNA 4V2LA 5CRWA 5LD0A 1EP7A 2O89A 3UEMA 1X9WB 1XVQA 2AUVA 4GRFA 2YWOA 3VWXA 3G7IA 1ZMAA 4HU9A 1UVZA 1SL2B 3RAZA 1EGOA 1M2BA 4BVYA 2LJRA 3NIVA 4MPGA 3WGXA 2L59A 2ON5A 4KA0A 1X9SB 1MDKA 1WOUA 3M8NA 1SYXA 3GIXA 4XS1A 2J9HA 1SU9A 1WJKA 4FIWA 4Q5NA 3V1WA 1ZGNA 1AIUA 1EP8A 4IVFA 5J9BA 2KLXA 4IJ3A 2JADA 3EU4A 4XS4A 2WFCA 5F8BA 3TJFA 2H19A 4KSOA 2WCIA 5CRHA 3KH9A 3DEXA 2L4QA 5ID2B 1YQ1A 5ELAA 2HE3A 1OC8A 6GSVA 1G6YA 1PRXA 2H0IA 3VK9A 3DVWA 4KCEA 2TRCP 17GSA 3EMPA 3LJRA 3HZ8A 2LKUA 3M0FA 3HD5A 2DJ1A 1V9WA 2CVBA 1TJDA 1Z7PA 2GSSA 3H79A 1T1VA 1Y6EA 4GF0A 1K3OA 2V32A 5IPHA 4CHSA 4ZL7A 1O7UA 4OCEA 3L0HA 4HUAA 1I9DA 4PX1A 4G10A 9GSSA 1BEDA 3GX8A 1K0CA 1V40A 2CZ2A 3GL3A 4AJ8A 5DAKA 2LEGA 1QMVA 2H01A 1F3BA 4KDYA 1FVKA 3LG6A 2IMDA 4XS4B 1XWBA 4HQSA 2DJ3A 3WYWA 5HQPA 5IMFA 5FHIA 3HJPA 2WDUA 3QMXA 4FYUA 2KOKA 4EVMA 3VURA 1OC3A 3CRUA 4ZXGA 3H1NA 5GAND 2IMKA 2C3NA 4N11A 1AXDA 4YQUA 4PXOA 1PA3A 1XW5A 3EINA 4HJMA 3NZNA 4HOJA 4J57E 1JFUA 2VL9A 2B7JA 2FWFA 1TOFA 2OBKA 2OACA 5CYYA 4TR0A 1QGVA 4CDOA 1XZOA 4BPYA 1AUCA 6GSTA 3FRCA 4RI7A 2P5QA 4ILFA 2O87A 1F2EA 2K8SA 1T7PB 2IMIA 4KGIA 1U3AA 2GT5A 1ML6A 1WPIA 4N30A 5J3RA 4JR6A 5DAKB 1O85A 4ECBA 1PX6A 2C1YA 2GQMA 4HZ2A 3LFLA 4FO5A 3C71A 1XBSA 3C7MA 2H6YA 4MJEA 3PGTA 1ILOA 2VO4A 4O7HA 1M99A 5ECSA 5HFIA 1MDIA 3TOUA 5G2ZA 1SK1A 1R5AA 1SJIA 1Z7RA 5EY6A 5F06A 4NHWA 2FUG2 2HT9A 2ZCTA 3O6TA 5HR2A 2NPBA 1PGTA 5JWOB 1QK8A 1ZCPA 1F3AA 4POBA 2KP1A 4QL9A 5AISA 2YJ7A 2PN8A 5HR3A 2IJYA 1KBNA 3FK8A 3UARA 3L9VA 4KH7A 1VGLA 6GSUA 12GSA 3P90A 4TXVA 1OVNA 3A2WA 4ACSA 1IYHA 1KNGA 3GHAA 3APOA 3IAS2 2VOCA 1GSFA 4MA9A 4Q5FA 3D5JA 1LU4A 1Z3EA 1SKWB 1M9AA 3BCKA 1T4ZA 1NHOA 2F9SA 2QC7A 4O92A 4PGTA 5L71A 3ERWA 4K7NA 4RI6A 3LXTA 5DQSA 1O6JA 1HYUA 1MEKA 4NPBA 1ERUA 1YF0A 2OBIA 3IRAA 3DXBA 3P7XA 4X1UA 4V1Ag 5DBQA 3KZQA 2JL4A 3FKFA 2C0DA 2LUSA 2LNTA 1SJ6A 1XPVA 3LQ7A 3RPPA 1TXXA 3KM6A 1J9BA 1TKDB 2LNSA 1HD2A 2YV9A 2LQQA 1MTCA 4KAEA 4OFTA 5DDLA 4EDYA 2CX3A 2C3QA 2ZUPA 2DBCA 1ZL9A 5F07A 2JSZA 2NVLA 4ZBAA 4L8EA 3CYNA 3KD0A 2H6XA 3CSJA 2M46A 1YKCA 2B1KA 1TI1A 1T4YA 3FR6A 4MZWA 2V6KA 1T3BA 4Q5RA 3MSZA 3HKRA 1X9MB 2JZRA 3EWLA 4JRRA 2XBQA 3GKKA 2V41A 4ZL8A 2LJAA 3VLNA 1Z5YE 5FT3A 3KIJA 1ERTA 3QR6A 1GLPA 2L6DA 3J7Yk 2VM1A 3M3MA 3ZFLA 3HZ4A 1F37A 3BCIA 5AIVA 2VCQA 3TJBA 1B8XA 4PNFA 2XPEA 2H30A 4JU5A 5IO0A 19GSA 5ECHB 5GAPD 1H75A 3DYRA 1J08A 3F4SA 5G5EA 1LJRA 2F8AA 4K1FA 4E8HA 3GFKA 4BL7A 4HU7A 4YQVA 2YV7A 5HFGA 2L57A 1EV9A 4GWRA 3F4RA 4I8BA 4JBBA 4L0WA 4PQIA 3HVVA 3KGKA 1OKTA 2L5OA 1NW2A 5DALA 4PQHA 1THXA 6GSYA 3SBCA 4KSMA 4OO5A 3W8SA 3ZRDA 2QSIA 2WZ9A 1VF1A 2DMLA 4X0XA 3LYPA 2MMOA 1A23A 1XOBA 3CXGA 1WRYA 4TXOA 4POMA 1A24A 1AQVA 1EOHA 1NM3A 2PMTA 4IQ1A 3EMXA 3HHVA 2GSTA 1EEJA 5B6NA 1W4VA 4WBJA 2H75A 3BD2A 3CRTA 3GNJA 2JSYA 3HDCA 1TRVA 2GZPA 4HQZA 3RPNA 3TJJA 4NHZA 1XWCA 4GLTA 3AY8A 2YNXA 2GS3A 2FNOA 2VIMA 4BWQA 3PH9A 4GSNA 3HXSA 5AGYA 4TN8A 5DALB 1WWJA 5KN1A 3VFIA 5IMVA 3UJ1A 10GSA 3OR5A 4MH2A 1S3DA 3KJYA 1EZKA 2H76A 1V2AA 5JCUA 6GSWA 1URMA 2J23A 1PL1A 5IMZA 1R26A 5C04A 1TU7A 4WXTA 1A2JA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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