2H71A

Crystal structure of thioredoxin mutant d47e in hexagonal (p61) space group
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIAEEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant D47E in Hexagonal (p61) Space Group
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 33
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h71A00
5FT3A 2ON7A 4MF7A 1KNGA 2YWIA 3NIVA 4MZCA 4DSQA 1XVQA 2C3TA 5G5EA 3GFKA 3LQ7A 3QDNA 1IYHA 2N5FA 1E6BA 4IJIA 3A2WA 3QCPA 1OAZA 2RM5A 3NOFA 4F03A 2XBIA 1UC7A 2FCHA 1B9XC 1SD9A 1SJ6A 5HR3A 3A3TA 2MZCA 4BWSA 2EIQA 1TP9A 3G7YA 2G2QA 3I9V2 1KTEA 1A23A 3D4TA 2H1BA 5D9VA 1H4OA 1WJKA 4PQIA 3UBKA 2XHFA 5G31A 4XS1A 4V1Ap 1MTCA 3H8QA 2K9FA 4TXOA 4MK3A 3ME8A 2GQLA 5DAKB 3PGTA 2GVPA 4K7OA 1TI3A 5L71A 4K7NA 3BCIA 1VF4A 3WYWA 1NW2A 10GSA 4RUVA 4FYBA 3TJKA 3LGCA 3M3MA 4CDOA 2X8GA 1FAAA 1JZDA 4TVEA 4ML6A 5EL8A 3TJBA 4YAVA 3IOSA 2YWMA 3ZMLA 5IOWA 1PD21 2WCIA 4FYCA 2H6XA 3QAWA 1TRWA 1W89A 1SD8A 5F0GA 3ZMKA 1SL1B 1MDKA 5INYA 1PA3A 1G7EA 14GSA 3APQA 1G6WA 2HXKA 3F4TA 2LJRA 4QL7A 2P5RA 1QGVA 1F37A 4HI7A 2IN3A 3F6DA 4I97A 2VL2C 1AIUA 4EF0A 5ABRA 5A4VA 1GL8A 2DJ3A 3WD6A 2F8AA 4E8EA 3DYRA 3FY7A 3H1NA 4ZL8A 4IW9A 5IMFA 3DD3A 4XHMA 3HKRA 2L5LA 3P90A 2JACA 4K9ZA 3DVXA 4ZL7A 3A2VA 4L5LA 1AUCA 1I5GA 2E2GA 3ZIJA 2YP6A 3HCZA 1SKRB 1RW1A 3TGZA 2K18A 2CVKA 2DJ0A 2IPAA 3LWAA 3L9VA 1SL2B 2CVBA 1X5EA 2H66A 3HA9A 3FR3A 3CBUA 3D21A 3QPMA 4AGSA 2K6VA 2L5OA 3I69A 3WT2A 2MMZA 3GYKA 2GS3A 1TI1A 2TRCP 4MP4A 2K8VA 3DVWA 3US3A 4Z7XA 1Q4JA 2GGTA 3QMXA 2DC5A 1ERWA 3W8SA 3ZREA 1TTZA 2CV4A 3APOA 3VWUA 1YF0A 2C8UA 1G7OA 5G2ZA 4MPGA 3C71A 1M9AA 4MPFA 2M46A 3IBHA 3TDGA 3VURA 2VCXA 2BJXA 3IC4A 2C0GA 2HSYA 4ECBA 2MYGA 2X8HA 5IIZA 2PVQA 1EGOA 5LCZA 2H1AA 1DSBA 1AW9A 4MA9A 1UVZA 5ELGA 3CSJA 4DSSA 3N5OA 2O89A 1Z7PA 4X0XA 4MJAA 6GSXA 1O81A 3O6TA 3EWLA 2HRFA 4H86A 5AIXA 5G30A 2YNXA 2CZ2A 4GQCA 3GL3A 3S9FA 2VD1A 1BYEA 1EOHA 2H1DA 3HVSA 2GTUA 1GWCA 1N8JA 2F3MA 1O7UA 3TJGA 2MMOA 3F3QA 5CRGA 2M80A 3L4NA 4V1Ag 3BOAA 5HFIA 2HNLA 4WF5A 4WR4A 4MJCA 1FO5A 2IL3A 1YKCA 3C7MA 1AQVA 1K3LA 3IAS2 4EO3A 2H76A 4KAEA 2YANA 1SL0B 4RI7A 2ES7A 1NHOA 3ZRDA 1WMJA 4HZ2A 4YQVA 5HFGA 4FH8A 2C0DA 1BX9A 3P7XA 4N0VA 1MEKA 3TKSE 3FHKA 3HY2A 2QKEA 2R2JA 3L9SA 3C8EA 4IJ3A 3UAPA 4ZXGA 2YWNA 2VCZA 2IMIA 4V2NA 1THOA 1UA5A 5B6NA 1KBNA 1QUWA 2X99A 1O8XA 4TRXA 3LYKA 1U88A 1EV9A 2NDOA 2H30A 5ECLB 1TKDB 4POLA 5DBQA 2PN8A 3V1WA 3VI7A 2F9SA 5ID2A 2LJKA 2LS5A 4BVXA 2CT6A 1O73A 3W8JA 2C3QA 5H5QA 2RUFA 3VPTA 5ECIB 4LMWA 1EP8A 1M9BA 2N5AA 5JCGA 1F2EA 1A8YA 4MCUA 2AJQB 5ID2B 1EV4A 3KM6A 5GZZB 2YV9A 4Q5RA 3BCKA 3HZ8A 1XW5A 2B5YA 4HZ4A 3UBLA 5A5KA 4HUAA 1PX7A 1R26A 5IM9A 1K0DA 2F8FA 5AISA 5LD0A 3IDVA 4GCIA 1F3BA 3UARA 3W6GA 1BG5A 5AIVA 2RUEA 5ECSA 4XCSA 1X5CA 1O85A 1K0OA 1PQNA 1O6JA 4JU5A 1XBSA 4K7IA 1T1VA 1BJXA 3FW2A 5H5SA 4GXZA 2O87A 2DJKA 6GSTA 2YOIA 16GSA 1JZWA 2YV7A 1FOVA 2LV3A 1GSEA 4TR1A 1EOGA 3IR4A 1URMA 2YN1A 6GSUA 3UEMA 3EU4A 1M2BA 1J9BA 4BA7A 1F3AA 3QOUA 2ZUPA 1DUGA 3BJ5A 4KNDA 2PBJA 5IPHA 4OFTA 4O32A 2E2MA 4GQFA 4LA1A 3AY8A 3Q19A 2HYXA 1OC9A 3G7IA 1SENA 3KP8A 1FG4A 2WULA 2VM2A 1ACVA 1OC9B 1X9SB 5B8BA 2GSQA 3HZ4A 9GSSA 1Q98A 4F9ZA 4IQAA 4GSSA 4PNGA 3VI5A 3TKSA 2V1MA 5HR2A 5JCUA 4HQZA 4Q5NA 3IAM2 3GKMA 3UMAA 2IMFA 4NWYA 1VRSD 4OCEA 2PU9C 4GWRA 4J57E 2XPEA 3ZTLA 3VK9A 1X9WB 1XW6A 2OE0A 4NMUA 2MBSA 3WT1A 1X9MB 1K0CA 4K2DA 5F06A 1XXUA 3HJMA 3FR6A 3LYPA 4ZIJA 5C00A 2JADA 4DSRA 4EE0A 2F51A 2I1UA 1YDKA 3HJPA 2XC2A 4TR0A 1M7TA 2C0EA 3VWWA 3WGEA 3I6AA 4IP1A 2WZ9A 4WBJA 1XCCA 5DJMA 4HEA2 2ON5A 1JHBA 3IV4A 1HNAA 1QMVA 4J2FA 4EXJA 2DBCA 1XW9A 4HJ2A 4HJMA 2CX4A 3ZVJD 5DAKA 4JZQA 2VUPA 3H79A 3GKNA 2LNTA 3TKPA 3MAKA 1GSDA 1FHEA 3UJ1A 2VLVA 5DQYA 1YEXA 1XIYA 4YAPA 3HVVA 2LJAA 4PX1A 1XOAA 1DE1A 3P8WA 5JCWA 4EKZA 2VD0A 2H74A 5J9BA 1ERTA 1A0FA 4HDEA 2X8CA 4TOPA 4KA0A 4PUAA 5F07A 1TK5B 4L8EA 5D73A 4NV5A 2YWOA 2O8VB 1GP1A 3M9JA 3GH6A 1M2AA 2FD3A 2V41A 2RIIA 4IKHA 1T4ZA 4G2EA 1GNEA 3Q6OA 3F4SA 4GLTA 2WS2A 1I9DA 4L5OA 1GSFA 4TW5A 3TUEA 5D9WA 1V57A 5JWRB 3PH9A 3ZFLA 3HD5A 2YJ7A 2VL9A 5D9XA 1U3IA 2LEGA 4IGJA 6GSSA 5B6MA 2P0GA 4HQSA 2V6KA 2OE1A 2H75A 3GRXA 1AQXA 5CNWA 4G9HA 3FR9A 2HSHA 2IFQA 4ECJA 5D96A 3TOUA 4LL4B 2WJUA 2GZYA 3D22A 4I2TA 2VAFA 5G1LA 1PMTA 4RQXA 2DMLA 1GSYA 1EGRA 1YZXA 3LEFA 3QFAC 2A2SA 2H8LA 1SK1A 1EZKA 2HI7A 3DKSA 4D73B 2H6ZA 1TJDA 2IFQB 3ISOA 5AGYA 3F3RA 1V2AA 2JSYA 2Z9SA 3GKXA 1T3BA 4ULXA 2TRXA 3O3TA 4POBA 1TDIA 1GLPA 4YQMA 1U6TA 5DJLA 1S3AA 2R6KA 2QGVA 1AAZA 2FWFA 2B6MA 1ERUA 1FVJA 1R4WA 3KTLA 2IWTA 1J08A 3L0HA 1ZCPA 2I4AA 4OFNA 3LXTA 1GSQA 4N10A 2QC7A 5F05A 1R7HA 2OKAA 3CRUA 3H4KA 4MZBA 3LG6A 3F0IA 4K0NA 2ZNMA 5H5RA 5IO0A 11GSA 4EDZA 4MDCA 4NHWA 2MBTA 4AF2A 4LL1B 3EURA 1WPIA 1EWXA 5CYYA 4X43A 1PL1A 1WIKA 3CYNA 1M2DA 1WE0A 1JZOA 1OC8A 4N11A 2RM6A 5CO3A 5EVOA 3FYGA 5JWQB 2H71A 2EIRA 2OE3A 2YZUA 1A24A 3A2XA 1XWBA 3JCML 3KJYA 2VM1A 2H0GA 1VGLA 1YY7A 1A2MA 3J7Yk 5D9TA 5CRHA 1EEMA 4TXVA 2DLXA 1XVWA 1TU8A 3FZ9A 2ZCTA 3C1RA 3GMFA 2FWHA 6GSYA 4BVYA 2J23A 2R37A 2B5EA 1OE8A 3DGQA 3E9JB 5LNKe 3TKRA 3KGKA 4RI6A 4IVFA 2AHEA 5ECOB 1K0BA 3GL5A 2DJJA 2JZRA 2L57A 3ZIVA 5ENUA 3KCMA 1LJRA 3RPNA 1THXA 3HDCA 3R2QA 3HXSA 1OC3A 1SU9A 1ML6A 1O8WA 4IELA 2NPBA 5F8BA 3ZFBA 2G0FA 4QL9A 3I43A 4JR4A 2HT9A 5HFKA 3PINA 1ON4A 1ZMAA 4EVMA 2JZSA 4CW9A 3LORA 1GULA 1XWKA 2GT6A 4V2MA 2JZTA 1XWGA 3O76A 4KCEA 5KEJA 4KGIA 4K6XA 3TRXA 3U5RE 3EYTA 1G0TA 3ZL5A 1QFNA 3KZQA 3KTBA 2FGXA 3EC3A 3EE2A 3HVXA 4DEJA 3GIXA 2KP2A 2A2RA 1XWCA 3D4MA 3P2AA 4AJ8A 3QR6A 1K0AA 4XTSA 1XFLA 4EUYA 4WEYA 1ERVA 1GUKA 2E7PA 4OMVA 4LLRA 1Y25A 4OO4A 4ID0A 4GSTA 1X0RA 2EIOA 5C04A 1J0FA 1BAYA 2FHEA 1A0RP 2LKUA 4BPYA 1SKWB 3H93A 1GTUA 2FUG2 2FA4A 2H1GA 4V2LA 4YH2A 3UOMA 4BWQA 5IMDA 1CQGA 3TKQA 4K0GA 2B7JA 1MD4A 5DQSA 3LXZA 5GSTA 1ZYEA 4P3YB 3IXRA 5FWGA 3GURA 5J9CA 4HU9A 5DDLA 4KCAA 3ERWA 4PURA 3KXOA 3LSZA 1USBA 3KH7A 5ELAA 1G6YA 2MMAA 3BBYA 5CAXA 2OADA 3VWXA 1X5DA 3ERGA 4G19A 3QAGA 3TB2A 3KD0A 2B3SA 3GSSA 3CSHA 1W4VA 1GUHA 20GSA 1FW1A 2CAQA 3MDKA 3RAZA 4F0BA 4J56E 3ZZXA 4K8MA 5A4WA 4MABA 3GX8A 2VO4A 2YZHA 3M0FA 2KHPA 1TXXA 3F4RA 5IO2A 4O7HA 3VLNA 5ECKB 6GSWA 3VWVA 18GSA 3HHVA 3F8UA 5GSSA 1XPVA 1ZGNA 1B9YC 4OWYA 1YQ1A 5AN1A 3ED3A 2KLXA 4ZL9A 2CZ3A 1HQOA 22GSA 1DBYA 1Z6MA 3A5WA 4OD7A 4ZB8A 3GX0A 2JSZA 1AQWA 1UN2A 2HE3A 2IMDA 2I81A 1QK8A 4ILFA 2B7KA 2M72A 2H19A 3G9BA 4PQ1A 4KE3A 2CAIA 1U87A 4K1FA 1HNBA 4AJ6A 4XRDA 1K0MA 5IMCA 3TJFA 1OE7A 1HD2A 2WGRA 1AC1A 12GSA 2H0HA 2JU5A 1TRSA 3U6VA 2CX3A 2L6CA 5DALA 4FYUA 3APSA 3CSIA 2PGTA 4ZBAA 4YQUA 3GTUA 3N9JA 5KN3A 2PVOC 3KMOA 3OR5A 3MSZA 5G1KA 1N2AA 2DIYA 1B4QA 1CQHA 3ZITA 5CRWA 5D8IA 5DVBA 1T7PB 2NTOA 3GUSA 5DALB 2AAWA 4WKWA 4GF0A 3GKKA 4Q5QA 2P31A 3UL3A 1TK0B 4ZB9A 3GTUB 4WXTA 2NBSA 1PX6A 5KN2A 5J41A 1YKAA 2VOCA 5DCHA 4ACSA 2L4CA 1PN9A 1T8EB 4ZILA 4MLYA 3D6IA 3ZLPA 2FWGA 5E59A 2VL3A 3VPQA 2FWEA 1WWJA 4GSNA 3TJJA 4ZBBA 5ECNB 1GTIA 2IIYA 4NPBA 2PPTA 5IPGA 2VCVA 1VF3A 1E2YA 4PGTA 3EMPA 5DCGA 4ISDA 3DIEA 13GSA 2HRNA 2VIMA 3DRNA 5B8AA 4JRRA 5FHIA 2HZFA 1S3DA 2A4VA 1SYRA 1Z6NA 2IMEA 2O85A 2AB6A 4IBPA 1OVNA 3MWHA 4ZB6A 3NZNA 2H73A 1SJIA 2LRNA 4OFMA 1A8LA 3RDWA 1ST9A 5J4UA 1SK0A 3CMIA 1VF2A 1Y6EA 4X1UA 3D5JA 3IRAA 2V32A 2FNOA 1ABAA 4BL7A 1GNWA 2FA8A 4ZBDA 3IE3A 3G7JA 3CTGA 2YJHA 2H0IA 2C0FA 4MH3A 4GTUA 4MZWA 4TXOB 5B7CA 2HZEA 2OBKA 6GSVA 3RHCA 2L4QA 1YJ6A 2WDUA 4QQ7A 2HZEB 4WF4A 5JWOB 1Z5YE 2ALBA 4L0WA 5A4UA 3TKSC 4AJ7A 3TOTA 2R4VA 3E3EA 1XZOA 4XRAA 1PKZA 1M0UA 4POKA 3ME7A 4O92A 4HU7A 3WGXA 2VLTA 4KH7A 1R5AA 1C72A 4G10A 2I3YA 1OKTA 5GAND 1GTBA 3BD2A 4LMVA 2K8SA 3C1SA 4D73A 3F63A 5ECPB 3IK9A 1BQ7A 3DWVA 2D2ZA 5IMVA 1FB0A 4WR5A 4IS0A 1RQMA 4GRFA 1B48A 1NM3A 1QXHA 3DMLA 1ZYQB 3KEBA 4ML1A 3RHBA 2FLSA 4PQHA 1K0NA 1GTAA 2LUSA 3EVIA 2EC4A 1Z9HA 1YEPA 4MMMA 1TK8B 2WB9A 3Q74A 5CREA 1V58A 1ZOFA 1B8XA 2IJYA 1B4PA 4MH2A 4I6XA 1XOBA 5KN0A 1SKSB 4Q5FA 19GSA 3LFLA 1PRXA 4N30A 4IQ1A 2XPDA 3CRTA 2MMNA 3GN3A 2PERA 3RBTA 2NVLA 5EY6A 1NSWA 7GSSA 1FVKA 4TKYA 2PUKC 2OA7A 2R5GA 1JFUA 2GSRA 3QD9A 5J3RA 1FB6A 1A2LA 3GNJA 1Z3EA 1Z7RA 4FO5A 1VF1A 1EP7A 4DVCA 2VLUA 2VCWA 4EL1A 2GDRA 4KDXA 2FY6A 3MNGA 1V9WA 4KSMA 2LSTA 3KIJA 1T4YA 3CXGA 4XS4A 3FEUA 1GLQA 5ECQB 3C73A 3TRQA 3LJRA 3EU3A 3KP9A 2LRCA 4KDYA 1GUMA 3DXBA 4ECIA 1SYXA 2GLRA 3UIWA 4XS4B 4KB3A 3IA1A 4WETA 3EINA 4E8HA 2DJ2A 4EDYA 4TN8A 2LTKA 3GA4A 5E4WA 4MF5A 2LQQA 1R5PA 4IN0A 4PNFA 1TRUA 5IOXA 2R3XA 1YF1A 2OBIA 1JLWA 1LBKA 4I5QA 1MD3A 4DSSB 3M9KA 3RPPA 1HNCA 2J9HA 3QFBC 2AV4A 2AYTA 1GH2A 1S3CA 4F0CA 1M99A 4TR4A 5IMAA 4TR3A 5G5FA 3F9UA 2OACA 2GZZA 1GSUA 2X64A 3HJOA 4XS6A 5HR1A 1F6MC 3KH9A 2C3NA 1TRVA 3M8NA 3D0ZA 3ZVJA 4PUFC 1LU4A 5HQPA 4JE1A 3WGDA 3FZAA 4NHZA 3DEXA 2L59A 8GSSA 4I2UA 4JBBA 5KN1A 2KP1A 1T00A 5ECRB 3UVHA 1A2JA 2OJLA 3J7Yb 3F6FA 1KEBA 1F9MA 5ECHB 4NXIA 2GQMA 1WRYA 1HYUA 2BTOT 2GSSA 2H72A 3GHAA 1XWAA 3M1GA 4CHSA 2DIZA 2N5BA 2DSAA 3E0UA 4N0ZA 2C1YA 2I9HA 3KMNA 5COHA 2PMTA 1NHYA 4I8BA 2GT5A 2C80A 2CA8A 1PGTA 1IYIA 4F82A 1V98A 4MJEA 3PR8A 4ECCA 2WRTA 2B1KA 2V2GA 4NV2A 2H01A 2WFCA 2HLSA 1ZZYA 1GSSA 3VFIA 5CP1A 5ECMB 3ZYWA 4XIHA 3IPZA 3ERFA 1TU7A 4KSOA 1OYJA 3FRCA 3TCOA 2IMKA 3GV1A 3K8NA 4OO5A 2VCQA 1PL2A 2DJ1A 3SBCA 3FKFA 1TOFA 4JEDA 1RK4A 2GZPA 2KOKA 4NAXA 2VCTA 4F2IA 3IHQA 1TW9A 2DMMA 4IP6A 4HOJA 2TIRA 3HYPA 3FZ5A 5J5NA 1ILOA 5D93A 3Q18A 5IMZA 1GRXA 1MDJA 5EPFA 4KX4A 1EEJA 1JLVA 2AUVA 2LRTA 2HFDA 1U3AA 4KDUA 1H75A 3EMXA 2L6DA 3TRPA 1JZRA 1WOUA 1BEDA 2P5QA 1WP0A 2E0QA 2XBQA 2C4JA 2CQ9A 1K3YA 1PKWA 4FIWA 5IQYA 2H70A 4O5RA 1QQ2A 4KW6A 4TR1B 1K3OA 1SJZA 1MDIA 4MJBA 4EC0A 2O7KA 3FK8A 3GSTA 4JR6A 2YPMA 4POMA 3FZ4A 17GSA 4IHUA 1OKDA 2LQOA 2BMXA 2GQKA 2B1LA 1V40A 4RQRA 3L78A 2YCDA 1ZL9A 1PSQA 2H6YA 4OCFA 3IK7A 1DE2A 5GAPD 2QSIA 2LNSA 2B5XA 2REMA 4MF6A 2VL2A 3CTFA 3SWLA 2RLIA 2GSTA 2JL4A 4WBRD 2PWJA 4HS1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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