2H8LA

Crystal structure of the bb' fragment of erp57
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
PASVPLRTEEEFKKFISDKDASIVGFFDDSFSEAHSEFLKAASNLRDNYRFAHTNVESLVNEYDDNGEGIILFRPSHLTNKFEDKTVAYTEQKMTSGKIKKFIQENIFGICPHMTEDNKDLIQGKDLLIAYYDVDYEKNAKGSNYWRNRVMMVAKKFLDAGHKLNFAVASRKTFSHELSDFGLESTAGEIPVVAIRTAKGEKFVMQEEFSRDGKALERFLQDYFDGNLKRYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the bb' Domains of the Protein Disulfide Isomerase ERp57.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A3
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
total genus 64
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2006-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h8lA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h8lA02
2DMLA 2M46A 1O6JA 1R5PA 3ZIJA 14GSA 2YOIA 1K3YA 1ERTA 4AJ7A 1ERWA 4GTUA 4MA9A 2FNOA 2C0EA 2WCIA 3Q18A 4L5OA 5IOWA 1A2MA 4F0CA 1BYEA 5HFGA 4HS1A 2F8AA 2VCZA 2VL9A 4TW5A 2FUG2 4PQIA 4TRXA 1MDJA 2JZSA 1J08A 2R6KA 1BJXA 2H76A 2OACA 4MZCA 2XBIA 4IJIA 4O5RA 1GNEA 4IP6A 1FAAA 5D9WA 3LJRA 3GIXA 3EU3A 4KSOA 4TVEA 1NHYA 2B5YA 3EINA 3ZITA 2DJ3A 1A23A 4KA0A 4MF7A 1PX7A 4O32A 4HJ2A 4JZQA 5EPFA 5IOXA 3H79A 4KNDA 5IPHA 2AB6A 2MMOA 3P7XA 2NTOA 3TOUA 4WF5A 2KOKA 3IPZA 1S3AA 5J9BA 3Q74A 4ZL8A 5DVBA 5B6NA 3GN3A 4DSRA 1QUWA 1I5GA 1USBA 1AUCA 3M3MA 2NVLA 3HJOA 3J7Yb 4N10A 2AUVA 2R3XA 2V2GA 2H1AA 2PVOC 3ZIVA 4X43A 3D22A 1WMJA 2YWIA 4MDCA 4EXJA 4JRRA 4ZL7A 4G19A 2VO4A 1ERVA 4PQHA 3QR6A 1HD2A 1SJZA 5CRHA 3GX0A 1S3DA 4YQMA 4POBA 4TOPA 1IYIA 1U88A 1SL2B 3CBUA 2JSZA 2FCHA 3DIEA 1M99A 1KEBA 2B5XA 4J57E 1DE1A 1JHBA 2OE3A 1XXUA 1K0BA 1MD3A 5G30A 5IMZA 1UVZA 5ECIB 2DBCA 1V2AA 3C7MA 3HA9A 1JLVA 4MJBA 3F63A 4G2EA 2QC7A 4E8EA 4ECCA 3GKMA 1Z5YE 4KDUA 3F4TA 1Z7PA 2HSYA 3IDVA 2QKEA 3HJPA 1T4YA 3KEBA 1O73A 3FW2A 3GFKA 3PGTA 1OC9B 1FHEA 3KMNA 3ZVJA 3HY2A 3L78A 4KH7A 5F06A 3P2AA 2MMNA 4FYBA 2VM1A 2E0QA 4F0BA 1EGRA 3D5JA 4WR4A 4YAPA 1WPIA 1Y6EA 5ECQB 1OC9A 1QFNA 2F8FA 3DGQA 1XVWA 2YCDA 1QQ2A 3D0ZA 1ON4A 4MJAA 3UJ1A 1AXDA 3F3RA 3HJMA 2LNSA 4FH8A 1Z3EA 3E0UA 9GSSA 1YJ6A 20GSA 1LU4A 3IAM2 3VWVA 4GQCA 4XHMA 5FT3A 3DEXA 1SYRA 3S9FA 5ID2B 1XWGA 1G7EA 2REMA 3H93A 3KCMA 2PN8A 5D93A 1R4WA 3Q19A 2DIYA 4XIHA 5G5FA 2GQKA 2OA7A 2LS5A 4MLYA 2LKUA 2DJ0A 2FA8A 4G10A 2WRTA 5ID2A 1OYJA 2BMXA 3HXSA 2H73A 2MBTA 5HFKA 1J9BA 3VK9A 4IQ1A 3H1NA 2E2MA 2L59A 4XS4B 4N11A 1KBNA 2CZ3A 2HRFA 1ZGNA 1QXHA 3UVTA 2YP6A 3KH7A 1AQWA 2H66A 3WGDA 4GSTA 5JWOB 2F9SA 1DUGA 2NDOA 1PMTA 3A5WA 4Q5QA 4MK3A 4XS4A 2GDRA 2PVQA 1K3LA 1TP9A 2GT6A 1B9YC 3GHAA 4N0ZA 3LXZA 4GWRA 4ULXA 4ECIA 5B6MA 3KH9A 5ABRA 3UIWA 2OKAA 3GH6A 1TTZA 4E8HA 1EEJA 3D21A 2HRNA 1LJRA 3BJ5A 1T1VA 2F3MA 4BL7A 2YWNA 2CQ9A 2HXKA 4MZBA 4PNGA 2LTKA 3AY8A 1X0RA 5COHA 4OCFA 1R5AA 4X1UA 5AN1A 1YKAA 1Z6NA 2VCWA 4PX1A 5CREA 4KCAA 1JZDA 4ZBBA 1IYHA 4L8EA 3ZZXA 4K7IA 5G5EA 1GH2A 3UVHA 2HNLA 3LFLA 4KSMA 1PQNA 5G2ZA 4K0NA 1UN2A 2GQMA 1KTEA 1M2DA 1DE2A 3G7IA 2WGRA 2HSHA 2CAIA 2RLIA 4JR6A 4MJCA 4HQZA 12GSA 1FB6A 2B6MA 3M8NA 1R26A 4FYUA 3F6DA 2CX3A 4EF0A 5FWGA 1SL0B 4GLTA 2L4CA 1UC7A 5IIZA 3CSJA 2BJXA 2HYXA 4O7HA 2L57A 2VCVA 2K6VA 4NHZA 2H71A 4MCUA 2LRCA 2VD1A 5ECPB 5CP1A 2VM2A 1ML6A 3GKXA 2ON7A 3CXGA 1W89A 3KXOA 5A4WA 4RI7A 3GURA 4HEA2 3ZYWA 4TXVA 4ZL9A 2XHFA 1A8YA 2ON5A 1X5CA 3U6VA 2P5QA 3GSTA 4HJMA 1NM3A 10GSA 2CA8A 3A2VA 3WD6A 1EOHA 1PX6A 5AGYA 2LRNA 1PL2A 2M80A 1TW9A 2V6KA 1LBKA 1G0TA 5GZZB 4QL9A 2O85A 1GNWA 5G31A 3ERFA 2HI7A 1GTBA 2E7PA 4EL1A 1UA5A 3QCPA 2B7JA 3RDWA 2LQOA 5GAPD 1MTCA 1V9WA 4ILFA 3EVIA 1GSDA 1SK0A 2GGTA 1GSYA 3O6TA 2OE1A 6GSXA 1YZXA 4AF2A 2H75A 3APOA 4DSSB 3WT2A 5GSSA 3PINA 1QK8A 4WBJA 2CVKA 3F6FA 1GSQA 5IMAA 2PGTA 2MMZA 3CTFA 3FR6A 2N5AA 4IKHA 1NHOA 3EMPA 3GV1A 3IOSA 4OFNA 5D73A 4K6XA 1X5DA 4DSSA 4ZB9A 1BEDA 3VPQA 5EL8A 1TXXA 2A4VA 5EY6A 1NSWA 2VCXA 1GSUA 2LUSA 4IVFA 2I1UA 5D9TA 2IFQB 3VPTA 4HDEA 1A8LA 2PU9C 1ZOFA 2QSIA 4ZILA 4WKWA 1SL1B 1SKRB 5C04A 4O92A 2X8HA 3TGZA 4EKZA 3DVXA 4V2NA 4EDYA 2GZZA 4BVXA 4POLA 1G7OA 5J4UA 2IFQA 3U5RE 4K8MA 22GSA 4NWYA 3KP8A 4NXIA 4WEYA 2WJUA 2KP1A 5AIVA 4ISDA 3QAGA 4PUFC 2L5LA 3FR3A 3LYPA 5F05A 4J2FA 3F4SA 4EVMA 4QQ7A 3UMAA 2FHEA 5HR2A 3E3EA 1U6TA 2GLRA 6GSWA 4I6XA 4OD7A 4I2TA 2M72A 3LG6A 2PBJA 4V2MA 2LJRA 3UBLA 2DMMA 2CAQA 1FB0A 3W8JA 4XTSA 2ZNMA 4NV5A 3GYKA 1EOGA 2JU5A 2K8VA 1QMVA 2FWFA 19GSA 4BPYA 4PNFA 3Q6OA 1XFLA 3QD9A 1K3OA 2TIRA 5H5RA 4OFTA 1SD9A 2VL2C 1T00A 4HU7A 3VWUA 2GZYA 4EC0A 5IPGA 1PL1A 5D8IA 4FIWA 5INYA 3UL3A 3WGEA 3P90A 1EGOA 5E59A 3BCIA 2PERA 5G1LA 2RM5A 1YEPA 5D96A 3GL3A 3GH9A 1GL8A 3SBCA 3IC4A 1SD8A 1DSBA 2L6DA 4OO5A 1OAZA 2H0IA 2RUFA 2K9FA 3A3TA 3LQ7A 4POKA 3VI7A 2GSRA 1U3IA 2C0DA 4GSSA 3I69A 3QPMA 2IN3A 1F3AA 2D2ZA 3GMFA 3LEFA 3DD3A 5C00A 3EC3A 5HFIA 2YV7A 2A2SA 1HNAA 4ID0A 5J3RA 1T4ZA 1THOA 2ES7A 1V98A 3QMXA 4ZBDA 3LWAA 1JZRA 2A2RA 5FHIA 4F82A 5ECRB 4I97A 4MMMA 3BD2A 4K0GA 5A4VA 2CX4A 2DLXA 3WYWA 3I9V2 1S3CA 1K0NA 1G6YA 2BTOT 5CRWA 1GULA 1XW6A 2KHPA 4PQ1A 2MZCA 1O7UA 3VWWA 3LORA 3TJJA 4KAEA 1TRSA 2DJKA 4EUYA 3I6AA 3EE2A 1PSQA 3IK7A 4Q5FA 3QDNA 4GXZA 3GSSA 4DVCA 3IAS2 1ERUA 1U3AA 3WT1A 1U87A 2I81A 2VCTA 2VLUA 2K18A 1FOVA 3KTBA 2V32A 1JLWA 1A2JA 3C8EA 5J9CA 2K8SA 2ZCTA 4KUNA 3E9JB 1X9WB 2ZUPA 17GSA 4AJ6A 5LNKe 2V1MA 4X0XA 4AGSA 2CVBA 5JWQB 3IHQA 6GSTA 3KM6A 3TKPA 3G7JA 2IMDA 3L4NA 6GSVA 1M9AA 2DC5A 3ZMLA 1XIYA 1I9DA 2JADA 1WE0A 3GA4A 2LSTA 2O87A 1GSFA 4EE0A 3HHVA 3KP9A 5F8BA 2HZFA 3QAWA 4LL4B 1ABAA 1AW9A 2KUCA 2R5GA 4K7OA 4KE3A 2TRCP 4L0WA 5ECNB 2FA4A 3FEUA 3HVSA 1B8XA 1YEXA 3HVVA 1MEKA 2C3NA 4TN8A 5B7CA 3HZ4A 1B9XC 3GL5A 1XBSA 4IS0A 2WULA 5DAKB 2YWOA 3US3A 2J23A 2VL3A 2H01A 1PA3A 2H6XA 3M9JA 5GAND 4NMUA 4KX4A 2WS2A 4BA7A 5DALB 3TDGA 2YJ7A 2H30A 5DAKA 2DIZA 4MABA 3KJYA 1DBYA 1F3BA 5JCGA 1JFUA 11GSA 2DSAA 2P31A 5CO3A 2O7KA 5DALA 2AV4A 3GNJA 1EP8A 2YJHA 2YZUA 5IMCA 3FZ5A 3PH9A 1GTIA 1V57A 2AAWA 3IR4A 3MAKA 1TK5B 2CZ2A 1K0AA 3L9SA 3TKRA 2CV4A 4OWYA 2E2GA 3HDCA 1OVNA 4JEDA 1EZKA 2RUEA 1XOAA 3VURA 1E6BA 3C73A 2H74A 3G9BA 3IK9A 5ECSA 3DVWA 4TR0A 5EVOA 4WF4A 1TRUA 3NOFA 2B3SA 1XW5A 4PURA 7GSSA 4YAVA 3TKSE 1R7HA 1SENA 1GUMA 3QOUA 4HQSA 4K1FA 4LA1A 1B48A 1OKDA 3RHBA 1SYXA 3LGCA 1Y25A 2FLSA 3HVXA 3KMOA 3HYPA 2H1BA 3IV4A 1XPVA 2NPBA 16GSA 4POMA 1AIUA 2H0HA 1YKCA 1WWJA 4ACSA 4RI6A 5J5NA 1T8EB 4JE1A 1A2LA 1T3BA 3O76A 2VOCA 4NPBA 4HZ2A 5ECKB 2B1KA 1V40A 5DQYA 3APSA 1BQ7A 4RQRA 1N2AA 1FW1A 3M0FA 2I3YA 3BOAA 3TCOA 4ECBA 1RQMA 2C4JA 1J0FA 3KTLA 3LYKA 2AJQB 4IGJA 2X8GA 3DRNA 5A4UA 3FYGA 4XS6A 1WRYA 1TKDB 4IW9A 1OE8A 2RM6A 2B5EA 4F03A 1TDIA 3TKSC 1ZMAA 4V2LA 2MYGA 1PRXA 4BWSA 1X9MB 2R2JA 4DSQA 2P5RA 4EDZA 3F3QA 4NAXA 2H0GA 2EIOA 3FRCA 2OADA 2H19A 2IPAA 1XWAA 4FYCA 3W6GA 3ED3A 1A24A 4TR1B 3J7Yk 4CDOA 2PWJA 4JBBA 5KN2A 1G6WA 2KP2A 1HNBA 5B8AA 4N30A 5CRGA 4ML1A 1TI1A 3FHKA 5HR3A 1SU9A 3UEMA 1A0FA 4TR1A 2FWGA 4IHUA 1XWKA 2C0FA 2C0GA 2GTUA 3ZFLA 3KD0A 1XZOA 4MF5A 2OE0A 1PN9A 3F0IA 3TRPA 3CSIA 2GQLA 1CQHA 4CW9A 1BAYA 5IMVA 2VAFA 3KGKA 1YDKA 2YANA 2H6YA 1VGLA 2V6OA 4BWQA 4F2IA 1TU7A 2LNTA 4FO5A 2C1YA 4WETA 4KB3A 5KN3A 1HNCA 2EC4A 3KZQA 4KCEA 3IBHA 3GTUB 3FK8A 3EU4A 2VLTA 4IBPA 1FVKA 3TKQA 1GUHA 1M9BA 4IP1A 3BCKA 3TB2A 1URMA 1ZZYA 1XW9A 3MWHA 3VWXA 1MD4A 5JWRB 4YQUA 3ZLPA 3GTUA 1TJDA 6GSYA 4RUVA 3TRXA 1M2BA 3DWVA 5ENUA 1EV9A 1ZCPA 4DEJA 4TXOB 4PXOA 4V1Ag 1Z7RA 3ZRDA 3K8NA 2IMFA 5IM9A 2FY6A 4KDXA 1ZYQB 2ALBA 1A0RP 4IQAA 1YY7A 2LJKA 3C71A 5KN0A 3APQA 1M7TA 3CYNA 2HFDA 1B4QA 1TI3A 3GX8A 4XRDA 3HCZA 4N0VA 1GLPA 5L71A 3TJBA 5A5KA 2GT5A 4TXOA 4D73B 2DJJA 2TRXA 1F37A 3TUEA 1N8JA 4TR3A 6GSSA 3HZ8A 1BG5A 1CQGA 3QAVA 2H1GA 3H8QA 4K2DA 1ZYEA 8GSSA 4D73A 2MMAA 5IMFA 3N9JA 2CT6A 2GVPA 3NIVA 3O3TA 5GSTA 4XRAA 1YQ1A 3L0HA 1ILOA 1XWBA 1GWCA 4MF6A 1VF1A 3A2WA 4TR4A 2DJ2A 4OCEA 1SK2A 2C80A 1EWXA 2VUPA 2JZTA 1AAZA 5JCWA 1VF4A 2N5FA 3L9UA 5J41A 3C1RA 4JU5A 2HT9A 3GKKA 3FKFA 2LJAA 5DCHA 2IJYA 1O81A 4ZBAA 3GKNA 4XCSA 3DKSA 4GF0A 4K7NA 3TJFA 1JZOA 4RQXA 3A2XA 5KN1A 3RPPA 2XPDA 3MDKA 4ZB8A 2YN1A 4K9ZA 1H75A 2GSTA 2HZEB 3EURA 4HI7A 2O8VB 5DQSA 2VLVA 3RHCA 1OC8A 1GTAA 1AC1A 3IRAA 1TRWA 1VF3A 2H1DA 3MNGA 1AQVA 2XBQA 3IA1A 4MH2A 5ELAA 5ECOB 1GUKA 4MZWA 2WFCA 3EMXA 5KEJA 2HZEA 4YH2A 5E4WA 5CRDA 2MBSA 3JCML 3HD5A 1ST9A 3VI5A 1E2YA 5IO0A 1F6MC 2WB9A 1GP1A 5D9VA 3UARA 1VF2A 5IQYA 2IIYA 2JZRA 1HQOA 1XVQA 2WZ9A 2IMEA 2V41A 2YWMA 3TRQA 1THXA 4LLRA 2WDUA 3CRTA 3M9KA 5D9XA 4F9ZA 5ELGA 3QFAC 4Q5RA 5H5SA 3TKSA 4WXTA 5HR0A 4V1Ap 2X99A 1FO5A 4CHSA 4LL1B 2YZHA 2XPEA 1QGVA 1SJIA 4WR5A 4AJ8A 4P3YB 1PKZA 4ZIJA 2PPTA 1Q4JA 3UBKA 2HE3A 3PR8A 1V58A 1O8XA 5DJLA 5HQPA 3V1WA 1K0OA 1WJKA 4OO4A 3LXTA 2G0FA 3IE3A 1W4VA 1T7PB 3R2QA 3IXRA 4HUAA 5LD0A 1TK0B 3TOTA 2H8LA 1M0UA 3ZVJD 3EWLA 1XWCA 1BX9A 3D4MA 1RW1A 4HOJA 3GRXA 4JR4A 2O89A 4GCIA 4EO3A 4KGIA 1GRXA 5IMDA 4GQFA 3FR9A 1WIKA 3LSZA 5DCGA 1F2EA 2AYTA 2EIRA 1TRVA 1Q98A 1X5EA 1RK4A 5F07A 1C72A 2IL3A 1MDKA 2IWTA 2EIQA 3CTGA 3ME8A 2FWHA 1PGTA 2H72A 4H86A 3ZL5A 1K0DA 1K0CA 2JACA 2OJLA 3D6IA 1GLQA 2FGXA 5CYYA 4NV2A 2NBSA 3SWLA 4QL7A 2L6CA 3QFBC 5AIXA 5DJMA 4ECJA 3D4TA 5DBQA 1EEMA 3HKRA 4HU9A 5AISA 2R4VA 5ECHB 1TU8A 2DJ1A 2GSQA 1JZWA 1HYUA 4MH3A 1PD21 4I5QA 2C8UA 3DYRA 3FZ4A 1TK8B 2OBIA 4ML6A 3VFIA 1EV4A 2X64A 5B8BA 5H5QA 3G7YA 1ACVA 3DXBA 4MJEA 2FD3A 3H4KA 2PUKC 3P8WA 2P0GA 4MPGA 1SJ6A 3FY7A 3M1GA 1FVJA 2F51A 2C3TA 1YF1A 4NHWA 1SK1A 4IJ3A 2AHEA 2VL2A 1B4PA 1Z9HA 4G9HA 3CRUA 1PKWA 3I43A 1GSSA 3ISOA 2L5OA 2Z9SA 2RIIA 1F9MA 2L4QA 4J56E 3ZMKA 5LCZA 13GSA 3GUSA 4ZB6A 2OBKA 1SKSB 3EYTA 4LMVA 2IMIA 2G2QA 2I9HA 2YPMA 1NW2A 5DDLA 3F8UA 1SKWB 2HLSA 1H4OA 2LEGA 4Z7XA 4OMVA 3DMLA 2B1LA 1XOBA 4OFMA 5G1KA 4ZXGA 3ZFBA 1AQXA 5HR1A 1K0MA 2VIMA 3CSHA 2LV3A 4XS1A 5ECLB 3ERWA 3RPNA 4MPFA 2GSSA 2GS3A 1FG4A 2QGVA 5CNWA 3BBYA 2CVDA 2VCQA 3F4RA 3WGXA 2LRTA 4I8BA 4BVYA 1YF0A 3TJGA 4PGTA 3L9VA 5ECMB 1OC3A 2PMTA 1OKTA 1VRSD 3ME7A 3KIJA 1Z6MA 4LMWA 2IMKA 4GSNA 3RAZA 3C1SA 4L0UA 3UOMA 3CMIA 4KDYA 1WOUA 2VD0A 2H6ZA 3FZ9A 4IELA 1O85A 4YQVA 1M2AA 2JSYA 1MDIA 3TJKA 2H70A 4MP4A 1KNGA 3ZTLA 1OE7A 2I4AA 4Q5NA 5F0GA 3MSZA 4WBRD 3F9UA 2YV9A 4GRFA 2YNXA 1GSEA 1WP0A 1XCCA 5CAXA 4L5LA 4IN0A 4I2UA 2X8CA 1O8WA 6GSUA 2FWEA 3UAPA 2B7KA 3OR5A 1EP7A 4PUAA 2J9HA 3NZNA 3ERGA 3W8SA 2LQQA 3RBTA 2JL4A 2C3QA 2XC2A 1TOFA 5IO2A 1X9SB 5JCUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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