2HE3A

Crystal structure of the selenocysteine to cysteine mutant of human glutathionine peroxidase 2 (gpx2)
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
185
structure length
185
Chain Sequence
MIAKSFYDLSAINLDGEKVDFNTFRGRAVLIENVASLCGTTTRDFTQLNELQCRFPRRLVVLGFPCNQFGHQENCQNEEILNSLKYVRPGGGYQPTFTLVQKCEVNGQNEHPVFAYLKDKLPYPYDDPFSLMTDPKLIIWSPVRRSDVAWNFEKFLIGPEGEPFRRYSRTFPTINIEPDIKRLLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the selenocysteine to cysteine mutant of human glutathionine peroxidase 2 (GPX2)
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Glutathione peroxidase 2
total genus 58
structure length 185
sequence length 185
ec nomenclature ec 1.11.1.9: Glutathione peroxidase.
pdb deposition date 2006-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00255 GSHPx Glutathione peroxidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2he3A00
4KUNA 5IMAA 1UA5A 4MP4A 2ON5A 1ML6A 1FG4A 4JBBA 4GQFA 1URMA 2GT6A 4EXJA 4ECIA 1GSUA 2CT6A 3E0UA 1AUCA 1OAZA 3QOUA 3E3EA 6GSSA 3QD9A 4OCEA 3HVXA 1A2JA 3R2QA 2NBSA 5IMDA 4V2NA 4RI6A 3HJMA 1OC9B 3TKSC 2HRFA 2F8FA 4X0XA 5H5RA 1WPIA 1MDJA 4G2EA 2MMAA 3FR6A 4ZXGA 1M9AA 5A4WA 4I5QA 10GSA 4I97A 16GSA 5D93A 3GKKA 3KH7A 3CSHA 1MD4A 3DXBA 4AJ7A 2PVOC 4HUAA 4N10A 2EIOA 1WOUA 3KJYA 1VF4A 1OC3A 4K7NA 4OMVA 5ID2B 2FWGA 4YQMA 1JZRA 3EYTA 3UAPA 3UJ1A 4K8MA 1EEMA 5ENUA 3ZMKA 2OA7A 2R6KA 1PX7A 3RAZA 4PX1A 4PQ1A 3J7Yk 4IS0A 3GA4A 5IPHA 1IYHA 4TR4A 4BVYA 1YEPA 3HJPA 4OFTA 4IBPA 2C1YA 2DIZA 2E2GA 5IOWA 1B9YC 2L57A 3ERFA 2RM6A 5EPFA 3UL3A 1V9WA 2EIRA 1RW1A 1SD8A 2CVDA 2TRXA 4ZL8A 5D9TA 2DJ1A 5AIXA 1T4YA 2HSYA 1PMTA 3QAWA 5DJLA 1K0AA 1FW1A 3LXZA 2A4VA 5DCHA 4GSSA 5J4UA 2H1DA 3GKXA 2REMA 2P0GA 4HZ4A 1TU8A 3VK9A 4MPGA 1MDIA 2HSHA 5C04A 3FRCA 4PUFC 4BWQA 1SK1A 2HXKA 2L6DA 2RIIA 3IR4A 3CTFA 3LSZA 3WGEA 1M99A 3DMLA 1AQWA 1DSBA 1XWCA 1QQ2A 3ZIJA 2VM2A 3VFIA 2I9HA 17GSA 2DBCA 1PQNA 2CX4A 2VL3A 1JLVA 2YP6A 3GMFA 1M7TA 1J0FA 1GLPA 4MJCA 2ZUPA 1A0FA 1SJZA 5IOXA 4F82A 3ZITA 2PWJA 1Z5YE 1QMVA 1TDIA 2FLSA 4FYBA 1QGVA 3GV1A 1PN9A 3HVSA 5CNWA 1GL8A 4HJMA 4GSNA 5KN3A 3GH9A 2V6OA 2GSSA 2FWEA 4XS1A 4NV2A 1EOHA 4ZB8A 1SYRA 4OFNA 5ECNB 5JWOB 1RQMA 2IL3A 2ON7A 5JWRB 4L8EA 2HZEB 4HU7A 3HD5A 3GL5A 3HDCA 4HI7A 4KW6A 1K0NA 4TR0A 2IMKA 1GRXA 1AAZA 5EVOA 4WF4A 5ECQB 5J41A 3Q19A 2PGTA 5GAND 1A0RP 4WBJA 2GS3A 5ID2A 1WE0A 2KUCA 1TRVA 1X9MB 4OO5A 3KM6A 1T4ZA 2LV3A 2CA8A 5JCUA 2L5OA 3KXOA 4NHWA 2K6VA 1PKZA 3NZNA 2X8CA 1GNWA 2F8AA 1AIUA 2E2MA 1TI1A 2WGRA 2JZSA 3C8EA 4MA9A 2DJ3A 5IMVA 3DIEA 3VLNA 5B6MA 13GSA 4BWSA 2GZPA 1HYUA 3M8NA 1V58A 2H0IA 3D4TA 1S3AA 4GRFA 2LEGA 3Q18A 2C8UA 1BG5A 1GWCA 2K8SA 3GNJA 3APSA 1LU4A 5HFGA 3VURA 3VPQA 5CRHA 4HDEA 2PPTA 2WULA 3GRXA 2YCDA 4RUVA 5J9BA 1Z6NA 2AYTA 2CZ3A 5G31A 2LKUA 3HZ4A 4DSSB 2WDUA 1VF3A 1F2EA 4KSOA 4HU9A 1TP9A 1H4OA 3F6FA 3KMNA 1EGRA 2H0GA 2I1UA 4F0CA 3A2VA 3IAS2 4EUYA 4F9ZA 1SENA 1ZOFA 2R3XA 3UARA 1M2AA 2WZ9A 3FR3A 4NV5A 1QXHA 1R5PA 1GUHA 3GFKA 4IQ1A 4BVXA 2LNSA 4EE0A 2GQLA 2FWFA 4Q5NA 3QR6A 2FD3A 1JZWA 2H66A 3VI5A 4X1UA 3KP9A 3LYKA 4L0UA 4TOPA 2GQMA 3GUSA 5GSSA 4HQZA 5G5EA 3H93A 1GSFA 1SYXA 2XBQA 1FOVA 4O7HA 1MEKA 3Q74A 5DQSA 2XPEA 4POMA 2VCVA 3ZFBA 1G0TA 1GLQA 4G10A 2CZ2A 1S3DA 5FT3A 3MDKA 5DDLA 3EC3A 3ZRDA 1M2BA 2RM5A 1UN2A 3ZTLA 2X99A 3ZVJA 14GSA 1NM3A 2CX3A 2IIYA 4ZL7A 5D9VA 2OADA 2GGTA 1NSWA 3F8UA 5D73A 5KN2A 5D9WA 4L0WA 3LXTA 1T1VA 4J2FA 3F3QA 3L4NA 2X64A 3D5JA 4CHSA 5HFIA 3A3TA 2L59A 3EINA 4QL7A 3DWVA 2I4AA 3O6TA 3IA1A 1TJDA 3O3TA 3ZFLA 1X9WB 4PNGA 2QC7A 2CV4A 3GSSA 2VLUA 1PGTA 2KHPA 1X5DA 4XS6A 7GSSA 1XWGA 2H01A 2IFQA 3RPPA 5COHA 2KP1A 4L5OA 4IVFA 1XPVA 2VLVA 4XHMA 2H1GA 2GSQA 5IMZA 4E8EA 5IPGA 5KEJA 3TJFA 1J9BA 3TJGA 1WMJA 4HQSA 4GF0A 5HR1A 1SKWB 4IJ3A 6GSTA 3KH9A 4IKHA 1R4WA 2H70A 1XVWA 5C00A 3U5RE 1PL1A 3EE2A 2LRCA 3HCZA 1XCCA 3CTGA 4ILFA 3UBLA 4XRDA 3FYGA 4OWYA 1T3BA 2GDRA 3F4SA 1QK8A 3ZLPA 4F2IA 3TOUA 1Z9HA 3HHVA 5CAXA 3UBKA 2DC5A 3CRTA 3D21A 1NHYA 3SWLA 1THOA 3RHBA 1AW9A 2PUKC 2WB9A 5IO0A 2YJHA 4ZIJA 1X5CA 2V6KA 4DSSA 1FVKA 3TRXA 2YV9A 2BJXA 2C3NA 1V2AA 1EV9A 3I43A 4HOJA 4MK3A 2H19A 3GX0A 4OFMA 3LWAA 3TKSA 6GSXA 2B3SA 3H8QA 2CVKA 4BA7A 2FWHA 4DSQA 3KTLA 4EDYA 4I2UA 3HA9A 5ELGA 2HYXA 2L5LA 1KBNA 1BAYA 4LMVA 2KOKA 5ECSA 1PKWA 3FEUA 3BCKA 3BCIA 4KGIA 1TOFA 2WFCA 3L9UA 1HD2A 5HR2A 4MJEA 1A23A 1F3AA 2M80A 2C3QA 2OACA 2YANA 5CREA 4YQUA 3UIWA 1B9XC 4O32A 5ECLB 1HQOA 4O92A 1OE7A 1F9MA 4JE1A 5LD0A 5GSTA 4FIWA 4AGSA 4KE3A 5G5FA 1O6JA 1PRXA 6GSYA 2H30A 2FGXA 3FZ4A 1HNBA 3ERGA 3FW2A 5DCGA 5J5NA 3BD2A 4V1Ag 3P90A 2VCZA 2H74A 4POBA 2VO4A 4ZBDA 2JZRA 1YF1A 4KDUA 2G0FA 4DVCA 4ECBA 2XHFA 3KGKA 2LJRA 4ECJA 1PL2A 1GTAA 2H6YA 1GSYA 1DE2A 2IMFA 1F3BA 2K8VA 1ZCPA 2DJKA 3QAVA 4XCSA 1THXA 2F3MA 4MDCA 1FB0A 3WGDA 3WGXA 1O8WA 2JU5A 4RQXA 1XXUA 1M0UA 4ZB9A 2QSIA 1OVNA 2JACA 2KP2A 3EVIA 1GTUA 3HKRA 5IQYA 2ZCTA 1SKRB 1SL2B 2QGVA 1NW2A 2VLTA 2NTOA 1U3AA 1YF0A 5G1LA 4K1FA 2ES7A 2WCIA 4ISDA 1M9BA 1KTEA 4LMWA 1BQ7A 2C0EA 3ZMLA 1B4PA 2L4QA 2O8VB 2L4CA 1SJ6A 4LA1A 3IDVA 1G6YA 1WRYA 5CO3A 1DBYA 3G7YA 2VM1A 1AC1A 2K9FA 5ECHB 4ZILA 3U6VA 1GH2A 2O7KA 4HEA2 2DSAA 2OBIA 5CP1A 1GUMA 2YN1A 3C73A 2DJJA 4K7IA 1OE8A 5IMFA 1J08A 3G9BA 3HYPA 1GSEA 1HNAA 5KN0A 6GSVA 5B7CA 3LYPA 5DAKB 1K0MA 1B8XA 3DVXA 1K0CA 3LJRA 3SBCA 1SL0B 4NWYA 2XBIA 1GULA 3TUEA 3QPMA 2B7KA 5G30A 4ZBAA 2LSTA 20GSA 5FHIA 1Q98A 3HJOA 4IP1A 3PGTA 2V2GA 1JLWA 2R4VA 5HR0A 19GSA 2FHEA 2VCWA 3TJKA 1SJIA 1EGOA 2VCTA 4LL4B 5LCZA 1MTCA 2YOIA 2C0GA 2WJUA 4TR3A 4K0NA 1S3CA 1XWAA 4YQVA 2FA4A 2VL2A 3ZREA 2QKEA 1YJ6A 2PU9C 2CVBA 2FA8A 2YZHA 3IBHA 4MF7A 2BTOT 2Z9SA 5JCGA 5HR3A 3N9JA 2IFQB 4XRAA 3CBUA 1BX9A 3UVHA 4FYUA 5ECOB 3CRUA 3DYRA 2IJYA 3TRPA 2N5AA 2LJKA 2VL2C 2YPMA 2B5YA 2A2SA 1O8XA 1ZYEA 2MBSA 5F05A 5JCWA 3A2XA 5ECIB 2WS2A 2TRCP 1YKAA 1X0RA 4TR1B 5F06A 3TRQA 1K0OA 3FZ5A 2DLXA 3IK7A 2H73A 1K3LA 4WETA 1KEBA 5G2ZA 1MD3A 3DEXA 3IHQA 4NHZA 1GSSA 2YWNA 1ZL9A 4XTSA 2BMXA 2B5EA 2C0FA 3CSJA 1EEJA 3C1SA 3KMOA 3LGCA 4PUAA 3A2WA 4KAEA 1BYEA 2PN8A 3ZIVA 4KDYA 4I2TA 5ECRB 8GSSA 1YQ1A 5GAPD 4AJ6A 2R2JA 1RK4A 4F03A 3F6DA 4JR4A 1YDKA 1I9DA 1OKTA 3S9FA 2LS5A 3P7XA 5H5SA 4JU5A 2B1LA 2F9SA 4GSTA 3RDWA 5DVBA 2NDOA 1ILOA 1TU7A 2WRTA 4AF2A 1G7EA 4MF6A 1VGLA 2AUVA 5DAKA 3ZVJD 1EP8A 1XWBA 2L6CA 1T00A 3KEBA 3IXRA 3C7MA 5ECPB 4WKWA 3DKSA 4EL1A 4TRXA 3I9V2 1TKDB 3M1GA 2DJ0A 2GTUA 4TVEA 1VF1A 4TW5A 4EF0A 2FY6A 1F37A 4G19A 3ME8A 5INYA 22GSA 1ZGNA 3TB2A 1FO5A 3LG6A 3TJBA 1GNEA 1T8EB 5H5QA 1F6MC 1CQHA 2AAWA 4PQIA 2LRTA 1SKSB 3FKFA 4MLYA 3CSIA 2OJLA 3F3RA 3H79A 1TW9A 4GWRA 4IGJA 2I81A 5ECMB 1N2AA 3GN3A 1GTIA 3VI7A 1T7PB 1XIYA 4MJAA 5A4UA 1JZOA 2PBJA 1Y25A 1DE1A 3D4MA 3F9UA 3UEMA 1B48A 3TGZA 2B6MA 3GKNA 3PH9A 1U88A 1BJXA 1PD21 1K3OA 1WP0A 3C71A 4Z7XA 4MMMA 2YNXA 1EWXA 4MH2A 2GSTA 4IN0A 5F0GA 1ERUA 1PX6A 3HY2A 4GCIA 1XWKA 4TR1A 3F4TA 3BOAA 2H6XA 6GSWA 1SU9A 3VWUA 3APOA 4GQCA 2CAIA 2DJ2A 1A2LA 4TXVA 3TCOA 2AB6A 2OE1A 4NAXA 1GUKA 1R26A 1Y6EA 3GX8A 4TXOA 3MSZA 3GTUA 4ZBBA 3EMXA 4ULXA 2AV4A 1OC8A 1IYIA 2K18A 4XIHA 2LUSA 3NIVA 3F63A 4ML6A 3ED3A 1B4QA 2TIRA 4K7OA 3IE3A 2LQOA 2C0DA 1XW9A 4PGTA 4N0ZA 2GZYA 3KP8A 1ERTA 3IRAA 2B5XA 3RPNA 1YY7A 1O81A 2CAQA 3FZAA 2H1AA 1ABAA 3ZL5A 4Q5FA 5EY6A 1ZYQB 4FYCA 1O85A 4ID0A 4ZL9A 1SL1B 2DMMA 4EKZA 4TKYA 5F07A 4H86A 3MAKA 2E7PA 3KIJA 5E4WA 4I6XA 2MBTA 1OYJA 4P3YB 3RHCA 3O76A 1FHEA 2LTKA 3L0HA 2H6ZA 12GSA 1YKCA 3KTBA 2IMDA 2O89A 2VAFA 1JZDA 4E8HA 2YWMA 2H8LA 1XVQA 1SD9A 3F4RA 1X5EA 2DIYA 4PQHA 2FNOA 9GSSA 3HZ8A 1V98A 3QFBC 3JCML 5HQPA 1ST9A 4CDOA 3G7JA 3APQA 5AGYA 4D73A 1XOAA 1AQVA 4I8BA 3TOTA 1USBA 5J9CA 4WBRD 1WJKA 4CW9A 1U87A 2A2RA 1VRSD 4EO3A 2AJQB 1Z7PA 1MDKA 5D8IA 4IHUA 5DJMA 5ELAA 2C80A 4JEDA 2DMLA 2YWOA 3OR5A 1M2DA 1U6TA 4J56E 4V2MA 4JRRA 3CMIA 3TJJA 1UVZA 3WT1A 3KCMA 5B8BA 5B6NA 1C72A 2E0QA 6GSUA 5JWQB 3M3MA 2M72A 4RI7A 2RUEA 1QFNA 1E6BA 3K8NA 5D96A 4FH8A 4DEJA 3I69A 2XC2A 3VPTA 3CYNA 4K0GA 1Z7RA 1XW5A 3W8JA 4O5RA 3H1NA 4K2DA 2XPDA 5CRGA 3P8WA 2HZFA 1O73A 1LBKA 2GVPA 4PNFA 1CQGA 4V1Ap 1HNCA 4NXIA 3ISOA 4MJBA 1K0DA 5KN1A 11GSA 3WT2A 2PMTA 1ACVA 1LJRA 2VOCA 3QFAC 3UMAA 3M9JA 2V41A 4QQ7A 4IQAA 1E2YA 2R37A 5DALB 4OD7A 4WEYA 5DBQA 4KDXA 2FUG2 4ZB6A 3LFLA 3VWWA 2B1KA 2HE3A 2EC4A 4FO5A 5J3RA 2YJ7A 2OE3A 4HS1A 3QMXA 2B7JA 5AISA 3MNGA 3GL3A 1GSDA 3GYKA 4PURA 4K6XA 2MMZA 4L5LA 3IC4A 2GLRA 2ZNMA 3G7IA 1JHBA 1A8YA 4N0VA 1TK5B 5AIVA 2YWIA 2LRNA 2AHEA 5E59A 4BL7A 3L78A 5IM9A 2JADA 4MZCA 3HXSA 3NOFA 4GXZA 1G7OA 3LEFA 3D22A 5A5KA 1OC9A 1TK0B 1WIKA 3W8SA 3DD3A 18GSA 5GZZB 2KLXA 1TK8B 3EU3A 1BEDA 2RUFA 1YZXA 2NPBA 4XS4B 4WXTA 3EMPA 2I3YA 2MZCA 2VUPA 2YV7A 4JZQA 3FK8A 3KZQA 1W89A 1G6WA 1U3IA 2VD1A 4YH2A 2H0HA 4KCAA 3M9KA 3DRNA 2IN3A 3FY7A 2HLSA 4KNDA 2X8HA 4NPBA 3QDNA 4F0BA 2J23A 3GHAA 5B8AA 1SK2A 5ECKB 2PERA 3EWLA 4BPYA 3US3A 1GTBA 2P5RA 1TRSA 2FCHA 1TXXA 2RLIA 5IMCA 3IV4A 1Q4JA 2N5BA 4ECCA 3ZZXA 3WD6A 1A24A 4X43A 2HI7A 1V40A 1EOGA 3UOMA 3IOSA 2C3TA 2MMOA 4MF5A 1X9SB 3F0IA 2P5QA 5LNKe 4MPFA 4PXOA 3KD0A 1AXDA 3GSTA 4TXOB 3GTUB 1ERVA 3MWHA 1ZMAA 2CQ9A 3TKSE 3DGQA 4YAVA 3M0FA 1GSQA 3H4KA 5CRDA 3QCPA 1GP1A 2H71A 1K0BA 1K3YA 4YAPA 4MZWA 2O87A 2MYGA 4IJIA 2PVQA 5FWGA 3IK9A 2EIQA 3PR8A 4LL1B 2P31A 1R7HA 4WR4A 1TTZA 4K9ZA 2ALBA 5DALA 2GT5A 5HFKA 4AJ8A 4MABA 3J7Yb 3TKRA 3RBTA 2OBKA 2HFDA 4MH3A 3P2AA 3C1RA 2MMNA 1XW6A 4KA0A 1W4VA 2VIMA 4ACSA 2JSZA 4OCFA 2NVLA 3L9VA 3GIXA 2D2ZA 3ERWA 1KNGA 3VWVA 1OKDA 1FB6A 4HZ2A 2LQQA 4LLRA 4N30A 5DQYA 3TKPA 3ME7A 2IPAA 2LJAA 1TRWA 2VCXA 4DSRA 3GURA 1R5AA 4QL9A 3I6AA 4TN8A 4POLA 4IELA 4EVMA 5ABRA 1XBSA 3TDGA 4J57E 4D73B 5F8BA 1I5GA 5EL8A 4MCUA 5D9XA 2JZTA 1XZOA 1JFUA 2OE0A 3CXGA 2G2QA 1V57A 3BBYA 1NHOA 4JR6A 2VCQA 4G9HA 5G1KA 2M46A 1FAAA 2IWTA 2HZEA 2H72A 4IW9A 4XS4A 2YZUA 3TKQA 1TI3A 1EZKA 3EURA 3EU4A 1WWJA 3FR9A 3D0ZA 1EV4A 2JL4A 2LNTA 4Q5RA 1EP7A 1AQXA 5L71A 4V2LA 4KH7A 3L9SA 3IPZA 2HRNA 3LQ7A 2H76A 2C4JA 4KB3A 2IMEA 3FHKA 3BJ5A 2R5GA 1ZZYA 4WR5A 3VWXA 4EC0A 1YEXA 3LORA 3ZYWA 1SK0A 2GZZA 4ML1A 2IMIA 4HJ2A 3FZ9A 2VL9A 3AY8A 4NMUA 1PSQA 1XOBA 1Z3EA 3IAM2 3QAGA 1DUGA 2J9HA 2JSYA 4GLTA 4KX4A 1A8LA 2V1MA 2X8GA 3Q6OA 3D6IA 1N8JA 5IO2A 3UVTA 1A2MA 2OKAA 4N11A 4KCEA 2H75A 1UC7A 3HVVA 5CYYA 5AN1A 4MZBA 5A4VA 2HT9A 4WF5A 5CRWA 3V1WA 1Z6MA 2O85A 4KSMA 2GSRA 3GH6A 4OO4A 1PA3A 2N5FA 2V32A 3E9JB 3A5WA 1ON4A 1FVJA 2VD0A 3DVWA 3WYWA 3GKMA 4Q5QA 3PINA 3N5OA 1VF2A 1XFLA 3W6GA 4RQRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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