2HFDA

Nmr structure of protein hydrogenase-1 operon protein hyae from escherichia coli: northeast structural genomics consortium target er415
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
132
structure length
132
Chain Sequence
MSNDTPFDALWQRMLARGWTPVSESRLDDWLTQAPDGVVLLSSDPKRTPEVSDNPVMIGELLREFPDYTWQVAIADLEQSEAIGDRFGVFRFPATLVFTGGNYRGVLNGIHPWAELINLMRGLVEPQQERAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Protein chaperones Q8ZP25_SALTY from Salmonella typhimurium and HYAE_ECOLI from Escherichia coli exhibit thioredoxin-like structures despite lack of canonical thioredoxin active site sequence motif.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hydrogenase-1 operon protein hyaE
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Escherichia coli
total genus 30
structure length 132
sequence length 132
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07449 HyaE Hydrogenase-1 expression protein HyaE
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hfdA00
1PX6A 3P90A 3I9V2 4HQZA 1E6BA 2C0GA 4NAXA 4I6XA 4TXVA 1RW1A 2WFCA 2GTUA 3TJBA 1G6WA 5DALA 5HQPA 2L4QA 5DQYA 5B8BA 3M0FA 3FR6A 3O3TA 4L0UA 1KNGA 5ECNB 1TU7A 1J08A 4YQVA 5DQSA 4POKA 5J3RA 1K0NA 4LMWA 4ML6A 2H01A 4WF5A 1VF2A 1V40A 4GXZA 3VI7A 3UVTA 4MJCA 2H71A 4MDCA 5KN1A 4XS4B 4PX1A 1SJIA 4JE1A 3I6AA 2RIIA 4OFTA 3VWVA 2PN8A 2LKUA 4NMUA 10GSA 3VPQA 3KMNA 4KA0A 3TOUA 3TRXA 2WGRA 4KSMA 4KB3A 3EE2A 4OO5A 2JZRA 1TRVA 3D6IA 4OO4A 2P5QA 1THXA 2WULA 3BCIA 4NWYA 3U5RE 1RK4A 2GQLA 3HVXA 4JR4A 4XTSA 2NBSA 5CAXA 5ECKB 5AGYA 2DLXA 4XRDA 5CRGA 4XRAA 3F4TA 2DJJA 4HU9A 4Z7XA 3H4KA 1SK1A 1O7UA 1IYIA 1M2BA 4IQ1A 2ALBA 3O6TA 2JU5A 1DSBA 3R2QA 3ED3A 2CX3A 5IMAA 1FHEA 3E3EA 1GP1A 1FOVA 3HY2A 3HVVA 2CVDA 5KEJA 1EZKA 4HU7A 2AUVA 4AJ8A 3GTUA 4ECIA 4ULXA 4TOPA 1ZYEA 1FVKA 4K0NA 4MH3A 5D9VA 3L9SA 3ZITA 4X0XA 1GSEA 1XVQA 1AXDA 2E0QA 3DEXA 1XPVA 2CAQA 3GTUB 3N5OA 4KSOA 1AQVA 1O8XA 1PMTA 3IC4A 2PU9C 3QOUA 2J9HA 4WR4A 3RPNA 5ID2A 2CX4A 2FCHA 3FRCA 2YOIA 1SL2B 5B6MA 4LMVA 4ILFA 4K7OA 1F3AA 4MZWA 4EE0A 1GWCA 3QR6A 3M8NA 5F0GA 4YAPA 5HR0A 4TR1A 5ID2B 2FWEA 3HJPA 3W8JA 2YWMA 3CRTA 3GNJA 2HZEA 1WOUA 4N0VA 2B5YA 1AUCA 1PA3A 3BOAA 3H1NA 4IKHA 4HOJA 2VL9A 1LBKA 3GHAA 5G5EA 2LJRA 4DVCA 2LUSA 1Q98A 3FR9A 5ECMB 2C0DA 4J57E 1GLPA 4IELA 2LJAA 2GZPA 3HCZA 4ID0A 2H1GA 2L5OA 3L4NA 3LXTA 1AIUA 2VL2A 1SU9A 3L78A 1JFUA 2WJUA 2GZZA 3HZ4A 2HE3A 2P31A 2MBSA 2GT6A 4KH7A 5J9CA 3IOSA 1OC3A 6GSUA 2L4CA 4ACSA 2VCTA 1GTAA 5GAND 5GAPD 1F6MC 2IL3A 1JLWA 1GUKA 3TKSE 1PQNA 5A5KA 3EINA 2MZCA 4PNGA 2FWFA 3F9UA 4EVMA 2EIRA 5J9BA 2PMTA 4RI7A 2VL3A 4ISDA 2IMDA 3WT1A 2MYGA 1LU4A 4POBA 3J7Yk 1K3YA 5L71A 20GSA 4WR5A 3AY8A 2C8UA 2GS3A 4MLYA 3LJRA 2TRXA 2C0EA 3LYPA 2H1DA 3H8QA 2L5LA 1ERTA 5COHA 4EL1A 2C80A 4NV5A 1YEXA 2R6KA 1NW2A 3FY7A 3UMAA 2WCIA 1MDIA 1YKCA 4FIWA 2Z9SA 2L57A 6GSWA 2JL4A 1XW5A 3TKPA 1S3DA 2K8VA 3ZFLA 3GMFA 4F2IA 2VM1A 1ZMAA 1ABAA 1OC8A 3LORA 4AJ6A 2KOKA 3A3TA 4HJMA 5A4VA 3BJ5A 1HNCA 1F37A 2JZSA 3TKRA 3MSZA 4BA7A 1Z7PA 3HZ8A 1Y6EA 2RUFA 3ZL5A 1K0BA 3GUSA 3IBHA 5CREA 1XOAA 1B4QA 4ZXGA 2HSYA 5H5QA 4MZBA 2MMNA 17GSA 1SYRA 1A8LA 2FA4A 5IM9A 1U88A 2FA8A 2YV9A 2OE0A 3GURA 2JADA 5ECLB 1Z6NA 3PR8A 1SJ6A 2P5RA 2DMMA 1QXHA 1O73A 2LTKA 2PVOC 5G2ZA 1OKDA 2X8HA 5DAKB 1TK5B 3S9FA 5GZZB 2VD1A 3DVXA 3M9JA 5ABRA 1TK8B 1SD9A 5EY6A 3C8EA 1SJZA 5H5RA 3GL3A 3EU4A 1XBSA 3GRXA 2CAIA 1UC7A 3LFLA 3KEBA 3GH6A 3CSJA 3APOA 1M0UA 2WDUA 2FNOA 4G9HA 1F3BA 2QSIA 4O7HA 4V2NA 2DBCA 3GN3A 1V2AA 3MWHA 3BCKA 2H0HA 2OE3A 2R37A 2VIMA 3TJKA 1SK2A 2JZTA 4OFNA 3IV4A 3TCOA 4J56E 4JBBA 4XCSA 1WPIA 2YZHA 3GIXA 3C73A 4J2FA 5IMCA 4PNFA 5J5NA 3VK9A 1TI3A 5JCWA 2H73A 2VCZA 5D9XA 1ERVA 1WJKA 5FWGA 3ZMKA 2FGXA 1X5DA 1PKZA 2E7PA 3E9JB 3DRNA 4ZBBA 4N11A 3IPZA 5AIXA 5ECPB 3PGTA 3CXGA 1N2AA 2PPTA 3RPPA 4WF4A 3TKQA 4ZL7A 3ZIVA 1GH2A 2DIZA 1V57A 4HQSA 5IIZA 11GSA 5G5FA 2TIRA 4K1FA 1B8XA 1K3OA 1QFNA 2HYXA 2FWHA 3KIJA 2JSYA 3IRAA 1ERUA 4F0BA 5LD0A 1FO5A 2I1UA 1SL1B 9GSSA 1W4VA 4I8BA 4MPFA 4BWSA 3C1RA 2AV4A 5IO2A 3QPMA 3UL3A 4IP6A 4IS0A 2GGTA 4TRXA 3D5JA 3FK8A 1TRWA 4TXOA 4JRRA 4BPYA 3HVSA 2KP2A 4WETA 3ERFA 5EPFA 1VF3A 4G10A 3KP9A 1TK0B 2BMXA 3F0IA 3NOFA 2M72A 2X8CA 4LLRA 2R2JA 3G7YA 1XVWA 1OC9A 4IN0A 4MABA 2G2QA 2YJHA 5JCUA 2IMIA 5D93A 4EKZA 5H5SA 3L9VA 4E8HA 5G1KA 1XWAA 1BJXA 3M1GA 2NTOA 3RDWA 3ERGA 4PXOA 2BJXA 4KDUA 4KW6A 4DSRA 4N30A 5CYYA 2IN3A 5IPHA 4XS6A 1OC9B 1H4OA 3KCMA 4IVFA 1R26A 3J7Yb 2CT6A 3ZREA 5CRWA 5IQYA 5ECSA 3QFBC 2B3SA 2OBIA 5DALB 1ZYQB 1WE0A 3FYGA 3HYPA 3IAM2 3ZMLA 1XCCA 2V41A 3QMXA 1PSQA 1WRYA 1J9BA 4O32A 2IPAA 2YWNA 2XBQA 4MA9A 1DBYA 3C71A 6GSYA 2I4AA 4KCAA 5JWRB 3L9UA 1F2EA 4GLTA 2X8GA 4KDXA 1G7OA 4EXJA 1GTUA 3A2VA 4WBRD 4GQCA 3LEFA 4OFMA 1V58A 4QQ7A 5G31A 1A2LA 2F8AA 1X5EA 4FH8A 2L6DA 3KGKA 4KCEA 4H86A 2LQQA 4I2UA 5CO3A 1UVZA 1A23A 1AAZA 1SKSB 4OD7A 3HJMA 1T8EB 3DWVA 4WBJA 14GSA 2GVPA 3IAS2 1X9SB 5F07A 3ZRDA 22GSA 4GSSA 4BL7A 2IIYA 3A2WA 1AQWA 5IMZA 4EDYA 1XWGA 4YQMA 1YQ1A 1YJ6A 3KD0A 4JR6A 2GQMA 5AIVA 2GQKA 1R5AA 3DGQA 1EOGA 1FAAA 5J41A 1TXXA 2ZNMA 1HNAA 1EEJA 3EC3A 2HNLA 4ZBAA 3Q19A 2KHPA 2H30A 3HJOA 4FYCA 1OAZA 4EC0A 3P8WA 1V98A 5KN2A 1EOHA 1A2JA 1GNWA 1OE7A 2AAWA 1B4PA 5JWQB 1TKDB 3PH9A 1BX9A 2FLSA 2X99A 4LA1A 1C72A 1CQHA 2H66A 5D9WA 1Z5YE 1U6TA 1S3CA 2FD3A 4AGSA 2VLUA 4MH2A 3CTGA 4MMMA 3GX8A 3KXOA 4TR4A 4HS1A 2JACA 2CA8A 5IO0A 3A2XA 2KP1A 3MDKA 3HHVA 2A2RA 3WYWA 2ZCTA 4MP4A 4TVEA 4F0CA 5CRHA 3D0ZA 4TR1B 4HJ2A 2DMLA 1GSDA 5IMDA 2HZEB 3EVIA 1GULA 5IOWA 2IFQA 4CDOA 1MTCA 1WWJA 2XPEA 3I43A 2LEGA 3C7MA 3FZ5A 8GSSA 4D73A 4HUAA 4ECBA 2E2GA 5INYA 4DSSA 4MJEA 3VPTA 2FUG2 3UBLA 1DUGA 2R3XA 1WIKA 4YAVA 4V1Ap 2I3YA 2VO4A 3FZ9A 2OJLA 3WD6A 2DIYA 4X43A 1XIYA 3DXBA 2GSRA 3UJ1A 3KP8A 4D73B 5AISA 4DSSB 2RLIA 3VWXA 4K2DA 3HXSA 5ECRB 5A4WA 3IXRA 5IPGA 1ZL9A 5FHIA 6GSVA 5F06A 2GLRA 4XHMA 1ZOFA 3F6FA 1R5PA 1BEDA 4HI7A 1Z9HA 2DJKA 1V9WA 1FB6A 2K9FA 1PX7A 4ZB8A 2PVQA 4KX4A 3W6GA 18GSA 4MK3A 3TGZA 3K8NA 3IR4A 2DJ2A 6GSTA 2N5FA 1PKWA 4V2LA 7GSSA 2LNTA 2H1AA 3WGDA 3F63A 3M9KA 2OBKA 5KN3A 3KH7A 1WMJA 2H1BA 3D22A 5HFKA 1PN9A 6GSXA 4IQAA 2QKEA 5HFIA 1GTIA 3GSSA 1GNEA 1XZOA 1F9MA 1G6YA 1TU8A 3WGEA 2HRFA 2LV3A 1Q4JA 3UIWA 5ELAA 4F82A 4TR3A 4OWYA 2C1YA 2LRNA 3VWWA 2VD0A 2GSTA 1PGTA 1G7EA 4Q5NA 1K0AA 3TUEA 2B6MA 1A24A 2C3NA 5KN0A 3TKSA 3UOMA 1GL8A 1QK8A 2IMEA 2AB6A 2L59A 1XXUA 3IHQA 2PERA 5B8AA 2QGVA 4GSTA 4FYBA 2B1KA 2XPDA 4PUFC 3FR3A 1VRSD 2RUEA 3US3A 1SD8A 5C04A 2VAFA 3A5WA 4I97A 1BG5A 1GSSA 3RBTA 1ZZYA 3W8SA 1YEPA 3GA4A 3MAKA 2YJ7A 2GT5A 3F3RA 6GSSA 1W89A 3D4MA 2GSQA 2J23A 1TRSA 1LJRA 1U3IA 5J4UA 4EDZA 2BTOT 3G9BA 1QMVA 4MPGA 5FT3A 4POMA 1NHOA 4IJ3A 3FZ4A 1BAYA 4KAEA 2V6OA 4KNDA 3EU3A 4FYUA 2IJYA 3DKSA 2KUCA 2PUKC 1JHBA 2H0GA 2YWIA 3ZFBA 1KBNA 3Q18A 3FZAA 3TDGA 4HZ4A 1O81A 4F03A 1NSWA 3CSHA 4TW5A 1EP8A 3H93A 1ZCPA 4K0GA 4GTUA 3V1WA 1XW9A 3PINA 2FY6A 4L0WA 1HYUA 1TW9A 2O89A 2VOCA 12GSA 3QAVA 1IYHA 2HXKA 2VUPA 2H70A 3QAWA 3VWUA 1TRUA 2LS5A 4OCEA 1PD21 1O85A 1YY7A 2LJKA 3C1SA 1VF1A 3D4TA 4NHWA 1JLVA 3GYKA 2A4VA 2CQ9A 4AF2A 2ES7A 2YCDA 3LXZA 4GSNA 2B7JA 3TKSC 3DMLA 1PL1A 2DJ1A 5CNWA 4ZILA 2C3TA 2FWGA 2OE1A 1J0FA 2P0GA 1JZDA 2VLTA 3CTFA 4HZ2A 1M99A 3EWLA 3UARA 3P7XA 3LGCA 3UBKA 3RAZA 4IP1A 5F05A 4LL4B 3VLNA 2H75A 2ON5A 4PUAA 3KTLA 1PL2A 3EMPA 1USBA 1Z7RA 4K7IA 3LQ7A 1YF0A 2K6VA 3KJYA 5HR2A 1E2YA 5D8IA 2GDRA 4K8MA 4EF0A 2O8VB 1M7TA 3BBYA 1SL0B 1ACVA 5CP1A 3HD5A 2XC2A 3GH9A 4TXOB 3ME8A 4PURA 5ELGA 3JCML 1BQ7A 3I69A 2AHEA 4NHZA 4NPBA 1GUMA 2HFDA 1FG4A 4O5RA 2HT9A 2REMA 5EVOA 2KLXA 2CZ3A 3LSZA 3SBCA 4N0ZA 3GKMA 1M2AA 4ML1A 1B9YC 4MZCA 1I9DA 1ILOA 3MNGA 3FKFA 1NM3A 2AYTA 2K18A 2RM5A 5LNKe 2V6KA 1ZGNA 1GRXA 4XS4A 1QGVA 3ISOA 2B5EA 4GQFA 2C3QA 2VCXA 1R4WA 2VCWA 4BVYA 4IW9A 4MF7A 1T4YA 1VGLA 2M80A 3DD3A 1GSQA 3VFIA 2OADA 3CRUA 2HI7A 2QC7A 2YPMA 1T3BA 2LRTA 3LWAA 4KUNA 4EUYA 4G19A 5D96A 5JWOB 4FO5A 3CBUA 5DCHA 3H79A 5HR3A 4JU5A 1UA5A 1A2MA 1I5GA 1NHYA 3Q6OA 2HLSA 2PWJA 4GCIA 4TKYA 2H6YA 16GSA 5B6NA 4CW9A 3EMXA 1UN2A 3IA1A 2N5AA 5IOXA 4I2TA 5F8BA 4QL9A 4JEDA 4KDYA 3TJJA 1SK0A 2GSSA 1FB0A 2N5BA 2OACA 3D21A 3HA9A 3LYKA 1R7HA 1EP7A 1Z6MA 2H6ZA 1ERWA 1Y25A 2CVKA 4ZIJA 4ZBDA 1ON4A 4PQ1A 4ZB9A 3QCPA 2B1LA 1HQOA 3TB2A 2R5GA 3QDNA 4Q5FA 4O92A 3ME7A 2EIQA 1ML6A 4AJ7A 1MDJA 4RQRA 1FVJA 3CYNA 5GSSA 2H6XA 1TJDA 1K0CA 5HR1A 3HDCA 3KMOA 4EO3A 2VCQA 3KZQA 2X64A 4IBPA 2E2MA 3U6VA 3O76A 3G7JA 19GSA 4HDEA 4RQXA 5ECIB 4MF5A 2EIOA 2NVLA 1T1VA 4E8EA 2C4JA 3OR5A 1A0RP 2FHEA 5ECHB 1Z3EA 3WGXA 2IMFA 1JZRA 4XIHA 2YP6A 5G1LA 4WEYA 4RUVA 3IK9A 3FHKA 3GX0A 1K0OA 4X1UA 2NPBA 2JSZA 1CQGA 2L6CA 3ZTLA 1VF4A 2LNSA 1DE2A 5C00A 2G0FA 3RHCA 2H0IA 2XHFA 1M9AA 2D2ZA 1OKTA 1GSUA 2K8SA 1BYEA 2IFQB 3CMIA 3CSIA 2CVBA 4MJBA 2PBJA 1THOA 3P2AA 1A8YA 4OCFA 5LCZA 2IWTA 2VLVA 4PQHA 1PRXA 5EL8A 4V2MA 3APSA 3DIEA 3FEUA 1EV9A 3UVHA 1ST9A 1M9BA 2WZ9A 2GZYA 1X9MB 2R4VA 1O8WA 4V1Ag 1K3LA 2F8FA 4TR0A 2C0FA 1YF1A 2YWOA 1H75A 1TOFA 4F9ZA 4XS1A 4ZB6A 4IGJA 2ZUPA 4IJIA 2TRCP 1URMA 1MD3A 4DEJA 3KTBA 4PQIA 2PGTA 2I9HA 1EGOA 5HFGA 3M3MA 2WRTA 4WXTA 3IK7A 4POLA 4MJAA 1EWXA 2LSTA 1QQ2A 1GLQA 4K9ZA 3UAPA 2A2SA 2DJ3A 1U87A 2WS2A 3GL5A 3GSTA 2M46A 4WKWA 3HKRA 1MD4A 4HEA2 4IHUA 5G30A 3TJFA 3GV1A 3FW2A 1XWKA 3UEMA 5DJLA 3EURA 4K7NA 13GSA 2YV7A 1MEKA 3F4SA 3GKKA 1XOBA 2V2GA 4GF0A 1X0RA 2MMZA 2H72A 2MMAA 1SKWB 1OYJA 3Q74A 4RI6A 5JCGA 1EGRA 2F9SA 3VI5A 3TRQA 2O7KA 3ZIJA 1QUWA 2AJQB 2LQOA 3ZVJD 3QFAC 1T00A 2YN1A 1X9WB 5A4UA 2DSAA 5DAKA 2VL2C 3TOTA 1G0TA 1TP9A 1B48A 4BWQA 2OA7A 2F3MA 3GFKA 1X5CA 4P3YB 1SYXA 1U3AA 3APQA 3F6DA 4YQUA 3QAGA 2DJ0A 3NIVA 4Q5QA 4QL7A 5E59A 1YKAA 1FW1A 5ECOB 5DBQA 1GSFA 1JZOA 2VM2A 1AC1A 1S3AA 3DVWA 3F3QA 1TTZA 2B5XA 4KGIA 3WT2A 4CHSA 2H74A 5B7CA 2HZFA 1EV4A 5IMVA 3N9JA 1AW9A 3BD2A 1OE8A 2EC4A 1M2DA 5DDLA 4K6XA 3L0HA 2I81A 3LG6A 1TDIA 1B9XC 5DVBA 4GWRA 2LRCA 1GSYA 1XWCA 3IE3A 1XW6A 1GUHA 1GTBA 5D9TA 3TJGA 1SKRB 4L8EA 1TI1A 3E0UA 4DSQA 2H76A 4PGTA 1DE1A 1SENA 4ECJA 1OVNA 3ZVJA 3ZZXA 4JZQA 4BVXA 2O85A 4LL1B 2H19A 5AN1A 2F51A 1HNBA 2MMOA 3F4RA 3IDVA 1N8JA 2V1MA 2WB9A 3VURA 5E4WA 2VCVA 2YZUA 5DCGA 5GSTA 1AQXA 5DJMA 4ZL8A 1A0FA 1YZXA 3NZNA 4I5QA 2B7KA 1EEMA 4ZL9A 3DYRA 3ERWA 4MF6A 5ENUA 3QD9A 2NDOA 3KH9A 3F8UA 2YNXA 2ON7A 2IMKA 3TRPA 1JZWA 2H8LA 2YANA 3ZLPA 3G7IA 1T4ZA 4OMVA 1MDKA 2RM6A 3RHBA 4G2EA 4GRFA 4Q5RA 2CZ2A 3GKNA 2CV4A 4NV2A 1XFLA 2DC5A 3EYTA 3ZYWA 1RQMA 1YDKA 4KE3A 5D73A 1K0MA 4NXIA 4ECCA 4YH2A 4N10A 3SWLA 1XWBA 2O87A 2V32A 1KEBA 5IMFA 5ECQB 2HRNA 3KM6A 4MCUA 5CRDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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