2HI7A

Crystal structure of dsba-dsbb-ubiquinone complex
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHAYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the DsbB-DsbA Complex Reveals a Mechanism of Disulfide Bond Generation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbA
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 53
structure length 188
sequence length 188
ec nomenclature ec 1.8.4.-:
pdb deposition date 2006-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hi7A00
3BD2A 3L0HA 5D9VA 4WXTA 3FR9A 3GH6A 1F9MA 4XTSA 5ENUA 5DCHA 2VO4A 1N2AA 4PGTA 1RK4A 2OBKA 1A8YA 1O6JA 5ECKB 4DEJA 6GSXA 1OAZA 4TR0A 4K7OA 3PR8A 4LL4B 3NIVA 4ZB9A 3TJJA 2CZ3A 4L5OA 2FA8A 4XS1A 2H6XA 1T7PB 3KTBA 4LMWA 1SU9A 2LKUA 3GV1A 1DUGA 1GP1A 1K3YA 2R5GA 1C72A 1JZOA 3DYRA 2CAQA 4NAXA 2FWHA 3J7Yb 3C73A 2A4VA 4EKZA 3QDNA 3C8EA 4V2LA 2YNXA 1OKDA 2OKAA 2EIQA 2VIMA 1AQVA 1M7TA 3HHVA 4NWYA 2DSAA 4K0GA 3D6IA 4ECJA 1SYRA 3GSTA 3HD5A 4RI7A 3D4MA 4KW6A 3GH9A 2MMZA 4MF5A 3NZNA 1MD3A 3GYKA 3DD3A 3KD0A 3KM6A 4GF0A 3DXBA 1NHOA 1B9XC 4TN8A 3LXZA 1PX6A 1A0FA 1K3OA 1QK8A 1VRSD 5JCGA 2B1LA 1J0FA 5AGYA 1EP7A 3ZMLA 1G0TA 1M2AA 1WP0A 5F8BA 5IMCA 2MMAA 4ZBBA 5DDLA 1K0CA 1HD2A 2BTOT 3QMXA 5H5QA 2X8HA 4WKWA 4KCEA 2MMOA 1IYHA 3A5WA 4K0NA 1T1VA 4IS0A 1AUCA 3S9FA 3F63A 4TOPA 2L57A 4V1Ap 5IIZA 4L0WA 1PRXA 5D9WA 2YOIA 4JRRA 1F6MC 1GTIA 5ECRB 5A4VA 4HU7A 2H75A 2DJKA 2H6ZA 3LQ7A 5J3RA 2VCQA 4PURA 1FVJA 3U6VA 4IJ3A 1XOBA 5GZZB 4MCUA 1OKTA 3KEBA 2OA7A 4TR4A 2FLSA 1S3AA 3TKQA 2D2ZA 3VI5A 3KH9A 4XHMA 1GLQA 1M99A 2H1BA 5LCZA 2NTOA 2GSSA 3CSIA 2OBIA 4ZL7A 1FG4A 3GKXA 2VCVA 4FH8A 1SL2B 5A5KA 3MDKA 2YWIA 3GX0A 3ZLPA 2L5OA 3UAPA 2PVOC 2FWFA 5D8IA 2RM6A 2REMA 1TRWA 2XC2A 1K0BA 3HVVA 3TJKA 4IP1A 5J5NA 1GSFA 2VL3A 3ZFLA 2HZFA 1V57A 5IMZA 3RPPA 1TTZA 4IW9A 4TKYA 1TP9A 2VCZA 2GZZA 4PQHA 3HJOA 4MZBA 3TKPA 1TK5B 3F3RA 1Z7RA 3UIWA 4GCIA 4OFMA 2L59A 2JSYA 2P31A 3R2QA 1V58A 3APSA 3W6GA 1X9MB 4YAVA 4WEYA 5IMVA 4TR1A 4LMVA 2GT6A 2K6VA 2DIYA 1V98A 2GS3A 3CRTA 2P5RA 2DJ2A 2G0FA 2C3TA 3ZRDA 4IKHA 3TUEA 5JCUA 1DBYA 4KH7A 1K0NA 3SBCA 4PUFC 3H4KA 4H86A 4OFNA 2H30A 1SJZA 3ZITA 2B1KA 2P0GA 4D73A 4IHUA 3HVSA 1WIKA 4G9HA 1FO5A 3U5RE 3KP8A 1BX9A 1TKDB 5HFIA 2FUG2 2EIOA 1R4WA 2LJKA 2GTUA 3FZ9A 4ZILA 2XPDA 3ME7A 4O7HA 1HQOA 3MNGA 1TRUA 2FY6A 2JU5A 4MABA 4KB3A 4MP4A 2XHFA 1ON4A 1LJRA 4GXZA 1K0DA 3I43A 4BL7A 3KMOA 3P90A 1XWCA 5HR3A 3DKSA 3UARA 4CW9A 4F9ZA 4NHWA 4QL7A 4AJ6A 5KN1A 4G10A 2IFQA 1HNBA 1USBA 2ON5A 3QAGA 2O87A 2PERA 3LWAA 3QD9A 1JZWA 3QFAC 1OC9B 3HKRA 2F51A 1SK0A 3ZYWA 4BVYA 1R5AA 4MJAA 1FHEA 1XZOA 2HYXA 1X5DA 1K3LA 1NHYA 3P8WA 2X8CA 3KMNA 1WOUA 4F03A 4EF0A 2HZEA 1M9AA 3GN3A 1XCCA 3FY7A 1Y25A 3EINA 2MZCA 1AQWA 1F3AA 5DJLA 1GTUA 3BJ5A 4XCSA 1OE7A 1GUMA 2X64A 4GSTA 3TJGA 3CSJA 5B6NA 13GSA 3VI7A 1VF3A 1PMTA 4AJ8A 1XVQA 2HI7A 4ULXA 2GVPA 3UL3A 4PQ1A 2MYGA 1SKWB 3OR5A 5AN1A 1U3AA 1Z6MA 2H76A 1BAYA 3IXRA 5C04A 1DSBA 1PKZA 2K9FA 4POBA 2HT9A 2PUKC 1X0RA 2PPTA 5HR1A 1AXDA 2HSHA 3JCML 2DJJA 2NBSA 4HEA2 1Q98A 2LV3A 3IRAA 4DSSB 3ERFA 1DE1A 1Z7PA 4KX4A 4DSQA 1KBNA 3TKRA 4PUAA 5IO0A 4G2EA 1SJIA 3WGDA 3LGCA 2C0FA 1FW1A 3KCMA 2I3YA 4ZL8A 4EUYA 1GTAA 1YDKA 3MWHA 1LBKA 3IBHA 4HQSA 1M2BA 1WRYA 5GSTA 3LXTA 3LEFA 2N5FA 1ZYEA 1G7EA 2GLRA 1EEJA 3UOMA 4AGSA 2H73A 4O32A 1OC8A 5ECSA 3G9BA 4FYBA 4YAPA 1ZL9A 4RQXA 3HXSA 2GSTA 1FOVA 5ECNB 3TGZA 4GRFA 4TXOA 1WJKA 3M8NA 2TIRA 2ZCTA 3M9KA 1T8EB 2FA4A 2A2SA 3O3TA 1XWBA 4N11A 4MPGA 1XW9A 1ZGNA 3UJ1A 2IN3A 4J57E 4YQMA 5G5FA 1TK8B 4RI6A 3RHCA 3F9UA 1O8WA 3DVWA 1AC1A 3KTLA 3FKFA 2CX3A 4OD7A 5JWOB 2WB9A 4WF4A 4K9ZA 4WF5A 1GL8A 4NPBA 4PX1A 3IAS2 2RIIA 2TRXA 2R3XA 2DMLA 3SWLA 1ZMAA 2C3NA 1A8LA 1RQMA 5IMDA 1TRSA 3K8NA 4WR5A 3EYTA 1SYXA 1OC9A 4GLTA 4KDUA 2H0IA 4BWQA 8GSSA 2WCIA 3E3EA 5L71A 1B48A 2H6YA 4Z7XA 3Q18A 1LU4A 2C0EA 3L4NA 4ZBAA 4HQZA 3LORA 3DIEA 2GGTA 2P5QA 3C1SA 1GULA 2V6KA 4FYCA 4GWRA 2LS5A 4ZIJA 4L8EA 3I6AA 2F8AA 2K8SA 2V1MA 5KN3A 4KGIA 1JZDA 1TJDA 3N5OA 5KN2A 1YKAA 1VF2A 5D9TA 2V6OA 3F0IA 3TRPA 1QGVA 2CAIA 1AIUA 1A2MA 4TW5A 1FAAA 4RUVA 3LSZA 1B4QA 2H71A 1F2EA 5JWQB 5DALA 5HR0A 1WPIA 2YWOA 5AIVA 1NW2A 1GUKA 1HYUA 2QGVA 2IMKA 1RW1A 2B5XA 3APQA 2C8UA 1V40A 2OACA 4GSSA 2IL3A 1V2AA 4IP6A 1X9WB 1U87A 1UVZA 3GNJA 5FT3A 4AJ7A 2FWGA 3RAZA 3L9UA 4O5RA 4KAEA 2L4QA 5G30A 4NV5A 3APOA 1KNGA 4ZBDA 1X5EA 5G31A 6GSWA 3F6FA 4ZL9A 4FIWA 3GMFA 2R6KA 2PVQA 3NOFA 5G1KA 1GTBA 5ID2B 4LLRA 2DJ0A 3HA9A 4Q5QA 2J23A 4OO4A 4XS4A 3DWVA 1XW5A 3ZFBA 1B8XA 4IQ1A 1OYJA 1VGLA 2K18A 3TB2A 4N10A 4HDEA 2GT5A 5E59A 4MLYA 5G2ZA 10GSA 3UMAA 2LUSA 5JWRB 2H19A 1GNWA 2CT6A 1QMVA 2F8FA 2M46A 5KN0A 2OE3A 5D96A 3GL5A 4I5QA 2DLXA 3QFBC 2JSZA 3UVHA 2KOKA 3QAWA 2AB6A 2E0QA 2VL2A 1SJ6A 3UVTA 2LSTA 1XBSA 4P3YB 4MJEA 2VL2C 2VCXA 1EEMA 4I2TA 3EC3A 2E2GA 3GTUA 3KIJA 2L6DA 4WBRD 5ECMB 1G7OA 4HU9A 1WWJA 5H5RA 2N5BA 3PH9A 3CYNA 4HJMA 2IWTA 2DMMA 1WMJA 2L6CA 5ELAA 4JU5A 3AY8A 5CO3A 2M72A 3HJMA 3GUSA 1ZOFA 2WJUA 3FZ5A 2GQKA 1PGTA 5CAXA 3GSSA 2L4CA 3RPNA 1B4PA 1JLWA 3A2WA 2WGRA 1TXXA 2GDRA 2DC5A 3FR6A 2VCWA 22GSA 4L5LA 2H0HA 1UC7A 1K0AA 5G1LA 1CQGA 4XRDA 2O89A 4KDYA 2WFCA 1YY7A 1PN9A 1R7HA 4KUNA 2FGXA 3O76A 4EVMA 5HQPA 1EGOA 4IJIA 4HZ2A 2VCTA 3LYPA 1O81A 3QOUA 2FNOA 5D73A 2XBIA 3GKMA 4IGJA 3LJRA 2C0GA 1YEXA 4ML6A 5ABRA 2YP6A 2OADA 3GL3A 3QAVA 2CVDA 3VFIA 3GKNA 2QSIA 4KSMA 1X5CA 2B7KA 4ZB8A 4J2FA 4MH3A 4ECBA 3HVXA 2Z9SA 4XIHA 4POLA 2YCDA 3M9JA 1THOA 3FYGA 3IDVA 4ILFA 4I97A 4NV2A 3EMXA 4IQAA 3E9JB 1PL2A 4TR3A 2H8LA 2RLIA 4YH2A 2CX4A 3C1RA 3M1GA 5DAKB 1A2LA 3D5JA 5FWGA 1ML6A 2WULA 5EL8A 3CTGA 4QL9A 2F9SA 1XFLA 3CMIA 1DE2A 4K2DA 3ZL5A 3Q19A 2GQLA 1GSUA 2MBSA 4V1Ag 1PSQA 1N8JA 2LJAA 2VL9A 4IELA 1PL1A 3GIXA 4POMA 1GRXA 3HDCA 1SL1B 2LNSA 5IQYA 3TRQA 1J08A 4KNDA 3EVIA 1TW9A 2C4JA 2M80A 1BG5A 14GSA 2R37A 1QUWA 2ALBA 4I2UA 5AIXA 4HJ2A 3IOSA 2CVKA 1TK0B 4EE0A 1Y6EA 3LG6A 1S3CA 3L9SA 6GSUA 1XPVA 3UBKA 4RQRA 2A2RA 4Q5FA 3F4RA 5ECIB 3ED3A 5EPFA 2AHEA 1TU8A 1FVKA 2VD1A 2DIZA 5IMAA 1SENA 3VWWA 4ECIA 4MDCA 1XOAA 4ZXGA 1TDIA 3WYWA 4BVXA 2VLUA 1PA3A 2H1DA 1A23A 1F37A 1M2DA 1E6BA 2IIYA 3KGKA 2VM2A 4JEDA 1W4VA 3EE2A 3TKSA 2CQ9A 3ZTLA 3IR4A 3TKSC 5CRDA 3F8UA 2H72A 1THXA 4JR4A 5D9XA 3A2VA 2H0GA 1QXHA 1EOHA 2C3QA 2PWJA 4YQUA 1E2YA 5LD0A 2LJRA 1IYIA 4HUAA 4MMMA 1VF4A 1H4OA 2LTKA 2FCHA 5COHA 1FB0A 5FHIA 3W8SA 4IVFA 2O8VB 3M0FA 1O7UA 3ISOA 3ZZXA 5CRWA 3QPMA 5CREA 5F07A 1G6WA 4KCAA 5IPGA 2PBJA 4GSNA 2B3SA 2RUEA 2KLXA 4JE1A 1YF1A 5DJMA 5J9BA 1AAZA 1GNEA 2ZNMA 2JZSA 4KDXA 4TRXA 4F0BA 2YJ7A 4ZB6A 5C00A 5F06A 1QFNA 5A4WA 1YEPA 2IPAA 2BJXA 4OFTA 2E7PA 3IPZA 4BWSA 3L9VA 2JL4A 5ECQB 2AYTA 4WETA 3WGEA 1YKCA 4GTUA 3KJYA 4Q5RA 4E8HA 3DEXA 4TR1B 4JR6A 1MDJA 3GKKA 2OE1A 2I4AA 6GSTA 5ECOB 2WZ9A 3CXGA 3D21A 5DAKA 3ZVJA 2C80A 4AF2A 3G7IA 1MEKA 3WGXA 4X43A 1R5PA 2LRTA 4MZWA 4FO5A 2HFDA 2VLTA 2LQOA 5G5EA 5IPHA 1T4YA 1K0MA 1F3BA 3WT1A 1X9SB 2HNLA 3RHBA 1BJXA 3TDGA 2ON7A 2CA8A 2HE3A 2GZPA 2YWMA 1SL0B 4PNGA 4F0CA 5JCWA 4L0UA 1XWKA 3F3QA 1CQHA 3M3MA 2I9HA 4D73B 4HI7A 2FWEA 5E4WA 3DVXA 4POKA 3IE3A 1EP8A 2YANA 1HNAA 1EV9A 5EVOA 2LQQA 1BQ7A 3IV4A 1Z6NA 3Q74A 3ZVJD 3D22A 1XIYA 2NPBA 3BCIA 1ERWA 2X99A 2IMEA 2RUFA 4WBJA 5EY6A 3TJBA 1YJ6A 1XW6A 4K7IA 3L78A 5ECHB 1PX7A 1A0RP 3VURA 1B9YC 1SK1A 3VK9A 1SD8A 2J9HA 3P2AA 3GRXA 4BA7A 2L5LA 3FHKA 3CBUA 5AISA 2RM5A 3G7JA 4DSSA 3EU4A 3GX8A 3VPTA 2KHPA 3MSZA 4EL1A 2F3MA 2O7KA 3TKSE 2IFQB 3P7XA 3ZIVA 1SKRB 2WS2A 3GHAA 2LRNA 1ZYQB 2XPEA 3UBLA 2B7JA 5J4UA 1K0OA 4HOJA 2HRNA 1UA5A 1FB6A 4PXOA 4K8MA 3VLNA 1GWCA 1G6YA 4ECCA 16GSA 1S3DA 3C7MA 2KP2A 1M9BA 3DRNA 3PGTA 2DJ1A 1OC3A 2PU9C 2AJQB 2YZHA 3HZ4A 17GSA 1PKWA 1AQXA 3FRCA 1XWAA 2VAFA 4KSOA 3H93A 1NM3A 2HZEB 9GSSA 1I9DA 3E0UA 5IMFA 1ZCPA 4HS1A 1T3BA 3EMPA 5DCGA 3ERGA 2I81A 4IBPA 1M0UA 1ACVA 4V2NA 2ZUPA 4K6XA 1EV4A 2VD0A 4N30A 2BMXA 1ABAA 2PGTA 4ML1A 2JZRA 3ME8A 5B6MA 1YQ1A 3FK8A 1GSSA 2VLVA 3PINA 1OVNA 1TI1A 2C0DA 1U6TA 2G2QA 1GUHA 1Z3EA 2LEGA 2YWNA 2K8VA 5F0GA 1TI3A 1GSQA 1I5GA 3CSHA 5CP1A 1ERUA 5GAPD 2IMDA 3CRUA 1O73A 2OJLA 3IK9A 4EO3A 1Z5YE 4MA9A 3TOTA 2JACA 2VUPA 5B7CA 3VWUA 1EGRA 5IO2A 4N0ZA 4X0XA 5ELGA 5IOXA 1ST9A 5B8AA 1HNCA 2H66A 4V2MA 1YZXA 3BCKA 1SD9A 4MF6A 2DJ3A 4NHZA 2VM1A 4EDYA 2GSRA 3HZ8A 3ZIJA 3IHQA 1A2JA 1T4ZA 1JFUA 1V9WA 3F4SA 2WRTA 2XBQA 4K7NA 2PN8A 1JZRA 1ZZYA 4K1FA 2YJHA 2H70A 2FHEA 5GSSA 3GFKA 1AW9A 5HR2A 5A4UA 4GQFA 4LA1A 1H75A 4ID0A 2ES7A 3O6TA 2YPMA 2TRCP 20GSA 1U88A 3KXOA 2R2JA 2O85A 3WD6A 1XXUA 1XVWA 3FZAA 1Z9HA 3UEMA 2MBTA 2NVLA 1JLVA 3H1NA 4TXOB 2IMIA 3ZREA 2LNTA 1UN2A 5CNWA 5HFGA 3GURA 2CZ2A 3HCZA 2H01A 3W8JA 1GSDA 2HRFA 5INYA 2GQMA 4JZQA 3BBYA 2HSYA 4F2IA 3QCPA 4DVCA 2C1YA 4EC0A 3IK7A 2YV7A 2KP1A 1R26A 3GA4A 5DVBA 3V1WA 2FD3A 3FW2A 4CDOA 4PNFA 4OO5A 4I8BA 5ECLB 5IOWA 3D0ZA 1U3IA 4TXVA 4BPYA 1GSYA 5LNKe 4XRAA 4DSRA 6GSSA 4F82A 1ERTA 5DQSA 5ID2A 5IM9A 1ILOA 3EURA 1EZKA 2LRCA 5H5SA 3CTFA 2CV4A 3VWVA 4FYUA 2YV9A 1GH2A 4QQ7A 2EC4A 4I6XA 6GSVA 4MH2A 3EWLA 1KTEA 5DBQA 1TU7A 3Q6OA 4OMVA 3BOAA 2H1GA 2R4VA 1A24A 4ISDA 3FR3A 1YF0A 4OWYA 3RBTA 3IC4A 3TCOA 2V41A 2CVBA 1EWXA 3QR6A 3VWXA 2MMNA 4N0VA 2AUVA 3HY2A 3WT2A 1GLPA 4Q5NA 1GSEA 1MDKA 4MZCA 2AAWA 5HFKA 5DALB 1QQ2A 4LL1B 19GSA 3ERWA 4EDZA 2IJYA 3ZMKA 4KE3A 2H1AA 1TOFA 4NXIA 4J56E 3IA1A 3HYPA 4GQCA 1T00A 1SKSB 1MDIA 3DGQA 1J9BA 5F05A 2X8GA 2B6MA 4CHSA 2AV4A 1EOGA 1XWGA 2HXKA 1O8XA 3F4TA 2B5YA 7GSSA 2JADA 5GAND 3US3A 2N5AA 18GSA 1BYEA 3J7Yk 3TJFA 1MD4A 2V2GA 2NDOA 4XS6A 1W89A 1PD21 2HLSA 2WDUA 4ACSA 2GSQA 4TVEA 4YQVA 3HJPA 3FEUA 2IMFA 2QC7A 2VOCA 3D4TA 4XS4B 2YN1A 3KP9A 4MJCA 1O85A 1WE0A 2V32A 6GSYA 3FZ4A 3LYKA 3VPQA 5DQYA 12GSA 5CRHA 3N9JA 5CYYA 4MF7A 1BEDA 3TOUA 2QKEA 4PQIA 5J41A 2H74A 1NSWA 4O92A 4HZ4A 2DBCA 3IAM2 4MJBA 3MAKA 3F6DA 3LFLA 4E8EA 5B8BA 1VF1A 3I9V2 5CRGA 1JHBA 3EU3A 3DMLA 5ECPB 4G19A 4MPFA 1SK2A 1MTCA 2EIRA 4EXJA 3TRXA 5J9CA 2GZYA 1KEBA 4NMUA 5D93A 3A2XA 3I69A 2I1UA 5KEJA 3KZQA 1TRVA 3A3TA 2E2MA 1URMA 3H8QA 4KA0A 4JBBA 1ERVA 4WR4A 2KUCA 2YZUA 2JZTA 2PMTA 4OCEA 2B5EA 4MK3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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