2HRFA

Solution structure of cu(i) p174l hsco1
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
173
structure length
173
Chain Sequence
SFTGKPLLGGPFSLTTHTGERKTDKDYLGQWLLIYFGFTHCPDVCLEELEKMIQVVDEIDSITTLPDLTPLFISIDPERDTKEAIANYVKEFSPKLVGLTGTREEVDQVARAYRVYYSPGPKDEDEDYIVDHTIIMYLIGPDGEFLDYFGQNKRKGEIAASIATHMRPYRKKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Human Sco1 functional studies and pathological implications of the P174L mutant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO1 protein homolog, mitochondrial
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 55
structure length 173
sequence length 173
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hrfA00
1SL2B 5DCHA 1FHEA 2VCZA 5F05A 5DBQA 1ILOA 4OD7A 4CDOA 5ECSA 8GSSA 2CX4A 5JWRB 1F9MA 2KP2A 2LEGA 1LBKA 2VLTA 5DAKA 2IPAA 3M9KA 4TRXA 4HQSA 4MABA 3I43A 2A2SA 2V2GA 3RPPA 2IMIA 1X5CA 3CBUA 1K0AA 1GSYA 4Z7XA 3WD6A 2A4VA 4AJ6A 2C0FA 4GWRA 1HNCA 4OFTA 2LRTA 3M1GA 3GSSA 6GSTA 5HFIA 1AC1A 1NSWA 3CRTA 3IE3A 3KMNA 2H6XA 1QGVA 1WIKA 2X8CA 4D73B 3LQ7A 2G2QA 4DSSB 2KUCA 3PH9A 5KN3A 2X64A 3LG6A 3D22A 4LA1A 5EPFA 4AGSA 5CRHA 1HNBA 2O85A 3VWUA 4EE0A 3KD0A 5CRDA 3EYTA 1N8JA 4Q5QA 3LFLA 1USBA 1GP1A 5A5KA 2CVDA 5C04A 9GSSA 3G7YA 5F0GA 6GSYA 3IHQA 1W89A 3VFIA 2IMKA 2MMZA 2GTUA 1O73A 2B5YA 2M72A 1SK1A 4XIHA 4Q5FA 5DALB 1GLPA 4OWYA 4WR5A 2GGTA 3FR9A 4KAEA 4MH2A 5B8BA 5AGYA 3H4KA 1E6BA 2DJ0A 5KEJA 3HKRA 3F4RA 4TXVA 4ZL7A 3DYRA 1O81A 2L5LA 2CAQA 1B48A 1MDIA 3ME8A 3MWHA 4MZBA 2YWNA 1YEPA 4TN8A 2LRNA 3US3A 2C0GA 2LNSA 3IA1A 2GS3A 4IQAA 1M99A 2GZZA 3DVWA 3ISOA 1X0RA 2GZPA 5LNKe 2VD1A 1T00A 3AY8A 3CTFA 1RK4A 3TKSC 2NVLA 2FCHA 3A2WA 1G0TA 4E8HA 2KOKA 4NV5A 1PRXA 2P31A 4DSRA 1JZOA 2X8GA 4N11A 4KX4A 2PVOC 4GTUA 5D9TA 1T7PB 4L0UA 5D93A 2KP1A 4KCAA 3M3MA 5HR3A 4ZB9A 3H79A 4WKWA 2L4CA 2LQQA 4P3YB 2E7PA 5EL8A 1BQ7A 1ERVA 1VF4A 2KLXA 2LKUA 3G7JA 2FHEA 3C73A 1HD2A 4G9HA 5ECNB 4K0GA 3TJGA 4BVYA 1OC3A 1K0DA 1GUKA 1TK0B 3QR6A 3BOAA 2LJKA 2LS5A 4POLA 4GSTA 1I9DA 2LUSA 5J9BA 1EP7A 4YQUA 4PNFA 5D9XA 2H01A 2WJUA 1SKWB 3L4NA 5J3RA 1EEJA 1WPIA 1N2AA 4AF2A 4TXOB 3UMAA 2E0QA 3W8SA 3A5WA 3VK9A 2VL2C 5H5RA 1B4QA 4QL9A 4RQRA 4JZQA 5EVOA 2GT6A 1R7HA 3ED3A 4ZIJA 2I1UA 3UVTA 3UJ1A 1R5AA 3N5OA 1FB0A 2YV9A 2LRCA 3LWAA 1TRSA 5ECMB 1KTEA 2H1DA 5IO2A 2DMMA 5F8BA 2PWJA 2V41A 3WT2A 1VGLA 4L5OA 1SJZA 2ES7A 3ZFLA 2DMLA 1S3CA 3QFAC 1A2JA 3O76A 4I8BA 1VRSD 2GVPA 3VURA 3DD3A 3CSHA 1TW9A 5ABRA 2DIZA 2GSSA 3FYGA 2V6OA 2OADA 1DE2A 4WETA 5G1KA 3TJKA 1XWKA 1OE7A 1T3BA 2DJKA 4FO5A 4O92A 4K8MA 3HY2A 2E2MA 1U3AA 3TJJA 4QL7A 2YV7A 4OFNA 4EC0A 3K8NA 1Q4JA 4MDCA 5DDLA 1MD4A 2REMA 5JCUA 1X9SB 3KP9A 1MTCA 3SBCA 3E0UA 4ISDA 5IMVA 4MF7A 3L0HA 2H19A 2RM6A 3TKQA 3P90A 4FYUA 2B1LA 1Z7RA 2H0GA 4FIWA 1VF2A 3KJYA 4CHSA 1BYEA 1QXHA 3IV4A 4DEJA 4I6XA 1FG4A 2NBSA 18GSA 3CSJA 5ELGA 1ZOFA 3VLNA 1I5GA 3G9BA 1OKTA 2C0DA 4J56E 3GYKA 1Z9HA 2OJLA 3HHVA 1K3YA 2HI7A 22GSA 3VWWA 2WFCA 1F3AA 3LYKA 2GT5A 2H73A 3TUEA 4V2LA 3TCOA 2MMOA 4V1Ag 1URMA 4NWYA 2WZ9A 1ERUA 3LYPA 5KN2A 1V2AA 1YDKA 1XVQA 1PX6A 6GSWA 3RBTA 1G7OA 3QPMA 3KEBA 3FHKA 3TJFA 4KSOA 3FRCA 1AXDA 10GSA 3F3QA 3C71A 5DJMA 1Z3EA 1WJKA 3GIXA 2HRNA 2HSHA 4F03A 3RHBA 4N30A 4EKZA 1OC9B 2PERA 2GZYA 5IOWA 3H1NA 4K7OA 2RM5A 4O32A 5JWOB 1U3IA 2P5QA 4KE3A 2YN1A 2HT9A 1K3OA 2HRFA 5HR0A 4ZB8A 3LXZA 3ZRDA 3IRAA 2DLXA 5A4WA 2YCDA 1K0MA 3EVIA 4XCSA 3P8WA 1FAAA 3HZ8A 5HR1A 1SK0A 4Q5RA 2GSQA 3TKSE 3ZTLA 1T8EB 2C3NA 4LMWA 3ZLPA 2JZRA 1TU8A 2IJYA 2WDUA 1EWXA 4ECIA 4GSNA 3TOUA 5CREA 2VCQA 1A0FA 1BG5A 5JCGA 2L6DA 2V6KA 3LEFA 2IN3A 3ZFBA 5IPHA 2BMXA 3VPTA 2N5AA 5DQSA 4ML1A 2YP6A 5EY6A 3P2AA 1TTZA 3TRQA 4JR6A 2HZEA 2X99A 1AW9A 1PQNA 4MK3A 4XS4B 5J4UA 2PPTA 4FYCA 1XWBA 3QAGA 5L71A 1T4ZA 3QCPA 4HEA2 2IMDA 3HJPA 2VAFA 4AJ7A 5AISA 2CZ3A 3ERGA 3MDKA 3QAVA 1TRUA 4PNGA 4F0BA 2ZCTA 1TK8B 3DIEA 1TU7A 5LD0A 4EO3A 1GWCA 2H76A 4ECJA 2IMEA 4J2FA 2I3YA 1O8WA 4ZILA 4G2EA 1BAYA 2P5RA 3ZYWA 1OVNA 3P7XA 1RW1A 4HOJA 1GUMA 2EC4A 2YNXA 1FOVA 2H1AA 2PVQA 5ID2B 1TRVA 3GFKA 3HDCA 1RQMA 3HZ4A 3RHCA 1XIYA 4KCEA 4GSSA 2IIYA 4GF0A 1GSUA 1HYUA 4ECCA 2CVBA 2H72A 1TOFA 1A2MA 2DJ3A 1C72A 4TKYA 1M2AA 3FEUA 1K0CA 2HYXA 2NDOA 3VWVA 4ZL9A 2NPBA 1T4YA 3GX8A 4GRFA 1K0OA 2MBSA 1PKWA 2FWGA 1GL8A 4NHZA 4K0NA 3TJBA 1NW2A 4KW6A 2E2GA 4QQ7A 1WOUA 3GH9A 4MH3A 1K0BA 1EGOA 3D5JA 5ECPB 5ECLB 5KN0A 3RPNA 2FA8A 5AIXA 3RDWA 1JZWA 3FZ4A 7GSSA 4EXJA 1XOAA 2B7KA 3QFBC 5HR2A 3WYWA 3KGKA 1THOA 1PSQA 1B9YC 4GQFA 1G7EA 3HA9A 4V2MA 5ECQB 4L0WA 5IMAA 3OR5A 1YZXA 3GH6A 3ZL5A 4XRAA 2O89A 3HVVA 4LL1B 1U88A 3UVHA 3NZNA 1EOHA 4MF6A 1GSFA 5IMFA 2DJ1A 1A23A 1XWGA 4TR1B 4WEYA 2YOIA 3GUSA 3U5RE 1QK8A 1O85A 5ECKB 1A8LA 1TRWA 4X0XA 11GSA 3FZ9A 4MP4A 1XW6A 5B6NA 1K3LA 3J7Yb 3APQA 4POBA 5IPGA 3H8QA 4XTSA 1M0UA 3ZITA 2H0IA 1PL1A 3QMXA 1EP8A 1SD8A 4EL1A 4LLRA 4MCUA 4BVXA 1HQOA 2AUVA 1KNGA 3KMOA 3PR8A 3A2VA 3DXBA 1QFNA 3LORA 5INYA 2YWOA 2PUKC 2FLSA 3KCMA 3CTGA 3UOMA 4HJ2A 3O3TA 4K9ZA 4MZWA 1XXUA 4RQXA 2JACA 3GMFA 3W8JA 1M7TA 2CAIA 4WBRD 1V58A 3FK8A 4ZBBA 4MLYA 2K8VA 3TDGA 5GAND 2MBTA 2L57A 3D4MA 4HU9A 3IR4A 3IPZA 2R5GA 2QC7A 3FW2A 2IFQA 3GTUB 4JE1A 1PKZA 3VI7A 4WF4A 2WS2A 2OA7A 19GSA 4JBBA 4KDUA 1YKCA 4OO4A 1F37A 2AYTA 2LQOA 3C1SA 4PUFC 3HJOA 1GSQA 4IW9A 2H75A 1MD3A 3HJMA 3ZREA 3F63A 2AHEA 4IELA 4ECBA 1TJDA 5F06A 4NMUA 2B5EA 4BPYA 4BWSA 17GSA 1SJ6A 20GSA 4IQ1A 1JZDA 2V32A 4WR4A 4X1UA 1H75A 3BCIA 2FWHA 4WBJA 1PGTA 1ZCPA 2N5BA 1UN2A 1FO5A 2GSTA 3IDVA 1O6JA 3VWXA 5A4UA 1ON4A 3U6VA 2TRCP 3LXTA 4N10A 3DKSA 3I6AA 1YF0A 1A24A 1GNWA 4IJIA 1NM3A 4TW5A 3GURA 3M8NA 4TR3A 5FWGA 3H93A 1JZRA 3V1WA 1V40A 3D21A 5DAKB 2VM1A 2PMTA 4ZBAA 3ZMKA 4D73A 2DJ2A 2H66A 4DSSA 3F6FA 1PN9A 4FH8A 4WF5A 4YAPA 1ZYQB 1E2YA 1QUWA 1F3BA 4K7IA 3QDNA 5CO3A 2JADA 2LTKA 3J7Yk 2MMAA 5GZZB 3CXGA 6GSXA 3WT1A 1ZZYA 1TDIA 2AJQB 3CSIA 1OC8A 5ECRB 5CP1A 4HI7A 2CV4A 5B6MA 3R2QA 3F0IA 2L59A 5H5SA 3D4TA 4PXOA 2VOCA 3WGEA 3FR6A 2VUPA 1Z6MA 4ML6A 2N5FA 3KM6A 2BTOT 5DALA 3FY7A 2O8VB 5KN1A 3TB2A 4OMVA 4GQCA 4HDEA 2H71A 1XOBA 3IK9A 3KIJA 1IYIA 4AJ8A 2Z9SA 3UL3A 4TR0A 4MA9A 2MMNA 5ECIB 3QD9A 3EURA 1FB6A 2YJ7A 1A8YA 2FY6A 1MEKA 3IAM2 3M0FA 2L6CA 1TKDB 3C1RA 3EINA 1YKAA 1K0NA 3A3TA 1U6TA 5FHIA 3EU3A 1Y6EA 1T1VA 3TGZA 4RUVA 1QQ2A 4L5LA 3HYPA 2PN8A 3KH7A 13GSA 1M2DA 2VCVA 4G10A 4ILFA 2VIMA 1OE8A 4HU7A 3F6DA 3IK7A 4KB3A 4N0ZA 2HE3A 2ON5A 1SL1B 1IYHA 2L5OA 3TRPA 3UEMA 1VF3A 1GULA 3D6IA 3GKXA 12GSA 2CVKA 2ZUPA 5E4WA 1GTAA 1EV4A 4HQZA 4PQIA 1JLVA 3ZMLA 5D9VA 3IAS2 1GH2A 6GSVA 1X5DA 3CYNA 1TXXA 2F3MA 2VL3A 2OBIA 2R4VA 3BJ5A 2NTOA 3ME7A 4NAXA 5ELAA 4EF0A 5GSTA 5ECHB 1B4PA 3DMLA 4GCIA 1GNEA 5DVBA 1CQGA 3TKRA 5DJLA 4ZBDA 1EV9A 5E59A 2DSAA 5G5FA 2QKEA 4RI7A 2FWEA 2P0GA 4G19A 2VL2A 4MPFA 3VPQA 2O7KA 2H8LA 1X5EA 3FR3A 3TRXA 1YY7A 3KXOA 3ZVJA 3NOFA 1GUHA 4OO5A 1OYJA 4NXIA 4TXOA 4I2TA 3ZVJD 2HXKA 3GA4A 2G0FA 2XPEA 2K6VA 5B7CA 1JHBA 1TK5B 4IBPA 1UA5A 4Q5NA 3NIVA 4TR4A 3A2XA 1XCCA 2FGXA 2D2ZA 2VCXA 3GL3A 4JR4A 2FA4A 2B6MA 3ZIVA 1MDKA 2EIQA 4OCEA 3KP8A 2C8UA 2VM2A 2K8SA 3E3EA 5AIVA 4F2IA 1WE0A 2RUEA 3D0ZA 5A4VA 3DRNA 1O8XA 3GV1A 4KGIA 5G2ZA 2J23A 3WGXA 2DIYA 1TI1A 2H1GA 2QGVA 4IVFA 4CW9A 2BJXA 3GSTA 3IOSA 2CA8A 1WMJA 1KBNA 5CYYA 6GSSA 5AN1A 1JLWA 1WWJA 3Q74A 3HVSA 4HUAA 4ULXA 4PUAA 2GLRA 4IP1A 2IWTA 2DBCA 4HZ2A 4FYBA 5FT3A 2ON7A 5GAPD 3GHAA 3E9JB 4YQVA 2C3TA 4EDZA 1YEXA 1M9BA 4MJBA 1G6YA 5JWQB 1J9BA 2AV4A 5DQYA 1LJRA 1LU4A 1GSEA 2H1BA 4EDYA 3L9SA 4MPGA 3G7IA 2LJRA 1PA3A 3KTLA 4F0CA 2WGRA 5HFGA 2YZHA 1EOGA 2FWFA 4KSMA 2I9HA 2WULA 1G6WA 2GQMA 5J9CA 3LJRA 3APOA 4MJCA 1Z5YE 2VD0A 4IGJA 1PD21 1Y25A 2H6YA 1J0FA 5IQYA 3GL5A 1AIUA 2FUG2 4ACSA 2K18A 2GQKA 2IMFA 3Q18A 4E8EA 3QAWA 1XWCA 5IMZA 3ERWA 3UAPA 3JCML 2HFDA 2A2RA 4LMVA 1DSBA 2XC2A 2XPDA 4GXZA 3HVXA 3Q6OA 2HZFA 4PQHA 4IP6A 4YAVA 2C4JA 1OC9A 3DWVA 1THXA 4JRRA 1TP9A 1ST9A 4KNDA 1BEDA 2LV3A 2J9HA 4IJ3A 4JEDA 4RI6A 4K1FA 2I81A 1R26A 3MSZA 4GLTA 1V9WA 3UARA 2I4AA 2XBQA 2YWMA 1VF1A 2TIRA 1FVJA 4NPBA 2JSZA 3C8EA 5IMDA 14GSA 4IHUA 1YJ6A 1SL0B 4ID0A 3L9VA 3F3RA 5D96A 1ML6A 1SU9A 1O7UA 1R5PA 16GSA 3CRUA 4KUNA 3HD5A 2FNOA 5CNWA 2OACA 1GSSA 3DGQA 4XHMA 1NHOA 1M9AA 5D8IA 4O7HA 2GSRA 2JZTA 3EE2A 3ZZXA 1ERTA 5IOXA 1BX9A 2EIOA 4OFMA 3KZQA 2B1KA 3IBHA 4HS1A 3S9FA 3GRXA 2VCTA 2F8FA 2MYGA 4XS4A 3WGDA 5ENUA 3W6GA 2WRTA 3BD2A 3L78A 3UBKA 1ACVA 5J5NA 1XBSA 3HCZA 2X8HA 1AQWA 1H4OA 3EC3A 4L8EA 1WP0A 3MAKA 1TI3A 1XZOA 5COHA 5G31A 1WRYA 1GLQA 1DE1A 2YWIA 5J41A 4POKA 2HZEB 3FZ5A 4V1Ap 3APSA 3SWLA 1AUCA 2HLSA 2B7JA 1B9XC 2TRXA 3KTBA 1CQHA 5F07A 2GDRA 4V2NA 1A2LA 1W4VA 1J08A 1XW9A 5CRGA 5H5QA 5GSSA 2CZ2A 2H0HA 3GN3A 2JSYA 3EMXA 2RUFA 1SYRA 5ID2A 3IXRA 2R2JA 4XS6A 1F6MC 4IN0A 2MZCA 3F9UA 4POMA 1Z6NA 2KHPA 2JU5A 2PGTA 1PMTA 4YQMA 4N0VA 1JFUA 3EU4A 2M46A 5IIZA 4K7NA 4BA7A 2YPMA 1SJIA 4ZB6A 3PINA 4OCFA 3DEXA 4IKHA 5DCGA 2WCIA 4K2DA 2O87A 3LGCA 5C00A 1SYXA 2IL3A 1XWAA 1S3DA 3VI5A 4MMMA 5G30A 3M9JA 1GRXA 1AQXA 4HJMA 2F8AA 4TOPA 1NHYA 2LSTA 1MDJA 3MNGA 4PURA 4K6XA 2DJJA 4XS1A 1U87A 5IM9A 1ZMAA 4MJEA 5CRWA 1UVZA 3O6TA 1S3AA 2OE1A 3CMIA 1ZGNA 1X9MB 1R4WA 2AAWA 3TKPA 2DC5A 3ERFA 3Q19A 3BCKA 2AB6A 3BBYA 1XPVA 1GTUA 5G1LA 1PX7A 4O5RA 3GNJA 5HFKA 1V57A 3UBLA 1Z7PA 1GTBA 1PL2A 2OE0A 2PU9C 1EZKA 1SD9A 2VLUA 1SENA 1FVKA 1GTIA 3TKSA 5CAXA 1Q98A 4PX1A 1YQ1A 4DSQA 2F9SA 3DVXA 5D73A 3FKFA 3IC4A 3F4TA 4MF5A 2OE3A 3QOUA 3FZAA 4PQ1A 2RIIA 4DVCA 4JU5A 5HQPA 2K9FA 4KH7A 2EIRA 2V1MA 3PGTA 4HZ4A 4MJAA 1A0RP 2CT6A 2R3XA 2JZSA 5IO0A 1OAZA 3ZIJA 3TOTA 4TR1A 2VLVA 4TVEA 2YANA 2VL9A 1EGRA 3N9JA 5JCWA 2RLIA 3RAZA 1X9WB 2C3QA 3HXSA 3EMPA 5ECOB 4X43A 1BJXA 4PGTA 4BL7A 4NV2A 1ZL9A 1ZYEA 1KEBA 4F82A 2L4QA 2XBIA 1DBYA 4KDXA 2YJHA 2VO4A 4F9ZA 4IS0A 4MZCA 3GKKA 1SKRB 1YF1A 1XW5A 2PBJA 5G5EA 2WB9A 5D9WA 4YH2A 1UC7A 2GQLA 2FD3A 1M2BA 1EEMA 3I69A 2ALBA 2CX3A 2YZUA 4XRDA 5LCZA 4ZL8A 1OKDA 2B5XA 1B8XA 3F4SA 3LSZA 1ABAA 2C80A 3GKMA 1GSDA 4BWQA 2R37A 4NHWA 2C0EA 5IMCA 1QMVA 4EVMA 4LL4B 4H86A 5B8AA 3GTUA 2HSYA 2F51A 3GX0A 2JL4A 4KDYA 1F2EA 3C7MA 1V98A 2XHFA 2ZNMA 3F8UA 2VCWA 1AQVA 4WXTA 2CQ9A 4ZXGA 2OBKA 1FW1A 1XFLA 2H30A 4I5QA 2LNTA 6GSUA 1XVWA 1HNAA 2B3SA 4I97A 4EUYA 4I2UA 2R6KA 3L9UA 1SK2A 3EWLA 3UIWA 2OKAA 1AAZA 2C1YA 2IFQB 2M80A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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