2HSHA

Crystal structure of c73s mutant of human thioredoxin-1 oxidized with h2o2
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKSMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Buried s-nitrosocysteine revealed in crystal structures of human thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Thioredoxin
total genus 40
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hshA00
3I6AA 2C0DA 4MK3A 2AUVA 4Q5NA 1Z6NA 4IHUA 4K2DA 5HR1A 1K3OA 1TKDB 2K18A 1PX6A 1RQMA 1XWAA 5ABRA 1GLPA 3VWWA 4DEJA 4MJCA 5D9XA 4X0XA 3IXRA 1G6WA 5G1LA 1WP0A 3GKXA 1TTZA 3GN3A 1LU4A 4MPGA 2H70A 1URMA 2MBSA 3US3A 3GHAA 5COHA 2D2ZA 5JWQB 1EGRA 3GSSA 3KTLA 1PSQA 4PUFC 2B1KA 2J9HA 2EIQA 5G30A 4PQ1A 1XIYA 3UAPA 3M0FA 1S3DA 4MPFA 4L0WA 5DCGA 1A2JA 3LJRA 4MLYA 5IM9A 2PERA 3DWVA 1PKWA 2HYXA 3QAVA 1FOVA 3F9UA 3H8QA 3O6TA 4MJEA 2YOIA 3UOMA 1BJXA 3A2WA 5C00A 3W8SA 2I3YA 1R5AA 5HFKA 4POBA 2PWJA 4DSSB 3RHBA 5JWOB 1QFNA 1TDIA 3FK8A 2CX4A 3APQA 2C0EA 5ECPB 1HNBA 3BD2A 5H5QA 2QKEA 5IO2A 1SJZA 3ZVJA 2LQOA 2IMFA 3P2AA 2ON5A 2KUCA 2GQKA 1ZCPA 1FO5A 2FA4A 5B8AA 2HT9A 3E9JB 4KUNA 1PX7A 2B5YA 4OFTA 3IPZA 2RUEA 1J08A 6GSXA 1GNWA 3ZMLA 4QQ7A 4TN8A 2BJXA 2FLSA 1QUWA 4K0NA 1YQ1A 1A23A 2OKAA 3DVXA 1OC9A 5CRGA 1EEJA 1W89A 5IOXA 3IAM2 3KIJA 3KXOA 1YF1A 1K3YA 5IMVA 3TJFA 4FYBA 4LA1A 5L71A 2JACA 3FY7A 1YF0A 1VRSD 4JZQA 2HZFA 3LXZA 2VCWA 5A4VA 2P5QA 4LL1B 3ERWA 2ZCTA 2IJYA 2TIRA 1YEPA 2O8VB 2XPDA 3ERFA 3WT2A 3G7JA 1W4VA 5B7CA 1MDIA 4QL9A 3PH9A 4O32A 2DMLA 1VF1A 4OCEA 2C3TA 3TB2A 1KTEA 3PR8A 5D9VA 2DMMA 3HVSA 2HI7A 2DJ0A 3GX0A 2JU5A 3RPPA 1F37A 3QDNA 1GSQA 2B5EA 4RUVA 5HR0A 2FNOA 3QPMA 2WS2A 3D22A 2DJ2A 2C1YA 2AB6A 3ME8A 2LKUA 1QQ2A 1NHYA 2WRTA 2H1AA 3UBLA 1FVJA 1U3AA 5J4UA 4AJ8A 5CAXA 4TR4A 3KTBA 2IMDA 1GLQA 1N8JA 4PXOA 5HQPA 3MWHA 3Q18A 2HLSA 4JEDA 2V41A 3SBCA 3LORA 3UJ1A 1SD8A 5FWGA 2R5GA 1FHEA 5JCUA 1M9BA 3FZ9A 1AIUA 1M2BA 1OC3A 2C0FA 3WGXA 1Z6MA 1O85A 3MDKA 5INYA 5KEJA 4XIHA 2YZHA 3Q74A 1ML6A 3RAZA 1B8XA 4ZL7A 4FO5A 4F9ZA 5H5RA 3G7IA 4I2TA 4IW9A 5GZZB 4FYUA 3KH7A 1ZOFA 4HQSA 5HFGA 5ELGA 1T1VA 5DDLA 2H19A 3LEFA 3DYRA 2DIYA 4IP6A 2F9SA 5IPHA 4E8HA 5EVOA 11GSA 3FZAA 1DUGA 2LNTA 4G9HA 3ZREA 3APOA 3KM6A 3FZ5A 4F0BA 1EOGA 2OJLA 4POMA 4OCFA 2AYTA 3CRUA 5D96A 6GSSA 2IMIA 5D9WA 5KN2A 3KJYA 1XW5A 4D73A 1YY7A 2LS5A 3I43A 1JHBA 3H1NA 1J9BA 4P3YB 1BG5A 2L57A 2GSTA 2GTUA 5DQYA 4GTUA 4HZ4A 4ULXA 2H73A 5ECSA 1I9DA 2OBIA 1XWGA 4PURA 3CXGA 1GH2A 2GQLA 3IDVA 3TRQA 5AGYA 2EC4A 1SENA 4MH2A 1OE8A 2KP2A 3AY8A 2Z9SA 1XVQA 2XHFA 4L8EA 2DJJA 1K0BA 4MZWA 3G7YA 5D73A 5ECIB 3LFLA 2E7PA 4AJ6A 4IJIA 2B3SA 4WR5A 2YJHA 2OADA 3DVWA 4BVXA 1SKRB 4IKHA 3FR3A 5FT3A 4O92A 2ES7A 5KN1A 4XS4A 1GL8A 1A24A 2GGTA 3EE2A 4F0CA 4D73B 4HJMA 1QGVA 3WD6A 3VI5A 1R7HA 5CNWA 3LG6A 3VFIA 1JFUA 5F07A 5DBQA 3VPQA 5LD0A 2JL4A 1HNCA 3D4TA 4WF5A 2B1LA 2REMA 2XBQA 1F3BA 5DVBA 5IIZA 2CAQA 2I1UA 2L5LA 2F51A 2AV4A 1G7OA 1ST9A 3VLNA 3L4NA 3CRTA 5FHIA 2P5RA 2P0GA 3ME7A 1M7TA 5AIVA 4EVMA 1OKTA 4I97A 3EINA 4KDYA 2FY6A 2R2JA 1AXDA 2H76A 1O8WA 4XRDA 5G5EA 1IYIA 1TI3A 3QD9A 4X1UA 1RK4A 1S3CA 4ZBBA 4MZCA 3M8NA 4MF6A 2LEGA 2AAWA 2PGTA 3W8JA 2DSAA 2E2MA 1TOFA 3GTUA 4BWQA 4WBRD 1SJIA 3HDCA 4IQAA 19GSA 3NOFA 1WIKA 3TJJA 1PL1A 2N5AA 1B9YC 4OO4A 1JLWA 4TR3A 1GSSA 5G5FA 6GSYA 4F2IA 3H4KA 3ZRDA 4EUYA 2JZRA 5G31A 1TU8A 2GVPA 3L9VA 3IK7A 1HQOA 4NWYA 2VIMA 4ECIA 2L4QA 4Q5QA 3ERGA 1GSEA 4XTSA 4KDUA 4AJ7A 3CSJA 2CZ2A 1O8XA 2C80A 2IMEA 2VM2A 4ISDA 3WYWA 2V6OA 3C1RA 5HR3A 2H6XA 1JZDA 2RM5A 3TCOA 2QGVA 3GH6A 3ZZXA 1UA5A 2L59A 4PQHA 1Z3EA 1TJDA 3PINA 2B5XA 1UC7A 1V40A 2JZSA 4QL7A 4O5RA 4ZL8A 3F0IA 3TGZA 5GSTA 1PN9A 2DC5A 3L9SA 2YWMA 5ECKB 1PMTA 4RI6A 2RIIA 2VUPA 2ZUPA 4XS1A 2LSTA 5CO3A 1WJKA 5IMFA 2BTOT 5AIXA 4ML1A 3FHKA 2VL9A 6GSWA 3QMXA 1K3LA 3LGCA 1GSUA 3EMXA 2L4CA 3H79A 4OMVA 2TRXA 20GSA 4HEA2 3LSZA 4F82A 1ERWA 3VURA 4TRXA 2HNLA 3NZNA 4N30A 2CQ9A 3ZFBA 5CRHA 1V57A 4ECCA 2OE1A 4E8EA 1ZMAA 3ZIVA 2PVQA 4ILFA 4NMUA 5C04A 2LTKA 2J23A 4BA7A 3LWAA 2WDUA 1EZKA 3HZ4A 3L0HA 1ERVA 2WFCA 3HVVA 3TJGA 3EU4A 3IBHA 3QR6A 2GSQA 3KH9A 3HKRA 1YEXA 1TRSA 2YJ7A 4PQIA 2VD1A 4KCEA 1TW9A 2XBIA 1VF2A 2YV9A 3GIXA 1DBYA 3TKRA 4EKZA 5DALA 2H1BA 2O89A 2FCHA 1BX9A 2IMKA 2B7JA 3RHCA 3GKNA 3TKPA 3PGTA 2PUKC 1SYXA 2I81A 1K0CA 2E2GA 2G0FA 3F3QA 5IMZA 3U5RE 1EGOA 1T3BA 1AAZA 2RM6A 1GSYA 4OFNA 1SJ6A 1JLVA 1X0RA 2GS3A 3ZL5A 2H75A 4ZBDA 4EC0A 4WEYA 2LRCA 5ECMB 3FR6A 4OO5A 5DAKB 2H0IA 2YCDA 3HA9A 2M72A 5LNKe 2H30A 4MJBA 3O3TA 4K9ZA 1XW9A 1T00A 4ZXGA 2CA8A 4I2UA 2IPAA 1SKSB 2C4JA 1G0TA 2FA8A 1A8LA 2C3NA 2PVOC 1ON4A 1AW9A 1OE7A 2MBTA 3DEXA 5DALB 2X99A 1F2EA 4POLA 1WRYA 3DD3A 3S9FA 22GSA 5JCGA 4L0UA 1DE1A 4GLTA 4NHWA 1XWKA 2GZYA 3WT1A 2GLRA 1KNGA 1GTUA 2H8LA 1E6BA 4H86A 3D6IA 3IV4A 1EP8A 1UN2A 2YWNA 2M80A 3ZYWA 12GSA 2GT6A 1TP9A 1XVWA 5DJMA 2V2GA 1SYRA 2H6YA 3HZ8A 4DVCA 1MEKA 1H75A 4PNFA 4WBJA 2BMXA 4ACSA 5AN1A 2NPBA 1BEDA 2FWHA 1K0MA 3GV1A 2LUSA 4L5OA 3HCZA 3UVHA 2YWOA 2XC2A 3SWLA 4O7HA 3GL5A 4BPYA 4HZ2A 2LJKA 3UIWA 2GZPA 1HNAA 5CYYA 3TOUA 2HSHA 5J41A 1FW1A 3L9UA 2C8UA 3L78A 2H66A 4PX1A 1V98A 2VCVA 4HU9A 4TR0A 4KNDA 3WGDA 4BL7A 3UEMA 1ZZYA 1M2DA 4CW9A 1VF3A 2EIRA 4HS1A 1GRXA 5CREA 3C8EA 2CVBA 4DSRA 3F4TA 3CYNA 1X5DA 3U6VA 1V58A 4TOPA 4ZBAA 3EURA 5EPFA 2V6KA 4KGIA 3KCMA 4GXZA 1FB0A 3QAWA 5F05A 3TRXA 3KP8A 5IMAA 2VLVA 5EL8A 4J2FA 2OE0A 5AISA 2NDOA 4FH8A 3VWXA 2JADA 3GURA 3RBTA 2GDRA 1XZOA 1U3IA 1R26A 2OA7A 4TR1A 5D8IA 4ZL9A 2MMAA 3LYPA 3I69A 5KN3A 2JZTA 5DQSA 1JZWA 1CQGA 1X9SB 2V32A 5ECRB 2H71A 1T8EB 1A0RP 3F6FA 4V2LA 1SL2B 3FRCA 5KN0A 1AC1A 4I5QA 3ZITA 2HXKA 5B6MA 7GSSA 1Z7PA 4JRRA 3G9BA 2DIZA 4BWSA 1BYEA 4K7IA 2FWGA 2K9FA 4G2EA 3TKQA 1O6JA 2NTOA 2VCZA 4MZBA 1AQXA 1ERUA 2P31A 1FB6A 4X43A 3M3MA 4RQXA 2GSRA 6GSUA 1GUMA 2YZUA 1GTIA 4KW6A 4EXJA 1WPIA 2HFDA 3HY2A 2ON7A 2HRNA 2H74A 3I9V2 4G10A 4KB3A 3GFKA 4TR1B 4FIWA 3CTFA 4GSNA 1Z5YE 1GWCA 2HRFA 5GAPD 4EDYA 2IIYA 1JZOA 4EL1A 2A4VA 1A8YA 1VGLA 1QMVA 3CTGA 3ED3A 2LQQA 4IVFA 5A4UA 1MD3A 4MJAA 2H6ZA 3E0UA 1ZGNA 5J9CA 5HR2A 1GNEA 3IA1A 3MSZA 10GSA 1THOA 1WMJA 2O85A 3OR5A 3C1SA 6GSVA 1OYJA 4HI7A 4RI7A 4N11A 1SKWB 2LRNA 3F3RA 1PL2A 3BCIA 1M0UA 2IL3A 5F0GA 3ZVJD 4ID0A 4MH3A 4K7OA 3QFAC 1BQ7A 1YKAA 1JZRA 2MMZA 1PA3A 3GA4A 1TXXA 1N2AA 2LV3A 4MABA 2TRCP 1H4OA 2VCXA 1T7PB 1PQNA 1PRXA 2PU9C 3EWLA 2HE3A 2JSZA 4KDXA 1ACVA 3KP9A 1SU9A 5ID2A 4CDOA 5DJLA 3MAKA 1X9WB 4LLRA 1EOHA 1SL1B 1OVNA 5IMDA 2G2QA 1QK8A 2YN1A 1M2AA 4XCSA 16GSA 1USBA 1MDKA 3N5OA 4AGSA 3K8NA 4GRFA 4V2MA 4WETA 1ERTA 1HD2A 3GL3A 5GAND 4IJ3A 1EV4A 3BCKA 2NBSA 2JSYA 2GQMA 3DXBA 2L5OA 5E4WA 3DKSA 4POKA 4TVEA 1B4QA 3GUSA 2DJ1A 4CHSA 4ECBA 2R37A 4TXVA 4IGJA 1TK5B 3ZMKA 3D0ZA 3FZ4A 2MYGA 4N0VA 1XFLA 3QOUA 1THXA 3TRPA 4YQVA 3M1GA 1S3AA 1XPVA 1WWJA 2K6VA 2F8FA 5B6NA 2A2SA 3E3EA 5CP1A 1PGTA 1CQHA 5ID2B 1A2MA 4TXOA 3DGQA 1J0FA 3RDWA 3JCML 1GP1A 4ML6A 2WJUA 5B8BA 2CX3A 3DIEA 6GSTA 2IFQA 1GTBA 2X8CA 3GRXA 2ALBA 4OFMA 2X64A 1O81A 2PN8A 2QC7A 2YP6A 14GSA 5ECQB 1K0NA 3MNGA 2PMTA 2YANA 2VD0A 4ZILA 1EV9A 4KSOA 3TUEA 1GUKA 1LJRA 5ECNB 4IBPA 2CAIA 3ZLPA 1G7EA 2PBJA 2VCTA 2GZZA 4BVYA 1U87A 1XW6A 5DAKA 3D4MA 4EF0A 2AHEA 3EU3A 3KMNA 4HU7A 3HYPA 3TKSA 3GMFA 2E0QA 4ZB8A 4K8MA 5GSSA 1DSBA 1ILOA 4TXOB 2MMOA 1B9XC 3BBYA 1MTCA 3DRNA 3F63A 1F9MA 1PKZA 3GH9A 2LJRA 2H1DA 2IFQB 3FEUA 1WE0A 3IAS2 1SK1A 1TRUA 3P7XA 5DCHA 4KA0A 1XWCA 4YQMA 3H93A 1U6TA 8GSSA 3HVXA 3VI7A 4G19A 1B4PA 2X8HA 2FUG2 4LMVA 2B7KA 3F4RA 4NAXA 2H01A 4YQUA 3QAGA 4IN0A 2FD3A 3TJKA 1Y25A 1KBNA 5ECOB 2K8SA 4YAPA 4NV5A 2H1GA 1ZYEA 3GX8A 4XHMA 4GQFA 3BOAA 13GSA 3HJOA 3D21A 2M46A 2VO4A 5F8BA 2VL2A 2DBCA 5IOWA 2QSIA 1SK2A 2IN3A 3M9JA 3VK9A 4K6XA 3A2VA 4K1FA 4WKWA 4JR4A 4KX4A 4EO3A 3A2XA 3A3TA 4Q5FA 3HXSA 2R4VA 3UVTA 1XXUA 4WF4A 2WZ9A 4MDCA 1FVKA 1OC9B 4GSTA 3EYTA 1TRWA 4K0GA 3WGEA 4HJ2A 3GKKA 3IC4A 2LNSA 1DE2A 4EDZA 2DJKA 2VLTA 2H0HA 2FWFA 3IOSA 1SD9A 4ZB9A 4V1Ag 2HSYA 2N5BA 5ECLB 2OE3A 3FR9A 3C73A 4NXIA 4ZIJA 1UVZA 1Z9HA 4WXTA 4PNGA 3VWUA 4PGTA 2WCIA 1V2AA 2XPEA 1XCCA 2FHEA 4NHZA 1NW2A 1M9AA 4HOJA 2C3QA 1XBSA 1GUHA 1YZXA 1RW1A 4I6XA 4GCIA 2HZEA 1G6YA 1A2LA 1NM3A 5A5KA 3DMLA 3IR4A 1R5PA 2VL3A 3GYKA 4IQ1A 1U88A 4MCUA 2RLIA 1MDJA 3VWVA 2R6KA 2ZNMA 4AF2A 1EEMA 2PPTA 1QXHA 2YWIA 4ECJA 2I4AA 1XOAA 3FW2A 2O87A 3CSHA 1O73A 4MA9A 4KH7A 4Q5RA 2VAFA 1E2YA 1EWXA 4FYCA 1F3AA 3ZTLA 4JBBA 3TDGA 2WULA 4EE0A 1T4ZA 3FKFA 2KHPA 5F06A 1Q4JA 1WOUA 5HFIA 2F3MA 3ZIJA 4XS6A 3UARA 1X9MB 1GULA 2FWEA 1XWBA 2FGXA 3HD5A 1ABAA 4TW5A 1FAAA 1NHOA 2R3XA 4V1Ap 5G2ZA 2KLXA 2I9HA 4KE3A 1GSFA 2HZEB 1TU7A 3TKSC 4OWYA 1Q98A 1Y6EA 1GSDA 1C72A 4IP1A 4XRAA 3HJMA 5ELAA 4F03A 2DLXA 2B6MA 2OBKA 9GSSA 1ZL9A 3F8UA 2X8GA 1EP7A 3EC3A 4JU5A 1LBKA 3F6DA 5LCZA 4NPBA 3UL3A 1OKDA 3ISOA 3ZFLA 1K0DA 3QFBC 4NV2A 3LYKA 5H5SA 5CRDA 4GQCA 3UBKA 3KD0A 5JCWA 4HQZA 3CBUA 2A2RA 2GT5A 3O76A 2VLUA 3CMIA 3TKSE 4N10A 2VCQA 5D9TA 5IMCA 3TJBA 1F6MC 4I8BA 4V2NA 4HUAA 1K0AA 3KEBA 1YDKA 3Q6OA 4YAVA 5D93A 2MMNA 3GSTA 2K8VA 2NVLA 1X5EA 17GSA 4IELA 2DJ3A 2O7KA 3QCPA 3BJ5A 2MZCA 5E59A 5A4WA 4GF0A 2VL2C 1VF4A 1T4YA 3C7MA 4J56E 4DSQA 4GWRA 3FYGA 1TI1A 2WB9A 2LJAA 3KZQA 4OD7A 1SL0B 3C71A 1OC8A 4PUAA 1V9WA 3IK9A 5IQYA 3Q19A 4WR4A 5EY6A 1X5CA 1A0FA 1HYUA 4XS4B 3IRAA 4KAEA 2CT6A 5IPGA 5J9BA 3UMAA 3TOTA 2RUFA 2L6DA 3EMPA 4K7NA 3VPTA 2KOKA 3RPNA 1BAYA 4JE1A 1AQVA 3GKMA 3W6GA 5ECHB 2CZ3A 4IS0A 4MF7A 4N0ZA 4MF5A 3KGKA 1K0OA 4RQRA 2YNXA 1B48A 1YJ6A 3EVIA 1I5GA 5J3RA 4TKYA 4LMWA 2CVDA 1XOBA 2N5FA 3LQ7A 4KCAA 5CRWA 2V1MA 4ZB6A 3R2QA 2LRTA 1TK0B 3CSIA 2H72A 4L5LA 3HJPA 2YV7A 2OACA 3F4SA 1YKCA 3IE3A 3D5JA 1AQWA 2VM1A 3P90A 2EIOA 3A5WA 4JR6A 2GSSA 1IYHA 2L6CA 3P8WA 2IWTA 1SK0A 1AUCA 3J7Yb 5G1KA 4YH2A 2CV4A 1ZYQB 1R4WA 1Z7RA 5JWRB 4J57E 4MMMA 1TRVA 2C0GA 5IO0A 3V1WA 1NSWA 2KP1A 5J5NA 1MD4A 3LXTA 3M9KA 1O7UA 5ENUA 4Z7XA 4GSSA 3KMOA 4KSMA 4HDEA 1M99A 1PD21 3N9JA 3NIVA 3HHVA 3GNJA 2H0GA 1OAZA 3GTUB 3J7Yk 3APSA 4MP4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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