2HSHA

Crystal structure of c73s mutant of human thioredoxin-1 oxidized with h2o2
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKSMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Buried s-nitrosocysteine revealed in crystal structures of human thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hshA00
2FWEA 4TR4A 3ZZXA 2H72A 1AC1A 3F63A 4OFTA 4GSSA 4IN0A 4Q5QA 1X0RA 2GQMA 3HKRA 1PL2A 3KH9A 2PU9C 18GSA 3QAWA 2P5QA 3H1NA 1ZYEA 3QDNA 2YZHA 4EDZA 2P0GA 2A2SA 3WT1A 2VLVA 2VUPA 2LKUA 3ERGA 1A2MA 1GSDA 1E6BA 2B5YA 2C3NA 3CSJA 1V9WA 5ELGA 2QGVA 4F0CA 1ERWA 3CSHA 4PUFC 3AY8A 3TOUA 1GP1A 1Y6EA 3F6DA 1R5PA 4MK3A 2MMAA 2HE3A 4O32A 3DIEA 5B6NA 3BOAA 2VCWA 2OACA 2XHFA 2E7PA 4MH3A 1MDKA 3I69A 3RAZA 1SJZA 2AV4A 4IGJA 4N0VA 3LSZA 1T8EB 4PUAA 4Z7XA 4K2DA 4BVYA 1ERUA 2DLXA 2VLTA 3KEBA 2C8UA 3IBHA 2KOKA 1O6JA 1PSQA 3J7Yk 3G9BA 2OE3A 5ID2A 1Z7RA 2QC7A 5DQYA 2KP1A 5GSTA 3EWLA 1BJXA 3G7YA 12GSA 3ZITA 1LJRA 3ED3A 2A4VA 2GLRA 3C71A 2HZEB 1MDIA 1MD3A 1S3AA 5HFGA 3SBCA 3F4TA 1I9DA 2C0FA 4GRFA 3UOMA 3Q19A 2XC2A 1GSSA 5J5NA 3M8NA 2V6OA 2RLIA 1KEBA 19GSA 4GF0A 4EUYA 3ZMKA 4DSSB 1TRSA 1OC9A 4KCEA 4ML6A 2FY6A 2LQOA 2LRTA 1AQXA 4XS1A 2CQ9A 5CAXA 3IXRA 5KN2A 2R6KA 1U3AA 1GSEA 1K3LA 5JCUA 2H1BA 4O5RA 1VF4A 3KP9A 4E8HA 5IMZA 1WWJA 5HR0A 1YEXA 1SD8A 3D22A 2YPMA 1EV9A 4O7HA 3CTGA 1DE1A 2FUG2 4E8EA 2HNLA 1EP7A 2H1GA 3J7Yb 4N10A 5J4UA 1CQHA 4K8MA 3VWWA 3MDKA 5ECNB 1SYRA 3EVIA 1K0CA 5D9VA 1LU4A 2DJKA 1T4YA 2MMNA 2HSHA 4NV5A 3LEFA 2F51A 2GQLA 1K0MA 1T3BA 3A5WA 3GIXA 1H4OA 4KDUA 3UBLA 3P8WA 1I5GA 5CP1A 2M72A 1GTBA 1MDJA 4KAEA 1AXDA 1ZYQB 1GTIA 2WCIA 3PR8A 1HQOA 4J57E 5IPGA 2V6KA 1XW9A 4JEDA 1A2LA 3KIJA 2MZCA 2RM5A 3BCIA 3P7XA 4L5LA 3E3EA 2I1UA 1PL1A 2WJUA 2CV4A 3GUSA 1WRYA 1PA3A 22GSA 2GS3A 1WMJA 1TXXA 4MJBA 2K8VA 5D73A 4OD7A 2KUCA 4ZIJA 3GH6A 4V2MA 1YZXA 3TOTA 5IOWA 2GSTA 4OFNA 2K6VA 2IMFA 3VI7A 2R2JA 2YWIA 4K0NA 3VWVA 5B8BA 1ON4A 1YQ1A 5ECPB 4PQIA 4V1Ag 3HD5A 2B1LA 3D0ZA 4NAXA 4ECJA 2V41A 3KCMA 3FYGA 3F6FA 3FW2A 2LEGA 2VAFA 5F06A 5CRGA 1WIKA 2H01A 1KBNA 3ME8A 1KTEA 2H1AA 4TXVA 4WBJA 3QOUA 3UL3A 4EVMA 1TOFA 5LNKe 2I9HA 4MZBA 1U88A 2ON5A 3M0FA 3ZMLA 3GTUA 4KE3A 2LNTA 3GNJA 1XWKA 3CTFA 1CQGA 3H79A 3QFBC 1GTAA 1O73A 4K7IA 3VFIA 3L9UA 1BQ7A 1NHOA 2E2MA 2DSAA 2F9SA 2B5XA 5DALA 3LWAA 4HUAA 1IYIA 2H19A 1OYJA 1W4VA 1VF1A 1DE2A 4WKWA 2MMOA 1B9XC 4MPGA 1SL0B 2RUFA 3JCML 2CVKA 3M9JA 4JRRA 1K3YA 4MF5A 5COHA 4J2FA 1V57A 2H1DA 2FA8A 4TXOA 3VPQA 3IRAA 3QMXA 1YDKA 3HVVA 4JU5A 2VCZA 2L6CA 1GRXA 2GT5A 5DAKB 1X9WB 3GSSA 4HZ4A 1O8WA 2VCQA 1X9SB 2F3MA 1R4WA 3KXOA 2YV9A 1G6WA 2E0QA 2VIMA 5AGYA 2JU5A 2M46A 2PWJA 1OVNA 1X9MB 2PGTA 1TDIA 2AYTA 3D4TA 3F4SA 3F8UA 4HJ2A 5G1KA 1ST9A 4Q5NA 3QPMA 1FB0A 3F0IA 5IMCA 1SK1A 5J9BA 1A8YA 3FZ9A 2DMMA 3MWHA 5H5RA 4TR1B 1OC8A 3HXSA 1M9AA 5D93A 4IBPA 5B8AA 4D73A 2VL9A 1W89A 3GFKA 3F9UA 1EOHA 3V1WA 1QQ2A 1B8XA 2IIYA 2YCDA 3UVTA 4G10A 5DALB 1YKCA 3UJ1A 5JWOB 3IC4A 4MMMA 2JZRA 4ECIA 3C1RA 1HNBA 3GMFA 2X8CA 4LL4B 5ECMB 5HQPA 5IMFA 4HI7A 4MF7A 1XIYA 1AQWA 2R37A 5JCGA 2YJ7A 1XW6A 2VL2C 4CW9A 4TXOB 3N9JA 5C00A 1KNGA 3ZREA 4TRXA 4HZ2A 2YOIA 3L4NA 4PQHA 2H76A 1GWCA 2HI7A 3M9KA 4YQUA 5AIXA 3UMAA 3RPPA 3PH9A 1OE7A 3TKSC 1ERVA 3H93A 1Z5YE 4X1UA 3WGDA 1A8LA 2LQQA 3HY2A 5D96A 4TVEA 2YNXA 3NOFA 4MJAA 2MYGA 4IJ3A 2R4VA 2LSTA 2YP6A 1QK8A 4D73B 2L5LA 5ECQB 4LMVA 5ECSA 2H66A 3C8EA 2RM6A 3CBUA 1EGRA 5CRHA 4Q5RA 2WFCA 1T7PB 3TB2A 2N5BA 1FO5A 2P31A 1Z6NA 2JACA 1K0DA 1YEPA 1TI1A 1ERTA 5J3RA 3VWXA 2CAIA 4GSNA 4XTSA 2HZEA 4ZL7A 3UBKA 5EL8A 5AIVA 3KJYA 3ZIVA 3DRNA 2EIRA 1G7OA 3R2QA 1BYEA 1YY7A 3DVWA 1DSBA 2K9FA 1OAZA 4X0XA 2O8VB 1Z9HA 3BCKA 5FWGA 2CA8A 1X5DA 4DSSA 5D8IA 1TTZA 1VF2A 1F37A 2MBTA 2GZYA 3QD9A 3G7IA 3EU4A 4AJ8A 3NIVA 1SU9A 2B7KA 4GSTA 3CXGA 4MLYA 3TKSE 3Q6OA 3TRPA 3I43A 4NHWA 1A23A 3CMIA 2IMDA 1FB6A 1XCCA 2VM2A 2IMKA 3EC3A 5DVBA 2GT6A 1A2JA 1EZKA 1O7UA 3FEUA 2CT6A 4ZB9A 3F3QA 5EPFA 1WP0A 4CDOA 1TU7A 1OKDA 4LA1A 5JWQB 3UVHA 4EE0A 5G5EA 2CAQA 3ME7A 1NW2A 1N8JA 2E2GA 3ZFLA 2I4AA 4FO5A 4HEA2 3LXZA 2B5EA 1FW1A 1XW5A 2L5OA 1DBYA 1O81A 2AUVA 2H0GA 4V2LA 2PBJA 5CRWA 2O7KA 2WGRA 5CNWA 1JLVA 4EF0A 4MP4A 2L4QA 4WR5A 3QR6A 4AGSA 4PXOA 3HA9A 4TR3A 4IJIA 3DD3A 1ZZYA 2IJYA 1MD4A 2H8LA 2OKAA 2YZUA 5D9WA 1EGOA 3E0UA 1F6MC 1RW1A 4ZBAA 1T00A 1PRXA 1JZWA 4RQXA 1XXUA 4BPYA 3GKNA 2HZFA 4TW5A 4ML1A 2I81A 1AQVA 4ZBBA 3P90A 4AJ7A 4K7NA 4PX1A 3VK9A 2NBSA 4IW9A 1O85A 1FVJA 4X43A 5IIZA 4N30A 3TKRA 3ZL5A 1XWBA 3N5OA 3D21A 4LLRA 4K9ZA 4GWRA 1MTCA 1JHBA 1SYXA 2LJKA 1TKDB 1K0NA 4XRDA 3C7MA 2WS2A 2DIZA 4XHMA 1JFUA 1Q4JA 3H8QA 5IPHA 4BWQA 3TJKA 5FHIA 2H70A 1V2AA 1PQNA 4ECBA 1URMA 1MEKA 1X5EA 4OCEA 2KLXA 2L59A 4HJMA 4RI7A 3GYKA 2RIIA 4OCFA 3EMPA 4IKHA 6GSTA 5G5FA 1UA5A 3WGEA 2WULA 8GSSA 2PN8A 2GTUA 1Z3EA 3DMLA 4IQ1A 1A0FA 1SK0A 2BJXA 2C0EA 4OO4A 2LRNA 4FYBA 3ZYWA 4I6XA 5DBQA 1SKRB 2O87A 2WB9A 2F8AA 1NHYA 4ISDA 3A2XA 4PQ1A 3APSA 1GH2A 4BA7A 4FYUA 1K3OA 2FHEA 1GSUA 1HNCA 4F82A 2GSSA 4FIWA 4V2NA 2WRTA 3VLNA 2X64A 1GNWA 4K0GA 1GUHA 2OE0A 1GSYA 2C3TA 4H86A 3EURA 1WE0A 2X8HA 3P2AA 1ABAA 1PX7A 1K0OA 5ECRB 5GAPD 3KH7A 5DAKA 1GSQA 4ID0A 4BL7A 1PKZA 1B4QA 1RQMA 3EE2A 2EIOA 2FGXA 2AJQB 1PX6A 3FK8A 4LL1B 1TW9A 1Y25A 3D5JA 3PGTA 4PURA 4JR4A 4NPBA 1XOAA 3HJPA 5DJLA 1GL8A 1TK0B 2OJLA 1O8XA 2DJJA 3I9V2 4MZCA 4ACSA 3TJBA 4TR1A 2OADA 5HR3A 5A4VA 2JZSA 3H4KA 4EC0A 5G1LA 1YJ6A 5C04A 2HSYA 4HS1A 5EY6A 1SK2A 4ULXA 1M99A 4KSMA 4K1FA 1QGVA 1F9MA 1R7HA 1M0UA 2NVLA 2V2GA 4JZQA 1V58A 1M7TA 3VPTA 4YH2A 1F3BA 3IK7A 1GUKA 3IAM2 5ECOB 1QUWA 1GLPA 4IS0A 1PN9A 1FHEA 1FG4A 2BMXA 5HFKA 4AJ6A 3G7JA 2XBIA 2OE1A 4AF2A 2N5FA 4XS6A 2DMLA 1GLQA 1XWGA 2FD3A 2RUEA 2ZCTA 4JBBA 4F9ZA 2J9HA 2C0GA 1GNEA 3DVXA 2IPAA 2QKEA 2V1MA 1R5AA 3TCOA 5IMDA 4HOJA 3WYWA 4HU7A 4KX4A 2H73A 3A2WA 4MF6A 5HR1A 4WETA 2FLSA 3DXBA 5DCGA 1PMTA 2K18A 3DGQA 3HVSA 1VGLA 4NXIA 5IMAA 2NDOA 2LUSA 5FT3A 2PVOC 4MABA 2GVPA 4I2TA 1WJKA 3KGKA 4NMUA 3LJRA 3EINA 2GZPA 3MSZA 4NV2A 3MAKA 4F03A 4OO5A 2PMTA 3KTBA 5ECKB 3O3TA 4GQCA 1OE8A 5A5KA 4KDYA 2LRCA 5GAND 1AW9A 4QL7A 4POKA 1VF3A 4P3YB 4POMA 4MDCA 1S3CA 1LBKA 1YF0A 2PERA 1SL2B 2AHEA 2D2ZA 2GSQA 1U87A 2DC5A 3ZLPA 2LJAA 4GTUA 4POLA 4Q5FA 4EL1A 3CYNA 2H6ZA 1B48A 3F3RA 5IQYA 2DJ2A 2OBKA 1XVQA 3EYTA 2IWTA 5H5QA 1XZOA 3HZ8A 1XOBA 2H0IA 3HVXA 4YQMA 4XS4A 3E9JB 5KN0A 4IP6A 1EWXA 1GULA 1A24A 5CYYA 1F3AA 4MCUA 3O76A 3TGZA 4DEJA 3GSTA 5CREA 5LD0A 3TDGA 4F0BA 5G30A 1NM3A 5JCWA 2VCXA 2A2RA 2YJHA 3SWLA 4IQAA 5ECHB 3GKKA 2LJRA 1PD21 4IELA 4KB3A 3TUEA 3LG6A 1V98A 2KP2A 17GSA 1G6YA 1UC7A 1SD9A 1SENA 4HU9A 4I97A 2V32A 4HQZA 4QQ7A 5E59A 1B4PA 1SKSB 1SJIA 3L9VA 2R3XA 3ZTLA 4I2UA 3RHCA 1U6TA 1OC3A 1THXA 2IFQB 4F2IA 4L8EA 1ZL9A 2CVDA 4XIHA 4WR4A 3WD6A 2Z9SA 4WBRD 3APOA 1QXHA 3GX0A 3L9SA 2LV3A 4TN8A 2H6XA 1PGTA 1UVZA 3KMOA 4KSOA 2JSYA 2P5RA 1XVWA 4KCAA 3IOSA 3KMNA 4MA9A 9GSSA 5D9TA 5J41A 3GV1A 1EOGA 2B7JA 3IHQA 2TRCP 1GTUA 4WF5A 4N11A 2B1KA 5ECIB 2CX4A 2R5GA 3TJFA 2C1YA 4KH7A 3FZ5A 4XS4B 5D9XA 2LS5A 2H71A 3LGCA 2CZ3A 5GSSA 3GURA 3FR9A 11GSA 3UEMA 20GSA 5DQSA 5KN3A 2L4CA 2DBCA 2FCHA 4XRAA 1R26A 2IMEA 3WT2A 2H75A 3EU3A 1PKWA 2C4JA 2VL2A 3L0HA 3FR6A 5ELAA 1TU8A 2DJ1A 2DJ3A 10GSA 3RBTA 2CZ2A 13GSA 1WOUA 3M1GA 1JZDA 2XPEA 2QSIA 3GH9A 4WXTA 5EVOA 3TKSA 3APQA 5LCZA 1ACVA 1OKTA 6GSWA 3FHKA 2CVBA 5IM9A 3HYPA 4KGIA 2WDUA 2MBSA 3QAVA 4IVFA 2IL3A 3LYKA 3UAPA 4HDEA 3FR3A 1M2BA 3DWVA 3IA1A 2GGTA 5B6MA 1ZGNA 1J08A 3WGXA 3HZ4A 2HT9A 1TRWA 1E2YA 1Q98A 1XBSA 2FWHA 3HCZA 3GX8A 3VURA 2VOCA 2JSZA 4TR0A 5DJMA 2HYXA 3RPNA 2J23A 1ML6A 2ZNMA 1XWCA 4MJCA 2L57A 3W8JA 2TIRA 3O6TA 2H0HA 5F8BA 2VO4A 4BVXA 1SJ6A 5IO0A 4DSQA 1QFNA 1USBA 1SKWB 2ALBA 6GSSA 2FNOA 4EDYA 1Z7PA 1XWAA 1FOVA 4RI6A 4ZB6A 2ZUPA 2C0DA 4L5OA 1VRSD 1T4ZA 3KTLA 5L71A 2LTKA 1J9BA 1GSFA 1S3DA 3OR5A 2H6YA 2YWNA 2NTOA 4G9HA 5KN1A 4DSRA 1QMVA 4NWYA 3UIWA 4I8BA 4EO3A 3TRQA 3VI5A 4PGTA 2H30A 3IDVA 3L78A 3GN3A 5B7CA 2YWOA 4FYCA 2GZZA 3KZQA 1J0FA 3HHVA 5ID2B 3C1SA 2FWGA 4OFMA 1U3IA 2YWMA 3ZVJA 4KA0A 5G31A 2PVQA 3TRXA 1TK8B 4BWSA 2H74A 3CSIA 3D4MA 1JZRA 2MMZA 4ZB8A 4GCIA 6GSXA 2EC4A 4ZILA 2HRNA 2AAWA 1THOA 4KDXA 2VM1A 5J9CA 3FZAA 3TKQA 2JADA 4ZBDA 1TK5B 1OC9B 2L6DA 3RHBA 2LNSA 2EIQA 1XFLA 3RDWA 3A3TA 1G7EA 3C73A 1A0RP 4EKZA 3KD0A 3GRXA 5IO2A 1IYHA 3HJMA 3FY7A 4MH2A 5AISA 4TKYA 3K8NA 4K6XA 5E4WA 4ILFA 2JZTA 3IPZA 1EEMA 5F07A 3FRCA 4CHSA 14GSA 2GDRA 4V1Ap 5F05A 1AUCA 4ZL8A 1GUMA 1EP8A 1Z6MA 3IK9A 3D6IA 1NSWA 3CRTA 3IV4A 3ZRDA 1UN2A 4OMVA 2B6MA 1RK4A 2JL4A 5DCHA 1JLWA 3BJ5A 6GSUA 1K0BA 1ZCPA 3QAGA 3KM6A 5KEJA 2N5AA 2OBIA 3QCPA 4MPFA 4ZXGA 3IAS2 3ZVJD 4ECCA 2AB6A 2ES7A 5CRDA 1YKAA 5JWRB 3Q74A 4GQFA 2HLSA 4L0UA 4IHUA 1FAAA 4GLTA 1H75A 5ABRA 4G2EA 3DEXA 4YAVA 5A4UA 2WZ9A 1XPVA 2PUKC 4HQSA 1G0TA 2C80A 1V40A 1N2AA 2VLUA 4RQRA 1B9YC 2VD1A 2VL3A 3EMXA 3LQ7A 1HNAA 4EXJA 2B3SA 2DJ0A 4JE1A 4N0ZA 2XPDA 2X99A 2DIYA 3CRUA 4GXZA 2M80A 5INYA 1X5CA 4RUVA 3IR4A 1HD2A 4J56E 1BAYA 2IN3A 3PINA 4L0WA 3GL3A 1ZMAA 2G0FA 4FH8A 3IE3A 1EV4A 1BG5A 3W6GA 4PNFA 3LFLA 3S9FA 4KUNA 4YAPA 4I5QA 3HDCA 2KHPA 2HFDA 3VWUA 3ERFA 3GTUB 1TP9A 16GSA 3U6VA 4JR6A 2VCTA 2ON7A 1C72A 1M9BA 3W8SA 5HR2A 3BBYA 1TRVA 3A2VA 2CX3A 5CO3A 3TKPA 3F4RA 4TOPA 2FWFA 2K8SA 2X8GA 2IFQA 5ECLB 3DYRA 5G2ZA 5A4WA 1HYUA 1TRUA 2IMIA 4G19A 2GSRA 1TJDA 3ZIJA 2TRXA 3GL5A 3UARA 5HFIA 3US3A 6GSYA 2FA4A 4MZWA 1ILOA 1M2DA 4NHZA 3GA4A 4K7OA 7GSSA 2HXKA 4DVCA 2HRFA 4OWYA 4POBA 5F0GA 2GQKA 1TI3A 2XBQA 2YV7A 2G2QA 3HJOA 5GZZB 2O89A 3GKMA 2BTOT 2YANA 2VD0A 6GSVA 1ZOFA 1AAZA 2O85A 5ENUA 2PPTA 4LMWA 5IMVA 4O92A 1EEJA 1BEDA 5H5SA 3ZFBA 1JZOA 4KW6A 2I3YA 3U5RE 1YF1A 4PNGA 4YQVA 2REMA 2YN1A 4WF4A 3QFAC 4IP1A 3LYPA 1K0AA 2OA7A 1FVKA 3LORA 1SL1B 2VCVA 3ISOA 3KP8A 4ZL9A 4MJEA 1DUGA 5IOXA 3FKFA 5AN1A 1AIUA 3GHAA 1WPIA 3LXTA 3Q18A 2NPBA 5DDLA 3TJJA 4WEYA 1T1VA 1F2EA 3I6AA 4KNDA 4XCSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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