2HXKA

Crystal structure of s-nitroso thioredoxin
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
105
structure length
103
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPCKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDQDVASEEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Buried s-nitrosocysteine revealed in crystal structures of human thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 36
structure length 103
sequence length 105
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hxkA00
2FUG2 2LUSA 1XIYA 4J56E 3QDNA 1PRXA 2PVQA 2D2ZA 5IMVA 2GZPA 2C0FA 1K3LA 5IPHA 3PH9A 1FO5A 4IBPA 2PVOC 2H01A 3GIXA 2K8VA 2MYGA 3M8NA 4WR5A 3LSZA 1Q98A 2AYTA 4IHUA 2H73A 9GSSA 3H79A 2ON7A 2KHPA 4POBA 4TKYA 3EYTA 4ECJA 1GL8A 4L0WA 1ZCPA 2H74A 5G1KA 5ECPB 4MJEA 3KZQA 2J9HA 1B4QA 2I9HA 4EXJA 1GSFA 1A24A 4XHMA 4N0VA 3P2AA 2L4QA 3TUEA 1BAYA 2CA8A 3KJYA 2VOCA 3ISOA 3RAZA 4N11A 5G2ZA 2FHEA 2DJKA 3KH7A 3DIEA 2C3NA 4GSTA 5AISA 1EP8A 2YOIA 2B5YA 3HZ8A 1CQHA 4D73B 1XPVA 1TW9A 2IFQA 5COHA 1A2LA 4Z7XA 5ECMB 1Z7PA 5DVBA 1VF2A 4JE1A 5JWQB 1I9DA 1G0TA 2RUEA 4TXOB 3IOSA 4K2DA 1TK8B 2NPBA 3TRXA 5ABRA 5ECNB 5C04A 3L9SA 5ECQB 4DSRA 1M99A 4IS0A 1X9SB 4IW9A 3ZREA 2QC7A 2YCDA 2V1MA 1YQ1A 4ECCA 2HI7A 1SL0B 3EMPA 4HOJA 4EL1A 2A2RA 3PGTA 1TU8A 2AV4A 1PL2A 1MD3A 2BMXA 2GDRA 4JR6A 3FZ4A 4MH3A 2PBJA 3FR6A 4K0GA 2GGTA 1MEKA 4NXIA 4PUAA 3ERWA 1KBNA 3HXSA 1T4YA 5LD0A 3GTUA 3NOFA 3F9UA 3IAS2 2WJUA 2JL4A 5LNKe 1V2AA 2WB9A 3CBUA 5D8IA 1X9MB 1FB0A 1URMA 2O8VB 3LXZA 1EZKA 1MDIA 4F03A 2VLTA 2H1DA 1MDKA 2VD1A 2H1AA 2VUPA 1O8XA 1XWGA 3PINA 5A4WA 4MCUA 1X5CA 3D5JA 1PKWA 19GSA 2HZEA 4YQUA 2YANA 1WWJA 5CAXA 1S3AA 3H4KA 1GSQA 3FW2A 1YKCA 4OO4A 3ZMKA 3TGZA 2X8GA 3WT1A 1WIKA 3TKPA 4FYUA 2JSZA 2ZCTA 5CYYA 5INYA 1SK1A 2CZ3A 1Z6MA 1PX6A 3FHKA 2RLIA 1VRSD 1TI3A 3Q19A 2FLSA 3IK7A 2C8UA 2LQQA 1HNBA 3D22A 2PUKC 4Q5FA 3TKSE 1QK8A 3TJKA 2P5RA 2XBQA 5G5FA 3F63A 2CT6A 4CDOA 17GSA 2E2MA 1JLVA 2X8HA 3M3MA 2G2QA 4RI7A 2LNSA 4MF7A 3LXTA 5EL8A 4POKA 3DVXA 1THXA 5ECKB 3GL3A 3ERFA 2MMNA 1UN2A 3FZ5A 4TVEA 2X64A 3ZVJD 1SYRA 2NBSA 3TJFA 1OAZA 1NSWA 3ZMLA 1PMTA 4DSQA 1O85A 3CRUA 4ISDA 3RHCA 2IJYA 3D6IA 2FGXA 3ZIJA 3WD6A 2GQKA 1TI1A 2G0FA 5A5KA 1F6MC 1T4ZA 4XS1A 2PERA 4ZBAA 3DVWA 3N9JA 4ZL7A 3ZFLA 3D4TA 4N0ZA 4FYCA 4MH2A 5D73A 3U6VA 3KXOA 3QAVA 5CRHA 2FWGA 5B7CA 4XCSA 4K7OA 2IPAA 3RBTA 3HY2A 2YV9A 1G6WA 5D9VA 3PR8A 4G2EA 3P90A 2GS3A 3V1WA 2B1KA 3DMLA 3DEXA 4MF6A 3IRAA 4L0UA 5A4UA 1AW9A 4EKZA 1BQ7A 2VM2A 2JZTA 3D21A 1IYHA 3TRPA 2M72A 1YF0A 4K9ZA 4I5QA 4MPFA 1AQWA 2ZNMA 5H5QA 5ECRB 1JZDA 3GKXA 4XIHA 3GH6A 3VPTA 1TRSA 5HFIA 2CAIA 4KW6A 1GLQA 4O5RA 1M2BA 3HYPA 2VCQA 4GF0A 2WDUA 4I2TA 1V58A 2R3XA 1XWBA 4MABA 3VURA 2B5EA 1JFUA 4MK3A 4NAXA 3O3TA 1GLPA 1K0OA 2L6DA 4GLTA 3MDKA 1TK0B 3ZTLA 2F9SA 3M9KA 3LORA 2LKUA 2K9FA 1NW2A 1EEJA 2NVLA 1IYIA 4JRRA 2YWNA 3VI5A 2LSTA 1DSBA 1G7OA 1N8JA 2ON5A 2YWOA 3EU4A 4PQ1A 1YEXA 3KH9A 3UIWA 2H6ZA 5HR0A 1X9WB 1ILOA 2BTOT 4ZB8A 12GSA 6GSYA 4HQZA 1HNAA 3EURA 3ZL5A 1VF4A 1SL2B 1WPIA 1G6YA 2CZ2A 2B5XA 3P7XA 1EGRA 2YPMA 3I6AA 2FWFA 3E9JB 1USBA 2H6XA 1PKZA 3ZYWA 5GSSA 5IOWA 2LQOA 2YJ7A 3L9VA 3RPNA 2I3YA 1FHEA 1OVNA 1OKTA 1YDKA 3F3RA 4AF2A 1K3YA 2OADA 2JZRA 5JCWA 1XZOA 1SJIA 1VF1A 4HJMA 2N5BA 5J3RA 4O7HA 2C80A 2VLUA 2NDOA 4RQRA 4WKWA 3C7MA 1E2YA 1BJXA 1OC3A 4EE0A 4F0BA 5EPFA 5D96A 5ECOB 1AQVA 4QQ7A 1PN9A 2OE1A 2PMTA 4NPBA 1B9XC 2KLXA 4GXZA 1T1VA 4EVMA 2VL2C 2DJ2A 1U88A 4ULXA 4ML1A 4HZ2A 2PPTA 1OC9A 3VI7A 4TR1B 5IQYA 4MMMA 1GWCA 2FD3A 4BVXA 2R5GA 4KSMA 1B4PA 2L4CA 1ERVA 3S9FA 1R5AA 1VF3A 2L5LA 3APSA 3EVIA 1GSYA 5IM9A 2DBCA 5JWRB 2V2GA 4PQHA 1E6BA 1QUWA 5F0GA 3RDWA 4TRXA 1ZZYA 3BD2A 1XVQA 4TN8A 1MDJA 2PGTA 3JCML 1JZRA 1HD2A 4ECIA 4OMVA 5ECHB 5KN0A 3BCIA 3A3TA 1DE2A 2F8FA 6GSXA 2H8LA 2XBIA 1SKSB 5LCZA 1K0NA 3VWWA 4TW5A 6GSSA 2JSYA 4WF4A 1ZOFA 2GLRA 3GYKA 5CP1A 2R6KA 2WS2A 3UVTA 3CTGA 1H75A 1ERWA 5ENUA 4GSNA 2LJKA 4HEA2 5EY6A 3F6FA 1H4OA 1JZWA 1TJDA 4PQIA 1SU9A 4KAEA 3KIJA 2DSAA 2YWMA 2HSHA 1GSUA 1WMJA 3HD5A 4MP4A 2DIZA 2REMA 1RQMA 1GUMA 2WRTA 4DEJA 1PQNA 1ERTA 2VLVA 2CVBA 1GH2A 2GT6A 3GA4A 4TOPA 2C0GA 1ACVA 5DAKB 4EDYA 4EC0A 4HQSA 3HJMA 4LA1A 2VL3A 1PSQA 4HUAA 1R4WA 4WXTA 3Q18A 4EDZA 3QMXA 4MZBA 1ML6A 4FO5A 2K6VA 3F8UA 3H8QA 1EWXA 2F3MA 2IMEA 3IPZA 2B7JA 4MJBA 1TRUA 1TP9A 8GSSA 2IMIA 4G9HA 2MZCA 1FVJA 2X8CA 5J5NA 4F2IA 5JCGA 1M9BA 4KNDA 1K0CA 2GSSA 4X0XA 2RIIA 3FK8A 4V1Ap 1WRYA 3TOTA 4PGTA 4NWYA 2XPDA 1GNEA 1X5EA 2H19A 3W6GA 2FWHA 2C0DA 1RW1A 2AB6A 3D0ZA 4HDEA 1A23A 3GSTA 4XS4B 3IA1A 1VGLA 4YQVA 5E4WA 2VD0A 3IC4A 1V98A 2MMAA 5DCGA 3W8JA 2A4VA 1N2AA 2AJQB 5ECSA 2MBTA 1U6TA 1SK0A 4ML6A 3CSIA 1Z9HA 1AQXA 4KUNA 4DVCA 3ZVJA 3LYPA 1F9MA 3FYGA 2HLSA 4XTSA 3LEFA 3Q74A 2FNOA 4KDUA 3FKFA 3IE3A 4Q5RA 4YH2A 5CRWA 3FY7A 4ZB9A 4DSSA 1S3DA 2V32A 2C3QA 3GHAA 2H72A 2QKEA 4GSSA 3ZIVA 3IV4A 5GAND 3CYNA 1EP7A 1Z7RA 2IL3A 4PUFC 4P3YB 3VFIA 3NZNA 4E8EA 3ERGA 1T3BA 4LL4B 3UOMA 2O85A 3M9JA 4KSOA 2H66A 2LJRA 3TJGA 1PGTA 3HA9A 3KM6A 3GURA 2TRXA 1A8LA 3QOUA 1LBKA 5D9XA 1HQOA 1O73A 1GSSA 3F4TA 5G31A 1WP0A 2OBKA 22GSA 1O6JA 1QQ2A 2L59A 5ID2A 1V57A 2R37A 4I8BA 4MJCA 4O32A 4K1FA 3GFKA 3UAPA 5GSTA 4N30A 1SKWB 1A2JA 4TR4A 3I9V2 1M2AA 1FVKA 1RK4A 2IFQB 4V2MA 3TOUA 4GRFA 4ZBBA 2H30A 1K0AA 3RPPA 2VO4A 2P0GA 3C1RA 2HNLA 6GSVA 3ZLPA 1R7HA 3KMNA 3LGCA 4CHSA 4ID0A 5DJMA 1GSDA 3QAWA 4OO5A 1PL1A 5HQPA 1A0FA 2HFDA 2OBIA 1FW1A 3R2QA 2LEGA 1CQGA 3C8EA 4PNFA 3I69A 4K6XA 4ZIJA 7GSSA 4K7NA 4KCEA 2I4AA 1KTEA 3DKSA 4E8HA 5JWOB 2H0IA 1SD8A 1GULA 4IELA 1FG4A 2PN8A 2H0GA 4KCAA 1C72A 4HI7A 4LMVA 1FB6A 3A2VA 1DUGA 3MNGA 2H70A 3GTUB 2CX3A 1ABAA 2VCZA 4FH8A 4J57E 2H1GA 3US3A 5IO2A 3J7Yb 3VWUA 2HYXA 3EINA 3EE2A 2XHFA 1LJRA 2L5OA 2RUFA 4JU5A 4IKHA 5AIXA 5H5SA 1EGOA 2NTOA 1ST9A 2FWEA 2LNTA 2C0EA 1V40A 1TK5B 3GSSA 1XWAA 1B48A 4OFTA 2HZEB 4DSSB 3ZITA 3WT2A 1ZYQB 3P8WA 5CNWA 1W4VA 2GSRA 1PD21 3UEMA 1YZXA 2XPEA 1J0FA 4GQFA 3L78A 4X1UA 4WBRD 5HR2A 3IHQA 3F4RA 4IP6A 1GTBA 3CXGA 3GRXA 3HDCA 5DBQA 5HR3A 1SD9A 2GQLA 1EEMA 5ELAA 4KGIA 2A2SA 3CRTA 3TB2A 2YZHA 1TRWA 3UMAA 2DJ1A 1T8EB 3GN3A 1A2MA 5DALA 3QR6A 2M80A 1S3CA 3VWXA 3HJPA 5FHIA 1XOAA 3KP9A 1BEDA 3E3EA 1T7PB 2FA8A 1GTAA 2R4VA 3VK9A 3F3QA 4I2UA 2M46A 3CMIA 3MAKA 2PU9C 5DQSA 5B6MA 3GX8A 1NM3A 5DQYA 1EV9A 3WGEA 2EIOA 2OACA 1SK2A 4MDCA 5HFKA 2XC2A 3DYRA 1GSEA 4BPYA 2E0QA 4YAVA 1SYXA 4LMWA 3FEUA 2BJXA 3DXBA 3QCPA 1J08A 1JHBA 2OE0A 4OFNA 4ZB6A 3TKQA 4BL7A 1SKRB 3HHVA 5B8BA 2H6YA 1YF1A 3EU3A 3FZAA 3KGKA 4EF0A 4JR4A 5H5RA 5AN1A 3M1GA 4YAPA 5DCHA 4IJ3A 3VWVA 3DRNA 2QGVA 3G7JA 5F05A 3HVVA 2VCTA 1F2EA 3TKSA 1MTCA 1Z5YE 4IQAA 4CW9A 4V2LA 6GSWA 1W89A 1SJ6A 5ELGA 1OE7A 4D73A 4POMA 4WBJA 1O81A 4F82A 3GV1A 4ZXGA 2JZSA 4BVYA 2MMZA 3GL5A 1XCCA 4IP1A 1K0MA 3IK9A 4TXOA 4K8MA 2RM5A 5GAPD 1BG5A 5KN2A 3CSHA 1I5GA 5KN3A 3A5WA 4WETA 2HRNA 2LRNA 1M0UA 4ECBA 4IN0A 5F07A 3LYKA 3O76A 3F4SA 1K3OA 4XS6A 3H93A 3ZRDA 3OR5A 4GQCA 3DD3A 4KX4A 1U87A 1F3AA 3A2XA 1YKAA 3GX0A 1JZOA 13GSA 3CTFA 2GQMA 4OD7A 1UA5A 3KCMA 1TU7A 2KP1A 2P5QA 2VM1A 1OKDA 2VCVA 2EIQA 4WR4A 1Q4JA 1TRVA 3GKNA 1XVWA 2X99A 3HVXA 2OKAA 1ON4A 2R2JA 4HU9A 2F8AA 4MLYA 3F6DA 2WZ9A 3M0FA 1QMVA 4XRDA 3SWLA 2KUCA 1OYJA 2OJLA 2DMMA 2V6OA 5G1LA 3TRQA 1SJZA 4Q5NA 1TTZA 2DMLA 3UL3A 3WYWA 5IPGA 4KE3A 2HSYA 5J9CA 2IIYA 3BBYA 1EOHA 1GRXA 3ZZXA 4BWSA 4O92A 1UVZA 1ZGNA 4TXVA 2MBSA 4EO3A 3TDGA 2V6KA 2F51A 5L71A 2B1LA 1R26A 2L57A 1GUHA 2J23A 1THOA 1DE1A 1OC9B 4OFMA 1QGVA 4PX1A 2E2GA 4V1Ag 2VL9A 5E59A 3C71A 2OA7A 2CX4A 4HS1A 5HFGA 3J7Yk 4KDYA 3QFAC 4GTUA 4ZILA 4KH7A 4I97A 1JLWA 4K0NA 1ZYEA 4EUYA 3GNJA 5CRGA 3IDVA 4IQ1A 1K0BA 1XWKA 2B7KA 1KNGA 2HXKA 4NHWA 1AXDA 1YY7A 16GSA 3UJ1A 1B9YC 1MD4A 1AIUA 4OCEA 2IWTA 2LRTA 2GSQA 2GSTA 2H75A 5IMZA 1V9WA 3UVHA 3MSZA 4IVFA 3O6TA 1R5PA 4JZQA 1ERUA 3HVSA 4MZCA 2GZYA 1YEPA 1BYEA 1OC8A 1F37A 4LL1B 2VL2A 4GCIA 2LV3A 2WFCA 4POLA 1ZL9A 1GTUA 1G7EA 1WOUA 1O7UA 5GZZB 3EMXA 3N5OA 3K8NA 4NHZA 1XOBA 3BOAA 4MZWA 4MJAA 3I43A 3HKRA 1EV4A 2YV7A 4AJ8A 4NV5A 4ZL8A 4F9ZA 2H0HA 1GUKA 3DGQA 5D93A 4X43A 2CQ9A 4QL7A 4V2NA 5ECLB 1ZMAA 1BX9A 4HU7A 2VCWA 4IGJA 3Q6OA 3U5RE 6GSTA 4BWQA 2O7KA 4N10A 2YWIA 2OE3A 1SENA 4NMUA 2DIYA 4OWYA 5F06A 1LU4A 1HNCA 2WGRA 1QXHA 1AC1A 3LQ7A 2P31A 1J9BA 1X5DA 2YNXA 2JACA 3LG6A 4TR0A 2GVPA 3IAM2 2L6CA 1TOFA 5J4UA 1M9AA 1A8YA 5FWGA 3WGDA 14GSA 1XW5A 3TKSC 3D4MA 2V41A 2DJJA 2WULA 5CO3A 4TR3A 5J41A 1TDIA 5D9WA 4WEYA 4PNGA 3FR9A 3QPMA 1KEBA 2CVKA 4XRAA 4G10A 5AIVA 4MPGA 1GNWA 3GKKA 1Y25A 3APOA 2CVDA 1U3AA 3KEBA 2LTKA 3WGXA 4ACSA 1PX7A 3LFLA 4ZBDA 4L5OA 5HR1A 3F0IA 3C1SA 4PXOA 1Y6EA 3ZFBA 1XBSA 3IXRA 4FYBA 2CAQA 3IBHA 4RI6A 1DBYA 1O8WA 3KP8A 5ECIB 5IIZA 3G7YA 1XWCA 2KP2A 1AAZA 4HJ2A 4ILFA 3UBKA 3TJJA 5FT3A 1YJ6A 3TCOA 1Z6NA 4GWRA 4ZL9A 4G19A 4JBBA 5KN1A 3HJOA 3LJRA 2AAWA 2FCHA 2RM6A 2B6MA 2IMDA 3ME7A 4H86A 4TR1A 2AUVA 3H1NA 3SBCA 5AGYA 1K0DA 2KOKA 3AY8A 3MWHA 1AUCA 2C4JA 2K8SA 3RHBA 2LRCA 3A2WA 1TKDB 3L4NA 4AGSA 2DC5A 2H71A 3QFBC 5CRDA 2VCXA 20GSA 4Q5QA 5F8BA 2MMOA 5ID2B 4FIWA 3GUSA 2N5FA 2LJAA 2DJ0A 3GKMA 5B6NA 2ZUPA 3KTLA 4I6XA 1EOGA 3EC3A 2PWJA 11GSA 1M2DA 1Z3EA 6GSUA 3LWAA 5EVOA 2Z9SA 2DLXA 2TRCP 2IMKA 2H1BA 1XW9A 3L0HA 5IOXA 3DWVA 3HCZA 2LS5A 4LLRA 18GSA 1T00A 2GTUA 2YJHA 4KA0A 1FAAA 3BJ5A 3G7IA 1OE8A 1FOVA 5IMAA 3KTBA 1XFLA 1B8XA 2GZZA 1WJKA 2JADA 2O87A 4IJIA 3C73A 2I81A 1UC7A 3QD9A 4J2FA 1NHOA 1X0RA 4WF5A 4NV2A 4AJ7A 4HZ4A 1A0RP 3VLNA 3HZ4A 2C3TA 5D9TA 2HE3A 5IO0A 5G30A 1PA3A 1QFNA 3ME8A 4L5LA 4YQMA 5IMFA 2IN3A 2JU5A 3TJBA 3L9UA 4MA9A 5DDLA 3FR3A 1HYUA 2FY6A 4RUVA 3KMOA 5JCUA 5DAKA 5B8AA 2N5AA 1WE0A 4BA7A 4KDXA 3FZ9A 2YN1A 5CREA 2EC4A 10GSA 4QL9A 3TKRA 2B3SA 3FRCA 3NIVA 1M7TA 2VAFA 2I1UA 4OCFA 5IMDA 1XW6A 4AJ6A 5KEJA 2DJ3A 2YP6A 1XXUA 3W8SA 4K7IA 2E7PA 3CSJA 5G5EA 2HZFA 4JEDA 1TXXA 4L8EA 2O89A 3KD0A 5A4VA 2TIRA 5IMCA 4PURA 2HT9A 4MF5A 3BCKA 2EIRA 1GP1A 3ED3A 2GT5A 2WCIA 5C00A 3UARA 1U3IA 3APQA 4F0CA 2K18A 2H76A 3GMFA 3QAGA 5DALB 5DJLA 3G9BA 4XS4A 2YZUA 1GTIA 2CV4A 2C1YA 3IR4A 2HRFA 2VIMA 2ALBA 3E0UA 2QSIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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