2I4AA

Crystal structure of thioredoxin from the acidophile acetobacter aceti
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
SEHTLAVSDSSFDQDVLKASGLVLVDFWAEWCGPCKMIGPALGEIGKEFAGKVTVAKVNIDDNPETPNAYQVRSIPTLMLVRDGKVIDKKVGALPKSQLKAWVESAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Atomic-resolution crystal structure of thioredoxin from the acidophilic bacterium Acetobacter aceti.
pubmed doi rcsb
molecule keywords thioredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Acetobacter aceti
total genus 33
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2i4aA00
1PRXA 4XS4A 3I43A 3APQA 1AC1A 2ON5A 5HR0A 1FHEA 4I8BA 1R5PA 3D5JA 3TJJA 3QCPA 1SK0A 5ID2A 4PGTA 3EURA 2HI7A 2EIOA 3Q6OA 4IQAA 1HD2A 2RIIA 2AHEA 1FG4A 1F2EA 1Y25A 4CDOA 3VWXA 2YV9A 3EU3A 2VL3A 3RAZA 1YDKA 3HHVA 3L9VA 4IJ3A 3TJFA 1GP1A 2I3YA 10GSA 3ZIJA 1O85A 1XFLA 1Q98A 3IXRA 2XBQA 5ECLB 2H72A 4BA7A 5ENUA 3UEMA 4AGSA 3HJOA 5KN0A 1X5EA 8GSSA 3QR6A 2CAIA 2RLIA 3UAPA 3BBYA 2YN1A 5ECQB 1TW9A 4IBPA 2MZCA 4CW9A 3WT1A 2C8UA 4E8EA 1XWAA 2IMIA 1MD4A 2YANA 3GRXA 5F8BA 2QGVA 2HSYA 3M9JA 1PA3A 4KDUA 1A0FA 19GSA 1G7OA 2B6MA 1SYRA 4H86A 3JCML 1SKWB 2OADA 3D4MA 3QD9A 3CTFA 2AYTA 3GSTA 3MAKA 4GWRA 4TVEA 2PGTA 2LNTA 1Z3EA 1YZXA 2IFQB 4ECJA 3RHCA 5H5SA 2GVPA 4XCSA 2DJ2A 5DDLA 2L4CA 4HJ2A 5INYA 3F6DA 2HRNA 3I9V2 2C0DA 1F9MA 3FZ4A 4NV5A 4QQ7A 2R6KA 4EVMA 2H74A 5HFKA 1WE0A 4N30A 1AAZA 1NHYA 13GSA 1U3AA 3WD6A 2PERA 1SYXA 1GTUA 2DC5A 2YZUA 3P7XA 1FW1A 4TXVA 4MF7A 3ISOA 2H0GA 2CX4A 3KXOA 1JZDA 4XS4B 4GSSA 4F9ZA 3IBHA 2F9SA 4NPBA 1XXUA 2NPBA 1JZOA 3GH6A 5G30A 3DKSA 4Q5QA 4FIWA 3FRCA 3ZL5A 1SK1A 3G7IA 4KH7A 1GSDA 2N5AA 2G2QA 4MZBA 1XBSA 1PQNA 3ZVJD 2L6DA 6GSWA 2NVLA 1K0MA 4I2UA 5L71A 4QL7A 4AF2A 1BX9A 2JZRA 1ZCPA 5F07A 1N8JA 2OACA 4MK3A 5CRGA 5IMVA 5J4UA 5ECNB 1A8YA 2CVKA 2E0QA 1M2AA 4MPFA 4CHSA 2DIYA 3M9KA 5DQYA 5ABRA 2LRTA 5D9WA 2L6CA 1FO5A 3UARA 1K0BA 4YAPA 2RM5A 3ZFLA 1ILOA 2P5QA 4FYCA 4GQCA 3QAGA 2JACA 3M8NA 5ECKB 1VF1A 2VIMA 3HKRA 1BJXA 1GSQA 1SJ6A 5HR2A 2H71A 1R4WA 2IMDA 3FR3A 1GRXA 3QFBC 4IELA 1SL2B 4BWQA 3KP9A 3ZITA 2H66A 2LNSA 4HJMA 1SL1B 3V1WA 1OVNA 1TJDA 2FCHA 2GQKA 3D22A 3HYPA 3L4NA 5FWGA 5CYYA 4D73A 1K0NA 20GSA 3VFIA 1GUKA 1GTBA 2KP1A 3H1NA 3PGTA 3DWVA 5G1LA 2H0HA 1I9DA 2WJUA 2GSTA 5DCHA 1AQVA 2LV3A 4MABA 4TRXA 2AUVA 4PNFA 4L5OA 4LA1A 4ZB9A 5J3RA 1UC7A 5D93A 3DVXA 4OO5A 5C04A 5DBQA 1T4ZA 2B5EA 6GSUA 1ERVA 3NIVA 4MH2A 1FB6A 3P90A 4L5LA 1G6YA 3W8SA 5DVBA 2O85A 1GTAA 2H6YA 2IPAA 2M46A 4HOJA 1G6WA 2MBTA 5KEJA 2FWHA 3FR6A 5ECIB 4EF0A 2ZUPA 2FWEA 1V57A 2IWTA 3H93A 6GSSA 2P5RA 1AQWA 2A4VA 1Z9HA 1EV9A 5ECMB 4TOPA 2J23A 4ZIJA 3F9UA 4MJBA 3QAWA 5A5KA 4EO3A 1T1VA 4LL4B 5LNKe 4OCEA 4F82A 2YV7A 3LWAA 1AUCA 1YKAA 4LLRA 2E7PA 4XIHA 2B3SA 5D9XA 2CZ2A 3ZTLA 4XS1A 3KH7A 3EINA 4HU9A 2VCZA 2PUKC 1WWJA 1M7TA 1QGVA 4ZB8A 1A8LA 5B6MA 1F3BA 2PWJA 4IVFA 1XCCA 3HJPA 4NV2A 4K9ZA 18GSA 4POBA 5GZZB 3DXBA 4HQZA 1OE8A 4HI7A 4F03A 2H1AA 1SL0B 3TJGA 3G9BA 2HLSA 5E59A 3L0HA 1FAAA 3DD3A 1EGRA 4D73B 2BTOT 3TRXA 2DJJA 3E9JB 1R26A 2FLSA 4K1FA 4BL7A 1B4QA 2J9HA 1KBNA 1GLQA 3GSSA 3UBLA 1JLWA 3FHKA 1S3DA 2FD3A 2FGXA 1ACVA 3W8JA 1EWXA 5C00A 4GSTA 3ZMLA 1B48A 2ZCTA 1T4YA 1XIYA 4WBRD 5JCWA 4ID0A 3C71A 4NHWA 1GTIA 4TKYA 4V2MA 2B5XA 1C72A 4N11A 1ABAA 4WXTA 4KX4A 2OE1A 4AJ7A 4HQSA 1GH2A 2TRCP 3TB2A 5CREA 3CTGA 1JZRA 4KGIA 3ME8A 3FW2A 2EIRA 2TRXA 1H4OA 2K18A 3EC3A 3WGXA 5D73A 1QMVA 2PU9C 1ERWA 3CBUA 2VCVA 1K0CA 2ON7A 3GN3A 3TKPA 2E2MA 1E6BA 4YAVA 1Z5YE 3D6IA 1URMA 3LSZA 1S3AA 4WEYA 2YJ7A 1GL8A 4OO4A 4PURA 1QK8A 5JWOB 3LGCA 4KAEA 1OYJA 4Z7XA 3BD2A 3TCOA 2OBIA 3KP8A 3KMNA 3GKMA 3IPZA 4MJCA 2VD0A 2XPDA 2N5BA 3EU4A 3UVHA 3CRUA 2KUCA 1TI3A 1BEDA 3HVXA 1THXA 1VF3A 14GSA 3GL5A 1W4VA 3TRPA 1SJZA 3IHQA 2CVDA 1OKDA 2PVQA 3H4KA 2GDRA 2O87A 3KH9A 2R5GA 3F4TA 4I5QA 3BJ5A 5G5EA 4ZL9A 1T00A 2V41A 2X99A 2JSZA 2B1LA 4IQ1A 2H76A 3MSZA 1X0RA 3NZNA 4POKA 4ISDA 1THOA 5F0GA 5E4WA 4JE1A 3KZQA 1XWBA 1SK2A 2DJ0A 4YH2A 1M2BA 1M2DA 1SKSB 2DMMA 5IO2A 2NDOA 2AAWA 1M9BA 1G0TA 3IC4A 2GT5A 3CSHA 5IM9A 4ILFA 4MZWA 3D0ZA 2WULA 5A4UA 3FK8A 2WZ9A 2FY6A 2EC4A 4K0NA 3EE2A 2LJKA 1EZKA 2FA8A 2R4VA 1WRYA 1A2LA 2YP6A 2Z9SA 6GSXA 1CQGA 1NM3A 1H75A 1WOUA 4N10A 1U6TA 3UJ1A 1RQMA 1XWKA 5F06A 1KNGA 1V98A 2IIYA 1EGOA 4WKWA 4YQUA 3IR4A 3ZZXA 2GZYA 2H0IA 1U3IA 3DVWA 4GLTA 1WMJA 2GGTA 4GCIA 4PNGA 2FWGA 3UBKA 2PVOC 1OE7A 4F0BA 1YKCA 4KNDA 2FA4A 3KGKA 4GSNA 4NWYA 4HDEA 2GS3A 3TJBA 1XW6A 3GA4A 1K0OA 1HQOA 4DSRA 1MDJA 2VLTA 2R37A 2I9HA 2YWMA 5DALA 1TI1A 4IHUA 3RPNA 2JSYA 4F2IA 3CSIA 1SD9A 1Q4JA 3KD0A 5CRHA 5DJMA 2XC2A 2GSQA 3HZ4A 4FYUA 2VL9A 4TN8A 2I81A 3KM6A 4POLA 1PSQA 5DCGA 2GZZA 2LSTA 1USBA 2G0FA 4ACSA 3C1SA 4GTUA 3ZYWA 4BPYA 1RW1A 5CAXA 1FOVA 1DSBA 1EEMA 4JBBA 1B8XA 1XVWA 2LJAA 3LXTA 4G2EA 2R3XA 1XOBA 3IDVA 2HRFA 4I97A 5EY6A 2H8LA 3UMAA 2ZNMA 1KEBA 2O7KA 3F3QA 2B5YA 2VL2C 1U88A 3CXGA 1O7UA 5D8IA 1TRVA 2LJRA 4XS6A 3FZAA 4KSMA 22GSA 4ULXA 3UOMA 1F3AA 1GSYA 4ML6A 4YQVA 3SBCA 3ZREA 3ZLPA 2DSAA 4LMWA 1SU9A 1V40A 4OD7A 1HNAA 1W89A 1YY7A 4FYBA 3VWUA 2LRNA 1ST9A 3LYKA 2RUEA 5AIVA 4HZ2A 4WR5A 2B7KA 4PQ1A 4MMMA 1VGLA 3GIXA 5AIXA 1X5DA 4AJ8A 3D21A 1YEXA 3O76A 1AW9A 2DJ3A 2M80A 4BWSA 2DLXA 2C0FA 2LUSA 2JU5A 4BVXA 5HR3A 3MWHA 3GKKA 3FEUA 5CP1A 5FT3A 3ERFA 1RK4A 1ERUA 3L9SA 2HZFA 2LS5A 3TKSC 1FVJA 4PQHA 5DALB 4QL9A 2HNLA 2BMXA 3IK7A 3VURA 4KW6A 5B8BA 2V6KA 3RHBA 4TR1B 3L78A 4RQXA 2IMKA 3IAS2 5G5FA 3GHAA 2DJKA 3US3A 4IGJA 1T3BA 2V2GA 1JFUA 4POMA 3A2XA 3LG6A 4HUAA 1V58A 4E8HA 3F6FA 3K8NA 3GX0A 3IOSA 4XRDA 2YCDA 5EL8A 4V2LA 5CO3A 5AN1A 4FH8A 3OR5A 3QDNA 3KTBA 2CT6A 4ML1A 4DSSA 2FWFA 3GX8A 3N9JA 1E2YA 3DYRA 4ZL7A 3WT2A 1PMTA 2C3QA 3C8EA 3EYTA 5HQPA 5KN1A 5IO0A 1PD21 1XVQA 5ECRB 5CRWA 4OFNA 4BVYA 4PXOA 3VK9A 2GQMA 3TKSE 2MBSA 2LTKA 3L9UA 4G10A 2CV4A 2HYXA 4EL1A 2PBJA 2K8SA 1MEKA 1PKWA 1V2AA 3HJMA 2H01A 5IPHA 3F3RA 1X9WB 3M1GA 4OFTA 4WETA 3GKXA 2YOIA 3RPPA 2H19A 3BCIA 1NSWA 5DQSA 1J0FA 2RUFA 2MMZA 1VF4A 3GTUA 2WDUA 2JZTA 4K7NA 1TP9A 4KE3A 1EV4A 1ZGNA 2QSIA 4JRRA 2L5LA 4MJEA 1IYHA 4WF4A 2OJLA 2ALBA 4ZXGA 2L4QA 1UA5A 4EDYA 2VCXA 3DMLA 4YQMA 4G19A 1A23A 5ECOB 5EVOA 1OC3A 2TIRA 2HT9A 2GSRA 4ECBA 1TU7A 1X5CA 1PL1A 4MH3A 1HYUA 3GV1A 2KHPA 2VLUA 3N5OA 1SKRB 2AJQB 2XHFA 1DE1A 1J08A 1QUWA 2KP2A 1ZZYA 4RQRA 2B7JA 4K7IA 3Q74A 1TDIA 3UIWA 2WRTA 3HD5A 1A2MA 1PX6A 3O6TA 1T7PB 2LQQA 4J56E 4L8EA 3TKRA 2B1KA 3W6GA 4V1Ag 4AJ6A 1F37A 2WS2A 4JR4A 4OFMA 5DAKB 5FHIA 3GL3A 2VAFA 4DSSB 1AIUA 1QFNA 3APSA 1PGTA 2C80A 3VWWA 3DRNA 5HFGA 3A2WA 2VCTA 2WCIA 4Q5NA 5COHA 5EPFA 3HVVA 2CQ9A 3ED3A 1IYIA 5ELGA 1Z6NA 4EC0A 2X8HA 4O32A 1OC8A 2VLVA 4KSOA 1YQ1A 3FZ5A 1BAYA 3VLNA 1J9BA 1K3YA 2YZHA 4TXOB 4KDXA 3DEXA 4ZBBA 5H5QA 3H8QA 2ES7A 2F8FA 1YF0A 2PMTA 1M0UA 2JL4A 2DIZA 1S3CA 2HE3A 3UVTA 1B9XC 3GTUB 2XPEA 1OC9A 2CA8A 4MF5A 2VO4A 4TR0A 1JLVA 5IOWA 1GNEA 4P3YB 4O7HA 4MJAA 2GLRA 2H1BA 1TXXA 3J7Yb 5D9VA 3F63A 1QQ2A 1N2AA 5GSTA 2YWOA 1JHBA 2GSSA 2GZPA 3GURA 2C1YA 1BYEA 1M9AA 3C73A 3HDCA 3TGZA 2GQLA 1GSEA 5J5NA 4HU7A 1TOFA 3GYKA 2K9FA 2AB6A 1OAZA 1ON4A 3M3MA 5F05A 1FB0A 2P0GA 1GSSA 4EKZA 3CMIA 3F4RA 1X9MB 3F0IA 4V2NA 4N0ZA 5HR1A 1K0DA 3BCKA 2DMLA 4NAXA 3NOFA 2YPMA 3MDKA 1TRSA 4TR3A 4Q5FA 1PN9A 4ZBDA 3VPQA 2NBSA 3Q18A 3F8UA 1TTZA 5B7CA 1GSFA 3KCMA 3DGQA 2L57A 1XOAA 4PQIA 2X8GA 3GFKA 2A2SA 1GULA 2VM2A 1Z6MA 4LMVA 3QAVA 4JZQA 2O8VB 4ECIA 4EDZA 3EMPA 1K0AA 4MZCA 2L5OA 3RBTA 4IS0A 1YJ6A 2C0EA 4NMUA 4KB3A 4Q5RA 3TDGA 1VRSD 2VCQA 1HNBA 3HXSA 1XZOA 1ZOFA 2CZ3A 2H6ZA 1SENA 3QPMA 2JZSA 1YEPA 4XRAA 3KMOA 1XPVA 5IQYA 1UN2A 5LCZA 1SD8A 1AQXA 5AISA 5IIZA 4J57E 2LRCA 2QKEA 1OC9B 3APOA 2CVBA 4J2FA 9GSSA 4ZL8A 5IMDA 11GSA 2DBCA 4KCEA 4L0WA 3D4TA 1MDKA 3EMXA 3LORA 4TR1A 5ELAA 4ZB6A 3QOUA 4DEJA 3GH9A 2R2JA 5D96A 4XHMA 1R7HA 5JWRB 4G9HA 2IN3A 2A2RA 2D2ZA 1KTEA 4V1Ap 5G1KA 4IW9A 3BOAA 1WP0A 3I6AA 2OE3A 5IPGA 4IN0A 3LEFA 2VD1A 2IMEA 3CYNA 1QXHA 3CRTA 1XWGA 1XW9A 1MDIA 1EP7A 2HZEA 5IMFA 3P2AA 2FHEA 4WF5A 2OKAA 2F51A 1PX7A 3PINA 4K7OA 3QFAC 4ECCA 3QMXA 1A2JA 5ID2B 1EOHA 1MTCA 1JZWA 4GXZA 5IMAA 2F8AA 1XW5A 4K2DA 2OA7A 4N0VA 3IRAA 3SWLA 3C7MA 4IKHA 2FUG2 5LD0A 3TJKA 1BQ7A 1GUHA 1TK5B 1GNWA 1YF1A 2VCWA 1GWCA 4X43A 2F3MA 4IP1A 3ME7A 5ECHB 4MF6A 1EOGA 5G31A 3PR8A 4MPGA 1VF2A 1B4PA 5KN3A 3TOUA 3P8WA 5ECSA 2VL2A 3J7Yk 2JADA 4RI7A 1A0RP 1WPIA 2VOCA 2HXKA 2OE0A 4OCFA 1DUGA 2GTUA 2YNXA 2DJ1A 2LQOA 5IOXA 4K8MA 2H75A 2C0GA 4RI6A 1TRUA 1TRWA 3VPTA 1U87A 7GSSA 2WB9A 3HY2A 4JU5A 2OBKA 3VI5A 1O73A 3GKNA 3F4SA 1LU4A 2CAQA 1Y6EA 2YWIA 3H79A 5DJLA 4EXJA 3KEBA 5CNWA 3KIJA 3FZ9A 5H5RA 2PPTA 4JR6A 5KN2A 3ZIVA 3WGDA 2H30A 2KLXA 4NHZA 4MLYA 3TKSA 5DAKA 3GMFA 2HZEB 1O81A 3HZ8A 2EIQA 5JCUA 4RUVA 4LL1B 4KA0A 1DE2A 2E2GA 1DBYA 3LQ7A 2C3NA 1MD3A 2I1UA 2X64A 4O5RA 2RM6A 4OMVA 4L0UA 3ZVJA 1X9SB 3I69A 2I4AA 3TRQA 4KCAA 1TK0B 2WGRA 4MCUA 1T8EB 3E0UA 17GSA 1FVKA 1ZMAA 4HZ4A 1OKTA 2PN8A 3EWLA 4NXIA 1ZL9A 4ZILA 3IA1A 3TOTA 1WIKA 4TXOA 4I2TA 5J9BA 4OWYA 2BJXA 2KOKA 1LBKA 5D9TA 1GSUA 2YJHA 3U6VA 1Z7PA 1O8XA 5AGYA 3UL3A 2GT6A 6GSTA 3IE3A 3O3TA 6GSVA 1BG5A 1HNCA 3G7YA 4F0CA 4WR4A 3WYWA 2XBIA 4WBJA 4MA9A 3M0FA 2AV4A 3CSJA 3U5RE 2WFCA 3ZMKA 2C4JA 3E3EA 5IMCA 4X0XA 2V32A 2H1GA 1EEJA 2IJYA 1ZYQB 5A4VA 5J41A 4MDCA 2MMNA 3HCZA 1Z7RA 2IMFA 12GSA 3IAM2 1GUMA 4HEA2 2K6VA 3ERWA 3LYPA 4HS1A 3KJYA 4XTSA 3IV4A 2M72A 3S9FA 1NHOA 3KTLA 3VWVA 5GAND 3WGEA 4KDYA 3GUSA 1PKZA 1I5GA 3MNGA 4DVCA 6GSYA 1ERTA 2O89A 3LFLA 1AXDA 4O92A 2HSHA 3A2VA 4GF0A 2VM1A 1ML6A 3HA9A 2K8VA 4TW5A 16GSA 4X1UA 2V6OA 1CQHA 2MMOA 4KUNA 2MYGA 3Q19A 2NTOA 5B6NA 5A4WA 4EE0A 3EVIA 4EUYA 1R5AA 4GRFA 3DIEA 1SJIA 4JEDA 3LJRA 5J9CA 2H70A 3FKFA 3HVSA 3TKQA 5G2ZA 2MMAA 2LEGA 1LJRA 1XWCA 3ZFBA 1UVZA 1K3LA 4K0GA 2QC7A 1V9WA 2VUPA 2H6XA 1ZYEA 3FR9A 4PUFC 1TK8B 1PL2A 2N5FA 3C1RA 5B8AA 2YWNA 4TR4A 5GAPD 3ERGA 4PUAA 1G7EA 5ECPB 3TUEA 2V1MA 2LKUA 3FY7A 4PX1A 1O6JA 3IK9A 4DSQA 1K3OA 2H1DA 5JWQB 4I6XA 5IMZA 2CX3A 2REMA 3G7JA 4FO5A 4ZBAA 3RDWA 2C3TA 2IFQA 3A3TA 1WJKA 3ZRDA 3FYGA 5HFIA 4MP4A 1F6MC 1B9YC 1EP8A 3AY8A 1TU8A 1M99A 1TKDB 3LXZA 1O8WA 3R2QA 2HFDA 2X8CA 2FNOA 3PH9A 2IL3A 4K6XA 4IJIA 3GNJA 1GLPA 3VI7A 3A5WA 4IP6A 5JCGA 1A24A 2L59A 1NW2A 5CRDA 5GSSA 2H73A 2P31A 4GQFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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