2IPAA

Solution structure of trx-arsc complex
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
104
structure length
104
Chain Sequence
MAIVKATDQSFSAETSEGVVLADFWAPWCGPSKMIAPVLEELDQEMGDKLKIVKIDVDENQETAGKYGVMSIPTLLVLKDGEVVETSVGFKPKEALQELVNKHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conformational fluctuations coupled to the thiol-disulfide transfer between thioredoxin and arsenate reductase in Bacillus subtilis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport/oxidoreductase
source organism Bacillus subtilis
total genus 31
structure length 104
sequence length 104
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ipaA00
5KN2A 4F9ZA 1SYRA 3NOFA 1Y6EA 4YQVA 1V2AA 3CYNA 4JRRA 5CAXA 5F07A 5J3RA 1GTIA 4MJAA 2H8LA 3F6DA 5IMVA 3QAWA 2HLSA 2GZPA 5H5QA 2R6KA 3A3TA 2FGXA 1MD3A 1T8EB 1THOA 5DCGA 1M9BA 2IIYA 2YV9A 1PL2A 1K0DA 1VRSD 4G2EA 1USBA 3A2VA 1SYXA 10GSA 2FCHA 5HFKA 6GSYA 5IIZA 2GDRA 1B48A 4XRAA 1IYHA 3DD3A 3LG6A 3TRXA 4J2FA 4ML6A 4WF5A 4N10A 2O87A 1KNGA 3MNGA 1GTAA 2H6YA 3IBHA 5IMAA 3LGCA 3VPQA 2H71A 2WULA 3K8NA 5D93A 18GSA 2PERA 2VL2C 2YZUA 1PA3A 22GSA 6GSXA 3TKSA 3TOTA 4MZBA 3F9UA 2RIIA 5LCZA 1AIUA 3KTLA 5DJMA 3CXGA 1OVNA 4EDZA 1Z6MA 3CSIA 5ECLB 3DMLA 3VWVA 1LU4A 4F2IA 2C8UA 2ON5A 3TKQA 2CX3A 1OC3A 2O85A 4F0BA 6GSWA 2B7KA 1GSEA 3EURA 3LYKA 5FT3A 1O73A 3W6GA 3P90A 3ZFLA 4ULXA 2VIMA 1EOGA 2H1DA 2YZHA 2GQKA 4IBPA 5DALA 4MJCA 1O8WA 1FAAA 4L0WA 1GULA 4QL7A 4MCUA 5JWRB 3WYWA 2LJAA 4HJ2A 3RDWA 2DJJA 5DCHA 4MF5A 4XRDA 1NSWA 4ZXGA 4NXIA 2LNTA 3RPPA 3AY8A 3N9JA 1AC1A 4KSMA 2OE3A 1IYIA 1JLWA 2FD3A 3PH9A 4HOJA 4ECIA 3HY2A 3KP9A 4GF0A 4QL9A 3LJRA 3BD2A 4GSNA 5DQSA 3F6FA 3HDCA 2PVQA 4MH3A 4TR3A 2C0GA 4TR0A 4MLYA 5ECSA 5CRHA 2X8CA 3GHAA 1KTEA 1YF0A 3GSTA 2G2QA 1QMVA 1Q4JA 1SD8A 4KB3A 3EYTA 4GWRA 1Z5YE 4EF0A 4IQAA 1GSUA 4NPBA 4HI7A 4K2DA 4L8EA 2V41A 1HQOA 16GSA 4L5LA 3ZZXA 1F3AA 1QGVA 1XWKA 1TU7A 1JHBA 3NIVA 4IW9A 4O7HA 1WMJA 3GNJA 1XPVA 2I81A 3KMOA 5C00A 2LUSA 4JR6A 2O8VB 2OE1A 4V2NA 1TKDB 3LXZA 1R4WA 3PR8A 2YOIA 1EOHA 1AQXA 4JU5A 3HCZA 1GSFA 2XC2A 4QQ7A 4EL1A 4JE1A 4GTUA 3VI5A 1JZOA 2HI7A 1EZKA 2PUKC 1M2BA 5DBQA 3DVXA 2IMKA 3CMIA 1FVJA 3C1RA 3TJFA 5J5NA 1SKSB 4YQMA 1PX7A 3KD0A 1FO5A 4ZBAA 3G7YA 3UVTA 2V6KA 4ECCA 2DJKA 2VCXA 4TW5A 1VF3A 2PN8A 3QCPA 1V98A 2N5FA 3ERGA 3QPMA 2MBTA 3GTUA 4RQXA 4EUYA 5CYYA 2OE0A 1W4VA 3M1GA 4GLTA 3N5OA 5CP1A 2AUVA 3EMPA 1TI1A 4XIHA 5JCUA 5IPGA 3I6AA 1TU8A 1WWJA 4FYBA 1YEPA 1AAZA 3UVHA 3RBTA 3EVIA 4G9HA 3J7Yb 4N30A 4PURA 2NVLA 4TXOA 1A8LA 2YPMA 3HVVA 3FK8A 3MWHA 14GSA 3G7IA 2PGTA 4K7OA 3FZ4A 2OADA 2WGRA 2CQ9A 2WDUA 4OFTA 3UL3A 3P2AA 4KGIA 3L9VA 5JCWA 1VF1A 3C73A 1TRVA 2EIOA 1ACVA 2FWHA 2IWTA 3ZMKA 1NM3A 5IO0A 1ZGNA 5D9TA 4EE0A 1XWBA 3TRQA 4AJ8A 1ZZYA 11GSA 3RPNA 2VCZA 5G31A 6GSSA 2YWNA 5EVOA 2K9FA 3LORA 3H8QA 1ILOA 2WS2A 3M0FA 5AIVA 2F51A 1ZCPA 3CRTA 2V6OA 2TIRA 3UEMA 4OMVA 3TDGA 2CAIA 3A2XA 2I9HA 3EU4A 5IPHA 4D73B 3F63A 3ZL5A 1FB6A 3HVSA 1R26A 1GNEA 4IJIA 2B1LA 4KW6A 3L9UA 4BVYA 5B8AA 1YDKA 2C0DA 3ZVJD 2E0QA 1AUCA 1XOBA 5F0GA 4IP6A 5B6NA 1O6JA 1V57A 2K8VA 2L57A 1A2MA 3GL3A 4TOPA 2GQMA 2X64A 3BOAA 4YH2A 2VCWA 4FO5A 1TXXA 4I8BA 1A0RP 3TJBA 2EIRA 3VURA 1T4YA 4TR4A 4WETA 5DDLA 2DJ0A 3VI7A 5IQYA 1DUGA 3F4RA 1S3DA 3R2QA 5D8IA 2C3NA 4KDYA 1SJIA 2N5AA 4ZB6A 2H66A 4F03A 4RI7A 2H6ZA 2VOCA 2MZCA 2RM5A 4BWSA 1ZMAA 2L4CA 4NWYA 1Z3EA 2X99A 4G10A 3ZIVA 4YQUA 5A4UA 3MSZA 4GXZA 1JFUA 2HSYA 5EL8A 1WE0A 4LA1A 3LYPA 1PD21 2GZYA 5ECOB 5H5SA 2D2ZA 5GSTA 12GSA 2FA4A 1R5AA 3FYGA 4K8MA 2N5BA 3E9JB 3MAKA 1FB0A 1O7UA 2IMIA 1ZYQB 3D22A 2ZNMA 3WT1A 2RUEA 5G1LA 1ON4A 1TK0B 1XIYA 2JACA 4LL1B 1WIKA 4HZ2A 1TDIA 4IQ1A 4PUAA 1X9SB 5DALB 4WXTA 4XCSA 3GURA 4MPGA 4O5RA 3F0IA 2AV4A 4HQZA 1QQ2A 4I5QA 3OR5A 1G7EA 4KX4A 1S3CA 3TB2A 2GLRA 4KDXA 5ELAA 4LL4B 2PBJA 3F3QA 3IRAA 3KCMA 3DVWA 5LD0A 2OA7A 2PWJA 2GQLA 1SK0A 4MDCA 2GT6A 1JZDA 2HXKA 3JCML 4K0GA 3GA4A 1Q98A 3S9FA 4EVMA 3EU3A 1MDIA 4GQCA 2LQOA 2VCQA 2AYTA 2WJUA 1U88A 3DXBA 2YWMA 1OC8A 2I4AA 4IP1A 3ZMLA 1GUKA 4YAPA 1B9YC 5IMFA 6GSUA 1TK5B 4KH7A 4IS0A 1SJ6A 3EINA 4EXJA 4V1Ag 1O81A 2REMA 4XS1A 1M2DA 3FRCA 2F8FA 2LS5A 4KAEA 3GKNA 4JBBA 3ISOA 3A2WA 3M8NA 5ECRB 2VD1A 4EC0A 4XS6A 3TCOA 2HE3A 1F2EA 5IMZA 1X5EA 5CO3A 4XS4A 2DJ2A 2O89A 3FY7A 1YF1A 1TP9A 1K3LA 5DAKA 3L78A 2ON7A 1V40A 4NMUA 3ZFBA 3M3MA 3TJGA 2IPAA 5ECHB 1X9WB 2M46A 5JWOB 1FVKA 2QSIA 3KM6A 3QAVA 2H01A 5F06A 2NTOA 3TGZA 1N2AA 2RLIA 3H79A 1ERVA 2H19A 1ERWA 4WBJA 3GTUB 2AHEA 4FIWA 1EWXA 4AF2A 2EC4A 4HDEA 4V2MA 1U87A 1J0FA 5J9CA 3F4TA 2I1UA 2LJRA 2Z9SA 2MMOA 4IHUA 3WD6A 3UMAA 2YV7A 1ABAA 2R37A 3GYKA 2EIQA 3Q6OA 2G0FA 4POKA 4OO5A 3IE3A 4ZL9A 1CQGA 1OC9A 2JSZA 3FR9A 5DQYA 4I97A 3QD9A 1PSQA 1K0NA 2PMTA 1T4ZA 4ZBBA 4TXVA 4TXOB 3WGXA 3GUSA 3O76A 2JU5A 2NDOA 1T3BA 2V32A 3KEBA 3GKXA 1WPIA 2C0EA 3QOUA 2GSRA 1BYEA 1K0BA 4BL7A 4F0CA 2C3TA 2IMDA 5KN3A 2LKUA 4IKHA 5G30A 4CDOA 4RI6A 4ZIJA 2WFCA 1CQHA 1GLQA 1YEXA 3VFIA 3UARA 1SL1B 4BPYA 2FY6A 3C71A 1GNWA 2H76A 4OO4A 3WT2A 3KGKA 1TRUA 4Q5RA 2VM2A 4IJ3A 3TJJA 3FZ9A 9GSSA 1OE8A 2OKAA 1TI3A 1ERUA 2L6CA 5F05A 3EMXA 1MTCA 3APOA 1GLPA 3QAGA 2CAQA 4MH2A 1THXA 2IMEA 2LNSA 3LEFA 1XZOA 5KN0A 2VO4A 3WGEA 5INYA 4PXOA 2LV3A 5IOWA 3ZIJA 4TN8A 2C80A 4ILFA 2YJ7A 4HZ4A 2YN1A 2K18A 3NZNA 4OD7A 2R4VA 1B4PA 2L5OA 4PGTA 5IO2A 2FLSA 4IVFA 2VL3A 1EP8A 3RHBA 1ML6A 1BX9A 2H1GA 4N11A 3U5RE 4AGSA 4LMVA 4MABA 2RUFA 3ZRDA 1UC7A 4KCEA 3E0UA 5G5FA 3HHVA 2YWOA 5G2ZA 2GGTA 3GN3A 3PINA 3ZLPA 3RHCA 2JL4A 2RM6A 4AJ7A 3CSJA 4CHSA 5AN1A 4K6XA 3HJPA 3Q18A 1XOAA 1EP7A 2ALBA 2H0GA 3FZAA 4MA9A 8GSSA 1FG4A 2BMXA 3DGQA 4YAVA 2IN3A 2JZRA 2HRNA 2P5QA 4MZWA 5C04A 4K7IA 4POBA 1X5CA 1O8XA 4Q5QA 3WGDA 19GSA 4MF7A 4MMMA 1DBYA 1WRYA 2PU9C 13GSA 2LRCA 1XCCA 3TOUA 4ZL8A 2M80A 3GX0A 1OKDA 1F9MA 1Z7PA 4LLRA 3ME7A 4PQ1A 5HR1A 2VL2A 1PRXA 2L6DA 4ZBDA 4JR4A 3VK9A 2WCIA 1BEDA 3GV1A 4MPFA 2H75A 3GSSA 2FUG2 2O7KA 3ZTLA 2IMFA 3GMFA 3TJKA 2GT5A 3BCIA 3FR6A 2DBCA 2VCVA 4X1UA 1GH2A 4ECJA 2QKEA 1QFNA 2E2MA 3TKSC 2LEGA 2H72A 2K8SA 2IJYA 5FHIA 1MDKA 3TKPA 1K0AA 4G19A 5D73A 2H6XA 2B5XA 3BJ5A 2YWIA 3GL5A 4MJEA 4PQIA 1ST9A 4XHMA 3L0HA 2GSQA 5G5EA 2AJQB 1XWCA 4I6XA 2E2GA 5ECQB 3APQA 2VLVA 4ACSA 2H0IA 1VF2A 3F4SA 3QR6A 3QFAC 2I3YA 1YZXA 2VUPA 1GWCA 3DRNA 1OAZA 3IPZA 2L5LA 2NBSA 4TRXA 2ZCTA 1SK2A 4K1FA 1K0CA 2H74A 4IGJA 2F3MA 3L9SA 3HD5A 3C1SA 3VWUA 3D4MA 2V2GA 5J4UA 3SWLA 3KMNA 5ID2A 3LXTA 3ERWA 4X0XA 4KA0A 5A5KA 3KP8A 3I43A 4O32A 1WJKA 3UAPA 2PVOC 1HNAA 2R2JA 4ECBA 1OKTA 1X0RA 4MK3A 3HVXA 3CRUA 4WR4A 3GRXA 2OACA 1T1VA 1TOFA 4KDUA 4XS4B 3IK7A 1JLVA 2K6VA 4RUVA 3P7XA 4KE3A 5DAKB 1XW5A 1HD2A 5DJLA 2DIYA 3EC3A 3M9JA 1KEBA 1U3IA 4WKWA 1PGTA 2MYGA 3EWLA 5D96A 2FWFA 2J9HA 5CRWA 4NV5A 5AISA 4HU9A 5H5RA 2GSSA 4PNFA 17GSA 3TKRA 2L59A 1XW6A 1TRSA 4BVXA 5E4WA 2LRTA 2HNLA 1T00A 2F9SA 4OFNA 4PQHA 4MJBA 4BWQA 5GAPD 2BTOT 1B9XC 2B5YA 1DSBA 2IL3A 2J23A 3VLNA 1J9BA 3O6TA 3H1NA 5A4WA 1GL8A 3LWAA 2HFDA 1C72A 1R7HA 1OC9B 3C7MA 1W89A 4LMWA 3FR3A 1GTUA 4V2LA 4ZB8A 1HNCA 2KUCA 5HR3A 4K9ZA 2H1AA 2DIZA 4JZQA 5IOXA 5AIXA 1BAYA 1EV9A 1AQVA 2B5EA 5EY6A 2VL9A 4TKYA 2B6MA 1G6YA 2DLXA 1QK8A 4H86A 4L0UA 2YCDA 4RQRA 1AW9A 3SBCA 4DSSA 5COHA 3W8JA 1Z6NA 4K0NA 4BA7A 3D4TA 2OBIA 3FEUA 2X8GA 3IHQA 4GQFA 1R5PA 2DMMA 4F82A 1M99A 1I5GA 3A5WA 5ECNB 2C0FA 3TKSE 2DC5A 2LSTA 4ZL7A 1PMTA 5CRGA 3QMXA 4J57E 1PN9A 3I9V2 2FA8A 4OWYA 3KJYA 4J56E 1U6TA 1OYJA 4MZCA 4DSRA 3ME8A 1GUHA 1ZL9A 5HFIA 3FZ5A 4ID0A 4WR5A 1A23A 2HZEA 1M2AA 3O3TA 5LNKe 2ES7A 3P8WA 2IFQA 2ZUPA 1JZWA 2H30A 4IN0A 3DYRA 3CSHA 1GRXA 5HFGA 2WRTA 5ABRA 3TRPA 5ECMB 2YJHA 3IV4A 3CBUA 4FYUA 4EKZA 5J9BA 1GUMA 2JZTA 4P3YB 1SENA 2OJLA 4AJ6A 3UBLA 5KEJA 4GCIA 2R3XA 5D9WA 2P5RA 1HNBA 2C3QA 1XVQA 2XHFA 1LJRA 2X8HA 3J7Yk 2GZZA 2CZ3A 1SKWB 5ENUA 1X5DA 2WB9A 1M7TA 1BG5A 1XXUA 3KH7A 2PPTA 3F8UA 4ML1A 2QGVA 3US3A 2KLXA 3KIJA 4HJMA 1N8JA 1MEKA 1NHYA 2CX4A 1DE1A 3W8SA 2L4QA 1GSSA 2GS3A 3DWVA 3VWXA 1G7OA 2B3SA 3HZ4A 1DE2A 1X9MB 1URMA 2V1MA 1LBKA 2GVPA 5DVBA 3VPTA 5L71A 2YNXA 1SU9A 1J08A 3IK9A 4E8HA 4N0VA 1AQWA 3V1WA 4Q5NA 4HS1A 1Z9HA 1EV4A 2VCTA 5ECKB 3HZ8A 2A2SA 3BCKA 1E6BA 2XBQA 2MBSA 2E7PA 5HQPA 3IAS2 4KNDA 3I69A 1TJDA 3F3RA 1TRWA 3EE2A 2TRCP 1PQNA 4PNGA 4WEYA 1YKAA 1K0OA 1K3YA 2NPBA 1EEJA 1Z7RA 4CW9A 3HJOA 1V58A 3E3EA 2FWEA 4NAXA 4K7NA 2M72A 3UIWA 2CVBA 1SD9A 3APSA 3Q74A 1FW1A 5HR2A 5J41A 2VLTA 1XFLA 5AGYA 4POLA 3PGTA 3HKRA 1TTZA 1SL2B 1YKCA 2LTKA 1ZYEA 1VGLA 3ERFA 1UA5A 2FWGA 4IELA 1SJZA 2MMNA 1SK1A 4POMA 3ZITA 4V1Ap 4ZB9A 1YQ1A 5D9VA 4Z7XA 2LRNA 4E8EA 4ZILA 3QFBC 5GAND 3UJ1A 1BQ7A 3IC4A 1PKWA 5ELGA 1RW1A 1F37A 4WF4A 1K0MA 1EEMA 3HYPA 5CNWA 4KCAA 5ID2B 1YY7A 5GZZB 5JCGA 3HJMA 5KN1A 3GH9A 3KXOA 1S3AA 4N0ZA 3ZYWA 3GKMA 4DVCA 1SL0B 2FHEA 1FHEA 3M9KA 3D21A 1GSQA 4WBRD 3RAZA 5HR0A 4Q5FA 3ED3A 2JADA 1A24A 2CV4A 3DKSA 3QDNA 4PUFC 1F6MC 2C4JA 4DEJA 1O85A 1M9AA 1YJ6A 3LFLA 4O92A 4HUAA 1EGOA 1QUWA 1E2YA 4TR1B 2JSYA 2MMZA 6GSVA 3G9BA 3H4KA 4TVEA 2GTUA 1I9DA 2YANA 5CRDA 3H93A 1PL1A 1ZOFA 3GKKA 4NHWA 1NW2A 1UN2A 1M0UA 1Y25A 3VWWA 5ECIB 4GRFA 3LQ7A 3BBYA 2DJ3A 1A2LA 2CA8A 1MDJA 2AAWA 2VM1A 2KP2A 1TK8B 3D6IA 2KOKA 3GFKA 2VD0A 5FWGA 1B8XA 1GSYA 5IMDA 6GSTA 5G1KA 2MMAA 3GX8A 1JZRA 2B1KA 3IR4A 1B4QA 2F8AA 1UVZA 3Q19A 2KP1A 1HYUA 1BJXA 3DIEA 1FOVA 3HXSA 1WP0A 4NV2A 3IAM2 3IOSA 1EGRA 4MF6A 2VLUA 2A2RA 4NHZA 2H1BA 5ECPB 4ISDA 5CREA 4FH8A 2BJXA 4EDYA 5B6MA 1G6WA 4DSSB 1KBNA 2JZSA 3G7JA 3CTFA 3DEXA 4GSSA 2CZ2A 4DSQA 3KTBA 2HYXA 2B7JA 1GTBA 3GH6A 1A2JA 4KSOA 5E59A 5D9XA 1GSDA 1NHOA 1RK4A 3HA9A 3TUEA 4JEDA 2HSHA 3FW2A 2VAFA 3IXRA 4MP4A 1XVWA 4X43A 1G0TA 3MDKA 4OCEA 3UOMA 3D0ZA 3U6VA 2H73A 1T7PB 3KZQA 3GIXA 2GSTA 3KH9A 2FNOA 1QXHA 4HQSA 1ERTA 2QC7A 1A8YA 1VF4A 4L5OA 2CT6A 1RQMA 1PKZA 5F8BA 2HZEB 4OFMA 4GSTA 4XTSA 1WOUA 2IFQB 1H75A 4HEA2 1OE7A 1H4OA 3LSZA 1V9WA 3FHKA 4TR1A 5GSSA 4FYCA 5IM9A 4I2UA 2XPEA 2XBIA 3C8EA 5EPFA 1XWAA 2P31A 3D5JA 7GSSA 3L4NA 2CVDA 2H70A 2DMLA 1MD4A 2LQQA 1U3AA 5B8BA 5JWQB 3UBKA 4PX1A 5A4VA 1TW9A 2TRXA 2WZ9A 4KUNA 5B7CA 1AXDA 2HZFA 2YP6A 2H0HA 2CVKA 2A4VA 3ZVJA 3IDVA 2C1YA 1GP1A 3IA1A 2OBKA 1XW9A 3ZREA 5IMCA 3CTGA 1K3OA 2HT9A 2DSAA 2KHPA 4HU7A 4OCFA 2AB6A 2DJ1A 3FKFA 1A0FA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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