2J23A

Cross-reactivity and crystal structure of malassezia sympodialis thioredoxin (mala s 13), a member of a new pan-allergen family
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
HHHHLVPRGSVQVISSYDQFKQVTGGDKVVVIDFWATWCGPCKMIGPVFEKISDTPAGDKVGFYKVDVDEQSQIAQEVGIRAMPTFVFFKNGQKIDTVVGADPSKLQAAITQHSA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cross-Reactivity and 1.4-A Crystal Structure of Malassezia Sympodialis Thioredoxin (Mala S 13), a Member of a New Pan-Allergen Family.
pubmed rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Immune protein
source organism Malassezia sympodialis
total genus 32
structure length 115
sequence length 115
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-08-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2j23A00
1XW5A 2DSAA 3ZMLA 4KX4A 3M9KA 5HR3A 2C0DA 4K1FA 2GSRA 5DCHA 4KSOA 7GSSA 1HQOA 2O7KA 1F9MA 1GLPA 2E2MA 5IPHA 4NMUA 2F8AA 1DUGA 3GYKA 4IQ1A 2TIRA 1TXXA 4YAPA 1F3BA 2C80A 4EE0A 2L4CA 2HNLA 1UN2A 4MJCA 3QOUA 4PQHA 5F07A 4NHZA 1K0NA 3HZ4A 1OE7A 3FW2A 3M0FA 5IQYA 1K3LA 5B8AA 3ZLPA 2YWMA 1ZYQB 1KTEA 3VLNA 1TRWA 2BJXA 1SK1A 2JU5A 4PGTA 5DQSA 3CRUA 5HFIA 1EGRA 3WGDA 2CZ2A 2XPEA 2YV9A 1ERVA 2WFCA 5C00A 8GSSA 2RM5A 3CRTA 5EL8A 3U5RE 3I43A 1PMTA 2XPDA 5IMCA 1WOUA 2QGVA 2C3NA 2I3YA 1X9WB 4FYBA 5H5RA 1E2YA 2H1BA 4LMVA 3ZITA 2H1DA 2VL3A 3EINA 3NOFA 3VWVA 1XZOA 3WYWA 3FEUA 2K8VA 3P8WA 3TB2A 3AY8A 1O81A 1R4WA 1SL2B 4MF5A 3WT2A 2HYXA 5GZZB 4DSQA 4LLRA 3DYRA 4MJBA 1TRSA 1XOAA 4RI7A 1A0FA 3IV4A 4OCFA 3ISOA 2P5RA 1ILOA 1DE2A 2A4VA 3EU3A 3CBUA 4E8HA 16GSA 5CRGA 3F6FA 3L4NA 1G7OA 3QPMA 4X0XA 4KDYA 1WIKA 5C04A 3C7MA 3F3RA 3FKFA 1ON4A 2VM2A 2YANA 1CQHA 4V2LA 2HRFA 3A2WA 2H76A 2DJJA 4KDXA 4IKHA 4HZ4A 2WB9A 2OADA 4ILFA 4HQZA 2XC2A 2VD1A 5G30A 5DBQA 1EP8A 22GSA 2O85A 4DEJA 1F2EA 2WCIA 3GL3A 4GQCA 3IDVA 1EV4A 3KP8A 4V1Ag 3ZZXA 2BMXA 4HU7A 3LEFA 2ALBA 1FG4A 3GKMA 1SJZA 4F03A 4TN8A 3ERFA 1X5EA 5IOWA 2QKEA 1XVQA 3ZFBA 2K9FA 4KNDA 1NHOA 2IN3A 2YWNA 3E9JB 3DWVA 1OAZA 3KZQA 3D4MA 2PGTA 2KOKA 4DSSB 4YH2A 2I81A 5ECNB 2C0FA 3HCZA 5G1LA 2X64A 2JZRA 5JCWA 2LUSA 1NM3A 1J08A 4JBBA 4KA0A 2GZYA 2GSTA 3M1GA 1GSSA 2PBJA 3ERGA 3DEXA 3J7Yk 5HR2A 4KUNA 4LL4B 4TW5A 4IHUA 1A2JA 1VGLA 1M9BA 2VCZA 3GV1A 4EL1A 2WDUA 3HVXA 1U3AA 2LTKA 2GTUA 3LSZA 4V1Ap 2OE1A 5CAXA 4X1UA 2VUPA 1ACVA 3VWUA 1TTZA 2HZEB 3KIJA 2H01A 1EGOA 4POMA 1OC3A 1TK8B 1PA3A 3DRNA 3I69A 3KH7A 17GSA 2WZ9A 1A23A 4I6XA 1EZKA 3LFLA 5JWOB 2H0HA 4P3YB 1AQXA 3KMOA 2FY6A 2XHFA 4WEYA 2GS3A 2L57A 2EIOA 4TKYA 3C1RA 5ECPB 3CXGA 3ZRDA 3HHVA 2YJ7A 5IMFA 1TRVA 4IN0A 1GSYA 4PX1A 1PRXA 2YP6A 2CQ9A 4OFTA 2LS5A 5F06A 2H0GA 5H5SA 4IJ3A 4HOJA 5INYA 3F4TA 3FR3A 1R7HA 4ECCA 4HS1A 2VLVA 5ECRB 4GCIA 4PXOA 4OCEA 5EPFA 1U3IA 4EXJA 3APQA 4MPGA 2DJ1A 2VL9A 2LJAA 3CMIA 1QUWA 5JCUA 1OC9A 3U6VA 3HY2A 3GX0A 4KW6A 2L5LA 2G0FA 1WRYA 3GSTA 3ME8A 2ES7A 4LL1B 3ZL5A 1SENA 3LXZA 4K7OA 5CRWA 5IMVA 3O6TA 3RDWA 1A2MA 2FWHA 1GP1A 5A4WA 3GFKA 1SJ6A 2KP1A 2MMAA 3H79A 4XRDA 1T4ZA 3H1NA 3HJOA 1V2AA 3VFIA 4K2DA 3C1SA 2M72A 1JZRA 1SU9A 4ISDA 1PN9A 2QC7A 3DGQA 4HI7A 2O87A 4MPFA 1S3DA 1XIYA 3KCMA 2WS2A 2DIZA 4TXOB 4XCSA 5DQYA 3Q74A 5COHA 4BVXA 1UC7A 3EC3A 2GT6A 3EU4A 3LYKA 4PUAA 5GSSA 3GNJA 2C4JA 5AISA 2PVOC 4H86A 2E7PA 3DKSA 1MDIA 1S3CA 1E6BA 3D22A 3TCOA 1SYXA 2DIYA 1ZOFA 1Z6NA 2IMIA 1TDIA 2H6XA 5ECOB 1ERTA 2FWFA 4RUVA 3P90A 5ID2A 1GTUA 3K8NA 1EEMA 2IMDA 2CA8A 2PVQA 4BPYA 5KEJA 3GTUA 5IPGA 2FGXA 1K0OA 4E8EA 4Q5QA 4WXTA 3ZTLA 4GRFA 2KP2A 4V2NA 1ZYEA 5F0GA 3IK9A 2R2JA 2XBIA 1M2BA 1U87A 1YJ6A 1J0FA 18GSA 4Z7XA 1WPIA 2HZFA 3UIWA 2GT5A 3VWXA 1TW9A 2IMEA 1K0CA 3FZ5A 3L78A 3TRQA 4BL7A 2AUVA 1N8JA 4HDEA 1QMVA 4GTUA 3QAGA 3F6DA 4OO4A 3TJBA 4IBPA 3ME7A 4MP4A 4OFNA 3IE3A 3GIXA 5HR0A 4ML1A 3LORA 1MD3A 1PD21 1K0DA 2IWTA 2FLSA 3GH9A 2FA4A 2L59A 13GSA 4ECJA 4K6XA 3QAVA 3LYPA 3HXSA 1FVJA 2P5QA 2F9SA 2OE0A 1KBNA 4EF0A 1T3BA 3LQ7A 3QD9A 2G2QA 2E0QA 4PUFC 14GSA 2IFQA 3A2VA 2L6CA 4TR3A 4WF5A 4BVYA 4MZBA 2VLTA 6GSUA 3SWLA 3FR6A 2C1YA 3D4TA 4ZL9A 2CAIA 4K9ZA 5ECLB 3F63A 4HZ2A 1DE1A 1EV9A 2LSTA 2B5EA 1PQNA 3LG6A 3L0HA 1M2DA 3BOAA 5DALB 4O92A 2LNSA 3GURA 2BTOT 3PINA 1TI3A 2HXKA 1IYHA 5ELAA 3UEMA 1YKCA 3F3QA 2VCXA 2E2GA 1TJDA 1SKSB 3EMXA 2KHPA 1RK4A 1TRUA 4N30A 4HEA2 1YF0A 3HKRA 3V1WA 5G31A 2PU9C 1GH2A 1TI1A 3MSZA 4KGIA 2XBQA 2H71A 3GH6A 2EIRA 4MF7A 1PSQA 3PR8A 2V6KA 4G19A 2AAWA 2HFDA 5J9CA 4KSMA 3E3EA 1Q4JA 1LJRA 2N5BA 2FCHA 1SJIA 1R5PA 1X5DA 4EDZA 1JZWA 3QFBC 4TRXA 1XWKA 1VF4A 3W8JA 3G7YA 2H66A 2MMOA 3IAS2 2YWOA 3UBKA 1B9XC 2P31A 2DLXA 2REMA 1M99A 5G5EA 3IRAA 4ID0A 5J4UA 3C8EA 4OFMA 4ZBBA 4NHWA 5HFGA 3ZIVA 3L9UA 3UL3A 2WULA 4I2UA 2LV3A 2HLSA 1ZZYA 3TUEA 5GAND 4K7NA 5D9WA 4FIWA 4TOPA 5AGYA 1TU7A 2F51A 3I6AA 4HJ2A 3BCIA 4GLTA 1M2AA 1SL1B 3HJPA 1XWBA 4Q5NA 3QDNA 2D2ZA 1Z7RA 2GSQA 2H30A 4OMVA 3L9VA 3CYNA 3WGEA 2I1UA 2NTOA 4DVCA 2HE3A 2OJLA 3TOUA 3QR6A 4O7HA 3FK8A 2VCQA 4JU5A 5HR1A 2VCWA 2VOCA 4MA9A 4XS4B 3G9BA 1SYRA 5A4UA 5HQPA 1YZXA 1V57A 1K0AA 2MBSA 4MH3A 2B7JA 4XRAA 4EVMA 3FZ9A 5AIXA 5ENUA 1AXDA 1GTIA 4IP1A 2X8HA 1OKTA 3F9UA 5IIZA 2K6VA 1ML6A 2CV4A 3LJRA 1AQWA 2H1GA 1VF3A 3IOSA 2WGRA 2DMMA 3KXOA 4I8BA 2H1AA 1Z6MA 2KLXA 1GUMA 3FYGA 2C8UA 2HSYA 4HJMA 2YJHA 2NPBA 4J2FA 1URMA 1UVZA 2JSZA 3G7IA 1AIUA 4ZB6A 3HJMA 4N10A 4ACSA 4HUAA 2GZZA 5LNKe 2EIQA 4MABA 2LQQA 4F82A 1GLQA 4FYCA 2FD3A 4TXVA 2K8SA 4TR4A 1SKRB 4XIHA 5F8BA 5KN0A 1YDKA 1RQMA 3APSA 5ECQB 2CAQA 1OE8A 1C72A 4XS1A 1GNWA 2VIMA 5HFKA 5LD0A 3ED3A 4EC0A 2L4QA 5J5NA 4ML6A 5ECHB 3QMXA 2CX4A 2F8FA 4BWQA 1EWXA 2VCTA 2KUCA 2O89A 2IMKA 4G2EA 3TKRA 1BQ7A 1JZDA 3H8QA 2GLRA 1O8WA 4MDCA 1B4QA 4JRRA 4TR1B 3UJ1A 3E0UA 1XVWA 2IPAA 3Q18A 2I9HA 3QCPA 2AJQB 4ZBAA 4X43A 1QGVA 3S9FA 1QQ2A 3H4KA 2H8LA 2H73A 3GX8A 5KN1A 2RLIA 2RUEA 4IQAA 2AHEA 2YV7A 4GQFA 2H72A 4ZL7A 1BX9A 1A8YA 4YAVA 3EE2A 3FY7A 4WR5A 4DSSA 4WKWA 1QFNA 1Z7PA 2IJYA 3CTGA 5KN2A 1JFUA 1A24A 1ZL9A 2ZCTA 2FUG2 3ZIJA 2M46A 4F9ZA 1WMJA 3UOMA 1HD2A 3C71A 1ST9A 4L5LA 3VURA 2NVLA 1TP9A 5ECKB 4XHMA 5ABRA 3CTFA 1BAYA 5KN3A 1XPVA 4RI6A 1T8EB 3TRPA 3MWHA 2PWJA 4K7IA 4MZWA 5E59A 1HNCA 4ZB9A 5ELGA 5CNWA 2LQOA 1XBSA 4RQXA 2TRCP 2CZ3A 3ERWA 4WR4A 1X5CA 3GKNA 2JL4A 3CSHA 4TVEA 4NXIA 3NZNA 2IMFA 1K3OA 5IMZA 1XFLA 5B7CA 5A5KA 2FHEA 4MJEA 2R37A 3GA4A 1XXUA 4ZL8A 3NIVA 1NSWA 3QFAC 2VAFA 3O3TA 4F0CA 2FNOA 1Y6EA 3HD5A 3IA1A 1SL0B 4WBRD 3VWWA 5DAKA 1TKDB 1T1VA 3TKSA 2ON7A 1GNEA 3VI7A 4I97A 1GUKA 4JE1A 1AC1A 1BYEA 5A4VA 3FZ4A 2YNXA 3GMFA 1CQGA 4L0UA 2AYTA 1JLWA 5D8IA 2GSSA 2OACA 4JEDA 2R6KA 1XW9A 1K0BA 2Z9SA 3TJGA 1GL8A 2DJ2A 2MBTA 1J9BA 5J41A 2A2RA 1OKDA 2MMZA 5CRHA 4AGSA 2DJ3A 1I5GA 2FA8A 3GKXA 2RUFA 4YQMA 3DVWA 2MZCA 2LEGA 3RAZA 1N2AA 5L71A 1XOBA 1K3YA 1EEJA 2HSHA 4MZCA 2IFQB 1F6MC 5FWGA 5LCZA 2R4VA 3TJFA 3OR5A 3MAKA 4O5RA 3LGCA 4D73A 3GUSA 2ZNMA 4MLYA 1ERWA 3TKPA 1WJKA 2AV4A 3HDCA 5B8BA 2JACA 9GSSA 4L0WA 4O32A 3HYPA 2H75A 4MH2A 5AN1A 2CVBA 3LXTA 1GSFA 2JSYA 3ZVJD 3LWAA 4F0BA 4G9HA 4YQVA 2RM6A 4CDOA 3GN3A 1JHBA 3APOA 1PGTA 3UMAA 1GUHA 2GZPA 3HA9A 1AQVA 3WD6A 5G1KA 1YF1A 6GSTA 4FH8A 5DVBA 1KEBA 1FB0A 3MDKA 1HYUA 2LKUA 5IMAA 2M80A 3GHAA 1MTCA 1G6WA 1U6TA 2CVDA 3TKQA 5FT3A 3DIEA 3KEBA 5ECIB 3TKSC 3TOTA 1BJXA 3ZVJA 2GQMA 1XCCA 2RIIA 2OA7A 1OVNA 3L9SA 1FO5A 2DC5A 3ZFLA 2VO4A 1WWJA 3R2QA 1NW2A 3IC4A 1QXHA 1ABAA 1K0MA 1G6YA 3N5OA 5D93A 3IHQA 4KH7A 2PERA 4WF4A 1O7UA 2PMTA 4KDUA 1VF2A 5CO3A 3DVXA 3F8UA 1JZOA 2VCVA 2LJRA 3KP9A 4EKZA 5E4WA 5CRDA 4IVFA 3GRXA 5F05A 5G2ZA 4ZBDA 3TJKA 1THOA 6GSVA 1XW6A 3RPPA 2F3MA 4BA7A 5IM9A 5AIVA 3ZMKA 4GXZA 2H0IA 3GKKA 4G10A 1Z3EA 5GSTA 1B48A 3UBLA 2N5AA 1VRSD 1R5AA 3A2XA 2DJKA 5JCGA 1U88A 3WT1A 1ZMAA 2GQLA 2LRTA 2NBSA 4KAEA 1H75A 2IIYA 1GTAA 2LRCA 1KNGA 4JZQA 1PX6A 2B7KA 4L5OA 1MEKA 3TRXA 1ZGNA 5DALA 4AJ8A 6GSYA 4MK3A 3IXRA 1HNAA 2YPMA 1TK5B 2B5XA 4K0NA 3DXBA 1V58A 3N9JA 3M9JA 4XS6A 2VD0A 3A5WA 1EOGA 5IMDA 2J23A 5J9BA 3IAM2 4OO5A 3US3A 3KH9A 1YEXA 2X99A 10GSA 3TDGA 4K0GA 1GULA 5D96A 2FWGA 2OBIA 3H93A 4K8MA 2OKAA 2DBCA 6GSWA 3F4SA 3M8NA 1X0RA 3HVVA 1FB6A 2MYGA 3EURA 3VI5A 19GSA 1B8XA 4PNGA 3D0ZA 3MNGA 1G7EA 4GF0A 2H74A 3RHBA 5JWQB 4CW9A 3EWLA 3C73A 2V41A 5EY6A 2LJKA 4NWYA 1EOHA 3UVHA 1GSEA 4RQRA 3W8SA 1FOVA 3GL5A 3DD3A 2B5YA 4FO5A 1VF1A 5GAPD 6GSXA 1DSBA 2O8VB 2N5FA 2H6ZA 3A3TA 2K18A 4PQIA 2FWEA 3IK7A 1GTBA 1T00A 2X8GA 4J57E 1H4OA 3EVIA 3IR4A 3BCKA 1GSQA 4PURA 4GWRA 1SKWB 2GQKA 3WGXA 3D5JA 3Q6OA 4XTSA 1JLVA 4ECIA 1G0TA 4MMMA 2DMLA 4Q5FA 5H5QA 4POLA 5ECMB 4XS4A 3I9V2 1YY7A 1R26A 3KTLA 2VLUA 2HRNA 2GVPA 1TK0B 4YQUA 1PX7A 2B1KA 1XWCA 2YCDA 3VPTA 2V32A 1A2LA 3G7JA 4GSNA 1V98A 5ECSA 12GSA 2NDOA 2YZUA 4KCEA 4F2IA 1AUCA 5DJMA 4KCAA 1V9WA 1SK2A 5G5FA 1B4PA 4Q5RA 1FW1A 3FR9A 2V2GA 1MDJA 5DCGA 3QAWA 1PL1A 3KD0A 3O76A 3W6GA 2HI7A 1EP7A 2B6MA 5DJLA 1OC9B 2WJUA 2H6YA 3TGZA 2R5GA 2PPTA 1O6JA 1USBA 2CX3A 3VK9A 4EDYA 5DDLA 4L8EA 4ECBA 11GSA 3VPQA 1Z5YE 2YOIA 1T4YA 4PNFA 4AJ7A 2JADA 4HU9A 1BG5A 1MD4A 1T7PB 1Y25A 2LRNA 1LU4A 1W89A 4JR6A 2X8CA 2P0GA 3JCML 2IL3A 1SK0A 1WP0A 4KE3A 3TKSE 1I9DA 3FZAA 1SD9A 4V2MA 4MJAA 3IBHA 3KMNA 4FYUA 2MMNA 3M3MA 4AJ6A 3BBYA 4EO3A 2JZSA 1BEDA 5B6MA 4N0VA 4POKA 3UVTA 4NPBA 6GSSA 1X9MB 4QL7A 5IO0A 2OE3A 4TR1A 5DAKB 2PN8A 3RPNA 1TU8A 1F3AA 1W4VA 4NV2A 1FAAA 4ZXGA 4IW9A 2HZEA 5ID2B 1RW1A 2R3XA 2VL2A 1O85A 2CVKA 2DJ0A 3Q19A 1M0UA 5IOXA 1OC8A 4TR0A 3ZREA 3GTUB 4N0ZA 4N11A 4J56E 4MF6A 1Q98A 2C0GA 3HZ8A 4WBJA 1A8LA 2H19A 5IO2A 1THXA 4LMWA 1GRXA 5CYYA 4ZIJA 3SBCA 1M7TA 3KM6A 2L6DA 5JWRB 1PKWA 2ZUPA 1NHYA 2TRXA 2B1LA 3KTBA 4D73B 3KGKA 4QL9A 1YQ1A 3ZYWA 20GSA 2OBKA 2HT9A 1QK8A 4PQ1A 2B3SA 2AB6A 3GSSA 4AF2A 4CHSA 2A2SA 4IGJA 4NV5A 3FRCA 1A0RP 1M9AA 1SD8A 3D21A 1PKZA 4IS0A 4BWSA 3DMLA 1GSUA 5D9XA 3IPZA 1DBYA 3CSJA 3P7XA 3HVSA 1XWAA 3CSIA 2JZTA 1TOFA 1Z9HA 2H70A 2GGTA 4IELA 5B6NA 2C3QA 5J3RA 4POBA 1AAZA 4HQSA 3PGTA 4LA1A 4JR4A 2EC4A 1PL2A 4DSRA 1UA5A 2YN1A 2I4AA 1ERUA 1O73A 1B9YC 4NAXA 4QQ7A 4TXOA 1HNBA 4ZB8A 3D6IA 4ZILA 1X9SB 1IYIA 4OD7A 5D9TA 2GDRA 2C0EA 3BJ5A 4IJIA 3P2AA 2VL2C 3RHCA 2LNTA 4GSTA 4EUYA 5EVOA 3KJYA 1AW9A 1GSDA 5CP1A 4GSSA 1OYJA 4ULXA 1FVKA 3J7Yb 1S3AA 2J9HA 3BD2A 3F0IA 3TJJA 4OWYA 2C3TA 4KB3A 2CT6A 2V1MA 3PH9A 1V40A 5CREA 2YZHA 1XWGA 2PUKC 4IP6A 3FHKA 3RBTA 1GWCA 1FHEA 1O8XA 3UAPA 5D9VA 1LBKA 4MCUA 4WETA 2V6OA 3EYTA 2L5OA 5D73A 1MDKA 2QSIA 2ON5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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