2JSZA

Solution structure of tpx in the reduced state
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
MAEITFKGGPVTLVGQEVKVGDQAPDFTVLTNSLEEKSLADMKGKVTIISVIPSIDTGVCDAQTRRFNEEAAKLGDVNVYTISADLPFAQARWCGANGIDKVETLSDHRDMSFGEAFGVYIKELRLLARSVFVLDENGKVVYAEYVSEATNHPNYEKPIEAAKALVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus subtilis
publication title Reversible conformational switch revealed by the redox structures of Bacillus subtilis thiol peroxidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable thiol peroxidase
total genus 47
structure length 167
sequence length 167
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-07-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2jszA00
1ERTA 1BAYA 3QFAC 2H19A 1KBNA 5B6MA 3ZMLA 2LSTA 1OKDA 2GQMA 2FNOA 2L59A 1WWJA 4Q5QA 1B8XA 3EURA 5JCGA 1SD8A 2QKEA 2GSRA 5AIVA 3BBYA 2AV4A 1TK5B 3D0ZA 2A2RA 3VI7A 2YWMA 1PQNA 1WE0A 3FR3A 1WOUA 3KTBA 1GSDA 4JU5A 1GSYA 2VCQA 4YAVA 2C80A 2TRXA 2F3MA 2MBTA 3L9VA 3TJGA 2VCXA 3L9UA 3IE3A 3CTGA 1R26A 2PU9C 2QSIA 1K0AA 1F9MA 3DGQA 4WBRD 5GAND 1XWGA 1Z7RA 5IMVA 1H4OA 2WRTA 3LGCA 4Q5NA 2G2QA 3M8NA 1USBA 2H6ZA 2LNSA 4KH7A 4POKA 1U3AA 2HYXA 2RUFA 3W8JA 2MMOA 4PURA 2IPAA 3C71A 3WGDA 3HXSA 5GZZB 1FW1A 4RI7A 6GSTA 1A2LA 5JWQB 3RAZA 5A4WA 4O5RA 2YNXA 4MJCA 2H0IA 2OKAA 4TR1A 2DJ1A 5DBQA 2I4AA 1VF2A 3U6VA 5IIZA 3LYKA 3NOFA 1PX6A 2HZEB 1GLQA 3V1WA 4MF7A 5JCWA 2VCWA 1SK2A 3HJPA 1GWCA 2V2GA 3M1GA 4NWYA 3C73A 1GNEA 1XBSA 3TKQA 1AUCA 2JZTA 2B5YA 5D73A 3UEMA 3VWWA 1PSQA 4V1Ap 1GRXA 2X64A 3CBUA 3BJ5A 1W4VA 2OE1A 4ZIJA 1LBKA 5F07A 3HA9A 5INYA 2IN3A 2DIYA 3EMPA 3ZFLA 4KUNA 2LRCA 4ZILA 5EL8A 5HFGA 4NMUA 2KOKA 2ON7A 3ZREA 11GSA 3G7IA 4NXIA 3HHVA 3DVWA 2AJQB 4ZB9A 2X99A 4ZBBA 1OE8A 5EPFA 4HI7A 1AAZA 1XOAA 4HOJA 6GSUA 3APOA 5H5QA 4AJ8A 2C0DA 1K0CA 2VD1A 4XS4B 3J7Yb 2GVPA 4KSOA 4Q5FA 5DJLA 1UA5A 5J9CA 2LV3A 3UVTA 4FYCA 5ID2B 3TUEA 5IMAA 1XWAA 2CVKA 3RBTA 4FH8A 3TDGA 2LS5A 1FB6A 3H79A 5LNKe 2GTUA 3FYGA 1ML6A 4TN8A 1M9AA 5IMCA 1S3AA 1A0FA 3TRQA 2V1MA 1F6MC 5ECSA 3KXOA 3HYPA 4ACSA 2B7KA 1R7HA 1FB0A 4K8MA 4V1Ag 1ST9A 2C1YA 2F51A 3KMOA 3HJMA 3E3EA 1QUWA 4TOPA 4XRAA 3FK8A 1MDIA 3ZYWA 5AISA 4IHUA 1UC7A 3QPMA 4QL7A 5KN2A 5EY6A 3F4SA 1PD21 3FHKA 3QD9A 1YJ6A 1LU4A 4F9ZA 1QQ2A 1SENA 5AIXA 2V32A 4KDUA 3O76A 2H73A 3KMNA 2I3YA 1SKSB 3DKSA 1I5GA 2L6DA 3Q74A 3CSJA 3VK9A 2H0HA 2RLIA 2JACA 1TP9A 5AGYA 2LJRA 2HNLA 4K9ZA 3FZ4A 2FY6A 2O7KA 5G5FA 3ERGA 4GTUA 3VWVA 2J9HA 2MMAA 2E2GA 5D9VA 2E7PA 5D96A 3KEBA 1TOFA 1URMA 2GT5A 1S3CA 3FZ9A 5H5RA 1YKAA 5HR1A 4NHWA 3EU4A 6GSXA 2DJ0A 1VGLA 1JFUA 3HZ8A 3UBLA 2R37A 4POBA 4MCUA 3LXZA 2H0GA 3TKSA 4IJIA 3LEFA 3EC3A 4MH3A 3A2WA 2VL9A 1O85A 1HQOA 3D4MA 2OACA 3FW2A 5EVOA 4PNGA 3GMFA 2H1AA 2FA4A 4L5OA 1HNAA 1DUGA 3IAS2 3IRAA 4O7HA 2XPEA 4BWSA 1M7TA 1PN9A 1GNWA 2WZ9A 3M9JA 2PMTA 5ECPB 2NVLA 2DMLA 3F3RA 3P8WA 2DJJA 2CZ2A 2P5QA 3F4TA 4LA1A 5IQYA 1M99A 4IP6A 2FCHA 2PUKC 3DWVA 5J4UA 1ERWA 5CRGA 3HVSA 4Q5RA 4PQHA 3TKSE 1AQXA 2LRNA 2BTOT 4MMMA 1XWCA 4JEDA 1ZMAA 3TOUA 1JLWA 1JZRA 3CSIA 1TI1A 3QFBC 2KP1A 1V57A 4YQMA 5ELAA 4XCSA 2K8VA 5D9TA 3Q18A 3MSZA 2P0GA 4HJ2A 4WR5A 2C3QA 4E8EA 2O89A 1Z5YE 4OWYA 3LYPA 2L57A 3ED3A 3KP9A 4I6XA 2BJXA 1T4YA 5F8BA 3GH9A 4ZB6A 1OC8A 5GSTA 1XW5A 2TIRA 3WT1A 1YKCA 1N2AA 4PUFC 3FR6A 4XRDA 1ACVA 3TJFA 5KN1A 2CX3A 5CYYA 3Q6OA 1BJXA 4ZL7A 2WGRA 1JZDA 5HQPA 1XXUA 1M0UA 2MMNA 2ZNMA 5CRWA 4CHSA 3ME8A 1THOA 2PBJA 4BA7A 2VD0A 1PL1A 2HT9A 5ECOB 4K0GA 3GUSA 4ECJA 3CXGA 4K6XA 3RDWA 2B1KA 1WP0A 1SU9A 2EC4A 1A24A 1GULA 3GN3A 2O8VB 3GX0A 5HR3A 3QDNA 4BVXA 1T00A 4F2IA 3ZZXA 1T7PB 2YWIA 4L0UA 5C04A 3M3MA 4ZBDA 3ZTLA 4ECBA 2ALBA 5CRHA 4G10A 4ISDA 5IO0A 1XOBA 2MZCA 2VLUA 1K0BA 3UIWA 2C0GA 2LJKA 1EP7A 2YP6A 2N5BA 3D6IA 4WBJA 1PA3A 2V41A 2RM5A 2YJHA 3TJKA 3UVHA 3LORA 5IMZA 4YQUA 1CQGA 4JRRA 6GSWA 4JR4A 5J41A 2H75A 4PX1A 3H93A 2H01A 4EC0A 3QCPA 2IIYA 4KA0A 9GSSA 4MABA 3VLNA 2GS3A 2OE3A 2IMDA 4F82A 2H30A 3DVXA 2DMMA 4I8BA 2AAWA 3VPQA 4GLTA 3BOAA 4HU9A 1SD9A 2NDOA 1K0NA 1GSEA 3VWXA 4QQ7A 2VLVA 3GIXA 4G2EA 3KH9A 4MDCA 2JSYA 4LL4B 4O92A 3GA4A 2K6VA 1EV9A 3LFLA 3GKKA 5DALB 5IPHA 3IOSA 5DQSA 4OCFA 5B6NA 2VM1A 5CRDA 2KUCA 2FUG2 2JU5A 3HD5A 3HZ4A 3TRXA 2MMZA 1MDKA 4MPGA 2BMXA 5IOXA 10GSA 3PR8A 3C7MA 2LQOA 5IM9A 2NTOA 3KZQA 2K18A 4MJAA 4DSQA 4KB3A 2N5FA 3UARA 2M80A 2L5LA 1XW6A 4TXOA 4OFNA 3VI5A 1OVNA 1SJZA 3H8QA 1QK8A 2EIRA 2MYGA 5ECKB 1GTUA 4J2FA 2QGVA 2C0FA 4HZ2A 1R5PA 5DQYA 1B48A 4EF0A 1GTAA 3N9JA 4X1UA 4K0NA 3IXRA 5KEJA 4EKZA 1QMVA 2GZZA 4EL1A 4K2DA 2C8UA 1PMTA 2HFDA 4HQZA 5ID2A 1GLPA 5ABRA 4MPFA 1IYHA 2CQ9A 2HSYA 3RHBA 1LJRA 5ECIB 4RUVA 4P3YB 2MBSA 2LRTA 5GSSA 3I43A 4EDYA 4OCEA 4KSMA 4IP1A 3UAPA 2EIQA 1J0FA 2TRCP 5B8AA 4G19A 3M9KA 3F63A 5G5EA 1A0RP 2RIIA 2ZUPA 4FO5A 1WJKA 2LNTA 1M9BA 3HVVA 2X8HA 2FHEA 1ZYQB 1GSQA 5GAPD 2HZFA 3KJYA 1A23A 2YOIA 3KTLA 2H76A 1O73A 2RM6A 3IC4A 4HDEA 5IMDA 3FR9A 4EO3A 4ZL9A 3ZMKA 1YEPA 4MZCA 2R2JA 1SK1A 1ZYEA 1EGRA 1TI3A 2H1DA 3ZVJA 4ML6A 3GYKA 5G30A 2O85A 3F6FA 3DIEA 4RQXA 2WFCA 3EMXA 1SJIA 5ECLB 1Y25A 4ML1A 1TU8A 2HXKA 2WJUA 4HJMA 2IMKA 4D73A 3NIVA 5DAKA 2Z9SA 1EP8A 4XS1A 4WXTA 3FRCA 2P31A 4DSSA 1T4ZA 4HU7A 5HR2A 3U5RE 2DJ3A 2B1LA 4HZ4A 1XIYA 3GTUA 1S3DA 5JCUA 3TOTA 3ZITA 2GSSA 3HVXA 1B9YC 1O8XA 3GKXA 4GSSA 1V98A 1DBYA 4PGTA 2JL4A 1J08A 1SYRA 2DSAA 2PWJA 5DCHA 3CTFA 1ZL9A 2VIMA 2OBKA 4N0ZA 3ZL5A 3HY2A 3EYTA 3P90A 1O7UA 1O8WA 3IBHA 2DJKA 2V6OA 4N30A 2H72A 2HI7A 3IPZA 3IV4A 3LXTA 2AYTA 2VOCA 2FD3A 4EVMA 1M2AA 1GUHA 3UJ1A 1AIUA 2XC2A 2YZUA 3I9V2 1ERVA 1GUMA 3TRPA 5COHA 1W89A 5DDLA 3QAVA 3TKPA 3H1NA 2YZHA 2WULA 1G7EA 5D8IA 4I97A 4KE3A 4XS6A 2XHFA 3US3A 1UN2A 1XPVA 4OO5A 3GHAA 3FKFA 5A5KA 3ERWA 3ISOA 3DD3A 2PGTA 1WPIA 3OR5A 3LSZA 4O32A 1TU7A 1JZOA 1SJ6A 2M46A 2PN8A 1QGVA 4DVCA 4QL9A 1U88A 4YH2A 3UL3A 1ERUA 5G1LA 2GZPA 2LUSA 5FHIA 2JZRA 1DE2A 4TR4A 4ILFA 4OFTA 1X5DA 2FGXA 4K7OA 5HFIA 1PL2A 5C00A 2I1UA 1ZOFA 3F9UA 3EINA 4GWRA 3E9JB 4FIWA 5E4WA 1GTIA 3CRUA 3GFKA 1YF0A 2DBCA 4NV2A 4MZBA 3UBKA 3C1RA 4TRXA 1CQHA 4CW9A 1Z9HA 1K3YA 4GF0A 3QR6A 4HUAA 2CVBA 5J9BA 1YDKA 4IQ1A 1FHEA 1TK0B 1ABAA 1TDIA 4CDOA 1TRVA 4FYBA 4V2MA 4KDXA 1K0OA 2JZSA 3QAGA 2F8AA 1Y6EA 2A4VA 1F3AA 1G7OA 4BWQA 3HJOA 2CAQA 4X0XA 2RUEA 1OAZA 16GSA 4GQCA 2JADA 2I81A 3S9FA 4TW5A 3F0IA 3IK7A 4IJ3A 1WRYA 4WR4A 3DXBA 1TRWA 1TRSA 1VF3A 3VWUA 3WYWA 2VO4A 3IA1A 2GQLA 1EEMA 4IVFA 2OJLA 3ZLPA 3EU3A 4F0BA 1OC9A 1AQWA 1BEDA 3TKRA 4I2TA 4XHMA 2GQKA 1T1VA 3PH9A 1SKRB 3DRNA 3ME7A 5CAXA 2FWEA 3APSA 3HCZA 4N0VA 4GCIA 3GL3A 4E8HA 3GURA 3LQ7A 2D2ZA 2YV9A 5HFKA 2L6CA 3H4KA 2OE0A 5LD0A 4AGSA 2GZYA 3MAKA 1FOVA 1GSUA 2H71A 4NPBA 3D21A 2H8LA 1T8EB 3O3TA 3BCIA 4KAEA 2FWFA 20GSA 1YY7A 2IL3A 1BG5A 1EGOA 4L8EA 1SL1B 1WIKA 1HNCA 2DIZA 5JWOB 2FLSA 2F8FA 2IWTA 1U6TA 5FWGA 4J57E 4ID0A 3E0UA 1F2EA 4JZQA 3N5OA 4MF6A 1RQMA 2K9FA 3EWLA 3IHQA 4ZBAA 1E2YA 13GSA 4N11A 2KHPA 1K3LA 2G0FA 3G9BA 1AC1A 3ZRDA 3APQA 2C4JA 2PPTA 2ON5A 4POLA 2E2MA 5IO2A 3RHCA 1G6WA 5A4UA 4KCAA 1JZWA 2IFQB 1QXHA 3WT2A 3KIJA 3F3QA 1THXA 3FEUA 1PRXA 3QMXA 1TKDB 2FWHA 3KGKA 3SBCA 3F6DA 2N5AA 5DALA 2IMFA 2GT6A 1V58A 2WB9A 3EVIA 1KEBA 4OD7A 4L0WA 1SKWB 4BVYA 1TXXA 1H75A 3C1SA 2YN1A 2WDUA 1V40A 1EOGA 4IKHA 1OE7A 4BL7A 3GL5A 5LCZA 1EWXA 3GV1A 4F03A 2OA7A 2IMEA 3CRTA 4OO4A 2H1GA 4V2LA 3CYNA 4WETA 1R4WA 2H6XA 3QOUA 2HZEA 4LL1B 4KGIA 1FO5A 2H66A 5F06A 1DSBA 1O81A 4TR0A 1QFNA 1V2AA 5ECMB 4NHZA 6GSYA 2LKUA 2LQQA 1PKWA 2VCTA 22GSA 1U87A 3ERFA 1MEKA 4PXOA 5ECNB 2IMIA 4ECCA 1TK8B 1E6BA 1XFLA 2GDRA 5D93A 5J3RA 2VL2C 4MZWA 1IYIA 5IOWA 1Z6NA 2LJAA 4GXZA 1X9MB 3PINA 1M2DA 4TVEA 5KN0A 2DC5A 2H74A 4MJEA 1A8YA 4K1FA 1B4PA 1PGTA 1VF4A 4KNDA 5ECQB 3RPNA 1XWBA 4MH2A 5ECHB 5A4VA 3KD0A 4EUYA 6GSVA 1RW1A 3DEXA 5DCGA 5D9WA 1TW9A 3VFIA 2C3TA 3DMLA 3CSHA 4NAXA 4OMVA 1XW9A 4N10A 1G6YA 1X0RA 2H1BA 1EOHA 1SL2B 4GRFA 1X5CA 2LEGA 3A5WA 3GSTA 3D5JA 4IS0A 1TRUA 1I9DA 1FG4A 4XS4A 5ENUA 1Z7PA 1YF1A 1MD3A 2VCZA 3ZFBA 4AF2A 4HS1A 1SL0B 2H70A 3G7YA 4LLRA 1ZCPA 2B3SA 1VF1A 2CAIA 1O6JA 1NHOA 4TR1B 5G2ZA 2WS2A 4EXJA 2X8CA 5IMFA 1X9WB 3ZVJD 4TXOB 2EIOA 1EZKA 4KW6A 1A2MA 4MK3A 3NZNA 3O6TA 4I5QA 4LMVA 3F8UA 1M2BA 5CREA 2R3XA 3GSSA 2DLXA 2L4QA 3P7XA 2YWOA 2F9SA 3GKNA 1NHYA 1K3OA 4ZL8A 4GSTA 1GUKA 2I9HA 2OADA 2P5RA 4X43A 1GL8A 2K8SA 2CA8A 5JWRB 2YV7A 1G0TA 2O87A 1TJDA 2J23A 2PVQA 4JBBA 4WKWA 5KN3A 3TGZA 3IAM2 3AY8A 4OFMA 2GLRA 2OBIA 1GTBA 3GKMA 3ZIJA 2NPBA 4FYUA 2B7JA 1A2JA 5CNWA 2JSZA 4KX4A 5B7CA 1EV4A 3L9SA 2VCVA 2REMA 1MD4A 2YJ7A 3A2VA 2WCIA 2PVOC 4I2UA 1PKZA 3W6GA 1AW9A 1Q4JA 4MJBA 1ZGNA 19GSA 2L4CA 4IELA 1T3BA 5J5NA 4ULXA 5H5SA 5AN1A 1FAAA 1OYJA 1NW2A 1XWKA 5CO3A 3TCOA 8GSSA 2FA8A 1BQ7A 3FY7A 4RI6A 4HQSA 2VUPA 7GSSA 2XPDA 5ELGA 2C3NA 17GSA 1GP1A 4XTSA 3BD2A 4XIHA 1ON4A 4IQAA 2HE3A 5ECRB 4D73B 1U3IA 3KH7A 1F3BA 5DAKB 2YPMA 5FT3A 1RK4A 4DSSB 4RQRA 3K8NA 4TR3A 4ZB8A 5F05A 1Q98A 3FZAA 3GTUB 2R4VA 4HEA2 3HKRA 1OC3A 4G9HA 2B5EA 2ZCTA 3MNGA 3VPTA 3R2QA 2XBQA 2YWNA 3CMIA 3RPPA 2YCDA 3WD6A 4J56E 3GH6A 2CV4A 4JR6A 1V9WA 2B6MA 2AUVA 2HRNA 4PUAA 3QAWA 1MDJA 3W8SA 5HR0A 5IPGA 2GGTA 3M0FA 1B4QA 1R5AA 1UVZA 1XCCA 2FWGA 2VLTA 1OKTA 2HRFA 2X8GA 2GSQA 3Q19A 2KLXA 4ECIA 4WF4A 4DEJA 4NV5A 5B8BA 3DYRA 1NSWA 2E0QA 1HYUA 1ZZYA 1KNGA 1K0DA 3L0HA 3UOMA 3IDVA 2CZ3A 2V6KA 3A3TA 1PX7A 3GX8A 1GSFA 4H86A 2R5GA 1FVKA 4IN0A 4PNFA 4LMWA 14GSA 2XBIA 1K0MA 3IR4A 3MDKA 1SYXA 4ZXGA 12GSA 1WMJA 2QC7A 2VL3A 3L78A 2AB6A 5CP1A 2A2SA 2CT6A 1EEJA 2VM2A 2H6YA 1Z3EA 1BX9A 1JLVA 3TB2A 4BPYA 3TJJA 1XVWA 2CX4A 3G7JA 1TTZA 3A2XA 3WGXA 3IK9A 3I6AA 1Z6MA 1SK0A 1XVQA 1YQ1A 2ES7A 4IGJA 2VL2A 5G1KA 4MF5A 4MA9A 2C0EA 4L5LA 1HD2A 4YAPA 3LJRA 4DSRA 3HDCA 4IBPA 2CVDA 4K7IA 2HLSA 1X5EA 3KCMA 1YEXA 2R6KA 3JCML 3GRXA 3MWHA 3GNJA 4PQ1A 1N8JA 2IJYA 5DJMA 2AHEA 3LWAA 2DJ2A 4KDYA 5F0GA 4F0CA 5DVBA 4GQFA 1ILOA 4K7NA 4WF5A 4WEYA 4YQVA 1KTEA 4AJ7A 2VAFA 4GSNA 4PQIA 5D9XA 1FVJA 4AJ6A 1DE1A 2IFQA 4IW9A 3ZIVA 1XZOA 1OC9B 3KM6A 3L4NA 3D4TA 2LTKA 1F37A 2PERA 3EE2A 3C8EA 1J9BA 3UMAA 3PGTA 5G31A 1BYEA 3WGEA 1C72A 1HNBA 2HSHA 3TJBA 1AQVA 1X9SB 2YANA 4JE1A 1YZXA 2GSTA 5E59A 3P2AA 4KCEA 1GH2A 4POMA 3KP8A 1B9XC 1VRSD 3J7Yk 4EDZA 3SWLA 1MTCA 1JHBA 2M72A 4V2NA 3BCKA 2NBSA 2KP2A 2L5OA 3D22A 4MLYA 1NM3A 1AXDA 3F4RA 4MP4A 3FZ5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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