2JU5A

Dsbh oxidoreductase
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
144
structure length
144
Chain Sequence
ARRRASGENLQQTRPIAAANLQWESYAEALEHSKQDHKPIGLFFTGSDWCMWCIKMQDQILQSSEFKHFAGVHLHMVEVDFPQKNHQPEEQRQKNQELKAQYKVTGFPELVFIDAEGKQLARMGFEPGGGAAYVSKVKSALKLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insight into Disulfide Bond Catalysis in Chlamydia from the Structure and Function of DsbH, a Novel Oxidoreductase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin Disulfide Isomerase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Chlamydophila pneumoniae
total genus 31
structure length 144
sequence length 144
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ju5A01
1VF2A 5ID2B 3GYKA 3QD9A 2HXKA 3I6AA 4JBBA 1U3AA 2RM5A 1GSSA 1K3LA 2CX3A 1TRWA 2VL3A 4NMUA 3FZ5A 5GAPD 1EGOA 4CW9A 2H01A 4N11A 4HI7A 3ME8A 1TXXA 3GN3A 1GTIA 4CHSA 4DSRA 4TR3A 1WRYA 6GSVA 5IQYA 2REMA 5IMFA 5CRDA 5J9BA 1F3AA 2VLTA 3BCIA 3ZMKA 1M9AA 1X9SB 1GUHA 1ML6A 5AN1A 1GULA 2LNSA 1PKZA 1DSBA 4ZBBA 1UC7A 4ZB8A 1KBNA 2FD3A 1YY7A 4PQHA 3FY7A 4BPYA 3VPTA 1WOUA 2VO4A 1DE1A 2L5OA 2OADA 5GZZB 3H93A 2H70A 4MH3A 1I9DA 1SKWB 1XBSA 3C73A 4QL9A 5J3RA 4TW5A 5C04A 4ZB9A 3UL3A 4L5OA 3ZFBA 1B4PA 2CV4A 5FWGA 3EMPA 1GSFA 3LYKA 1X9MB 3TRXA 1R7HA 4ECIA 2GSTA 1WP0A 4MJBA 3G9BA 3IAS2 4K0NA 2YJHA 1UA5A 1XWAA 1ERVA 2NTOA 1XW5A 1YKCA 1A2JA 4IJIA 2ZCTA 5JCWA 3FK8A 2DC5A 3HY2A 3LGCA 4PURA 2R3XA 2ZUPA 1LJRA 2TRCP 4GQCA 3GUSA 1WJKA 1HNBA 1OC9B 2DBCA 4ML1A 4AGSA 1ABAA 2YN1A 4AJ7A 3VFIA 4YQVA 1GSEA 1NHOA 1UN2A 3EYTA 4PUFC 4GSTA 2TRXA 2DIZA 2KP2A 5D9XA 2H8LA 1SK2A 2RLIA 2WRTA 4HUAA 5DCGA 2GVPA 1M2DA 5CNWA 4BVYA 1SENA 4KAEA 2HLSA 2YJ7A 1U6TA 5JCGA 1Z6NA 3F4SA 2CZ3A 3MDKA 1YKAA 2H0IA 4AF2A 3VWUA 3F9UA 2VLUA 5IMZA 1X9WB 4DVCA 4NHWA 4KSMA 3LXTA 3GL5A 1GP1A 1AQXA 1TI3A 2IFQB 3CRUA 2H6YA 1A2LA 4O32A 5ECIB 1O81A 1BG5A 1XOAA 4MJAA 2PVOC 5HQPA 2FNOA 3KM6A 3L9SA 4OO5A 2LKUA 4HJ2A 3QPMA 2R4VA 2MBSA 3KJYA 1VF3A 1RQMA 1SK1A 3J7Yb 3NOFA 3EU3A 4NV2A 4NV5A 2GT5A 5GSTA 2C0GA 1GSYA 5JCUA 2C0EA 3FR6A 3IPZA 5G5EA 3G7YA 2O85A 4IQ1A 3J7Yk 2LQQA 2LTKA 3U6VA 4MMMA 1HNAA 5HFKA 16GSA 3ZRDA 3LXZA 2OACA 3QFBC 1G7EA 1YJ6A 3DMLA 2HYXA 2I9HA 3Q74A 2GZPA 3O6TA 4GWRA 3EMXA 2YV7A 3APSA 2H0HA 2EIOA 4NWYA 5KN0A 3MAKA 2RUEA 3D4TA 1OE8A 1MDIA 3A3TA 2K8VA 4XS1A 4DSQA 2C3QA 3L0HA 5IM9A 3HJPA 2H73A 3D0ZA 2XBIA 1SU9A 1EEJA 3P90A 2FCHA 3R2QA 4IS0A 2LUSA 2HFDA 2LNTA 4N0ZA 5D9WA 2VOCA 3ZZXA 2FHEA 1DBYA 5F8BA 4DSSA 5ID2A 2ALBA 5IOXA 3UARA 1PMTA 2IMKA 4ZL7A 4WKWA 2DJKA 4HZ4A 4P3YB 12GSA 5HFGA 4EC0A 3RHCA 2HSYA 4MDCA 4WF4A 5A4UA 4GCIA 2WGRA 2RIIA 1YF0A 9GSSA 4LL1B 3ZLPA 2OBIA 3DVWA 1T1VA 3Q6OA 1T7PB 3RHBA 2C1YA 4KW6A 4LMVA 5DQYA 4I5QA 3RAZA 1F6MC 2PVQA 18GSA 2EC4A 4FYUA 3TKQA 5FHIA 2CVKA 5DAKB 3EE2A 4XTSA 3QR6A 5HFIA 1NW2A 2IIYA 4MZBA 3HYPA 4MLYA 2IMFA 1G6WA 1FO5A 2VM2A 3VWWA 3IHQA 3LSZA 3HD5A 5IMCA 2BMXA 1B4QA 4JR4A 4IHUA 3VURA 4KA0A 1EWXA 3A2WA 4ML6A 5G30A 4FYCA 4IBPA 1FG4A 1V57A 4Q5FA 2WCIA 3GKMA 5KN2A 1SYXA 2XC2A 1MD3A 1C72A 1V9WA 1XPVA 1J0FA 1TRSA 3MSZA 2JSZA 1X5DA 2HE3A 5ECNB 1K0AA 2VL2C 3H79A 5B7CA 4TOPA 4JR6A 3TDGA 1PL2A 2O89A 1MD4A 3GIXA 1U88A 1XOBA 3W6GA 1AAZA 1O85A 4KCEA 4ACSA 1ZGNA 1HNCA 4OFNA 2IJYA 2OE1A 2E2MA 2YOIA 2GDRA 1EOHA 3M9KA 2YZUA 1RK4A 4XS4B 4EL1A 5J4UA 2WJUA 3KIJA 1OKDA 3UBLA 1MTCA 1K0CA 5DJLA 4PUAA 1TTZA 5ELGA 3Q19A 3IR4A 1X5EA 4EVMA 2J23A 2JZRA 4MK3A 1OC9A 3UEMA 4IP1A 1XVQA 3WYWA 1R5AA 2OE0A 2B5EA 4L5LA 6GSSA 4N30A 1I5GA 4K7OA 5AISA 2V2GA 4KDXA 2FWGA 3F6DA 2AHEA 2CT6A 4ZL9A 4TXOA 3GHAA 4XCSA 5D9VA 2A4VA 3C71A 5D73A 3U5RE 3GV1A 3D21A 4K1FA 1TK5B 3QDNA 2B6MA 4RQXA 1OE7A 3C1RA 5B8AA 3ERFA 2GT6A 1JZRA 2IL3A 2DJ3A 1HYUA 2KOKA 4HS1A 2YWNA 2L57A 3VI5A 1O6JA 4MJCA 4POLA 1AQWA 5CAXA 1K3YA 5ENUA 2WFCA 1M0UA 2HRNA 4MH2A 4KDUA 3PINA 3WGDA 3IXRA 3GTUB 5HR0A 2PN8A 2H76A 3TJBA 5F05A 4F0BA 5CRWA 20GSA 4F03A 1M2AA 1BYEA 3AY8A 4OWYA 3F3RA 1XXUA 3W8SA 2IFQA 3UJ1A 4K2DA 4X43A 4NPBA 5IPGA 2K6VA 5ECQB 1PN9A 1SK0A 3IA1A 2X8CA 5G2ZA 2DIYA 13GSA 4IVFA 2IN3A 2C8UA 1XWKA 1K3OA 2VCQA 2GQLA 3FKFA 2D2ZA 1TW9A 1LBKA 4ID0A 1DE2A 3E0UA 1SD9A 4ZBAA 2HSHA 1GLQA 5CO3A 5JWOB 1B9YC 4TR4A 2B5YA 7GSSA 5IMAA 5DCHA 2FUG2 3H4KA 5CRGA 2VUPA 2HRFA 4EUYA 2RM6A 4POMA 2PGTA 3KD0A 3CTFA 2XHFA 1FB0A 1AIUA 3US3A 2VCXA 2H66A 4GF0A 4K9ZA 1GL8A 1F2EA 3TKSA 5C00A 4XHMA 4RQRA 1E6BA 2L4QA 3DWVA 1ZYQB 3UBKA 2BTOT 4G10A 1J9BA 3CYNA 1GNEA 1AC1A 2YV9A 2VCZA 1PX6A 2Z9SA 2XBQA 3UVTA 2C0DA 1BQ7A 5JWQB 2PU9C 2YP6A 1A0FA 1JLWA 3ERWA 2M72A 2H1BA 3RPNA 1GLPA 4YQUA 2H30A 8GSSA 3QOUA 4EDZA 4PX1A 1ERWA 1G0TA 4EDYA 4GQFA 1FVKA 4BL7A 1GTBA 3GNJA 1QUWA 5GSSA 3VLNA 5H5QA 5F0GA 4NXIA 2MYGA 3BJ5A 3H8QA 2LRCA 1T4YA 3TOUA 2F9SA 1KNGA 4WBRD 4TR1B 2B5XA 1FVJA 1VF4A 1YEXA 2F8AA 1XCCA 4NHZA 4EF0A 3GSSA 2CQ9A 1QK8A 1XW9A 2IMIA 3CSJA 3KTBA 2GZZA 5B6NA 1ST9A 4J2FA 3VPQA 1CQGA 2GQKA 3GRXA 5J9CA 4HU7A 4V2NA 1U3IA 1K0MA 2OA7A 4LL4B 4XIHA 4ZIJA 2VCWA 3H1NA 2CX4A 2FWEA 3L9UA 2H74A 2AV4A 5ECRB 4K7NA 5A5KA 2IMDA 2J9HA 2DMLA 1QFNA 1O8XA 1YDKA 3TJJA 2PERA 2F3MA 3RDWA 2H1AA 1WMJA 1WWJA 2ON5A 1QGVA 3F6FA 1CQHA 4WETA 1FW1A 4ECCA 4MPFA 1GUKA 2YZHA 2GTUA 3CMIA 2GS3A 3HZ4A 4L0WA 2MBTA 2JU5A 3G7JA 5A4WA 2YWIA 3I9V2 3IDVA 1IYIA 3IAM2 3DKSA 1Q4JA 2O87A 3TKSC 4HEA2 2V1MA 2WULA 2HZEB 1ZZYA 2X99A 2M80A 4ZILA 1TU8A 1SL2B 4IKHA 3GH9A 1PX7A 5J41A 1V40A 3FZ4A 2I4AA 4YH2A 2RUFA 3FR9A 5LCZA 5ELAA 3ED3A 3EURA 3ZMLA 5CP1A 4G9HA 4LLRA 2OKAA 4KNDA 5H5RA 3KMNA 1OKTA 2KP1A 1JLVA 2H6ZA 3HJMA 1NHYA 2X64A 2JZTA 4F0CA 2QGVA 3QAGA 3LG6A 2CA8A 5HR3A 1M9BA 2C0FA 3GTUA 4IW9A 4TXVA 4O7HA 2MMNA 1THXA 5ECMB 1ZYEA 1GSDA 4ECBA 2N5FA 2PBJA 3NIVA 4OFTA 5ECPB 4OMVA 5F06A 4XRDA 3SWLA 5D96A 2FWHA 1K0BA 4KUNA 4TRXA 3P7XA 3KXOA 3VK9A 1XWCA 2XPDA 1GTUA 5IO2A 3KEBA 1Z7PA 4TKYA 1M99A 2OJLA 1F3BA 5ECKB 2N5AA 3RPPA 1H75A 3M8NA 2LEGA 4IP6A 4AJ6A 4MP4A 3RBTA 1PD21 2C4JA 1T4ZA 2A2RA 4N0VA 3FZ9A 3EU4A 3O3TA 2L5LA 19GSA 2FGXA 4PNFA 1NM3A 1B48A 4Q5NA 3APQA 4MZWA 1GSUA 3JCML 3IBHA 1TRVA 2DJ2A 5G5FA 1Z9HA 2C80A 3WGEA 3F4RA 4BA7A 1XFLA 1BX9A 2GSSA 5E59A 2MZCA 1PGTA 3IK9A 2LRTA 1SL1B 3M9JA 4HZ2A 5L71A 2B7JA 1PQNA 3TJFA 2X8GA 2GSRA 1S3AA 1X0RA 1AUCA 3KGKA 3FRCA 2PUKC 1TRUA 2QKEA 3MWHA 2KLXA 3UOMA 2FY6A 4RI7A 2DJ0A 3KTLA 1GUMA 2BJXA 3ISOA 1UVZA 1SKSB 4LA1A 3D4MA 2GQMA 2JACA 4GLTA 2VM1A 5COHA 5HR2A 5B8BA 4WR5A 5EY6A 3M1GA 3ERGA 4O5RA 1OC3A 3CSIA 4I8BA 1JZWA 3QAWA 3GH6A 1O73A 2YCDA 1SD8A 3O76A 1M2BA 1S3DA 2AAWA 3CBUA 4IELA 4J57E 5DVBA 1WIKA 1N2AA 1Y6EA 4GSSA 4QQ7A 11GSA 3OR5A 4I2UA 4K6XA 3BCKA 2P31A 1PSQA 4MABA 3KP8A 5EVOA 2E2GA 2KUCA 1JZDA 4Q5QA 1A24A 2VIMA 1GNWA 3IC4A 4RI6A 2GLRA 4MF7A 2V6OA 3ZREA 3GA4A 5ABRA 4KDYA 4KX4A 3DRNA 1A8YA 2VD0A 3A5WA 1OVNA 4AJ8A 3GX0A 3FYGA 2JADA 3PH9A 3L9VA 3HCZA 3KZQA 1TK8B 4X0XA 1V2AA 4OFMA 4WR4A 3GSTA 2I3YA 5G31A 1X5CA 1W89A 1J08A 3TKRA 4ZB6A 3GKNA 3Q18A 5KN3A 1K0DA 2YWMA 1YZXA 4IQAA 1QXHA 1VRSD 5FT3A 1H4OA 1R4WA 3C1SA 1EEMA 3UAPA 2IPAA 1PKWA 4MCUA 3LQ7A 3F3QA 3F8UA 3WD6A 4WEYA 1G7OA 5LD0A 3FR3A 4MZCA 4E8HA 4IJ3A 1XIYA 1EZKA 2IMEA 1GRXA 4PQIA 2HZEA 4ECJA 1F37A 2H19A 2M46A 1HQOA 1U87A 3M0FA 4J56E 4DSSB 2OBKA 2V6KA 5DALB 2B1LA 1YEPA 5AIXA 3D6IA 1ZOFA 4D73B 4EO3A 1ACVA 3I43A 4RUVA 4DEJA 5CRHA 2AYTA 2LQOA 1ZMAA 3DYRA 4JE1A 1F9MA 1WE0A 5IOWA 3FW2A 1MDKA 4K8MA 4ZXGA 4L0UA 3ZL5A 3UIWA 2NBSA 2H0GA 4PXOA 2NPBA 3GL3A 1ZL9A 2L59A 4MPGA 4HDEA 4POBA 2O7KA 5J5NA 5AGYA 5G1LA 1AQVA 1TU7A 2VAFA 3V1WA 5D93A 3W8JA 2R6KA 1A2MA 3TJKA 4KE3A 2AUVA 1URMA 3LFLA 3P8WA 1R5PA 3MNGA 2V32A 3ZIVA 2AJQB 3F0IA 3D22A 1DUGA 2B3SA 2VCVA 3HVXA 4KSOA 3KH9A 22GSA 4YAPA 5AIVA 4JZQA 3VWXA 4YAVA 3VWVA 2I81A 1FOVA 1GTAA 3K8NA 1O8WA 2HI7A 3KP9A 5G1KA 1SJZA 2OE3A 4V1Ap 5IPHA 4HQSA 3N5OA 1ILOA 4MF6A 3TJGA 3C7MA 2VLVA 1A23A 2G2QA 4BWSA 3TCOA 2GSQA 5ECSA 3HKRA 1MEKA 3F4TA 4F2IA 4MA9A 1W4VA 5DAKA 1EV9A 4WXTA 2VCTA 5IMVA 1ERUA 5JWRB 4OD7A 5D9TA 2F51A 3APOA 2LRNA 2IWTA 4I97A 2O8VB 2C3TA 4KB3A 1XVWA 4TVEA 1JFUA 3P2AA 4OCEA 1Z5YE 3IOSA 4F9ZA 2MMAA 3DIEA 4NAXA 3WT1A 1QMVA 2G0FA 4OCFA 4HOJA 3ZTLA 3ZITA 1YQ1A 3D5JA 1FAAA 2DLXA 2P5QA 2QSIA 2XPEA 2CAIA 3SBCA 5B6MA 2EIQA 2VD1A 2E0QA 3DD3A 3DGQA 1SJIA 5INYA 4HJMA 1TDIA 2N5BA 2JSYA 2YNXA 3BBYA 1EGRA 2X8HA 1G6YA 2ES7A 3EWLA 4MJEA 4TXOB 3IK7A 2HZFA 1SYRA 2GGTA 2WS2A 2DJJA 6GSYA 3TRPA 3TUEA 4XRAA 1K0OA 4WBJA 1T00A 5IMDA 3HDCA 1RW1A 4ZL8A 3F63A 2R2JA 2WB9A 2JL4A 2V41A 3GFKA 4XS4A 1BEDA 4TN8A 2CAQA 2R5GA 17GSA 3CRTA 1Q98A 4G19A 2FWFA 1FB6A 4ZBDA 3HJOA 3QMXA 4PGTA 5EPFA 2H1GA 4V2LA 1OAZA 1PRXA 1V58A 1GH2A 2P0GA 3QFAC 1M7TA 3TKPA 3ZIJA 5DDLA 2LSTA 2FA4A 4JU5A 3TB2A 2KHPA 4TR0A 4FH8A 4XS6A 4EKZA 2AB6A 3GKKA 1GWCA 1AW9A 3GX8A 4G2EA 2LJRA 5KN1A 1FHEA 2VL9A 3IRAA 1S3CA 3ME7A 1IYHA 3UMAA 1XZOA 2VL2A 2L4CA 3DEXA 3CTGA 4GSNA 5A4VA 4YQMA 1O7UA 4ISDA 1XWGA 2PMTA 2H6XA 3KMOA 3M3MA 2NDOA 3QAVA 2DJ1A 2L6DA 5ECLB 2GZYA 5E4WA 2DSAA 1BAYA 1Z3EA 2MMOA 3FHKA 4V1Ag 1ERTA 6GSTA 2F8FA 3N9JA 3LJRA 1EP8A 5HR1A 5F07A 1YF1A 4K0GA 5DBQA 6GSWA 3TRQA 4KGIA 4H86A 3LEFA 3A2XA 4I6XA 3WT2A 5DALA 4D73A 4I2TA 3GKXA 5H5SA 2CZ2A 2K9FA 2DMMA 3VI7A 2H1DA 1R26A 4QL7A 1B9XC 2JZSA 3EVIA 1WPIA 2YWOA 2YANA 2CVDA 10GSA 2H72A 2TIRA 1N8JA 5ECHB 3LORA 4K7IA 4JEDA 2K18A 3WGXA 3FEUA 2B1KA 5KEJA 1SKRB 3HXSA 5IIZA 5D8IA 5ECOB 4FYBA 2HT9A 3EINA 2PWJA 1JZOA 3C8EA 3L4NA 5IO0A 1XWBA 2PPTA 5CYYA 3TKSE 3LYPA 1USBA 2L6CA 3G7IA 4N10A 6GSUA 1TOFA 3L78A 2K8SA 4ULXA 4Z7XA 3IV4A 4FO5A 1KTEA 5DQSA 3ZVJD 1KEBA 1MDJA 1TI1A 1Z6MA 4BWQA 1AXDA 1T3BA 3TGZA 1NSWA 3KH7A 3E9JB 4ILFA 3CXGA 2CVBA 3DVXA 5CREA 4CDOA 1VGLA 4O92A 1E2YA 4V2MA 3PGTA 4X1UA 3TOTA 3KCMA 4F82A 4FIWA 2YPMA 1SL0B 4E8EA 1PL1A 1EP7A 2LJAA 4EE0A 4Q5RA 1A0RP 3ZYWA 1V98A 4KCAA 4TR1A 3HHVA 3S9FA 3CSHA 5GAND 4GXZA 4L8EA 4WF5A 3IE3A 3A2VA 2H75A 1OYJA 1VF1A 3NZNA 2E7PA 3GURA 4IN0A 4HQZA 2FA8A 1TJDA 1OC8A 1XW6A 1Y25A 4PNGA 4MF5A 3HVSA 4HU9A 4LMWA 3BD2A 3HZ8A 4EXJA 4PQ1A 3PR8A 3HA9A 2WDUA 4JRRA 3DXBA 3UVHA 3ZVJA 3GMFA 1EOGA 2A2SA 4OO4A 2QC7A 3E3EA 3FZAA 3BOAA 1K0NA 1B8XA 1HD2A 2B7KA 2R37A 1EV4A 1TP9A 2I1UA 6GSXA 1QQ2A 3HVVA 3LWAA 1T8EB 2LV3A 14GSA 2EIRA 4GRFA 2LS5A 2ZNMA 2NVLA 1JHBA 5EL8A 2FLSA 1ZCPA 1TKDB 2LJKA 4POKA 4BVXA 4KH7A 2P5RA 4GTUA 3I69A 4IGJA 2ON7A 2WZ9A 1BJXA 1A8LA 1GSQA 5DJMA 2HNLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite