2JZS | Genus

Total Genus 31

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	31
sequence length	144
structure length	144
Chain Sequence	MVPHTLSTLKTADNRPASVYLKKDKPTLIKFWASWCPLCLSELGQTEKWAQDAKFSSANLITVASPGFLHEKKDGDFQKWYAGLNYPKLPVVTDNGGTIAQSLNISVYPSWALIGKDGDVQRIVKGSINEAQALALIRDPNADL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Solution structure and dynamics of the reduced and oxidized forms of the N-terminal domain of PilB from Neisseria meningitidis. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB
molecule tags	Electron transport
source organism	Neisseria meningitidis serogroup a
total genus	31
structure length	144
sequence length	144
ec nomenclature	ec 1.8.4.11: Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase.
pdb deposition date	2008-01-15

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	2jzsA00

2YOIA 2HSHA 1HD2A 2YWMA 2LTKA 2JZSA 3QAWA 2H1BA 3SWLA 2KLXA 3TGZA 3I69A 4X43A 4G10A 4L5LA 4ILFA 4ML6A 2CAQA 3CXGA 6GSSA 3IXRA 5ECIB 4BWSA 3A5WA 1T7PB 3FZ9A 4EDZA 1GSUA 4K7OA 3IAS2 4ZL9A 2DJ3A 4V1Ap 3VWXA 4GSTA 5F06A 4TVEA 2QC7A 1XWKA 5EL8A 1NSWA 1M2AA 4FYBA 4MF7A 4V2NA 4N30A 4IJIA 4WF4A 2GZZA 2NPBA 3CSIA 2EIOA 2FWHA 1XW9A 3GYKA 1A0RP 2VCZA 4DSQA 3KTBA 2B3SA 3LORA 4JZQA 2AB6A 2CZ3A 9GSSA 2VLTA 2K6VA 5IOWA 1B48A 2BTOT 1WOUA 1AW9A 1IYHA 2QKEA 3QFAC 4MZBA 1K0MA 4PNFA 2F8FA 3APOA 4J2FA 4TR4A 1C72A 3G7JA 1VF4A 3QR6A 1SKWB 3ZL5A 2A2SA 3P8WA 2L4CA 2OBIA 3ZIJA 2H6XA 2ON5A 2RM6A 1WIKA 3LGCA 1K3LA 2FA4A 3ZRDA 3ED3A 4TXOB 4XS4B 4LA1A 4ML1A 4RUVA 4NMUA 3BD2A 2PGTA 2VCQA 2VL3A 1S3DA 1UA5A 1Q98A 1Z6MA 5G1KA 4BL7A 4WR5A 1ST9A 5ECLB 1XW6A 2M46A 1PQNA 3VI5A 5IMDA 5DBQA 2C0GA 3DMLA 3DRNA 4JE1A 4HZ4A 1X5CA 2B5EA 2YP6A 3J7Yb 5IMCA 1M9AA 3FY7A 3HJPA 2AAWA 1THXA 5F8BA 1G6YA 4N0VA 1V40A 5HR3A 1TK8B 1FOVA 1GSFA 1DUGA 2HRNA 4ZBDA 3WT2A 1PD21 1F3BA 3TKPA 3N9JA 1YEPA 2DSAA 3US3A 5J4UA 2AYTA 4TRXA 4L0UA 5C04A 4XHMA 5GSSA 2LV3A 5DALB 4G19A 2ZUPA 4GLTA 3ZMLA 2J23A 1FO5A 2FWEA 2LQOA 4J57E 1AQXA 1XWCA 5B7CA 3EU4A 4X0XA 4G9HA 2REMA 5KN1A 3IA1A 4H86A 2GSSA 1MTCA 4K0NA 5ECNB 2O89A 4LL4B 4EO3A 1TK0B 2IIYA 2GQMA 1WWJA 3G7YA 1S3CA 4HU9A 2PWJA 2CX3A 2H01A 4ECIA 2V1MA 1QGVA 4LMWA 20GSA 5ECQB 2GDRA 2HT9A 2VL2C 4O92A 5KN2A 2OKAA 6GSUA 4HU7A 1GL8A 1XW5A 1BG5A 4ZILA 1GSEA 3ZVJA 3QDNA 1HNBA 1KTEA 4PURA 2N5BA 2HI7A 2ZCTA 2GQKA 2OE1A 4MZWA 3ZREA 5IIZA 1VRSD 1TDIA 6GSXA 1G7EA 4GQFA 1TRUA 1OE7A 3UIWA 4ECCA 4K6XA 5A4VA 2FCHA 6GSTA 2I3YA 2OE0A 4KAEA 3W8JA 1AAZA 4HEA2 1M99A 1O8WA 3HJMA 4PGTA 3EU3A 5JWOB 4WXTA 5LCZA 1KNGA 4IGJA 4OFTA 4MZCA 1TW9A 4N0ZA 2VD1A 3FYGA 5DQYA 1A24A 4XRAA 3G9BA 2VL9A 1U3AA 2WRTA 2LEGA 1YEXA 2O85A 3HD5A 2R4VA 2I9HA 2YWIA 4KDXA 4EVMA 2HSYA 2DIZA 5IMAA 4KDUA 3U5RE 4TW5A 4OD7A 5HR2A 2WZ9A 3IK7A 4XIHA 5CRHA 2EIQA 4G2EA 2GSQA 2FY6A 5IO0A 3MWHA 1HNCA 3EINA 3IPZA 2HZEB 4Q5RA 3D5JA 4CW9A 1OVNA 2MZCA 3W6GA 2VM2A 5JCGA 4RI7A 3ERFA 2VO4A 5CO3A 3GRXA 5FHIA 3GTUB 3C1RA 4TXOA 4XS4A 3DIEA 1OC8A 5JWQB 2DJKA 4KA0A 3LWAA 2P5RA 3ME8A 2L59A 1V98A 3A2VA 2ZNMA 2ON7A 4QQ7A 4TR3A 3RHCA 3TJBA 2QGVA 5IOXA 4EE0A 2GLRA 1PX6A 4ZL7A 3C1SA 4OWYA 3M0FA 3WT1A 4PUAA 1GH2A 5EPFA 2LJAA 1FHEA 2X99A 3ZFLA 2RUEA 1T4ZA 3L9SA 2PPTA 2L4QA 4I6XA 2KP2A 3RDWA 3WGDA 5LNKe 3RHBA 3DWVA 4K7NA 3HJOA 1QQ2A 3FEUA 2V32A 3HVXA 5DALA 2FLSA 5J41A 4HUAA 3FHKA 3IHQA 1T4YA 5GAND 1BJXA 1B4PA 1V57A 5AIVA 2VCWA 1SKRB 3GA4A 4HJ2A 1CQHA 3M8NA 4GWRA 14GSA 2C8UA 3OR5A 4RI6A 5FWGA 5B6NA 3KH7A 6GSYA 3GKNA 1BYEA 5CNWA 1TKDB 5INYA 3F0IA 1EOGA 1J9BA 1ZMAA 4KCAA 4YAVA 1J08A 2C4JA 3GMFA 1B9XC 5IMFA 2XHFA 4QL9A 1G6WA 3H8QA 2VCTA 3KCMA 3FKFA 1T1VA 2OBKA 1X5EA 1O7UA 4ECBA 5ECPB 4ZB9A 5A4UA 1XOBA 1M9BA 4KW6A 5E59A 2I1UA 2P0GA 3LSZA 3CSHA 4ACSA 1U87A 3GV1A 2VUPA 2L5LA 3FZ4A 5D73A 4MPFA 19GSA 2HRFA 4CHSA 2RUFA 2VOCA 1O81A 4ZIJA 3IOSA 1GSDA 1N2AA 2DJJA 1PL1A 1XWAA 3GH9A 4DSSB 2JSYA 3GX0A 2JZTA 2EIRA 4MK3A 10GSA 2H75A 4ZXGA 4N10A 2AUVA 2IFQB 1JZOA 4L5OA 3KZQA 4EC0A 4CDOA 2HE3A 4TN8A 1O85A 4Z7XA 5EVOA 4YQVA 4MJCA 4EL1A 1TRSA 2TRCP 5DAKB 1WPIA 3TDGA 1GUKA 2QSIA 3O3TA 1DBYA 3VWVA 1SJZA 4KH7A 2RM5A 2VLVA 3LXTA 2CAIA 3NOFA 1OKTA 1WJKA 4ZBAA 4IP1A 2LRTA 2G0FA 1X9WB 4FIWA 1MD4A 3D21A 3APQA 3H79A 5GZZB 2H0GA 3GL5A 1MD3A 2VCVA 2HZEA 2DMMA 3F4TA 4WEYA 3LEFA 3KP9A 1GP1A 2PUKC 1NHYA 1XZOA 4PX1A 4IQAA 2H1GA 3VURA 3FZAA 3GTUA 3KXOA 1PGTA 2C3TA 3I43A 4E8HA 1GLQA 3FR9A 1PRXA 3ZTLA 3HVVA 1NW2A 1XWBA 1FW1A 2H76A 2N5AA 12GSA 1TRVA 5ECHB 1OE8A 2PVOC 2X8GA 4F0CA 2YWNA 4OMVA 4GQCA 3W8SA 3TUEA 1OC3A 3TRPA 2IWTA 3GL3A 5IPGA 4KUNA 1TU7A 4IELA 1Z7RA 3EC3A 3C71A 7GSSA 3TJJA 1TTZA 2B5XA 1J0FA 1H4OA 4I2TA 3UARA 2LNSA 4EKZA 3G7IA 1PKWA 4KGIA 5ECOB 1RW1A 5G30A 1T3BA 4V2LA 3NIVA 1XCCA 1VF2A 3GX8A 1FVKA 2VIMA 3HA9A 1YQ1A 4GRFA 1TXXA 5HFKA 2FD3A 1Q4JA 2D2ZA 3EMXA 3Q19A 1XXUA 1DE2A 2JACA 2V6KA 3ZVJD 1SYRA 2NVLA 1BEDA 1GTUA 2R6KA 3IC4A 1ZOFA 3KP8A 1K0OA 2FNOA 4GSSA 1FAAA 2PERA 3TB2A 5ECRB 1QUWA 2J9HA 3D4MA 3F8UA 3VLNA 1BX9A 1AQVA 5ECSA 2MMAA 4V1Ag 2WCIA 2K9FA 1PN9A 1O6JA 5L71A 4GF0A 3WYWA 3VPTA 3GSTA 2LQQA 1G7OA 2F51A 5HFGA 2IN3A 4F0BA 4D73B 2FGXA 4K7IA 4KB3A 5CREA 2WS2A 4IW9A 4POKA 3QOUA 2P31A 3KMNA 1JFUA 5GSTA 1SYXA 1ILOA 5ID2B 2YN1A 1GSQA 3LFLA 1YF1A 4I97A 4IP6A 3TRXA 1OYJA 2DMLA 1KEBA 4LLRA 2XPEA 3D0ZA 5IO2A 4KDYA 1GTIA 4KCEA 2LUSA 3IV4A 4DSSA 4IHUA 2YV7A 1MEKA 4IBPA 3O76A 4OO4A 1M0UA 3MNGA 3LYPA 3CMIA 1EZKA 1EGRA 2WDUA 5GAPD 4F82A 2WJUA 3M9KA 18GSA 2IFQA 3P2AA 5ECMB 4NHZA 2OA7A 4DSRA 1XIYA 1I9DA 1EEJA 4JU5A 3ZFBA 2LSTA 5HFIA 3D4TA 1TJDA 1M2DA 2VM1A 1Z7PA 2LRCA 3GNJA 3LJRA 5DAKA 2DBCA 4MLYA 4Q5FA 1ZYEA 1MDJA 2TIRA 4JBBA 5ENUA 4MJEA 3VWWA 5H5QA 3Q6OA 3D22A 1VGLA 2E2MA 2IPAA 4MJBA 1R26A 1JZRA 2B5YA 3A2WA 3JCML 1HYUA 2LRNA 1YKCA 1ZCPA 3GH6A 3KM6A 2CVBA 3V1WA 2GT6A 4L8EA 1BAYA 2GVPA 5DJMA 3VI7A 1HNAA 3LYKA 2O7KA 2JZRA 1K0CA 2HZFA 3EWLA 2LKUA 4NXIA 2BJXA 2JADA 3RPPA 2JL4A 4PUFC 3GN3A 1YKAA 4NWYA 2B1LA 2A2RA 2E7PA 4XCSA 2C3NA 1PKZA 3I6AA 1EGOA 1UVZA 5AISA 3CRTA 2MMZA 4NPBA 3R2QA 3QPMA 1AQWA 3TOTA 4K1FA 4WR4A 5D96A 5HR1A 4ECJA 1SKSB 5B8BA 2PMTA 5DVBA 13GSA 2H8LA 1SJ6A 5JCWA 2P5QA 4TOPA 3VPQA 5IM9A 1GSYA 3AY8A 4YQUA 16GSA 4IKHA 4FO5A 3GKMA 5IPHA 1JHBA 1ERTA 3O6TA 2H74A 3IR4A 3IAM2 2DC5A 4I5QA 5F05A 3ZITA 5DDLA 1V58A 4TR1B 2FWGA 1K0AA 1X0RA 5D8IA 5F0GA 1HQOA 5D9XA 1U88A 4XS6A 4P3YB 3UL3A 4QL7A 2ALBA 1RQMA 2IMFA 4K2DA 1U3IA 2LS5A 3KMOA 2WB9A 1Z5YE 2H6YA 1LU4A 5AGYA 4BVYA 2LJKA 1WRYA 5KN0A 4ZB8A 5D93A 3KJYA 2CQ9A 4TR0A 3E3EA 3CSJA 4LMVA 4Q5QA 5J5NA 4BPYA 2KOKA 4FYCA 1AXDA 1USBA 2OACA 2XBIA 2R2JA 2H19A 4OFNA 1THOA 1EP8A 3WGXA 4BA7A 1Z3EA 3HKRA 1XOAA 5G31A 2AV4A 1R7HA 1SL1B 4OCFA 3ZYWA 1Y25A 3KD0A 1FB6A 1TOFA 1QFNA 3HXSA 4V2MA 4HS1A 2NBSA 1GTAA 4X1UA 4D73A 3L9VA 2VD0A 2V2GA 1T00A 3CBUA 5LD0A 2YANA 3CTGA 4XRDA 2CVKA 2A4VA 2B6MA 22GSA 1TI1A 3F63A 5HR0A 2L6DA 5ID2A 3F6DA 4ZL8A 1R4WA 4ID0A 2H0HA 5A5KA 2I81A 3HHVA 4JEDA 1TI3A 3KH9A 1ERUA 2C80A 4EDYA 5J9CA 1GUMA 4N11A 4MCUA 1K3OA 1A23A 5CRWA 3ME7A 3QAGA 2YZUA 3UEMA 4HQSA 3QD9A 3RAZA 2X8HA 2JU5A 3E0UA 4MF5A 2DJ0A 3ZIVA 4NV5A 4MA9A 1B9YC 4MH2A 2L6CA 3E9JB 3Q74A 4HQZA 5CP1A 2H1AA 1QMVA 1A8YA 4JRRA 4GTUA 3A2XA 1ML6A 2H0IA 2TRXA 4MJAA 3FW2A 2GSRA 3H4KA 3EE2A 5CAXA 4HI7A 1ZL9A 5CYYA 5G5EA 1B4QA 3VFIA 1A8LA 1XVWA 2WGRA 3UMAA 2IMDA 2XPDA 2C3QA 2VL2A 3IDVA 3CTFA 3EMPA 2H71A 3TJKA 1K0BA 4EXJA 4AJ8A 2M80A 2LNTA 3WD6A 2R5GA 4IN0A 5D9VA 4WBJA 2CZ2A 2O8VB 2RLIA 4RQRA 1SU9A 4F2IA 1M7TA 1GLPA 3VK9A 4K9ZA 2FHEA 1OC9B 3GKKA 1GWCA 4ZBBA 2L5OA 1S3AA 4NHWA 3LXZA 3TKSC 4MP4A 1ACVA 3UBLA 4ULXA 1M2BA 4J56E 3F4SA 4WBRD 2NTOA 3M1GA 2GZPA 2F8AA 1FB0A 2PBJA 2N5FA 3FR6A 1GRXA 2KP1A 4JR4A 3CYNA 3P90A 2V41A 5ECKB 4BVXA 2Z9SA 2K8VA 2HFDA 4POLA 5COHA 1A2MA 2X8CA 1A2LA 2WULA 2YCDA 4O7HA 5D9TA 4JR6A 3ZLPA 1VF1A 2DJ2A 3FR3A 5JCUA 3KIJA 3L78A 4I8BA 3HYPA 3WGEA 2IL3A 4TR1A 1YJ6A 5KEJA 1H75A 5B6MA 6GSVA 3UAPA 2DJ1A 4KNDA 2H73A 5JWRB 1ERWA 1I5GA 2H6ZA 2H66A 2XC2A 3U6VA 2IMEA 1WP0A 4NAXA 1LJRA 4FH8A 1IYIA 4E8EA 1UN2A 3HZ4A 4HOJA 1AIUA 3QFBC 1PX7A 2FUG2 1U6TA 5J9BA 2HNLA 1TK5B 3L0HA 3VWUA 1QK8A 1JLVA 4POMA 3ZZXA 3ZMKA 1V9WA 1R5AA 2I4AA 2HLSA 1K0DA 4MPGA 1X9SB 1F2EA 1YDKA 3TKQA 4DEJA 3FZ5A 2CT6A 2F9SA 2GS3A 2BMXA 3IBHA 2K18A 3L4NA 2OJLA 3DD3A 4TXVA 5DQSA 3EVIA 1O73A 1GNEA 2KUCA 4POBA 2WFCA 4YQMA 2AHEA 5G1LA 2JSZA 3F4RA 3EURA 1EEMA 4O32A 1ON4A 4BWQA 3MDKA 1SL0B 1SENA 1F6MC 1W89A 4K0GA 1PSQA 3LQ7A 3UBKA 4KSOA 3PH9A 1ABAA 3UJ1A 2OADA 1DSBA 4O5RA 5H5SA 2MMNA 3GHAA 3TJFA 2K8SA 1Y6EA 3EYTA 2YJHA 3ERGA 1DE1A 3TRQA 3I9V2 3GUSA 1AUCA 5IMZA 3J7Yk 2CX4A 1TP9A 4IQ1A 4HZ2A 3PINA 1UC7A 4GXZA 1URMA 5ABRA 1X5DA 3BJ5A 3GKXA 4MDCA 1F37A 5F07A 3UVHA 2DLXA 3QAVA 2V6OA 3IK9A 4AJ7A 2R3XA 4WKWA 1WMJA 1W4VA 1Z6NA 3DYRA 5H5RA 3F3RA 2GZYA 2LJRA 1SL2B 3H1NA 3BOAA 4I2UA 2HXKA 4GSNA 2GQLA 3GIXA 4YAPA 1YY7A 2MMOA 3P7XA 3HY2A 3HCZA 4OCEA 1XFLA 2VCXA 2EC4A 4AJ6A 3Q18A 4MH3A 1F3AA 3HZ8A 2L57A 3FK8A 1XPVA 1QXHA 3BCKA 1EWXA 1OC9A 1K3YA 1N8JA 3D6IA 4RQXA 2O87A 1E2YA 5A4WA 2XBQA 3TKSE 3DXBA 2C0FA 3FRCA 1R5PA 1MDIA 4TKYA 1E6BA 3TOUA 3S9FA 1YF0A 2GSTA 3TJGA 4FYUA 3KTLA 4HJMA 1TRWA 3GSSA 4AGSA 11GSA 3HDCA 2YJ7A 4GCIA 3GFKA 3APSA 5DCHA 2R37A 1NHOA 1XBSA 2IMIA 4MF6A 5D9WA 5G2ZA 2YV9A 2H30A 5EY6A 4NV2A 2OE3A 2CVDA 1ZGNA 2MYGA 3TKRA 3HVSA 1JZWA 5B8AA 2FWFA 1VF3A 1KBNA 3LG6A 1F9MA 1EOHA 5CRDA 1A2JA 1SK1A 2B7JA 1Z9HA 4KE3A 3F3QA 4KSMA 2GGTA 2YPMA 1MDKA 2E2GA 3ERWA 5G5FA 1O8XA 1XWGA 1WE0A 3DVXA 2M72A 2PU9C 4HDEA 5CRGA 2CA8A 3TKSA 1EV4A 4L0WA 4XTSA 3QMXA 1K0NA 4OFMA 1ERVA 1NM3A 3IE3A 17GSA 1BQ7A 2X64A 4XS1A 3N5OA 6GSWA 3PGTA 1B8XA 2B7KA 2F3MA 2B1KA 1PA3A 3C73A 4PQ1A 3MSZA 1G0TA 4WF5A 1X9MB 2KHPA 2PN8A 2G2QA 4IS0A 2H70A 1JLWA 2DIYA 1GSSA 3PR8A 3IRAA 5ELAA 4EUYA 4YH2A 1GULA 1RK4A 3K8NA 3ISOA 4ISDA 4MABA 3C7MA 5IMVA 2GTUA 5FT3A 3GURA 3SBCA 1PMTA 2IMKA 1SJIA 4IJ3A 1ZZYA 2NDOA 4AF2A 2E0QA 3M9JA 4PXOA 1CQGA 3BCIA 4DVCA 4MMMA 3C8EA 1OAZA 1SK2A 1GNWA 3NZNA 1ZYQB 3UVTA 2FA8A 1T8EB 5AIXA 2RIIA 1OKDA 3DKSA 1FVJA 1XVQA 1GTBA 3DVWA 1TU8A 2AJQB 3DGQA 3BBYA 4PNGA 2VLUA 3UOMA 2CV4A 4F03A 2MBTA 5AN1A 3M3MA 4KX4A 2MBSA 1JZDA 1GUHA 4WETA 4PQIA 2YZHA 1LBKA 2YWOA 2ES7A 1SK0A 2HYXA 1YZXA 4PQHA 3RPNA 1A0FA 3QCPA 4OO5A 3KGKA 4ZB6A 2C1YA 3H93A 1FG4A 5C00A 2YNXA 1PL2A 3TCOA 5ELGA 1SD9A 5E4WA 5DJLA 1V2AA 2GT5A 3DEXA 3RBTA 4LL1B 2IJYA 1EP7A 3A3TA 2PVQA 4F9ZA 4IVFA 4Q5NA 5J3RA 5HQPA 3L9UA 2H72A 3KEBA 2H1DA 3MAKA 2C0DA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2JZSA

Total Genus

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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