2JZSA

Solution structure of the reduced form of the n-terminal domain of pilb from n. meningitidis.
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
144
structure length
144
Chain Sequence
MVPHTLSTLKTADNRPASVYLKKDKPTLIKFWASWCPLCLSELGQTEKWAQDAKFSSANLITVASPGFLHEKKDGDFQKWYAGLNYPKLPVVTDNGGTIAQSLNISVYPSWALIGKDGDVQRIVKGSINEAQALALIRDPNADL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure and dynamics of the reduced and oxidized forms of the N-terminal domain of PilB from Neisseria meningitidis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB
molecule tags Electron transport
source organism Neisseria meningitidis serogroup a
total genus 31
structure length 144
sequence length 144
ec nomenclature ec 1.8.4.11: Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase.
pdb deposition date 2008-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2jzsA00
3ED3A 3ZREA 2C0FA 5CRGA 5DALA 2DJJA 3BCKA 3QDNA 4N30A 2YWMA 5D73A 2GGTA 2FA4A 1VRSD 2DIZA 4BVXA 3TUEA 3LG6A 3CSJA 3C1RA 2GZZA 4LMWA 3HJMA 3EU4A 1TDIA 1TU7A 3J7Yk 2JSZA 4NAXA 1GWCA 1OC9A 5IMFA 3APQA 11GSA 5IMCA 1CQHA 1JZRA 2ON5A 3M0FA 2VAFA 2ALBA 1EP8A 2KHPA 1TKDB 4MF6A 4P3YB 3QFBC 3WT2A 2WULA 2XPEA 4GF0A 4OFMA 3DIEA 1A2JA 3KH9A 3C73A 5F05A 1SL1B 2F9SA 1S3CA 3F0IA 4PX1A 3EC3A 1V98A 1NHYA 3DD3A 4TR4A 3LSZA 1FB0A 4I8BA 1M0UA 2FD3A 3GSTA 3ZIVA 2R37A 1PL2A 1TK5B 2CX4A 3TRPA 2X8GA 3EYTA 3WT1A 4ZB6A 2X8CA 4GSTA 2YNXA 5LNKe 1O73A 6GSWA 4MLYA 1PQNA 5LCZA 1XW5A 1Z7PA 5J9CA 3LXZA 4ZILA 4V2LA 3IRAA 2B7JA 1WJKA 4D73A 4KA0A 3KMOA 1M9BA 3IOSA 3G7JA 3FY7A 3ME8A 3VI5A 2L6CA 2XBIA 1SKRB 3F4SA 1TI3A 3BJ5A 2HT9A 1TRSA 4ID0A 4F82A 2YPMA 1X5EA 1EGOA 3IK9A 1PN9A 2LTKA 4X1UA 4ZL8A 2M80A 4ML1A 9GSSA 5ELAA 3QOUA 1F6MC 4HQZA 3BD2A 3D21A 5ECHB 4KE3A 4ECJA 5CNWA 1M99A 1VF3A 2G2QA 3GKXA 4IHUA 2FGXA 4I2UA 3VLNA 2WDUA 1GNWA 1YY7A 1M2BA 4HZ4A 5DAKA 4KGIA 4MABA 4WR5A 3M3MA 4L0UA 5ID2A 1B9XC 2FLSA 4KW6A 3GRXA 5IIZA 5ABRA 2TRXA 1AQXA 1S3AA 1SK2A 1PL1A 3Q74A 1O8XA 4ULXA 1OKDA 4LL4B 2QKEA 4YAVA 3FEUA 3N9JA 1WP0A 5G30A 1A2LA 2I4AA 1O85A 2B6MA 5IM9A 1PA3A 3EINA 2MYGA 1BG5A 3GA4A 3HZ8A 4Q5FA 1TU8A 5CRDA 5HFKA 4KDYA 4ILFA 4HZ2A 2IN3A 3CTFA 2REMA 4EVMA 1YDKA 5DQYA 4GRFA 3J7Yb 1GSDA 1PD21 4ZBAA 3JCML 1TTZA 2RM5A 2IMKA 2FWFA 2HLSA 4HDEA 4J2FA 2GQKA 4EDYA 12GSA 1K0OA 2GVPA 1KBNA 5DQSA 4POLA 3VFIA 2N5BA 5J3RA 1FOVA 3KH7A 4D73B 3RDWA 4NV2A 1TP9A 3GH6A 2JU5A 3H1NA 2AJQB 3IC4A 2CAIA 3G7IA 3FZ9A 5DCHA 1GH2A 1DE2A 1XVQA 2WGRA 2IPAA 1SK0A 3E0UA 4YAPA 3L9SA 4FYCA 1LBKA 2HFDA 3GX0A 5GZZB 2NVLA 6GSYA 1HQOA 2OADA 2OE3A 3VPQA 5GAPD 5IMDA 2R3XA 2N5FA 3GFKA 5EY6A 3VPTA 3BBYA 1PRXA 4K2DA 2RM6A 1UA5A 3GYKA 1HNAA 3M9JA 5ECPB 2IWTA 5F07A 3FRCA 2C0GA 3IBHA 4K0NA 2IMDA 2YWOA 1K0DA 3LEFA 2H1DA 2B1KA 2HZEA 2V6KA 2I9HA 5B6NA 5KN0A 2H66A 5A4UA 4FO5A 5ECQB 3QCPA 2GTUA 3F4RA 1TW9A 3IE3A 5H5QA 4TXOA 1M2DA 3DKSA 2K6VA 4JE1A 4MJEA 4IKHA 2VCTA 3W8SA 1WMJA 5G5EA 5KEJA 1QXHA 2C8UA 2VLUA 2HNLA 22GSA 1ZGNA 1PGTA 1ZYQB 2VLTA 1JZWA 3VURA 3QFAC 2GSRA 2HYXA 4LMVA 2DJKA 4K9ZA 1VGLA 4WETA 3VWUA 1K0NA 10GSA 2OACA 4XCSA 4XRDA 4F0CA 4KSOA 1X5CA 2OBIA 2IMEA 5ECOB 3GV1A 3GUSA 1QGVA 5AGYA 2V41A 1GSEA 1XWBA 2XBQA 4PQHA 5AN1A 2IL3A 4L5OA 4EXJA 4RQRA 1AUCA 2C1YA 1SKWB 3F4TA 3A2VA 4XS4B 1F2EA 4FYBA 4IBPA 4CW9A 5D9VA 5H5RA 2XC2A 4N0ZA 1KNGA 2VCZA 1ERVA 5CAXA 3EU3A 2CVKA 4GXZA 3RHBA 4HQSA 4GQFA 3CRTA 3HVSA 4OFTA 3C7MA 4FH8A 3LYKA 2KLXA 1B8XA 3CXGA 3DGQA 1X0RA 1XWAA 4JBBA 1GUKA 5LD0A 2JZSA 3PR8A 2JSYA 3UBKA 1VF2A 1ZOFA 5DCGA 4IQ1A 2HRNA 1EEMA 3LFLA 1SENA 4JEDA 4IELA 1TOFA 3GSSA 5JCGA 2I3YA 3L9UA 2AB6A 1TJDA 1SL0B 3PGTA 1TRUA 2PPTA 1XBSA 4MPFA 3QD9A 3F3QA 2MBTA 4I2TA 1HNCA 4NHZA 3ZFBA 5G2ZA 3HKRA 3DEXA 4I6XA 4AJ7A 4MJCA 3HZ4A 3FR3A 5IOXA 5ECMB 3L9VA 2WRTA 2B5EA 1K0CA 6GSXA 3DYRA 4TXVA 1ILOA 4OO4A 2D2ZA 2YV9A 3GKKA 8GSSA 1WOUA 1A2MA 2R5GA 1ZL9A 3I9V2 2OJLA 1Z3EA 3MNGA 2K18A 4O92A 4I5QA 2V32A 4MJBA 4PQIA 3GL5A 1K0BA 4BVYA 2BJXA 4FYUA 3P8WA 4IVFA 1SJZA 4ECCA 4F2IA 2VCVA 4AF2A 3M9KA 2LUSA 2X99A 1JLWA 1H4OA 2GSTA 3V1WA 3WGXA 2H30A 1YF1A 5G1LA 4YH2A 3S9FA 1T00A 1YZXA 4WR4A 1KTEA 5HQPA 3TKPA 5IOWA 1R5AA 5FT3A 4TOPA 1KEBA 3KEBA 2VL2C 3UJ1A 5D9TA 3H79A 4ZIJA 1Z9HA 1JFUA 1XOBA 3QPMA 4V2NA 3A5WA 4MCUA 4OD7A 2MMOA 5DDLA 3TB2A 4RUVA 1FHEA 2FCHA 3UAPA 3KJYA 1O8WA 3C1SA 4E8EA 2NTOA 4E8HA 1OE7A 1HYUA 4PNGA 4KH7A 3GKNA 1JZOA 4HU7A 1A24A 2H74A 4ACSA 3TJJA 1FVKA 1GSFA 4GTUA 1Y25A 2RUFA 1QUWA 1R4WA 5ECRB 2DJ0A 4WKWA 2DLXA 4GQCA 4ZB8A 3C71A 1SYXA 3LGCA 3TJGA 5HFIA 2AV4A 5IO0A 3CBUA 5CREA 1YKAA 3IV4A 3HD5A 3SWLA 3UOMA 4Q5QA 5D93A 2DSAA 1GSYA 5EPFA 2H1GA 1EWXA 2VD1A 4MJAA 2KP1A 19GSA 4HUAA 4V1Ap 1TI1A 3FR9A 1XXUA 3WGDA 1SJIA 2JADA 4N0VA 2VCWA 3EE2A 1GLQA 3Q18A 2YJHA 5J9BA 5F0GA 5D9WA 4XIHA 3D4TA 4KX4A 2MMAA 4HJ2A 4MZBA 4HOJA 2LQQA 7GSSA 5H5SA 1X9MB 2L57A 2X8HA 5JWQB 1QFNA 4QL7A 1J9BA 3F6FA 3K8NA 1SJ6A 2YP6A 2IFQB 2VD0A 1SL2B 1USBA 3WD6A 2EC4A 2P5QA 3IAS2 4XS1A 5AIVA 2GS3A 2LSTA 3GH9A 5IMAA 5JWRB 2P0GA 3TJFA 2O89A 3HY2A 5JCWA 2L5LA 4TR1B 4L5LA 2HSYA 2FY6A 4WBJA 3MSZA 3GURA 3HVVA 5B7CA 1VF1A 2VOCA 2EIOA 4ZBBA 4WF5A 4G2EA 2IJYA 4J56E 3DXBA 3TRQA 4JR6A 5JCUA 3TDGA 1XOAA 3HXSA 1SYRA 1GSSA 1YKCA 1THOA 3RPPA 2R4VA 5C04A 3LORA 2B1LA 4IQAA 3LQ7A 2ES7A 3TRXA 5B8BA 4OO5A 1X5DA 3L78A 4DSSB 1THXA 2C80A 3D0ZA 3FZ5A 5A4VA 1EGRA 3VWWA 5DBQA 3W6GA 4TW5A 4JR4A 4QL9A 3CYNA 4N10A 4LA1A 1B4PA 2N5AA 3EMXA 4EL1A 2MMNA 1EZKA 1N8JA 1OE8A 1W89A 4AJ6A 2NBSA 2CA8A 4JU5A 2E7PA 1X9WB 2LNTA 2WCIA 1T3BA 1TXXA 3GX8A 4WEYA 1K0AA 3DRNA 14GSA 2F51A 3DVWA 4DVCA 1ERUA 4ZB9A 1XVWA 1PKWA 1XW9A 3FZAA 2YZUA 4POMA 2WJUA 3QMXA 3G9BA 1PSQA 1UVZA 2DJ3A 3QAGA 4ZXGA 2L5OA 1G0TA 3D22A 4K8MA 2AAWA 2CQ9A 4XS4A 1U3AA 2KOKA 4POKA 4DSQA 2YWNA 2V2GA 2PGTA 1WE0A 1DUGA 3TOUA 5GAND 4MPGA 1RW1A 5CO3A 4BA7A 3EVIA 3ZVJD 1YJ6A 2PERA 3KZQA 1A23A 3O3TA 2J23A 1U3IA 5CYYA 5J41A 1RK4A 1M2AA 2L59A 2LRTA 5GSSA 3ZMLA 1I9DA 1F3AA 5JWOB 4XTSA 3F6DA 1E6BA 1MTCA 4BWSA 5G31A 1PMTA 2H0HA 4KCEA 2AYTA 2HXKA 4NMUA 3ERFA 3IHQA 5A4WA 1GTUA 2Z9SA 1A0RP 1PX7A 1EP7A 2WS2A 2PVOC 1V2AA 1OVNA 4GLTA 2LRNA 3DVXA 3F8UA 3H4KA 4XS6A 1TRWA 4POBA 3ZL5A 2G0FA 5D96A 1HNBA 3KP8A 3P90A 1F9MA 1LJRA 4EKZA 3IAM2 6GSVA 4ECIA 4AGSA 2B5XA 3EWLA 5G5FA 4CHSA 3ZMKA 2F8FA 3KIJA 2DC5A 5ENUA 3U6VA 2E2GA 1WPIA 2V6OA 3VI7A 3M1GA 3CTGA 4AJ8A 4MK3A 1SD8A 2H1AA 2LEGA 4K7NA 1SU9A 4YQVA 4RQXA 4OCEA 5HR3A 3DMLA 2VL9A 5ECKB 1IYHA 2J9HA 2H0GA 1G7EA 4IGJA 3IA1A 2H1BA 1XZOA 5IPGA 3SBCA 3TGZA 1O6JA 2VM2A 4MA9A 2VIMA 3ZITA 4IS0A 4BWQA 3D5JA 3KXOA 3CRUA 1AQWA 3A3TA 3ISOA 1ST9A 4QQ7A 2AUVA 4RI7A 4HU9A 2MZCA 5HR2A 3P2AA 2F8AA 2FUG2 3QAVA 1GL8A 3HDCA 1AQVA 3EURA 2CZ3A 3GKMA 3D6IA 5F8BA 4KAEA 3NOFA 4MH3A 1ZZYA 1Z6NA 1T8EB 2QC7A 3HCZA 2GT6A 5CRHA 2OKAA 1GTIA 1FO5A 1G6WA 13GSA 3KCMA 2IIYA 3W8JA 2IMFA 3APSA 3E3EA 1MD4A 2WFCA 4ZBDA 1Y6EA 1Z6MA 3Q19A 3IPZA 3IDVA 1I5GA 2ZNMA 2DIYA 2VLVA 1XWGA 1QK8A 1XPVA 3UL3A 4K7OA 5B8AA 2WZ9A 1ON4A 1MDKA 5IO2A 2RIIA 4GCIA 3KM6A 2C3TA 1T4ZA 1WRYA 4BPYA 18GSA 1FG4A 1T4YA 3KD0A 1WIKA 1W4VA 2E2MA 5IQYA 2LJRA 3KTBA 3TOTA 2VM1A 3F63A 2VO4A 2ON7A 2E0QA 4TRXA 3GN3A 3CSHA 3UEMA 4JZQA 1BYEA 2GSQA 3U5RE 1U88A 3LYPA 2IFQA 3GNJA 3GTUA 4L8EA 1V9WA 16GSA 4TR3A 2C0EA 1GLPA 3NIVA 2I81A 6GSUA 5F06A 1FB6A 2R2JA 4FIWA 1ML6A 2GSSA 5ECNB 1ABAA 2H8LA 1CQGA 4TR1A 1YF0A 2LJKA 2OA7A 1MDJA 1GTBA 1XWCA 3FKFA 2H70A 1IYIA 4G10A 1A0FA 5ECSA 5IPHA 2NDOA 2K8VA 4MDCA 2WB9A 1B4QA 4K7IA 1K0MA 5E59A 2YV7A 4V1Ag 1WWJA 1K3OA 3HVXA 2A2SA 3VK9A 3O6TA 4L0WA 4CDOA 1GULA 3TKSA 3PH9A 4PURA 1R5PA 3M8NA 2EIRA 3KP9A 4IP6A 3TCOA 3KGKA 1G7OA 3D4MA 1HD2A 1ZMAA 1OC3A 1FW1A 4DSSA 3IXRA 2VCXA 4OWYA 5GSTA 4XHMA 4MMMA 4PQ1A 1C72A 4MH2A 1U87A 1H75A 1AC1A 5DJMA 2PUKC 5KN1A 2OE0A 3RAZA 4N11A 2C0DA 1OKTA 5C00A 3A2XA 2BMXA 4KCAA 1V58A 5D8IA 4HS1A 2L4QA 3WYWA 4ZL7A 1NHOA 5ECIB 1ZYEA 2DBCA 4MF5A 4MZCA 6GSTA 1J08A 2VL2A 3ZRDA 4F9ZA 3C8EA 4HI7A 5J4UA 4IN0A 2GZPA 3MWHA 5IMVA 2LNSA 3UBLA 3RBTA 4XRAA 1LU4A 1DE1A 4J57E 1TRVA 2YANA 3UMAA 2H75A 3H93A 4K0GA 4IW9A 5A5KA 4NV5A 4G19A 3ZLPA 3ZFLA 3FYGA 4KB3A 4OFNA 4YQUA 1U6TA 3GTUB 4EE0A 3F3RA 1FAAA 2F3MA 2HZFA 3L0HA 4EF0A 5INYA 1YEXA 3I6AA 3VWVA 4GSNA 4NWYA 1EEJA 4KSMA 1GTAA 2K9FA 5CP1A 4Q5NA 2C4JA 5CRWA 1R26A 2GQLA 5COHA 3ZIJA 3NZNA 4OCFA 4ECBA 3ZTLA 2CV4A 5DALB 1XWKA 4RI6A 1GUHA 3HA9A 1EOGA 2L4CA 20GSA 3EMPA 6GSSA 1URMA 3QAWA 3H8QA 2O87A 4O32A 2H19A 2B7KA 1V57A 2TIRA 4X43A 2I1UA 2KP2A 2JZTA 3TJKA 4KUNA 4PUFC 2QSIA 3FR6A 1OC9B 2LKUA 1T1VA 2XPDA 3ZZXA 1T7PB 2C3QA 2DJ1A 2FHEA 5KN3A 1ERTA 3F9UA 2LS5A 2C3NA 4EUYA 3ZVJA 1TK8B 2H01A 3N5OA 5G1KA 2NPBA 3TKQA 2XHFA 1MD3A 5DVBA 2FWHA 4H86A 1YQ1A 4MZWA 2YWIA 3ZYWA 2LV3A 2GQMA 1SK1A 1OC8A 3MAKA 1O81A 2GT5A 2JACA 4KNDA 1M7TA 5FWGA 1A8YA 3HJPA 2DMMA 2H6YA 2V1MA 1K3YA 3RPNA 2MMZA 1V40A 3FHKA 2HE3A 4Q5RA 1K3LA 1GSUA 4GSSA 2CAQA 2YCDA 3BCIA 2GZYA 1GSQA 4JRRA 2H76A 4PNFA 2YJ7A 3L4NA 1M9AA 1MDIA 1EOHA 1Q4JA 1JHBA 2IMIA 2TRCP 1BX9A 5KN2A 17GSA 1SKSB 2CZ2A 3UVHA 1AAZA 2VUPA 4NXIA 5E4WA 2CVDA 4TR0A 1QMVA 2B5YA 2OBKA 1J0FA 2RUEA 1NSWA 3IK7A 2H71A 5IMZA 1ERWA 1F37A 4OMVA 3CMIA 2M46A 5B6MA 1JLVA 1XW6A 4DSRA 2PBJA 4KDUA 1QQ2A 1B48A 1RQMA 4EC0A 3VWXA 2L6DA 2AHEA 3GL3A 4X0XA 5DAKB 1AXDA 2O8VB 3FW2A 5ID2B 3RHCA 4NPBA 1EV9A 2H72A 2LRCA 3LWAA 1AIUA 4NHWA 3QR6A 3E9JB 2LJAA 3GMFA 4LL1B 1EV4A 5EL8A 5AIXA 1GUMA 5HR1A 4LLRA 1MEKA 2O7KA 2PMTA 1UC7A 1A8LA 3FZ4A 2DJ2A 1FVJA 2MBSA 3O76A 4HEA2 2FWGA 1VF4A 2JZRA 3KMNA 4F0BA 3WGEA 2CVBA 2R6KA 2CT6A 2ZUPA 4BL7A 2O85A 3HYPA 3TJBA 1XFLA 2YZHA 3HJOA 4TKYA 3AY8A 2A4VA 3HHVA 1OAZA 5HR0A 4KDXA 1OYJA 1TK0B 3I69A 3ERWA 2ZCTA 3LJRA 2PN8A 3P7XA 4IP1A 3ME7A 4PGTA 4EO3A 2H0IA 1XCCA 2M72A 4PUAA 1SD9A 1BEDA 1Z5YE 2H6XA 3GIXA 1ACVA 3Q6OA 1XIYA 3US3A 1X9SB 2LQOA 1PKZA 2PU9C 3I43A 2FA8A 2HRFA 5J5NA 3G7YA 1F3BA 2VL3A 3A2WA 3UVTA 2KUCA 2BTOT 4EDZA 2GDRA 2FWEA 2K8SA 2B3SA 3IR4A 1YEPA 3APOA 5D9XA 2QGVA 2RLIA 2X64A 1DBYA 4TVEA 4HJMA 2P5RA 3R2QA 2EIQA 2PVQA 2VCQA 4WF4A 3CSIA 5ELGA 2FNOA 4I97A 1GP1A 4K6XA 4DEJA 2H73A 1S3DA 2P31A 4ISDA 2DMLA 3MDKA 4O5RA 1G6YA 3FK8A 2HSHA 1N2AA 4V2MA 2OE1A 1UN2A 2HZEB 4MF7A 5ECLB 3ERGA 3PINA 1ZCPA 4G9HA 4O7HA 1B9YC 3GHAA 4K1FA 2A2RA 4TXOB 1NM3A 2YOIA 4GWRA 4ML6A 2PWJA 5AISA 2JL4A 1O7UA 1JZDA 1E2YA 4ZL9A 4MP4A 1BQ7A 5DJLA 3TKSE 3OR5A 4WBRD 3TKSC 3UIWA 2YN1A 5L71A 5FHIA 1NW2A 5EVOA 1GNEA 2GLRA 4Z7XA 1Z7RA 3DWVA 4F03A 1BAYA 4WXTA 1BJXA 1PX6A 4YQMA 1Q98A 1R7HA 3UARA 3LXTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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