2JZSA

Solution structure of the reduced form of the n-terminal domain of pilb from n. meningitidis.
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
144
structure length
144
Chain Sequence
MVPHTLSTLKTADNRPASVYLKKDKPTLIKFWASWCPLCLSELGQTEKWAQDAKFSSANLITVASPGFLHEKKDGDFQKWYAGLNYPKLPVVTDNGGTIAQSLNISVYPSWALIGKDGDVQRIVKGSINEAQALALIRDPNADL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure and dynamics of the reduced and oxidized forms of the N-terminal domain of PilB from Neisseria meningitidis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB
molecule tags Electron transport
source organism Neisseria meningitidis serogroup a
total genus 31
structure length 144
sequence length 144
ec nomenclature ec 1.8.4.11: Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase.
pdb deposition date 2008-01-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2jzsA00
3TJFA 4TXVA 8GSSA 2H6ZA 4XHMA 3HA9A 3QPMA 5ID2B 3F6FA 4MH2A 3FZAA 1UC7A 3QR6A 1JZWA 4QL7A 5DVBA 3ED3A 1GWCA 1M7TA 2M46A 1A2JA 4MF7A 2FGXA 2OBKA 3HY2A 3DMLA 5D9XA 3CYNA 1K0OA 3HCZA 3I69A 1AIUA 2NPBA 1GL8A 1QXHA 3QFAC 2FWGA 6GSTA 1VF4A 2OE0A 1T4YA 2FWFA 2LQOA 5ELGA 2CAIA 2I4AA 1ZYQB 2LJKA 4XS6A 1GRXA 5J41A 4WF4A 1G7OA 1BAYA 4N0VA 1WWJA 1XVWA 3ZL5A 4TR3A 5DAKB 2QKEA 1TU8A 1YEXA 3U6VA 4I8BA 4P3YB 17GSA 1A0FA 3EYTA 1K0BA 2MBTA 1NHYA 4IQAA 4E8EA 1ERVA 4E8HA 3KIJA 2MMAA 1A8LA 2PN8A 2O7KA 1OKDA 1H75A 2B1LA 3L9VA 5J9CA 2R5GA 1ZGNA 2LJRA 2DJ1A 4I2UA 1Z7PA 2H30A 2FWHA 2L6CA 3C73A 1SKWB 4Z7XA 2F8FA 2YNXA 1YZXA 5B7CA 1ILOA 2VD1A 2H1AA 5CREA 4FH8A 2H0GA 3DXBA 1V2AA 2PWJA 1B4PA 1OE7A 4TRXA 4WBRD 1OKTA 3A2XA 2WJUA 3G9BA 1JZOA 1SL0B 4MK3A 4IBPA 1FAAA 2XHFA 3IE3A 4TR1B 1Z9HA 2B5EA 4O5RA 1T3BA 3ZTLA 1EP8A 4OFMA 3WGXA 2J23A 4NHZA 3W8JA 4TW5A 5AN1A 2KUCA 2YWNA 3ZMKA 1Z6MA 2C3TA 4ECBA 1ST9A 3I9V2 1F9MA 2CX4A 1DBYA 5IQYA 3HHVA 3C1SA 3UIWA 5IMVA 2DSAA 1WRYA 3QOUA 4K7NA 3IC4A 4GCIA 3GSSA 20GSA 1M9BA 1XVQA 3TJGA 4H86A 5ECNB 4N30A 4MLYA 1F3BA 1ZOFA 2K8SA 5COHA 3TKSC 5JWOB 4HU9A 1AXDA 2B7JA 2OACA 5EVOA 5C04A 2V41A 4MH3A 2ZCTA 1FOVA 3TRPA 4OFTA 2DJJA 2H71A 2TIRA 2G2QA 1V57A 3L4NA 2M72A 2CQ9A 3LJRA 3KP9A 1N8JA 4POMA 4ECIA 3HVSA 9GSSA 3BOAA 3S9FA 4J56E 2GSQA 1SU9A 2OE1A 1YKAA 4TOPA 2V32A 5F06A 3LG6A 4PQIA 2GSRA 3HJPA 1FO5A 5INYA 2A2RA 2GQLA 3MNGA 3BD2A 1Q4JA 4KNDA 1BJXA 19GSA 5ECPB 1JLVA 5ELAA 3KXOA 1SYRA 2YANA 5C00A 3VI7A 1T7PB 1YY7A 1AUCA 2HI7A 4ZBDA 3TRQA 3LORA 1WOUA 3F63A 2JADA 1A8YA 5DBQA 4V2NA 3HJMA 2X64A 2A4VA 2H70A 2B1KA 2VO4A 2GT5A 1SJZA 4PQ1A 4F0BA 1SYXA 2QGVA 2YCDA 2AHEA 3W8SA 1USBA 2IPAA 5JWQB 4IW9A 2H8LA 4X1UA 1S3DA 6GSVA 3ERFA 3IR4A 4EF0A 2FUG2 4EE0A 1LJRA 3IHQA 4RQRA 3P7XA 1QMVA 2AAWA 1H4OA 4WR5A 1GNWA 3ERWA 4ACSA 18GSA 3FZ5A 5IPGA 2IIYA 2IMEA 2YJ7A 3WT1A 3EC3A 4HZ4A 3GYKA 2GLRA 2VCVA 2IJYA 2O85A 1YF0A 3NIVA 1TI3A 1TK8B 4K7IA 1XWKA 3BCKA 2AUVA 2GTUA 4PUFC 4Q5FA 2HSHA 2ON7A 3GTUA 3Q6OA 4QQ7A 1PL1A 4JZQA 4AGSA 1YDKA 5GSTA 5J3RA 5D73A 3ZITA 5B8BA 1NSWA 1JZDA 1GSQA 3N9JA 3HYPA 2YZUA 1T1VA 4JE1A 1ZZYA 5HFKA 1Z6NA 5EY6A 1LBKA 4MZWA 5IOWA 2HZEA 2OJLA 2ZNMA 4KCAA 3TGZA 4GQFA 3H1NA 1DUGA 3EVIA 2P0GA 3GURA 2P5RA 3UARA 11GSA 1R4WA 1FVJA 1OE8A 4WETA 4K9ZA 5E4WA 4XS4A 4GQCA 2HE3A 2P5QA 1U88A 1PA3A 4NV5A 1GTIA 1GULA 1XW5A 1TRVA 1HNBA 4BVYA 3M9JA 2OBIA 4N0ZA 1ZL9A 1R7HA 1UN2A 1N2AA 4WF5A 1GUKA 2WULA 3DWVA 1SJ6A 3PH9A 1WIKA 1GUMA 3H79A 1EP7A 2DBCA 3RAZA 2VL3A 3GFKA 4RI6A 2JZTA 6GSXA 1V40A 5KEJA 2E7PA 3F6DA 2JZRA 2I3YA 4ZL8A 2PVOC 2B7KA 3F4SA 3H8QA 3VFIA 3ZFBA 4F82A 5IMCA 1EV9A 2V6OA 5DQSA 5CAXA 4MABA 3GKNA 4PX1A 4D73A 1LU4A 3CTGA 2Z9SA 4I6XA 3M9KA 1GNEA 2B3SA 2LQQA 1XWGA 1XBSA 2YWMA 2R2JA 6GSWA 4ZL7A 1FB6A 4IHUA 1O85A 4AJ8A 2ZUPA 2WZ9A 2ON5A 3GKMA 2C1YA 4IJ3A 4GSNA 6GSYA 1U3IA 4JBBA 4MZCA 5H5SA 1XPVA 1YQ1A 3BCIA 4HI7A 1XCCA 3OR5A 4MMMA 3CXGA 3ZREA 4HDEA 3FEUA 1KNGA 3UVHA 3LYKA 1FW1A 3A2VA 1EOHA 6GSUA 1XFLA 4I2TA 3TCOA 2XPEA 3DRNA 3GMFA 3EU4A 4TR4A 4WKWA 5IOXA 3RHCA 3IOSA 1DSBA 5A4UA 1OYJA 3TKSA 1U87A 3IBHA 1BEDA 1THOA 1UVZA 2R6KA 2H01A 2P31A 4IN0A 2FA4A 2JSZA 3TKPA 2VCQA 3ZIJA 3CSIA 4YAPA 4BVXA 3F4TA 1KTEA 1EGRA 2KHPA 4IS0A 3KTBA 1F3AA 3M3MA 1OC9A 1VF3A 4OD7A 4DSSA 5G30A 3PINA 3EINA 2FD3A 5H5QA 3Q74A 5CYYA 5GSSA 2RIIA 2C0FA 3QDNA 3IA1A 3UL3A 1KBNA 4KUNA 4TN8A 13GSA 3VI5A 2L4CA 4MF5A 4WXTA 5IO2A 2C8UA 3TJKA 3GX8A 1PX7A 1MD3A 1GTBA 3LEFA 4EVMA 4POKA 2HNLA 3QCPA 5ECQB 2H74A 5B6MA 4XTSA 3TJBA 3IK7A 4KSOA 1X5CA 4MJAA 2PU9C 3IXRA 4ML1A 4MF6A 4RQXA 3NOFA 3GSTA 5LCZA 4EO3A 3M0FA 3K8NA 5H5RA 2L59A 1AC1A 1O7UA 1TRSA 1XWAA 1TK0B 1YEPA 3Q19A 4RI7A 1GTAA 3SBCA 2B5YA 1FHEA 1EV4A 2C0GA 4HQSA 2XC2A 2FCHA 4OWYA 3C1RA 4K6XA 1SD8A 4YQMA 1HNAA 4AF2A 4MJEA 2MBSA 2TRCP 4TKYA 4F0CA 2PBJA 4MPFA 4PNGA 4G19A 1OVNA 4NWYA 2YJHA 22GSA 3GH6A 4XIHA 1EZKA 4ULXA 1F2EA 2VUPA 2CAQA 2R37A 1F6MC 2X8HA 5G2ZA 2VD0A 1TRWA 3EE2A 3WD6A 3ZYWA 3EMPA 5CP1A 3VWVA 1A2MA 3EU3A 1EEJA 14GSA 4DSQA 1O8XA 5DALA 5IMDA 1S3CA 4ECJA 1OC8A 4IELA 4ZB8A 1GH2A 4EL1A 2QSIA 1SK2A 2IMFA 3CBUA 2L6DA 3ME7A 1R5PA 2IMKA 2H0HA 4KW6A 1SL1B 1FB0A 5JWRB 1ZCPA 2QC7A 3CMIA 5FWGA 5LD0A 4GLTA 1R5AA 1PN9A 1VGLA 1Q98A 4ZB9A 1K0MA 1SD9A 4BPYA 4ILFA 3D0ZA 3E9JB 3PGTA 3JCML 4DEJA 1WMJA 2K8VA 4V1Ap 1JHBA 1K3YA 3CRUA 2IFQB 2EIRA 1V58A 1GLPA 1SJIA 4MJBA 2OADA 3LXTA 3TOTA 3FR9A 5DDLA 2I9HA 4IGJA 4KA0A 3ME8A 3LSZA 2X8CA 1O8WA 2RUFA 4I5QA 3CTFA 3KTLA 2O89A 2V2GA 4ZXGA 1Y6EA 1T8EB 2H6YA 3EMXA 3ZVJD 3GHAA 2F51A 2M80A 3Q18A 5FHIA 2O87A 4IQ1A 2A2SA 4NHWA 2C3QA 3D6IA 3RPNA 3WYWA 5G1LA 1XXUA 3DKSA 6GSSA 3UOMA 1GSEA 3TKQA 3FY7A 1CQHA 2C3NA 2PVQA 2FWEA 4EDYA 4YH2A 5D93A 1RK4A 4PNFA 3L9SA 5G1KA 4IP1A 2HXKA 4G10A 4KAEA 3TKRA 1O81A 2V1MA 3P2AA 3SWLA 4GSTA 1TXXA 1HD2A 5G31A 1PSQA 5ECSA 4L0WA 3G7IA 1G6YA 5IMZA 3MAKA 4LMVA 1PL2A 1EGOA 4HUAA 5D9VA 4NV2A 4F9ZA 2FHEA 1BQ7A 4K1FA 3FK8A 4EDZA 2VL2C 1M99A 2HZFA 3EURA 2RM5A 4GSSA 5F07A 2DLXA 1YJ6A 2PMTA 2EIQA 3VK9A 1BG5A 3UJ1A 1B48A 1TW9A 2LKUA 5ECOB 4IJIA 2J9HA 3M8NA 2F3MA 4XRAA 3GL3A 2DC5A 1OAZA 3VPTA 3KMOA 1E6BA 3TOUA 1PD21 2MYGA 4HZ2A 1ON4A 1NM3A 4ZILA 3O6TA 1R26A 3RPPA 2CX3A 1AQXA 1GP1A 3ZMLA 2V6KA 2AJQB 1E2YA 2I81A 3TDGA 1PGTA 1YF1A 3VWWA 2HRFA 4LA1A 3GV1A 4NXIA 5CRDA 2C80A 1X9MB 4L0UA 4V2MA 5AGYA 5ABRA 1HNCA 5DCGA 3FR3A 3NZNA 4PGTA 5F05A 5A5KA 3TUEA 1XZOA 2GQKA 3KCMA 2IMIA 1J08A 3FHKA 5F8BA 1GTUA 3F3RA 3VPQA 4IP6A 2LNTA 1QK8A 4OCEA 1SK1A 5DCHA 3HVXA 4PXOA 3A2WA 1NW2A 4Q5RA 4TXOB 5IMFA 2GS3A 3APSA 1M9AA 4TR0A 2VCWA 5HR1A 3ZZXA 4GF0A 4KDYA 2L5LA 1ACVA 4JRRA 2K6VA 4O7HA 1SK0A 2GZPA 2HZEB 4EKZA 4GRFA 2N5BA 2VM2A 3QD9A 2KP2A 2GZZA 3DD3A 1XWCA 5JCGA 1HYUA 4HJMA 5F0GA 2L5OA 2OE3A 5EL8A 4Q5QA 5E59A 5GZZB 1X0RA 2OKAA 1A24A 4XS4B 2G0FA 5LNKe 3GN3A 1JFUA 2LRTA 2L57A 3DGQA 4WBJA 4G9HA 2VLTA 1TTZA 1GSDA 3I43A 12GSA 3BBYA 3D22A 1ERUA 4I97A 3ZIVA 2D2ZA 4NPBA 1SKRB 3HDCA 1M2BA 3KP8A 1BX9A 4JEDA 1O6JA 4MDCA 5ID2A 4JR4A 3MWHA 5CNWA 4N10A 1ZMAA 3IAM2 2YV9A 3CSHA 4F03A 4OO4A 1M2DA 2DMLA 3HZ8A 3TB2A 2H66A 4KDXA 2H1GA 3KGKA 3CSJA 2XBIA 3DVWA 5HFGA 3IK9A 1GSUA 2HRNA 3GX0A 4J2FA 2VOCA 4ZBAA 2CA8A 2IWTA 4OMVA 1TOFA 5IM9A 3G7JA 3UEMA 2NBSA 1TRUA 3LWAA 2B5XA 2DJ2A 1W89A 3UMAA 5HR3A 1AQWA 3FZ4A 2WDUA 3D4MA 5GAPD 4ML6A 3W6GA 2RM6A 1A2LA 4KGIA 1G7EA 1QGVA 4KDUA 1GSSA 2IN3A 1QFNA 4V2LA 2LRNA 2K18A 2GVPA 2NTOA 1SL2B 2L4QA 5DAKA 3DIEA 3LYPA 3GH9A 3UAPA 2DMMA 1U6TA 2DJ0A 1FVKA 1F37A 4DVCA 5CRWA 5J4UA 3C71A 2YZHA 4O92A 2YWIA 4PUAA 2HLSA 4IKHA 3F9UA 2C0DA 4DSRA 5HFIA 3LXZA 4KCEA 2BJXA 5D8IA 3GRXA 4PQHA 4TVEA 4KSMA 3V1WA 3GNJA 3GKKA 3QFBC 2DIZA 1OC9B 4X0XA 1ERTA 1AAZA 1X5EA 2VIMA 1QQ2A 4DSSB 2E2MA 3EWLA 4GWRA 4XCSA 1MD4A 2JL4A 4MPGA 1V9WA 4TR1A 4XS1A 2LSTA 2LUSA 1AW9A 1GSYA 1M0UA 5JCWA 1EWXA 2PERA 3E3EA 5KN2A 1K0DA 3D5JA 5JCUA 3G7YA 3MDKA 4HS1A 2EC4A 4WEYA 4FO5A 2VL2A 1B4QA 4K7OA 7GSSA 1URMA 4ZB6A 1GSFA 2DJKA 4ZBBA 1XOAA 3F4RA 5ECRB 1MDIA 4LL4B 1J0FA 1G6WA 4MJCA 2R4VA 3GUSA 5HR0A 1IYHA 1WJKA 4BA7A 2FY6A 1K0NA 2HFDA 2VLVA 4QL9A 2AB6A 3M1GA 1XW6A 2YWOA 5IPHA 5GAND 1M2AA 5B8AA 1ABAA 1TP9A 5FT3A 2MMZA 2IFQA 1TU7A 3J7Yb 5L71A 2PGTA 4ZL9A 3KZQA 4Q5NA 3UVTA 3GKXA 2H76A 4O32A 3A3TA 2XPDA 3R2QA 3GIXA 2JACA 3CRTA 4LLRA 1K0AA 3HVVA 1K3OA 1FG4A 1PRXA 5IO0A 1K0CA 2ALBA 2LS5A 2OA7A 3APQA 4J57E 3DEXA 2E0QA 3RHBA 1CQGA 2CVKA 2F9SA 2N5FA 4CDOA 1XW9A 2F8AA 2E2GA 4NAXA 3C7MA 5G5FA 3HKRA 3QAWA 4EC0A 3FZ9A 5DALB 3WT2A 1THXA 1PX6A 1JLWA 2C4JA 2CVDA 2JZSA 3KM6A 4FYBA 1O73A 5IMAA 2NDOA 1WE0A 2LV3A 3BJ5A 2YOIA 3I6AA 3IPZA 2FLSA 1MEKA 1Z5YE 3VWXA 4BWQA 3ZFLA 3MSZA 3E0UA 4ID0A 3KEBA 1Y25A 5G5EA 2DJ3A 2WFCA 3WGDA 2I1UA 4CW9A 3HD5A 2O8VB 2VL9A 3F0IA 4LL1B 5ECKB 3TKSE 2REMA 5AISA 2LRCA 2H1BA 2VAFA 2CT6A 4L5LA 4KH7A 2LTKA 1I9DA 4K0NA 3ZRDA 4JU5A 4MP4A 3L9UA 16GSA 2MZCA 1Z3EA 3KJYA 1X5DA 4GXZA 2AV4A 3KD0A 3TRXA 2AYTA 1G0TA 3LGCA 1TI1A 1XOBA 2H75A 4OFNA 4AJ7A 2YPMA 5A4VA 5DJLA 3LQ7A 2KP1A 2WRTA 2FA8A 1W4VA 3KH9A 1ERWA 1V98A 2PUKC 2RUEA 4F2IA 4V1Ag 1QUWA 4MA9A 5CO3A 4G2EA 4POBA 1SENA 2JSYA 1SKSB 3UBKA 1ML6A 5HR2A 3L0HA 5D9TA 1PKZA 2IL3A 3LFLA 3TJJA 5ECIB 4K0GA 2CZ3A 1DE2A 2DIYA 1AQVA 3F8UA 2YP6A 2MMOA 4MCUA 3APOA 5ENUA 2R3XA 3KMNA 2HYXA 2GQMA 1PQNA 4KX4A 4N11A 2FNOA 2BTOT 2TRXA 1B8XA 1MDJA 4OO5A 5KN1A 3P90A 4KB3A 2C0EA 3FYGA 4HOJA 2IMDA 2H0IA 2GSTA 2YV7A 2LEGA 3IRAA 2GGTA 1BYEA 4JR6A 1PMTA 3DVXA 1WPIA 4AJ6A 1X9WB 3PR8A 4HEA2 4TXOA 3GA4A 2K9FA 2YN1A 2LNSA 3IAS2 2HSYA 4NMUA 3IV4A 4ECCA 2HT9A 1RW1A 3H4KA 4L8EA 2H72A 5AIVA 3FW2A 3D4TA 3QMXA 5B6NA 1VRSD 4WR4A 1WP0A 4RUVA 3FR6A 2H73A 4HJ2A 2BMXA 4POLA 2H1DA 4YQVA 3IDVA 3KH7A 4BL7A 3ZLPA 3F3QA 1T00A 3GTUB 1JZRA 4X43A 2H6XA 2VCZA 3FKFA 3AY8A 5DQYA 3VLNA 3UBLA 2MMNA 1VF1A 2N5AA 2XBQA 2H19A 1A0RP 1KEBA 2WGRA 2GDRA 5KN3A 4ISDA 4L5OA 1OC3A 1T4ZA 1NHOA 1A23A 2PPTA 4CHSA 1TKDB 5ECHB 4YAVA 4FYCA 5ECMB 3J7Yk 1PKWA 3HXSA 2KLXA 5DJMA 3A5WA 2ES7A 2CVBA 2WB9A 4FIWA 1IYIA 4K2DA 1X9SB 3HJOA 1UA5A 2VM1A 2GZYA 1XWBA 1I5GA 3C8EA 5D96A 3QAGA 2GSSA 4GTUA 5J5NA 2EIOA 3DYRA 3ZVJA 3O76A 2NVLA 1C72A 3O3TA 4IVFA 1TK5B 3VURA 4K8MA 2KOKA 1B9XC 2B6MA 2WCIA 1TDIA 4OCFA 4PURA 3HZ4A 5CRGA 5KN0A 1U3AA 1S3AA 2LJAA 1J9BA 3QAVA 2CZ2A 4EUYA 3VWUA 2JU5A 3N5OA 5IIZA 2CV4A 5CRHA 1EOGA 1RQMA 3RDWA 4LMWA 2RLIA 3WGEA 3U5RE 1ZYEA 5ECLB 5J9BA 5AIXA 10GSA 1Z7RA 1GLQA 3L78A 3P8WA 4MZBA 3RBTA 2VCTA 1VF2A 1TJDA 2WS2A 1MDKA 1K3LA 2X99A 3FRCA 4FYUA 4D73B 5A4WA 1GUHA 4HU7A 1B9YC 1EEMA 4ZIJA 4HQZA 1DE1A 4YQUA 3D21A 5D9WA 1HQOA 2VCXA 1YKCA 4KE3A 4EXJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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