2K18A

Solution structure of bb' domains of human protein disulfide isomerase
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
GPLGSPAATTLPDGAAAESLVESSEVAVIGFFKDVESDSAKQFLQAAEAIDDIPFGITSNSDVFSKYQLDKDGVVLFKKFDEGRNNFEGEVTKENLLDFIKHNQLPLVIEFTEQTAPKIFGGEIKTHILLFLPKSVSDYDGKLSNFKTAAESFKGKILFIFIDSDHTDNQRILEFFGLKKEECPAVRLITLEEEMTKYKPESEELTAERITEFCHRFLEGKIKPHLMS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of the bb' domains of human protein disulfide isomerase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
total genus 47
structure length 228
sequence length 228
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2008-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2k18A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2k18A01
1NHOA 1ERVA 3P7XA 1E2YA 1ILOA 3ERWA 2HZFA 1DE2A 5HFIA 3IAM2 3LSZA 3GX0A 1VF4A 3AY8A 4KSOA 1SU9A 4OO4A 2WDUA 1RQMA 4KAEA 3VI5A 1SJIA 5DJLA 3M9KA 4EL1A 5CYYA 5DAKA 1WRYA 2V41A 3KM6A 1A24A 2PWJA 2VLUA 1TK0B 5DCGA 2ON7A 2FA8A 4ECIA 1YEPA 2HXKA 1EGOA 4N10A 3RBTA 1TP9A 1M9BA 4WR4A 17GSA 5F06A 4HS1A 2O8VB 4GLTA 3DIEA 4IQAA 5DCHA 2VM2A 2YJHA 4HUAA 1ZYQB 3JCML 5G31A 1YKAA 4I8BA 1TRSA 3TB2A 3M8NA 5CRWA 2JACA 4PX1A 2OACA 3IPZA 4XS4A 4BWQA 3F9UA 3FZ4A 1VF3A 3KMOA 5F0GA 5IO2A 2YNXA 5KN2A 2A2SA 4RI7A 2F8FA 1EV4A 4KCAA 3EU4A 4AJ7A 2GZYA 5IMVA 3WT2A 2IMEA 2GGTA 1GUKA 6GSXA 2H71A 4O5RA 1OC9B 2O85A 3LGCA 1Y6EA 4L0WA 4G9HA 5DBQA 2IPAA 2V6KA 1RK4A 4F2IA 3HD5A 3LEFA 2VUPA 2FWEA 3LYPA 1V98A 3L78A 1ZCPA 2L5LA 4KX4A 4RQRA 2YCDA 3PGTA 2LRTA 1VGLA 3D21A 5CRGA 2FY6A 3FR3A 3DGQA 3KTLA 4NXIA 6GSTA 2GZPA 1ABAA 3EMPA 3BBYA 3RHBA 1HNBA 3GTUA 12GSA 4TR3A 2TRXA 1Z6MA 3F63A 4KA0A 4O92A 2C3TA 3H8QA 1YZXA 1DSBA 1F37A 5KN3A 3C8EA 2YANA 2H72A 4NHZA 1ZL9A 2H73A 2N5BA 3FY7A 1NHYA 1K3LA 2QSIA 1FB6A 3C7MA 3NIVA 4OCEA 2IMKA 2HT9A 3GNJA 3TRXA 3FRCA 2NPBA 3ERFA 2HYXA 3UAPA 1J0FA 3E9JB 5G1LA 1PL2A 3I6AA 2IJYA 3QPMA 4ZL9A 1TI1A 3U6VA 1G6WA 1MDIA 5G2ZA 3FR6A 1GSEA 4WKWA 3APOA 3WYWA 3HY2A 2C0DA 2FWFA 4P3YB 1GULA 2VCXA 4K6XA 3GHAA 5IM9A 5AN1A 3ZVJA 3VK9A 3FZ5A 5CNWA 4E8EA 4V1Ap 3A2VA 3ZIVA 3LORA 1M2AA 1W89A 4I97A 5B8AA 2H66A 3F0IA 2VD0A 1QFNA 2YOIA 1G7EA 4F0CA 5HFKA 4YQUA 1EZKA 2VL2C 4MH3A 3C1RA 3OR5A 4XTSA 1B48A 5ECKB 3BOAA 4MABA 3ZTLA 1SK2A 2PU9C 2YP6A 1GTAA 2H30A 2H01A 4KCEA 1K0AA 1ZZYA 2N5AA 3EINA 3VWWA 1EP8A 4TN8A 4MMMA 5J3RA 3CMIA 5IMFA 1M9AA 2L6CA 1Z6NA 3UL3A 2XHFA 3F3RA 2GT5A 3IAS2 4K7OA 2C4JA 3GKXA 3TOTA 4EDZA 2KHPA 3DWVA 2XPDA 3M3MA 4RQXA 1OE7A 5D73A 4J2FA 1K0NA 4TR1B 3E3EA 2PN8A 4HZ2A 2GQKA 2EIRA 4MJEA 3GUSA 3KH7A 1EEMA 2JU5A 3ZFLA 4YAVA 4JBBA 2MMOA 1EGRA 5C00A 2R6KA 2GSQA 2MBSA 4PXOA 1PX7A 4MLYA 5HR3A 2B5XA 4POKA 1SL0B 2LEGA 6GSUA 6GSVA 1QQ2A 4J57E 3DRNA 4POMA 1JZRA 5F07A 5H5RA 2QKEA 3IXRA 2BJXA 1PA3A 4ILFA 5H5SA 3A5WA 1XPVA 2LJKA 18GSA 2JSZA 3W8JA 3VWVA 1PD21 4RI6A 1LJRA 5FT3A 2RIIA 3DVWA 5ABRA 1GLQA 2J23A 5E4WA 2E2MA 1XW5A 2IIYA 3TKSE 3TUEA 2FA4A 4ZIJA 2LNSA 2LRNA 4GSSA 4O32A 1V9WA 4K7NA 4NWYA 5JCWA 4HEA2 2OKAA 5LCZA 3F6FA 4IKHA 1UVZA 1Z3EA 3CBUA 5CO3A 1XOBA 4X0XA 4KGIA 1XFLA 2IMFA 1LBKA 1PKZA 1URMA 2K8SA 2VCTA 5D8IA 1O73A 3ZMLA 4N0ZA 3CRUA 1DBYA 2IL3A 3Q18A 4L5LA 4PUAA 1AQWA 1M2BA 1XBSA 2DMLA 3FEUA 3DKSA 1TDIA 1XIYA 1OC3A 4KW6A 4IW9A 4KDXA 3TRQA 4L5OA 3TDGA 4BWSA 3UBLA 4MF7A 1G7OA 5IQYA 1ST9A 2JZSA 4DEJA 4PUFC 5INYA 4PNGA 4TOPA 1TRVA 3P8WA 2TRCP 3EWLA 1JHBA 5F8BA 1R7HA 3TKSC 1OE8A 3KP8A 4DSSB 1RW1A 2VL9A 4OO5A 5CRDA 5AIXA 5A4WA 3RDWA 1H4OA 1GSYA 5DJMA 4MCUA 4MZCA 5JCUA 3ZITA 2DJJA 4KDYA 2YV7A 2B5EA 3EC3A 3KXOA 4FIWA 3QMXA 2DJ3A 2OADA 1U6TA 2I4AA 2H8LA 4WF5A 3APQA 3F6DA 1EWXA 4F03A 2H1AA 1O8WA 2YN1A 3FKFA 2AJQB 4K0GA 1JZWA 4ZL7A 1O8XA 1A8YA 4HJMA 1TJDA 3HCZA 2LNTA 2KLXA 1IYIA 3QAGA 5CRHA 1XW6A 2DJ2A 2I9HA 2M80A 3UBKA 1Z5YE 1K0MA 3WGDA 4HI7A 4MK3A 6GSSA 4XS1A 1HNCA 2H1BA 3UJ1A 1WOUA 3UARA 4LL1B 1ERUA 4FYCA 3FHKA 4OCFA 4PGTA 3CRTA 4V2NA 2YWMA 4MPFA 2TIRA 2NVLA 5CREA 1XWBA 1U88A 2JL4A 1NSWA 2O7KA 1TOFA 4IS0A 5DQSA 2H1DA 4K7IA 1SD8A 2OE3A 3QD9A 1V57A 3D4TA 3TKQA 2MYGA 3RPPA 3DVXA 4JU5A 2R4VA 3DD3A 1WIKA 1XWAA 4BPYA 1VF1A 3EU3A 2R37A 1NM3A 1MEKA 1F3AA 1FOVA 2L6DA 2A2RA 1TW9A 4HOJA 2V1MA 1BG5A 2O89A 4WXTA 1OYJA 3TKPA 3M1GA 1YJ6A 3ZREA 1GL8A 1Y25A 2WRTA 1XWKA 2ZCTA 4ULXA 3ZVJD 1T8EB 5KN0A 2ES7A 2M72A 4KB3A 4KDUA 4OFMA 3HVSA 4DVCA 1F2EA 2OBIA 1YKCA 4KH7A 1X9SB 3A2XA 1KTEA 4XS4B 3KTBA 3EYTA 2GSTA 1GP1A 1SKRB 2OBKA 3DMLA 2EIOA 1SL1B 3F4TA 2DIYA 1BJXA 2VCZA 2HZEA 1TI3A 5B6MA 1ML6A 3D4MA 2H0GA 2IFQA 1WP0A 3GRXA 1EOGA 2VOCA 2P31A 4QQ7A 3H1NA 4XRDA 2CVDA 3EMXA 2O87A 4ZBBA 4PURA 5HR2A 2OA7A 2BTOT 3VURA 3HVVA 1FAAA 3RPNA 4Q5NA 3R2QA 1MD3A 3GTUB 4JR6A 1T4YA 4K2DA 3TCOA 1QXHA 4FYUA 1B4PA 3GURA 5ELGA 16GSA 5IPGA 2QGVA 3D0ZA 2K18A 3PINA 2YZUA 1EEJA 4TXVA 2H19A 2H74A 1A2LA 2F3MA 5D9TA 4BVXA 2LJAA 4YQMA 2DJKA 3RHCA 1BAYA 2EC4A 5CAXA 3CSHA 3WT1A 2GLRA 4X43A 2GZZA 2XBIA 2RM5A 4FO5A 2PVOC 1R4WA 4KSMA 5HFGA 3TOUA 4WEYA 5EY6A 4TXOB 1FO5A 1GTIA 4OFNA 2IMDA 2KUCA 1N2AA 4Z7XA 1XCCA 2JSYA 4GWRA 1SYXA 2H76A 2HSYA 1GSUA 1F9MA 3ME8A 1JFUA 1USBA 1J9BA 1GUMA 3QAVA 3IBHA 1XWGA 1V40A 2EIQA 2F8AA 1XW9A 1T00A 1CQGA 4CDOA 3J7Yb 5J5NA 3TKRA 2WZ9A 3TGZA 1I9DA 4OWYA 3LWAA 4YQVA 5E59A 3BCKA 4K8MA 3QDNA 4OFTA 3GN3A 3IA1A 2Z9SA 5IIZA 2KOKA 1V58A 1MD4A 4ECJA 1M99A 1O6JA 1FVKA 1HD2A 1PRXA 3BJ5A 3GKKA 2V6OA 5ECIB 3CTGA 3VI7A 2K8VA 2MMZA 2WFCA 4TRXA 4ZILA 4GF0A 1O7UA 13GSA 2HE3A 3K8NA 1U87A 5AIVA 1JZDA 1TK5B 2CZ3A 4IQ1A 22GSA 2FLSA 4IJIA 4ZXGA 2CVKA 3CSJA 1EV9A 4EXJA 4DSQA 4GTUA 2J9HA 5DQYA 3D22A 4NAXA 4MA9A 1HNAA 3IR4A 2XBQA 2CV4A 2C0GA 2NBSA 1K0OA 2H6YA 1AC1A 2PUKC 1DUGA 3F4SA 3O76A 1FB0A 1A2MA 3FYGA 1A0FA 3LQ7A 1BEDA 4MZWA 1F6MC 2V32A 4KUNA 2YWNA 2H0IA 3DXBA 1T4ZA 4JR4A 4TW5A 4D73A 3ED3A 1WPIA 4TR0A 5B8BA 2L59A 1X5DA 5ECHB 1FW1A 3ISOA 2GT6A 4POLA 2G0FA 3GH9A 4N0VA 2B1LA 1Q4JA 2AV4A 3I43A 3WD6A 3HJMA 6GSWA 1S3AA 5IPHA 5J4UA 1GWCA 2YWIA 1TK8B 1MTCA 3GH6A 1YQ1A 2B3SA 3GL5A 1PSQA 2N5FA 4AGSA 3VWXA 2OJLA 2DLXA 3GL3A 4AJ8A 4AJ6A 1T1VA 3VWUA 3LG6A 3TRPA 1GTBA 1ACVA 3O6TA 1SYRA 3GYKA 2C0EA 2PERA 1A8LA 3HYPA 3LXZA 4MJAA 2D2ZA 4KNDA 5A5KA 2HSHA 4ML1A 5IOXA 3ME7A 1XOAA 1OKDA 3O3TA 3L4NA 1R5AA 4POBA 1TXXA 1MDKA 5HR1A 3QFBC 2VCWA 3G7JA 3MWHA 2DJ1A 3GSTA 1GNWA 1QUWA 1K0DA 2OE1A 1MDJA 2E2GA 4HQZA 4Q5RA 1M2DA 5B7CA 1FVJA 2KP2A 5EL8A 3DYRA 4HU9A 2CAQA 2FCHA 4KE3A 4JZQA 1SK1A 4DSRA 1VF2A 1FG4A 2YJ7A 2AHEA 3QFAC 5ENUA 1TU7A 3FR9A 4I5QA 4GRFA 4LMWA 2FD3A 2LS5A 2GQLA 1SK0A 5EPFA 4LMVA 2CQ9A 5IMCA 1GUHA 3A3TA 1SJZA 4EO3A 4YH2A 8GSSA 4GXZA 2OE0A 4H86A 4GQCA 3FK8A 3MNGA 6GSYA 2P0GA 1HYUA 1QGVA 2X64A 1GNEA 1PGTA 4IBPA 2R3XA 1GLPA 1AQVA 4WBRD 4G19A 3U5RE 3UVTA 1ON4A 1EP7A 4I6XA 1TKDB 2G2QA 2WGRA 1VRSD 2LV3A 4LA1A 1YDKA 1THXA 5HQPA 1AAZA 1PMTA 2CT6A 3N5OA 2LQOA 2MZCA 2VCQA 1AW9A 2R2JA 3LFLA 3UOMA 4N11A 3VFIA 4ZL8A 1SKSB 5A4VA 1WJKA 4ZB8A 2VM1A 5AISA 3EURA 4WETA 4LL4B 4IHUA 2PMTA 4I2UA 1E6BA 4GSNA 2C3NA 2DMMA 9GSSA 3HJOA 2ON5A 1YF0A 2HRNA 1DE1A 4GQFA 3EE2A 4JRRA 5ECNB 3KJYA 2VIMA 3TJKA 1G6YA 5DALA 1GRXA 3KZQA 3TJBA 2LRCA 1GH2A 1XZOA 2CX4A 4QL9A 3VPTA 2VL3A 5ID2A 2FHEA 3HKRA 3P90A 3M9JA 3HHVA 3IK9A 5DAKB 5IMZA 1YF1A 4ZBDA 2WB9A 2FNOA 1BX9A 3D5JA 3C71A 1WMJA 14GSA 4XCSA 3D6IA 5ECLB 4MJBA 1HQOA 1PX6A 2F9SA 3IOSA 3LJRA 1SL2B 3KMNA 2AB6A 1R26A 5JWRB 5GSSA 2I1UA 5D96A 5G30A 3KD0A 4HZ4A 4RUVA 4Q5QA 1Q98A 1CQHA 2C3QA 1N8JA 3ZFBA 1K0BA 2H0HA 5KEJA 2GQMA 3KH9A 1A2JA 3VLNA 2MMAA 1BYEA 4IN0A 2YZHA 3DEXA 3KP9A 5F05A 1B9XC 3KEBA 1XWCA 3GKMA 2WJUA 10GSA 2CA8A 4WBJA 2HZEB 3CTFA 5HR0A 3F3QA 2KP1A 19GSA 1K3OA 3GSSA 4JE1A 2E0QA 2B7JA 2IFQB 4L8EA 1PKWA 4K0NA 4YAPA 2HI7A 2CX3A 1OAZA 1OVNA 1X5EA 5J41A 3FZAA 4V2LA 1KNGA 1ZMAA 2HFDA 5J9BA 5IOWA 5AGYA 4GSTA 4O7HA 4V1Ag 1Z9HA 2RUFA 1OC8A 5EVOA 1F3BA 1GSSA 4TR4A 3G9BA 5IMDA 1SJ6A 5GZZB 2GVPA 2VLVA 2GSRA 5ECRB 3VPQA 5C04A 1O85A 1ZOFA 3L9VA 2V2GA 2VL2A 4PNFA 4MH2A 3Q19A 3L9SA 1OC9A 5DDLA 1X0RA 2RUEA 3N9JA 3G7IA 2C0FA 2L4QA 3PR8A 2LSTA 3Q6OA 4PQHA 5IO0A 1U3AA 4NMUA 1Z7RA 1AXDA 2A4VA 2VD1A 3HA9A 1UA5A 3TJGA 1H75A 4NPBA 2XC2A 2K9FA 4ISDA 11GSA 3L9UA 1B8XA 2X99A 5DVBA 2ALBA 2B7KA 20GSA 3I69A 2H75A 3I9V2 2P5RA 1PQNA 5D93A 3PH9A 2X8CA 1XVWA 1ERTA 3ZIJA 1PN9A 3CXGA 3C73A 4QL7A 3ZRDA 1X9WB 2GDRA 5GSTA 5H5QA 1UC7A 2B5YA 2AYTA 2IMIA 5D9XA 1QMVA 3MAKA 4V2MA 1SKWB 3J7Yk 4TXOA 4IGJA 2L57A 1C72A 5D9VA 3QAWA 1S3DA 2HRFA 3HJPA 4EF0A 2JZTA 2JADA 3GA4A 2LQQA 3GX8A 2QC7A 4HDEA 4OD7A 1FHEA 4IVFA 2NDOA 3S9FA 5JWQB 1WWJA 2DC5A 1TRUA 1TRWA 1M7TA 2M46A 1THOA 3HXSA 2LKUA 3US3A 4HU7A 2VCVA 2K6VA 5GAPD 2LUSA 2FWGA 2ZUPA 4ZB9A 3HVXA 4FYBA 2DJ0A 4G2EA 1XVQA 3ZYWA 2GS3A 5CP1A 4Q5FA 3SBCA 1B4QA 3IV4A 5IMAA 4ACSA 3EVIA 1X5CA 3H93A 1G0TA 1PL1A 5ECMB 1GSDA 2PBJA 3BCIA 2X8GA 5GAND 1NW2A 2RLIA 1V2AA 3MSZA 2NTOA 3M0FA 4J56E 5LD0A 3TJFA 4K9ZA 1TU8A 1TTZA 1K0CA 2FGXA 4EVMA 3F4RA 3MDKA 4D73B 5LNKe 1R5PA 2IWTA 2F51A 1I5GA 2HNLA 3TKSA 2WCIA 3LYKA 4MPGA 4F9ZA 2VLTA 4JEDA 5G5FA 1KEBA 4TR1A 1GSFA 3IDVA 1AIUA 1A0RP 4EKZA 4WR5A 3W6GA 1ERWA 1SD9A 2B6MA 1BQ7A 3HZ8A 1J08A 1QK8A 3HZ4A 1S3CA 3NOFA 1WE0A 4PQIA 1AUCA 2B1KA 2PPTA 4F82A 5D9WA 2H6ZA 3ZLPA 4MZBA 3KCMA 1ZGNA 5J9CA 2X8HA 3GKNA 1GSQA 4ECCA 3A2WA 2BMXA 1M0UA 2RM6A 3TJJA 2MMNA 2YPMA 3P2AA 7GSSA 3IK7A 4E8HA 1O81A 2C8UA 2FWHA 5KN1A 1Z7PA 4CHSA 4BVYA 2VO4A 4ZBAA 1A23A 3F8UA 3WGXA 4MF5A 5COHA 2XPEA 4GCIA 1JLWA 2AAWA 5B6NA 3CYNA 3BD2A 4LLRA 5JCGA 2DIZA 2H1GA 4FH8A 5G5EA 2E7PA 1UN2A 2LJRA 2DSAA 4IP6A 4IP1A 3SWLA 1ZYEA 4L0UA 2H6XA 2C80A 3ERGA 4IELA 2FUG2 2REMA 3IC4A 3UMAA 2YWOA 3W8SA 3Q74A 1B9YC 5ELAA 4NV2A 3UIWA 3ZL5A 1AQXA 4HJ2A 2IN3A 3C1SA 3APSA 4XHMA 5L71A 4K1FA 3E0UA 4NHWA 2WS2A 1KBNA 4ID0A 3ZZXA 3IRAA 1JLVA 4DSSA 2ZNMA 4AF2A 1K3YA 4MDCA 5ECPB 2DBCA 3H79A 5ECQB 1T3BA 4X1UA 5FHIA 2HLSA 4EE0A 3G7YA 2PGTA 1EOHA 1X9MB 2PVQA 1XXUA 4EUYA 3GIXA 3GMFA 3NZNA 3GV1A 4MF6A 4WF4A 1YY7A 4IJ3A 4TVEA 4ML6A 2AUVA 2YV9A 3CSIA 5G1KA 4XRAA 2LTKA 4BL7A 4ECBA 2MBTA 2GTUA 1U3IA 3UEMA 3KIJA 4BA7A 2L4CA 4XIHA 2I3YA 2CVBA 3FZ9A 2H70A 2L5OA 3QR6A 3LXTA 5JWOB 3QCPA 3HDCA 1LU4A 4XS6A 1W4VA 4PQ1A 4I2TA 2C1YA 5ECSA 4ZB6A 4EDYA 2CZ2A 1GTUA 3ZMKA 2I81A 3V1WA 4HQSA 5A4UA 3H4KA 4N30A 3QOUA 5DALB 1SENA 4MJCA 3FW2A 5FWGA 4OMVA 2CAIA 4F0BA 4TKYA 3KGKA 3IE3A 4CW9A 5ID2B 4EC0A 1IYHA 3UVHA 1JZOA 1YEXA 3GFKA 4MP4A 1OKTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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