2KP1A

Solution structure of the a' domain of thermophilic fungal protein disulfide isomerase
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GPLGSEGPVTVVVAKNYNEIVLDDTKDVLIEFYAPWCGHCKALAPKYEELGALYAKSEFKDRVVIAKVDATANDVPDEIQGFPTIKLYPAGAKGQPVTYSGSRTVEDLIKFIAENGKYKAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Redox-Dependent Domain Rearrangement of Protein Disulfide Isomerase Coupled with Exposure of Its Substrate-Binding Hydrophobic Surface
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Humicola insolens
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
total genus 29
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2009-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2kp1A00
1U6TA 2IIYA 4G9HA 3VI7A 1XW9A 2CZ3A 3LXZA 2OJLA 3IHQA 1OE7A 3O3TA 2NVLA 2OE3A 3RHCA 19GSA 1AUCA 3EWLA 3IK9A 3GSTA 1GP1A 1SK2A 5D96A 1U3IA 3ZYWA 4K8MA 2V41A 3F0IA 1OVNA 5J4UA 4G10A 5GZZB 2O8VB 4X1UA 3DVXA 2IMIA 2LQOA 1EGOA 2V2GA 3GKKA 1PKZA 2XHFA 4ULXA 4POLA 1PL2A 5B6NA 4LA1A 5B6MA 2C0GA 2IWTA 3WGXA 3OR5A 5ECKB 1V2AA 3ZVJD 1B9YC 2CZ2A 1PKWA 3WYWA 5F06A 5A5KA 3FR6A 2G0FA 2KOKA 2LNTA 2WFCA 2L4QA 3ZIJA 2K8SA 1GUKA 4IW9A 4TXOB 1SKSB 1SJZA 1ERUA 2CQ9A 5E4WA 1S3DA 3CYNA 4JR4A 3GH6A 4BPYA 4KH7A 3F6DA 3W8SA 1TK5B 1HNCA 4GSSA 2GLRA 1YEPA 5IMFA 4ZILA 5ECQB 1EZKA 4KDUA 3EYTA 4JE1A 1X0RA 2C0DA 3M8NA 4OCEA 4DSQA 1WWJA 3TJBA 3BCKA 2X8CA 1HYUA 1BJXA 2NPBA 3NOFA 4WEYA 1PRXA 1GNWA 3EMPA 1XPVA 1O8WA 3VWVA 2PWJA 2GZPA 2GSTA 5HR3A 5H5SA 1OAZA 3KTBA 3VFIA 5DJLA 3IBHA 4JR6A 1T00A 4OCFA 2AUVA 3I43A 4J56E 2K9FA 3UAPA 3GSSA 1EOHA 1W4VA 4H86A 1WMJA 4OFNA 5CRHA 2N5AA 3UIWA 1N8JA 5HR1A 2G2QA 3KM6A 1FOVA 4MPGA 18GSA 5H5QA 1ACVA 2F9SA 4BA7A 1TK8B 2OA7A 4NHZA 1MDIA 2DIZA 3ERGA 4BL7A 4RI7A 4MABA 3SBCA 1OC9B 1YKAA 1ERWA 1X9SB 3F8UA 2DMMA 4HZ2A 3MNGA 1O7UA 2ALBA 3H79A 4GSTA 5G2ZA 3KGKA 4PUFC 5D93A 1ZGNA 1JZDA 2WJUA 2YP6A 4JZQA 1NSWA 1M0UA 2GGTA 4FYUA 2DJ0A 1F6MC 1G7OA 2VCVA 2GQMA 5J3RA 2YPMA 2L5OA 4L5OA 4EDYA 1YDKA 3TJFA 3VK9A 1HNAA 2H66A 2PGTA 3TRXA 1C72A 2R2JA 3U6VA 16GSA 2VLVA 2H30A 2HZEA 4KCAA 5F05A 2B5XA 5J5NA 3QMXA 5ECPB 1XWBA 3CBUA 4PNGA 4I6XA 1M2BA 3TGZA 4F82A 1B4PA 2GSRA 3M9JA 1ABAA 3G7JA 4PUAA 2B6MA 4JRRA 2MBTA 3D6IA 3GH9A 6GSUA 1THXA 1ON4A 1YF1A 4K0GA 2DJ1A 4GLTA 1ZZYA 2L4CA 2WGRA 5JWQB 3WD6A 4LLRA 2HYXA 4POBA 5EVOA 1IYIA 4ZB6A 5IOXA 2HZFA 3H93A 3W6GA 4L0WA 4EE0A 3LG6A 2RLIA 3TKQA 3APOA 5CYYA 3UBLA 1O73A 4KSMA 2R6KA 2OBIA 2YJHA 5ECHB 2I1UA 2PERA 1XW6A 5B8BA 1K0DA 1EEJA 2H1GA 1V40A 1YZXA 2BJXA 1EWXA 3TKPA 4NV2A 4X43A 2N5FA 3U5RE 1XOBA 1Z6MA 4XS1A 1K0AA 1QK8A 1XVQA 4TKYA 3D0ZA 1G7EA 1K3YA 2C4JA 1WPIA 2B1LA 4D73A 1Z5YE 3KH9A 4PQHA 1TKDB 5ABRA 3C8EA 4OWYA 4KX4A 4K0NA 2P5RA 3QPMA 2VD1A 2C3TA 2GZYA 2LKUA 3DD3A 2H1AA 2WB9A 2AJQB 5IMDA 2VUPA 2GSSA 2FHEA 2GT5A 3UBKA 4K7IA 3ZRDA 5GSSA 2LJRA 1Q4JA 3TOUA 1LU4A 3HVSA 5D73A 3DWVA 3ZMKA 2A4VA 1NHYA 3KZQA 4MZWA 1XBSA 5AISA 2VM1A 4X0XA 1AAZA 2IJYA 1AQWA 4PX1A 1M7TA 3VURA 3BBYA 3QCPA 3VPQA 1T7PB 3FZ9A 1DSBA 1YF0A 2R37A 2FCHA 3ERWA 1YEXA 1XWAA 1XW5A 4XS6A 2X99A 1A24A 5G5EA 5IOWA 1SKRB 2CVDA 3ED3A 2AB6A 3APQA 1SL1B 1GH2A 1MDJA 4KDYA 4ZBDA 2JACA 5HQPA 4IKHA 2BMXA 3FZ5A 4IJIA 1AXDA 1GRXA 1EV9A 1FAAA 3DIEA 3TJJA 3GNJA 1GTIA 4Z7XA 1VF1A 2JL4A 3ZREA 5KN0A 1J08A 2V6OA 5DJMA 1RW1A 5LNKe 1GSQA 1TW9A 4BWSA 4ZXGA 3BOAA 4IVFA 4MH2A 1KNGA 1TRWA 5F8BA 2DBCA 5C00A 3F3QA 4LMVA 1J9BA 1R4WA 4IQ1A 2H01A 3JCML 5CNWA 2YV7A 2I3YA 1V57A 4MCUA 1XIYA 1GULA 5D8IA 3F4TA 1SJIA 4HS1A 4K2DA 1BYEA 2M46A 3KTLA 4HJ2A 1TOFA 4RQXA 1B9XC 1QQ2A 3TKRA 4F0BA 3N5OA 4ZIJA 3W8JA 3DRNA 4IELA 4HU7A 4K7OA 4G2EA 1GUHA 2LNSA 2EIOA 1PX7A 3TKSE 3TJKA 1O81A 2A2SA 2CAIA 2NTOA 3HDCA 14GSA 1MD3A 2B3SA 1NHOA 4MMMA 2IMEA 4O92A 2MMNA 4E8HA 2TRCP 3VWXA 1JZRA 1XZOA 4POKA 4F9ZA 5GAND 3IA1A 5CRWA 3EE2A 2NDOA 2PVQA 1EV4A 2VCTA 4DVCA 1ZYQB 1FO5A 2RIIA 2IPAA 2VL2C 3Q74A 2XC2A 5DAKB 4EUYA 1AQXA 1DE2A 1S3AA 1OC9A 4ZL8A 3KJYA 2H75A 3CSJA 2B7KA 1M9AA 1PL1A 3E9JB 4QL7A 3GL5A 1OKTA 5HR2A 1B8XA 2A2RA 4E8EA 2L57A 1OC3A 1V9WA 1MD4A 4IP1A 1XFLA 2HSYA 5HR0A 5EY6A 3P2AA 4RI6A 4KAEA 1HQOA 3LWAA 7GSSA 1Z3EA 5AIXA 6GSWA 2PUKC 1SU9A 3IAS2 2VCXA 5AN1A 4I2TA 5CP1A 2LJAA 3FKFA 1M2AA 2L6DA 3CXGA 3TUEA 3CTGA 1FB6A 2YWMA 3K8NA 1JZOA 5IMCA 1GTUA 4WBRD 2HRFA 3GHAA 4KE3A 4YAPA 1XXUA 2LV3A 4GCIA 1URMA 2HE3A 3I9V2 5INYA 3EVIA 4IGJA 3KEBA 4RUVA 1FHEA 2F8FA 1ERVA 5GSTA 4N0VA 1I9DA 2H19A 2KP2A 3TKSC 4IJ3A 4YQVA 3LFLA 4KW6A 5COHA 1K0OA 3EMXA 3IE3A 4F0CA 2WS2A 2H76A 4ZBAA 2DSAA 4V2NA 2KUCA 2FY6A 2LQQA 4O7HA 2MZCA 4HQZA 3ZIVA 4KGIA 1CQGA 4KUNA 2N5BA 1R5AA 2O85A 1AQVA 3D22A 3ME8A 5DVBA 2FGXA 2K6VA 5ECLB 1Y25A 2IL3A 3FK8A 4ZL9A 3IV4A 2XBQA 4OFTA 3FR9A 1SK0A 2QSIA 2P31A 2BTOT 1OC8A 3GFKA 3LXTA 4N30A 2GT6A 3HJPA 2OKAA 3UVHA 1IYHA 3HCZA 2M80A 2IMFA 1PX6A 2MBSA 4YAVA 2LS5A 4KNDA 5A4UA 2LRTA 3QAVA 2YV9A 5HFIA 4WXTA 3BJ5A 3QOUA 1DBYA 3UOMA 4POMA 2YZUA 3BCIA 5H5RA 3RBTA 2H74A 2VLUA 5DDLA 4P3YB 3TB2A 2IMKA 3FRCA 1X5CA 2OE1A 3VI5A 2IN3A 2CA8A 1GL8A 3ZMLA 2TIRA 3EC3A 2LJKA 3PR8A 3HD5A 2H0HA 4Q5FA 1AW9A 1MTCA 2KHPA 5G5FA 1M2DA 1ERTA 1Z6NA 4ZL7A 2V32A 4GTUA 3IRAA 3RDWA 4MP4A 1N2AA 4J57E 3ZL5A 5CRDA 4HI7A 1THOA 1WOUA 4XS4B 3KH7A 1WE0A 3GTUB 1TRVA 1DE1A 2QC7A 4WETA 5G1LA 1T3BA 5IO0A 4IHUA 3VLNA 3C1SA 3C71A 5AGYA 2CVKA 2MMAA 2H70A 3A5WA 5EPFA 2RUEA 3TCOA 3FHKA 1SD9A 1M9BA 9GSSA 4AJ7A 4NMUA 2IFQB 3DXBA 2B5EA 2JZTA 1SYRA 2LRCA 1BQ7A 1Z9HA 2RM6A 2YANA 3IR4A 3IOSA 5E59A 3CSHA 4CW9A 4QL9A 4YH2A 1K0CA 4KDXA 1VF2A 2VAFA 4FYCA 1F3AA 4ML1A 4TR1B 1T4ZA 3L9SA 2PPTA 4G19A 1A2JA 1QMVA 5G1KA 5A4VA 4L8EA 5A4WA 3LGCA 2FWEA 2H0GA 5B7CA 4XRAA 4ZBBA 1DUGA 1XWCA 4FH8A 1EGRA 2HI7A 2DJ2A 1QXHA 3VWWA 2IMDA 1OYJA 3GA4A 3Q6OA 1K0NA 1TDIA 3F63A 3HY2A 2DJ3A 1ZCPA 4LL1B 3RAZA 1GLQA 2WDUA 3A2VA 1B4QA 5ECSA 4ISDA 1R26A 4RQRA 2YWIA 2V1MA 1SENA 3J7Yk 2DC5A 3LYKA 5DQYA 2XPDA 2K8VA 3EU3A 1PN9A 4FIWA 1GTBA 2H1DA 3A2XA 1YQ1A 4KCEA 2OE0A 4TVEA 4XCSA 4OFMA 1ZL9A 5HFKA 4V2MA 5IPHA 1UN2A 1F3BA 1ZOFA 1SD8A 1XWGA 3G9BA 3HVVA 2GQKA 5EL8A 20GSA 3A2WA 4MLYA 1E6BA 1Q98A 1QFNA 1H4OA 3ZTLA 5DAKA 1PD21 4I8BA 4I2UA 2AHEA 1JLVA 1X5DA 3IPZA 3GKMA 3LYPA 2ZNMA 2C80A 1X5EA 5G30A 4OO4A 3HA9A 1GLPA 4MDCA 4ECCA 5ECRB 1GSYA 3SWLA 2AV4A 4LL4B 2VD0A 1GSSA 4PURA 1Z7RA 4FO5A 2D2ZA 4O32A 3FYGA 4ECJA 2OBKA 3HZ8A 2HT9A 3QD9A 1FG4A 3QAWA 3M3MA 4WR5A 5ECNB 4I97A 3TRPA 5D9XA 1ILOA 2I4AA 3TOTA 1JFUA 2E2MA 1Y6EA 2B7JA 1GNEA 1R7HA 5ECIB 5GAPD 1F37A 4AJ6A 1TI3A 2E2GA 4MJCA 3DGQA 2LRNA 4F03A 2F51A 5D9VA 2O7KA 2AYTA 1UVZA 3EURA 4Q5NA 3ISOA 5IM9A 3KP9A 1T8EB 3ZFBA 2DIYA 1F2EA 2HXKA 4MJBA 5DCGA 4GQFA 5DCHA 5IQYA 4JBBA 3MAKA 4F2IA 2ES7A 4XTSA 5ELGA 11GSA 2PN8A 4N0ZA 4BVYA 1G6WA 3HZ4A 2B1KA 2ON5A 1K3OA 5DQSA 5CREA 1VRSD 2JSYA 1E2YA 1V98A 2EIRA 4XHMA 1PQNA 2KP1A 2TRXA 1USBA 3G7YA 3CMIA 5KN3A 2FWGA 3ZZXA 4HZ4A 4K1FA 5CAXA 3E0UA 4KA0A 1OE8A 1J0FA 1W89A 1A0RP 3NZNA 2I81A 1TXXA 3D4TA 3N9JA 4HUAA 1HNBA 5KEJA 3DVWA 1PMTA 4XIHA 3GRXA 1PA3A 3HJOA 5C04A 3FZ4A 2R4VA 4TOPA 4MF5A 3UL3A 3MWHA 2P5QA 1MEKA 1HD2A 2GDRA 4FYBA 2QKEA 2RM5A 4GQCA 5DALB 2GSQA 4PQ1A 4HU9A 1BEDA 2XBIA 2J9HA 4NXIA 1A8LA 5HFGA 3HHVA 3L78A 4HDEA 1K0BA 4YQMA 6GSVA 2CT6A 3RPPA 4PNFA 1X9MB 1YKCA 3HVXA 1EOGA 4MF7A 5CO3A 3GL3A 3L0HA 1O6JA 1T1VA 2V6KA 1FVJA 2ZUPA 3P8WA 1BX9A 3DMLA 4ILFA 4Q5RA 1T4YA 2R3XA 1O8XA 2GZZA 3GN3A 5CRGA 5IMZA 2FWFA 4PGTA 1TRSA 5FT3A 3PGTA 2I9HA 4O5RA 6GSSA 1MDKA 5KN2A 3VPTA 4ECBA 5LD0A 2R5GA 4QQ7A 4MH3A 1SL2B 1XWKA 1JLWA 3R2QA 4TR0A 4XS4A 4JU5A 3GTUA 4TXVA 1GSUA 4GXZA 3CRUA 3D21A 2C0FA 1JZWA 4NPBA 1U87A 12GSA 2VL2A 4WBJA 4MK3A 2DJJA 2F8AA 4YQUA 4HQSA 5J9BA 3GURA 5IO2A 2IFQA 1A23A 2OACA 1LJRA 3UJ1A 5B8AA 1TI1A 1VGLA 1M99A 4IN0A 3F6FA 3ZLPA 2H0IA 2LTKA 1FVKA 1PSQA 3A3TA 3US3A 1GSDA 4EF0A 2K18A 1K0MA 3C73A 4TR1A 2FA4A 2L59A 3HJMA 2WRTA 2DMLA 2YNXA 4MA9A 1WP0A 2JADA 3O6TA 4TR3A 1Z7PA 2QGVA 1EP7A 4IBPA 2MYGA 2FUG2 3Q18A 2H1BA 3M1GA 4EL1A 1KEBA 4GF0A 2VL3A 6GSYA 1QUWA 17GSA 1TU7A 5J41A 1V58A 5KN1A 2H6XA 3TRQA 1I5GA 2H71A 2P0GA 3M0FA 1G0TA 1JHBA 3RHBA 2RUFA 3LORA 3H8QA 2WULA 4MPFA 2HNLA 1FB0A 6GSXA 2JU5A 1UC7A 3QFBC 4NWYA 2FD3A 4KSOA 3WT1A 3TKSA 3HYPA 4XRDA 3J7Yb 4KB3A 4GSNA 1WJKA 3FZAA 1GUMA 1KBNA 2WZ9A 4PQIA 2VOCA 2DJKA 1SKWB 4GRFA 4L5LA 3GV1A 1A8YA 3P7XA 4ZB8A 3F3RA 3F9UA 3MSZA 3I69A 4ACSA 4EDZA 4CDOA 2FA8A 3E3EA 3D4MA 3MDKA 4DSSA 2YWNA 3H4KA 2YN1A 3TJGA 2F3MA 4V2LA 5AIVA 2C0EA 3UVTA 3L9VA 3EINA 2HFDA 1ML6A 1BG5A 3GMFA 5IMVA 5ELAA 5G31A 3ZFLA 2CV4A 3HKRA 5F0GA 2VCQA 1TP9A 2DLXA 1TRUA 4OMVA 2JZSA 4BWQA 3EU4A 5IPGA 10GSA 3ME7A 1A2MA 2JSZA 5JCGA 2EC4A 2LSTA 3IAM2 1XVWA 1GSFA 2GVPA 1SK1A 2VLTA 1EEMA 2O89A 2VIMA 5J9CA 3LEFA 4GWRA 1ST9A 1PGTA 3GX8A 3QAGA 1TJDA 3ZVJA 2CX4A 4MZBA 2GS3A 2X64A 1SYXA 1GSEA 1TK0B 2JZRA 1QGVA 4MJAA 4PXOA 1XCCA 13GSA 4TRXA 4WF4A 3PINA 3LJRA 1FW1A 2FLSA 5FWGA 2C3QA 1VF3A 1SL0B 4WR4A 3UMAA 1O85A 4MJEA 1A2LA 3IK7A 2YZHA 4N11A 3ERFA 1U3AA 2L6CA 3F4SA 3O76A 2KLXA 2HSHA 4OO5A 8GSSA 3GIXA 2NBSA 4NHWA 2C8UA 5JWRB 3DYRA 3KMNA 5IIZA 1NM3A 1UA5A 3WGDA 4ZB9A 1A0FA 3GYKA 2M72A 4EO3A 3WT2A 4OD7A 5JCWA 3LSZA 2LEGA 4NV5A 1AC1A 4JEDA 3Q19A 4TR4A 1X9WB 3NIVA 4J2FA 1SJ6A 3IXRA 1AIUA 4ML6A 2OADA 3WGEA 2ON7A 22GSA 1GWCA 1U88A 4IP6A 3DKSA 3FEUA 4IS0A 2PU9C 2CAQA 1ZYEA 2B5YA 4V1Ap 5D9TA 1R5PA 1YJ6A 3FR3A 4MZCA 3KXOA 3CTFA 4DSSB 1CQHA 3CSIA 1TTZA 2H73A 4K7NA 2LUSA 5ID2A 3HXSA 2H8LA 2X8GA 4AJ8A 5DALA 2H72A 1TU8A 3I6AA 2HZEB 2X8HA 2FWHA 3L9UA 3GKNA 1GTAA 2VCWA 3KP8A 5LCZA 3APSA 3H1NA 2CX3A 5JCUA 3UEMA 2MMOA 2Z9SA 1BAYA 4EXJA 3LQ7A 2PVOC 4WF5A 1OKDA 1F9MA 5F07A 4ECIA 3QR6A 4K6XA 2VM2A 3L4NA 3BD2A 2ZCTA 2YJ7A 4MF6A 3PH9A 5ECOB 4V1Ag 3IC4A 1LBKA 4CHSA 3FW2A 2VCZA 3KD0A 3P90A 2J23A 4K9ZA 5JWOB 1VF4A 4NAXA 4EVMA 4ID0A 3KMOA 1G6YA 1B48A 3CRTA 2H6ZA 3DEXA 3GKXA 3FY7A 1H75A 3M9KA 4DEJA 4N10A 4IQAA 2XPEA 1WRYA 3KIJA 3ZITA 2C3NA 4TXOA 2L5LA 2GTUA 3UARA 3D5JA 2CVBA 2MMZA 2YWOA 3GUSA 3VWUA 2HLSA 2C1YA 5FHIA 1WIKA 1K3LA 2O87A 2VL9A 4AF2A 1NW2A 4BVXA 3C7MA 3AY8A 1S3CA 2GQLA 3C1RA 4TW5A 2E0QA 4EC0A 5L71A 2AAWA 2PMTA 4HEA2 1EP8A 4D73B 4LMWA 1YY7A 3S9FA 6GSTA 3F4RA 4I5QA 1KTEA 4DSRA 4WKWA 1RK4A 3IDVA 1RQMA 2WCIA 2EIQA 3QFAC 2REMA 3TDGA 2HRNA 2YOIA 4Q5QA 3V1WA 3G7IA 4HJMA 3KCMA 2E7PA 3GX0A 5DBQA 2FNOA 2YCDA 4HOJA 5ECMB 2H6YA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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