2KP1A

Solution structure of the a' domain of thermophilic fungal protein disulfide isomerase
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GPLGSEGPVTVVVAKNYNEIVLDDTKDVLIEFYAPWCGHCKALAPKYEELGALYAKSEFKDRVVIAKVDATANDVPDEIQGFPTIKLYPAGAKGQPVTYSGSRTVEDLIKFIAENGKYKAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Humicola insolens
publication title Redox-Dependent Domain Rearrangement of Protein Disulfide Isomerase Coupled with Exposure of Its Substrate-Binding Hydrophobic Surface
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
total genus 29
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2009-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2kp1A00
2DSAA 3FW2A 1OKDA 1TTZA 2KOKA 1Q98A 3RHBA 2IMEA 4ML1A 4K6XA 3UARA 4X1UA 3E0UA 4E8HA 3PINA 1TRWA 1ZMAA 2IL3A 1IYHA 5L71A 4IKHA 1XXUA 1ILOA 2GLRA 2LRTA 1O73A 1A8LA 1TI3A 3LFLA 4K8MA 3N5OA 3TRQA 3D22A 1Y25A 1MD4A 2VLTA 2FA8A 4D73B 2C8UA 3FK8A 2K18A 3C73A 4K0NA 4FIWA 2YWIA 5CRGA 5D9WA 1O8WA 4Z7XA 2DC5A 1K0BA 2AYTA 3VWVA 3VFIA 3RPNA 2IN3A 2VCVA 4TR1A 4JBBA 2CX3A 5D73A 5JWQB 3TCOA 5F8BA 4K0GA 4MH2A 2HSYA 2K6VA 3CSHA 2R2JA 4MZCA 5JCWA 1F3AA 1XBSA 4FO5A 9GSSA 4IW9A 4JE1A 2M46A 3TGZA 3ZFBA 2R4VA 22GSA 2BTOT 3VK9A 3E3EA 4MZBA 2G2QA 2H72A 5AIVA 2H74A 3G7IA 4HQZA 5FHIA 3F4RA 2I4AA 5B8AA 3A2WA 1AIUA 4RQXA 4HOJA 1FHEA 4IHUA 4N10A 1K0MA 3KH7A 5IIZA 1JLVA 3CSIA 1KBNA 4V1Ag 4ZBBA 2EIQA 3IHQA 4V2MA 2VCTA 4JRRA 2X8CA 3GL5A 3D6IA 5GAND 2JACA 5GSSA 2IJYA 1OC3A 4XS4A 2WULA 3ED3A 5G1LA 1QXHA 3DRNA 3IE3A 4POLA 5DCHA 3IBHA 3BCIA 4IS0A 4N0ZA 3LYKA 3DD3A 4IJ3A 4IN0A 1KEBA 3VLNA 5CO3A 2DJ1A 19GSA 2OE0A 2A2RA 1Y6EA 1S3DA 3GH9A 2MBSA 1F6MC 3WGXA 4HUAA 2GGTA 4ISDA 4X0XA 1AQVA 2LQOA 1ZGNA 4LMWA 4ZL9A 4ECIA 1V57A 1UA5A 3ZTLA 4D73A 3KP9A 3BJ5A 2HI7A 3Q18A 4MDCA 4MMMA 1Z3EA 2EIRA 4N30A 3GRXA 4KSOA 4NXIA 4YQVA 3LJRA 2M72A 3P90A 2HRNA 3U5RE 3ZVJD 2JL4A 3HD5A 5AISA 1BG5A 3RAZA 1JHBA 3D21A 4HQSA 4PUAA 3UBKA 2PPTA 12GSA 2V41A 1O85A 1SJZA 2VO4A 4YAPA 1B4QA 4BA7A 3RBTA 1THXA 3QOUA 4WR5A 5DBQA 3KGKA 1Z6NA 2CVBA 2NTOA 3EMXA 2PGTA 3M9KA 3I9V2 5ECKB 3KTBA 3NIVA 2HXKA 2MMOA 1XVQA 4NPBA 3GX8A 5B7CA 4N0VA 5JCUA 2PWJA 3CXGA 4GSNA 5H5RA 4QL9A 2YNXA 2IMFA 5IMDA 2CA8A 1PRXA 1EGRA 1M2AA 4XRDA 3F8UA 1NM3A 3PGTA 4TOPA 4ECJA 1ERUA 1VGLA 4LMVA 3SWLA 3P8WA 5ECRB 1T1VA 1SL0B 3UMAA 4ZB9A 2L57A 5IO2A 1U3IA 2H75A 4MF6A 4OFMA 3F9UA 4G9HA 1X9WB 1R5AA 5HFGA 5ID2B 1DBYA 3C1RA 2C4JA 5ECSA 3TKSA 3IV4A 1XWBA 1NSWA 3BD2A 2LV3A 2OACA 2LNSA 2IMIA 4MPFA 4WBJA 2FY6A 2QSIA 3FR3A 4XS1A 2YZHA 4TR4A 3FY7A 4WXTA 5INYA 2L5LA 4EC0A 6GSWA 1TRUA 4J57E 4PXOA 5G31A 2K8VA 3GURA 6GSVA 2HE3A 2NBSA 3WT2A 4GWRA 4Q5FA 4RUVA 1B9XC 2GT6A 5IO0A 4IP1A 4G19A 4POBA 2CAIA 4TXVA 2H70A 3F6DA 1TDIA 3FZ9A 4DEJA 1AAZA 5A4VA 3IR4A 2OADA 4F0BA 2JSYA 1K0OA 3F0IA 2PERA 3MDKA 4PQ1A 1S3CA 3M1GA 4ILFA 5DCGA 2YWMA 5D9TA 2GDRA 2YWNA 2JADA 3BOAA 3TJBA 5IOXA 1EZKA 4GQCA 3RDWA 1Z7PA 3HCZA 4F03A 2G0FA 1SU9A 2XBIA 3VI5A 2VCWA 3ZIVA 4F0CA 1WE0A 4IELA 1HNAA 2A4VA 2F3MA 4Q5NA 2LKUA 3LGCA 5A4UA 1SK2A 2WRTA 2O85A 4F2IA 3CRTA 1X0RA 2H6YA 4LL4B 4EO3A 1DSBA 4AF2A 3WGEA 4ZIJA 7GSSA 1R26A 1YQ1A 3ERWA 3OR5A 3GN3A 5F07A 2GZPA 3VPTA 3TRXA 2GT5A 1TP9A 1AQWA 1PL1A 2LEGA 2ZNMA 4L0UA 1ON4A 3Q19A 2OBIA 1M2DA 3V1WA 4XIHA 1E2YA 5LNKe 3UIWA 5ID2A 1MDKA 3MSZA 2DMLA 2D2ZA 1EV4A 4GCIA 4WBRD 1F9MA 3FHKA 1SYRA 4CHSA 4KDYA 1GH2A 4IP6A 1JZOA 1XWCA 4JEDA 2CT6A 2GQMA 1BYEA 1ZYEA 4HEA2 2CAQA 2JU5A 2E2GA 1WOUA 4DSSA 3L78A 1OE7A 2LNTA 4TR1B 2XPEA 2ON5A 2HSHA 2WDUA 2C3QA 11GSA 3IOSA 1XW9A 1GTUA 3IAS2 2XC2A 4OD7A 4GSTA 3VWXA 2GZYA 2VL3A 3U6VA 2C3TA 5ELGA 4QL7A 1J0FA 2EIOA 5IMAA 1T4ZA 4G2EA 1XCCA 4OCEA 1EGOA 1LBKA 4O5RA 1PX6A 2B5EA 1FW1A 3CTFA 2N5FA 3GUSA 4FYUA 5KN2A 5F06A 1A2LA 3D4TA 3F4TA 1N8JA 4ECCA 4TW5A 1ERVA 2VUPA 2AAWA 3QPMA 3I43A 3LXTA 5GAPD 4PURA 2L5OA 2CV4A 2TRXA 4NHZA 4IQ1A 2LSTA 3KMNA 4ECBA 1FAAA 3GNJA 4MA9A 2V6KA 4NAXA 2H1GA 2VL9A 2HNLA 4V2NA 3UJ1A 2VAFA 3WGDA 1SJIA 2F51A 1ERWA 4MJBA 1TJDA 3EWLA 1ML6A 3H8QA 1NHYA 1ZL9A 4PQHA 2ES7A 2L59A 2PU9C 3GH6A 2DLXA 2CQ9A 1Z7RA 5DDLA 1FVJA 1EP7A 4KCAA 5G5FA 2AB6A 4DVCA 1GTBA 4POKA 4BPYA 5D8IA 4HZ4A 3TOTA 3TJKA 2C0DA 2PVQA 5IOWA 4TVEA 2P31A 3GKXA 5ECLB 2X99A 2H73A 1YJ6A 5J9BA 4NV5A 1K0DA 3HJOA 5AGYA 5AN1A 2H01A 3C7MA 1AUCA 2F9SA 3EINA 2X64A 2FWGA 2CZ2A 3FKFA 5D96A 2B3SA 4KCEA 1SKRB 4Q5QA 4FYCA 1XWGA 1XWKA 2KP2A 3KMOA 5E59A 4RI6A 1PMTA 4OO5A 1Z9HA 1PX7A 4TXOA 4DSRA 2H76A 1A24A 4YQUA 4K7NA 2AJQB 1OE8A 5IMVA 2HFDA 4OO4A 1TK8B 3SBCA 4MP4A 3ZZXA 3GYKA 3APSA 3GL3A 1PKZA 3F63A 1MDIA 1EV9A 4ZBDA 2VCZA 2RM5A 4IQAA 5DQSA 4I97A 3GSTA 6GSXA 2HYXA 1E6BA 2VL2A 4DSQA 2VD1A 3EU4A 1FOVA 1H75A 3EYTA 1ST9A 3NOFA 1W89A 5DJMA 2WCIA 1U6TA 3GTUA 3HY2A 1MDJA 2GVPA 2DJ0A 3CYNA 4KGIA 4EXJA 3HDCA 4GRFA 3QDNA 1W4VA 2WS2A 1USBA 3KJYA 3O76A 1B48A 1MTCA 3BBYA 1ERTA 2H66A 1EEMA 2VM2A 4XS6A 2KLXA 1FB6A 20GSA 5ECPB 2YWOA 1X5CA 13GSA 2J23A 3IRAA 3TUEA 2XPDA 1EOGA 3Q6OA 1TW9A 2KHPA 3M8NA 5EY6A 4EUYA 2P5QA 3TB2A 18GSA 1KTEA 3IPZA 4WETA 3DVWA 3IXRA 1JZWA 1GNEA 1GWCA 5DALA 5GZZB 2DJ2A 3L9UA 2L4CA 3KTLA 2H1AA 1SK1A 4PGTA 1GLPA 4EL1A 5DVBA 3C8EA 1YKCA 5F05A 1TKDB 4H86A 3CRUA 4HU7A 3CSJA 2IMKA 5B8BA 3A2XA 4MH3A 2OA7A 2PN8A 4MJAA 5KN0A 1THOA 1ACVA 5ECQB 4CW9A 1ZCPA 3IC4A 1OYJA 1QMVA 2C0FA 1C72A 2NPBA 1FB0A 4PQIA 2FCHA 4JR4A 2WB9A 5DQYA 1SENA 4J2FA 3GKMA 3LYPA 2LS5A 3WD6A 4F82A 4L0WA 1O81A 1A2MA 3ERGA 2I3YA 3GIXA 4JU5A 1N2AA 1F2EA 4MF5A 2V6OA 2YV9A 3GA4A 5HR0A 2IIYA 1GSSA 5J4UA 1XZOA 2GTUA 4BWQA 2GSTA 2LRCA 4K1FA 3Q74A 3FR6A 1GSUA 3UVHA 1WJKA 4FH8A 1HYUA 4TKYA 3M9JA 1WMJA 3P2AA 1GTIA 2MMNA 5HFIA 3J7Yb 5CP1A 1SYXA 3TKPA 5D9XA 1XOBA 5HR3A 2ON7A 2X8HA 5CREA 2H1DA 3DEXA 1EOHA 2ZUPA 2REMA 2GSQA 1QK8A 2X8GA 3TDGA 3ZFLA 2V32A 3ZL5A 1V98A 3RHCA 5ECMB 4K7OA 3QFBC 1YEXA 1M9AA 4P3YB 3WYWA 5D93A 1TK0B 2N5BA 2I1UA 3TRPA 1BAYA 2BJXA 4DSSB 1X5EA 4BVYA 2PVOC 3ZLPA 1TOFA 4MABA 3FEUA 5JWOB 3TJJA 2YV7A 2AV4A 2FWHA 1G7OA 1YF1A 1LJRA 3EMPA 4O32A 2WGRA 2CVKA 3EU3A 17GSA 1BQ7A 2C0EA 4WKWA 1M0UA 1GSDA 3HVVA 4IVFA 3FZAA 1U3AA 2DIYA 1WIKA 3HVXA 1DE1A 1G7EA 4KAEA 5ECHB 3EE2A 1M2BA 1XW5A 1QFNA 4ZXGA 3IA1A 2MMZA 5IM9A 2CX4A 1CQGA 4K7IA 4O7HA 5ECOB 2FUG2 5C00A 2RIIA 2VLVA 2GQLA 3HYPA 1GSEA 4GQFA 5CRWA 2AUVA 2IFQA 3GKNA 1GUKA 3LORA 3FRCA 4KW6A 4KB3A 3ZREA 1AC1A 1OAZA 3APQA 2DJJA 3A5WA 1UVZA 3KEBA 1A8YA 2LRNA 4L5LA 2RUFA 2YN1A 3LWAA 1OC8A 1VF1A 4EKZA 2GSRA 5H5QA 2B5XA 2LJAA 1ZOFA 3HVSA 1SKWB 4YAVA 1V9WA 2NDOA 1O6JA 1V40A 3J7Yk 3EC3A 3GX0A 5J41A 3D0ZA 2RM6A 1GL8A 4OMVA 4WF5A 2E2MA 3HA9A 4RQRA 1YZXA 2O8VB 3GKKA 4IGJA 3UBLA 4ZILA 2WJUA 1WWJA 4CDOA 1X9SB 1PSQA 2YANA 5ELAA 4AGSA 1EP8A 3VI7A 3F3QA 3F6FA 3HXSA 2H6XA 1JLWA 2DJKA 16GSA 2L4QA 1VF2A 3QFAC 3ZITA 1GRXA 1O7UA 4HZ2A 1WPIA 1YKAA 2HRFA 5FT3A 3LXZA 4K2DA 5HFKA 2P5RA 5IPHA 4PUFC 4KNDA 4XHMA 2NVLA 1PD21 2FD3A 1Q4JA 1SJ6A 1TI1A 1O8XA 1B4PA 4TN8A 3LG6A 3H1NA 2L6DA 4TXOB 5HQPA 2VOCA 3ZMKA 3GMFA 1T8EB 4I6XA 3GV1A 2PMTA 2FLSA 4V1Ap 3CMIA 4HJMA 4MJEA 3DVXA 4NMUA 5EPFA 3QMXA 3DXBA 3M0FA 4L5OA 4NV2A 4ZL7A 1I5GA 4ML6A 3I6AA 1TK5B 1VF4A 5DJLA 3HJMA 2B6MA 5C04A 2H0GA 4KDUA 3QR6A 3KD0A 4ULXA 3JCML 2OKAA 2TIRA 2E0QA 3W8JA 4EDYA 2C3NA 3GTUB 3D4MA 3UL3A 3A3TA 5ECIB 1TU8A 1NHOA 2OBKA 3FZ4A 5G2ZA 1AQXA 3DMLA 2VLUA 5D9VA 2J9HA 3IK9A 2B1KA 8GSSA 1GTAA 1DUGA 2H8LA 3CBUA 5FWGA 1M7TA 2JZRA 4KSMA 1K3LA 1K3YA 1H4OA 1GP1A 5B6NA 4HDEA 2O7KA 4POMA 2CZ3A 4GLTA 4I8BA 5B6MA 1PGTA 2R5GA 1SKSB 2LTKA 4F9ZA 3G7JA 4MPGA 3VURA 4ZB6A 1FG4A 2V1MA 3L0HA 1T00A 4X43A 2OE1A 3ME7A 2HZEB 2M80A 4OCFA 1Z5YE 3L9SA 4E8EA 3M3MA 2VM1A 3RPPA 5DALB 5EVOA 4GF0A 4XRAA 2QKEA 1CQHA 4Q5RA 5ECNB 4BWSA 3HZ8A 1V2AA 3FR9A 2MYGA 3VPQA 1V58A 4YH2A 3MNGA 3PH9A 3TKSC 2WFCA 4LA1A 4V2LA 1EEJA 2YCDA 3GFKA 4WF4A 5ABRA 4PNGA 3L9VA 3ME8A 3ZIJA 5CRDA 3H93A 3ISOA 1B8XA 2KUCA 1PQNA 1A0RP 1VF3A 3ERFA 2H71A 4WEYA 2B5YA 2BMXA 2V2GA 4BVXA 3W8SA 5IQYA 1XPVA 1F3BA 1WP0A 4QQ7A 3ZMLA 2H6ZA 2OE3A 5E4WA 1G6YA 1FVKA 3LQ7A 3TJFA 3US3A 1XFLA 1GNWA 1SK0A 2F8FA 4TRXA 4MLYA 3BCKA 2VCXA 3DWVA 2R6KA 1S3AA 4OFNA 1JFUA 3TKSE 4PX1A 3UEMA 2MBTA 2O87A 2YJHA 4XCSA 4EE0A 3S9FA 3QAWA 6GSYA 5LCZA 1B9YC 3UVTA 1TRVA 1X9MB 1AXDA 5JWRB 4EDZA 3KXOA 3FZ5A 5DAKA 2MZCA 5HR1A 5IPGA 3CTGA 1PL2A 4HU9A 1A23A 4J56E 3TOUA 3E9JB 2F8AA 1UN2A 4HI7A 4TR3A 4KX4A 2HZEA 4LL1B 1U87A 3G7YA 2A2SA 3G9BA 2IPAA 2I81A 2FWEA 3HKRA 5HR2A 1BJXA 4RI7A 1GSQA 1HNCA 3D5JA 2C1YA 5IMZA 1HQOA 3IK7A 3TKQA 1YDKA 2CVDA 2VIMA 2LQQA 3KIJA 1YEPA 1KNGA 1F37A 2JSZA 2B7KA 5CNWA 4KA0A 4K9ZA 4EF0A 4I5QA 3C71A 1GUHA 4IBPA 1GUMA 1K0CA 1BEDA 2HLSA 1WRYA 2FNOA 1T4YA 2I9HA 4MZWA 1EWXA 2PBJA 1ZYQB 2R37A 2E7PA 2IFQB 1R7HA 3LSZA 3APOA 5G30A 2XHFA 4EVMA 4IJIA 2YOIA 1J9BA 3O6TA 3LEFA 1JZRA 5AIXA 5G1KA 5KEJA 4KDXA 3HJPA 1OC9B 4BL7A 4MF7A 1LU4A 1YY7A 4HJ2A 3GHAA 1XOAA 1FO5A 2QGVA 4ZB8A 2O89A 3DIEA 4YQMA 4ZL8A 1AW9A 2YPMA 1ZZYA 2DMMA 5J9CA 6GSSA 5A5KA 1HNBA 3AY8A 3P7XA 2GZZA 3GSSA 1OVNA 3O3TA 3HZ4A 1Z6MA 4KE3A 2P0GA 1SL1B 3EVIA 2HZFA 3KZQA 5CYYA 5COHA 3UAPA 2LJRA 5H5SA 3QCPA 1K3OA 2FWFA 3NZNA 1NW2A 5A4WA 4NWYA 2IWTA 3EURA 3TKRA 3VWWA 3A2VA 2QC7A 4N11A 5JCGA 3C1SA 4OWYA 1TXXA 1TRSA 2EC4A 4ID0A 1PA3A 5KN3A 1DE2A 5GSTA 2C0GA 4AJ7A 3PR8A 4ACSA 4JZQA 1ABAA 2B1LA 3QD9A 1IYIA 2RLIA 5KN1A 3DGQA 4XTSA 2DJ3A 1GSYA 5J3RA 1QUWA 2H0IA 2WZ9A 4MCUA 4KUNA 3R2QA 4G10A 1OKTA 1G0TA 3ZVJA 2H19A 2GQKA 3MWHA 2AHEA 1VRSD 1QGVA 1XW6A 1U88A 1GULA 3VWUA 1RW1A 4MJCA 1XVWA 2OJLA 4WR4A 2K9FA 1K0AA 2PUKC 1OC9A 1M9BA 4OFTA 3H4KA 3DYRA 2FA4A 1T3BA 1K0NA 1JZDA 1MD3A 2LJKA 3KM6A 1HD2A 5J5NA 2VCQA 2GS3A 1UC7A 2C80A 5IMFA 2R3XA 5EL8A 3ZYWA 5IMCA 2H30A 4JR6A 2L6CA 2VL2C 3L4NA 1A2JA 3K8NA 4TR0A 4I2TA 4NHWA 1XIYA 4AJ8A 1X5DA 3DKSA 1SD8A 1TU7A 1QQ2A 3UOMA 3H79A 2RUEA 3QAGA 6GSTA 3WT1A 1RQMA 1RK4A 4GSSA 1T7PB 1GLQA 3W6GA 1MEKA 1GSFA 2HT9A 4ZBAA 2YP6A 1I9DA 1A0FA 2JZTA 5G5EA 4MK3A 2ZCTA 2IMDA 2JZSA 10GSA 1M99A 3TJGA 1URMA 2VD0A 4GTUA 4AJ6A 4L8EA 14GSA 3MAKA 2N5AA 2H0HA 2KP1A 5ENUA 5CAXA 5F0GA 5CRHA 1R5PA 1SD9A 2YJ7A 2H1BA 3F3RA 1R4WA 4LLRA 2Z9SA 4GXZA 1XWAA 2DBCA 6GSUA 2LUSA 2TRCP 4PNFA 3IDVA 4FYBA 1BX9A 3F4SA 3KP8A 4I2UA 2DIZA 2XBQA 4HS1A 3QAVA 3IAM2 2FGXA 3HHVA 3N9JA 2MMAA 4KH7A 3FYGA 1G6WA 2YZUA 2GSSA 1SL2B 3I69A 2FHEA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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