2KUCA

Solution structure of a putative disulphide-isomerase from bacteroides thetaiotaomicron
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
AQADGIAFRELSFPEALKRAEVEDKLLFVDCFTTWCGPCKRLSKVVFKDSLVADYFNRHFVNLKMDMEKGEGVELRKKYGVHAYPTLLFINSSGEVVYRLVGAEDAPELLKKVKLGVESEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure of a putative disulphide-isomerase from Bacteroides thetaiotaomicron
rcsb
molecule keywords Putative disulphide-isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Bacteroides thetaiotaomicron
total genus 34
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2kucA00
4K6XA 4YAVA 1UA5A 1TP9A 3HVXA 4XIHA 1SK2A 2ES7A 3Q6OA 2VM2A 3RHBA 4BWQA 5A4VA 3M1GA 1BQ7A 3M9JA 1XW6A 2CVKA 3H4KA 4O32A 3A3TA 4JBBA 4PQHA 1B9XC 2L57A 1TRVA 1Z9HA 1YF0A 4GRFA 2VIMA 4K2DA 1GSEA 3CTFA 1WRYA 3ERWA 4K9ZA 2E2GA 4IQ1A 2CX3A 1LJRA 3CSJA 4MF6A 4V1Ap 3MWHA 1K0BA 1QMVA 3KJYA 3KTLA 3ERGA 1THOA 4MJCA 2MBTA 2H72A 3ZMKA 4KH7A 1PL2A 3TCOA 4GLTA 3F9UA 1ON4A 4ECBA 2O85A 5AGYA 2ON5A 2WDUA 1WPIA 1O85A 2WFCA 1BEDA 1QUWA 2X64A 3WYWA 1XFLA 3ZTLA 4IP1A 2I4AA 4TR4A 2GQKA 1OVNA 3G9BA 1XIYA 4ID0A 1ILOA 3G7YA 4K8MA 1PKWA 4H86A 1PGTA 14GSA 3HJMA 1OC8A 2FUG2 3F4TA 2CAIA 2H0GA 1K0NA 7GSSA 3D0ZA 4GQFA 3VI7A 4JRRA 3FY7A 4O7HA 3EURA 1EOGA 1USBA 1ZL9A 1V9WA 4OCFA 4TR1A 4DSQA 1QGVA 3UBKA 1BX9A 2VCTA 3KZQA 5D96A 5CP1A 2H70A 2YP6A 6GSXA 1ABAA 1ZGNA 1X5EA 3GN3A 5ELAA 1TDIA 2PGTA 3GSSA 1M0UA 1KEBA 4J56E 2FNOA 2K9FA 4MZWA 3ZVJD 3C1RA 2MYGA 3RHCA 3UEMA 1QFNA 5DCHA 2B6MA 2CA8A 1GUHA 4TR0A 1V57A 2XPDA 4K1FA 5IMCA 3P2AA 1XW9A 3GV1A 3DVWA 1UN2A 3M0FA 1A24A 5G5EA 20GSA 4ZILA 2JZSA 1M2BA 1JHBA 2YPMA 3L78A 4LA1A 1NSWA 4POMA 4ECJA 2L4QA 1GTBA 1EGRA 3LJRA 3GURA 2RUFA 3O6TA 2NTOA 4IW9A 4Q5RA 2WULA 3EE2A 4GF0A 2NPBA 2O7KA 3BCIA 2C1YA 4RI6A 1MD3A 3IC4A 4PNFA 2Z9SA 4PNGA 3A5WA 3GTUA 1K0MA 5D8IA 4MLYA 5F05A 2OA7A 3L9SA 5AIVA 3EC3A 2VLUA 5A5KA 5EPFA 1W89A 2H8LA 2HZEA 3GIXA 3EINA 4XS4B 5IOXA 4TXOB 3WGXA 4OCEA 1X5CA 3GKXA 4BPYA 4FH8A 1OAZA 2C0EA 3PINA 6GSUA 1SL0B 3PGTA 5EY6A 2JSZA 1GSUA 3BBYA 4TOPA 5D73A 1ZMAA 2EIOA 4F2IA 2VL3A 1SKWB 1VF3A 3LEFA 3F4RA 1YEXA 4PUAA 3UARA 1GRXA 3GA4A 5IMAA 2DJ0A 5FWGA 3LGCA 2PPTA 3QOUA 3GKKA 1JZWA 4XCSA 2JSYA 1VRSD 2NBSA 3FZ4A 2YCDA 1PMTA 2F9SA 1T1VA 1FB0A 1R7HA 5B6MA 1TRUA 3QFBC 3UVHA 4EL1A 3IDVA 2WZ9A 2VM1A 1X5DA 2YZHA 2IJYA 4JEDA 4NHWA 4D73A 1DSBA 5G5FA 2HYXA 1O73A 1M9AA 3GFKA 3GYKA 2NVLA 2V2GA 5L71A 3ZL5A 1XWCA 2R37A 2H1BA 3TKSE 4NPBA 4HEA2 2IMEA 4F82A 3HXSA 3FZAA 3H1NA 2QSIA 2H19A 1W4VA 5KN1A 3ZREA 1PRXA 2CVBA 4L8EA 1OKDA 2D2ZA 1V40A 3TRQA 4V2NA 4PQ1A 4AJ8A 1VF1A 2WCIA 1THXA 5GZZB 1G7EA 5B8AA 2LJKA 4WF5A 2LNTA 4WEYA 3F6FA 3IRAA 3ERFA 1J9BA 4QQ7A 3GH9A 3FHKA 3MNGA 2L4CA 4ZBDA 4HQZA 4ISDA 2GT6A 2B5XA 2HFDA 4I2UA 1AC1A 5CRGA 1YKCA 2YN1A 1YKAA 5H5SA 2M72A 3L9UA 1GP1A 3VWVA 1T3BA 1K3OA 6GSYA 3HCZA 1NHOA 4NAXA 3I43A 3W8SA 3DYRA 2PERA 5DDLA 3LG6A 2R6KA 5ECQB 2H1GA 4IGJA 2VCWA 3HJPA 3LSZA 4IBPA 4KE3A 2X8GA 4O92A 3FR9A 3BD2A 1EV4A 2RIIA 2LQQA 4P3YB 2FGXA 2AB6A 4TKYA 3QFAC 1EP7A 4ZB6A 3LXTA 3IR4A 1PX7A 3IAS2 2GSQA 1J08A 2K6VA 4POBA 1YEPA 1MTCA 1A23A 2BJXA 3TKSC 2CT6A 1YY7A 2FA4A 3CTGA 3ME7A 4PGTA 3CRTA 2N5AA 5ID2A 3VURA 2A2SA 3GL5A 2G0FA 2DJ1A 5HR0A 2LUSA 4KSMA 4ZL8A 4POKA 1XPVA 2H0HA 3ZIJA 2GZPA 3KIJA 2DMLA 3IHQA 1XVWA 3TOTA 5IPGA 1SENA 3KM6A 3FRCA 1PN9A 1EZKA 5LNKe 4TR3A 1A0RP 3UIWA 1QXHA 1GSFA 3QPMA 1ZYQB 1PQNA 2VL2C 5HR1A 2E2MA 4OWYA 1OC9A 3HZ8A 4KB3A 5IO2A 2LJRA 1WJKA 2DJKA 1SK1A 5B6NA 3UVTA 3ME8A 2YWMA 3US3A 3KMNA 2C0FA 1HNAA 3KMOA 3D22A 4Q5FA 4EVMA 4DVCA 1TRSA 1AAZA 2C80A 3KGKA 4MMMA 3UMAA 19GSA 5F8BA 1ST9A 5JCUA 3FEUA 3VPQA 1U87A 5DJMA 4MF5A 4JR6A 4PQIA 2G2QA 4ECIA 5HR3A 2AYTA 3CXGA 3DD3A 4CW9A 1OE7A 1KTEA 4Q5NA 5C00A 1LBKA 4BVYA 4G19A 1MDKA 1TI1A 2HI7A 2O89A 4ZL7A 2X8HA 4CHSA 1UVZA 3QR6A 6GSSA 2K8VA 4XRAA 1UC7A 4ZBAA 1TTZA 3IV4A 1K3YA 4K7IA 3TGZA 3FW2A 5ECOB 1VGLA 5KN0A 4EXJA 3APSA 5AN1A 2GSTA 1GNEA 3KP8A 4NHZA 2H6ZA 3F63A 4LLRA 1DE2A 3EMXA 4HUAA 5B7CA 2KHPA 1TOFA 5DALA 1EOHA 3APQA 1R26A 3M3MA 1TK0B 5E59A 3OR5A 4TR1B 1GNWA 1X9MB 4HDEA 1PA3A 3FKFA 1ML6A 4NXIA 4OFMA 5D9TA 4EDZA 2N5BA 1YDKA 2LRNA 4MK3A 3HYPA 1GTAA 2PVOC 2E7PA 4XHMA 3UL3A 4G10A 5D9XA 2YOIA 2B5YA 4KDUA 5B8BA 2H71A 2C4JA 17GSA 3C71A 1VF2A 5D9WA 1K0AA 2LKUA 2C3TA 2CZ3A 4RI7A 1RK4A 4IKHA 1MDIA 2IMFA 4J2FA 1SD8A 4K0GA 4MJBA 4PXOA 2FLSA 1Y6EA 1WWJA 4ML6A 4GSSA 4WBJA 4MDCA 3TJGA 1SKSB 4I8BA 3WGEA 2L5LA 1A0FA 2ZCTA 1SD9A 2FWHA 2KUCA 3IK9A 1U3AA 4ZBBA 2L59A 1GSSA 2HRFA 5CO3A 1FG4A 2R3XA 1AXDA 2A2RA 4PUFC 4MZBA 3NOFA 2M46A 4HI7A 3JCML 4MCUA 4FYBA 1HNBA 4EUYA 3WGDA 4GWRA 2LEGA 3VWWA 1GSYA 2B7KA 3KCMA 2HXKA 4XTSA 4E8HA 4DSSA 3GTUB 1N2AA 5FHIA 5ELGA 3BJ5A 5EL8A 1GL8A 4ZB8A 1AIUA 2RM5A 4GQCA 1I9DA 4YQVA 5J9BA 3F6DA 1O7UA 5JCWA 4N11A 1BJXA 3A2XA 3D5JA 3N5OA 3WT2A 2IWTA 4HOJA 1T00A 1G6WA 1HQOA 4OFNA 3DIEA 3QMXA 2YNXA 5IOWA 2GSSA 1Z5YE 4YH2A 3F3RA 1FVKA 4KX4A 4MJEA 5IM9A 1TI3A 3TUEA 2V6KA 4EDYA 1KBNA 2VCVA 5D9VA 5DQSA 1DUGA 1F2EA 2B1LA 3QAGA 5DBQA 2LS5A 4NV2A 2IMIA 3GX0A 5J41A 2AV4A 2L5OA 2JZRA 2L6DA 3Q74A 1F3AA 3GH6A 4G9HA 3V1WA 3ISOA 4D73B 3HDCA 2VCZA 2H66A 3EYTA 1Q4JA 4MJAA 4Q5QA 4IELA 4MABA 2FY6A 4TXVA 3DGQA 4KCEA 2ZNMA 2WRTA 1SKRB 2XHFA 5KN2A 2REMA 1MEKA 1URMA 1XWGA 3TJFA 4N0VA 2VLTA 1JZDA 2GLRA 4ZIJA 2VO4A 5H5RA 5ENUA 1A2LA 3A2WA 1G0TA 1ZOFA 5DAKB 4ML1A 1GLQA 2JU5A 3RBTA 2ON7A 2IFQB 5GAPD 3QAVA 1FAAA 1ACVA 1WE0A 2H0IA 1PX6A 2R2JA 3ZZXA 4L0UA 1M2DA 13GSA 1A2MA 1JZOA 1Y25A 1XCCA 4N10A 4XS4A 5DCGA 4LMWA 1PSQA 4ECCA 1FB6A 3D4TA 1Z7PA 2I3YA 1GLPA 4AF2A 4OO5A 4WBRD 1SK0A 3L9VA 1TW9A 5KEJA 1SYXA 2PMTA 1XW5A 5J5NA 4KCAA 16GSA 3F8UA 1HYUA 3H8QA 2H6YA 4DEJA 4F0CA 2GVPA 2YZUA 3ZVJA 3P90A 1T4YA 3C73A 5D93A 5IMZA 5LCZA 2DIYA 2QC7A 2HLSA 1CQGA 1CQHA 2PVQA 2OE1A 1PKZA 2P5QA 3FR3A 2R4VA 3CRUA 4L5LA 1NHYA 2GZZA 2YJHA 3GKNA 2H73A 4V2LA 1FW1A 4HS1A 3QAWA 1B8XA 2JADA 2C8UA 1K0DA 1U6TA 4DSRA 3F0IA 3CSHA 3W8JA 1B9YC 4IVFA 3FK8A 5G31A 2DJJA 3HZ4A 3H93A 3TJJA 4FYUA 5COHA 3FR6A 1JLWA 1O8WA 4JU5A 3I9V2 3E0UA 3ZFBA 3LYKA 4BA7A 4IS0A 2B7JA 5H5QA 4KAEA 2I81A 3RPPA 2MMNA 3TJKA 2B1KA 1XXUA 3IE3A 3TKRA 1M9BA 2IMKA 1OE8A 2GQMA 2H1DA 1TKDB 2GZYA 2V6OA 5ECLB 3UJ1A 2LRCA 3CYNA 4Z7XA 4MPFA 2KLXA 2P31A 3HA9A 1V2AA 3P8WA 5IQYA 1YF1A 4EKZA 3KXOA 5GSTA 2GSRA 2LV3A 2PBJA 4KDYA 3EU3A 1JZRA 5DQYA 2C3QA 1X9WB 1IYHA 3FZ5A 18GSA 4RQXA 12GSA 4IN0A 2HZFA 1XWKA 3I69A 3E3EA 3QDNA 2VLVA 2H74A 4X1UA 1XZOA 4BVXA 4V2MA 1RW1A 4KW6A 1FVJA 3IA1A 1GSDA 3RAZA 3TRPA 4E8EA 2PU9C 2OBKA 4LMVA 2BMXA 5E4WA 2KP1A 2B3SA 5ECKB 3VI5A 1T8EB 3TKPA 4TRXA 4X43A 4HU9A 3CMIA 1GTUA 1G6YA 4LL4B 1GTIA 1LU4A 2JACA 1V58A 4F9ZA 2QKEA 3QD9A 5GAND 1U88A 4LL1B 4ACSA 2CQ9A 4QL7A 2QGVA 4MH3A 4WR4A 2AUVA 2J9HA 5ABRA 3RDWA 5J9CA 2K8SA 4OO4A 2XBQA 4RQRA 5CREA 2AHEA 9GSSA 4MZCA 4BWSA 3ZITA 2C3NA 2OADA 3KP9A 2OE3A 1ERUA 1O81A 2N5FA 1PD21 2O87A 3QCPA 4YQMA 4I97A 3LQ7A 1V98A 2XBIA 4WF4A 1NW2A 2GT5A 4K7OA 4N30A 2RUEA 1WIKA 3GNJA 2RM6A 5JCGA 1IYIA 1B4QA 2HSHA 2KP2A 1M99A 1GUMA 2LRTA 2F8FA 1T4ZA 3ZMLA 1H4OA 2BTOT 2OBIA 3IXRA 3TJBA 2PN8A 4I2TA 1B48A 1XWAA 1FOVA 2DLXA 1HD2A 2GTUA 1ERWA 1B4PA 1VF4A 3CSIA 4X0XA 3HD5A 3VPTA 4MH2A 3D4MA 3E9JB 5ECPB 4ZXGA 1AUCA 1F3BA 2EIRA 2HNLA 2VOCA 4AJ7A 4IJIA 5LD0A 1GSQA 1EEJA 5AIXA 1N8JA 4GCIA 2EIQA 1ERVA 3MDKA 5CYYA 3DWVA 1R5AA 4WKWA 3O76A 3GRXA 2LQOA 1K0OA 1RQMA 5CRHA 2FHEA 3LXZA 4J57E 1F6MC 3GUSA 2OE0A 4ULXA 2WS2A 5JWOB 4MP4A 2MMZA 4IQAA 5G1KA 3UOMA 4WR5A 3N9JA 2ZUPA 1QQ2A 1XOBA 5IPHA 1I5GA 1Q98A 3Q18A 1WOUA 1F37A 2YWNA 3L0HA 4EC0A 4F0BA 3EMPA 3IK7A 4WXTA 4DSSB 2HSYA 1EGOA 3Q19A 4OMVA 4OFTA 2PUKC 2I1UA 4RUVA 3P7XA 4HZ2A 1E2YA 2VCXA 2FA8A 1XBSA 3GHAA 5GSSA 4N0ZA 4ZB9A 2FWGA 5F0GA 5G2ZA 3DVXA 2IL3A 3CBUA 4NMUA 1Z7RA 1SJIA 3LYPA 1TK5B 2MBSA 3ZLPA 2I9HA 1FO5A 1KNGA 4ZL9A 3BOAA 5CRDA 2CV4A 3ZIVA 3F4SA 4EE0A 5KN3A 1GUKA 2CX4A 2TIRA 3GMFA 3D21A 1WP0A 3GL3A 1HNCA 3ZYWA 2MZCA 5ECSA 3WT1A 4JE1A 11GSA 4K0NA 4QL9A 3DEXA 4KA0A 1A8LA 2GS3A 2HZEB 4FIWA 4HJ2A 4XS6A 2EC4A 3ZFLA 2LNSA 5IMVA 3UBLA 3HHVA 2HRNA 1XWBA 5IIZA 3ED3A 3J7Yk 3IOSA 1S3CA 5HFKA 3APOA 2TRXA 2X8CA 1QK8A 2C0DA 2LSTA 4XRDA 4IP6A 5CRWA 1SJZA 4I5QA 1F9MA 1M7TA 2AAWA 2X99A 5CNWA 3VFIA 1EEMA 1GULA 1A2JA 2XPEA 5A4WA 1YZXA 2IN3A 2V1MA 2F8AA 3U5RE 6GSTA 2A4VA 1K3LA 2YWOA 1OC3A 3LORA 3M8NA 1MDJA 1TRWA 3KEBA 1EV9A 4XS1A 2MMOA 2NDOA 4AGSA 2J23A 5ECNB 1ZYEA 5IMFA 1AQWA 2B5EA 4KGIA 2DIZA 4IJ3A 4FYCA 2R5GA 3IBHA 4KDXA 2FCHA 3EWLA 5JWQB 2VD0A 2E0QA 1BAYA 1TJDA 3KH9A 3BCKA 2VCQA 2H6XA 1G7OA 3C1SA 3AY8A 5DJLA 3TKQA 3A2VA 3I6AA 3DRNA 2XC2A 3H79A 2DJ3A 2F3MA 2GGTA 1Z3EA 2JZTA 3WD6A 2F51A 1XOAA 3TDGA 2DJ2A 1OYJA 1X0RA 6GSWA 1EWXA 1SJ6A 4CDOA 4PURA 3PR8A 5G1LA 2MMAA 4O5RA 4PX1A 4KNDA 2H30A 1GH2A 3HKRA 1M2AA 5INYA 2YV7A 2KOKA 2H75A 5EVOA 1BG5A 3LWAA 5ECRB 2OACA 2RLIA 3HVSA 5IMDA 1BYEA 3UAPA 2O8VB 22GSA 2GQLA 1S3AA 2WGRA 2TRCP 3IPZA 4TXOA 1SU9A 1O6JA 1AW9A 3VK9A 5HFGA 3TKSA 1Z6MA 4EO3A 3MSZA 3FZ9A 1AQVA 3SBCA 4GTUA 2H01A 4I6XA 3LFLA 5F07A 3GSTA 2AJQB 3NIVA 3J7Yb 1ZCPA 4GSTA 2ALBA 5C04A 4BL7A 1OKTA 4HQSA 4ILFA 1Z6NA 3C7MA 10GSA 1ZZYA 5FT3A 3TB2A 1A8YA 3DMLA 3G7JA 2VL9A 5DAKA 3SWLA 2VL2A 2LJAA 2OJLA 5A4UA 2WJUA 4KUNA 2IFQA 2CZ2A 2YWIA 4GXZA 4HJMA 3HVVA 4K7NA 1DBYA 3O3TA 1E6BA 3FYGA 3D6IA 1X9SB 5ECIB 1XVQA 4L0WA 2DMMA 4TN8A 3M9KA 2V32A 4OD7A 4WETA 2DC5A 2HE3A 4G2EA 4TVEA 5HR2A 2JL4A 2DBCA 4MA9A 1TXXA 1SYRA 3HJOA 3VWXA 3G7IA 1SL1B 2CAQA 1J0FA 1AQXA 1WMJA 3W6GA 2VUPA 4JZQA 5DVBA 5IO0A 4KSOA 6GSVA 5ID2B 1U3IA 3R2QA 5JWRB 2GDRA 3KH7A 2FD3A 3U6VA 2YANA 2L6CA 2YJ7A 1SL2B 2FWFA 4YQUA 2H76A 3GX8A 2IMDA 2IIYA 1FHEA 2LTKA 2VD1A 2DSAA 4JR4A 5HQPA 3VWUA 1OC9B 8GSSA 2PWJA 3MAKA 1O8XA 5ECMB 4FO5A 3K8NA 3TRXA 5J4UA 2C0GA 4L5OA 1R4WA 5CAXA 4HU7A 3KTBA 1YJ6A 5F06A 5G30A 1K0CA 2FWEA 1GWCA 3DKSA 4NWYA 2IPAA 1PL1A 2HT9A 3KD0A 1TU7A 5HFIA 4POLA 4EF0A 3F3QA 3IAM2 3TOUA 3S9FA 1T7PB 2WB9A 3NZNA 2V41A 1R5PA 1MD4A 1S3DA 3PH9A 3EVIA 1TK8B 1H75A 2K18A 3ZRDA 3EU4A 2P0GA 2M80A 4V1Ag 1JFUA 4F03A 3GKMA 2YV9A 4AJ6A 3HY2A 4MF7A 3DXBA 4GSNA 2VAFA 4YAPA 1DE1A 2H1AA 4MPGA 1EP8A 2CVDA 1JLVA 3C8EA 5AISA 4IHUA 1ERTA 1NM3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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