The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
34
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sequence length |
121
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structure length |
121
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Chain Sequence |
AQADGIAFRELSFPEALKRAEVEDKLLFVDCFTTWCGPCKRLSKVVFKDSLVADYFNRHFVNLKMDMEKGEGVELRKKYGVHAYPTLLFINSSGEVVYRLVGAEDAPELLKKVKLGVESEG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure of a putative disulphide-isomerase from Bacteroides thetaiotaomicron
rcsb |
| molecule keywords |
Putative disulphide-isomerase
|
| molecule tags |
Isomerase
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| source organism |
Bacteroides thetaiotaomicron
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| total genus |
34
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| structure length |
121
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| sequence length |
121
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-02-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00085 | Thioredoxin | Thioredoxin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Glutaredoxin | Glutaredoxin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QGV A; 2DIY A; 2H0I A; 3VFI A; 3EIN A; 4ZB6 A; 2R5G A; 3E3E A; 3H93 A; 2OE0 A; 1BAY A; 2R3X A; 2WS2 A; 1YQ1 A; 1O85 A; 1MD4 A; 7GSS A; 1PSQ A; 2GQK A; 4F0C A; 1Q4J A; 2O8V B; 2Z9S A; 4LL1 B; 1SL1 B; 3IOS A; 3F6D A; 5D9V A; 4NV5 A; 2OE3 A; 2EC4 A; 5J5N A; 5DQS A; 1M7T A; 3LJR A; 1WIK A; 3FY7 A; 5DJL A; 2X8C A; 3QCP A; 3GUR A; 3UBK A; 3UAP A; 4XHM A; 4OD7 A; 5ECN B; 3WGX A; 3GST A; 1B9X C; 1GUM A; 4O5R A; 5GZZ B; 3A2X A; 3MDK A; 2V32 A; 4IQA A; 1EZK A; 1B8X A; 3TGZ A; 1G6Y A; 4J2F A; 3GIX A; 3JCM L; 3KJY A; 1RK4 A; 3EVI A; 2GTU A; 2H8L A; 1EEM A; 1R7H A; 1NHY A; 1WRY A; 2GST A; 3BD2 A; 1M2D A; 5ID2 B; 3LFL A; 5DCH A; 5B8B A; 1F3A A; 1NHO A; 2HNL A; 3TJB A; 2VCV A; 5G30 A; 2P5R A; 5HFI A; 2I81 A; 2PVO C; 4MPG A; 1MD3 A; 2AUV A; 3F4S A; 2A2S A; 2TRC P; 1X9M B; 4IP1 A; 1YEX A; 2QGV A; 4MF6 A; 2PPT A; 2L57 A; 4KA0 A; 2IMF A; 1SL0 B; 4KGI A; 3ZZX A; 1GSS A; 3MNG A; 4K8M A; 4XS4 A; 5COH A; 2WRT A; 5IO0 A; 4D73 B; 3LOR A; 2PN8 A; 1KNG A; 2WDU A; 1EOG A; 1JLW A; 1HQO A; 5ELA A; 2FWG A; 5L71 A; 1PN9 A; 2IMD A; 2JAD A; 2O87 A; 4MP4 A; 4MCU A; 3ZVJ D; 3TRP A; 3RHB A; 4NWY A; 4DSS A; 1XFL A; 5IMA A; 3HYP A; 2E2G A; 2VD0 A; 1B4Q A; 2LUS A; 2HYX A; 4I97 A; 3EC3 A; 4Q5F A; 4TR3 A; 1XWG A; 1QUW A; 1AQX A; 3TOT A; 5KN0 A; 1A0R P; 1T3B A; 4MJC A; 3TOU A; 3TKS E; 1A2J A; 5A4V A; 3IE3 A; 1PL2 A; 1FHE A; 3ERF A; 3Q6O A; 3UL3 A; 3AY8 A; 2NPB A; 2JL4 A; 1X9S B; 2HE3 A; 2H30 A; 3FKF A; 1SJZ A; 1O7U A; 4O32 A; 1AQW A; 4ZL9 A; 5CRG A; 2YV7 A; 3IDV A; 5ELG A; 4DSQ A; 3BBY A; 1DE2 A; 3L9V A; 1K0B A; 3DML A; 2HSH A; 5IMZ A; 2XPE A; 4YQM A; 3J7Y k; 1ML6 A; 4K1F A; 3UBL A; 1E6B A; 1LJR A; 2BTO T; 1ERU A; 4MJB A; 1OVN A; 2C3Q A; 3GH9 A; 3HKR A; 2VL9 A; 2YOI A; 5KN2 A; 2FY6 A; 3F4T A; 1HYU A; 3GKM A; 3LXZ A; 2HFD A; 3GX0 A; 4MF7 A; 5G1K A; 5HR3 A; 1H75 A; 4V2L A; 5C04 A; 5AIV A; 5GST A; 4XTS A; 3G7J A; 3GV1 A; 5B6M A; 5ECI B; 4DEJ A; 2O7K A; 4JZQ A; 2DJ0 A; 1Z7P A; 4ISD A; 4YH2 A; 1YKC A; 1T1V A; 5CO3 A; 3KP9 A; 2JZT A; 3PR8 A; 4HOJ A; 1GLP A; 5ECQ B; 3G9B A; 1NM3 A; 3PH9 A; 2M72 A; 2VL2 A; 1FOV A; 2LNT A; 1X5E A; 3APQ A; 5D93 A; 1FAA A; 3HVX A; 1S3A A; 3KP8 A; 1PA3 A; 4KH7 A; 2YWO A; 1K3Y A; 3TCO A; 3QFB C; 1XWB A; 2CX3 A; 1C72 A; 3VWV A; 3TKR A; 10GS A; 4PXO A; 4EF0 A; 1TK8 B; 2R2J A; 2B7J A; 16GS A; 4POL A; 4V1A g; 6GSS A; 2M46 A; 5CRE A; 1PX7 A; 1ERV A; 2HZF A; 1A8Y A; 2K8S A; 3L0H A; 5GSS A; 5LNK e; 4CDO A; 1UN2 A; 1FB0 A; 3K8N A; 5AIS A; 1SKW B; 4Q5Q A; 2RM6 A; 3RAZ A; 1B9Y C; 5IPH A; 2N5B A; 2F51 A; 4KUN A; 2H76 A; 2E2M A; 4IN0 A; 2XHF A; 2PBJ A; 3M9J A; 3CMI A; 1XW6 A; 1AXD A; 5JCG A; 3EMX A; 4QL7 A; 3FZ4 A; 1WP0 A; 2N5F A; 1V9W A; 1TKD B; 2OKA A; 4N0V A; 5ECR B; 1XVW A; 1S3C A; 3F4R A; 2IJY A; 3WD6 A; 5ID2 A; 4K6X A; 2B6M A; 2L4Q A; 2GGT A; 22GS A; 2O89 A; 1DSB A; 5JWO B; 1V40 A; 5IMD A; 2YZU A; 2HSY A; 3N9J A; 1N8J A; 3ZFB A; 5IIZ A; 3DD3 A; 2AJQ B; 3FHK A; 2A4V A; 3RPN A; 3UAR A; 3QAW A; 3HY2 A; 3DEX A; 1N2A A; 2VCW A; 4ZB9 A; 2HZE B; 1TI3 A; 4XCS A; 3N5O A; 4XS4 B; 3ZVJ A; 4D73 A; 1JZO A; 1V57 A; 1OAZ A; 13GS A; 4EVM A; 3UVH A; 1XBS A; 4ECB A; 2H71 A; 1WPI A; 1J9B A; 2CX4 A; 1ZYE A; 3OR5 A; 1GSD A; 2WCI A; 2X8H A; 2C4J A; 3C1R A; 4KND A; 2R4V A; 1ACV A; 3LYP A; 4DSS B; 1VRS D; 3L4N A; 4WBJ A; 1JZR A; 3LGC A; 2QC7 A; 3IK9 A; 4G9H A; 1ON4 A; 4ML1 A; 5IQY A; 1K3O A; 3TJG A; 1T8E B; 1M99 A; 1O8W A; 4I5Q A; 6GSV A; 2MMA A; 3IK7 A; 2C80 A; 3CSH A; 3F3R A; 2K9F A; 4PNF A; 2PMT A; 1GTU A; 4ECI A; 14GS A; 1CQH A; 3VK9 A; 5IM9 A; 5IMC A; 1VF3 A; 1ZCP A; 5IPG A; 3GSS A; 2CZ2 A; 1FVJ A; 2DJ1 A; 1Z3E A; 2C0G A; 3A2W A; 5FT3 A; 2VLU A; 4PQI A; 1T00 A; 4N10 A; 1M9A A; 3NZN A; 4WF4 A; 1W4V A; 3KM6 A; 4MK3 A; 3IRA A; 2L6D A; 4AJ8 A; 2YNX A; 1SK1 A; 2H75 A; 3DYR A; 4L5L A; 3CRT A; 1BYE A; 5F8B A; 1HNA A; 1YY7 A; 5JWR B; 4JRR A; 1XPV A; 4I2T A; 2IWT A; 4NHZ A; 4O92 A; 1KTE A; 2R6K A; 2KP1 A; 3KH7 A; 4BWQ A; 1K0D A; 4NV2 A; 1TRS A; 4K7O A; 1QK8 A; 2CV4 A; 5DDL A; 1K0M A; 2LRC A; 1TP9 A; 5J9B A; 2DJ2 A; 3ZYW A; 4DSR A; 1LBK A; 3FR3 A; 3WT1 A; 3TRQ A; 1Z9H A; 2X8G A; 3IAM 2; 3HZ8 A; 4GST A; 4L0U A; 4KCA A; 1J0F A; 2H19 A; 1EEJ A; 1EP8 A; 3DIE A; 4KX4 A; 1U3I A; 1AW9 A; 2I4A A; 2X64 A; 4TVE A; 4AJ6 A; 3HVV A; 1MTC A; 3LQ7 A; 3GX8 A; 1THX A; 1MDJ A; 5IOW A; 1M2A A; 4NAX A; 3ME7 A; 4PNG A; 3IBH A; 3UOM A; 3CBU A; 1X5C A; 1WMJ A; 5EPF A; 2PWJ A; 1EGO A; 1RQM A; 2DJJ A; 3SWL A; 3ZRD A; 4F03 A; 4IHU A; 3KGK A; 4I8B A; 3KMO A; 1F9M A; 4G2E A; 2EIQ A; 3BCK A; 3Q18 A; 2F3M A; 1XVQ A; 1SEN A; 2YPM A; 4OO5 A; 4YQV A; 2ES7 A; 4WR4 A; 4POM A; 1VF1 A; 3APS A; 3FZ9 A; 1WOU A; 1HD2 A; 5EL8 A; 3P90 A; 5HR2 A; 2JSY A; 2FLS A; 1K0A A; 2H6Y A; 1YDK A; 3TRX A; 1YF0 A; 2B1K A; 2H70 A; 2H01 A; 3D0Z A; 1HNC A; 2H66 A; 1XOB A; 4OWY A; 1R26 A; 2FWH A; 19GS A; 3C1S A; 4IVF A; 4KW6 A; 1Z7R A; 2LJK A; 4L8E A; 3QR6 A; 3KH9 A; 1ERW A; 2K8V A; 2PER A; 5H5R A; 1A23 A; 1F37 A; 3FZ5 A; 4HQS A; 1ABA A; 2NBS A; 3HDC A; 1YKA A; 2YCD A; 4OFN A; 4ECC A; 3DXB A; 3HXS A; 5G5E A; 3O3T A; 1JZW A; 2DBC A; 4FYC A; 2HZE A; 5DBQ A; 1TRV A; 4OO4 A; 5G2Z A; 1ILO A; 1XZO A; 3IV4 A; 5CRH A; 1K3L A; 2KHP A; 5D9X A; 1KBN A; 2HLS A; 2ZUP A; 1OC3 A; 3HHV A; 5JCU A; 2MMO A; 2O85 A; 2AYT A; 4KE3 A; 4PUA A; 2CQ9 A; 2DJ3 A; 2BJX A; 3J7Y b; 4ZIJ A; 1TW9 A; 1SKS B; 4POK A; 4F0B A; 2VCX A; 1GSU A; 5B6N A; 1JLV A; 2LNS A; 4X1U A; 5AN1 A; 4E8H A; 4WKW A; 3VWW A; 4X43 A; 4KCE A; 4YQU A; 4IBP A; 2RLI A; 3KTL A; 4ECJ A; 3GKN A; 2IMI A; 3TJK A; 1GUK A; 2GSQ A; 3KD0 A; 1QFN A; 4GXZ A; 5HFG A; 1GSY A; 2VM1 A; 1A24 A; 3ZIV A; 1Y25 A; 4FO5 A; 2I9H A; 4MJE A; 2LV3 A; 3A3T A; 2V1M A; 2FGX A; 3L9S A; 1DBY A; 4ZBB A; 3F0I A; 2GZP A; 5EY6 A; 1UVZ A; 5G31 A; 3KXO A; 2OBI A; 5KN1 A; 5KN3 A; 3Q19 A; 3VI7 A; 1IYH A; 2I3Y A; 3ZFL A; 1WJK A; 2H74 A; 2VCT A; 1R5A A; 3M3M A; 2VM2 A; 3HCZ A; 5ENU A; 1A2M A; 4PX1 A; 4J56 E; 1TU8 A; 5CP1 A; 1XOA A; 3S9F A; 3DVX A; 5FWG A; 2QKE A; 5D96 A; 3PIN A; 2DSA A; 4JED A; 2ON5 A; 4TXO A; 4HQZ A; 1OKT A; 5DVB A; 2VO4 A; 4ILF A; 2B1L A; 3ME8 A; 3L9U A; 5F05 A; 1URM A; 2C3T A; 1EWX A; 1T7P B; 5AIX A; 3WGE A; 2GSR A; 3RBT A; 3GL3 A; 1JHB A; 4XS6 A; 2WGR A; 1X0R A; 2AB6 A; 4OCF A; 9GSS A; 5C00 A; 4PUR A; 4HEA 2; 3HD5 A; 1PL1 A; 2GZY A; 5ECH B; 3P2A A; 4HZ4 A; 4LLR A; 5E59 A; 1G7O A; 4K7I A; 5J3R A; 5FHI A; 5A4U A; 3CTG A; 3GHA A; 1K0C A; 3ZRE A; 4TOP A; 2LTK A; 1MDI A; 2D2Z A; 2FNO A; 2F8A A; 1TI1 A; 4MF5 A; 3DGQ A; 2DIZ A; 3ZMK A; 1SD9 A; 3FEU A; 4V1A p; 4F82 A; 3QFA C; 1Z6N A; 2FUG 2; 2BMX A; 2E7P A; 2YWI A; 3KZQ A; 3F8U A; 5EVO A; 4K0N A; 4QQ7 A; 4K0G A; 3W6G A; 2PGT A; 2VL2 C; 1AIU A; 1GWC A; 1GNW A; 1JZD A; 2VCZ A; 4FYB A; 2E0Q A; 2ON7 A; 1RW1 A; 2LQQ A; 4MA9 A; 4IEL A; 4NPB A; 1R4W A; 3CSJ A; 1X9W B; 4EE0 A; 4MLY A; 2LRT A; 3V1W A; 1GTA A; 2LRN A; 2OAC A; 2HRN A; 1O6J A; 2YWN A; 5DJM A; 3C7M A; 4POB A; 4PQH A; 4V2M A; 4WXT A; 5DAK A; 4N0Z A; 1O81 A; 3ZIJ A; 4MJA A; 3VLN A; 1VF4 A; 5JCW A; 2HI7 A; 4MZW A; 4F9Z A; 1YJ6 A; 3FR6 A; 2GT6 A; 3DKS A; 4GF0 A; 4BPY A; 2GSS A; 1OYJ A; 2GVP A; 5HR0 A; 2GT5 A; 2FWF A; 4Q5N A; 5D9T A; 4K7N A; 3R2Q A; 1TK5 B; 3P7X A; 4J57 E; 2TIR A; 2IMK A; 3GH6 A; 2H1G A; 1NSW A; 4GCI A; 1VF2 A; 1SYR A; 3FRC A; 1G0T A; 4RI6 A; 1XWC A; 2C0F A; 3GFK A; 3VPQ A; 2TRX A; 1Y6E A; 2IFQ A; 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2B5Y A; 2CAI A; 4TRX A; 2L6C A; 1BX9 A; 1W89 A; 3QMX A; 4TXV A; 2B7K A; 5F0G A; 3ZIT A; 2HXK A; 4HU9 A; 3PGT A; 3FZA A; 4ZBA A; 4MZB A; 1GSQ A; 3QAV A; 3BJ5 A; 3TKP A; 3G7I A; 3U5R E; 5ECO B; 1AQV A; 5B7C A; 1Z6M A; 4HS1 A; 3GRX A; 3Q74 A; 3RHC A; 6GSW A; 2IIY A; 5J9C A; 2ALB A; 1U88 A; 4OMV A; 2P0G A; 4I2U A; 2QSI A; 6GST A; 2JZS A; 2J9H A; 1UA5 A; 1ST9 A; 2C3N A; 2FHE A; 3C71 A; 2IPA A; 2LS5 A; 3VWU A; 4Q5R A; 3I69 A; 4JR6 A; 3E9J B; 1G6W A; 2CVB A; 2V6K A; 1TTZ A; 4NHW A; 2MZC A; 4RQX A; 3M0F A; 4HZ2 A; 1PGT A; 1ZMA A; 3ERG A; 4WEY A; 2OBK A; 3WYW A; 2R37 A; 3C8E A; 5DQY A; 1K0N A; 1PKW A; 1IYI A; 4XRD A; 3IC4 A; 5DAK B; 2G2Q A; 3ZL5 A; 5ABR A; 4KSM A; 1V58 A; 3GUS A; 2L59 A; 4AJ7 A; 2RM5 A; 2WJU A; 2NVL A; 1EV4 A; 2ZCT A; 3MAK A; 3LSZ A; 1ZZY A; 4KAE A; 1THO A; 2K18 A; 1XCC A; 1VGL A; 4P3Y B; 2PUK C; 2LJR A; 1EGR A; 5B8A A; 1OC8 A; 1TDI A; 3DWV A; 1ZL9 A; 3LXT A; 5F07 A; 3VUR A; 4N30 A; 1SKR B; 2C0D A; 2DLX A; 5D9W A; 3HJO A; 2JSZ A; 5E4W A; 3DVW A; 1M9B A; 4ULX A; 1USB A; 2H0H A; 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