2L57A

Solution structure of an uncharacterized thioredoin-like protein from clostridium perfringens
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
MSLEGIKQINFQSINVVENLEEAKEGIPTIIMFKTDTCPYCVEMQKELSYVSKEREGKFNIYYARLEEEKNIDLAYKYDANIVPTTVFLDKEGNKFYVHQGLMRKNNIETILNSLGVKEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure of an Uncharacterized Thioredoin-like Protein from Clostridium perfringens
rcsb
molecule keywords Uncharacterized protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Clostridium perfringens
total genus 41
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-10-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2l57A00
3KTLA 1R4WA 1Z3EA 3Q6OA 3CYNA 2OA7A 3M0FA 16GSA 1JZRA 1XWBA 3UAPA 3GNJA 1Z9HA 4V2LA 2GSQA 5ECRB 3IV4A 2K8SA 2H1BA 4KCEA 4MF7A 5AISA 4OFNA 2WB9A 1X9MB 1M9AA 3KZQA 5C04A 3TB2A 2CZ3A 4MJCA 5G2ZA 2H6ZA 2C3QA 2R6KA 4NXIA 5G1KA 3LXZA 1QK8A 3D4MA 3TKPA 1QQ2A 1EGRA 1JZOA 4DEJA 1PKWA 2KP2A 3HJPA 4MF6A 3A2WA 2MMNA 2YWMA 4ZXGA 5ECOB 14GSA 2B1LA 2BMXA 1WOUA 2JU5A 1GWCA 1EWXA 4Q5QA 4XS6A 4NWYA 2H6YA 3TKSE 4OO5A 1VF2A 2V6OA 3GL3A 3O3TA 1PX6A 4KGIA 1N2AA 1S3DA 4WBJA 3C7MA 1DSBA 1GSQA 3D21A 1XW6A 3W6GA 1SENA 3EWLA 1GSSA 1WIKA 1Z6NA 1C72A 1V40A 1QXHA 3GKMA 5KN3A 4KDXA 3M1GA 4YAVA 4TXVA 2YANA 4OO4A 4KW6A 3EYTA 4O92A 2VO4A 4K0GA 2NBSA 1YEXA 4I2TA 1TRSA 1V98A 4EKZA 4PNFA 4IVFA 2DSAA 1UVZA 5A5KA 4XS4A 2K6VA 1AW9A 4ZL7A 4K8MA 4I8BA 4XRDA 3GKKA 1XWKA 5ECQB 1BYEA 4Q5FA 3ME7A 4HUAA 4XTSA 3GH6A 1ZZYA 3QFAC 4LL1B 4MH2A 2HSYA 4J57E 1VF3A 4GXZA 2CZ2A 3D6IA 2WJUA 1B9XC 3E0UA 1MD4A 5GZZB 5ECHB 2LQQA 5IPGA 1RW1A 4MZWA 5ABRA 3HZ4A 2C80A 1I5GA 2R5GA 4WKWA 3Q18A 5DJLA 1A8YA 6GSVA 1SD8A 2CX3A 1SL0B 1E6BA 1QFNA 5ID2A 4PXOA 1TP9A 1HNAA 2YNXA 3ZMLA 3CTGA 2IL3A 1VF1A 5ECMB 4N10A 3Q74A 1Q4JA 2B3SA 3S9FA 3KJYA 3KTBA 4NV2A 1U88A 4GSTA 1JLWA 2OBIA 3MDKA 3C71A 1BJXA 3ZIJA 2KP1A 3LGCA 2MMZA 2FWEA 2LNTA 2B1KA 4JR6A 3MSZA 11GSA 5IQYA 1F3AA 4HI7A 1XWGA 5IPHA 3F6FA 3GKXA 3RPPA 2X8GA 8GSSA 1XIYA 3L9UA 1Y6EA 2YWOA 2YZUA 1CQGA 5B6MA 1O8WA 1GTBA 4ZL8A 4JEDA 2A2SA 3UBLA 1EP8A 4JU5A 1EV4A 1OVNA 4KE3A 1SK2A 2VM2A 1MTCA 1PA3A 2PVOC 1K0AA 3A5WA 3RBTA 2TRCP 5AN1A 4ID0A 2B6MA 3IPZA 1OAZA 1WWJA 2MYGA 2I9HA 2ZNMA 3IR4A 2C3TA 3IC4A 3LFLA 3PR8A 1MDIA 1OC9A 3H1NA 2FD3A 3NZNA 3RHBA 4HJMA 1TJDA 1AC1A 2V41A 1GUHA 3IA1A 4POLA 1JHBA 3HVVA 4KSMA 5HR2A 3EU3A 3TDGA 3IHQA 2H01A 2F8FA 3EVIA 5HFKA 3UJ1A 3HA9A 5D73A 4MJAA 2H74A 5IMZA 4K0NA 4ZBAA 2LJAA 2QC7A 2VAFA 2EIOA 1A24A 4DVCA 4ACSA 2TIRA 2MZCA 1HYUA 1V9WA 3TGZA 2WGRA 2JL4A 2OE0A 5KN1A 2FA8A 3KMOA 3VURA 1OYJA 1XXUA 5HR1A 4OWYA 2LSTA 2H72A 2L59A 2C0DA 4L0WA 2VL9A 5CO3A 2M80A 3L0HA 3LG6A 1Z7RA 3ZFLA 1PSQA 2H0HA 4N30A 5B7CA 2C3NA 5E4WA 1EEJA 3ZVJA 7GSSA 4E8HA 3HVSA 3I9V2 5DJMA 1Z7PA 1AUCA 4BL7A 3DMLA 4EUYA 4BWQA 4I97A 2LS5A 5ENUA 3C73A 2P0GA 1ERUA 3M8NA 2IMDA 4MK3A 3L9SA 3GV1A 2H19A 2DMLA 4V1Ag 4QL7A 2JZTA 2OADA 1XW5A 4TXOB 4KUNA 1XFLA 3DVXA 4TN8A 2P5QA 4TR1B 3HZ8A 4OMVA 2RM5A 5H5RA 2E2MA 2H6XA 5IIZA 4FYCA 1V2AA 3PH9A 4MH3A 3HD5A 2V6KA 1K0MA 2KLXA 3QDNA 4Z7XA 4E8EA 5HQPA 3DGQA 2VOCA 4OCEA 5ELGA 1G6WA 5A4UA 1DE2A 2QGVA 1J0FA 5HFGA 3UVTA 3I6AA 4JZQA 2P31A 1U87A 4LA1A 4ZBBA 2JZSA 2X8CA 2GTUA 3QAWA 4IHUA 5D9TA 3GFKA 2PPTA 1GRXA 1VRSD 2DJ0A 2V1MA 4HQZA 4TRXA 1TDIA 2H71A 1K3OA 3F4RA 6GSTA 1B4QA 2HZFA 3D22A 1WRYA 2LNSA 4ILFA 4RI6A 3GH9A 1T3BA 4XCSA 3M9KA 2PN8A 2AJQB 3GSTA 4KDUA 1G6YA 3CMIA 2FCHA 2A2RA 3KH7A 4JBBA 2JZRA 4G10A 2C1YA 1SL1B 3GYKA 2K8VA 5HFIA 1MD3A 4EVMA 2H76A 1Z5YE 4FYBA 1LU4A 2VCWA 2H1GA 2ON7A 1TRUA 4RQXA 4F82A 3IXRA 4YQVA 4PGTA 4L8EA 4KCAA 1HNBA 1SKSB 5JWRB 3I69A 3UVHA 5J9CA 1O6JA 5DALA 3ZMKA 4K7IA 4O32A 1EV9A 5CP1A 1AAZA 2L57A 1O8XA 2YWNA 1V58A 2FWGA 3QAGA 3SBCA 3KMNA 3FZ9A 3APOA 1GH2A 3EURA 2R3XA 3G7IA 1EEMA 4DSQA 3WT1A 4PX1A 5G5EA 2G2QA 1M0UA 2I3YA 2YZHA 4CHSA 2JSZA 5KN2A 4NHWA 1GSFA 5CAXA 1TK0B 2LKUA 2LQOA 1PL2A 1M9BA 1FVJA 2CVBA 1KEBA 4ZBDA 3ZL5A 1U3IA 4H86A 1TK8B 2WS2A 2I4AA 4G19A 2N5AA 2MMAA 1FVKA 2WRTA 2MMOA 5A4WA 1U3AA 1WP0A 6GSSA 2ZCTA 4KX4A 5DAKB 10GSA 3DEXA 2HT9A 3D5JA 2HNLA 1W89A 3GSSA 5G5FA 3M9JA 5KEJA 1YJ6A 3WGXA 3TRPA 4OFMA 3FKFA 4IBPA 4ECJA 2HSHA 2F3MA 3I43A 2GT5A 3AY8A 3HJMA 2GS3A 3MWHA 2X64A 1R5AA 5J4UA 1A0RP 1ST9A 2H30A 4KB3A 5GAND 3LQ7A 1BG5A 4GSSA 2YOIA 2KOKA 1XWCA 1K3LA 1TKDB 1PRXA 1X5EA 3TRXA 2V32A 4G9HA 5EPFA 4CDOA 3TJJA 4GSNA 1K0DA 5JCUA 1FHEA 5ECPB 2B5EA 5F0GA 1X5CA 1M2BA 4GLTA 2KUCA 3HVXA 4HZ4A 4K9ZA 3TJBA 4HU7A 2OACA 1FW1A 1Z6MA 4JRRA 4YH2A 2OE1A 2DJKA 4DSSB 3KGKA 2FGXA 2VCVA 4L0UA 1GSUA 5IMCA 4GF0A 2H1DA 2N5BA 2MBSA 1YF1A 3BJ5A 1YKAA 4GQFA 3WGEA 1SYRA 4ULXA 3LJRA 4IJ3A 1SK0A 2R37A 2HFDA 2RLIA 5CNWA 5D8IA 5CRGA 1G7EA 5D9VA 2F9SA 2RUFA 3HY2A 2B5YA 3UEMA 2LRTA 3F0IA 4ISDA 2XBQA 4PURA 4AGSA 4ML1A 2XHFA 3QD9A 5EVOA 1PKZA 1EP7A 4X0XA 5GSTA 1M7TA 1T1VA 4XRAA 4D73B 2HI7A 5CRWA 2EIRA 2DJ1A 2DC5A 1PMTA 4ZL9A 3L4NA 2TRXA 4IQ1A 2GZYA 4WR5A 1KNGA 2BTOT 1ZGNA 5ECKB 5ECLB 4AJ7A 2GSTA 3QPMA 4GRFA 4WXTA 3EU4A 1AQXA 4OD7A 2IPAA 3HKRA 3BOAA 1XOAA 1HD2A 4K6XA 1X9WB 4V1Ap 3APSA 2GZZA 2OBKA 3FR9A 3ERFA 2EC4A 5GSSA 3IAS2 2GLRA 1ON4A 3F4TA 2L5LA 4JR4A 2IWTA 2LUSA 3KCMA 5COHA 4HQSA 1SYXA 4G2EA 22GSA 3DYRA 3PGTA 4MABA 4PQ1A 2REMA 2EIQA 1G7OA 4WEYA 1UC7A 1SL2B 3D0ZA 2GZPA 5AIXA 3IBHA 1O73A 2O89A 2P5RA 1OKDA 4TXOA 3BD2A 3E9JB 2HYXA 3DKSA 4TR4A 2AB6A 4TR1A 4RQRA 3HXSA 4IS0A 1B9YC 1ACVA 2LJKA 2FY6A 1YF0A 3FY7A 2HRNA 3HHVA 3P8WA 1TOFA 1YZXA 4X1UA 2VCZA 1HQOA 4MP4A 4AJ8A 1VF4A 4MMMA 3GX0A 1ZYEA 2AUVA 2HE3A 3TKSA 2B7KA 5GAPD 3DXBA 3ERGA 2KHPA 3GMFA 3EE2A 1NW2A 4I5QA 3UIWA 1ABAA 4EL1A 1DUGA 4EXJA 3L78A 1S3CA 5DCHA 3WT2A 1OC3A 4POMA 1JZWA 4BWSA 4YAPA 1V57A 4AJ6A 1F3BA 2L6DA 3GRXA 3U5RE 1A2LA 3BBYA 2YWIA 3W8SA 3TOTA 5H5SA 3FRCA 1XW9A 1K0OA 1M2AA 2NVLA 4F03A 4XIHA 2NPBA 2DJ3A 3C8EA 3A2VA 3QCPA 1AIUA 2ALBA 2E7PA 2V2GA 3UL3A 4IJIA 1SJZA 2J9HA 2GQKA 1EGOA 5DDLA 2L5OA 1GUKA 2VL2A 2O8VB 3TCOA 1OE8A 3VK9A 2PMTA 5D9XA 3EMPA 3F3RA 4Q5NA 3CSHA 5ID2B 2H66A 4FYUA 1SKRB 3G7YA 2GT6A 1SKWB 2O85A 2O87A 2AYTA 4KSOA 2CAQA 1X0RA 3CSIA 4F0BA 4EC0A 1JFUA 2WCIA 3GX8A 2WDUA 4GTUA 1IYIA 1PN9A 5IOXA 5CREA 3LYPA 3GKNA 2DIYA 3F4SA 3G9BA 5G31A 3D4TA 4V2MA 2X99A 4RI7A 3N9JA 5IMAA 3ZYWA 6GSYA 2PBJA 1R5PA 1GSYA 1GNEA 4HZ2A 3FK8A 1TK5B 5B8AA 2NDOA 2E0QA 4MZBA 1T4ZA 1THXA 2IFQB 5DCGA 3FW2A 4EF0A 1JZDA 3F63A 2F8AA 4F2IA 1T8EB 2O7KA 5IMDA 3FZ4A 2IN3A 2I81A 5DQYA 1XPVA 1QUWA 2K9FA 4MDCA 2YP6A 1XVQA 3HJOA 5JWQB 1FO5A 2F51A 4J56E 3CRTA 1B48A 2PVQA 1XOBA 5DVBA 2H0IA 1T7PB 3KP9A 5B8BA 5INYA 3VPTA 4PUFC 3CTFA 1GTAA 2VUPA 3IOSA 1DBYA 2X8HA 1XZOA 5G1LA 3TKSC 1MDJA 3IDVA 3KD0A 3P90A 3LORA 5J9BA 1R7HA 2H0GA 5EY6A 5C00A 4N0ZA 3KP8A 2NTOA 1PD21 1IYHA 4PNGA 1O7UA 4TKYA 4IQAA 2LJRA 4P3YB 2WZ9A 3VLNA 1WE0A 3U6VA 3FHKA 1O85A 1ZMAA 1JLVA 4GCIA 4EE0A 4ZB6A 4DSSA 1K0NA 3DIEA 3VWUA 2LRCA 3ZREA 1UN2A 5FT3A 5B6NA 3WD6A 4NHZA 2R2JA 4QL9A 4ECIA 1KBNA 3M3MA 2GSRA 4ZB9A 3RDWA 3NIVA 1PL1A 3F3QA 2JADA 3W8JA 4HDEA 3ZIVA 3HCZA 2VIMA 4ECBA 4NAXA 2GDRA 2VL2C 3TJKA 3ED3A 4WR4A 1GLPA 1TW9A 1SK1A 3O76A 1SD9A 2LTKA 4YQUA 1A8LA 4F9ZA 4HJ2A 1NM3A 3F8UA 1MEKA 2Z9SA 3HYPA 4WETA 3ZFBA 2OKAA 3ZITA 2XPEA 2L4QA 2H70A 1LJRA 2XPDA 1GL8A 2VM1A 1H4OA 4OFTA 2PU9C 2MBTA 1YY7A 4WF4A 5ECIB 3Q19A 3FZ5A 1GUMA 4ZIJA 2IMKA 2C0FA 2OJLA 1YEPA 3J7Yk 4FH8A 2RUEA 1RK4A 4GQCA 3H8QA 1B8XA 3F9UA 12GSA 3TKQA 3QR6A 4YQMA 2A4VA 2RIIA 4KNDA 4PQIA 2CA8A 1TTZA 2IMFA 3GTUB 2GGTA 13GSA 2DLXA 2OE3A 4WBRD 4KAEA 1YDKA 4PQHA 3EMXA 4Q5RA 4ZILA 3VI5A 3KEBA 4BA7A 5AGYA 3LEFA 4HEA2 1SJIA 4J2FA 1N8JA 1WMJA 2HZEB 2IMEA 2IJYA 1X9SB 3BCKA 3FR6A 1XVWA 2JACA 6GSXA 1BQ7A 3LXTA 1ML6A 3H93A 2LV3A 1OKTA 5H5QA 3DVWA 4MPGA 1B4PA 2CVDA 1M2DA 3ZZXA 4TR0A 3DD3A 3DWVA 5FWGA 3J7Yb 3H4KA 1WPIA 4CW9A 5IO0A 2DJJA 1A0FA 3ISOA 1Q98A 2LRNA 5DALB 1T4YA 6GSWA 2M46A 2PUKC 2H1AA 4MCUA 3R2QA 5CRHA 5ECNB 1XWAA 4NMUA 1URMA 1FAAA 3VFIA 4JE1A 3QOUA 4I6XA 4ECCA 1YKCA 1CQHA 1GTUA 2QKEA 2VLTA 3C1RA 3IRAA 5JWOB 1E2YA 2C0EA 3UOMA 3FR3A 1K0BA 17GSA 3CBUA 2GQMA 4K2DA 3FZAA 3RPNA 1AQWA 2VLVA 4NPBA 1QGVA 3LYKA 1GSDA 3UBKA 3WYWA 2K18A 1F9MA 4OCFA 3FEUA 5J3RA 3RAZA 1X5DA 1XCCA 3FYGA 2DBCA 3L9VA 1ERTA 2CV4A 1BX9A 2ZUPA 4IP1A 1NSWA 1USBA 2WFCA 1MDKA 4N11A 2C4JA 1BAYA 3WGDA 1Y25A 1G0TA 3VPQA 2WULA 2AV4A 1J9BA 3LWAA 1ERWA 1F2EA 5EL8A 2PERA 4TR3A 5CRDA 3VWXA 3HDCA 1TRVA 3GL5A 4L5LA 4RUVA 1I9DA 2IIYA 1M99A 4GWRA 4IKHA 1SJ6A 1ZCPA 3KM6A 2B5XA 2VCTA 3GIXA 4XHMA 1ERVA 2PWJA 4IP6A 5LCZA 3QFBC 2BJXA 1PGTA 3KH9A 1YQ1A 4TOPA 2G0FA 3ME8A 1AQVA 2YCDA 5D9WA 4MJBA 1VGLA 3DRNA 1LBKA 5DBQA 4IELA 3A3TA 2VD1A 1QMVA 2DJ2A 1FB0A 1GSEA 2J23A 3PINA 4POBA 1ILOA 3A2XA 4BVXA 4EDZA 2IFQA 4MLYA 5AIVA 3IE3A 3CSJA 3TRQA 1FB6A 3KIJA 3VWVA 2HLSA 2CQ9A 1GP1A 2FWHA 2YPMA 5HR3A 2RM6A 3GHAA 3RHCA 1O81A 9GSSA 1SU9A 2FHEA 1GLQA 5ELAA 4XS1A 5J41A 4LLRA 2QSIA 1FG4A 4O7HA 4KA0A 2H73A 19GSA 2YN1A 3TJFA 4XS4B 3VI7A 5L71A 2H75A 1T00A 3NOFA 2VLUA 4HOJA 2CX4A 3GUSA 5DQSA 3ZTLA 2VL3A 1OE7A 2JSYA 5IM9A 2ES7A 4PUAA 4F0CA 4K7OA 2L4CA 3P2AA 2VCXA 1R26A 2XBIA 5IO2A 2H8LA 4ZB8A 6GSUA 1NHYA 4K1FA 1ZOFA 1DE1A 1TI3A 4L5OA 3G7JA 4HS1A 2ON5A 2VD0A 4MF5A 3IAM2 2B7JA 3SWLA 4HU9A 2FNOA 4ML6A 2DMMA 3EINA 2I1UA 3QMXA 3GN3A 3P7XA 4IW9A 5D96A 5F07A 1FOVA 3H79A 3O6TA 1GTIA 3KXOA 3CXGA 4MJEA 2FUG2 1KTEA 5IMVA 1TRWA 1W4VA 1F6MC 2HRFA 2E2GA 2GQLA 2D2ZA 3CRUA 3US3A 3F6DA 4K7NA 1K0CA 5F05A 4AF2A 2CAIA 2CT6A 3ERWA 1RQMA 1S3AA 1WJKA 5DAKA 1EOGA 5CYYA 3ZVJD 4N0VA 4I2UA 2VCQA 2L6CA 2YJHA 2GVPA 5HR0A 1OC8A 4QQ7A 3VWWA 1A2JA 4TVEA 1EZKA 3ZLPA 3APQA 4POKA 5JCWA 4TW5A 3E3EA 1J08A 3EC3A 3ZRDA 2M72A 4LMWA 3TKRA 4LL4B 1UA5A 1TI1A 5FHIA 3LSZA 2LEGA 3QAVA 3TUEA 2IMIA 1TU8A 4V2NA 1HNCA 1EOHA 4NV5A 5G30A 1U6TA 2GSSA 20GSA 5E59A 5IOWA 2R4VA 1ZYQB 1OC9B 3GTUA 2YJ7A 3N5OA 1TXXA 1PX7A 5LNKe 4FO5A 3V1WA 5F06A 3GURA 3IK7A 4X43A 2C0GA 3IK9A 4KH7A 2HXKA 1H75A 1AXDA 2AHEA 5A4VA 1A23A 4MZCA 3TOUA 2AAWA 1GULA 2HZEA 4LMVA 1K3YA 3MNGA 5JCGA 2N5FA 5IMFA 3K8NA 5ECSA 2FA4A 5D93A 1TU7A 4MPFA 1THOA 4WF5A 2YV7A 4IGJA 3UMAA 1NHOA 4BPYA 4BVYA 2FLSA 5KN0A 2DIZA 1F37A 1PQNA 5LD0A 1GNWA 4MA9A 1A2MA 2C8UA 3BCIA 4O5RA 5F8BA 3OR5A 3UARA 2YV9A 1BEDA 1ZL9A 2XC2A 4DSRA 4IN0A 18GSA 3MAKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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