2LEGA

Membrane protein complex dsbb-dsba structure by joint calculations with solid-state nmr and x-ray experimental data
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHAYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-resolution membrane protein structure by joint calculations with solid-state NMR and X-ray experimental data.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein, oxidoreductase
source organism Escherichia coli
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
total genus 44
structure length 188
sequence length 188
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2legA00
4K0NA 3P8WA 5G30A 2GSSA 1YEPA 5G5FA 2GZYA 3PINA 4IN0A 2H19A 4RQXA 4WF5A 2LTKA 3VWXA 1GUHA 1X9SB 2FNOA 3GFKA 2HSHA 4HI7A 1TP9A 2C3TA 1T3BA 1QGVA 5E59A 4WR5A 4GSTA 1WIKA 3DEXA 4GXZA 1J9BA 2YV7A 2HE3A 1PKWA 3CTFA 4IP6A 4YAVA 2RUEA 1HYUA 2TRXA 2XC2A 4L5OA 4KDUA 1EP7A 1T00A 3CTGA 4DSRA 3Q18A 3MAKA 5IMFA 2CZ3A 4TR0A 1Z7RA 2F3MA 1SKWB 4K0GA 1QK8A 2G0FA 3WT1A 2PBJA 1A0FA 4WR4A 5IO0A 4EC0A 4EL1A 1LBKA 2A2SA 1O85A 2AYTA 4PGTA 1OVNA 2L59A 2CVDA 3HJOA 2IWTA 5JWQB 2H0HA 4K7IA 4MPGA 2C0FA 3C1SA 1PGTA 1EV9A 3LFLA 2F8AA 3VWUA 3HYPA 2HRFA 2N5FA 3KEBA 1YKCA 1AXDA 5IO2A 1BAYA 2B7JA 4ML6A 1EZKA 5ID2B 4G9HA 4Q5QA 2QSIA 5IQYA 1GL8A 2KP1A 5A4WA 5ECSA 2LSTA 2CT6A 2LNTA 3N9JA 4QL9A 2NDOA 2R6KA 5KN1A 3A2VA 4XHMA 2R37A 3WGXA 2FWFA 2O85A 3M9JA 3DMLA 2VL9A 4LL4B 4OD7A 3A2XA 4D73B 4MMMA 5HFIA 2RLIA 4CHSA 1GSQA 1JLVA 1TU7A 1F9MA 3IV4A 4G10A 2WFCA 3VURA 4GLTA 3I69A 1O7UA 2WULA 2R5GA 3EU3A 1GSUA 2DIZA 4CW9A 3LJRA 1K3OA 3MWHA 4N0VA 4N10A 1R5AA 1UN2A 4TXOB 3ME7A 3E9JB 1BYEA 4MK3A 4TRXA 2KHPA 4YH2A 1SJZA 1XCCA 1B9YC 1BQ7A 4O92A 1OE8A 1CQHA 1BG5A 4HZ4A 5EPFA 1WP0A 2GT6A 1S3CA 4AJ6A 3CSJA 5IM9A 2ON7A 1X9MB 2P5QA 4KB3A 2N5AA 4KDXA 2WDUA 3W8SA 3ERFA 2FUG2 3M0FA 1SL0B 2FWHA 2JZTA 2K8SA 2WB9A 1LJRA 3C1RA 3UJ1A 2LS5A 2Z9SA 4LMVA 3ERGA 1QFNA 1QQ2A 3ERWA 2TIRA 4DSSA 1FVJA 3C8EA 3D5JA 3ZYWA 4JEDA 1JHBA 3GH9A 5KN3A 4ECJA 1URMA 1UC7A 1THOA 4HS1A 16GSA 4OFTA 1XW6A 3VI7A 5J5NA 1F6MC 1TRVA 3ZMLA 5J3RA 5IPGA 2JZRA 4TR4A 1VRSD 5JCWA 1XWCA 2LKUA 5FT3A 3V1WA 4AJ8A 4GSSA 1KBNA 4K8MA 4MZCA 3EINA 2FA8A 2LNSA 3D21A 1IYIA 3VWVA 2KOKA 4F9ZA 1T7PB 2DJ1A 1WJKA 4BWSA 3IHQA 4FYBA 4K7OA 3F9UA 2H75A 3RAZA 4GTUA 3GV1A 1X5CA 2EC4A 3GSSA 3QAGA 2LQQA 3VPTA 2GQMA 1GLQA 2M80A 3DWVA 2WRTA 5ENUA 1PRXA 1YZXA 2CA8A 3DRNA 3GTUA 4IW9A 3HD5A 2VLTA 3Q74A 1DBYA 5GAND 3M8NA 5DAKB 3E0UA 4DVCA 4MH3A 3GKKA 4MZWA 4MA9A 1AUCA 2J9HA 1T8EB 4HOJA 1WOUA 5EL8A 1U3IA 1IYHA 2PU9C 4IJ3A 3LYKA 3CYNA 1GLPA 4LMWA 1MEKA 3EC3A 5CRGA 1X0RA 3L9VA 3IK9A 1R4WA 4K2DA 1G7OA 5ECOB 4J56E 2IPAA 4QL7A 3G7YA 1Z7PA 3TJGA 2GT5A 2M46A 4FH8A 3ZMKA 2VLVA 1OC9A 1FAAA 2PMTA 6GSVA 3GURA 5ID2A 1A2JA 1F2EA 2DSAA 4TR3A 1TDIA 1GUMA 5INYA 4XS4A 2HNLA 2BTOT 4HJ2A 3HJPA 4O7HA 5HQPA 1LU4A 3SBCA 3VK9A 1ZOFA 4FYCA 3AY8A 4FIWA 1A8YA 2HT9A 4G19A 5ECIB 2LRTA 1FOVA 1E6BA 4TR1B 3DXBA 3TKSE 4PQ1A 1TU8A 4PUAA 4MJBA 2GQKA 1TXXA 4HUAA 4HQZA 3TGZA 3DIEA 5CRDA 5DQSA 3F6FA 4F03A 1ZGNA 1HNAA 3LXZA 1PKZA 2AHEA 2E2MA 2V6KA 1XWBA 3F3RA 1ERUA 1AQWA 4GSNA 1RW1A 3GMFA 1ML6A 1Z5YE 2X8HA 3I6AA 4IKHA 1PL1A 1GTBA 1I5GA 3DVWA 1M9BA 1R7HA 1WMJA 1A2MA 1AAZA 1K0AA 2L5OA 3L78A 4E8HA 1AC1A 4KAEA 3GIXA 2BJXA 1A2LA 2IMFA 3DKSA 2H71A 3LORA 3UOMA 3D4MA 4KH7A 2D2ZA 5JCUA 2OBKA 1BEDA 5HR2A 2LJKA 1TK5B 2C0DA 4WETA 3UMAA 4K9ZA 4WBJA 2HZFA 3TRPA 3APSA 3MNGA 4MPFA 4IBPA 3GHAA 2GLRA 1F3AA 4Q5NA 3ZIVA 4GF0A 3C7MA 4GRFA 3KM6A 5ECKB 4ID0A 1G6YA 1VF1A 2IMEA 1TJDA 4DSQA 2L4QA 3BCIA 5HFKA 4F82A 1OYJA 2X99A 1EOGA 1SD8A 2DC5A 3FEUA 2LJRA 1MDKA 4JR4A 3IRAA 2VD0A 4AJ7A 2MZCA 1MDIA 4QQ7A 1THXA 5ECRB 2C8UA 2GVPA 1T4YA 2OBIA 4NV5A 3RBTA 1K3LA 1JZWA 5J4UA 1V40A 3FZ5A 4ZXGA 2NPBA 4N0ZA 1YEXA 5ABRA 3KH7A 3FZ9A 4ZILA 3M9KA 1SK0A 3FR3A 4K7NA 2FCHA 4EUYA 2I4AA 4OO4A 4MH2A 4RQRA 1H75A 2PPTA 2L57A 5HR1A 4BPYA 5IMZA 1FO5A 4ECBA 3RPPA 1XVQA 3EMXA 1TRSA 3ME8A 4MJAA 1WPIA 3GKNA 2YJHA 2VAFA 1UA5A 1W4VA 4ZBBA 3WT2A 2ES7A 3PR8A 2VUPA 3HVXA 1XXUA 3KXOA 2X64A 1M2BA 3TRXA 2XPEA 1R5PA 3IA1A 2MYGA 4NPBA 4KSOA 2A2RA 5D9WA 5CRWA 2V1MA 1Q4JA 2LRNA 5CRHA 1MTCA 3BD2A 2IMDA 2H30A 5B6NA 2YWOA 3GL3A 1WWJA 2OE1A 3IPZA 2CAQA 3ZL5A 3IR4A 2WS2A 2YNXA 1NSWA 4EDYA 3ZIJA 4PNGA 2TRCP 1SD9A 1GUKA 2IFQB 1OC8A 2WCIA 2IMIA 1GTAA 5D8IA 3A2WA 1AQVA 1V58A 3VI5A 4TR1A 3QPMA 3HDCA 2IL3A 3M1GA 5HFGA 5J9BA 3RPNA 1SYRA 4OMVA 3TKSA 5A5KA 3D0ZA 1DE2A 2C0EA 3HA9A 4IP1A 3M3MA 2H6YA 3EWLA 5A4VA 2JADA 5AISA 2OJLA 5DJLA 2YZUA 1HD2A 2DJ0A 5DALB 3LSZA 4IQ1A 4CDOA 2IN3A 2K9FA 3D6IA 3KJYA 1FHEA 3W8JA 3L9SA 2YPMA 1ZYQB 4L0UA 1FB0A 4V2MA 2HYXA 4N11A 3EMPA 4WBRD 4EVMA 2HRNA 4OWYA 2C1YA 3N5OA 3J7Yk 2EIOA 3IC4A 3GNJA 4WXTA 3FZ4A 3H1NA 3G9BA 3CRTA 3P90A 2P5RA 2QKEA 5IMCA 5DCHA 4K6XA 1UVZA 1TI3A 1XW5A 2B5EA 1B9XC 17GSA 1TOFA 4YQUA 4IQAA 4DEJA 4PURA 4KA0A 1AW9A 5L71A 2O89A 1G0TA 2RM5A 4XCSA 3UVTA 2R2JA 1J08A 2HZEB 3F4TA 2GZZA 4OCEA 3ED3A 1SENA 2RM6A 4F2IA 4F0BA 2B5YA 1M9AA 3TJKA 1TTZA 3FRCA 1F37A 5DVBA 1PQNA 4ECCA 11GSA 1FW1A 2L6DA 6GSXA 4PQHA 5F05A 4WF4A 4PQIA 1EV4A 2FLSA 5ELGA 2A4VA 2DMMA 2H66A 1F3BA 2CVKA 1AIUA 1VF4A 2YOIA 4J57E 3H79A 2NBSA 4ZL8A 2FA4A 3GYKA 1BJXA 1OE7A 2K6VA 1X5EA 4PXOA 2B7KA 1XWAA 5AN1A 12GSA 2FWGA 3WGDA 2C0GA 2V6OA 4O32A 3H93A 1XIYA 2HSYA 1YQ1A 5CYYA 2VO4A 4TW5A 2DJKA 5CAXA 2JSZA 2YWNA 4MLYA 4NXIA 2F9SA 2YJ7A 1FB6A 3L4NA 4BA7A 2B5XA 2FD3A 5G2ZA 3U6VA 2YANA 3KD0A 5H5QA 3TJFA 3D22A 1CQGA 3FYGA 3K8NA 1YJ6A 5DDLA 2CQ9A 4LA1A 1GSYA 4ZB9A 3UL3A 1TK8B 5C00A 1DUGA 3KTLA 3APOA 1XOBA 2LRCA 5J9CA 1A0RP 3ZLPA 1GNWA 4P3YB 2YWIA 1ON4A 2YV9A 1USBA 2H6ZA 3RHBA 2O7KA 2OA7A 4IS0A 4GCIA 1TK0B 3EU4A 3I43A 4GQCA 3BCKA 3W6GA 4EF0A 2XBQA 1XFLA 1U3AA 1PA3A 3TB2A 3GA4A 2FHEA 2GDRA 2CX3A 1HNCA 3ZVJD 4ML1A 4AF2A 4YQMA 3TOUA 3E3EA 2GSTA 4WEYA 1B8XA 3CMIA 4J2FA 4F0CA 3HVVA 2KP2A 4TKYA 3LWAA 1WE0A 3KZQA 1WRYA 2K8VA 4NMUA 2LUSA 2VCVA 3MSZA 4EDZA 3TJJA 2PUKC 3CSIA 5DQYA 2H1DA 2AUVA 1Z6NA 3EURA 2P0GA 1NM3A 3SWLA 2AB6A 1PX7A 5EVOA 2PWJA 1XWGA 1EGRA 2RUFA 2PGTA 1XW9A 3ZITA 2PVQA 1A24A 4KNDA 6GSTA 1EOHA 3ZREA 2MMNA 2QC7A 1S3DA 3WD6A 4D73A 4V1Ap 2H74A 3WGEA 4IELA 4ZL9A 3ISOA 1OC3A 3HZ8A 2HXKA 1JZOA 5CNWA 3QOUA 3UARA 5CO3A 1A23A 1PL2A 5IPHA 4LL1B 5G5EA 1YDKA 5ECHB 2OE0A 2DJ2A 2XPDA 2B1LA 4NHZA 3HJMA 4RUVA 1SK2A 1C72A 1XOAA 5CP1A 4TXOA 4KE3A 2VD1A 3BJ5A 4TN8A 1OAZA 1SKRB 1O8XA 3QMXA 2PVOC 2VL2A 2YN1A 2CV4A 1SK1A 2ZCTA 3QDNA 5AIXA 2GGTA 4I97A 2LEGA 1G6WA 1K0BA 2HZEA 2OKAA 3GX0A 4KGIA 9GSSA 2OACA 1GNEA 1VF3A 2DJ3A 1QXHA 3QCPA 4OFMA 3D4TA 2H73A 19GSA 4V2LA 3TDGA 1XBSA 5JWRB 1Q98A 4X43A 4HDEA 5DJMA 1FG4A 3OR5A 1TRWA 4RI7A 5D9TA 4MF6A 4ECIA 1VGLA 5G1LA 5CREA 3QFBC 3KCMA 5DBQA 1JLWA 2L4CA 5ELAA 3CSHA 1SJIA 5C04A 2VOCA 1YKAA 5JCGA 1GSDA 4EXJA 4POLA 1EEJA 5KN2A 5ECPB 4ISDA 2PERA 3S9FA 2VL3A 1K0NA 1PD21 2GZPA 5KEJA 3F8UA 4AGSA 3GKXA 1GH2A 2V2GA 2JL4A 3ZFBA 4FYUA 14GSA 2KUCA 2MBTA 3FK8A 3VLNA 2REMA 2CAIA 4JU5A 1XZOA 2DIYA 2AJQB 4KX4A 4MJCA 5GSTA 4MZBA 5F0GA 2H6XA 1OKDA 2H70A 1MDJA 3IE3A 5D9XA 2ZUPA 3TKSC 2ALBA 1M2AA 4POBA 1S3AA 4G2EA 3LEFA 5DAKA 1YF0A 5FWGA 4FO5A 4ZB6A 1SL1B 1GTIA 3IOSA 3A3TA 2H76A 3LG6A 4K1FA 4XTSA 3J7Yb 4MDCA 2C4JA 4TXVA 5AGYA 3C71A 4X1UA 5COHA 3TCOA 3O6TA 1TRUA 4IGJA 2ON5A 3ZTLA 4LLRA 1K0DA 1GWCA 2JACA 3EE2A 1ZL9A 1H4OA 4ZBAA 3GKMA 2B1KA 4HZ2A 3FY7A 4WKWA 3TKPA 1U88A 1M99A 3F4RA 4XIHA 1O8WA 5DCGA 4KUNA 2MBSA 3HXSA 1K0CA 1V98A 3FZAA 1A8LA 3FR9A 3GH6A 3GTUB 4NHWA 2DLXA 2H0IA 3FW2A 5AIVA 1GSFA 4ZL7A 4X0XA 2PN8A 3F63A 3CBUA 4MCUA 2EIQA 2DJJA 3EYTA 4V2NA 4MF7A 2VCQA 5IOWA 3BBYA 1EWXA 1ERVA 1TI1A 4HEA2 1Z3EA 1N8JA 2L6CA 2FWEA 3IAM2 3UBLA 1JZDA 1MD4A 5B7CA 1G7EA 1SU9A 3ZZXA 4ILFA 1KTEA 1OC9B 1MD3A 1K3YA 3UIWA 4KCEA 4ZB8A 4JRRA 1B4PA 1XWKA 4MABA 4XS4B 1B4QA 1RK4A 2B6MA 3Q6OA 2OE3A 3IXRA 4XS6A 4MP4A 3US3A 2QGVA 5GAPD 2VLUA 1XVWA 1GTUA 1NHOA 5B8BA 3KTBA 2C80A 4TVEA 4YQVA 3QAWA 1ACVA 4GQFA 1O81A 4XRDA 3IBHA 2M72A 3GUSA 3ZRDA 3UAPA 2R4VA 1DSBA 4IJIA 3P7XA 3RDWA 3VPQA 4POKA 1ERTA 3U5RE 2NTOA 2VCTA 4XS1A 3KMNA 5F07A 2GSQA 2WZ9A 4I2UA 5LD0A 2I3YA 2BMXA 1QUWA 3HY2A 2H1AA 2VCWA 2H1GA 18GSA 1RQMA 5ECQB 5LNKe 2V32A 1ZCPA 2C3QA 5D93A 5IOXA 2DBCA 5EY6A 4I6XA 2R3XA 2YCDA 3GSTA 3H8QA 4MJEA 1V2AA 3FKFA 1KNGA 3F3QA 2G2QA 13GSA 2LV3A 3TUEA 1Y6EA 4H86A 5B8AA 3VWWA 1ZYEA 3L9UA 2K18A 1T1VA 5LCZA 2WJUA 2N5BA 4KSMA 4EE0A 3CRUA 1BX9A 3TRQA 3HZ4A 1YY7A 3R2QA 3HVSA 3PGTA 5IMAA 1SKSB 1T4ZA 1XPVA 5D73A 4BWQA 3LQ7A 3IAS2 4L8EA 1E2YA 1TKDB 1B48A 4EO3A 3JCML 1ERWA 1U6TA 3HKRA 1YF1A 4O5RA 3TJBA 3FR6A 4ZBDA 1OKTA 4IVFA 2EIRA 3F4SA 3H4KA 1PX6A 4KDYA 2XBIA 8GSSA 1K0MA 4KW6A 3DYRA 4Q5FA 1ST9A 2C3NA 2VM2A 2IMKA 1PN9A 3HHVA 2KLXA 4JBBA 5HR0A 3WYWA 1GSSA 5F06A 2GS3A 3I9V2 2WGRA 4OO5A 5D9VA 20GSA 1JFUA 1GRXA 3ZFLA 4I2TA 1V9WA 2O8VB 1W89A 5GZZB 2CX4A 4MF5A 4JE1A 3Q19A 2GTUA 1QMVA 2L5LA 3KP8A 1GSEA 4JZQA 3QAVA 3A5WA 2HI7A 4JR6A 2O87A 3LXTA 4PX1A 3QD9A 2F8FA 3KGKA 4I5QA 3UVHA 2IFQA 1K0OA 2VL2C 1ABAA 3C73A 1O73A 2RIIA 2JU5A 6GSSA 2H72A 1I9DA 3L0HA 2HLSA 3TKRA 2YWMA 2HFDA 5ECMB 5G1KA 5H5SA 4TOPA 2CVBA 3RHCA 2E2GA 4OFNA 1KEBA 5F8BA 1EP8A 1DE1A 2P31A 2I1UA 2VCXA 3DD3A 2NVLA 4I8BA 1EEMA 2YP6A 4L5LA 2E0QA 5DALA 2LQOA 3IDVA 4NV2A 5FHIA 2F51A 1R26A 4EKZA 5H5RA 2ZNMA 3DVXA 1VF2A 1O6JA 4Z7XA 2I9HA 1M2DA 2OADA 4BVYA 3VFIA 2H1BA 3TOTA 1EGOA 5IIZA 2JZSA 2GQLA 3KMOA 4BL7A 1Z9HA 2E7PA 3CXGA 3NZNA 4RI6A 5IMDA 3GL5A 2MMZA 1X9WB 1ZZYA 3UEMA 6GSYA 2B3SA 4N30A 2VM1A 3HCZA 4HQSA 2DMLA 4ULXA 2VCZA 2VIMA 5KN0A 2FY6A 1GP1A 3GN3A 4HJMA 3LYPA 1PMTA 4NWYA 3EVIA 3LGCA 4YAPA 5JWOB 1SJ6A 4NAXA 2FGXA 1U87A 1Z6MA 2IIYA 3MDKA 5A4UA 2H0GA 3QFAC 3TKQA 4KCAA 2AV4A 3P2AA 3QR6A 2V41A 5E4WA 1J0FA 4HU9A 4XRAA 2JSYA 3KH9A 1ZMAA 22GSA 1M7TA 1N2AA 2CZ2A 3BOAA 3F6DA 5G31A 6GSUA 5ECLB 2X8CA 1GULA 1SL2B 3PH9A 1M0UA 2LJAA 2XHFA 3GRXA 4E8EA 6GSWA 2H01A 4POMA 3G7JA 2X8GA 3G7IA 4ZIJA 5IMVA 2GSRA 5HR3A 3KIJA 2I81A 1JZRA 1NHYA 3UBKA 4Q5RA 2J23A 2MMAA 3NOFA 1HQOA 3FHKA 5B6MA 1AQXA 1V57A 4HU7A 3F0IA 5ECNB 5J41A 4ACSA 5GSSA 4V1Ag 1NW2A 4GWRA 4OCFA 3IK7A 3O3TA 4BVXA 2IJYA 1Y25A 1X5DA 4L0WA 3NIVA 2H8LA 2YZHA 3GX8A 2AAWA 4PNFA 1TW9A 5D96A 3ZVJA 3APQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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