2LJKA

Solution structure of the oncogenic-potential mien1 protein
Total Genus 10
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
10
sequence length
117
structure length
117
Chain Sequence
GSMSGEPGQTSVAPPPEEVEPGSGVRIVVEYCEPCGFEATYLELASAVKEQYPGIEIESRLGGTGAFEIEINGQLVFSKLENGGFPYEKDLIEAIRRASNGETLEKITNSRPPCVIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Solution structure of the oncogenic-potential MIEN1 protein reveals a thioredoxin-like fold with redox potential
rcsb
molecule keywords Protein C17orf37
total genus 10
structure length 117
sequence length 117
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10262 Rdx Rdx family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ljkA01
5IOXA 1GRXA 4DEJA 5JCWA 4RI6A 2H1AA 2GZZA 2YJ7A 3LQ7A 2H6YA 2VM2A 4WBJA 1GLQA 4ZILA 1NSWA 2VO4A 2V41A 4IP6A 1B4QA 2YPMA 1Z9HA 5IIZA 3IE3A 1R4WA 3E0UA 3ZVJD 2ZUPA 4BA7A 4MK3A 2V32A 2DC5A 1FOVA 2H70A 5ECRB 2LSTA 2HRNA 3EINA 1ERUA 3TGZA 2JU5A 4QQ7A 3U5RE 3ME8A 3GMFA 1M2AA 2DMLA 1ZL9A 5AISA 2YN1A 5DQYA 1CQGA 1I9DA 1XWCA 5LCZA 2LJAA 2HT9A 2LJRA 1SL1B 1FAAA 4HQZA 1SENA 3KD0A 1B4PA 3GKNA 4OCFA 3IPZA 1K0MA 4GXZA 3J7Yb 3F6DA 3HJMA 4HI7A 4ZL8A 4GCIA 1PRXA 4WXTA 4MLYA 3HDCA 5FT3A 4PQ1A 4KDYA 4OO5A 1FB6A 3C71A 1X5EA 4XS4A 5DAKB 3CSIA 3F3RA 1OC3A 2OJLA 4EUYA 3KJYA 1MTCA 2FD3A 1WIKA 3IC4A 3GRXA 2A2RA 3WYWA 4YQVA 1OC9B 2P5QA 3A2VA 1KTEA 3KIJA 3GA4A 1UA5A 2VCZA 19GSA 5ELAA 1LU4A 2H75A 2LRCA 2OE3A 3TJJA 3CRTA 4TKYA 5IMFA 3IAS2 3QOUA 3TCOA 2IFQA 2V6KA 1EV9A 1A8LA 2JZRA 5IMCA 3C1SA 2BMXA 5KN0A 4EDZA 3HD5A 4IQAA 1ZYQB 4I2UA 3F8UA 5G30A 9GSSA 2H01A 4ZL9A 3VI7A 3F4SA 2WZ9A 4WKWA 1MDKA 3NIVA 4KSMA 1HQOA 3WT1A 3GTUB 3C7MA 1GSYA 1JZRA 4LMVA 3GX0A 5CAXA 4JE1A 2RUFA 3A5WA 3HY2A 1F6MC 5ECHB 4RI7A 2NPBA 3CTFA 3FR6A 5IPHA 1ACVA 2VCVA 11GSA 3CRUA 3HCZA 2ON5A 3ZRDA 4BPYA 2QGVA 3P90A 5G5EA 2HXKA 2FWFA 1FG4A 5DVBA 5AIVA 3DKSA 2R6KA 3QAGA 4K8MA 1GUMA 3HKRA 4EDYA 1WE0A 4KSOA 5B6MA 1S3CA 5CRWA 2GSRA 2R37A 2LNTA 4JR4A 1GULA 1ERVA 2F8FA 4G10A 2L5LA 3DVWA 4OWYA 5ELGA 5IMDA 3ZVJA 1OE7A 1XPVA 3ERWA 5EVOA 3DWVA 1JHBA 2YANA 4MABA 4N0VA 5A4UA 2D2ZA 3L78A 4KGIA 2H76A 4P3YB 3H4KA 5CRGA 1U88A 3UOMA 2I3YA 2F9SA 3QFAC 3IAM2 4K6XA 4E8HA 3NZNA 1KEBA 2REMA 3ZMLA 3TRPA 4ECCA 4BVXA 2EIQA 1GSUA 3BCIA 4FIWA 3RBTA 1OAZA 1PL2A 2B5XA 3G9BA 3GKKA 3M0FA 2PERA 4TR4A 2R2JA 1SK2A 1S3AA 4ECBA 2KOKA 2VCXA 2I9HA 4WBRD 3C73A 4O92A 5FHIA 1Z6MA 4PUAA 4WR5A 3RDWA 4MJAA 2WDUA 3FEUA 3L9UA 4EO3A 2WULA 4GQFA 3APOA 3FKFA 2GZYA 3HJOA 3CTGA 1K3OA 3TDGA 3UVHA 4POMA 1GUHA 1M7TA 3TJKA 2ZNMA 2K6VA 2XHFA 1FVJA 1A0FA 4X0XA 20GSA 2CAIA 4EVMA 3TB2A 3WT2A 3IBHA 2KLXA 3UL3A 3GL5A 2YP6A 1I5GA 1O85A 2QSIA 3L4NA 1M99A 5J41A 1Y6EA 3ZITA 2O85A 3QCPA 4CDOA 4ILFA 4XTSA 1Z5YE 2V2GA 1Z7PA 1OC9A 4G2EA 2YWOA 4YAPA 1WWJA 4XCSA 4RQXA 1J9BA 3CSHA 4MF7A 2WFCA 4TOPA 4ZIJA 1T4YA 1GSDA 3K8NA 4Q5FA 5F06A 4Q5RA 4ZBDA 4F2IA 2OE0A 1EGRA 3FZ5A 1O6JA 2LKUA 4KCAA 1W89A 3KEBA 2PMTA 3TRXA 2YOIA 4YH2A 5AN1A 6GSTA 2YV9A 2I1UA 1E2YA 1HNCA 3RHBA 2XPDA 3IHQA 2YZUA 3GN3A 1G6WA 2J23A 5ID2B 3GTUA 2B5YA 4OFNA 3QR6A 3ZYWA 3D21A 2CVDA 3LXTA 1GSFA 5B8BA 1G0TA 4FYUA 3MWHA 4GLTA 4NAXA 3I43A 3VLNA 5DJMA 3TJBA 2C0FA 1A2LA 3EC3A 5CO3A 4AJ6A 5COHA 3KM6A 2H0GA 2B1LA 2NVLA 2B7JA 4I97A 2PVQA 1J0FA 2F51A 4X1UA 1TOFA 4EE0A 2R3XA 5EL8A 2CA8A 1GUKA 2V6OA 1GNEA 1YKAA 1W4VA 4BL7A 3NOFA 3LYPA 2L5OA 3AY8A 2C3TA 1SKWB 2NBSA 1JZDA 2X8HA 3CMIA 1YEPA 3O3TA 2LS5A 2R4VA 1K0NA 2RM6A 1U3AA 3JCML 2BJXA 1V57A 4NMUA 3UBKA 1EOHA 2JACA 2HZEB 5IOWA 5J9BA 4AF2A 4OMVA 1KNGA 1H75A 2VL9A 2FLSA 4AGSA 16GSA 1B9XC 5D9TA 1SL0B 4O32A 1XWBA 4MMMA 3MDKA 1B8XA 3DYRA 3H8QA 3HYPA 3Q6OA 3ZZXA 4KH7A 4HUAA 1A2JA 4I2TA 3BOAA 2C80A 2XBQA 5HQPA 4MF5A 3TKSA 3HJPA 3QD9A 4TXOB 2G0FA 5G31A 1T4ZA 1XWKA 3J7Yk 2WS2A 4G19A 3QPMA 1A8YA 4XHMA 1GSEA 4V1Ap 2JADA 2K8VA 1AIUA 1XW9A 2CX3A 3GH9A 3WGDA 1TJDA 3FR3A 3P8WA 2H1BA 3BCKA 3HZ4A 2K18A 1O7UA 5FWGA 4OFTA 1IYHA 1UC7A 2DJJA 2YCDA 1YF1A 3QAWA 2J9HA 5GAPD 3LSZA 1TP9A 5HR1A 2CAQA 5DJLA 2AJQB 4I8BA 4PURA 4ECJA 4Q5NA 1JFUA 1R5PA 4FYBA 3IR4A 3GKXA 1TRWA 3GSTA 1V9WA 2PVOC 1GSSA 1RK4A 3L9VA 3Q74A 5GZZB 2C0DA 1X9WB 3CXGA 1HNBA 1TK0B 2VCTA 2B3SA 1PKZA 2KP2A 5G2ZA 2MBSA 2LQQA 1F37A 4PQIA 4TR0A 4HEA2 5ECKB 3ZMKA 2MZCA 1MDJA 4POLA 3ZIVA 4MPGA 2A4VA 3FK8A 4YQMA 4V2NA 4NWYA 2AHEA 2MMNA 4POKA 3APSA 2YWMA 5ECPB 3LG6A 4PGTA 3U6VA 3DGQA 3SWLA 1GTIA 1SK1A 4POBA 4DSSB 3A2XA 1O8XA 5H5QA 5ID2A 2VL2C 1CQHA 4V1Ag 2L4CA 4IJ3A 2IMFA 4PNFA 1G6YA 1T3BA 4L5OA 1Q98A 1SKSB 1K0BA 4EC0A 4NV2A 1LJRA 2FWGA 1OC8A 1NHOA 1JLVA 3FZ9A 1XIYA 1MD4A 4K9ZA 2MBTA 14GSA 2FA4A 3GIXA 3DEXA 1MD3A 5DALB 3G7JA 1K0DA 3ZTLA 3EURA 2JL4A 1VRSD 1GSQA 1X9MB 3O6TA 4LL1B 4GRFA 2X8CA 4YAVA 2CV4A 1PSQA 1OE8A 1AAZA 3HVVA 1ERTA 3F63A 4TR1B 2BTOT 3KP8A 1TTZA 3QFBC 3RHCA 3TKQA 1A2MA 1X0RA 2HSHA 1B9YC 3TRQA 3N5OA 3CSJA 4HJ2A 3ED3A 2HLSA 2LRTA 2DLXA 5CRDA 5B6NA 3UJ1A 4KW6A 4WETA 1XOAA 4CHSA 1NHYA 4IJIA 3LGCA 1ABAA 1THOA 4IVFA 3LEFA 4TRXA 5IPGA 4L0UA 5KN2A 4ML1A 3UMAA 4WF4A 3RPPA 4GSNA 3GX8A 1QFNA 1ZMAA 3TKPA 3G7YA 5H5SA 5ECIB 4K7OA 2M46A 4EL1A 1QXHA 2LNSA 4KAEA 1DSBA 1XWAA 3GYKA 1URMA 1PD21 2FWEA 1EOGA 1O73A 12GSA 1S3DA 2WGRA 1U6TA 5ECOB 1YKCA 1AXDA 3WGXA 4E8EA 1EEJA 5J3RA 1Q4JA 4LA1A 3PINA 1VF4A 2GSQA 2LJKA 4F0BA 3Q19A 4TXOA 2AAWA 1G7EA 1FB0A 1THXA 1R7HA 2IMIA 2IIYA 2WCIA 2LQOA 2WB9A 1F9MA 3D22A 5J4UA 3HXSA 1VF1A 1Y25A 5EPFA 2CX4A 2VLTA 2JSYA 1BYEA 1F3AA 1IYIA 3BD2A 4HU9A 2M80A 1EP8A 4OO4A 5HFKA 2F8AA 4MCUA 1ZGNA 3E9JB 5DQSA 2GQLA 3GKMA 2HNLA 2NDOA 3GH6A 4L0WA 1VF3A 3ZL5A 3D4TA 4XRAA 1NM3A 5HFIA 4ZB9A 3DD3A 3F9UA 4OCEA 2GT5A 2XC2A 3FYGA 1TRSA 1UN2A 3TOUA 1F3BA 1FHEA 2DIYA 1WP0A 3CYNA 1PX6A 4IELA 1PQNA 3D4MA 5L71A 5G1KA 3QDNA 4J2FA 3FRCA 2MYGA 4KUNA 4IQ1A 4RQRA 2QC7A 5G5FA 1SJ6A 3IOSA 1A23A 4QL7A 3KMNA 4DSQA 5ABRA 4IGJA 2H1DA 1XCCA 5DAKA 4D73B 3VWWA 5EY6A 4KNDA 4MJEA 4JR6A 4I6XA 3KMOA 2DJ0A 2B5EA 2WJUA 4XS1A 2C4JA 1T00A 1GH2A 4H86A 2XPEA 2P31A 3UARA 2WRTA 4MH3A 4HZ2A 5AIXA 3P2AA 4LLRA 1PMTA 5LNKe 1Z6NA 1MEKA 2B1KA 3BJ5A 3D5JA 2YWIA 2OADA 2N5BA 1G7OA 1TXXA 2FA8A 1TDIA 3EU3A 3GFKA 2H19A 3I9V2 4HOJA 1ON4A 2H73A 2TRXA 6GSVA 2L6DA 4MDCA 4XRDA 2CZ2A 1PL1A 1K0OA 2E7PA 4BWSA 4NHWA 3WGEA 5DCGA 2C0GA 4KA0A 3LFLA 3EU4A 1U87A 2OACA 3ISOA 4F82A 2DMMA 1XXUA 4MF6A 4KX4A 4ACSA 8GSSA 4FYCA 1RW1A 1N8JA 2C0EA 3IK9A 1QMVA 4MPFA 2C1YA 5CNWA 3FZAA 4GTUA 3M9JA 3VPTA 4PUFC 5C04A 5KEJA 1K0AA 3MNGA 3DXBA 1TU8A 2PBJA 7GSSA 3QAVA 4NHZA 1QUWA 1M0UA 4IKHA 1YEXA 3D0ZA 2C3NA 2HFDA 2N5FA 4OFMA 2IWTA 1K3LA 6GSXA 2P5RA 1XVQA 2GS3A 3EE2A 1X9SB 2PPTA 4MH2A 1SYXA 2Z9SA 4V2MA 2IMKA 5KN3A 3G7IA 4F9ZA 1M9BA 2YV7A 6GSWA 1E6BA 2RM5A 3GURA 1Z3EA 3W8SA 4EXJA 1HD2A 2H71A 3QMXA 2H72A 2H6ZA 2LUSA 4V2LA 2KHPA 2IMEA 1AW9A 1PX7A 4N11A 2VD0A 1TI1A 3GHAA 4HQSA 2R5GA 1MDIA 5D73A 5ENUA 4J56E 2EIRA 1SD9A 2V1MA 1TK5B 3VWUA 1TRUA 4HZ4A 2RIIA 2A2SA 1GWCA 3N9JA 5CREA 3ZREA 2I4AA 4IW9A 4K7NA 3KH9A 2OE1A 2CZ3A 4GF0A 1AC1A 1J08A 1TU7A 1A0RP 2HE3A 3MSZA 2X64A 1AQVA 5ECNB 5F0GA 4JBBA 3OR5A 5GSSA 3KP9A 1YY7A 3H79A 2EIOA 4L5LA 3ZFBA 2B7KA 3UEMA 5A4VA 5JWOB 3M9KA 4JEDA 5ECMB 1ML6A 1K0CA 2ALBA 3HHVA 2DJKA 4Z7XA 4HDEA 4QL9A 2VM1A 2EC4A 2GSSA 3ZFLA 3IRAA 2H8LA 4ZBAA 4K7IA 3UVTA 2VD1A 5CP1A 2LV3A 2LRNA 4HJMA 5C00A 2JZSA 1SL2B 3C1RA 3M3MA 5D9WA 1ERWA 1YF0A 2H6XA 2IN3A 1YQ1A 5A5KA 4D73A 4PNGA 5IO0A 2FY6A 4ECIA 4ML6A 3GUSA 3L9SA 2L6CA 2RUEA 4N10A 4GSSA 5GSTA 5KN1A 4NPBA 1ZZYA 2PU9C 4ZB6A 4K2DA 4FH8A 3PH9A 3FY7A 1M2DA 2ZCTA 4K0NA 3V1WA 2H74A 1WJKA 3BBYA 5J9CA 2M72A 1VF2A 4TXVA 2GT6A 4IN0A 1RQMA 1XBSA 3GSSA 3P7XA 3R2QA 3KTLA 2FCHA 4PX1A 3UBLA 4LL4B 4TN8A 2GTUA 2PGTA 2E2GA 1M9AA 4ZB8A 3VURA 1XVWA 4XIHA 3GL3A 5DDLA 2XBIA 4GWRA 3IV4A 4DVCA 3LORA 1YJ6A 1GTAA 2RLIA 6GSSA 3KTBA 1OVNA 2AV4A 2PWJA 1EEMA 2IPAA 2VLUA 6GSUA 1QK8A 3DVXA 5JWQB 1V58A 4Q5QA 4X43A 3TKRA 4IHUA 2OA7A 3IXRA 2HZFA 5DCHA 4KDXA 3KCMA 1X5CA 3ERGA 3FR9A 3VK9A 1BQ7A 4MZBA 5IMZA 5D9VA 3DRNA 5D9XA 3ZIJA 4GQCA 1WOUA 2LEGA 1TW9A 3HVXA 5JCUA 4I5QA 2FHEA 2KUCA 4ID0A 1GP1A 2O7KA 5B7CA 1JZWA 1U3IA 5ECLB 4ULXA 1YDKA 5F07A 5D93A 2DSAA 2AYTA 13GSA 4MZCA 2CVBA 4PQHA 2HRFA 1T8EB 2K8SA 3TJGA 1OKTA 1WMJA 1BG5A 2YWNA 1ZYEA 2FGXA 3GNJA 2HZEA 1BAYA 2VIMA 1O8WA 3UAPA 1B48A 1JZOA 3ERFA 3MAKA 2MMOA 2MMAA 4TW5A 4BVYA 3WD6A 5F05A 1OKDA 1AQWA 3EWLA 3F0IA 3PR8A 3VWXA 3A3TA 1K3YA 2E0QA 18GSA 3VWVA 5DBQA 22GSA 1PN9A 2LTKA 2CVKA 4O7HA 1UVZA 2O8VB 3IDVA 3US3A 5G1LA 2L4QA 2GSTA 2L57A 3VPQA 1OYJA 5HR0A 1F2EA 1NW2A 3LXZA 3F4RA 2OBKA 4JU5A 4NV5A 1VGLA 1XZOA 3W6GA 4N30A 3HZ8A 1R5AA 1PA3A 4MJBA 3FZ4A 1XW6A 1XW5A 1GTUA 2DBCA 1DUGA 2X99A 3L0HA 1EV4A 4J57E 3RAZA 10GSA 2DIZA 4OD7A 2VL2A 4FO5A 3IK7A 2IJYA 1C72A 2FNOA 2H30A 3IA1A 4RUVA 3M1GA 5J5NA 1DE1A 1O81A 3FHKA 4TR3A 3LJRA 3F4TA 4WF5A 5AGYA 3S9FA 2VOCA 5GAND 4F03A 5IMVA 5JCGA 4KB3A 3D6IA 3TOTA 3F3QA 2GGTA 3I69A 4IS0A 2E2MA 5ECSA 2PN8A 4ISDA 5CRHA 2YNXA 2FWHA 4EKZA 1SD8A 3HVSA 4JZQA 2GLRA 1V98A 2GQMA 2H0IA 5A4WA 1XFLA 1WPIA 3Q18A 4CW9A 3VI5A 1T1VA 3M8NA 5CYYA 2DJ3A 2P0GA 5ECQB 2H66A 5HR2A 2DJ1A 2B6MA 4KDUA 3LWAA 2IMDA 5IQYA 1PGTA 5D8IA 4DSSA 4XS6A 2L59A 4F0CA 1PKWA 2H0HA 1DBYA 3APQA 2AB6A 2AUVA 4HU7A 1SYRA 5IM9A 3O76A 2O87A 3TKSC 3KGKA 1SKRB 2N5AA 1FO5A 2TIRA 1ZCPA 1TK8B 3CBUA 4HS1A 3EYTA 4EF0A 1TKDB 5LD0A 4N0ZA 1SU9A 5IO2A 4MA9A 4XS4B 1V2AA 5DALA 2VLVA 2DJ2A 3ME7A 2VAFA 4TVEA 2H1GA 3H93A 2C8UA 2VL3A 4DSRA 1GNWA 4WEYA 2GDRA 1EWXA 1BEDA 1USBA 2CQ9A 2TRCP 3TJFA 1LBKA 4JRRA 4KE3A 4TR1A 3EVIA 6GSYA 4K1FA 4ZL7A 2ON7A 1BJXA 2VCQA 3KZQA 2FUG2 2VCWA 4MP4A 2VUPA 5INYA 5IMAA 4L8EA 1QGVA 4IBPA 1XWGA 1GL8A 2IFQB 4AJ7A 1TI3A 2HYXA 1EGOA 5D96A 2X8GA 3EMXA 5F8BA 4AJ8A 2O89A 2KP1A 2MMZA 2C3QA 4IP1A 1ZOFA 2F3MA 1FW1A 4K0GA 3TKSE 1ST9A 1H4OA 1AQXA 4GSTA 1TRVA 3FW2A 2YJHA 2JSZA 5E59A 4PXOA 3I6AA 1SJIA 3W8JA 4BWQA 3VFIA 1ILOA 2NTOA 5HFGA 4ZBBA 3PGTA 4NXIA 4YQUA 2HSYA 1GTBA 3LYKA 4WR4A 2PUKC 2I81A 3F6FA 2IL3A 3KH7A 4MZWA 3HA9A 1JLWA 1A24A 3KXOA 1YZXA 5H5RA 3UIWA 2CT6A 3ZLPA 2JZTA 3DMLA 1XOBA 4G9HA 2QKEA 2OBIA 2GVPA 3RPNA 4KCEA 1DE2A 2G2QA 3C8EA 2HI7A 1HNAA 1M2BA 1BX9A 1N2AA 1R26A 2OKAA 1WRYA 1SJZA 1EP7A 5E4WA 4MJCA 3DIEA 5B8AA 1GLPA 1Z7RA 1SK0A 3A2WA 3GV1A 5JWRB 17GSA 4ZXGA 1T7PB 1V40A 4LMWA 1X5DA 3E3EA 4O5RA 1QQ2A 2ES7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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