The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
91
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structure length |
91
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Chain Sequence |
MRIKGVVLSYRRSKENQHNNVMIIKPLDVNSREEASKLIGRLVLWKSPSGKILKGKIVRVHGTKGAVRARFEKGLPGQALGDYVEIVLEHH
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution NMR structure of the ribosomal protein RP-L35Ae from Pyrococcus furiosus.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Ribosomal protein
|
| source organism |
Pyrococcus furiosus
|
| molecule keywords |
50S ribosomal protein L35Ae
|
| total genus |
18
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| structure length |
91
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| sequence length |
91
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01247 | Ribosomal_L35Ae | Ribosomal protein L35Ae |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | translation elongation factor selb, chain A, domain 4 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4AC9 A; 4ACA A; 4ACB A; 1SQR A; 2LP6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1ELA A; 4CRE A; 4F48 B; 1P2K A; 4HZH A; 4CH2 B; 1ELD E; 2ZA5 A; 1ZTL A; 2FXR A; 1O3D A; 1DY8 A; 2ZHF H; 1C1Q A; 2F3C E; 2PKA A; 4AGJ A; 1O3F A; 2ZG0 H; 1WBG B; 1Z1I A; 1LMW B; 1PQA A; 4X8S H; 1AUT C; 4F55 A; 2CF8 H; 5C0T A; 2EI6 A; 1BT7 A; 2R3Y A; 5FPS A; 4RT0 A; 1V2J T; 3RXL A; 2VU8 E; 1HUT H; 2M5T A; 3KQB A; 1N8O B; 1W8B H; 3T62 A; 2ASU B; 2KAI A; 2B0F A; 3N7O A; 2BVR H; 2BD5 A; 2BZA A; 1LVM A; 5JPM H; 1NRS H; 4ZXX H; 5GXP A; 1J17 T; 2F9P A; 4ZHA A; 8LPR A; 4DT4 A; 2HGT H; 2AER H; 2QIQ A; 1Z6J H; 3PMJ A; 5I46 H; 2IPH A; 1CGJ E; 1GVL A; 1H9L B; 1P2N A; 1BOQ A; 1EJA A; 1VCW A; 4PRO A; 2CF9 H; 4P00 A; 3SW2 B; 2AIP A; 4YT7 H; 1SGQ E; 1VCQ A; 1JRT A; 3SO3 A; 1YPM H; 1AU8 A; 3A8A A; 2HVY B; 1Z8G A; 1JBU H; 1AHT H; 5TCA A; 1ZHR A; 2O8U A; 3ZZ5 A; 1KLJ H; 3LC5 A; 1RTL A; 3UUZ A; 1BMN H; 1O2K A; 1BB0 B; 4OS1 A; 2VIV A; 1AVW A; 3SND A; 1H9I E; 5C20 A; 1O2V A; 3BTM E; 5HIY A; 1GL1 A; 1ZGI A; 5LGO A; 3M5O A; 2BHG A; 1JIR A; 3TJU A; 1UCY H; 4I8J A; 1O2P A; 2EEK A; 4Q7Z A; 1FV9 A; 5HXF A; 1E35 B; 1CGI E; 2IJD 1; 4FUG A; 5EST E; 1E79 D; 1A0J A; 2GD4 B; 3SHC H; 1DM4 B; 1FY4 A; 3BEI B; 3ZZB A; 1H8H D; 2RCE A; 1B5G H; 3PV4 A; 1CQQ A; 3MNC A; 2TIO A; 2ZFP H; 4ACB A; 4BAO B; 1DLK B; 3E0N B; 1YPL H; 3SGB E; 4IGD A; 2ZEB A; 6LPR A; 4GAW A; 4MTB A; 5DN6 D; 3SV8 A; 1RJX B; 2QXJ A; 2Z3E A; 3QN7 A; 4ZRO A; 4R0I A; 3RM2 H; 4TWW A; 3ZYD A; 3UNR A; 1O0D H; 1BUI A; 1GJ7 B; 1RS0 A; 5AVD A; 4B6F A; 3F6U H; 2FI5 E; 1YWU A; 6CHA B; 4XBD A; 1IQI A; 1FAK H; 3KCG H; 1CT4 E; 1FNI A; 1TB6 H; 1VIT H; 2OD3 B; 1V2L T; 2HPP H; 3OFN D; 1UVS H; 1O3K A; 3UTU H; 2BD9 A; 1EOJ A; 3PO1 B; 3TGJ E; 1L1N A; 4RKJ B; 1WTH D; 2SGQ E; 9LPR A; 3S0N A; 5FL7 D; 4VGC C; 1T8N A; 3BTF E; 2RDL A; 1QIX B; 4AGK A; 1EPT C; 3V3M A; 3C27 B; 3OYP A; 5KGO A; 1DLE A; 3ZVF A; 3UQV A; 1PPE E; 3IG6 B; 2L74 A; 5DP4 A; 2SGP E; 4DIH H; 4ABB A; 1K1O A; 3L33 A; 3QGN B; 4JK6 A; 4X8T H; 5J4S A; 3SV2 H; 1PYT C; 1M9U A; 1TYN A; 3U28 C; 1EXF A; 3RUO A; 2ZFQ H; 1TRY A; 2B5T B; 3GDV A; 2EY4 C; 1RRK A; 2A4O A; 1TPS A; 2FX6 A; 3FKS D; 1SLW B; 2KR7 A; 3RLW H; 1L2E A; 2XCN A; 2J95 A; 3RXO A; 4H6T A; 1YPG H; 1AZZ A; 1XM1 A; 2SGE E; 1XUG A; 4AN7 A; 2ODQ A; 1B0E A; 2STB E; 2H6M A; 3ZV9 A; 2XNI A; 4NWL A; 1SGT A; 3KQD A; 1WCZ A; 4O03 A; 4XSK U; 2FOG A; 2A0Q B; 2FPZ A; 1MTN B; 2J98 A; 1UVP A; 2OBQ A; 1LTO A; 1DWD H; 5EQQ A; 5CHA B; 1UTJ A; 5DSF A; 1MAY A; 1GBA A; 1GBI A; 1PPZ A; 5DKM A; 1F0U A; 1TNK A; 1VJA U; 2J34 A; 5DK1 A; 1A4W H; 2Z3D A; 2FLR H; 1OYQ A; 3SNA A; 3GY2 A; 1BBR K; 1TX8 A; 4ZCN A; 1GJ8 B; 1PQ8 A; 4I8K A; 1SHY A; 2PUQ H; 2QF3 A; 1AB9 C; 4H42 U; 1QZ8 A; 2UWL A; 3QZQ A; 1YC0 A; 1P05 A; 2F83 A; 2UUY A; 1OWD A; 1MTS A; 1TGT A; 3CS0 A; 5ETX A; 1DPO A; 1SGN E; 2CJI A; 1NS3 A; 2VB0 A; 3O8D A; 4CHA B; 3SUD A; 4BAM B; 1C9P A; 1NBM D; 3VB6 A; 1HAP H; 1OWJ A; 1SGF A; 2OC7 A; 4I86 A; 1HAH H; 3HPT B; 1F0R A; 1OP0 A; 2Q6F A; 3FZD A; 3LGT A; 4TPI Z; 5CMX H; 5L2Y H; 3WWB A; 2VIW A; 1BRU P; 1P09 A; 3ATL A; 5C17 A; 4X0W U; 1FLE E; 3RU4 D; 3MI4 A; 1MD7 A; 4RN6 A; 3U69 H; 1AND A; 3MO6 A; 1KDQ B; 1GJ4 H; 2O8L A; 1ZSL A; 3SV6 A; 3AK5 A; 2GZ8 A; 1AUJ A; 3ZVG A; 2RFK C; 1ZPC A; 1V2K T; 1W0K D; 5GND A; 4FVD A; 4MPW A; 1GBL A; 2H1U A; 5PTP A; 3EGK H; 2VVU A; 3SUG A; 8EST E; 1D3T B; 2VID A; 3HK3 B; 2C90 B; 5EOD A; 1EP6 A; 9EST A; 1HIA B; 1QCP A; 1AFQ B; 1WTG H; 2W3K A; 2Y7X A; 1JOU B; 3KQE A; 3HGP A; 2J38 A; 2H9T H; 1WQV H; 1HYL A; 4X1N U; 3ZZ3 A; 1HAV B; 1CHG A; 4UFG H; 4Y0Z E; 1O2N A; 1PQ7 A; 2WV9 A; 2XC0 A; 3LGI A; 3A83 A; 1PFX C; 2ZKS A; 3QWC H; 3SJI A; 2VH0 A; 1ELF A; 1MH0 A; 1QY6 A; 1CT0 E; 1W13 U; 1GCT C; 3RXJ A; 3GDS A; 3HGN A; 1NPM A; 1Y3U A; 4ZAE A; 1Z8I B; 4IS5 A; 2KZ4 A; 3LJJ A; 5FBI A; 3PWC A; 2EST E; 3NRL A; 1UCY E; 1ZPB A; 1O38 A; 2ZQ2 A; 3PMB B; 4CBN A; 1H1B A; 3EE0 B; 1KXF A; 1V2Q T; 1NRQ H; 4X6P A; 1KXD A; 2WYG A; 4ZUH A; 4BTU B; 1UTP A; 4XD7 D; 4YT6 H; 3SU3 A; 5B6O A; 5DP8 A; 2ZP0 H; 2BY8 X; 2FEQ H; 5GJ4 B; 2G4T A; 2ZFS A; 5EQS A; 1ELC A; 3HKI B; 3SZN A; 4ABI A; 3VXE H; 1NZQ H; 2KCY A; 2XWB I; 3PYH A; 4ABJ A; 1IQH A; 3O8R A; 2FO9 A; 1F5K U; 2FES H; 2QA9 E; 2VVC A; 4RI0 A; 3IIT A; 4I32 A; 3FOA A; 3P8F A; 1UW7 A; 1PPF E; 1O2I A; 4Y76 A; 2BLW A; 2ZGJ A; 4YLQ H; 2G52 A; 3GY5 A; 1P2O A; 3LGV A; 3BIU H; 1KY9 A; 4YXW D; 1HAY B; 4X1S U; 2Z9G A; 5E0H A; 4Q2K A; 1C1O A; 5G4B A; 1ZTK A; 2BOK A; 1QNJ A; 1BHX F; 3UOU A; 3RXD A; 3GY7 A; 2LEL A; 2UUF B; 1C5T A; 3MMG A; 1C2D A; 3NUM A; 3N7E A; 1QGF A; 2D1J A; 1GPZ A; 1SOT A; 1XKB C; 4X8V H; 3SNB A; 1O35 A; 1DIC A; 2QN5 T; 1WXR A; 3M7Q A; 1FY3 A; 2BX3 A; 3DD2 H; 2AMP A; 5E0G A; 1YBW A; 1GHV H; 1QQU A; 1XUJ A; 2WZQ A; 4GVU A; 3NPS A; 1O5A B; 1NFW A; 2FTL E; 2WPJ S; 2QF0 A; 2QAA A; 1VR1 H; 2A4R A; 5E2O A; 4Y79 A; 3AAU A; 1WDI A; 4K1T A; 2GMT C; 5EOK A; 1O3I A; 2A5I A; 3QZR A; 1L1J A; 1DWE H; 1Y5B T; 1KLT A; 1RD3 B; 3TGK E; 2GCH F; 2XBX A; 5JB8 S; 2OXS A; 2P8O B; 2XC5 A; 3STI A; 2YNA A; 3ZVA A; 3ZVC A; 1UO6 A; 4IW4 E; 1COW D; 1GHW H; 4WXI A; 4X8U H; 3SYJ A; 3QDZ B; 1NT1 A; 1K0H A; 1SLV B; 3RXU A; 2JDI D; 1W7X H; 1S0R A; 2NU2 E; 1DVA H; 1TPA E; 1JXP A; 1OWH A; 3RXF A; 3Q3K A; 5F8X A; 3O8B A; 4JZD H; 5CE1 A; 5JBA S; 3UNS A; 3TH3 H; 4OS7 A; 3URD A; 1BBR H; 2J94 A; 4E7R G; 2F43 B; 3KNX A; 4FXG H; 4NSY A; 4X2W A; 5TCC A; 2C8Z B; 1MKW K; 2AEI H; 1EZS C; 1A2C H; 1TNH A; 4ABD A; 4DUR A; 1FXY A; 4MNY A; 1ABJ H; 2A32 A; 5DG6 A; 4D9Q A; 1YLN A; 1D3Q B; 1FUJ A; 3E3T A; 2F9V A; 3A7Y A; 1H9H E; 2Z9J A; 1HXE H; 2TBS A; 1KDQ A; 4JZI A; 3F68 H; 5FBE A; 1GJA B; 4M9F A; 1ZGV A; 3M5N A; 1Z7K A; 3A82 A; 4O3T A; 2BY6 X; 4AOQ A; 2BXT H; 3F9F A; 1OPH B; 4AYV B; 1C1M A; 1DIT H; 1QRW A; 4ZHL U; 4OGY A; 1ELB A; 3FP8 E; 1A5H A; 1C5M D; 1ZOM A; 4X6N A; 3W94 A; 3P8G A; 2GCT B; 1ZZZ A; 1YCP K; 1HIA A; 3SN8 A; 3F9H A; 2PKS C; 1DUE A; 3HKJ B; 3F2F A; 3D49 H; 1A3E H; 3KF2 A; 3QGJ A; 1ARB A; 1MMJ N; 1P06 A; 1S82 A; 1HAV A; 2HWL B; 3MO3 A; 3FO8 D; 5EQR A; 4FUC A; 4AYY B; 1MUE B; 2ZGH A; 1Y8T A; 3TGI E; 5GWZ A; 1AI8 H; 2B8O H; 3BF6 H; 4A7I B; 1O3L A; 1J15 A; 3UWJ H; 2H2Z A; 4U30 A; 1A0H B; 3A86 A; 1F0T A; 2FYQ A; 3DFJ A; 2FOB A; 1PPC E; 4HG6 A; 4XFQ A; 2OBO A; 1UTN A; 2ZF0 H; 1KXB A; 1QA0 A; 3OU0 A; 4B1T A; 2YMS C; 1CO7 E; 3SU6 A; 1GBD A; 2C8Y B; 2F9N A; 2G5V A; 1TX7 A; 5C67 A; 1DX5 M; 1TGC A; 3TK9 A; 2TGA A; 2ANK H; 1O5F H; 3BG8 A; 1G9I E; 2BD8 A; 3T29 A; 1TNI A; 2PSX A; 5I25 A; 2W6J D; 1DUA A; 2ZCH P; 2QYI A; 5EPY A; 4KTS A; 4KTU A; 3SJ9 A; 3BG4 C; 4KTC A; 4NIY A; 4FUF A; 1TIO A; 3OAA D; 1UMA H; 1NU7 B; 2VNT A; 1SQA A; 2Y82 A; 4AFQ A; 2OLG A; 5DO4 H; 1TMB H; 4U32 A; 1Z8R A; 2BQ7 B; 5EXN A; 3NZI A; 1VIT F; 1S6L A; 3PB1 E; 4GPG A; 1FON A; 1KIG H; 5T6D A; 1NRR H; 1AKS B; 3PRO A; 1TQ0 B; 1IQL A; 3LDX H; 2YOL A; 1HFD A; 1AMH A; 4D7F A; 2PWX A; 1B0F A; 4MVN A; 4XBB A; 3VB3 A; 1MBQ A; 1NU9 A; 3F9G A; 3LH1 A; 3SZE A; 3Q00 A; 1SBW A; 1O5C B; 3U9A H; 2DUC A; 1TNG A; 1DWC H; 2WPL S; 3M3S A; 4RKO B; 1C1P A; 1S81 A; 4Y10 E; 5AFY H; 4ABE A; 1RTF B; 1H8I H; 2K1Q A; 1C2L A; 1KLI H; 4DT7 B; 4ZHM U; 2FOM B; 4NA7 A; 1TMT H; 4GCH F; 1P9U A; 3SI4 H; 1CGH A; 1O5E H; 1LHD H; 2VWM A; 1ZLR A; 2J98 B; 1S5S A; 2PUX B; 2ULL A; 1T4U H; 1FX0 B; 2AGG X; 2QC2 A; 2C8X B; 3W1E A; 1NN6 A; 3VXF H; 3UR6 A; 1GI7 B; 1KYN A; 2XOK D; 4BAQ B; 3A80 A; 4M7G A; 1O2U A; 1FY5 A; 2BD4 A; 1LPZ B; 1NBM E; 3OEH D; 1P0S H; 4K8Y A; 3N7D A; 2GZ7 A; 5EW1 H; 1EAT A; 1MAX A; 1O2Q A; 1QL8 A; 2XTT B; 1H4W A; 1W11 U; 3SJ8 A; 4XBC A; 1K1L A; 1TWX B; 1TAB E; 2XBV A; 1OP2 A; 3EA7 A; 1AE8 H; 4D7G A; 1NFU A; 1IQN A; 1V6D A; 3RXB A; 4BXS A; 4UE7 H; 3SOR A; 1ANC A; 4LK4 A; 3RU4 E; 3CS7 A; 1AE5 A; 1C5R A; 2Y7Z A; 3LON A; 5L30 H; 2ZCL P; 1XX9 A; 5C1U A; 2AIQ A; 1P3E A; 1V2O T; 4FU8 A; 4DOQ A; 1GHZ A; 1G36 A; 1ZTJ A; 2BLV A; 3NK8 A; 1NRP H; 2NWN A; 1BTP A; 1GBK A; 4JK5 A; 3SU5 A; 3U1J B; 1GBM A; 1AWH B; 1O31 A; 3QK1 A; 1O3J A; 1O3M A; 4LOY H; 1C5O H; 4TSF D; 1LHE H; 3SNE A; 3I78 A; 5DP6 A; 1CA0 C; 4Z1M D; 1NFX A; 3MO9 A; 5EJZ A; 2ZQ1 A; 4AB9 A; 1OS8 A; 3GCH B; 1E1R D; 3M61 U; 2GDD A; 1BTW A; 1GJ6 A; 1VGC C; 2BY9 X; 1BBR E; 3U1I B; 2BB4 A; 3URC A; 3KGP A; 1RIW B; 2ZPS A; 3K65 B; 3ODF A; 1VCP A; 3U8T H; 2HPQ H; 4J1Y A; 1XUH A; 1OSS A; 2VIP A; 3QX5 H; 1OYT H; 1SGD E; 4ISI H; 4OS6 A; 1MKW H; 4FOU C; 4ABG A; 1K1N A; 1UTM A; 1ORF A; 2ZCK P; 1FIW A; 1HJA C; 2EI7 A; 4CRD A; 4DII H; 1T31 A; 2SFA A; 1GI4 A; 3RXT A; 4GHQ A; 2ZGB H; 5DP5 A; 1RFN A; 5BRR E; 1MAB B; 3RLY H; 2PTN A; 2BM2 A; 2QE7 D; 3MQK C; 2Z6B D; 2V3M A; 2EC9 H; 3MYW A; 4WVP E; 2WPD D; 4NG9 H; 2ODY B; 3VEQ B; 2P3F H; 1O2O A; 1GG6 C; 1G37 A; 1IQG A; 3GIS B; 1BIO A; 3LKW A; 1BMA A; 1RTK A; 2J4I A; 4KGA A; 1MTU A; 5HIZ A; 1Y5U T; 5EGM A; 3A85 A; 4U2W A; 4RSP A; 1GHA F; 1YCP H; 1Q3X A; 3EE7 A; 1WYK A; 1EP5 A; 1UVU H; 3OSY A; 1O36 A; 1O2X A; 2XBY A; 2ZNK H; 3PV5 A; 2OTV A; 3VB5 A; 3FN8 A; 2GGV B; 4FUE A; 2RG3 A; 3PRB A; 2VIO A; 1BDA A; 3UAI C; 1Z71 A; 2BDA A; 1PPH E; 1TMU H; 1YPE H; 4WME A; 5T3H A; 2GT8 A; 2RDE A; 4FUH A; 3FZZ A; 3M37 A; 2D26 C; 3SOS A; 2O9Q A; 2O8M A; 2K0Q A; 1RGQ A; 2W6I D; 3AAV A; 3SJK A; 1QR3 E; 2VBC A; 3LGW A; 3VGC B; 1T8M A; 1ZMN A; 1XXF A; 2QV1 A; 5A8X A; 1QL7 A; 3MU5 A; 1EAI A; 2VVV A; 2F9B H; 4D76 A; 2K8I A; 1NRN H; 3K6Y A; 3RXA A; 3SU1 A; 3OY6 U; 2QF4 A; 4UDW H; 2JET B; 3MU0 A; 1N8O C; 2FMJ A; 2PHB A; 4CRB A; 1AKS A; 5DPA A; 2A1D B; 1P12 E; 1BTH H; 1EAS A; 2OC1 A; 4ZKS U; 3MH7 A; 5FX6 A; 3SBK A; 1HPG A; 1QUR H; 2BTC E; 2PGB B; 1GI9 B; 2ZFF H; 3DCL A; 2ZIQ H; 3E0P B; 5C0U A; 1TBQ H; 1A5I A; 1MKX K; 2KCO A; 2GCH G; 1UTO A; 3GOV B; 1IHT H; 1GHB F; 1C1U H; 1BTX A; 3PLK A; 2GJG A; 5GCH F; 2BZ6 H; 1KSN A; 1GBH A; 1MCT A; 3DSP A; 1PJP A; 3VG8 A; 4ZMA H; 1G2M A; 3S9A A; 2J97 A; 1TQ7 B; 5C3N A; 1GL0 E; 1Y59 T; 1XVO A; 3RC5 A; 1SPJ A; 5EU8 A; 4B2C A; 4WMF A; 2WHX A; 2OC0 A; 1HV7 A; 1GI5 A; 1TLD A; 2NU4 E; 1GI8 B; 2SGD E; 2FP7 B; 4NCY A; 5EIY A; 3M3V A; 4Q4L A; 2ZI2 H; 1FN8 A; 3ZZA A; 4BAK B; 4JZF H; 3TIU A; 5L2Z H; 4A5T S; 1O3E A; 2XRC A; 4F4O C; 1G3E A; 3SU4 A; 4WF8 A; 3UB0 A; 1SGI B; 3BN9 A; 5DJ7 A; 1YY3 A; 1SHH B; 3P70 B; 2A5K A; 1TGB A; 2WUC A; 1AY6 H; 4AB8 A; 1EZQ A; 1O32 A; 1MQ6 A; 1PPB H; 3STJ A; 4A1X A; 2B9L A; 3S9B A; 1AD8 H; 1P57 B; 5A0C A; 2J2U A; 1MTW A; 2BD3 A; 4UFE H; 1GDN A; 1C1N A; 1BRC E; 1XUF A; 3D23 A; 1P8V C; 1HRT H; 4B74 A; 1C5V A; 1OWI A; 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