2LQQA

Oxidized mrx1
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
88
structure length
88
Chain Sequence
MVTAALTIYTTSWCGYCLRLKTALTANRIAYDEVDIEHNRAAAEFVGSVNGGNRTVPTVKFADGSTLTNPSADEVKAKLVKIAGLEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mycoredoxin-1 is one of the missing links in the oxidative stress defence mechanism of Mycobacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative glutaredoxin Rv3198.1/MT3292
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 24
structure length 88
sequence length 88
ec nomenclature ec 1.-.-.-:
pdb deposition date 2012-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2lqqA00
3KMNA 4G19A 1GLQA 3HD5A 4EL1A 1U6TA 3QOUA 2ALBA 1GSQA 3BJ5A 1Z6MA 3S9FA 1EGRA 2M72A 4ID0A 1F37A 2H74A 4IW9A 2OA7A 2VL3A 4PQHA 3RPPA 2AV4A 2LJKA 2RM5A 4KH7A 4E8EA 1PN9A 1ST9A 3KGKA 2C3NA 1G0TA 1XW6A 2HXKA 4GSNA 2BMXA 4POLA 13GSA 1SK1A 2KLXA 1EWXA 5DBQA 3IV4A 3UVHA 2CVBA 4V1Ap 2H1GA 3A3TA 3F6FA 1IYIA 3LYPA 4OD7A 1BG5A 2R6KA 2YJ7A 3ZTLA 3NOFA 1K0AA 5DCGA 1WP0A 4EDYA 4F82A 1A8LA 2I81A 2JZRA 2YZHA 3TKRA 4I8BA 4JEDA 2AYTA 1F3AA 2DIZA 2H6XA 1RK4A 4IP6A 3J7Yk 18GSA 1OE8A 3CYNA 3SWLA 3UBLA 2WRTA 3GL3A 1W4VA 4DSSA 2CV4A 3PINA 3W8JA 2ZCTA 2M80A 3W6GA 4LMWA 1GH2A 4G10A 3DGQA 1GRXA 2WJUA 5EL8A 2NPBA 1DUGA 2CVDA 1WMJA 4KW6A 4ILFA 2L59A 3BCIA 2LSTA 4PQ1A 2DJ2A 2LJAA 3W8SA 5DALB 2GTUA 3WT2A 1R4WA 2E2GA 4XRDA 3ZL5A 5F0GA 1V98A 4GCIA 1FVJA 3KXOA 2VCZA 1TP9A 2F8FA 2MBSA 1PX6A 3L78A 1QQ2A 2ZNMA 5DJMA 3WYWA 5CRGA 4KNDA 4JBBA 3RHCA 4JRRA 5DCHA 4XS1A 5ABRA 2B7JA 4WKWA 2V32A 3CRUA 2H75A 4IN0A 4J56E 1GUKA 3DRNA 2OADA 2RLIA 5IMAA 4GXZA 2HYXA 5AN1A 4QL7A 2LRCA 1OKTA 2XBQA 4K2DA 4ML1A 2PU9C 3TRXA 3NIVA 4HOJA 1EV9A 1TKDB 2GZZA 2H0IA 2WGRA 2LNTA 3F9UA 2WCIA 1BQ7A 1SKRB 2GSTA 2JL4A 2O89A 2H19A 1AQXA 3HY2A 3WGEA 4P3YB 3E3EA 2NDOA 1GTUA 3EINA 5HFIA 3ISOA 2FHEA 1JZRA 4OCFA 3HZ4A 1FO5A 2RUEA 3GIXA 5KN3A 2YJHA 2V2GA 1EGOA 1ML6A 1SD8A 4LLRA 4RQRA 4IVFA 4DSSB 4D73B 3UOMA 3A2VA 5ECQB 4MZWA 1ABAA 2FWFA 1G6YA 2IMDA 1EV4A 3GNJA 3GV1A 3ZFBA 2LTKA 2L4QA 5AIVA 1SYXA 3GKKA 2VLUA 2R3XA 1NHYA 2LJRA 1V2AA 3EC3A 4TOPA 3HJPA 3G7IA 3LFLA 2NTOA 3KEBA 2LRTA 4X0XA 2G2QA 2HZEB 2EIQA 1BX9A 5IM9A 4KSMA 3F0IA 1YKAA 1YF1A 2NBSA 2E7PA 2VCXA 5KN1A 1O85A 4ACSA 1TRUA 3TJKA 3L4NA 5J3RA 1U3IA 2GT6A 4POKA 4PNGA 2C0FA 3MAKA 2H1AA 3TKSC 2JZTA 5CNWA 4RI7A 1AXDA 4DEJA 1FAAA 5HR1A 2H8LA 3GRXA 1PD21 1ZCPA 5G31A 3D4TA 1WRYA 4JE1A 2FLSA 3C71A 3DD3A 3N9JA 3IK9A 2GGTA 2VLVA 5J5NA 3VLNA 2IN3A 1JLWA 2VL9A 3HZ8A 1SL1B 1DE1A 2GSQA 1JHBA 4TN8A 2OE1A 2PVQA 5COHA 4WR4A 1WPIA 5H5RA 4H86A 3UVTA 1YZXA 3VWUA 3ZFLA 2EIOA 4Q5NA 1M7TA 2VCTA 2HZFA 3ZRDA 3QPMA 1UN2A 2FUG2 2CVKA 2VL2C 4MPFA 5C04A 1H4OA 2H6YA 2XPDA 1YKCA 3AY8A 3L9VA 1UVZA 3I9V2 3TJBA 4LA1A 1OKDA 4F0BA 5J4UA 4WEYA 1HNBA 3O6TA 2FWHA 1F2EA 1K0BA 3LGCA 5IMCA 2VAFA 1WJKA 4BVYA 1T00A 2B6MA 4MLYA 2LV3A 3KP9A 1QK8A 3QAWA 5A5KA 1PA3A 1EP7A 1GSYA 3ZMLA 4ZBBA 3M9KA 3M3MA 1TK0B 2H76A 3GA4A 4IBPA 2TIRA 3VURA 2C0DA 3KIJA 3LQ7A 3TCOA 1M2BA 2VOCA 4NXIA 4X1UA 3FEUA 4KCEA 5B8AA 14GSA 2HT9A 1Y6EA 4O7HA 3KM6A 4MH2A 4ZL8A 2LEGA 4NHZA 1R5AA 3GH6A 3M9JA 4GWRA 4K7IA 2TRXA 4TXVA 3GMFA 5E4WA 5A4WA 4HQSA 5G5EA 2B3SA 2YWMA 3F3QA 2GDRA 1OAZA 2IMKA 1GTAA 2HLSA 2N5AA 2FA4A 3D5JA 1PQNA 5INYA 4TR1B 4ECIA 4HZ4A 4OFMA 3C7MA 2E0QA 2FA8A 3Q19A 3D0ZA 3DEXA 1PL1A 3ZIJA 2I4AA 1RQMA 2VIMA 1J9BA 4XIHA 1IYHA 3APQA 3EMXA 4HDEA 3CMIA 1ERVA 2JU5A 1WE0A 4EE0A 3P8WA 22GSA 3VI5A 2V6KA 4NAXA 1WWJA 5GAND 1A23A 5FWGA 4NV5A 6GSVA 11GSA 3N5OA 3FYGA 2FNOA 3F3RA 4KSOA 3LEFA 2H0GA 2P0GA 5G1LA 2IMIA 4QQ7A 1VRSD 3GSTA 2IMEA 4GLTA 2LKUA 4MJEA 1TK8B 3E9JB 3CSIA 5ELGA 2K8SA 1X5CA 2HE3A 2AUVA 3DKSA 3LXZA 2I3YA 4IKHA 5D93A 3PR8A 5E59A 4KX4A 3TOTA 4MZBA 3BOAA 4ZBDA 4ECCA 5IPHA 1QGVA 3QAGA 1AUCA 5HR0A 2HNLA 4F9ZA 5GAPD 3P90A 3TJJA 2E2MA 2L4CA 5FHIA 2B5YA 2DJJA 4LL1B 5ENUA 1HNAA 1PX7A 2WB9A 3CRTA 1X9MB 2DC5A 5ECOB 1EP8A 1M9AA 4FYUA 3FZ5A 4O32A 3H4KA 2WDUA 3GFKA 3A2WA 1XPVA 5JWOB 2RUFA 4HEA2 3CSJA 5ECPB 3HXSA 5ECLB 1W89A 1Z3EA 1X9WB 4YAVA 3TKPA 2VM1A 2LNSA 2H1BA 5GZZB 1B9YC 1X5EA 3CBUA 3V1WA 3TJFA 1VF4A 2R4VA 4K9ZA 2J23A 1PGTA 5HFGA 5ID2A 2IFQA 4WBRD 4Z7XA 4EKZA 1YF0A 1MEKA 3PH9A 3MNGA 3DXBA 2DMLA 4KGIA 4WR5A 4TRXA 2MMOA 2QC7A 1EOGA 1TW9A 2WS2A 3GTUA 4MZCA 3L9UA 1GSSA 1KTEA 4HU7A 1SL2B 2YPMA 3BBYA 3H79A 1SKWB 3QFBC 1A0FA 1K3LA 5IIZA 3GH9A 1OC9B 1N8JA 3C8EA 4EF0A 1KNGA 1A24A 4ZL9A 4F2IA 4KE3A 3MSZA 1PKZA 2R37A 2O87A 1DE2A 1O6JA 2O7KA 3KP8A 4V1Ag 2EIRA 3ERWA 1ZYQB 1Q4JA 5ECRB 1GP1A 2H73A 4XRAA 2R2JA 4EVMA 1XFLA 2YOIA 4K6XA 4Q5RA 2JSYA 3FZ4A 3DWVA 4PX1A 1JFUA 5CO3A 4MJBA 3JCML 2N5BA 1B4PA 4K0NA 2PBJA 2C3TA 1JZDA 1XWGA 4GSSA 1BEDA 1QXHA 1A0RP 5KN0A 4TVEA 3CTFA 1GSDA 2K6VA 4OCEA 3KTBA 1FW1A 1TI3A 1V40A 2XC2A 5EY6A 1O81A 4AJ8A 1TDIA 2J9HA 3ZZXA 1GWCA 3D21A 2FY6A 5GSSA 1SK0A 1THXA 4N11A 5H5SA 4I97A 3KZQA 2GT5A 3FK8A 3ME8A 1T7PB 2C1YA 3RAZA 1TK5B 1R7HA 1GLPA 4ECBA 2GQMA 1MDIA 2FWEA 3NZNA 1E6BA 5EVOA 5LNKe 2VD0A 2C80A 4KDUA 5JWRB 1XWKA 3K8NA 5AIXA 4O92A 4EUYA 3ZVJD 2H66A 1K0MA 1XZOA 1ZYEA 3TRQA 4NHWA 2OBIA 4IJ3A 4N30A 5AISA 5J9BA 4WXTA 1HNCA 2MMAA 4TXOA 2AHEA 2F8AA 2OE0A 2YANA 3R2QA 3FR9A 4JR6A 5J41A 1SJZA 1SU9A 1M2AA 4L8EA 3D22A 1Z7PA 4AJ6A 1KBNA 4ZIJA 2YWNA 1Y25A 5B8BA 2G0FA 2B1KA 1XWBA 1S3CA 1KEBA 3MDKA 3ZYWA 2XBIA 1XBSA 1SYRA 1FG4A 1TI1A 1XW9A 3QDNA 4O5RA 4CW9A 2JACA 2CAQA 1SENA 4FO5A 1S3AA 2IWTA 4PQIA 3H8QA 2H71A 2VM2A 4ZB6A 1NM3A 3UBKA 3VPQA 1XOBA 1GTIA 5CYYA 1TU7A 4MF5A 1A2MA 4L5LA 4MDCA 2REMA 2QSIA 1S3DA 2C8UA 1XVQA 1K3OA 4TR0A 4PGTA 2XPEA 12GSA 3I43A 4YQMA 3QAVA 2IPAA 4I6XA 2DLXA 2F51A 2ON5A 3G9BA 1U3AA 3DVWA 1XOAA 3EMPA 4MJCA 1CQGA 3LJRA 1Z9HA 3IRAA 3ED3A 1GULA 3H1NA 4BA7A 4L0UA 3RPNA 3DVXA 5D96A 1HYUA 4L0WA 1TRWA 5ECIB 1XW5A 1DBYA 3UARA 3F63A 5A4VA 3FHKA 3ZIVA 4FH8A 2OACA 4IS0A 16GSA 1MD3A 1PSQA 3GUSA 2H0HA 4OMVA 4HJMA 4HJ2A 4TXOB 3VWXA 3KH7A 5HR3A 4JZQA 1M99A 3RDWA 4LMVA 3IDVA 1M9BA 3O76A 2CZ2A 3VFIA 4KUNA 4I5QA 2H01A 1TJDA 5CRHA 4DVCA 2PN8A 3KCMA 3IAM2 1SL0B 3UIWA 3WGDA 2OKAA 3C1SA 4XS6A 2P5QA 2GZPA 2TRCP 1NHOA 5IQYA 5CREA 3APSA 2O85A 3UMAA 3TKSE 5D9XA 3VI7A 2L5OA 4MMMA 4XS4A 3Q18A 4YQVA 3GX0A 2F9SA 3GKNA 4F03A 2C0EA 4KDYA 1OC8A 2PUKC 1OE7A 4OFTA 4GQCA 4ZB9A 3BCKA 1AW9A 1XIYA 2KP2A 5LCZA 4IGJA 4PXOA 4WF5A 5D8IA 3E0UA 3D6IA 1YQ1A 5B6NA 4NMUA 2A2RA 1ILOA 4HU9A 1F6MC 1VF1A 4DSRA 4J57E 2YCDA 5CRWA 1EOHA 2CT6A 1R5PA 2L6DA 1RW1A 3BD2A 4EDZA 2KUCA 3VWWA 2V6OA 3U6VA 3FW2A 1LU4A 2K18A 2C0GA 2OJLA 4NWYA 3FY7A 1T4ZA 2N5FA 1HQOA 4N0VA 4I2TA 1MDJA 5IO2A 3ZITA 3HYPA 3RBTA 3A2XA 4MK3A 4N0ZA 2XHFA 5F06A 3G7JA 4AJ7A 2YV7A 3FZ9A 1YEXA 1A2JA 4POMA 3UJ1A 5IMVA 3IOSA 2VUPA 2GSSA 3ZREA 2JZSA 1GNEA 4MCUA 5D73A 5G5FA 2IMFA 3HVXA 1GSFA 1JZWA 4MP4A 1WOUA 4FIWA 4FYCA 2V1MA 5H5QA 2H70A 1K0CA 3IE3A 1TRVA 1GUMA 5AGYA 1UA5A 1T1VA 2P5RA 4ZILA 3KD0A 5DALA 2AB6A 3HDCA 2YWIA 3TUEA 3IAS2 2DBCA 1GUHA 1GNWA 1T3BA 4XS4B 5F8BA 5CAXA 3VWVA 1B9XC 2KHPA 4YAPA 5DJLA 3GN3A 4QL9A 2X8HA 1EEJA 1GTBA 1NW2A 1WIKA 4XHMA 8GSSA 4MA9A 3A5WA 3VK9A 3SBCA 2DIYA 2NVLA 3HVSA 5ECNB 1C72A 1CQHA 4AF2A 3ZVJA 4IHUA 4K0GA 2YNXA 5IO0A 2OBKA 5IPGA 4L5OA 5IMDA 4ML6A 2RM6A 5D9WA 1XWAA 1YDKA 2MZCA 3IC4A 3M0FA 5C00A 3CXGA 1PRXA 4ULXA 3H93A 4TR4A 1ERTA 2HRNA 2X8CA 3IHQA 1AC1A 4TR3A 2L5LA 1YJ6A 3M8NA 1OC3A 5B7CA 2QGVA 5ELAA 1BJXA 2DMMA 1VF3A 5HFKA 3Q74A 3GKXA 4ZB8A 3CTGA 3IA1A 4JR4A 5IOWA 5KN2A 1ACVA 1SD9A 5KEJA 3LSZA 6GSUA 3VPTA 4K8MA 1TU8A 1PL2A 3D4MA 1HD2A 4ZXGA 6GSWA 3GKMA 5ECKB 4IJIA 4IQ1A 5DDLA 2R5GA 4AGSA 2B7KA 4GF0A 4D73A 2A2SA 4G2EA 4WETA 3CSHA 2V41A 3ZLPA 4G9HA 5HQPA 4K1FA 4BWQA 5IOXA 2X8GA 1EEMA 4Q5FA 9GSSA 2HFDA 1J08A 3FR6A 4MF7A 4ZBAA 3ZMKA 2Z9SA 17GSA 2MMZA 1U87A 4X43A 2LUSA 4OWYA 2VCVA 4JU5A 4E8HA 2K9FA 2WZ9A 4PUAA 2GQKA 1TTZA 1ZGNA 2MYGA 2HZEA 3M1GA 2M46A 1GSEA 5GSTA 2YWOA 2BJXA 1FB0A 2H6ZA 1R26A 2O8VB 2GS3A 4HS1A 3PGTA 2ZUPA 2LS5A 3IXRA 4NPBA 1LBKA 1XXUA 4KB3A 1OVNA 2RIIA 1A8YA 1T8EB 3EWLA 3RHBA 19GSA 4LL4B 3TRPA 3MWHA 2WFCA 1Q98A 3WT1A 5L71A 2VO4A 3IBHA 4NV2A 3GYKA 3ERGA 3J7Yb 2K8VA 1SKSB 3HJOA 1ERUA 5J9CA 2AJQB 3IR4A 1A2LA 5EPFA 3I69A 4MF6A 2YP6A 4FYBA 3G7YA 4IP1A 3F4SA 3P7XA 1YEPA 3DYRA 4EXJA 3L0HA 5ID2B 4RI6A 5B6MA 2IFQB 2IJYA 1Z7RA 6GSXA 1AQVA 1J0FA 1K3YA 3EURA 3TB2A 1JZOA 1M2DA 2H1DA 1LJRA 3ERFA 2VCQA 1DSBA 3F8UA 3GTUB 2CZ3A 2H72A 3DMLA 5F07A 4XTSA 4KA0A 1V9WA 3LORA 2L6CA 4V2LA 2VLTA 3FZAA 4MH3A 3GURA 1XVWA 1O73A 2GVPA 1I5GA 2P31A 3LYKA 3QR6A 1F9MA 2ON7A 3C1RA 1UC7A 4IELA 1BYEA 5DQYA 2X64A 5G30A 5D9TA 3GX8A 4XCSA 3FKFA 1G7EA 1SJIA 1EZKA 1ZMAA 3APOA 3FRCA 3HJMA 2HSYA 4K7NA 5D9VA 4GSTA 1TXXA 2X99A 1ZOFA 3I6AA 5DVBA 3QFAC 3U5RE 3QCPA 2GQLA 3TKQA 2C4JA 3WD6A 1AQWA 2DJ0A 2I1UA 4PURA 1GL8A 4IQAA 2FGXA 2YZUA 1K0NA 2L57A 2HSHA 1ERWA 1N2AA 4BPYA 4YQUA 2AAWA 5DAKA 2LQQA 4OO5A 1SK2A 3ME7A 2EC4A 3HVVA 2QKEA 4HI7A 2YN1A 1JLVA 1K0OA 2KP1A 4TR1A 4WBJA 3US3A 3F4TA 1F3BA 1NSWA 3TDGA 5FT3A 1X9SB 2OE3A 3WGXA 2YV9A 2F3MA 3LG6A 1THOA 1AAZA 2B1LA 1QFNA 3LWAA 4OO4A 4ZL7A 2GLRA 4TKYA 5IMZA 5HR2A 6GSYA 4RQXA 3UEMA 3LXTA 1XWCA 1V57A 2PERA 2WULA 3TJGA 5DQSA 2CQ9A 4HQZA 1B4QA 3HHVA 2CX4A 1OYJA 2HI7A 2LQOA 5ECHB 4RUVA 2H30A 1YY7A 3DIEA 2BTOT 4POBA 4KAEA 4MABA 2CAIA 1PMTA 5JCWA 1U88A 1O7UA 3TGZA 4OFNA 2B5XA 3OR5A 1ZZYA 2MBTA 3O3TA 3GSSA 3F4RA 4HZ2A 3UL3A 4Q5QA 1Z6NA 1FHEA 3L9SA 1K0DA 5JCGA 3HA9A 6GSSA 4BL7A 3IK7A 2PWJA 3EE2A 10GSA 1X0RA 4I2UA 5ECSA 2JADA 4GRFA 5CP1A 4CHSA 1M0UA 2DSAA 3Q6OA 1GSUA 2VD1A 1FOVA 4BWSA 3EYTA 1MTCA 3GHAA 4PUFC 1I9DA 1H75A 3EU4A 1B8XA 1MD4A 5CRDA 2PGTA 2IL3A 3QD9A 1SJ6A 2A4VA 2LRNA 5A4UA 20GSA 2FWGA 1V58A 2I9HA 4DSQA 2B5EA 3IPZA 2DJ3A 1E2YA 1VF2A 3UAPA 3EU3A 1XCCA 1Z5YE 5DAKB 4KDXA 3QMXA 4ISDA 1O8WA 3KJYA 4BVXA 2DJKA 4EO3A 3EVIA 4GTUA 2PVOC 1O8XA 1FB6A 1TRSA 4KCAA 3HCZA 3HKRA 1ON4A 2VCWA 2FD3A 1TOFA 2C3QA 2GZYA 4J2FA 1X5DA 3GL5A 1B48A 2KOKA 2IIYA 5JCUA 4ECJA 2CA8A 5G1KA 3TKSA 1BAYA 3P2AA 4N10A 1FVKA 4HUAA 4F0CA 1G6WA 1T4YA 3KTLA 2DJ1A 4PNFA 4EC0A 5LD0A 3FR3A 2ES7A 1URMA 4YH2A 3KMOA 5JWQB 1QUWA 5ECMB 3TOUA 4MPGA 4MJAA 2FCHA 3KH9A 2MMNA 1PKWA 1MDKA 2PPTA 2HRFA 4GQFA 4K7OA 5IMFA 1OC9A 4WF4A 4V2MA 1USBA 3C73A 1AIUA 2GSRA 2JSZA 2PMTA 5F05A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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