2LQQA

Oxidized mrx1
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
88
structure length
88
Chain Sequence
MVTAALTIYTTSWCGYCLRLKTALTANRIAYDEVDIEHNRAAAEFVGSVNGGNRTVPTVKFADGSTLTNPSADEVKAKLVKIAGLEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
publication title Mycoredoxin-1 is one of the missing links in the oxidative stress defence mechanism of Mycobacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative glutaredoxin Rv3198.1/MT3292
total genus 24
structure length 88
sequence length 88
ec nomenclature ec 1.-.-.-:
pdb deposition date 2012-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2lqqA00
4TRXA 4V2MA 5IQYA 4PNFA 3G7JA 3CRUA 4IN0A 2H73A 2ES7A 4F03A 1XOAA 4G2EA 1EV9A 2LTKA 3I9V2 3P7XA 4D73A 3UARA 1PKWA 3GMFA 3ZRDA 1F2EA 1DBYA 20GSA 3M9KA 2WDUA 4GCIA 4HQZA 1T4YA 4OO4A 2NBSA 1U88A 3SBCA 2H0IA 2JSZA 1PKZA 1HNAA 1AQWA 1V58A 2B1KA 3G7YA 2OKAA 3APOA 2L4QA 5CRGA 1JHBA 2HSYA 1XFLA 1ST9A 1XW5A 2OADA 1O6JA 2IMKA 4WR4A 4DSRA 2C1YA 3F4SA 4ML6A 5G2ZA 2VCXA 1R5PA 2R2JA 2YWIA 1MD4A 1O8WA 4WR5A 1GSSA 3GNJA 2EIOA 1SYRA 6GSTA 1X5EA 1YEPA 2MBSA 4KX4A 4XS6A 2JACA 3CSIA 3C7MA 2P0GA 5DCHA 1A24A 3F8UA 1SYXA 3N5OA 5ID2B 1JZRA 5FHIA 1LJRA 2GDRA 1Z9HA 2CAQA 4MZBA 4PQ1A 2LS5A 4L5OA 5ENUA 2C8UA 3P90A 2E7PA 2ZCTA 5E59A 2RM5A 5J3RA 5ABRA 4MDCA 3FZ4A 4PQIA 2AUVA 5GAPD 3VFIA 3DD3A 1ACVA 2I4AA 2LSTA 2WGRA 2YV9A 4TR1A 1OC8A 3KM6A 2LUSA 1WWJA 1E6BA 1TU8A 4L8EA 2HLSA 2O87A 4KE3A 3J7Yb 2K9FA 1AIUA 1F3BA 1TDIA 4O7HA 1TJDA 3F3QA 2H1BA 1XW9A 5HQPA 4K7IA 3FR6A 1AUCA 1SK0A 1UC7A 3C73A 3Q6OA 1J08A 1A2MA 2WZ9A 4GF0A 2VLTA 5CP1A 4EC0A 4IBPA 5CYYA 4GSTA 2LJRA 4HZ2A 2X64A 1NW2A 3EURA 5H5RA 3PGTA 4WKWA 4LA1A 3ZVJA 3IXRA 1G0TA 1SL0B 3GYKA 1WP0A 3FZAA 2R6KA 3HVVA 4JZQA 1UN2A 3DYRA 3RDWA 1YY7A 3TB2A 1QUWA 1PL2A 2CZ3A 4ZL8A 3A2WA 5KN0A 4F9ZA 5JWOB 4IJIA 2OA7A 4I2TA 1AXDA 1Z7PA 3KH9A 3ZIJA 2B6MA 4ZXGA 1FB0A 4I8BA 4WEYA 2A2SA 2CX4A 2H6XA 1AQXA 4X43A 4F0BA 3VI5A 4OWYA 3HA9A 2GZYA 4FH8A 2QC7A 5J4UA 1GUMA 2GSQA 1XXUA 1FVJA 1U87A 3FK8A 3EYTA 3QFAC 1JFUA 2EIQA 2IMDA 3EVIA 1X5DA 1QXHA 4O92A 2VIMA 3UVTA 2LJAA 3Q74A 5DBQA 1BAYA 5LCZA 2LNSA 1N8JA 3H4KA 3EMXA 2JU5A 3E3EA 3RHBA 4PNGA 1A0RP 3ERWA 4KH7A 3KH7A 1ML6A 2M72A 3F63A 3ZVJD 3IA1A 2CA8A 3TJBA 1DE1A 3LGCA 3TCOA 5IMCA 4N30A 2QKEA 2AYTA 4WF5A 1XCCA 4IW9A 1GP1A 1PN9A 2L57A 3U6VA 2YV7A 3D4TA 3ZTLA 2GZZA 18GSA 1FO5A 3LJRA 4IVFA 4HU7A 1NHOA 4MA9A 5CREA 1TK8B 1QGVA 5IPGA 1GLPA 2VLVA 4ECIA 2CV4A 1BJXA 2LRTA 2LQOA 4ULXA 4PGTA 3GRXA 2VAFA 2I1UA 1TRUA 4KW6A 4L0WA 2C80A 2JSYA 2M46A 2F8AA 3V1WA 1K3OA 3GIXA 4DVCA 1OAZA 1TK0B 2KUCA 4WF4A 4MF6A 1C72A 3TRPA 1WOUA 4ZL7A 4OCEA 2EC4A 3UIWA 2CZ2A 1QMVA 4TR4A 5HR1A 4PUFC 3DKSA 3FKFA 1TRSA 5GAND 2PGTA 3S9FA 1FVKA 4HJ2A 3LXTA 4J57E 4GSSA 2IIYA 3IAS2 2R3XA 3DRNA 3F4TA 1ERUA 3C71A 2L5OA 2HFDA 5DVBA 5JWRB 4YQMA 10GSA 4J2FA 4NXIA 2JL4A 5DQSA 1EGOA 1OKDA 2YOIA 3IK7A 3KTLA 1HNCA 3UMAA 4YAVA 1ERVA 3WYWA 1OVNA 4MJBA 2O8VB 2L6DA 2DJ3A 3IDVA 2IFQB 1TRWA 5LD0A 1BYEA 3IPZA 1SJ6A 1MEKA 5F05A 5ECMB 4EE0A 1SU9A 3KZQA 1O8XA 1QQ2A 3HKRA 2E2GA 1IYIA 2J23A 3D4MA 1A0FA 2FWFA 1UA5A 2YZUA 3WT1A 4IELA 2EIRA 1T00A 2HXKA 5B7CA 1EV4A 4GQCA 4EDYA 3ZMLA 3LWAA 1H4OA 2QGVA 1HNBA 2V1MA 3GSSA 3DXBA 4GRFA 2KP2A 4HS1A 3LFLA 2N5FA 17GSA 1UVZA 2HZFA 3C8EA 2VCWA 3WGDA 1ZYQB 2VL2A 5G5EA 5B6MA 2NVLA 4WXTA 1MDIA 4OO5A 4YH2A 4K0GA 2XBQA 5EPFA 3GHAA 3F0IA 5A4UA 3TKQA 1XZOA 4MMMA 2YJHA 3TOUA 3NOFA 1FB6A 5ECSA 4H86A 1XOBA 2MMOA 3IBHA 1R4WA 4V1Ag 2NTOA 2V2GA 1TTZA 2AJQB 2IMEA 1KEBA 2VUPA 2MBTA 4Q5QA 4LMWA 1GNWA 2C0DA 2H0GA 2VO4A 4PQHA 4XS4B 3TRQA 3VPQA 1XWGA 1XVQA 2CVKA 5F8BA 2LRCA 2DJJA 3GURA 2VL9A 1G6WA 3CXGA 1ERTA 5HFGA 1PQNA 2MMZA 2OE3A 4BWSA 4QQ7A 2H71A 1JLWA 5F0GA 11GSA 1U3AA 2KP1A 3EE2A 3HJMA 4KB3A 3CSHA 1XWAA 4ZBDA 1RK4A 5DCGA 1S3AA 1TI1A 2WFCA 1KBNA 3ED3A 2H66A 3F4RA 1O81A 3DGQA 4HQSA 4OFMA 1AC1A 4BA7A 2VD1A 4NWYA 4LMVA 4K2DA 3UJ1A 5IMDA 3BOAA 4J56E 3F9UA 4V2NA 2CVBA 4N11A 1SL2B 3UL3A 3LXZA 4V1Ap 5AISA 3J7Yk 5F07A 1Z7RA 1V40A 2R37A 3F6FA 1XWKA 1M99A 5G5FA 3BCIA 1RW1A 2IFQA 1VF4A 2IWTA 1SL1B 1PD21 3CMIA 4NV2A 4HZ4A 1GH2A 2P5RA 2GTUA 1TW9A 4EUYA 2PU9C 3O3TA 1HQOA 1WE0A 1YJ6A 3W8JA 1ZMAA 4MJCA 2HSHA 2DMLA 1JLVA 2GGTA 4FO5A 2LJKA 2H19A 3GA4A 2REMA 3BD2A 1XWCA 2OE0A 1G6YA 4PXOA 4P3YB 1HD2A 4FIWA 9GSSA 5C00A 5COHA 2X8HA 4XTSA 4CDOA 3SWLA 2VD0A 5AIVA 4HUAA 1R5AA 2GSSA 2YZHA 3KTBA 4NHWA 2X99A 2GSTA 2YP6A 5CNWA 2TIRA 4KDUA 3NIVA 3C1RA 3GKKA 3L9SA 1GULA 2FHEA 3I6AA 2FGXA 3HCZA 4F82A 5IMFA 2B7KA 4EKZA 3FEUA 1FW1A 3U5RE 2GLRA 3DWVA 3A3TA 4POMA 1X9MB 5J9BA 3L9UA 5ECNB 4AJ6A 2WCIA 2H6ZA 4K7OA 1B8XA 4V2LA 5JCGA 3UEMA 3D5JA 4POBA 6GSWA 5IIZA 4POKA 3C1SA 3GH9A 4XS4A 2RUFA 3CYNA 4MZWA 3HZ8A 1V57A 5D96A 1G7OA 3P2AA 1FOVA 3IV4A 5HR0A 4ID0A 4KAEA 4BVXA 4IP1A 5A5KA 3HD5A 2VL2C 3Q18A 5B8BA 4KA0A 3VK9A 3F6DA 2WRTA 1K0OA 4WBJA 3PR8A 3KP8A 3RPPA 2V32A 3UBKA 4IHUA 4IP6A 3E9JB 3ZL5A 3GTUB 1CQHA 3IHQA 4DSQA 5GSTA 3TJFA 3IK9A 3QAWA 4K1FA 2LQQA 1ZCPA 4EXJA 1YQ1A 2QSIA 2FA8A 2P5QA 2OACA 2VCVA 2E0QA 4TVEA 1ZZYA 4AJ7A 3EWLA 1DUGA 5ECOB 1MDKA 5AN1A 1I5GA 5G1KA 3APSA 5KEJA 1SENA 3GN3A 4XRDA 2GT6A 3LG6A 1F6MC 3RBTA 1PGTA 5J41A 5D73A 2I3YA 2YWNA 1F3AA 1XW6A 2PBJA 1NHYA 4ML1A 5L71A 4CHSA 5IOXA 4Z7XA 2H74A 1EP7A 4ZB8A 2O85A 1GSYA 2NPBA 3GX0A 2H1DA 4OD7A 7GSSA 4Q5FA 4AJ8A 5AGYA 2G0FA 1GWCA 1ZL9A 1TKDB 1OC3A 5ELAA 2C4JA 2HE3A 1TXXA 2O89A 1BG5A 3TJGA 2OJLA 2CQ9A 1BX9A 1MDJA 2KOKA 5G30A 4TN8A 3BBYA 5FWGA 4KCAA 1JZDA 3HVXA 4EL1A 1AW9A 3DVWA 4KSMA 1GNEA 3KEBA 3CRTA 5HFIA 3W8SA 2IN3A 5D93A 3IC4A 4ZILA 3FR3A 3FW2A 2AAWA 5ID2A 4MH3A 2RUEA 2AB6A 3CBUA 2JZSA 3KD0A 4ECBA 5HFKA 4IQAA 5AIXA 1PMTA 4EDZA 2DJKA 3QDNA 4AGSA 1YKCA 3ERFA 4MABA 3GL5A 3FY7A 2F3MA 1THXA 2GQMA 1FAAA 1OYJA 2RIIA 4HDEA 3QR6A 1GTBA 5ECQB 1HYUA 3W6GA 1ON4A 1G7EA 1GTAA 2B3SA 1QFNA 4ECJA 5GSSA 4AF2A 2FNOA 1SKWB 4G19A 4XCSA 1O7UA 3HVSA 4ILFA 3KIJA 5CRDA 2DC5A 2JZRA 5DALB 1ZOFA 4MJAA 2IPAA 4OFNA 2K8VA 3QOUA 1A8YA 2B5YA 2YJ7A 1R7HA 2TRCP 2YPMA 1Z3EA 1JZOA 1T8EB 3D6IA 2H1AA 3WGXA 3VURA 3VLNA 4TOPA 3TDGA 2MMNA 3DIEA 1QK8A 1PRXA 19GSA 2P31A 1M9BA 4N10A 1OE8A 4XIHA 3RHCA 3TKSC 2HZEB 2PWJA 4LL1B 4Q5NA 1GLQA 4JR4A 1M2BA 3TRXA 1SD9A 1URMA 1GUHA 2H76A 1SKRB 3N9JA 4L5LA 3GTUA 3P8WA 2VLUA 4MPFA 2X8CA 13GSA 3QCPA 1OE7A 5DDLA 2OBKA 3ZMKA 2VOCA 5D9VA 2FCHA 4NMUA 4TXOB 2XPDA 2GSRA 6GSUA 3KMOA 1SKSB 5EY6A 2DJ1A 2VCZA 4EVMA 3ZREA 5ECPB 4OMVA 3UBLA 1NSWA 2B7JA 4ZIJA 1X9WB 2YWOA 4OCFA 4MF7A 4IQ1A 1VRSD 1EWXA 2J9HA 5H5SA 3GSTA 2ZNMA 3D0ZA 2FWEA 3H79A 3RPNA 3HHVA 1U3IA 2DSAA 1AQVA 1IYHA 4ISDA 4EF0A 4BWQA 1EEJA 3ZZXA 2M80A 5H5QA 1DSBA 6GSVA 5HR2A 2E2MA 2BMXA 1SK1A 1A2JA 3MWHA 3QPMA 1YDKA 2KLXA 1E2YA 4MP4A 3MNGA 1BEDA 1V9WA 1YF0A 2K18A 4E8EA 5J5NA 1Y25A 1ILOA 3O76A 1EOGA 1PX6A 5CAXA 3EC3A 3ZFBA 2H01A 1CQGA 5KN2A 3AY8A 2YANA 2C0FA 2H70A 1T3BA 1XBSA 16GSA 1O85A 2PERA 4GWRA 1MTCA 4JBBA 1EP8A 4TKYA 2AV4A 5D9XA 4MH2A 14GSA 1M0UA 1XWBA 3UOMA 3EMPA 2O7KA 4NAXA 1WIKA 4ZB9A 2VCQA 2MMAA 1YF1A 2DJ2A 1YEXA 2L5LA 3TOTA 3US3A 5CO3A 4RQRA 4GQFA 4KUNA 3G9BA 2HT9A 5ELGA 4KSOA 1THOA 1TOFA 1X0RA 2HRFA 5D9WA 1W4VA 3LQ7A 2CX3A 2VCTA 1ZGNA 2LNTA 1M2DA 3HYPA 1K0NA 3UAPA 3DEXA 1TU7A 3VPTA 3ZFLA 3A5WA 3APQA 3KCMA 1SJIA 5HR3A 5DALA 2H75A 1FG4A 5A4VA 3NZNA 1EGRA 2IL3A 4OFTA 3IAM2 3GKMA 1YKAA 3VWWA 3HZ4A 5LNKe 3M3MA 3WGEA 4IS0A 5ECRB 1FHEA 1JZWA 2JADA 1GSDA 4F2IA 2FWHA 1Y6EA 2LV3A 2HZEA 1ABAA 2BJXA 1N2AA 1M7TA 4NV5A 4TXVA 4ECCA 4RUVA 3EINA 1TP9A 3HY2A 4QL7A 1W89A 3FZ5A 2C0GA 3E0UA 4RQXA 1V2AA 4TXOA 5ECHB 2HNLA 2H30A 3F3RA 2KHPA 4K8MA 5ECKB 1J9BA 1F9MA 4K7NA 3PINA 2IMIA 2XC2A 1GTUA 2PVOC 4GLTA 2L59A 3WD6A 5IMZA 4TW5A 1H75A 3MDKA 1U6TA 2PMTA 1X9SB 1J0FA 1OC9B 1M9AA 1LU4A 3L0HA 5G1LA 1K0MA 5IMAA 2GQKA 3ISOA 3G7IA 5ECLB 2RLIA 3L4NA 3R2QA 3QFBC 2I9HA 3KP9A 5DQYA 3ME8A 3TKSA 1NM3A 1F37A 3GL3A 2C3TA 4I2UA 2FY6A 3FR9A 3L9VA 4QL9A 1GTIA 1S3DA 4FYCA 3GKNA 3GV1A 5C04A 3TJJA 4LL4B 2ON7A 4NHZA 1T7PB 4N0VA 1TRVA 3IOSA 3LEFA 2HRNA 2XBIA 2K6VA 4LLRA 2F8FA 2DJ0A 2PN8A 3DVXA 2XPEA 2YCDA 3ZITA 4YAPA 2OBIA 2V6KA 4DEJA 2FUG2 1B9YC 2PVQA 2BTOT 2GT5A 2R5GA 4IJ3A 1V98A 2K8SA 2YNXA 3M0FA 4NPBA 3FRCA 1PSQA 1B9XC 4GSNA 4KNDA 4Q5RA 5EL8A 2B5EA 4KDXA 2FD3A 2LRNA 1SK2A 4K9ZA 2HYXA 4JEDA 3D21A 2L6CA 2C3NA 5IOWA 2PPTA 4MF5A 2I81A 4MK3A 22GSA 2GQLA 2DIZA 3TJKA 2FA4A 3VI7A 3TKPA 1GSEA 2DMMA 4PUAA 1A8LA 3KGKA 1SJZA 1K3YA 4PX1A 4RI6A 2AHEA 4BPYA 1GRXA 2LKUA 2G2QA 4MZCA 4PURA 5DAKB 6GSYA 3IE3A 2MYGA 4HJMA 3O6TA 1USBA 1I9DA 2GS3A 1WPIA 1B4QA 4MLYA 1PX7A 5J9CA 1VF2A 4JU5A 1WMJA 3QAGA 1MD3A 2DLXA 5DJMA 3LYPA 1BQ7A 3ZLPA 1S3CA 1GSUA 3CTGA 3GH6A 1Q4JA 3GX8A 1AAZA 4G10A 5D8IA 3I69A 3HDCA 2YN1A 5CRHA 2H0HA 1PL1A 4I6XA 4E8HA 1M2AA 1XVWA 2DBCA 4GXZA 4YQVA 4I97A 2H1GA 2WB9A 2JZTA 2XHFA 2X8GA 3OR5A 3IRAA 4KDYA 4DSSB 8GSSA 4K0NA 3ERGA 2H8LA 2VM1A 5B6NA 1X5CA 1XPVA 1OKTA 4HOJA 4XRAA 4EO3A 1LBKA 5KN1A 2TRXA 2H72A 4ZL9A 4BVYA 3PH9A 4MJEA 1K3LA 3JCML 2WS2A 4YQUA 2CT6A 1T1VA 4FYUA 1ZYEA 5JCWA 4RI7A 1OC9A 5B8AA 1VF1A 3BJ5A 1K0DA 1Z5YE 3D22A 3FYGA 4HEA2 1VGLA 1TK5B 3H93A 3Q19A 3VWVA 5DJLA 5IM9A 3TKSE 1VF3A 1T4ZA 4JRRA 3DMLA 1TI3A 1EZKA 3A2VA 1EOHA 4D73B 4X0XA 5INYA 4FYBA 2HI7A 3I43A 2IMFA 2WULA 5A4WA 3IR4A 4ZBAA 2A4VA 5IO0A 5CRWA 3CTFA 1K0BA 1KNGA 2N5BA 2V6OA 2VM2A 4TR0A 2N5AA 4G9HA 2FWGA 2R4VA 3L78A 4GTUA 1K0AA 1WRYA 2F9SA 3MAKA 1XIYA 3K8NA 4K6XA 2V41A 3WT2A 4JR6A 2C3QA 3H8QA 2C0EA 2DIYA 2PUKC 4F0CA 1SD8A 3A2XA 4WBRD 2A2RA 3M9JA 1O73A 3GKXA 3M8NA 1RQMA 1ERWA 5IO2A 3GFKA 1GL8A 1GSQA 3FHKA 1A23A 1A2LA 4CW9A 2B1LA 2FLSA 3VWXA 4XHMA 5ECIB 3BCKA 4MCUA 1B48A 5DAKA 2YWMA 5D9TA 3QAVA 3LORA 5G31A 1PA3A 2B5XA 5E4WA 1Z6NA 2NDOA 2H6YA 2ZUPA 2MZCA 2VL3A 4POLA 1B4PA 3TUEA 3HJOA 5IMVA 5JWQB 3EU4A 3HXSA 4N0ZA 4IGJA 1KTEA 3HJPA 3M1GA 5GZZB 4MPGA 1R26A 1YZXA 4KCEA 2WJUA 5EVOA 2D2ZA 1Z6MA 4TR3A 1GUKA 4TR1B 3FZ9A 4I5QA 4O32A 1DE2A 3GUSA 3ZYWA 2RM6A 3ME7A 2CVDA 2F51A 4HI7A 3LYKA 2LEGA 2ON5A 3EU3A 2CAIA 6GSSA 1EEMA 2ALBA 3KJYA 4DSSA 2GZPA 3QMXA 1K0CA 4O5RA 2Z9SA 5IPHA 5F06A 4L0UA 3VWUA 3CSJA 4JE1A 4HU9A 2GVPA 3KXOA 3TKRA 3KMNA 1GSFA 3LSZA 4XS1A 12GSA 3RAZA 1Q98A 4WETA 4ZB6A 3UVHA 4IKHA 5JCUA 6GSXA 2L4CA 3TGZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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