2LS5A

Solution structure of a putative protein disulfide isomerase from bacteroides thetaiotaomicron
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
MSLGYIVRIGEMAPDFTITLTDGKQVTLSSLRGKVVMLQFTASWCGVCRKEMPFIEKDIWLKHKDNADFALIGIDRDEPLEKVLAFAKSTGVTYPLGLDPGADIFAKYALRDAGITRNVLIDREGKIVKLTRLYNEEEFASLVQQINEMLKEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of a putative protein disulfide isomerase from Bacteroides thetaiotaomicron
rcsb
molecule keywords Uncharacterized protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bacteroides thetaiotaomicron
total genus 58
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ls5A00
3UEMA 2DJKA 2VLVA 1Z6NA 3SBCA 4ISDA 1K0DA 5COHA 2PWJA 3FEUA 3TRXA 1JLWA 4BWSA 2TRCP 1V58A 3PH9A 1GTBA 1R5PA 1BYEA 3GX0A 2YANA 3HHVA 4KUNA 1ST9A 4KDUA 3RDWA 4ZILA 3TJKA 4D73A 5J3RA 2R3XA 2HE3A 5CRWA 2V32A 2FCHA 3TKSC 2PU9C 4ZB9A 6GSUA 4H86A 2TRXA 2VOCA 4N0VA 4ZBDA 2Z9SA 3O3TA 3CSHA 1SL0B 1T1VA 2BJXA 2N5BA 1VF3A 18GSA 4GCIA 1OE7A 4HU7A 4K8MA 1K0OA 3G7YA 2F3MA 2GQMA 2F8AA 3TJJA 1GTUA 2HI7A 4POKA 4OFNA 2L5LA 5ECKB 3GX8A 1SJ6A 2C0DA 4QQ7A 5AIVA 5HFKA 1TOFA 3QPMA 1G6WA 3WD6A 4LA1A 1XWGA 2MYGA 1TRUA 3EE2A 2H1AA 3FRCA 1ML6A 2MMZA 4TKYA 1TDIA 2V1MA 4FYUA 3L4NA 1GP1A 2GQLA 3RAZA 3FK8A 5B6MA 4V2NA 4MABA 1WJKA 2WGRA 1XFLA 1YF1A 4DSSA 2K9FA 4DVCA 2JZTA 4KH7A 4XS4A 2PERA 2M80A 4WBRD 2P31A 3TRQA 2HZEB 3C71A 1YY7A 2V2GA 3D0ZA 4TN8A 1MD3A 5G1LA 1SKWB 3IK9A 2H75A 2JZRA 3ZMKA 1F3BA 4J2FA 2RLIA 2M46A 4AF2A 1AXDA 2YZHA 3UJ1A 4HJ2A 1Z7PA 2YCDA 5DBQA 1FHEA 3A5WA 3CMIA 1NW2A 1GL8A 4ECIA 2NBSA 4ZBBA 3GUSA 5KEJA 1QUWA 4I2UA 3M8NA 2B7KA 1THOA 2GZYA 5F0GA 1PKZA 4PXOA 1SYXA 3VWXA 3F0IA 2H74A 4NV5A 1XWAA 2JL4A 4V2MA 5IM9A 3J7Yb 5C00A 4EC0A 3HVSA 1A23A 3GIXA 5IMCA 2MMNA 4TR1A 3IAM2 1AW9A 4YQUA 5CP1A 4G19A 2GDRA 2NVLA 4AJ8A 1GRXA 1EP7A 1NHYA 4IGJA 3GL5A 2H73A 4WR5A 2OE3A 3DRNA 1YJ6A 2LEGA 2I81A 3VWWA 2C4JA 2O89A 2IFQB 2DJ0A 2DJ2A 2M72A 2AHEA 1XWKA 4ML1A 3LXZA 1T4ZA 3LSZA 2RUEA 1SK0A 2IMFA 5ID2B 3TKSA 2H19A 2ON7A 5IMZA 2YWNA 2H71A 10GSA 4DSQA 3TOTA 2FGXA 4QL7A 5D93A 5F05A 1K3OA 4EL1A 5ECOB 2GSTA 5DQSA 2GTUA 4NWYA 1SK2A 4MF6A 5E59A 1SD8A 2KHPA 3GTUA 1PL2A 4YH2A 2BTOT 4Q5FA 1I9DA 1H4OA 3KZQA 2JSYA 2VCVA 2VD1A 5IPHA 1JZWA 2JU5A 1O85A 4KGIA 1JZOA 4V2LA 1TW9A 2NTOA 1BX9A 3GH9A 1B4PA 2VLTA 2IWTA 3LJRA 3UBKA 5IO0A 1SJZA 1XBSA 1QGVA 2GS3A 2GT5A 2O8VB 3TKRA 4J57E 2YWOA 1KTEA 5HR0A 4FYBA 3IV4A 2IMIA 1GSDA 2X8HA 3Q74A 1GUMA 2AYTA 6GSSA 2LJAA 1WOUA 1TU8A 4G10A 1V98A 3IDVA 3FYGA 3ZMLA 4GLTA 2VM2A 1GLQA 4MDCA 1XCCA 2E7PA 4HEA2 5DALA 3QR6A 4EDYA 4KX4A 1FOVA 4WETA 1EEJA 4XS1A 5ECSA 3DD3A 2IMDA 1TXXA 1OC8A 2XPDA 3EVIA 1GLPA 5IOXA 2R5GA 2XBIA 5GAPD 4HI7A 4JR4A 4WEYA 16GSA 1KEBA 3ZL5A 2H66A 2HLSA 1X9SB 1X0RA 2FY6A 3D4TA 4MJCA 3VPTA 4PURA 1SENA 3FHKA 3TOUA 1GSYA 4RUVA 2B7JA 4BVXA 1N8JA 2GVPA 2N5FA 1T4YA 3RBTA 2VCXA 1A2MA 1I5GA 4G2EA 4MF5A 3LEFA 4ZIJA 4IVFA 3UBLA 3FR9A 2CVDA 2PUKC 3UL3A 2QSIA 2XC2A 5FT3A 19GSA 4IHUA 5KN1A 4NHZA 3VK9A 2OA7A 3QD9A 13GSA 2VL9A 1J08A 3HKRA 1TI1A 5A5KA 3OR5A 1IYIA 1EP8A 2VCQA 3O6TA 4ZXGA 1W89A 1U88A 1B9XC 4EO3A 2V6OA 3IC4A 1FO5A 4HQSA 3QFBC 3ZIJA 1U6TA 4KB3A 4MJAA 1HNBA 3CTGA 3ISOA 3IRAA 2EIRA 3L9VA 4KCEA 5DQYA 5J9CA 1M2BA 2WULA 3VWUA 4TR4A 2OE1A 4G9HA 5IPGA 3ZLPA 5G1KA 2LTKA 2LKUA 2CX4A 2C80A 2CA8A 5EPFA 2J23A 3P2AA 2FNOA 4IW9A 1YF0A 3KJYA 4MP4A 4TW5A 2OKAA 4FIWA 5L71A 4YQVA 4QL9A 3APSA 3ZZXA 3TKSE 4BPYA 2CZ2A 1SL1B 2MBTA 5B7CA 3TGZA 1RW1A 2B5XA 5H5SA 3EINA 1M2AA 3Q19A 5F8BA 2C3QA 2C1YA 4TXOA 2L6CA 1Q4JA 1WMJA 5ABRA 1DBYA 1EV9A 2LRNA 4MPGA 1TRSA 3W8JA 2B3SA 2RM5A 3I43A 1G7EA 2DMMA 3E9JB 5G2ZA 2VM1A 4K0GA 2GLRA 1B9YC 1GNWA 4XRAA 4K6XA 4RI6A 1GULA 2PGTA 1WRYA 3HYPA 4JBBA 3HZ4A 3HCZA 2GGTA 4F82A 2MBSA 2QKEA 5IQYA 4K0NA 3C73A 4IP1A 3F3RA 1QXHA 1XOBA 4WXTA 1DE1A 4MZCA 1ZGNA 4TVEA 3ME7A 4GTUA 3RHBA 1BEDA 2FD3A 3QAGA 4J56E 5CNWA 1ERWA 1ZOFA 3HJMA 1TP9A 1ZYEA 3VPQA 4HDEA 4IJIA 1AQVA 3GNJA 2LNTA 4POMA 2ZNMA 4EE0A 3JCML 4TR1B 2YP6A 2VLUA 3W6GA 1CQHA 1BJXA 3BCKA 1V9WA 5HR3A 4X43A 3H79A 1XOAA 4K7NA 2RUFA 2WJUA 5ECRB 1BQ7A 1R4WA 1YKAA 4EKZA 4BVYA 1T7PB 1GSEA 4PUAA 4HS1A 2REMA 1DSBA 2H70A 2KOKA 1O7UA 5G30A 2PVQA 1PX6A 5D73A 1HQOA 3LYKA 4TRXA 3TKQA 4IQ1A 3Q18A 1F37A 4JU5A 2PMTA 4KAEA 3VFIA 2XBQA 2YJ7A 4IKHA 3O76A 2IPAA 1W4VA 4KSOA 1A8YA 1ZMAA 3C1RA 4OO5A 2KUCA 4OCFA 5D9VA 3UMAA 3LXTA 2QGVA 3TJBA 2HSHA 4WF4A 1RQMA 1YEXA 1SD9A 3C7MA 3G9BA 4FO5A 3KEBA 3GTUB 2PVOC 3GN3A 3TDGA 1RK4A 3U6VA 1EWXA 4L0WA 1URMA 2FUG2 2YJHA 1ZCPA 5G5FA 3F8UA 1S3AA 1BAYA 2K8VA 4ECJA 2FA8A 1WPIA 1QQ2A 2WFCA 5EL8A 3IE3A 1F6MC 3WGEA 1AC1A 4BL7A 2VL3A 5D9TA 3PINA 3QOUA 3ZITA 3QAWA 2G2QA 5GSTA 2ZCTA 1GTIA 1UVZA 5ELGA 4EF0A 2H72A 3LWAA 6GSWA 3TB2A 4MZBA 5CRGA 1E6BA 2H30A 5B8AA 5J4UA 5J9BA 1O8WA 1V57A 1WE0A 2GZPA 1SL2B 1OKTA 2JADA 2YWIA 2CAQA 3IK7A 3HJOA 4KSMA 2N5AA 3GSSA 3H8QA 4KNDA 5G31A 1R5AA 1K3YA 1K0AA 3WGXA 5CYYA 5DJMA 5LCZA 1Z5YE 3EMPA 4DSRA 1XW9A 3SWLA 4MK3A 3HZ8A 1U87A 3MDKA 1AUCA 3EC3A 3A2VA 2YNXA 4PQHA 4K2DA 4N10A 3NOFA 5EY6A 2QC7A 1WIKA 2VL2C 2EC4A 4LMWA 6GSYA 1GWCA 1MDIA 4GXZA 4Q5RA 4HUAA 2JSZA 1TRWA 2VCWA 3M3MA 1X9MB 3GH6A 3N5OA 4Q5QA 5ECIB 3P8WA 1MD4A 2KP1A 1GSFA 3F4SA 5ECLB 3KH7A 2IL3A 4O92A 5CAXA 3QFAC 1NM3A 2O85A 1ERVA 3FZ4A 3U5RE 2XPEA 5AGYA 4XHMA 4NAXA 4ZB6A 4L8EA 4V1Ap 1ON4A 2C0FA 5CRDA 1GUHA 3A3TA 1OC3A 2LQQA 2OE0A 4EXJA 4MA9A 2R6KA 2VD0A 5H5QA 2MMAA 4GSNA 2CQ9A 3WGDA 3ZFLA 3FZ5A 3CSIA 2L57A 3F6DA 2HZEA 4ZB8A 4ZL8A 4TR3A 4MJEA 5HFIA 2YZUA 3I6AA 2FWFA 2H8LA 5LD0A 1ABAA 2KP2A 3C1SA 4LMVA 4WR4A 1J0FA 2YN1A 4XIHA 5IMAA 3HY2A 5JCWA 1TJDA 2RM6A 3IA1A 1JFUA 5AISA 3FW2A 3DIEA 2VCTA 4KCAA 1K0MA 2LRCA 2GT6A 12GSA 4IS0A 4OFMA 2A4VA 1PKWA 1XPVA 1THXA 4KW6A 2KLXA 5INYA 5IOWA 3ERWA 3K8NA 5G5EA 4PNGA 4DEJA 4IQAA 2YWMA 1NHOA 4MH3A 1O8XA 1YKCA 3IR4A 4TXOB 3WT2A 2WCIA 4N11A 4O5RA 1EV4A 4LL4B 1XWCA 5A4VA 3KCMA 2AV4A 2VAFA 5E4WA 1XXUA 4HZ2A 2IMEA 1TK8B 2HZFA 1GH2A 1TTZA 2LUSA 1SK1A 4ECBA 5ECPB 2XHFA 1XWBA 1A2LA 4L5OA 2H6YA 1GSQA 6GSTA 3TKPA 2HSYA 3L9UA 5FWGA 2E0QA 1VF1A 5J41A 3APQA 2L59A 1M0UA 3FR6A 2DIZA 2G0FA 2OADA 3TCOA 1FB6A 4K9ZA 3FZ9A 1NSWA 4IP6A 1FW1A 2E2GA 3C8EA 1V2AA 3I69A 6GSXA 3CRUA 2JACA 4O7HA 9GSSA 1AIUA 4YAVA 20GSA 2VL2A 2OBKA 3D6IA 4GQCA 4D73B 2DJ3A 3DVWA 1HYUA 2IMKA 5D8IA 1S3DA 1BG5A 4HOJA 4OMVA 3KXOA 2GQKA 2V41A 1X5DA 5JCGA 4O32A 1JHBA 3UOMA 4AGSA 4FYCA 4F0BA 4K1FA 3ZREA 1XVQA 2WZ9A 2J9HA 2H6XA 2CZ3A 3IOSA 1EEMA 3KGKA 4E8EA 4F03A 5HQPA 4JZQA 3CRTA 3ZRDA 2IIYA 5A4UA 3CTFA 3D21A 1T8EB 1X5CA 1B48A 2AAWA 3A2WA 1PGTA 4WF5A 3GHAA 2LQOA 3VI7A 1OE8A 4I8BA 2X8CA 1OVNA 2L4CA 1B8XA 2CX3A 1FB0A 3QDNA 2H0HA 4CDOA 3DEXA 1TK5B 3F9UA 2X99A 2LV3A 4PNFA 4E8HA 3FY7A 2FHEA 4HQZA 2LJKA 1PL1A 4TR0A 2X64A 1AQXA 1TRVA 2HRFA 5ECNB 2C3NA 1UC7A 3RPNA 4GRFA 4DSSB 1TU7A 2C8UA 2EIQA 5GZZB 4ML6A 2LRTA 1G7OA 4XS4B 3F6FA 2C0EA 1JLVA 4MZWA 4Q5NA 3N9JA 2B1KA 3D4MA 4Z7XA 2OBIA 3HA9A 2MZCA 3ED3A 3NZNA 1A24A 2WS2A 1TK0B 2B1LA 2L5OA 3MAKA 3L0HA 4KE3A 5IMVA 3GV1A 3QAVA 5GAND 3M0FA 2MMOA 3IAS2 2GSSA 2DMLA 1M9AA 2DBCA 4JEDA 3KTBA 4PX1A 1VF2A 2VO4A 3BCIA 1A0RP 3RHCA 4CHSA 1S3CA 3F4TA 1B4QA 5ECQB 2IN3A 3HD5A 4ZL7A 4I6XA 1PMTA 2JZSA 5DAKA 3UAPA 1MEKA 1IYHA 2OACA 2YPMA 4PUFC 3IXRA 1QFNA 1ZL9A 3ME8A 4WKWA 1VF4A 1GSSA 2LNSA 1QMVA 1XW6A 2H0IA 2C3TA 4KA0A 1ERTA 2ZUPA 5JWRB 3E0UA 5CRHA 1GTAA 2CV4A 2NDOA 5IO2A 2H0GA 5D96A 4CW9A 1UA5A 3KD0A 2A2RA 4GQFA 1X9WB 3G7IA 5ECMB 5DDLA 3DVXA 4RQXA 2HFDA 1HNCA 3GRXA 2DJ1A 2P5QA 3CBUA 2DLXA 1N2AA 5AN1A 3FZAA 2K8SA 2L6DA 3HVXA 1LU4A 4OO4A 5HFGA 1PRXA 1K0BA 1OC9A 2O7KA 3EURA 1FVKA 1OYJA 4IBPA 1Y25A 3HJPA 3GL3A 3KTLA 4YAPA 1JZRA 3CSJA 2CVBA 5DJLA 2R2JA 1Z7RA 3ZFBA 3ERGA 2B6MA 2GSRA 4MJBA 1XW5A 6GSVA 1SYRA 1YZXA 3E3EA 1R26A 2TIRA 3GKKA 4I97A 1HNAA 1SKSB 1G6YA 3NIVA 1SKRB 3ZVJD 1A8LA 1F3AA 3D22A 2RIIA 3KH9A 3PR8A 3GKXA 4OCEA 3IPZA 1GNEA 3F63A 1U3IA 5DCHA 5D9XA 4X0XA 3GMFA 3CYNA 4EDZA 3HDCA 5FHIA 4F9ZA 5ELAA 4P3YB 4JRRA 3ERFA 4NPBA 3KMOA 4ILFA 3ZVJA 4HZ4A 4ACSA 1ZYQB 1OKDA 5DVBA 2IJYA 2AB6A 3VWVA 3QMXA 3DMLA 5DALB 4HU9A 2DIYA 1CQGA 5ECHB 2R4VA 4WBJA 2YV9A 2F8FA 1LBKA 4PQIA 2L4QA 4V1Ag 4JR6A 3FKFA 2H1GA 4NXIA 3LORA 4HJMA 3EWLA 2ALBA 4ULXA 2I1UA 2CT6A 4I2TA 2AJQB 1AAZA 2FWGA 2FWEA 3M9KA 4IJ3A 5LNKe 2VCZA 3APOA 4I5QA 3V1WA 3TJGA 3EU4A 4ZBAA 1G0TA 1Q98A 5ENUA 5IMDA 3TUEA 1SJIA 2PBJA 3W8SA 3P90A 2LS5A 5CREA 1A0FA 3A2XA 4NHWA 5B8BA 1UN2A 1EGRA 4GF0A 1KBNA 2H6ZA 4XS6A 4POLA 5EVOA 3I9V2 4X1UA 4MPFA 3VI5A 4XCSA 1M2DA 2HYXA 2C0GA 4MCUA 1ILOA 1TKDB 1V40A 5F06A 5CO3A 4KDYA 3UVHA 1E2YA 2LJRA 1K0CA 2GZZA 3P7XA 4PQ1A 3ZTLA 1T3BA 1FG4A 5IMFA 3WT1A 1EZKA 3ZIVA 2DC5A 3GKMA 2B5YA 1DE2A 2EIOA 3DGQA 3DKSA 2LSTA 3L78A 5J5NA 2WB9A 4LL1B 1PN9A 2O87A 2FA4A 3S9FA 2BMXA 7GSSA 3ZYWA 2CAIA 2FLSA 2PPTA 3D5JA 1YDKA 2I3YA 1O73A 3LFLA 1Z3EA 2WRTA 4KDXA 2F9SA 1GUKA 4K7OA 2D2ZA 2X8GA 5DCGA 2GSQA 5JWOB 4MH2A 3LQ7A 2HT9A 2NPBA 4AJ7A 1JZDA 3EYTA 3KMNA 3HXSA 1K0NA 3RPPA 5D9WA 3F4RA 4NMUA 2V6KA 3KP9A 1Z9HA 1ZZYA 4XTSA 4MF7A 1EOHA 1M9BA 3VLNA 2HRNA 3KM6A 1T00A 3GKNA 4LLRA 4YQMA 5KN2A 3VURA 2H76A 1FVJA 1GSUA 3PGTA 1MTCA 2H1BA 4N0ZA 1HD2A 2HNLA 5C04A 3LYPA 5HR2A 3MWHA 4BA7A 17GSA 3MNGA 3IHQA 3M1GA 5A4WA 3GURA 2IFQA 3F3QA 3KP8A 2VIMA 1YQ1A 3UVTA 1Z6MA 1LJRA 1AQWA 5AIXA 1VGLA 2P5RA 3LGCA 4RI7A 3KIJA 4F2IA 4FH8A 1WWJA 4EVMA 5ID2A 1H75A 2H1DA 2YOIA 1XIYA 3HVVA 1EGOA 5DAKB 1MDKA 1ERUA 1OAZA 3AY8A 4TXVA 1TI3A 1PQNA 3EMXA 2R37A 1PD21 2CVKA 2H01A 4TOPA 4PGTA 2YV7A 5IIZA 2K6VA 1DUGA 3DXBA 3DYRA 1QK8A 4GWRA 1ACVA 3TJFA 4EUYA 3H93A 2DSAA 1F9MA 4L0UA 4K7IA 3TRPA 1O6JA 3BBYA 14GSA 3GFKA 3LG6A 5H5RA 1EOGA 1MDJA 4POBA 4OWYA 5GSSA 4OD7A 3BOAA 5B6NA 3CXGA 5JCUA 1WP0A 4IN0A 4IELA 2A2SA 4ECCA 5HR1A 4MLYA 3DWVA 3BJ5A 3QCPA 1PA3A 2ES7A 4N30A 3UIWA 1XVWA 1XZOA 4XRDA 1O81A 1SU9A 4RQRA 2OJLA 4AJ6A 4ID0A 5KN0A 4GSSA 1FAAA 2PN8A 22GSA 2DJJA 3J7Yk 3G7JA 4NV2A 3R2QA 1C72A 1OC9B 3BD2A 11GSA 3GA4A 2VUPA 2ON5A 3WYWA 2P0GA 3IBHA 1F2EA 3L9SA 1J9BA 1VRSD 1M99A 1Y6EA 1M7TA 1KNGA 2I4AA 1A2JA 2HXKA 3UARA 4BWQA 2K18A 3H1NA 3GYKA 2I9HA 2AUVA 3MSZA 1X5EA 5F07A 1K3LA 4JE1A 1PSQA 3H4KA 1U3AA 1USBA 4OFTA 3M9JA 4MMMA 1YEPA 4F0CA 4GSTA 1PX7A 2FWHA 5KN3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite