2LTKA

Solution structure of a monomeric truncated mutant of trypanosoma brucei 1-c-grx1
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
GAMVKKDIDDTIKSEDVVTFIKGLPEAPMCAYSKRMIDVLEALGLEYTSFDVLAHPVVRSYVKEVSEWPTIPQLFIKAEFVGGLDIVTKMLESGDLKKMLRDKGITCRDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma brucei
publication title Iron-Sulfur Cluster Binding by Mitochondrial Monothiol Glutaredoxin-1 of Trypanosoma brucei: Molecular Basis of Iron-Sulfur Cluster Coordination and Relevance for Parasite Infectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mono-cysteine glutaredoxin
total genus 29
structure length 110
sequence length 110
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ltkA01
2OJLA 1U6TA 4IJIA 1VGLA 3FR3A 2YWNA 1BEDA 4PQ1A 1K0DA 1R7HA 3ERWA 4GSSA 3L4NA 4QQ7A 4EDYA 2VLTA 4OWYA 1XXUA 2F8AA 1PX7A 2IJYA 1SU9A 3GKKA 2JU5A 1O73A 4G19A 3TKSC 3ZITA 1Z5YE 3RBTA 4O92A 1A2LA 4PX1A 3QOUA 2E0QA 4GF0A 3IOSA 4KUNA 5CYYA 2LRCA 2FWHA 2FGXA 1DBYA 3F63A 2GSQA 1B9YC 2CQ9A 4IP1A 4EKZA 5ECMB 4DSSA 2AUVA 3BOAA 3TJBA 3ME8A 3UVHA 1OC9A 1G0TA 1KEBA 2RM6A 4JU5A 4KGIA 1PD21 3G9BA 5CP1A 4HJ2A 3LYKA 5DAKA 5A4UA 5GAND 4MH2A 4HQZA 1U88A 4MF5A 1G6YA 2HZFA 1A0RP 1ST9A 5HFIA 2VM1A 2VL2C 2LQQA 4KE3A 4JBBA 1DSBA 2PU9C 2CVDA 4MJBA 5FWGA 2RIIA 2JADA 1X9WB 2WS2A 1SJIA 2HZEA 4O7HA 1GTIA 1WJKA 3TKSE 16GSA 4FH8A 3GSTA 4HS1A 4MMMA 5AN1A 2DIYA 2FWFA 4DEJA 4H86A 3EWLA 2YV9A 2YN1A 3TDGA 4WETA 1YEXA 4ZBAA 2IN3A 4MPFA 4D73B 2K6VA 2PBJA 4CW9A 5EL8A 2I9HA 1Z6MA 2GT6A 4BA7A 4F9ZA 3HKRA 3HY2A 1XVWA 2AYTA 2YPMA 4AJ8A 3G7IA 4NXIA 3KEBA 4RI6A 3GFKA 2H70A 1WIKA 1F6MC 1NW2A 5HR0A 4GQFA 1VF3A 5F07A 2MMAA 2KOKA 5HR3A 4JZQA 1DE2A 4N0ZA 1WWJA 3EE2A 3D4TA 3M3MA 2L6CA 5LD0A 4PNFA 5FHIA 4N30A 1GNEA 1V98A 5G1KA 4WF5A 4IJ3A 4K0NA 3M0FA 4RUVA 3ED3A 3KJYA 1Z7RA 1HNCA 1UN2A 1VRSD 3LGCA 3Q18A 1Y6EA 1SK2A 5KN0A 1GUMA 2CX3A 5LCZA 10GSA 3FEUA 3GIXA 1GP1A 3OR5A 3A2WA 4LLRA 3UMAA 3QAWA 2FUG2 3I69A 5EVOA 4Q5NA 4TVEA 1OC3A 1FB0A 3LWAA 3C1RA 5EPFA 1YF0A 1K3OA 3MNGA 1HQOA 2ALBA 1O6JA 3IAS2 1TI3A 3QR6A 3CSHA 3UL3A 1SYXA 2JL4A 3PH9A 3GH9A 5IO0A 4X1UA 2PGTA 3KP9A 1YY7A 2L4CA 1FB6A 5F8BA 4N11A 3GH6A 4F0CA 4ZILA 2JZTA 2R4VA 2VOCA 3ZFLA 1F3BA 3GURA 4WBJA 1YEPA 2WCIA 5J4UA 3MWHA 3D21A 2VIMA 2H1BA 4MDCA 3BD2A 2H73A 4J2FA 1X9SB 2WGRA 1TW9A 3I6AA 4XS4B 4TXOA 1BJXA 5IOWA 3CSJA 2XHFA 3L78A 2CVKA 1AC1A 3VLNA 1R4WA 5G5FA 4IELA 4EVMA 2LTKA 19GSA 5J9BA 5DQYA 1EP7A 2H1GA 3QMXA 3FZ4A 2IIYA 2DC5A 1SYRA 2GVPA 5GZZB 4FYBA 5CREA 2YP6A 4N10A 4FIWA 1GH2A 2C0DA 4EE0A 2HNLA 5C00A 4V1Ag 1QQ2A 1OE8A 1OKTA 3IAM2 1S3DA 4O32A 1FVJA 3IHQA 1OC8A 1B48A 1TJDA 3DXBA 1QXHA 5G31A 1FVKA 4K7IA 5C04A 1RQMA 5E59A 4L5OA 1K0BA 2K8VA 3HYPA 5COHA 3ISOA 5KN3A 1Q98A 1TU7A 2LKUA 2O87A 3L9VA 2X99A 1TI1A 3AY8A 1KBNA 3L9SA 1SKRB 2GZPA 2XBQA 2MBTA 4TR3A 2PERA 3TB2A 2TIRA 5IPGA 3UBLA 13GSA 5HQPA 3O6TA 2E2GA 3DRNA 5CRGA 4NHZA 4G10A 1GSSA 3LSZA 3APSA 2IPAA 5D9TA 4BVYA 5H5RA 1A24A 3IE3A 2WZ9A 4NPBA 5GAPD 2P0GA 3BCKA 3FKFA 5IMCA 1MEKA 4PXOA 1TK0B 2CT6A 4IN0A 1E6BA 2OACA 4LMWA 1B4QA 3ZRDA 2GGTA 3QCPA 3APQA 4TR0A 3CBUA 3KD0A 5ECKB 3DMLA 3U5RE 1PQNA 4YQUA 2FWGA 3QPMA 2O85A 3GKNA 2NDOA 1BYEA 5E4WA 1TDIA 1UVZA 5AISA 1URMA 2B7JA 2CZ2A 4WF4A 3TJFA 1PGTA 1CQHA 4NMUA 2GSTA 4KCAA 2DSAA 1Y25A 2FD3A 1PL2A 2BMXA 1PA3A 2HXKA 2CA8A 2B5YA 1JLWA 1SD9A 1NHOA 5G30A 4ZB6A 3UOMA 2RUFA 2K18A 2IMEA 3UARA 3Q19A 2EC4A 4ECIA 3FW2A 2ON5A 4GSTA 4QL7A 2EIQA 4KDUA 3D5JA 2GSRA 5D93A 2OE3A 2PVOC 4J57E 2VCWA 4HU9A 5AIXA 3E0UA 4MZCA 3GKMA 4RI7A 4KSOA 1F2EA 2LNSA 4K7NA 1TK5B 3H1NA 4KH7A 4MZBA 5ECOB 1ZYEA 3TKSA 2H72A 4OFTA 2HE3A 4MA9A 1TP9A 1XWAA 5D73A 3LYPA 3A5WA 3W8JA 4OFNA 4IS0A 2LRTA 1GSQA 1QK8A 3C1SA 2LJKA 2PVQA 6GSWA 2IMIA 1M9BA 3GKXA 5DDLA 3M9JA 3N9JA 1JZRA 1QFNA 1SENA 2G0FA 3DVWA 1EEJA 2HRNA 1I5GA 1ZMAA 5DCHA 5IMDA 4BWSA 5DJMA 2MMZA 4ZIJA 1ABAA 2H1AA 1F3AA 1XZOA 5D9WA 3KM6A 2VCXA 4NHWA 1OE7A 2H01A 5D9XA 2X8HA 1DUGA 2H6YA 3ZVJA 3WT2A 3HVVA 2C3TA 1O8XA 3N5OA 5DALA 2ZUPA 2VL2A 3D6IA 2LEGA 1UA5A 2IMFA 5JWRB 2JZRA 4N0VA 4BVXA 4ID0A 3IA1A 5CAXA 3C7MA 3ZLPA 3US3A 2O7KA 1J0FA 4V2MA 1SK1A 3H79A 3VPQA 2XPDA 4Z7XA 4IBPA 4KAEA 2YWOA 1PKWA 3TOUA 3W6GA 3FHKA 3F9UA 3JCML 1THOA 1GSYA 9GSSA 1M2DA 3KIJA 2J23A 1WPIA 2X8GA 4EF0A 4GQCA 3NOFA 1OVNA 2H0IA 1SKSB 2LUSA 5G5EA 3IXRA 4HZ2A 3QFAC 3DD3A 3GTUA 2IFQA 6GSSA 3LORA 1VF4A 1IYHA 1AQXA 1UC7A 2C1YA 1F9MA 2REMA 3RAZA 2M72A 4HEA2 4ZL8A 1GSUA 1GSDA 3DKSA 5JWQB 5B7CA 3DGQA 3FR6A 4K9ZA 4JR4A 1ZGNA 4Q5QA 4NWYA 1TRUA 6GSUA 2B1LA 3KP8A 3KTBA 1GLPA 20GSA 3CXGA 4IGJA 5EY6A 2LV3A 2AJQB 5IOXA 3G7YA 1HYUA 3LXTA 1B4PA 4POLA 1XOBA 3TUEA 2OBIA 1RK4A 1ERWA 3TRQA 2OE1A 4PUFC 2Z9SA 4OMVA 7GSSA 1M99A 2H76A 2JACA 2YWIA 3LFLA 4GWRA 3KGKA 3MSZA 4ZBBA 5ECNB 1XCCA 2IL3A 5J41A 2DJJA 3VK9A 1XPVA 5IIZA 3F6FA 1A23A 3EURA 4WEYA 1AXDA 1MTCA 3UEMA 2R2JA 1X5EA 3GV1A 1GTAA 3EVIA 4L8EA 2FWEA 2C3NA 2E7PA 3TRPA 4TOPA 4K8MA 4V2LA 5ECPB 2VD1A 2R6KA 4LA1A 3ZL5A 2YJHA 2CZ3A 4GSNA 5CRHA 2FLSA 4GRFA 4FYCA 5IO2A 2CV4A 4X43A 2GZZA 3U6VA 5CRDA 2PMTA 1V57A 1V9WA 1VF2A 3KXOA 2YZHA 1YQ1A 4MH3A 3A2VA 2DMMA 3ZIVA 4YAPA 4DVCA 4LMVA 2B7KA 3PR8A 3IK9A 5H5QA 1O8WA 1GTUA 2DMLA 2YNXA 4HQSA 5FT3A 3ERFA 3E3EA 2H74A 2C8UA 1SK0A 4AJ6A 3QDNA 2G2QA 4GCIA 5DCGA 5ECRB 2YOIA 5D96A 5ECIB 4YQMA 4QL9A 3F4SA 3DWVA 1EV9A 4XRDA 2F8FA 6GSYA 1WE0A 1AIUA 4MCUA 2YCDA 3UAPA 3LXZA 1XBSA 1EWXA 2C80A 3EU3A 2CAQA 4X0XA 3GA4A 5F0GA 1VF1A 2LSTA 1M9AA 4XS6A 4TW5A 1YJ6A 2PUKC 1THXA 1O7UA 4JEDA 5A5KA 2LJAA 3CTGA 4PURA 2LRNA 5KEJA 1GNWA 3HZ4A 4V1Ap 1BAYA 2CVBA 1KNGA 2HZEB 3VPTA 3RHCA 3WD6A 3TGZA 2VLVA 1S3CA 1XOAA 3DYRA 4HDEA 2B3SA 3HD5A 1TU8A 2FHEA 2MZCA 1B8XA 4I5QA 2GTUA 5CNWA 4K7OA 1EP8A 3APOA 1GULA 1ILOA 1S3AA 1U87A 5G2ZA 5H5SA 1WP0A 3EINA 4IKHA 3E9JB 4PQHA 5ID2B 1H4OA 4KB3A 4MLYA 4TXVA 4ECCA 4TRXA 1GTBA 1SJZA 1RW1A 1ERVA 4WBRD 1X5CA 1A2JA 4RQXA 3TCOA 2V6OA 5B8BA 1F37A 1M7TA 1FW1A 2VCQA 1ERTA 3HCZA 2VAFA 1OAZA 5B8AA 5LNKe 1ZL9A 3RHBA 3BJ5A 3EMXA 1N2AA 4NV5A 2OADA 4BWQA 1BG5A 3D22A 4F0BA 3HVSA 3FZAA 4PQIA 2YWMA 2OA7A 14GSA 3ZMLA 3WGEA 2YZUA 3O3TA 4ZL7A 2V32A 3QFBC 17GSA 1OYJA 3I9V2 1M2BA 5ECQB 5IMZA 5J3RA 1R26A 1T3BA 1R5AA 5HFGA 4OCEA 3LJRA 2VL9A 1A8LA 2WRTA 3LQ7A 4K2DA 2B5XA 1HD2A 1GRXA 4J56E 1EGRA 3GX8A 4KNDA 2WFCA 3GX0A 3KMOA 2CX4A 5J5NA 2DJ1A 3IR4A 1J08A 4MF6A 3VI5A 1SL0B 2NBSA 3GYKA 4AF2A 2KP2A 2DJ3A 5IMVA 2HYXA 4EO3A 4ECJA 2I1UA 4XRAA 4HJMA 2ZNMA 5CRWA 1U3IA 5GSSA 4TR4A 2PWJA 2R5GA 3FY7A 3UBKA 1PMTA 2B6MA 4YQVA 4HUAA 3TJKA 1C72A 3GMFA 1YZXA 2C0EA 4ACSA 4TN8A 2WDUA 5HR1A 5B6NA 3VWXA 1LBKA 2L5OA 3A3TA 4E8EA 4I6XA 1NSWA 2LQOA 3KH7A 2ES7A 2LJRA 3MDKA 5A4WA 2DIZA 5HR2A 3EC3A 2XPEA 4IVFA 3VURA 3ZFBA 1T00A 3SBCA 3UJ1A 4D73A 3QAGA 5B6MA 3WGDA 4DSRA 2DJ2A 1GUKA 3G7JA 3CRTA 2FY6A 1IYIA 5INYA 1E2YA 4ISDA 2HLSA 2E2MA 3CTFA 2MMNA 2GS3A 3F0IA 5AIVA 3L9UA 2BTOT 2L4QA 4TR1B 2VM2A 2I4AA 3RPPA 3SWLA 1V2AA 5G1LA 3H8QA 2P5RA 1A8YA 4P3YB 4XHMA 1MD3A 2NTOA 3CSIA 2AAWA 1TTZA 2QKEA 3FYGA 4POBA 2M46A 4NAXA 1GSFA 1TK8B 2GT5A 2L6DA 4HZ4A 3H4KA 4F2IA 2ON7A 3PGTA 3GL3A 1BQ7A 1X0RA 2VD0A 4OD7A 1TRSA 3QD9A 1M2AA 3ZIJA 2HRFA 2O89A 4ML6A 3CYNA 3ERGA 5JCUA 4TKYA 1K3LA 5D9VA 2N5BA 2K9FA 1X5DA 3V1WA 3TKQA 2CAIA 4XS1A 1WRYA 2WULA 1B9XC 2C0GA 1EZKA 1FOVA 1N8JA 3LEFA 2GQMA 3KCMA 2J9HA 1MDKA 2TRCP 3O76A 5IPHA 1LJRA 3ZYWA 1YF1A 4MZWA 1NHYA 3FK8A 2JZSA 11GSA 4XCSA 2GQKA 4KW6A 3VWWA 3IDVA 2VCZA 4I8BA 4G9HA 2YJ7A 4HI7A 4V2NA 3VFIA 4HU7A 3ME7A 4XS4A 1R5PA 5D8IA 3HDCA 3ZVJD 1XW5A 4YAVA 1AQWA 2N5FA 1M0UA 3DVXA 1ZYQB 3QAVA 2KUCA 4CDOA 2HSHA 3P90A 5DQSA 5L71A 3M8NA 2JSYA 1Z3EA 1O81A 2MMOA 3DEXA 4K6XA 4L0UA 4OO5A 3J7Yb 1O85A 3GUSA 4RQRA 3C73A 1MDJA 4HOJA 4MJCA 4XIHA 4ECBA 1FO5A 1K0MA 2H30A 1T8EB 4ZL9A 2X64A 4AJ7A 2L5LA 3HA9A 2RM5A 3GSSA 3HHVA 3KMNA 5HFKA 5IQYA 3UIWA 1MD4A 3GNJA 3KZQA 3ZTLA 3HZ8A 2YV7A 4KDYA 5ENUA 1QUWA 3FRCA 3F4RA 1XWKA 2QC7A 2MBSA 18GSA 2H66A 5ID2A 4DSQA 3IK7A 3VWVA 3VI7A 2BJXA 4MP4A 1XIYA 4GLTA 3HXSA 1GLQA 4K0GA 5ELAA 1CQGA 1T1VA 1MDIA 2HFDA 1T4YA 5ECLB 2C4JA 4ZB8A 1JZOA 2XBIA 3F4TA 2D2ZA 3DIEA 5J9CA 2F9SA 2LS5A 1A0FA 4WKWA 4LL1B 4IQ1A 3IRAA 2V41A 2ZCTA 3IBHA 4O5RA 4ML1A 2I81A 2OKAA 4MJAA 4IW9A 5DVBA 3EYTA 1AW9A 2H6XA 1SL1B 3FR9A 1AQVA 3KH9A 3FZ5A 1QGVA 2HI7A 2KLXA 3EMPA 2A2SA 1PSQA 1USBA 2OBKA 1HNAA 4KA0A 2GQLA 4IHUA 2B1KA 1T4ZA 2AV4A 4OO4A 3TKPA 2I3YA 4ZB9A 1K0OA 2GDRA 4ZXGA 3D0ZA 3S9FA 4KSMA 1T7PB 3P8WA 1KTEA 1SJ6A 4WR4A 1EOGA 3ZZXA 2PPTA 1AUCA 4MABA 5DALB 4MF7A 2QGVA 1QMVA 5ECSA 1DE1A 3HJMA 1PN9A 3TJJA 2O8VB 4Q5FA 1AAZA 2L57A 2VCVA 1G6WA 1YDKA 4F03A 3ZREA 12GSA 3R2QA 3C8EA 3RDWA 1EEMA 2X8CA 4DSSB 5F06A 6GSXA 1PX6A 1ZOFA 1OC9B 2GZYA 1PKZA 3GL5A 5IMFA 1HNBA 4EUYA 8GSSA 1ZCPA 2H71A 2DJKA 2H1DA 1K0NA 2JSZA 1GWCA 4KX4A 3WGXA 1FAAA 3VWUA 5DAKB 1XWCA 3WYWA 1GL8A 2OE0A 2DBCA 1Z6NA 2B5EA 4BPYA 4AGSA 3P7XA 1PRXA 1W4VA 2LNTA 3BCIA 3P2AA 3IV4A 3RPNA 3GTUB 2GSSA 2IFQB 2HSYA 1XWBA 3C71A 1XWGA 4MJEA 4JE1A 2VO4A 2QSIA 1NM3A 2RUEA 3Q74A 2C3QA 4POKA 1XW9A 2EIOA 6GSTA 2F3MA 2N5AA 5ECHB 4EC0A 3F6DA 2F51A 4JR6A 4TR1A 1BX9A 1XW6A 1Z7PA 1SKWB 1K0CA 4PUAA 3WT1A 1SD8A 1ZZYA 3FZ9A 5CO3A 1XFLA 2VL3A 1TKDB 3ZMKA 3A2XA 4PNGA 5KN2A 22GSA 1ERUA 4YH2A 4JRRA 3PINA 2YANA 4FO5A 2H6ZA 4G2EA 5JCWA 3I43A 4XTSA 4BL7A 1ON4A 2V6KA 2R37A 1X9MB 2L59A 2H0HA 2AHEA 2H8LA 4I2TA 3GHAA 2H75A 4Q5RA 2MYGA 4ILFA 3LG6A 1W89A 4WXTA 1FG4A 4ULXA 6GSVA 2A2RA 2V1MA 3M1GA 5JWOB 1EV4A 2RLIA 1TRVA 2K8SA 2P31A 1V58A 5DJLA 1I9DA 1GUHA 4IP6A 4L0WA 4KDXA 3UVTA 2XC2A 1JLVA 3K8NA 4OCFA 1U3AA 2GLRA 1PL1A 2NVLA 3F3RA 2A4VA 2KHPA 2H0GA 4IQAA 1JZDA 2WB9A 2FCHA 3CMIA 3EU4A 4KCEA 4MK3A 2IMKA 1G7EA 2VLUA 5IM9A 5AGYA 1EGOA 1K3YA 4PGTA 3TJGA 3H93A 1Z9HA 2WJUA 2EIRA 3GN3A 3GRXA 3Q6OA 2P5QA 4ZBDA 3D4MA 3HJPA 1WMJA 2AB6A 4NV2A 1TOFA 3NIVA 5A4VA 1EOHA 1GSEA 2NPBA 3HVXA 2C0FA 5F05A 1K0AA 4I2UA 1J9BA 1YKAA 4OFMA 1JHBA 3TOTA 4TXOB 1H75A 5DBQA 1WOUA 5IMAA 5ELGA 3J7Yk 3CRUA 4EDZA 4POMA 5GSTA 4MPGA 1SL2B 3KTLA 1XVQA 1LU4A 1ML6A 5JCGA 2IWTA 2TRXA 1OKDA 3W8SA 4GTUA 1TRWA 1JZWA 1ACVA 4CHSA 4EL1A 2H19A 3IC4A 4FYUA 4LL4B 3MAKA 2DLXA 2FA4A 2HT9A 2FNOA 3F3QA 2IMDA 3BBYA 1Q4JA 5ABRA 4I97A 1G7OA 2R3XA 3IPZA 1A2MA 5KN1A 4L5LA 2FA8A 3TKRA 4F82A 1YKCA 3NZNA 4K1FA 3M9KA 2M80A 2V2GA 3F8UA 4WR5A 3L0HA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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