2LV3A

Structure-functional characterization of grx domain of mus musculus tgr
Total Genus 21
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
21
sequence length
102
structure length
102
Chain Sequence
AREELRRRLRDLIEGNRVMIFSKSYCPHSTRVKELFSSLGVVYNILELDQVDDGASVQEVLTEISNQKTVPNIFVNKVHVGGCDRTFQAHQNGLLQKLLQDD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of glutaredoxin domain of Mus musculus thioredoxin glutathione reductase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin reductase 3
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
total genus 21
structure length 102
sequence length 102
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2012-06-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2lv3A00
4OMVA 5LD0A 1ZYEA 3F6DA 1SD8A 2MYGA 1XW9A 4D73A 4EXJA 1GRXA 3DMLA 1GNWA 3J7Yk 3RPNA 3KP9A 5HQPA 5B6NA 2GQKA 2WDUA 1XWGA 1F9MA 3H93A 5L71A 2GT5A 4Q5RA 1FB0A 5ECLB 3TKQA 3LJRA 3K8NA 4ID0A 3RAZA 1O7UA 2OE0A 4JR6A 2KOKA 3QOUA 3FR3A 3TKSE 2R6KA 5B7CA 3FRCA 4N10A 3TKRA 2FA4A 1YKAA 5D9XA 2C3NA 2FNOA 4WF4A 4WXTA 3QR6A 3Q74A 3HJOA 1ERVA 4MA9A 2V2GA 3CTGA 4OD7A 2VD0A 5DBQA 2O7KA 4H86A 2C80A 4PUFC 5IM9A 2M72A 4FYBA 1HNCA 3U5RE 3JCML 5GSSA 5CNWA 4BWSA 4GF0A 3KZQA 1V9WA 3RPPA 1A8YA 2HZEB 3L9VA 3D22A 16GSA 2OKAA 2PPTA 3KM6A 1M9BA 3Q18A 1ML6A 2LSTA 1K3YA 1GUHA 2H19A 2YPMA 3GSSA 5D96A 1Z9HA 4EC0A 2WZ9A 4DVCA 4YQMA 4TR3A 2FWEA 3KJYA 4JE1A 3GSTA 1SK1A 2LEGA 2ZCTA 1O8WA 2IPAA 3W8JA 4KDUA 5DCGA 2VOCA 1OYJA 4ECCA 1ON4A 2H0HA 4I5QA 2AHEA 1A0FA 3CSIA 3GNJA 2R5GA 4F0BA 3EC3A 2OACA 4ULXA 4I2TA 2FWHA 2GTUA 4MCUA 4YAVA 3M8NA 1A2JA 4K9ZA 2YV9A 2OADA 4KGIA 1R4WA 5ENUA 3I69A 2XC2A 4MABA 10GSA 2GLRA 4GSSA 4NHWA 3ZMKA 5B8AA 5IMFA 4KDYA 1UN2A 2H0IA 5KN3A 3LORA 1S3AA 3A2VA 2H71A 1TDIA 1GL8A 2JACA 3IOSA 3GL3A 4ZBAA 4K7OA 1SK2A 5AIXA 3UBLA 1S3CA 5GSTA 4XIHA 5B8BA 2VCZA 5IMVA 3WD6A 5DCHA 3KXOA 5ECOB 5ECQB 1THXA 2GZZA 4MP4A 5HFKA 1RQMA 1B48A 1FVJA 3MAKA 1K0MA 3EU4A 2IMIA 1BG5A 2F9SA 3C8EA 3HA9A 3QPMA 3TKPA 3F6FA 3NOFA 2L57A 3ZIJA 1MEKA 3TDGA 1M99A 2B5XA 4JRRA 1NHYA 4GQFA 3WGXA 3HCZA 5G1KA 3L78A 2C4JA 5JWOB 2H70A 4G10A 5JCGA 2GQMA 4CDOA 2DJ2A 2HT9A 4QL7A 2RM6A 5G2ZA 5ECNB 1N8JA 1QXHA 2BMXA 1PSQA 1X5DA 1B4QA 1OKDA 3L4NA 1SKRB 4IQ1A 2IWTA 2LS5A 1A2LA 4CHSA 1ABAA 3A5WA 3F4TA 1NW2A 1OAZA 4YH2A 4MF6A 3HVVA 4V1Ap 5KEJA 1K0OA 2IMEA 3GX8A 5IOWA 2WULA 2VCXA 2OE1A 5CP1A 3M9JA 3F63A 3IK9A 5JCUA 1ACVA 3BBYA 4LL1B 2FCHA 4MLYA 1TP9A 5D9WA 1XCCA 4DSSB 2H1AA 1ERWA 1R7HA 2JU5A 4KNDA 3BCKA 1XW6A 3TGZA 4HU7A 2YWOA 2RUEA 2TRCP 3GIXA 1B9YC 3F8UA 2ZNMA 3HD5A 3G7IA 1AQWA 4K2DA 1PL1A 2DMLA 4L8EA 1GTUA 1EEJA 2K18A 3OR5A 1JZOA 3LEFA 1TOFA 4F0CA 4LLRA 1F3AA 2B5EA 1M2DA 3I43A 2C0GA 2KUCA 5A5KA 3ZVJA 1F2EA 1ERTA 1PA3A 2NBSA 4IELA 2DJ1A 5LNKe 1SL0B 5IO2A 3FK8A 1SD9A 4KCAA 4EDZA 4DEJA 4XTSA 2VCVA 3ZTLA 1YDKA 1TK5B 2BJXA 3UVHA 4HQSA 6GSUA 4K1FA 2H6YA 1K3OA 2ON5A 3WT1A 5KN2A 3DD3A 1W4VA 4RQXA 2K8VA 3LXZA 2L4QA 3FZ5A 1EP8A 1FVKA 5CO3A 5CRDA 5AN1A 3MSZA 1VRSD 3TJFA 5GZZB 3LG6A 3ZLPA 1GTIA 1U87A 3KIJA 4V2NA 3BCIA 4IHUA 4MH3A 4NPBA 4E8EA 4PX1A 4NXIA 12GSA 2WGRA 2CX3A 2GDRA 4HZ4A 3KTLA 1X0RA 1KNGA 4ML6A 2DIZA 1VGLA 6GSWA 2CAIA 2WRTA 5IOXA 1Z6MA 5D9TA 5EPFA 3ME8A 2HYXA 2GZPA 1NHOA 1EZKA 1FB6A 5DALB 3ERWA 5HFIA 2R3XA 3PR8A 2FD3A 3EMXA 2I4AA 4LA1A 4WKWA 3IBHA 4HEA2 5FHIA 1Z3EA 1GTAA 5AISA 4NV2A 3GMFA 3CSHA 4OO4A 5JWQB 1T7PB 3GKMA 2I81A 1OC8A 3LGCA 4HI7A 2CA8A 4ZB6A 3TCOA 4MH2A 1Z7PA 2JZTA 3UVTA 3ZITA 5F07A 3LYKA 4TR1A 2H1GA 3HVSA 1MTCA 2DLXA 3VPTA 4K7NA 2DJ0A 1GLQA 4IKHA 3UAPA 2GQLA 5DQSA 2J23A 4K0GA 2LRNA 1V2AA 3ZRDA 2HE3A 2DJ3A 2YOIA 2HZEA 4HJ2A 3H1NA 1N2AA 4V1Ag 1AUCA 1TI3A 5AIVA 2C0DA 4KDXA 3WT2A 3SWLA 2H1BA 5IPGA 4ML1A 4PNFA 2HXKA 2N5FA 1GNEA 3DKSA 4K0NA 2YJHA 3F3RA 3Q6OA 1JZRA 3HZ8A 4POMA 1OE8A 4FH8A 2PN8A 1H4OA 4AGSA 2H6XA 4ZBBA 3FZ4A 3QAVA 2PUKC 4O7HA 5A4UA 4TKYA 1F6MC 4ZL7A 3HKRA 3G7JA 5JCWA 1H75A 4FIWA 1B8XA 1GP1A 3MNGA 4GXZA 3WYWA 2E2GA 4EKZA 4WEYA 1KEBA 3F4SA 2VIMA 2VO4A 4AJ7A 2AV4A 3EU3A 4PGTA 4HU9A 2I1UA 1XW5A 4L0WA 1OC9A 3R2QA 2LUSA 2E0QA 1SJ6A 4V2MA 1BYEA 1GSSA 1MDIA 4IW9A 1O81A 4EVMA 3IXRA 3ERFA 3KH9A 5KN1A 3P90A 2A4VA 1U3IA 1PN9A 3LYPA 1YKCA 3VWXA 2LJAA 3A2WA 2CVDA 2CQ9A 4IBPA 4RI6A 4ISDA 1KTEA 4I8BA 1MD3A 2E2MA 3KEBA 1A8LA 4IN0A 4JU5A 5G1LA 5HR1A 1K0NA 3DXBA 4I97A 3CBUA 4O32A 3H4KA 5HFGA 4N0ZA 2BTOT 3C71A 3DIEA 3KMNA 2MMOA 3V1WA 3GURA 3HYPA 2LJRA 1ZYQB 1T1VA 5DAKA 4ACSA 5COHA 3TRQA 4N30A 1ZCPA 4XS4B 2LQQA 4KA0A 3N5OA 4OFTA 1ZGNA 3AY8A 4LMWA 2D2ZA 1FHEA 1EV9A 1R5AA 4D73B 2IJYA 1BX9A 3NIVA 5CYYA 5F06A 2WB9A 2TIRA 2LJKA 3CYNA 2AYTA 2LQOA 3H8QA 3M3MA 2IN3A 4ILFA 2MZCA 1M2AA 1IYIA 4J56E 2JADA 3IA1A 4WR4A 3TJBA 1LU4A 4KW6A 3ZVJD 4PUAA 2IFQA 2LKUA 1XPVA 4LMVA 2E7PA 2DJJA 1UVZA 3F4RA 4WBRD 3VI5A 4XCSA 1XOBA 4X43A 1V98A 1W89A 2PGTA 1M2BA 4YQUA 2C0EA 3TJGA 3F3QA 3GH6A 1ERUA 2ES7A 3DYRA 3MWHA 4BVYA 2HNLA 3KCMA 1YF1A 19GSA 1X5CA 2B1LA 4Q5FA 5ID2A 1PMTA 3ISOA 5EL8A 4ZB8A 5IMAA 2DIYA 3PH9A 3LWAA 1SL2B 5H5RA 4DSSA 2PBJA 1K0AA 3GKKA 1TRVA 2H6ZA 13GSA 2ON7A 3VI7A 1GUKA 4GSNA 2LV3A 5F05A 1HNBA 2QGVA 3TB2A 5F8BA 3QAGA 3ERGA 4G2EA 7GSSA 2VCQA 4XS6A 2MMAA 2VL3A 4EL1A 3ZFBA 1TKDB 4EUYA 4EO3A 2H75A 4BL7A 4L5OA 1TU7A 2IL3A 3C73A 3CRUA 1GSYA 1QGVA 2CZ3A 1WMJA 2FHEA 4O92A 3FR9A 1JHBA 1SU9A 3UOMA 2L6CA 4HDEA 1TTZA 2PWJA 4ECJA 5J3RA 1E2YA 4AJ6A 5J41A 1OKTA 5D8IA 1AQXA 1GSDA 1QQ2A 1EOGA 2YV7A 3GTUB 4CW9A 4KCEA 1NM3A 2GSTA 3TOUA 2KP2A 3DEXA 1ZZYA 3DVXA 3RHCA 3VWUA 4MDCA 2VM1A 1VF3A 3QD9A 2NDOA 1E6BA 1RK4A 1WOUA 1PD21 1GSUA 1Z5YE 2X64A 3EMPA 2OA7A 2YZUA 2GVPA 8GSSA 1LJRA 4O5RA 2AJQB 1U88A 5ELAA 1O73A 4Q5QA 4N0VA 5E4WA 3APSA 2YANA 4TXOB 1PRXA 2PU9C 1GSEA 3VPQA 3FHKA 1M7TA 5G30A 5KN0A 5ECSA 4K6XA 4TN8A 4J2FA 2PMTA 5CRGA 1S3DA 2YCDA 2VD1A 2H0GA 1AIUA 5DALA 3KGKA 1HYUA 2R2JA 2FUG2 3DVWA 5J9CA 2IMKA 1T8EB 4PQHA 2H01A 3GN3A 1TRUA 2H66A 1EEMA 1XFLA 2YWMA 4X1UA 2WFCA 3TJKA 2FGXA 2O85A 3CTFA 1EV4A 1DE1A 5INYA 4DSRA 1WRYA 3VLNA 4BA7A 1V57A 4BWQA 1YY7A 2XPDA 1J08A 4XRAA 1OC3A 1MDKA 1TK8B 2M80A 1NSWA 4I6XA 5DQYA 2ZUPA 1LBKA 3O76A 5D93A 4TOPA 3L9SA 1WWJA 2YJ7A 5DDLA 2C8UA 2JL4A 4L5LA 2FWFA 2C0FA 4FYUA 3W6GA 18GSA 3C7MA 1GUMA 1QK8A 2FWGA 2YNXA 1TI1A 3PINA 1I9DA 3FZAA 2V32A 4WETA 1SL1B 2YP6A 4TRXA 3IAM2 4EDYA 1C72A 2WS2A 2B7JA 4MZWA 2VUPA 2RM5A 2VCWA 2V6KA 1KBNA 2H72A 3RBTA 4NV5A 1BEDA 1FO5A 2P5QA 1OE7A 3M1GA 3FW2A 3IHQA 5LCZA 1EGOA 4WF5A 3KP8A 2MBTA 1HD2A 3IC4A 4MJEA 3TKSA 3SBCA 4IS0A 4LL4B 1MDJA 2F3MA 1YQ1A 3QMXA 14GSA 1O6JA 2N5BA 1EGRA 2H1DA 3KD0A 3I9V2 3IE3A 2HI7A 3IPZA 2KLXA 2IMDA 3LSZA 1DSBA 3P7XA 5JWRB 4F2IA 1SYXA 3QFAC 1XWCA 4JBBA 2PVOC 4GQCA 1BJXA 3ED3A 3IAS2 1UA5A 1JLWA 1A2MA 1TXXA 3UARA 3GHAA 2GSQA 3RDWA 4TW5A 1AC1A 2RLIA 4FO5A 1CQHA 2DSAA 4MZCA 3J7Yb 20GSA 3HHVA 3GKXA 1O85A 4F03A 1GH2A 3DRNA 3HJPA 3HXSA 3ZZXA 3ZL5A 3MDKA 3C1RA 2P5RA 2JZRA 1X5EA 2VL2A 5D73A 3GX0A 6GSXA 2HRNA 3UL3A 3A3TA 4EF0A 5IIZA 2GT6A 4TVEA 1PL2A 2X8HA 3GKNA 1XIYA 3H79A 4WBJA 3N9JA 3EYTA 1YZXA 1B4PA 3U6VA 4GLTA 1SYRA 2WCIA 1PX7A 2QC7A 5H5QA 5HR0A 3HJMA 3QCPA 4MMMA 1SJIA 22GSA 1Z6NA 4IQAA 4XS4A 2B3SA 1XWBA 1J9BA 4HJMA 1HQOA 3APOA 3O3TA 2K9FA 3Q19A 4EE0A 2CT6A 1FW1A 1DUGA 5ECMB 4OFNA 1XWKA 1ZL9A 4POBA 4BPYA 1Z7RA 3US3A 4WR5A 4PURA 4MZBA 2DBCA 4OFMA 1GWCA 1O8XA 3HY2A 2HSYA 2X99A 3FYGA 3LQ7A 4IJ3A 2VL9A 2G2QA 5ECHB 2OJLA 4NWYA 1R5PA 3PGTA 4MK3A 4TR1B 2I9HA 4PQIA 2VLTA 4MPFA 2PERA 2ALBA 2RIIA 1EP7A 2NVLA 2VCTA 4QL9A 5FWGA 4XHMA 3TKSC 2HZFA 2JSYA 17GSA 3ME7A 1Y6EA 1T00A 1PKWA 5CRWA 3KTBA 5J4UA 3UMAA 3UBKA 1M0UA 4BVXA 2XBIA 2C1YA 1XVQA 1BAYA 2AAWA 4ZB9A 2H74A 3E3EA 1ZMAA 1YF0A 4K7IA 5J5NA 4ZBDA 1XBSA 2B5YA 3VWVA 1GULA 4KB3A 3TJJA 3TRPA 4RI7A 4RQRA 4MPGA 4MF7A 4E8HA 1GSQA 2R4VA 2OE3A 4MJAA 6GSSA 5ECKB 1GTBA 1TK0B 3GFKA 5J9BA 3EINA 4XS1A 3GUSA 4GCIA 2HSHA 1ST9A 4KSMA 4GSTA 2H8LA 3L9UA 4KH7A 3GTUA 3A2XA 3IR4A 4KSOA 4P3YB 1CQGA 3D6IA 2VL2C 4IJIA 4ECIA 2F8FA 1PKZA 4KE3A 2LTKA 1G6WA 5E59A 1EOHA 3ZFLA 2DMMA 5ABRA 1OC9B 3EURA 5ECRB 2B7KA 1URMA 2L5LA 3FR6A 2X8GA 4ZXGA 1SENA 4N11A 4KUNA 3GYKA 5DJLA 4NAXA 2DC5A 3RHBA 1WE0A 2J9HA 1WJKA 1TJDA 5A4WA 1F37A 5C00A 4OO5A 6GSVA 4TXOA 5ELGA 4AJ8A 2NTOA 4ECBA 1V58A 5GAND 5EY6A 3ZYWA 3P2AA 4XRDA 2VAFA 5IQYA 3HDCA 2F8AA 4HS1A 2VLVA 3BD2A 2A2SA 2RUFA 5IPHA 3EE2A 3APQA 4V2LA 2EIRA 2I3YA 1Y25A 1VF1A 1AQVA 4QQ7A 3CXGA 5DVBA 5EVOA 3QAWA 3BJ5A 1VF2A 4YAPA 1WP0A 2L4CA 3LFLA 1AAZA 2H76A 5CRHA 5G5FA 1QFNA 5DAKB 2HFDA 5H5SA 2YN1A 3P8WA 2CX4A 6GSTA 3VWWA 3IDVA 3UIWA 3E0UA 1FG4A 5ECIB 2V1MA 1K0BA 1YEPA 1JLVA 3TRXA 1V40A 4Q5NA 4ZIJA 5F0GA 5B6MA 3GH9A 4JZQA 5D9VA 2GS3A 3DGQA 4IGJA 3GA4A 5DJMA 3WGEA 1SK0A 2CAQA 3QFBC 2TRXA 1UC7A 2LRTA 3FY7A 4PQ1A 4I2UA 1FAAA 3ZMLA 2IFQB 3M9KA 2JZSA 2IIYA 4JEDA 1J0FA 3ZREA 3IK7A 4KAEA 4HUAA 5G5EA 5A4VA 2C3QA 3D21A 3VFIA 5IMZA 2PVQA 1Q4JA 3ZIVA 4IP1A 1TW9A 1TRSA 2O8VB 1JZDA 1VF4A 1YEXA 2XPEA 1G6YA 5ID2B 3TOTA 5C04A 3FEUA 2O89A 3W8SA 1DE2A 2L6DA 4FYCA 2XHFA 2B6MA 2JSZA 4L0UA 1PX6A 2MMZA 4ZL8A 1A23A 3D4MA 1Q98A 3E9JB 3M0FA 1A0RP 2L59A 1G7OA 2QKEA 2QSIA 3F0IA 2V6OA 1M9AA 1QMVA 2N5AA 4HOJA 3NZNA 3O6TA 3VURA 4ZL9A 3FZ9A 1XOAA 5HR2A 1U6TA 1JZWA 1QUWA 1X9SB 1XXUA 4GWRA 5CAXA 1XZOA 4G9HA 2HLSA 3EWLA 4DSQA 1WIKA 1U3AA 4TR0A 2GZYA 2CVKA 4TR4A 1PGTA 2HRFA 4RUVA 3GRXA 3G9BA 3HZ4A 1K0DA 3KH7A 2OBKA 2DJKA 3C1SA 1JFUA 4OCFA 1AXDA 2AUVA 4YQVA 3KMOA 3FKFA 1K3LA 5AGYA 1A24A 1G0TA 9GSSA 3CSJA 1YJ6A 1PQNA 1SJZA 4HZ2A 1T4ZA 4OCEA 2KP1A 4NMUA 2MBSA 3UEMA 1X9WB 2K6VA 1I5GA 2VM2A 2VLUA 2B1KA 4PNGA 3HVXA 4MJBA 1X9MB 3IRAA 2LNSA 3EVIA 2FLSA 3D4TA 4NHZA 2EC4A 4JR4A 2F51A 2GSRA 4IVFA 2Z9SA 2K8SA 1ZOFA 5IO0A 5IMDA 1IYHA 4PXOA 2CV4A 3LXTA 2EIQA 4X0XA 4GTUA 2X8CA 2P0GA 1XWAA 2OBIA 5GAPD 1AW9A 2GSSA 1SKWB 3TUEA 4KX4A 1F3BA 4OWYA 4IP6A 3GV1A 3DWVA 2FY6A 1K0CA 2LNTA 4Z7XA 2AB6A 6GSYA 3L0HA 3CRTA 1DBYA 2V41A 3QDNA 3WGDA 2M46A 3I6AA 2P31A 1EWXA 1GSFA 3UJ1A 2WJUA 3VK9A 2IMFA 4GRFA 5FT3A 1HNAA 3GL5A 4K8MA 2L5OA 4J57E 1GLPA 1ILOA 1T4YA 4POLA 1FOVA 1THOA 3CMIA 2REMA 3S9FA 2A2RA 4G19A 1TRWA 1G7EA 2GGTA 1TU8A 2XBQA 1XVWA 5G31A 2CZ2A 4HQZA 1OVNA 4MF5A 5IMCA 3F9UA 3D0ZA 5ECPB 4F82A 1USBA 2H30A 4POKA 2YWIA 2LRCA 1MD4A 2CVBA 11GSA 2NPBA 1B9XC 2EIOA 4ZILA 4AF2A 5CREA 2FA8A 2KHPA 2H73A 1BQ7A 1WPIA 2G0FA 1T3BA 4TXVA 2O87A 5HR3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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