2M72A

Solution structure of uncharacterized thioredoxin-like protein pg_2175 from porphyromonas gingivalis
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
NTYAQLPAVSLKNIEGKTVQTNKLENAGKPMIISFFATNCKPCLRELKAIQEVYADWQDETGVRLIAVSIDEGQNAQKVKPLADGNGWEYEVLLDSNGDFKRAMNVSLIPAVFIVDGNGKIVYNHTGYTEGGEAELIKKVRELVKEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of uncharacterized thioredoxin-like protein PG_2175 from Porphyromonas gingivalis
rcsb
molecule keywords Uncharacterized thioredoxin-like protein
molecule tags Unknown function
source organism Porphyromonas gingivalis
total genus 37
structure length 153
sequence length 153
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2m72A00
5CNWA 1UVZA 1O73A 2PMTA 1O81A 1ZMAA 4EXJA 3FR6A 2HXKA 4XCSA 4Q5NA 4BWSA 3J7Yk 1J08A 5ECOB 1FHEA 2XHFA 3CYNA 4P3YB 3GNJA 1DE2A 4TVEA 5CYYA 3GUSA 5IPGA 4YQVA 1GTIA 4FO5A 1SL2B 3HJMA 4DSSB 2LTKA 4IVFA 3UBLA 5ECLB 4KDUA 2MMOA 1V9WA 2HZEA 2H73A 1A2JA 1LJRA 5A4VA 2C1YA 4EL1A 4JBBA 2V32A 4N30A 5GZZB 2AHEA 4N10A 3EC3A 1XCCA 5GSSA 4E8EA 2H19A 2O85A 5F0GA 2IWTA 1VGLA 2IPAA 2YJHA 5CRDA 3IR4A 1O8WA 2B7JA 5COHA 2L4QA 2F8FA 2R37A 3GL5A 4OCFA 5F8BA 3APSA 2QSIA 3H1NA 2YJ7A 1ZCPA 1PSQA 4POBA 1T3BA 2YWMA 3UOMA 3E3EA 4PGTA 2HSHA 5G2ZA 2RM5A 1MDIA 6GSXA 1ZZYA 4EVMA 1K0DA 4HDEA 2H66A 5B6NA 2EC4A 1M7TA 4MMMA 1KNGA 5IMAA 1XW6A 2LV3A 4KH7A 4I6XA 5B6MA 3HVXA 2VL9A 4PQ1A 3KH9A 2GZYA 1SJIA 3EU3A 1NHYA 4FH8A 1OE8A 1G7EA 3F63A 5JWOB 1U6TA 3O3TA 4EDYA 1O7UA 2X8GA 2NDOA 3RPPA 3F4RA 1XOBA 3D0ZA 5DCHA 1GWCA 3IAM2 2HNLA 5F05A 1YDKA 2TRXA 2DSAA 3V1WA 1J0FA 1M2DA 2YOIA 3G9BA 4PX1A 3DD3A 1Q4JA 1TK8B 1SYXA 3TOUA 2F51A 2VM1A 2ES7A 3F4TA 3LSZA 4K1FA 3GL3A 5KN2A 4GSSA 1O8XA 2IMDA 2M72A 1EP7A 1OVNA 3QCPA 2C8UA 2H75A 2K8VA 12GSA 1T8EB 4XRAA 4XS4B 4X0XA 4AGSA 4DSSA 3ZFLA 3EMXA 3C8EA 2B3SA 1GSUA 3IC4A 3ZVJD 2DJ2A 3EMPA 2V1MA 4WXTA 2LJAA 1JZOA 4KNDA 1GLPA 5A4WA 1PMTA 4L0UA 11GSA 4JRRA 1MDKA 2OACA 4BPYA 3M9JA 2ZUPA 2X8HA 1DUGA 2A4VA 2HRFA 3TKSE 1FB0A 2XPEA 4K7OA 2CV4A 2WS2A 5IMFA 4ACSA 2VAFA 2PERA 1GSEA 1BEDA 4FYUA 2RUEA 2NVLA 2H6ZA 4K6XA 3EE2A 2H0IA 1GUMA 2L4CA 4EDZA 1ABAA 3QOUA 4HZ2A 4JU5A 3O76A 3SBCA 5ECNB 2CA8A 4MDCA 5HFKA 2G2QA 3IXRA 3CRUA 3RDWA 1AQVA 2CT6A 2ZCTA 3TKSC 2DJ3A 5HQPA 1GSFA 2B1LA 3PINA 3BD2A 1VRSD 2KP1A 4ECBA 1QFNA 4F0CA 2AYTA 4V2NA 2FWEA 3G7JA 4ZB8A 5D93A 2L59A 4AJ7A 3TRXA 5G5EA 4MLYA 1FB6A 3IOSA 1ERTA 2JZRA 3BBYA 3MDKA 3IRAA 5LNKe 1K3OA 2LSTA 3LORA 2J9HA 4WBJA 5EL8A 3NZNA 4OO4A 4MZWA 3HZ8A 22GSA 2AV4A 2JL4A 2OE3A 1VF3A 2G0FA 3UBKA 4JR6A 1OYJA 4QL9A 5E4WA 1SYRA 2E2GA 1JHBA 2HZFA 1YKAA 1M9AA 4LA1A 3OR5A 4TN8A 2MZCA 4MJAA 2YV7A 2OBKA 3HJPA 2F9SA 4V2LA 3KH7A 2C0FA 1F6MC 1YEPA 4HQZA 3F6DA 2FA8A 3UVHA 3DKSA 4ECCA 3A2VA 3QDNA 1SU9A 2GSQA 1WIKA 2OA7A 2REMA 3ZZXA 2R4VA 3A5WA 4F03A 4OMVA 1OE7A 3ZL5A 2RIIA 1ZYEA 5D9WA 3TB2A 2WDUA 2KLXA 4JR4A 3GV1A 4NAXA 2IL3A 3IA1A 3O6TA 2IMIA 5CRGA 3ERGA 2PN8A 5H5SA 1SL1B 5J3RA 3UARA 3CTFA 4F0BA 2YV9A 3VI5A 4I5QA 2EIOA 2YZHA 1Z6NA 3FKFA 3HYPA 5KN1A 4ML1A 1ST9A 3N5OA 2HZEB 2DMMA 1XWBA 3APQA 3ZRDA 2VO4A 2KP2A 3GKMA 4O7HA 2P5QA 1EV9A 3EINA 1YQ1A 5KN3A 2MYGA 4K9ZA 3VWUA 3F8UA 5F07A 2VOCA 3C71A 1SJ6A 2CVKA 5D73A 1JLVA 1Z5YE 1O6JA 2LNSA 4KUNA 2C80A 1N2AA 4V1Ap 4ZIJA 2AB6A 4ECIA 2LKUA 4MABA 3KZQA 1XPVA 1MDJA 3TUEA 2JZTA 1XWKA 1TK0B 2PUKC 1SENA 3VURA 3UAPA 2H6YA 1VF4A 1I5GA 3DWVA 4ECJA 2VL2A 3EWLA 4IJIA 2AJQB 2H71A 2KUCA 3BOAA 4TR0A 5GAPD 4NHWA 4F2IA 3S9FA 1CQGA 1GRXA 3RHBA 3HD5A 4O92A 3TJGA 2V2GA 5IMCA 4WEYA 3BJ5A 3ZTLA 1TOFA 4POMA 5HR0A 4TW5A 1TJDA 5ECPB 2YCDA 1G6YA 4MH2A 1ML6A 2WFCA 2VCZA 3N9JA 3M8NA 3CSJA 3NIVA 5DALB 4POKA 1F37A 20GSA 4NV5A 5JCUA 1PD21 2GQLA 4F82A 3RBTA 3I6AA 2YZUA 3LWAA 1N8JA 2ZNMA 1A8LA 2X99A 2XBIA 4WF4A 3HDCA 5D8IA 1THOA 3MWHA 3VPTA 1JZWA 4IGJA 1HNCA 1WMJA 3UL3A 3Q6OA 2NTOA 2MBSA 2L5OA 3BCIA 3ISOA 4JEDA 5CP1A 1GTBA 4IKHA 1UN2A 1TP9A 2H0GA 3QR6A 1V58A 1B4PA 1AQXA 1G0TA 4IS0A 3WGEA 5L71A 1T4YA 2WGRA 4BVXA 5CREA 5AIXA 3PH9A 3IV4A 5ECSA 3VI7A 2YPMA 1QQ2A 4HU9A 4MZCA 2YN1A 1PQNA 1WE0A 3QAVA 3WT1A 2VL3A 4ZL7A 4OO5A 3F3RA 2JSZA 1A0FA 2YWOA 3KXOA 1GSQA 3KTBA 5G5FA 4KSOA 5F06A 2GLRA 1AUCA 2P31A 5DQSA 2JACA 4NMUA 2H6XA 5HFIA 2IIYA 2R3XA 2YNXA 4NXIA 1K0AA 2O8VB 3E9JB 1NM3A 6GSVA 5B8AA 1JLWA 3VWVA 3QAWA 5AISA 1ILOA 3D21A 6GSUA 5CAXA 1ERVA 5ID2B 5CO3A 3TCOA 4MF7A 3ZVJA 1UC7A 1QXHA 2XC2A 2F8AA 1QGVA 4PXOA 1TTZA 1TK5B 3P90A 1MTCA 2GS3A 3C73A 3QAGA 2RLIA 4NPBA 1R5PA 5LD0A 3TKRA 1GSYA 1IYIA 2P5RA 2V41A 2V6OA 4KB3A 3Q19A 2PPTA 1BAYA 4IELA 5DALA 3CTGA 2DLXA 5J41A 3VLNA 3TJBA 4J2FA 3GN3A 1KTEA 4CHSA 3IE3A 2MMAA 3ERFA 1YEXA 1BX9A 2CZ2A 2LNTA 3ZITA 2FWHA 1ACVA 2GZPA 2VCXA 4GTUA 1DBYA 1HQOA 3WD6A 1HYUA 2VCQA 3DVXA 1YJ6A 2B5XA 4G2EA 2HRNA 2PWJA 4XS6A 3CRTA 5D96A 3IAS2 4NHZA 4AJ8A 3KJYA 1PX7A 2LEGA 2H30A 1T7PB 2OADA 4IN0A 1SK1A 1H4OA 4PNFA 5B7CA 4KW6A 2LUSA 3KMNA 2XPDA 2KOKA 3IK9A 5G31A 4L8EA 1B9YC 3GURA 1WJKA 1A0RP 3GRXA 2O7KA 2PVOC 3GX0A 3KCMA 3W8SA 4GLTA 4Q5FA 3P7XA 2WULA 4EE0A 6GSWA 1BYEA 4LL4B 5ELGA 4HOJA 2O89A 2X8CA 4TRXA 1SKWB 4JE1A 5FWGA 4YAPA 2DJJA 4WBRD 1ZOFA 1GNEA 3CBUA 5CRHA 4HI7A 2JADA 2GSRA 1XWAA 1EOGA 5IO2A 3H4KA 2GDRA 4KCEA 4IQAA 1TU7A 2K9FA 4TXVA 2FHEA 1YF0A 3UEMA 5EPFA 1V98A 2M80A 4IP6A 1RW1A 1U87A 5ID2A 1G6WA 3WGXA 1XW9A 3KTLA 4PQIA 4HEA2 4KGIA 1X0RA 1UA5A 1OC9A 5GSTA 4QQ7A 4LMWA 1B4QA 1TRVA 3G7YA 4MJEA 1X9SB 2H76A 4YQUA 1HNAA 18GSA 1EOHA 3GH9A 3FZ5A 4PQHA 1H75A 2FLSA 3KGKA 4EUYA 2K6VA 4QL7A 4HQSA 1EV4A 3Q18A 3LEFA 4IW9A 3GKXA 2IN3A 1K0OA 1FG4A 3LG6A 2B6MA 1B48A 5IIZA 4RI6A 1SL0B 4O5RA 4HS1A 2YWIA 3L9VA 4MP4A 3GA4A 4E8HA 3QD9A 8GSSA 3ED3A 1FOVA 3DRNA 5ECQB 5GAND 1SD9A 5E59A 3LXZA 4BA7A 4FYCA 1TKDB 1M9BA 3I9V2 1USBA 1S3DA 5ECHB 4LL1B 4DEJA 3GYKA 1HNBA 3KMOA 4OCEA 5A4UA 3R2QA 1PKZA 3HKRA 1F2EA 3RAZA 2N5BA 4MA9A 3M0FA 3DYRA 2CVDA 3HA9A 5HR3A 2GSTA 4GSNA 2QGVA 5G30A 1ZYQB 2I3YA 1F3BA 2BTOT 2K18A 4N11A 4HJ2A 3GHAA 4I8BA 2VCVA 4ZBDA 1KBNA 1PL1A 3FZ9A 3ZIVA 3IHQA 3VK9A 3DVWA 4N0ZA 5INYA 1A8YA 3AY8A 2VL2C 3L4NA 5IMDA 4AF2A 4FIWA 3QFAC 1OAZA 5G1LA 4LMVA 1M2AA 2L6DA 3IBHA 2CAQA 5G1KA 2RM6A 1Z7PA 4EO3A 2B7KA 3TJJA 3FK8A 2L57A 2B1KA 4WR4A 1S3AA 3ZFBA 4ZL9A 1ZL9A 3H79A 2PGTA 5J5NA 1R26A 5IQYA 2DBCA 1PKWA 5DCGA 5J9CA 4K7IA 3GX8A 1Z3EA 1GH2A 1IYHA 2LJRA 1NHOA 1T4ZA 3DIEA 1QK8A 3D5JA 4BL7A 2IJYA 3ZLPA 4ULXA 2VLTA 2EIQA 2IMKA 2QKEA 3A2WA 2E2MA 2P0GA 2OE1A 4MPGA 1W4VA 4DSQA 4MPFA 2MBTA 2OKAA 4YAVA 4OD7A 2HI7A 2HSYA 3D6IA 1C72A 2H72A 3EU4A 3IDVA 4GSTA 1V57A 4G10A 1TXXA 5IMVA 5ENUA 1MEKA 4K8MA 4Q5RA 2H1BA 3FZ4A 5DAKB 1X5DA 4TOPA 3HVSA 3J7Yb 3DGQA 13GSA 2VCWA 4YH2A 2VLUA 3GSTA 3WGDA 3L78A 4KCAA 5ELAA 2B5EA 1R5AA 4HU7A 3EURA 3LJRA 4K0NA 2FD3A 1A23A 1FAAA 1Z9HA 5DDLA 2CX3A 2JU5A 4MF6A 2HLSA 5CRWA 4LLRA 5ECRB 2EIRA 3W6GA 3CMIA 2FWGA 1ERUA 4GCIA 2R2JA 3JCML 4WF5A 1XXUA 1EGOA 2L5LA 2J23A 4KAEA 3C1SA 3M9KA 2FNOA 4WR5A 1K3YA 1RK4A 1AQWA 2H74A 3GMFA 4FYBA 2OBIA 3VWXA 1XBSA 2CZ3A 4K0GA 2E7PA 5IMZA 1R7HA 3BCKA 3A2XA 3APOA 1XW5A 1Y6EA 2H0HA 2VCTA 3F4SA 1WP0A 4AJ6A 1QUWA 1V40A 2N5AA 2X64A 2GTUA 3TJFA 1SK2A 1X5CA 4KE3A 3FHKA 3TRQA 3D4TA 5AIVA 2HE3A 3HVVA 1TW9A 3GKKA 4MCUA 4ZXGA 2PBJA 1PN9A 2DC5A 5DVBA 1GSSA 2GGTA 1FO5A 4G9HA 3TJKA 3Q74A 4EKZA 2GQMA 4L0WA 3DMLA 3L9SA 3C7MA 3WT2A 5ABRA 3QMXA 3WYWA 5IO0A 3P2AA 1G7OA 3H8QA 1ERWA 2JZSA 2VD1A 4X43A 7GSSA 2BJXA 3KD0A 4ID0A 2I4AA 1URMA 5FT3A 1KEBA 1V2AA 5ECIB 2WZ9A 4I97A 4MF5A 3ZYWA 5D9TA 4GXZA 4NV2A 3L0HA 5ECMB 4EF0A 2LJKA 2HFDA 1FVKA 3GSSA 3UIWA 2YANA 1XFLA 2FGXA 1EEJA 4TR1B 2YWNA 2IFQA 3D22A 3L9UA 4PURA 2GT5A 4IQ1A 2VUPA 2H01A 1Z6MA 3GTUB 1A2LA 1ZGNA 2DJ0A 1XZOA 3M1GA 2HT9A 3F6FA 1OC9B 1GL8A 3QFBC 5DAKA 1M0UA 1AIUA 1FW1A 3DEXA 1AW9A 5JCGA 1E6BA 1VF1A 5IOXA 2I1UA 4GF0A 1BJXA 2DJKA 1Q98A 2K8SA 2OJLA 1B9XC 1WRYA 2LRTA 4PUAA 4ZILA 4KSMA 2N5FA 1GUKA 4Z7XA 2H70A 1S3CA 5JWQB 3NOFA 1WWJA 1K0BA 4BWQA 2WCIA 3U5RE 4OFMA 1RQMA 2FA4A 1EP8A 1THXA 5KN0A 2O87A 17GSA 19GSA 1A24A 2LRCA 1YY7A 2D2ZA 5DBQA 2YP6A 1U3AA 3TKQA 3ZMKA 3D4MA 4JZQA 2MMZA 2XBQA 2E0QA 4TKYA 4V2MA 4PNGA 4F9ZA 3IPZA 1F9MA 2Z9SA 1XWGA 3QPMA 2JSYA 4XS1A 4OWYA 4TR4A 5A5KA 1WPIA 4ZB6A 3VPQA 3I69A 4HZ4A 1K0NA 3F3QA 1SKRB 2FUG2 2ON5A 1R4WA 4GRFA 1GP1A 3TRPA 4D73B 1M2BA 3I43A 4YQMA 2C3QA 4X1UA 2QC7A 4XHMA 3VWWA 1DSBA 4J56E 4MH3A 2AAWA 1XVWA 1B8XA 2VD0A 4L5LA 2LS5A 1T00A 5ECKB 1W89A 4DSRA 1X9MB 3FR9A 1X5EA 4EC0A 1VF2A 1J9BA 3HCZA 1OKDA 4L5OA 3ZMLA 5DJMA 5C04A 3MAKA 1YKCA 5EY6A 3FW2A 3UJ1A 1M99A 1F3AA 2LQOA 6GSTA 4TR1A 1HD2A 2ON7A 2L6CA 1U88A 1Y25A 3A3TA 5D9XA 3GTUA 4O32A 4GWRA 4ILFA 2DIZA 2A2SA 2ALBA 4CW9A 2PU9C 2DIYA 1PRXA 1GSDA 4IJ3A 5HFGA 2GSSA 4POLA 5H5RA 4MJBA 2A2RA 1PX6A 1GTAA 3CXGA 2GZZA 3KP8A 4GQCA 3KM6A 1XWCA 5DQYA 1GUHA 1TU8A 2R5GA 2WRTA 1OC8A 1TI1A 3TOTA 2GQKA 4N0VA 3ERWA 4KDXA 2M46A 3ME7A 4NWYA 2WB9A 3W8JA 5H5QA 1EZKA 5JCWA 10GSA 3UMAA 3H93A 4PUFC 2KHPA 1DE1A 3M3MA 2TIRA 3TGZA 3KEBA 1LU4A 2VLVA 4BVYA 4KA0A 1BG5A 2VIMA 3SWLA 1YF1A 1PGTA 2IMEA 4OFNA 1O85A 4G19A 4J57E 5IOWA 1CQHA 1SKSB 1QMVA 3EVIA 1TRUA 2NBSA 3IK7A 4KDYA 5LCZA 1AAZA 3HHVA 3HY2A 1YZXA 2CVBA 4K7NA 2H1AA 5J9BA 2BMXA 9GSSA 4XTSA 2CAIA 3LXTA 2H1GA 2LQQA 3FRCA 4ZBAA 2LRNA 4TXOB 1K3LA 5C00A 3GKNA 1K0MA 1MD3A 3HZ4A 3US3A 2GT6A 1PA3A 4D73A 1PL2A 2MMNA 3ZREA 3TKSA 3RPNA 1GTUA 3C1RA 4XIHA 4XS4A 1XOAA 2VM2A 3VFIA 3CSHA 2C3TA 6GSSA 1EGRA 3K8NA 5D9VA 4XRDA 4ZB9A 5JWRB 2FCHA 3UVTA 4WKWA 14GSA 2C0GA 5B8BA 3TKPA 1GULA 1TRWA 2FY6A 2OE0A 1TRSA 3LQ7A 1WOUA 3F0IA 3HXSA 1X9WB 3GFKA 4I2TA 2C4JA 3LYKA 5J4UA 2H1DA 5KEJA 6GSYA 3LGCA 5EVOA 1XVQA 3MSZA 4RUVA 4HUAA 4TR3A 2F3MA 4IBPA 1U3IA 1OKTA 1EEMA 4RQRA 1GLQA 1Z7RA 2CQ9A 2DJ1A 1E2YA 4GQFA 5AGYA 2C3NA 1I9DA 1NSWA 4WETA 2HYXA 3FEUA 4MJCA 2WJUA 1GNWA 2C0DA 2CX4A 1A2MA 3MNGA 5DJLA 1MD4A 5AN1A 4ZL8A 4DVCA 3TDGA 4H86A 3FZAA 4HJMA 2IFQB 4RQXA 1ON4A 2V6KA 5HR2A 2H8LA 4IHUA 3P8WA 3FYGA 1K0CA 1T1VA 1TDIA 2PVQA 4ZBBA 2DMLA 1LBKA 4CDOA 3LYPA 2I81A 2RUFA 4V1Ag 4IP1A 4MZBA 2TRCP 1EWXA 3RHCA 3GH6A 3ME8A 2B5YA 4K2DA 1OC3A 1TI3A 4Q5QA 3EYTA 1SD8A 2FWFA 3ZIJA 1SK0A 1BQ7A 1XIYA 4ML6A 2C0EA 4RI7A 3KIJA 3LFLA 3PGTA 3U6VA 4OFTA 16GSA 2I9HA 4I2UA 3GIXA 2R6KA 2AUVA 3E0UA 1FVJA 4KX4A 1AXDA 1NW2A 3FY7A 4MK3A 3HJOA 1JZRA 4TXOA 1JFUA 3DXBA 3KP9A 2GVPA 2IMFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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