2M72A

Solution structure of uncharacterized thioredoxin-like protein pg_2175 from porphyromonas gingivalis
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
NTYAQLPAVSLKNIEGKTVQTNKLENAGKPMIISFFATNCKPCLRELKAIQEVYADWQDETGVRLIAVSIDEGQNAQKVKPLADGNGWEYEVLLDSNGDFKRAMNVSLIPAVFIVDGNGKIVYNHTGYTEGGEAELIKKVRELVKEGHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of uncharacterized thioredoxin-like protein PG_2175 from Porphyromonas gingivalis
rcsb
molecule keywords Uncharacterized thioredoxin-like protein
molecule tags Unknown function
source organism Porphyromonas gingivalis
total genus 37
structure length 153
sequence length 153
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2m72A00
2V1MA 1H4OA 3ZMLA 3GIXA 4TRXA 1M99A 1FW1A 5IPHA 5D96A 1FG4A 6GSTA 4AJ6A 3UARA 4DVCA 3F6DA 2PWJA 3F63A 1YDKA 3Q18A 3ME8A 3HKRA 1NHOA 2AUVA 2L4CA 3ISOA 5KN3A 1YF1A 1C72A 3QCPA 5IOXA 4RUVA 2NDOA 3LEFA 4MJBA 4ISDA 2OKAA 4IJ3A 4OWYA 2H75A 3M9JA 6GSUA 2OE0A 1GL8A 4EF0A 3TOTA 2M46A 3Q19A 4NMUA 3KCMA 3HDCA 3KGKA 1ON4A 1GLPA 2PUKC 3O3TA 4TXOB 5DJLA 1W89A 3LGCA 4WF4A 1A23A 3U5RE 5AIVA 1WWJA 1WPIA 2B6MA 4MK3A 3ERFA 1QMVA 4MZCA 2V6OA 2YV7A 2YNXA 2C0EA 2HRNA 2CX4A 4O5RA 3UBLA 4D73A 4HJMA 10GSA 1GULA 3UJ1A 4EKZA 3HY2A 4WBJA 3H8QA 3HA9A 2TRXA 3HD5A 5F06A 2FY6A 4XRAA 4KB3A 4DSSB 5D9WA 1WOUA 2E2MA 5HR2A 4DSQA 5IMCA 2CQ9A 3EWLA 1J0FA 5ECHB 4AGSA 3KIJA 1LU4A 1MDJA 2FCHA 5ECNB 2AJQB 2HXKA 1U6TA 5AIXA 2ON7A 3LG6A 5A4WA 5D73A 3VFIA 2DSAA 3L9VA 1LJRA 4Q5NA 1SENA 4RI7A 4PQ1A 6GSYA 1U3IA 1V98A 4GRFA 2WRTA 5D9VA 2EIRA 1AC1A 2JACA 3LXTA 2HSHA 2OACA 1E2YA 4MMMA 5CREA 1PX7A 1OE8A 1O7UA 1THXA 2VOCA 1PL2A 3CRTA 2GT5A 3DKSA 4HQSA 4IJIA 5LCZA 6GSWA 4TOPA 12GSA 1YJ6A 3DVWA 5ELGA 3A2WA 5CAXA 4WR4A 2DJ2A 4IGJA 1BEDA 3K8NA 4MH2A 1F3AA 2H73A 3ZFBA 3G9BA 2TIRA 1ZL9A 4F2IA 3G7YA 2MMOA 1U88A 5ECLB 3CTFA 1FVJA 3L9UA 1AUCA 1GSUA 1K3LA 5HFIA 2H74A 3E3EA 1TRWA 1GNEA 1T3BA 3CRUA 2X64A 5JCUA 5IO0A 2D2ZA 4HDEA 3KD0A 3UVHA 2A2SA 2C4JA 2WS2A 3TJGA 1K0NA 3TCOA 8GSSA 4JEDA 4G9HA 1R5AA 3KTLA 5IMZA 2LS5A 6GSXA 3PGTA 1OC9B 1TI3A 3KM6A 4V1Ag 3C71A 4XHMA 3VPQA 1DUGA 2GZPA 3LQ7A 2GSSA 1WRYA 2R2JA 2HSYA 1EEMA 4KCEA 1NSWA 1XFLA 3U6VA 5FT3A 4K7OA 4HI7A 1K0BA 5F8BA 3F4RA 2WDUA 4KE3A 2M80A 3BOAA 1ZZYA 5G5FA 3D22A 3M9KA 1PD21 4X1UA 1PMTA 3EU4A 3TGZA 2V2GA 3KMOA 1G7EA 4KUNA 3CTGA 1Z9HA 1ZOFA 3TJKA 5JWRB 3TDGA 3M0FA 2MBTA 4TR4A 4TR1A 3IOSA 2JL4A 4O7HA 4OO4A 3ZVJD 2YWIA 1SK2A 4PUFC 2LQQA 2C3NA 2GLRA 2LJRA 2GZZA 3CXGA 3HHVA 4HU9A 5LD0A 2FNOA 3FZ4A 1EV4A 2IJYA 3IDVA 3P2AA 2H0HA 3WGDA 1GTUA 3VK9A 1YEPA 2LNTA 1XVWA 3EYTA 2H6ZA 4IHUA 1A24A 1GWCA 1M7TA 5KN0A 1M9BA 5G31A 1TJDA 3LWAA 5IQYA 3GRXA 5EVOA 3L0HA 5FWGA 2FD3A 2K9FA 4MJEA 4N0ZA 2VCZA 2VD0A 5DJMA 2FLSA 3VI5A 2H0IA 3F0IA 2IN3A 4MP4A 4KGIA 4TXVA 1RW1A 1A2LA 2CX3A 2FWFA 1BG5A 3N9JA 3KH7A 4K0GA 1EV9A 2MYGA 2DIYA 2K18A 3TUEA 1HNCA 1GNWA 1VRSD 1Y25A 3EURA 2MMAA 4MLYA 4PQIA 1SD9A 2H1AA 2F8FA 3J7Yb 2X8CA 1JLWA 4Z7XA 2PU9C 1S3DA 1XW6A 4FYCA 2X8GA 3KJYA 5CRGA 1O73A 4N11A 4ZL7A 1M2AA 1AQVA 2VCQA 5H5QA 2CZ3A 2RLIA 2PMTA 2PERA 5L71A 4K6XA 3F3QA 2BMXA 1A2MA 3PINA 4KW6A 4NXIA 3GSSA 2JSYA 2WB9A 4K9ZA 4I5QA 3VWXA 3QMXA 1N8JA 1BQ7A 3RPPA 3WGXA 4NV5A 2GDRA 1GTAA 1GUHA 1JZWA 5H5RA 1XOAA 1CQHA 1YKCA 4G19A 5ECOB 5D9TA 3GKNA 4NHWA 1LBKA 1YF0A 4AF2A 1GSEA 1J08A 3NZNA 3TKSC 2ES7A 2CA8A 4K7NA 2HZEB 4WETA 1Z7RA 2J23A 4EVMA 3DVXA 3WYWA 4EO3A 4HOJA 3LJRA 5DAKB 1SK1A 4MZBA 4GSNA 4Q5QA 2IFQA 1EOHA 5AGYA 2GSRA 5KEJA 3GSTA 1TRSA 3M8NA 3IPZA 4ML6A 3M1GA 5DDLA 2DBCA 3ERGA 2H8LA 4MF6A 3MNGA 4K1FA 1MEKA 2YOIA 1B4PA 3VWVA 2LQOA 5HR0A 20GSA 1VF2A 2DLXA 4FIWA 2YPMA 2VD1A 5DVBA 3GFKA 2DJJA 1Q98A 2KP2A 4E8EA 4TW5A 4OCFA 4MCUA 5GAND 1B48A 5A5KA 3BJ5A 2HI7A 3IV4A 2R37A 2YCDA 1B9YC 2VUPA 5ECQB 2HE3A 1USBA 2I81A 3JCML 3ZZXA 1FO5A 3UBKA 4YAVA 3SBCA 1ABAA 1F37A 4FH8A 5JWQB 3RDWA 5IO2A 1Q4JA 3QFBC 1OAZA 2AB6A 1Z6MA 5IMDA 2YWMA 2F8AA 2H19A 2LNSA 2B5EA 3HZ8A 4XCSA 4F82A 4PXOA 1GUKA 3HVVA 4HZ2A 3UVTA 3UL3A 1O8WA 2VM2A 3GX0A 2MZCA 3FZ9A 3F8UA 2GT6A 4BA7A 4IW9A 5ELAA 1KEBA 3MSZA 2H71A 3ZLPA 1F9MA 4I2TA 2F51A 2VL9A 4ACSA 1B4QA 1V57A 1NM3A 2R4VA 5JCGA 4I6XA 2YWOA 5HR1A 3APQA 4NHZA 2H6YA 1JHBA 1GRXA 1FB0A 4RQXA 5GZZB 1XBSA 1SU9A 4XIHA 5B7CA 17GSA 3GURA 2GZYA 2N5AA 4BVXA 4YQVA 5GSTA 1ERVA 2RM5A 4KDXA 1E6BA 3NOFA 2WULA 4XTSA 2REMA 3EMPA 5ABRA 1W4VA 3GV1A 2P0GA 1XVQA 3FR6A 5ECRB 1NHYA 5G5EA 4WF5A 3MWHA 4PQHA 3IK7A 4FO5A 2YJHA 2LUSA 2H6XA 1GTBA 4GQCA 3TJFA 4WXTA 1HD2A 4OFTA 2H1BA 2RUEA 4N30A 3LFLA 1T00A 4O32A 1XWBA 4ZB9A 4CHSA 2R5GA 1MD4A 3QAWA 2MMNA 2XPEA 1GSSA 1GTIA 2C80A 4MDCA 2E7PA 3RHBA 4GF0A 3LXZA 5DALA 3TRPA 3ZRDA 1YQ1A 2OE1A 2LEGA 1PKWA 3L4NA 4KNDA 3BCKA 4LLRA 3GTUA 3TJJA 1DSBA 5IM9A 2VL2A 5J4UA 16GSA 2XPDA 3UMAA 3DMLA 5KN1A 3BD2A 3FY7A 1XPVA 3LYKA 1EP7A 1QFNA 3H4KA 1ZMAA 2IMFA 4EDYA 1VF1A 2L6DA 2HFDA 1HNBA 4GLTA 1XOBA 2V6KA 2XBQA 2VCXA 2MMZA 1X9SB 1V2AA 2FA8A 5CRHA 2X99A 1M0UA 2HT9A 3LSZA 3EMXA 2I9HA 2YJ7A 4KSOA 1TDIA 4IKHA 4BVYA 3L78A 4KAEA 4F0CA 1QQ2A 2GTUA 4OD7A 1ILOA 3ZYWA 2V41A 4L0WA 2J9HA 1SKWB 1TKDB 1SL2B 2XBIA 3IK9A 4ILFA 3R2QA 1ERTA 1AAZA 5ECSA 3TKPA 1BX9A 4XS4A 1K0OA 2H1GA 1BAYA 2LJKA 4PNGA 5IMAA 1GH2A 1JZDA 3D21A 3KH9A 1S3CA 1CQGA 4F0BA 4N10A 2IMIA 4K8MA 2GSQA 3FR9A 4HJ2A 2H1DA 3HJOA 2HLSA 3W6GA 2JZTA 1VGLA 1JFUA 4XS6A 2YZHA 5ENUA 5A4VA 4PURA 2JU5A 3VLNA 2B5XA 2YV9A 4F9ZA 3D6IA 3ED3A 1GUMA 5D93A 3P7XA 4MZWA 3IC4A 3ZFLA 4HS1A 2DMLA 3QPMA 2B1LA 1AIUA 5JWOB 5A4UA 3VWWA 2CAQA 3MAKA 2IMDA 3WGEA 4GXZA 4KA0A 1SJZA 3L9SA 1WIKA 1WE0A 2ZNMA 3DGQA 5ECKB 1MDKA 2FWGA 2XC2A 5HR3A 1OE7A 2VLTA 4GSTA 3RHCA 4PNFA 4NWYA 1M9AA 3IE3A 4JRRA 3VI7A 2V32A 4LMVA 4WEYA 2AYTA 1VF3A 1ERWA 5J3RA 1WJKA 1X9MB 2I1UA 7GSSA 4AJ7A 3LORA 4ML1A 3C8EA 4ZL9A 1IYIA 2GQKA 1GP1A 1N2AA 2L5OA 3KZQA 1V58A 3IXRA 2GS3A 1Z3EA 3DWVA 2H30A 2OE3A 1ERUA 4V2MA 4L5OA 1G6WA 2CT6A 6GSVA 1U3AA 5C04A 4POMA 2PN8A 4ID0A 3DYRA 3OR5A 2LRCA 2E2GA 5HQPA 3GMFA 4HZ4A 3TKRA 4TXOA 2GGTA 2LRTA 3US3A 4WR5A 3A3TA 4D73B 2GSTA 3G7IA 4YH2A 5IIZA 3CSJA 2DC5A 1X5EA 1AXDA 3F4SA 2VO4A 2C8UA 1EZKA 1TXXA 1XZOA 4MA9A 2O85A 3E9JB 4ZB6A 1K0MA 2IIYA 2OBIA 4FYBA 4DSSA 2C3QA 4BPYA 5CP1A 4ECCA 4MH3A 3GH6A 3ERWA 1H75A 3E0UA 3FZ5A 2HNLA 2OBKA 4ZBAA 4V1Ap 1ACVA 1SYXA 5HFGA 5B6NA 2XHFA 3A2XA 3TRXA 1QXHA 4AJ8A 2VM1A 4BWQA 1ML6A 1ZCPA 2R6KA 4IVFA 1T4ZA 2P5QA 4ECBA 3D4MA 4G10A 3EU3A 4OFMA 2LV3A 4ECIA 4GSSA 5DCHA 4Q5RA 3GKXA 2R3XA 1EEJA 4X0XA 3HVXA 3C7MA 1AW9A 4MJCA 2H72A 4PX1A 1PQNA 1R26A 1KTEA 4K7IA 2A2RA 5CRDA 3KEBA 2KOKA 1HYUA 3IRAA 2IWTA 3KMNA 2OADA 3QR6A 2GQLA 4POBA 2HZFA 5IOWA 1BYEA 1K0DA 19GSA 2KLXA 4Q5FA 2G0FA 5CRWA 2RUFA 5IMFA 1MDIA 1OC8A 2HYXA 1A8LA 4GCIA 1XXUA 3IR4A 4MF5A 5J9CA 1VF4A 5G30A 5F0GA 2PVQA 1X5DA 2M72A 4LA1A 1RK4A 1EWXA 4POKA 5F07A 3KP9A 4MPFA 3SWLA 1AQXA 3IA1A 2VLVA 4XS1A 13GSA 3IHQA 3KP8A 4MJAA 1X0RA 5CO3A 1WP0A 1HQOA 1T8EB 3QFAC 5ECPB 3APSA 4KCAA 1UC7A 3I69A 4YQUA 1OC9A 1R7HA 4YQMA 3WT1A 1TRUA 3ZITA 2NVLA 1Z5YE 1SL1B 2O7KA 1YY7A 2YZUA 2L59A 1K3OA 2BJXA 4WKWA 4BL7A 1ZYEA 2WGRA 4HU7A 2B1KA 1SD8A 1DBYA 3H1NA 5GAPD 2G2QA 2GQMA 3D0ZA 5G1LA 3FW2A 5EL8A 2I3YA 2H01A 2DJ3A 5ECIB 4TR1B 2K8SA 2QKEA 5LNKe 1XIYA 1NW2A 1X5CA 3ZTLA 3O6TA 4IP6A 3F3RA 3MDKA 2MBSA 1SKRB 2RIIA 1YZXA 2QSIA 2P31A 2X8HA 3GH9A 2H0GA 2N5FA 3AY8A 1GSDA 3FHKA 3IBHA 3FK8A 4DSRA 1EP8A 2WJUA 3C73A 3IAS2 5F05A 3EVIA 3WT2A 2GVPA 5B8AA 2KP1A 2L5LA 4I8BA 2QC7A 4RI6A 1XW9A 3FEUA 3F4TA 2AV4A 3UAPA 1FOVA 3VWUA 1UA5A 2DJKA 2JADA 2NBSA 4ZBDA 3DEXA 4WBRD 5INYA 3DXBA 3RPNA 4H86A 2O8VB 3I6AA 4J2FA 1X9WB 3GN3A 4ZILA 2EIOA 3A2VA 2K6VA 2FGXA 2IMEA 2OJLA 14GSA 1XCCA 2N5BA 2VCVA 2KUCA 2JZRA 2ZCTA 3APOA 2IL3A 5COHA 2ZUPA 1XW5A 4NV2A 2FHEA 5C00A 3Q74A 3TKSA 2VAFA 4TN8A 1O8XA 3QOUA 5IMVA 2LSTA 1MTCA 2H66A 5E59A 4GWRA 3O76A 2QGVA 1SJIA 1TRVA 3I43A 4TKYA 4HQZA 5ID2B 4PGTA 5J5NA 2KHPA 1EGRA 1FB6A 3J7Yk 2DIZA 2VL3A 2YANA 4TVEA 3EINA 2H70A 3S9FA 4BWSA 3ZVJA 1T7PB 4HUAA 2CVDA 1FHEA 1TW9A 3GX8A 2C0FA 1XWAA 2BTOT 1R4WA 1EGOA 2P5RA 4J57E 2ALBA 3GKKA 3C1RA 1PL1A 3D4TA 3ZIVA 4I2UA 2CZ2A 3TOUA 1T1VA 2FWEA 5KN2A 2OA7A 2CAIA 4ZBBA 4RQRA 1QGVA 1TU7A 2CVKA 2LRNA 3TKSE 4GTUA 3HYPA 1A0FA 2DJ1A 3HVSA 5H5SA 2C3TA 2C1YA 1B8XA 2VIMA 2HZEA 2AAWA 4QL7A 3ZL5A 3TRQA 2IFQB 4MPGA 5GSSA 4EXJA 3ZMKA 3HXSA 4EUYA 3A5WA 2IMKA 5DAKA 3HZ4A 5EPFA 3D5JA 1O6JA 4IS0A 4N0VA 2FUG2 1SL0B 1K3YA 1KBNA 3TB2A 2RM6A 1TK0B 4MF7A 1A0RP 3EE2A 11GSA 3V1WA 1OC3A 2C0GA 4NAXA 4EE0A 2NTOA 4POLA 1XWKA 3LYPA 1OKDA 3IAM2 2VCTA 6GSSA 2HRFA 1PSQA 2JZSA 4IQAA 4V2NA 4E8HA 4V2LA 3QAVA 1TTZA 2DJ0A 1KNGA 2B7JA 22GSA 3ZREA 2YP6A 1K0AA 3GA4A 1JZRA 3QDNA 2A4VA 2B5YA 5E4WA 5HFKA 4ZL8A 4JBBA 3CSIA 1TP9A 5DQYA 3FRCA 5AN1A 3UOMA 1OVNA 1O81A 4IBPA 3GYKA 4QL9A 2WFCA 1O85A 5CNWA 18GSA 2CVBA 1GSYA 4OMVA 1XWGA 3H79A 1QUWA 5DBQA 1OKTA 4JZQA 4LMWA 4LL4B 1PRXA 5B8BA 2O89A 4FYUA 3CBUA 1BJXA 5DCGA 4L5LA 1JLVA 1TI1A 1PN9A 4J56E 4K0NA 3ME7A 2L4QA 2F3MA 4KDYA 4KSMA 2WCIA 4CW9A 1XWCA 1G0TA 4IN0A 1J9BA 2WZ9A 3CMIA 1DE1A 5J41A 1GSQA 5FHIA 2LJAA 2FWHA 4ZB8A 3FKFA 5JCWA 5D9XA 2DMMA 3F9UA 2B7KA 2E0QA 3DD3A 1G7OA 3CSHA 3NIVA 3HJPA 4P3YB 1PX6A 1Z6NA 3ZIJA 3QD9A 2I4AA 2L57A 2PGTA 1GLQA 1T4YA 1FAAA 4JU5A 3VURA 4X43A 1K0CA 4EDZA 1YKAA 2LKUA 3HJMA 4OCEA 4EL1A 1F2EA 2CV4A 2NPBA 3GNJA 2F9SA 3FR3A 4OO5A 1R5PA 1TK5B 1TOFA 4GQFA 1AQWA 4MABA 5G1KA 3RBTA 5ID2A 3P8WA 5DALB 4CDOA 3CYNA 5D8IA 4K2DA 2TRCP 1SYRA 1PGTA 4G2EA 3KXOA 4F03A 3GTUB 1OYJA 2H76A 1QK8A 1SKSB 1SJ6A 2K8VA 4KX4A 4OFNA 5J9BA 2O87A 3GL5A 4ECJA 3DRNA 3RAZA 1FVKA 3G7JA 1ZGNA 3FYGA 4TR3A 2IPAA 2YN1A 4ZXGA 2B3SA 3UIWA 3TJBA 4JE1A 3PR8A 1SK0A 3BCIA 9GSSA 1JZOA 1B9XC 4YAPA 1F3BA 3GUSA 1THOA 3QAGA 2JSZA 3GHAA 1IYHA 4L8EA 1U87A 2PBJA 1A2JA 1YEXA 2PPTA 1UVZA 1S3AA 2AHEA 4KDUA 1A8YA 2EIQA 5CYYA 3HCZA 2VCWA 3WD6A 1I9DA 1URMA 1M2BA 1DE2A 3F6FA 2C0DA 3GL3A 3GKMA 4JR4A 4NPBA 5AISA 3TKQA 3C1SA 1EOGA 2LTKA 4JR6A 3W8SA 4XRDA 2EC4A 4ZIJA 1PKZA 4XS4B 3EC3A 2VL2C 3I9V2 2Z9SA 1M2DA 1MD3A 3M3MA 4HEA2 4TR0A 2VLUA 1ZYQB 1V9WA 3Q6OA 4I97A 2L6CA 4L0UA 5ECMB 3H93A 1Z7PA 1UN2A 3BBYA 1Y6EA 1HNAA 5EY6A 2ON5A 4PUAA 3UEMA 3P90A 1RQMA 3N5OA 5DQSA 4KH7A 5G2ZA 1TK8B 4DEJA 1TU8A 4O92A 1ST9A 1PA3A 3KTBA 4IP1A 1I5GA 1GSFA 2PVOC 1WMJA 5IPGA 4IELA 1G6YA 2YWNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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