2M80A

Solution structure of yeast dithiol glutaredoxin grx8
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
MSAFVTKAEEMIKSHPYFQLSASWCPDCVYANSIWNKLNVQDKVFVFDIGSLPRNEQEKWRIAFQKVVGSRNLPTIVVNGKFWGTESQLHRFEAKGTLEEELTKIGLLP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-guided activity enhancement and catalytic mechanism of yeast grx8
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-8
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 24
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2m80A00
2DJJA 3BD2A 4BPYA 4DSQA 5IMZA 1BJXA 1YF0A 1YJ6A 2FWFA 4O32A 1WJKA 1A24A 4WR4A 2V1MA 3HJPA 4V2NA 4TXOB 2X64A 5ELGA 4AF2A 3F8UA 2LKUA 3M0FA 1V58A 12GSA 4ML1A 5ECHB 2IWTA 1M99A 3CTFA 5H5SA 2V2GA 3M9JA 2FA8A 1X5CA 5B6NA 3QFAC 1OE7A 5ELAA 2A2RA 3QAGA 1A2LA 5IMCA 3CXGA 4X1UA 3D6IA 4PX1A 3C1RA 1TKDB 2FLSA 4K0GA 3LG6A 5J9CA 1LU4A 2YPMA 1OVNA 2LEGA 3KMNA 1H4OA 3ZIVA 4ISDA 5AIVA 3FZ5A 2LRNA 5JWQB 4YQMA 2N5FA 2WZ9A 3Q74A 4ZL7A 3MSZA 2EIRA 3GSTA 3HJOA 4EL1A 5ID2B 1EP7A 5COHA 5HQPA 2L59A 4WBJA 3WGDA 1LBKA 2TRXA 4IGJA 2VLTA 5ECIB 1VGLA 4WETA 1I9DA 1WP0A 1HNCA 3QOUA 4BWSA 3ZMKA 4K7OA 2X8GA 1SK1A 1FW1A 4K7NA 1ZMAA 1OC9B 1O7UA 4YAPA 5AGYA 2H19A 4GQFA 2YZUA 3APSA 4I5QA 3P2AA 2PWJA 3LSZA 2CAQA 2CZ2A 4IJIA 5ENUA 3G7YA 2PU9C 3GUSA 2FNOA 2E2MA 4YQVA 1XBSA 3GV1A 3GN3A 2H66A 2O87A 3KXOA 1WIKA 2HRFA 2GSSA 4V2MA 2REMA 3G7JA 3WT1A 5C04A 4H86A 5G1LA 3RPPA 3GYKA 2MMAA 5D8IA 1SD9A 3VI7A 1R4WA 2B5YA 4LL1B 4FIWA 1GP1A 4MZWA 4J2FA 5HFKA 1M2AA 4MDCA 1MDIA 5FHIA 2G0FA 4HS1A 4F82A 1ZYQB 3FYGA 1XW5A 4KNDA 2K8VA 4NHWA 3GKMA 2YZHA 1T8EB 1LJRA 1JHBA 5ECMB 2GQLA 4NXIA 1PKZA 3VPQA 2QSIA 2IMIA 1YZXA 3W6GA 4MH3A 3ZTLA 3GURA 5GAPD 3VWWA 3PGTA 1EZKA 4ECIA 2YV7A 3S9FA 4HU9A 1JZDA 2CVKA 4FH8A 3GHAA 1QQ2A 1R7HA 3N5OA 3A3TA 4GLTA 5DAKA 2GZYA 1CQHA 3EURA 3FY7A 5FWGA 2YJHA 1EOHA 4LMWA 2A2SA 5CRWA 2FWEA 3C71A 1Y25A 2GSQA 2NPBA 3P7XA 3HZ8A 1JLVA 5D9WA 3UBLA 1WMJA 1URMA 3GNJA 4GXZA 1BEDA 4GTUA 5D9VA 2LUSA 1SL0B 3WYWA 2IL3A 3ERWA 4IELA 4QQ7A 2J9HA 4I8BA 1FHEA 3FW2A 1NW2A 4TN8A 3GKNA 4TKYA 2DJ2A 4GF0A 1PQNA 5G2ZA 4MF6A 2MBTA 1AW9A 3LEFA 5IQYA 2GQMA 3KZQA 5H5QA 3D0ZA 1TJDA 4BVYA 4TR1B 2FD3A 1O8XA 4PNGA 5HFGA 1IYIA 4KUNA 3TRPA 3UAPA 3EINA 4TW5A 1DE2A 1O85A 2V6KA 2R5GA 2YJ7A 4MF5A 2K9FA 4PUFC 1DUGA 3QR6A 4NMUA 3FR6A 1M0UA 1ON4A 1UN2A 1MEKA 2VAFA 3F4TA 1PX7A 3KMOA 1XVQA 4EF0A 18GSA 1Z7RA 11GSA 2I1UA 5DCGA 2I9HA 3TCOA 1C72A 3MWHA 1YKAA 5KN3A 5AIXA 2IJYA 4DSSA 4V1Ap 1SL2B 3GTUB 5J9BA 4MMMA 2R3XA 5B7CA 2M46A 4WEYA 2L5LA 2LRCA 3F9UA 5JCGA 3CSIA 4K6XA 3ZREA 2H01A 1XWBA 3C73A 3O3TA 3FZ9A 2J23A 2MYGA 1XW9A 4JR4A 1ZZYA 5IMAA 2P0GA 4RI7A 2DJ0A 2IMDA 2OACA 3LGCA 2B3SA 4AJ8A 2H0HA 3ZYWA 4NV5A 4MP4A 2O8VB 5DBQA 1GL8A 4IP6A 7GSSA 4Q5QA 4L5OA 5FT3A 4G10A 2PUKC 2VCQA 3EMXA 1YEXA 1K0BA 4K9ZA 3UL3A 4FYBA 4EDZA 4PGTA 1FAAA 4X0XA 3ERGA 1PL1A 1B4QA 3ZL5A 4EUYA 3IR4A 5IM9A 1M2DA 2FCHA 5CAXA 5HR1A 2GT5A 4N0VA 1HD2A 3IK7A 1T7PB 2ZCTA 1XVWA 1J0FA 2LSTA 4GWRA 4G9HA 2C8UA 2CZ3A 3ME8A 1F3BA 3TRQA 5AN1A 2H71A 4HEA2 5ECPB 3IV4A 3E3EA 2EC4A 4JBBA 1K0AA 4AGSA 5F05A 3EU3A 1OKTA 1XWGA 1ERWA 4MJAA 2GTUA 1GSQA 3D4MA 2B1KA 1T3BA 1TRUA 2F51A 2DMMA 4HU7A 3I69A 2ES7A 3DGQA 1S3CA 3KCMA 3RBTA 1BYEA 3EMPA 1X0RA 2KLXA 2VL9A 1RQMA 3ERFA 3IK9A 1Z7PA 3QCPA 2H76A 2AUVA 4PXOA 17GSA 5IO2A 1U3AA 1B4PA 3IC4A 2H1GA 4ZBAA 2JSZA 3IBHA 1HNBA 1JZRA 2YCDA 4MF7A 2K6VA 2RUEA 1PA3A 2DJ3A 3TKPA 2HZEB 1QUWA 1THXA 4GSTA 5F8BA 2FHEA 1OKDA 4CDOA 1SKWB 2H30A 1TW9A 1TI3A 3ED3A 2VCVA 4OCEA 1V2AA 3W8JA 2JL4A 1NHYA 1K0CA 5ECRB 1NSWA 1W89A 1K3LA 2WCIA 4N10A 3RHCA 2H73A 3D4TA 3TKSA 2FGXA 1AUCA 1FB6A 2GGTA 4IBPA 2RIIA 2YNXA 4PQHA 4E8HA 1IYHA 2XHFA 2LQOA 2XPDA 4DEJA 2D2ZA 1UA5A 1PSQA 5L71A 4TVEA 2HT9A 3APQA 5DJMA 4ZL8A 5G31A 3UARA 1JZWA 2HNLA 1CQGA 1WPIA 1EV9A 3L9UA 4KSOA 4KAEA 2LV3A 1KTEA 3LQ7A 2H75A 4POLA 3TJKA 2FWHA 2X8HA 4D73A 3TKSC 1XIYA 4XRAA 2PBJA 4L0WA 2YV9A 4ULXA 2IFQB 4IN0A 2H1DA 2H70A 3FZ4A 2JADA 3VURA 13GSA 2CX3A 4NV2A 1EV4A 2VOCA 3ZFLA 1AQWA 4ZXGA 1Z6NA 4HZ4A 1B9YC 2RM5A 2DMLA 2PVQA 6GSTA 3A2VA 4JZQA 4IQAA 4POMA 3KM6A 3ZLPA 1VF2A 3TDGA 4WR5A 3H79A 3SBCA 1ZL9A 1A23A 2H0IA 1TK0B 3M9KA 4I2TA 2JZTA 4L8EA 4TOPA 4XS4A 1DE1A 2H1BA 2C3TA 3MNGA 3TKRA 1T4ZA 5G1KA 3NOFA 3Q18A 1EEMA 2IN3A 3IPZA 3ME7A 5AISA 5KN0A 3HD5A 2L4CA 1MD3A 1TP9A 2K8SA 4JR6A 3H1NA 4I2UA 1GSSA 1K0OA 1O6JA 3HJMA 2P5RA 5HR3A 2DIYA 3D22A 1MDJA 1KNGA 1ABAA 2FWGA 3TOUA 4XRDA 3GL5A 3M1GA 1FVJA 4WKWA 2YWNA 1AQVA 1RK4A 2M80A 3F6DA 3C1SA 1GRXA 1Y6EA 3BCIA 2CX4A 2IPAA 1SYRA 1EEJA 1PMTA 4KDUA 2YWIA 6GSXA 2GS3A 14GSA 5JWRB 2K18A 2ZUPA 3TJGA 1F6MC 4BL7A 1R5PA 3ZVJD 2LJKA 5IMFA 2OE1A 1OC8A 3KGKA 5C00A 4KGIA 3WGXA 1MDKA 1MD4A 2CAIA 4KB3A 2C0EA 5LNKe 1XXUA 5CRGA 5KN2A 4KSMA 3KH7A 5LD0A 4CHSA 1G6YA 3US3A 4O7HA 1MTCA 4DVCA 1GWCA 4XTSA 1GUKA 4MJBA 4MZBA 4ZB6A 3APOA 2VL2A 3UBKA 3F4RA 3EWLA 1AC1A 3A2WA 5DALB 4PURA 3DVXA 2YWMA 3GX0A 4ZIJA 3CYNA 1KEBA 3LWAA 2FUG2 5A4VA 4RQXA 5IO0A 1PD21 5EY6A 1T4YA 3IXRA 2B1LA 4GSNA 3N9JA 5JCWA 3F63A 3JCML 1YKCA 3WT2A 1K0MA 2OE3A 5GZZB 1OC3A 3Q6OA 1XW6A 3O6TA 2L6DA 1A0FA 2BMXA 2VL2C 5DQYA 3A5WA 3EVIA 1X9SB 2FA4A 4V2LA 4NHZA 3IOSA 4NPBA 2GQKA 1A8YA 2DBCA 4V1Ag 1GSYA 3CMIA 3DYRA 2IMFA 4Q5RA 1TK5B 1N8JA 4FYCA 2XPEA 5G5FA 2B7JA 1GNWA 1F2EA 1JLWA 2V6OA 4OFTA 3DXBA 3GX8A 2H6ZA 3L78A 2VCTA 1YF1A 3F6FA 4JEDA 1X9WB 1OE8A 1S3DA 4JRRA 3UIWA 1TOFA 4OO4A 1XPVA 4ECJA 2NTOA 2E2GA 1QGVA 5D93A 9GSSA 4OMVA 3ZZXA 4POKA 1EWXA 5H5RA 3LXZA 2N5AA 1QXHA 4LMVA 4HQSA 2JZSA 4ZL9A 2LNSA 2PPTA 3EU4A 5ECQB 4MLYA 1JFUA 2WDUA 3CRUA 3BOAA 3HA9A 5CRDA 2VM1A 5IMDA 1SK0A 2KP2A 1N2AA 1WRYA 1SYXA 3LXTA 2HLSA 2OBIA 2LNTA 1XZOA 4GCIA 1M9BA 1K0DA 2H0GA 4GQCA 4TXOA 1B8XA 4KA0A 3PR8A 3TB2A 3P90A 1ERUA 1Z3EA 2HRNA 2WRTA 3I9V2 4F9ZA 2OADA 2WULA 1GSDA 3CRTA 1A2MA 3WGEA 3IRAA 3ZVJA 2HSHA 3GMFA 3C7MA 2VIMA 1O8WA 2DLXA 4HZ2A 1YQ1A 4YH2A 4K0NA 3TJBA 2NBSA 4XCSA 3DIEA 3ZMLA 4HI7A 2JZRA 3UVTA 3TKQA 4K2DA 1K3OA 5IPHA 5D9XA 3SWLA 4O92A 1ZYEA 5F07A 1V40A 3UEMA 2VD1A 5IMVA 3U6VA 6GSYA 4EC0A 3E9JB 1YDKA 4WF4A 5ID2A 2CA8A 3KP8A 2RUFA 3HY2A 3VPTA 3L0HA 4BWQA 4OCFA 3ZRDA 1V98A 5D9TA 4J57E 4NWYA 2L57A 3VI5A 1SENA 3R2QA 3KD0A 3LYPA 1GTUA 3PH9A 2XC2A 4Q5NA 2QKEA 2MMZA 2AB6A 4OFNA 5HR2A 1THOA 2YWOA 2H6YA 1OC9A 2OJLA 4LLRA 4KDXA 1XWCA 4ZB8A 1O73A 2LJAA 3L9VA 2DC5A 3HCZA 4G19A 5CNWA 5D96A 5GAND 3GRXA 3UMAA 2ALBA 3VWXA 4KDYA 4F0BA 3CSHA 1PN9A 4RUVA 2EIOA 1FO5A 2CVDA 2R37A 3KP9A 4KW6A 2AV4A 3GSSA 4CW9A 2M72A 2R6KA 4HQZA 2HZFA 2DIZA 1PL2A 5J3RA 3A2XA 1K3YA 2GSTA 2VO4A 4K1FA 4ZBDA 3J7Yb 5DAKB 4NAXA 2GDRA 4ECBA 6GSSA 1GUHA 4K8MA 2AHEA 3GFKA 2HSYA 2LQQA 2GZZA 1G7EA 1Z6MA 1HNAA 2B5XA 1HQOA 1SJZA 3UJ1A 3BBYA 3LYKA 4ZBBA 1KBNA 1TI1A 2C3QA 2HE3A 2MZCA 5ECNB 2L4QA 4XS1A 5GSTA 1Z5YE 3DWVA 3RHBA 1YEPA 4HDEA 2HFDA 1U3IA 3LFLA 1XWKA 1GH2A 2VCZA 2RLIA 5CREA 2KHPA 3NIVA 1FB0A 4MABA 3HXSA 2YN1A 4MPFA 3RDWA 1TK8B 1U88A 3I43A 2I81A 1SL1B 3QAVA 1EGRA 4RQRA 4TRXA 1PRXA 3IHQA 2G2QA 2H8LA 5A4WA 4EXJA 3KH9A 3O76A 1XWAA 2PERA 1DSBA 1U87A 4GRFA 1AAZA 3TJJA 4MK3A 1G6WA 4WBRD 1QFNA 2WS2A 3HDCA 2TRCP 3LJRA 1GLQA 2L5OA 2ON5A 5B6MA 3VFIA 4TXVA 1NHOA 2CT6A 4OFMA 2VCWA 3DMLA 5KEJA 5EVOA 3ZITA 2B7KA 4DSSB 2QGVA 5F06A 3NZNA 2F3MA 4TR1A 1V57A 5ECOB 3ZFBA 3BJ5A 4ID0A 1ERTA 5KN1A 3QD9A 2RM6A 5IPGA 2I3YA 4I6XA 4ML6A 2IMEA 4L5LA 3ZIJA 1VF3A 3GH6A 3TRXA 4MPGA 3P8WA 4XHMA 2E0QA 3H93A 5CP1A 4QL9A 5JCUA 1T1VA 3RAZA 2CV4A 3C8EA 1ML6A 19GSA 3F3QA 1SJIA 5A5KA 1M2BA 5ECSA 2JACA 5IOXA 1A2JA 3GTUA 1Q4JA 4OD7A 5GSSA 3EC3A 3F3RA 3FRCA 22GSA 3UVHA 4IQ1A 8GSSA 4PNFA 4E8EA 2C0GA 5HR0A 5G5EA 2TIRA 1X9MB 3FEUA 2GLRA 2VLUA 1FG4A 4HOJA 2KP1A 2Z9SA 2AYTA 1TRVA 1F37A 1G0TA 2ON7A 4XIHA 1SKSB 1OAZA 1EGOA 3V1WA 3QPMA 1BX9A 4IHUA 3VLNA 4MH2A 2OA7A 5DDLA 3RPNA 3E0UA 2DJ1A 4F03A 1OYJA 6GSVA 1F3AA 2P5QA 2HXKA 3W8SA 3D5JA 3IDVA 4ACSA 2VM2A 2OKAA 3Q19A 2PMTA 2F9SA 1XCCA 3EYTA 4TR3A 1GTAA 1SU9A 3H8QA 2HYXA 4LL4B 4X43A 4KCEA 3GL3A 2KUCA 5IOWA 4F0CA 3DEXA 4MA9A 4BA7A 2NDOA 4POBA 4I97A 2PVOC 2YOIA 3GKKA 1GTIA 1S3AA 2O85A 4ZB9A 2C1YA 4EKZA 3PINA 5J4UA 3QMXA 5LCZA 2ZNMA 1GSUA 2LRTA 3AY8A 1TRSA 1HYUA 3HVXA 3TJFA 4AJ6A 3D21A 4PQIA 2BJXA 6GSUA 4HJMA 2AJQB 2XBIA 4J56E 2H74A 1K0NA 5CRHA 1J08A 2LTKA 1U6TA 4TR4A 1DBYA 1SKRB 4Q5FA 5D73A 2VL3A 2GSRA 1USBA 2EIQA 4TR0A 4KE3A 5HFIA 2DJKA 3HZ4A 4XS6A 1TU7A 2PN8A 4GSSA 5J5NA 4KCAA 1E6BA 2WB9A 2R4VA 3UOMA 1X5EA 3FR9A 1R5AA 3KEBA 2YP6A 4DSRA 3G9BA 3MDKA 1FOVA 1ZCPA 16GSA 1ACVA 2HZEA 1SD8A 2JU5A 3TUEA 4F2IA 2B6MA 3IAS2 4KX4A 3BCKA 1WWJA 3IA1A 1VF1A 4D73B 3MAKA 4IW9A 4N11A 1A8LA 5E59A 1YY7A 3G7IA 2WGRA 1RW1A 2C3NA 1GLPA 2AAWA 5ECLB 1JZOA 1R26A 3EE2A 2A4VA 3I6AA 2I4AA 3CTGA 2XBQA 5ECKB 2L6CA 2F8FA 1WOUA 1XFLA 3GH9A 2JSYA 5B8AA 2YANA 1ZGNA 1X5DA 3LORA 4MJEA 3J7Yk 1BG5A 2F8AA 1B9XC 4ZILA 1VF4A 3KTLA 4HUAA 5DVBA 1EOGA 1F9MA 1NM3A 4IVFA 2CQ9A 4IP1A 4IS0A 3CBUA 4PQ1A 5E4WA 2C80A 4XS4B 4G2EA 5CYYA 2R2JA 3ISOA 1GULA 4IJ3A 4WXTA 4IKHA 4ILFA 4O5RA 3KJYA 3M3MA 1BAYA 1VRSD 2IFQA 1EP8A 4K7IA 3M8NA 2E7PA 2VLVA 3CSJA 4EE0A 6GSWA 2LS5A 4JE1A 1B48A 3FK8A 5A4UA 1ILOA 3DVWA 20GSA 3F4SA 2C0FA 3HYPA 1Q98A 3KIJA 1GSFA 3DD3A 3HKRA 1XOBA 3H4KA 5CO3A 2C4JA 3QFBC 1TXXA 3DRNA 1O81A 2H1AA 3HVSA 10GSA 2H6XA 5INYA 1UVZA 4YAVA 4PUAA 4BVXA 4MCUA 5DCHA 1T00A 2C0DA 2X8CA 2MMNA 5EPFA 4QL7A 3IAM2 5IIZA 4EO3A 4EVMA 1QK8A 3L4NA 2V41A 1PKWA 2IMKA 3GIXA 3FHKA 1GUMA 4RI6A 3KTBA 1SK2A 1XOAA 2OBKA 1BQ7A 2FY6A 4N0ZA 2VCXA 2OE0A 3WD6A 3HHVA 5J41A 5F0GA 3VWUA 2QC7A 2CVBA 4LA1A 5JWOB 3FZAA 2WFCA 5ABRA 3FKFA 4FO5A 4YQUA 1W4VA 2GZPA 3U5RE 1M7TA 4FYUA 2V32A 2BTOT 2NVLA 4EDYA 3VWVA 5DQSA 1QMVA 1AXDA 2O89A 1A0RP 4P3YB 1GTBA 5DJLA 2VD0A 1GNEA 3FR3A 5B8BA 3DKSA 2DSAA 2GVPA 1ERVA 2P31A 2MBSA 5G30A 2B5EA 4OWYA 1PX6A 3QDNA 2VUPA 3GKXA 1PGTA 3IE3A 5DALA 2LJRA 1J9BA 4WF5A 1TU8A 1E2YA 3HVVA 3TOTA 3QAWA 1I5GA 3K8NA 4N30A 1M9AA 4JU5A 2O7KA 4MJCA 4AJ7A 1Z9HA 1TRWA 3TGZA 4MZCA 1WE0A 4HJ2A 3F0IA 2N5BA 1G7OA 1FVKA 3VK9A 2PGTA 4KH7A 2X99A 3GA4A 5EL8A 1GSEA 1SJ6A 1TDIA 1UC7A 3TKSE 1ZOFA 2HI7A 2WJUA 4Z7XA 1AQXA 2KOKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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