2MBSA

Nmr solution structure of oxidized kpdsba
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
190
structure length
190
Chain Sequence
SNAQITDGKQYITLDKPIAGEPQVLEFFSFYCPHCYQFEEVLHVSDNVRQKLPEGTKMTKYHVEFLGPLGKDLTQAWAVAIALGVEDKITAPMFEAVQKTQTVQSVADIRKVFVDAGVKGEDYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADLQLQGVPAMYVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVAQYADTVKQLVEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comparative Sequence, Structure and Redox Analyses of Klebsiella pneumoniae DsbA Show That Anti-Virulence Target DsbA Enzymes Fall into Distinct Classes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Klebsiella pneumoniae
total genus 48
structure length 190
sequence length 190
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2mbsA00
3ERGA 2KOKA 1LU4A 1GUKA 4FYUA 1F6MC 4KB3A 1BEDA 2AV4A 5KN2A 4ZL8A 3BD2A 3EMXA 4EDYA 4MF7A 3H8QA 3HVVA 5IMDA 1GL8A 3LEFA 1EZKA 3EE2A 1ZGNA 4NV5A 3GKXA 5AIVA 3EC3A 4EC0A 3UVTA 1A2JA 6GSTA 1GLQA 3LQ7A 1YKAA 1A0FA 5D73A 1PKZA 5FHIA 4YQMA 2GT5A 2RIIA 2YPMA 4XRDA 4BVXA 4MJEA 1V40A 3O76A 1YF1A 3GURA 3I43A 2C1YA 2DMMA 2ZUPA 5ECPB 1ZZYA 1O81A 2P5QA 5ECKB 4ECJA 4JE1A 3E9JB 3VPTA 2H30A 2I4AA 1HQOA 2WB9A 3BBYA 2YWOA 1XW9A 3UEMA 4GCIA 2I9HA 3ZMKA 3CSHA 4ML6A 2CQ9A 3EINA 3RPNA 4L5OA 4IS0A 3RAZA 7GSSA 4WXTA 1TU8A 3M1GA 2VIMA 4TR0A 3WGEA 5B7CA 2F9SA 3RHBA 2VL3A 2H1GA 2L4QA 4EVMA 4K0GA 3GA4A 1H75A 1AAZA 2R2JA 1A2LA 3TJGA 2LSTA 5H5RA 2VL9A 2HRFA 4FYCA 3ZFBA 1KNGA 1XCCA 5COHA 3V1WA 2H01A 1W89A 1H4OA 3TUEA 4ZBBA 3P90A 3FRCA 3Q6OA 3GFKA 2BMXA 3FR9A 4PXOA 2A4VA 2B1LA 4EDZA 5DBQA 1OE8A 1J08A 1DUGA 2L6DA 3QOUA 3GSTA 3QFAC 5ID2A 5G30A 1NHYA 4GSSA 2OKAA 3IE3A 4TXOA 1T4YA 1K0NA 5JCUA 3LSZA 3DRNA 4OO5A 2JSYA 1Z7RA 2R3XA 4BA7A 2I81A 3PINA 2GGTA 3L9UA 1X5EA 2R5GA 3TJKA 4PNGA 4TOPA 3O6TA 4V1Ap 1TRSA 4KX4A 2G2QA 4K1FA 3KD0A 1PN9A 1SYXA 1Y25A 4I8BA 2A2SA 1BJXA 4HQSA 3FYGA 3KEBA 1A8YA 3GH9A 1XW5A 2V32A 3P8WA 2CT6A 2DJ3A 5J9CA 2VAFA 3FR3A 2NDOA 5D9TA 1Z3EA 1SENA 4F9ZA 1GRXA 2WDUA 5CAXA 4OCFA 1XVQA 5EY6A 4PX1A 5DQYA 1V58A 2CZ2A 2B5YA 2HSHA 4MJAA 4FH8A 1EV4A 3TJJA 3FZ9A 4I6XA 1X9MB 3GTUB 3I69A 4RUVA 3FR6A 3GTUA 2YNXA 3W8SA 1OYJA 3IC4A 2AHEA 1OKTA 5DCGA 1EOHA 5HR0A 2HXKA 1YKCA 2FLSA 3CRTA 4HU9A 1QUWA 4XTSA 1Q98A 2VL2A 3TDGA 1F9MA 5G5FA 1QXHA 3G7JA 2L5OA 4N11A 1WRYA 2LJKA 5CYYA 5ECNB 5ECSA 2DMLA 2DIZA 2OA7A 1AW9A 4OCEA 1THOA 2DBCA 1EWXA 1ZCPA 1O6JA 1KBNA 3F9UA 4TXVA 2BTOT 3UJ1A 3CYNA 3S9FA 1K3LA 2E7PA 5ENUA 1FB6A 1TK5B 1PMTA 1XIYA 2YANA 4JZQA 3CSIA 1WJKA 1GTBA 4IBPA 1GSYA 4PQ1A 3MNGA 2LNTA 1GULA 2HZEB 2FWFA 3W8JA 3VWVA 3TKQA 5HR2A 2HZEA 3IDVA 2PPTA 5J4UA 1U3AA 1E2YA 4IP1A 1TKDB 3C71A 3LJRA 4MDCA 2K8SA 2FY6A 2CVDA 2V6KA 5IM9A 5A4VA 2B7JA 3KH7A 2J23A 2JL4A 4TVEA 2TRCP 3U6VA 4O7HA 4EXJA 1SJIA 4N0ZA 2YWMA 2CX4A 2YZUA 4MA9A 3TJFA 2H66A 1WP0A 3BCIA 3GH6A 4POLA 1B4PA 2B5EA 5CRGA 1GUHA 4G19A 3GKNA 3GL3A 2OACA 4N30A 2H75A 3TOUA 3VPQA 2LKUA 3KIJA 1SD9A 2IFQB 4MF6A 5D96A 2M46A 1GH2A 4F0CA 5G2ZA 2LQQA 2H0HA 3PR8A 2K6VA 3QMXA 2YWNA 4MLYA 2N5AA 2CVBA 1QK8A 3FHKA 2CZ3A 2LJRA 4OO4A 1T1VA 1TK0B 1GTIA 2C8UA 2WULA 4HEA2 3RBTA 3H93A 1A24A 5DDLA 4TR4A 3ZMLA 2IMEA 1ZYEA 5A4WA 5IOWA 3QAGA 1I5GA 4KE3A 1IYHA 3RHCA 5ABRA 4N0VA 5ECMB 4ACSA 3GX8A 1AXDA 1TRUA 2P31A 1F37A 3JCML 4F0BA 3QFBC 3A2XA 3L9SA 1GNEA 3F6FA 4HZ2A 3HJOA 3UOMA 1CQGA 4RQRA 3TKSA 3VWUA 2CV4A 2YN1A 4JU5A 2V41A 3GUSA 3TB2A 2JACA 2VOCA 5F07A 4TR3A 2VM1A 5E59A 2Z9SA 3P7XA 3U5RE 2FA8A 2LRCA 4N10A 4ZL9A 4KSMA 3H79A 5DQSA 4POKA 1M2DA 3G9BA 4LA1A 1PGTA 1N2AA 1V98A 4MPFA 3A3TA 4PQIA 4MF5A 3ME8A 1FOVA 3G7YA 4PURA 2V6OA 3ZLPA 4OMVA 5ECLB 4HZ4A 1GLPA 1M2AA 2H74A 3GN3A 3UL3A 3WT2A 1R5PA 4DEJA 1K0BA 1JZWA 4NHZA 2IMFA 2FWHA 1QFNA 4YQUA 3LXZA 3VFIA 1EOGA 13GSA 2H70A 5LD0A 4ZB6A 3VI7A 3HCZA 2WFCA 3D4MA 4WBJA 3HZ8A 1K0CA 4JR6A 1SD8A 3K8NA 4YQVA 4JRRA 1SK0A 2PWJA 5F05A 1OKDA 3I9V2 1YZXA 1ERVA 3WT1A 1A0RP 2B5XA 3R2QA 1BX9A 1TK8B 4K2DA 4MJCA 1S3CA 2QC7A 2O7KA 1UVZA 5DCHA 19GSA 4LL4B 2RM6A 5EPFA 3LGCA 3C1RA 1R7HA 3P2AA 1MD4A 1JHBA 4MH2A 3LORA 5INYA 4HJ2A 1XBSA 3QD9A 4I97A 2C0EA 3QDNA 5G1LA 3A5WA 2PBJA 2FNOA 2X64A 1M0UA 4AJ6A 2DJJA 2MYGA 1EGOA 4LMWA 1GSSA 3J7Yb 4E8EA 3HXSA 4XRAA 2MZCA 3IBHA 3FKFA 2N5BA 2CAIA 2JZTA 1YEPA 1Z5YE 1Z6MA 16GSA 4KAEA 1UA5A 4CW9A 5DAKB 3CSJA 1SYRA 1EEMA 3HA9A 4HOJA 4KCAA 4L8EA 2O85A 2E2MA 5DAKA 5IMAA 5HR3A 3G7IA 5KEJA 2MMNA 4G10A 5ECIB 1EGRA 4ECIA 3UIWA 3ZZXA 3W6GA 1ZMAA 3SWLA 2CA8A 5GSTA 4D73B 4TN8A 3ME7A 3WGDA 1HD2A 4YAVA 3VK9A 2I3YA 3D5JA 3F3RA 4K7IA 4I2UA 2L4CA 4IELA 4IJIA 3L4NA 1KEBA 4WF4A 3PGTA 1ABAA 4ZXGA 1F3AA 1X9SB 1PKWA 4WEYA 5IPHA 3APQA 1FG4A 2HT9A 5J3RA 5JCWA 5EL8A 1WOUA 2HRNA 2D2ZA 3HYPA 1K0DA 4PQHA 2MBSA 1LJRA 3FZ4A 4DSRA 5DALB 3FZAA 4ZIJA 1XXUA 5HFGA 2A2RA 4ZL7A 4I5QA 3IAM2 6GSUA 1MD3A 1XWAA 5IQYA 3TRQA 3KMNA 1G6WA 3HJMA 3DWVA 3LXTA 5EVOA 3MWHA 2AJQB 3ZITA 2JZRA 1A23A 1G7EA 3APOA 2VO4A 2ALBA 3UARA 4GXZA 4MK3A 2C3QA 1R4WA 4K7NA 2IL3A 4Q5NA 1OAZA 2FCHA 2VCWA 1ML6A 3M0FA 1O85A 1AQXA 1IYIA 1W4VA 1PX6A 3TKRA 4X43A 4BL7A 3GIXA 1QMVA 3EWLA 2GSTA 2YOIA 1X9WB 1HYUA 4IJ3A 3I6AA 2WGRA 3F4TA 1Z7PA 2M72A 2P0GA 4L5LA 2VLVA 2GSRA 1O8XA 3M9KA 5AGYA 2VCTA 1B8XA 1AC1A 5HFKA 3ZRDA 1FVKA 1SU9A 5IMFA 4DSQA 2PN8A 6GSWA 2C3TA 1K3OA 4BWQA 4F03A 17GSA 1PX7A 3CBUA 4FYBA 4K8MA 2WJUA 2OADA 4IHUA 4LLRA 3CTGA 4BVYA 2C4JA 1YEXA 4J2FA 2VLTA 1O8WA 2TIRA 1F3BA 2FA4A 4O5RA 2B7KA 2H8LA 1OC8A 2PERA 4WR5A 3EU4A 1JLVA 3IK7A 4EE0A 1DBYA 4L0WA 2X99A 4AGSA 2IWTA 1QGVA 3GSSA 4DSSB 3VWXA 1V2AA 4FO5A 2FHEA 3DVWA 4KDXA 4GSNA 1HNCA 1XW6A 4O32A 4DSSA 8GSSA 4YH2A 4QL7A 4EUYA 2B6MA 4ZB9A 1YJ6A 3QPMA 2PVQA 3TKSE 1FAAA 1SL2B 4F82A 1V57A 4PNFA 2NVLA 1XVWA 1ILOA 3IOSA 3DVXA 2ON5A 2XC2A 1TI1A 2PU9C 1HNBA 4QL9A 3IK9A 2H6YA 1XOAA 3M8NA 3CRUA 2V1MA 2K8VA 3EU3A 1XWGA 1A2MA 1GTUA 4YAPA 4K0NA 3TGZA 5GZZB 2E0QA 1YF0A 2R37A 1SKWB 4WBRD 2R6KA 3D21A 3H4KA 1TJDA 4V1Ag 3EYTA 1TI3A 4ILFA 3LFLA 4NPBA 1GSQA 4EL1A 1FW1A 2EC4A 4IVFA 3ZIJA 1MDJA 2HFDA 1AUCA 2OBIA 4GLTA 3WYWA 1K3YA 1T4ZA 3SBCA 5IMCA 2KUCA 3GL5A 2VUPA 1WPIA 2C0GA 4G2EA 2GZPA 1U88A 5GAPD 5IOXA 4ECCA 2M80A 2DJ0A 2IJYA 2IFQA 2RUFA 3IA1A 1TRVA 2CX3A 2H72A 4J57E 1THXA 3L78A 1TP9A 3MSZA 2QKEA 2X8CA 3ERWA 4KDYA 3ZVJA 2G0FA 4IN0A 1GUMA 1TRWA 1ERTA 4IQ1A 4MH3A 2LNSA 3O3TA 4BPYA 5A4UA 1Z9HA 1TDIA 2EIOA 2F8AA 2LEGA 1X0RA 3GKMA 4MZBA 2DC5A 5HR1A 2JADA 1YY7A 2EIQA 2F3MA 4EO3A 3ZREA 5B6MA 4Q5FA 1T3BA 3F6DA 3CMIA 2LJAA 2HLSA 4WR4A 4PUFC 3UVHA 2E2GA 1EV9A 4CHSA 1XPVA 4K6XA 1X5DA 2J9HA 2VD0A 3J7Yk 4IW9A 3IPZA 2KP2A 2JZSA 2GS3A 3GNJA 1AIUA 4GTUA 2YWIA 4NXIA 1RQMA 2KHPA 1B48A 1BAYA 1M9BA 1AQWA 3Q18A 6GSSA 3EMPA 4POBA 1EEJA 3ZL5A 1PRXA 3M3MA 5DJMA 4EKZA 3OR5A 14GSA 1B9XC 3KCMA 1Y6EA 5B6NA 1FO5A 4HJMA 5F0GA 2NTOA 5ECRB 5AISA 1GSEA 3DXBA 5CO3A 1USBA 3UBKA 2GVPA 4MJBA 5KN3A 1PD21 4OFTA 1MTCA 2F8FA 4GQCA 9GSSA 4MPGA 5AIXA 2IIYA 2YJ7A 2B3SA 5HQPA 4HU7A 3UAPA 1MEKA 1YQ1A 2AAWA 1CQHA 1M99A 2H19A 1Q4JA 3L0HA 1PL2A 4GSTA 2PVOC 4HI7A 4P3YB 1XWBA 1ERUA 4O92A 3TCOA 4GF0A 3LYPA 3DD3A 4KGIA 1V9WA 2HNLA 1VRSD 1OE7A 2YCDA 4NV2A 1BYEA 2PGTA 1ERWA 2YV9A 1S3AA 3MAKA 1GSUA 3DMLA 5L71A 1SKRB 1S3DA 3CTFA 3MDKA 3A2VA 2V2GA 1JLWA 3ZYWA 2AB6A 2K9FA 2X8HA 4V2LA 2H73A 2FWEA 3D0ZA 4KDUA 3GHAA 4KA0A 5CNWA 3VURA 3DIEA 5ECHB 2RUEA 5JWRB 5CRWA 2OBKA 3D22A 1M2BA 2MMAA 3FEUA 1SL0B 1YDKA 2ES7A 3Q74A 4EF0A 4ECBA 2LQOA 2EIRA 5JCGA 2GSQA 4E8HA 3L9VA 2CVKA 3KTBA 1J0FA 1SK1A 3AY8A 3N9JA 4Q5RA 4IQAA 4ZILA 2LV3A 4GRFA 6GSXA 4ISDA 1ACVA 4OFNA 2C80A 4ZB8A 1TOFA 1VF2A 22GSA 2DJKA 2ON7A 3EURA 2LRTA 5F06A 3IR4A 2DLXA 1GP1A 2H0IA 2IMKA 3HVSA 12GSA 5IMZA 3D4TA 5KN1A 2B1KA 2FUG2 1PL1A 1K0MA 1VF1A 2QGVA 3LWAA 3N5OA 4D73A 1OVNA 4MP4A 3ERFA 2WCIA 1G6YA 2H0GA 2WS2A 2DJ1A 2H1DA 4NMUA 2OE0A 3DEXA 2BJXA 2GDRA 4WKWA 4KUNA 1QQ2A 3BCKA 3QR6A 4Q5QA 2L59A 2DIYA 5CREA 5ELAA 1PA3A 2FD3A 5H5SA 4HDEA 3VI5A 2O89A 4WF5A 11GSA 5LNKe 4IKHA 5B8AA 2QSIA 1TU7A 1G7OA 2TRXA 1RW1A 6GSYA 5DALA 1X5CA 4Z7XA 4L0UA 1FVJA 1NHOA 4V2MA 2REMA 5GAND 5CRHA 3IAS2 1WWJA 4MCUA 6GSVA 3FK8A 3C8EA 5ID2B 1NSWA 4GQFA 1DSBA 1VF4A 1XFLA 4TXOB 2H1AA 2VD1A 3KTLA 2IMDA 2F51A 1JZRA 3HY2A 1ZYQB 1SKSB 3ZVJD 1JFUA 3HD5A 2HZFA 3KMOA 2C3NA 4XHMA 1EP7A 2XPEA 3UMAA 3C73A 4XIHA 4K7OA 1PQNA 3F63A 4OD7A 5J9BA 3Q19A 2VCVA 1K0OA 5HFIA 2JSZA 3RDWA 4KH7A 2XHFA 1FHEA 4TR1B 3NOFA 1B4QA 3FZ5A 2H71A 4TR1A 1GWCA 5J41A 2LTKA 3IV4A 3GMFA 5FT3A 1GNWA 4IGJA 3WD6A 5J5NA 1T8EB 2H6ZA 3FW2A 3A2WA 2GQKA 2PUKC 5H5QA 1TTZA 3D6IA 2R4VA 4KNDA 1SJ6A 3US3A 2GTUA 2NPBA 2VCXA 3PH9A 5ECOB 4K9ZA 5D8IA 3FY7A 2FWGA 5DJLA 1G0TA 3LG6A 1LBKA 3F3QA 4RI7A 1I9DA 3DGQA 3F4SA 4AF2A 3E0UA 5IO0A 1NM3A 2VLUA 2P5RA 1JZDA 2O8VB 4GWRA 3HVXA 2H76A 3GKKA 4H86A 3KH9A 4CDOA 1SK2A 2VL2C 5IPGA 4PUAA 3HHVA 4JEDA 4X1UA 1GTAA 1ZOFA 1WE0A 4POMA 10GSA 3F0IA 1DE2A 4DVCA 4HUAA 3E3EA 4WETA 1UC7A 3KP8A 4JBBA 5D9WA 3ZTLA 2MMZA 3HKRA 3TRPA 1B9YC 1M9AA 4OFMA 5D9XA 3TOTA 2KP1A 3NIVA 3RPPA 4TKYA 2H1BA 1R5AA 1O73A 2NBSA 3KP9A 1GSFA 3KJYA 20GSA 1ON4A 1T00A 3WGXA 5B8BA 1KTEA 2VCZA 1SL1B 2L57A 4NWYA 1OC3A 2OJLA 4PGTA 5CP1A 2L5LA 3BOAA 4QQ7A 3TKPA 4TRXA 2O87A 1FB0A 2IMIA 4KW6A 1F2EA 4JR4A 2XBIA 5JWQB 3NZNA 2C0FA 3ISOA 1VGLA 1RK4A 2VM2A 4KSOA 2C0DA 4LMVA 1XWCA 5ELGA 1TW9A 3QAWA 4XCSA 1UN2A 1U6TA 1N8JA 2YZHA 1T7PB 1U3IA 1BG5A 1PSQA 1JZOA 4MABA 2N5FA 3HJPA 4ML1A 2JU5A 3ZFLA 4HQZA 2GZYA 3ED3A 3UBLA 4ZBAA 4TW5A 2LS5A 3HDCA 2KLXA 2XBQA 3F8UA 3KGKA 1VF3A 4ZBDA 1EP8A 1XWKA 2RM5A 1M7TA 4AJ7A 2ZCTA 5G31A 1HNAA 4ULXA 5CRDA 5A5KA 2PMTA 2YP6A 4IP6A 3IXRA 4AJ8A 4HS1A 2FGXA 4NAXA 2LRNA 3CXGA 4ID0A 1ST9A 1WMJA 5D9VA 2DSAA 4MZWA 5C04A 5IMVA 2IN3A 2HE3A 2L6CA 3F4RA 4MZCA 2YJHA 5D93A 3QAVA 3M9JA 2AYTA 3C1SA 3KZQA 2OE3A 3KM6A 4XS4B 1DE1A 4RQXA 3IRAA 5DVBA 5KN0A 3APSA 2VCQA 1Z6NA 3ZIVA 4XS4A 1GSDA 3GX0A 1K0AA 4V2NA 5G1KA 3TKSC 4F2IA 3IHQA 4G9HA 3VLNA 3DKSA 2WZ9A 4BWSA 5JWOB 2K18A 2IPAA 2GQMA 3TJBA 1R26A 2GLRA 3VWWA 4XS1A 5IIZA 3GRXA 4NHWA 2YV7A 5C00A 2MBTA 3GYKA 2GZZA 1A8LA 4FIWA 1OC9B 2GT6A 2X8GA 5F8BA 2GSSA 5LCZA 18GSA 1XZOA 1SJZA 1OC9A 4MMMA 2RLIA 1WIKA 4I2TA 1O7UA 3GV1A 1J9BA 5IO2A 1E6BA 2WRTA 3EVIA 5ECQB 4LL1B 2GQLA 1ZL9A 3DYRA 2HSYA 2DJ2A 3TRXA 4X0XA 1U87A 3QCPA 1URMA 4KCEA 3C7MA 1TXXA 2I1UA 1C72A 5GSSA 1NW2A 2LUSA 5E4WA 4OWYA 3KXOA 4J56E 1MDKA 4XS6A 3BJ5A 2MMOA 1BQ7A 2HI7A 1XOBA 5AN1A 2CAQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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