2NDOA

Structure of ecdsba-sulfonamide1 complex
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
189
structure length
189
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Determination of ligand binding modes in weak protein-ligand complexes using sparse NMR data.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
molecule tags Oxidoreductases
source organism Escherichia coli k-12
total genus 69
structure length 189
sequence length 189
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-08-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ndoA00
3HZ4A 2IN3A 2B6MA 3C1SA 2IFQB 2PU9C 3E0UA 2TIRA 2YJHA 2YV9A 1XWGA 2DMMA 13GSA 1MD4A 1Z6NA 5D9XA 1MEKA 4ZL9A 3PGTA 4NV5A 3C1RA 3DGQA 3ERFA 1MD3A 2HSYA 2CV4A 1K0OA 3FK8A 4KB3A 1SK1A 6GSXA 4BL7A 11GSA 4YAPA 4EF0A 4PQHA 1TRWA 3Q18A 2PN8A 4N0ZA 2ON7A 2CZ2A 1IYHA 1O8WA 5IOXA 5DVBA 4WEYA 2HRNA 2JZTA 4IN0A 2P0GA 4H86A 2DMLA 5DAKA 5AN1A 4DSRA 5DQYA 2Z9SA 2TRXA 4IQ1A 1T7PB 2GT5A 2RM6A 1MDJA 1OE8A 1JZOA 1M2BA 3TJKA 4X43A 2HI7A 3E9JB 2H75A 5E4WA 3GNJA 1ZZYA 1TOFA 1JZRA 2QC7A 3U5RE 2XPEA 2IWTA 2C4JA 3ME8A 4XCSA 4KDYA 3GA4A 1A2LA 3ZMKA 2YOIA 3WT2A 2YANA 1G7EA 1SD8A 3WYWA 1X9WB 2PPTA 3RBTA 4I6XA 2F8FA 3I9V2 1ABAA 3IK9A 3G7YA 1AAZA 1SL1B 5KN0A 3D21A 1GSSA 2VCTA 4TXOB 3E3EA 1MTCA 3DMLA 2XC2A 3UIWA 4TXVA 1F9MA 2H6ZA 1XWAA 3DEXA 5DCHA 4KNDA 1T4YA 2FWGA 5IM9A 1XW5A 3C71A 1YF1A 4XS6A 2H8LA 1W4VA 3DD3A 4J56E 3VPQA 2C0FA 4I8BA 2C8UA 2TRCP 3HYPA 4PURA 2BJXA 3UJ1A 2EIOA 3D0ZA 3F63A 3HHVA 2V6OA 4F03A 2CVDA 3UL3A 4PQIA 1J0FA 2NBSA 3VURA 1JZDA 1WWJA 3QAVA 1TJDA 1FHEA 3FYGA 2H01A 1IYIA 3IDVA 1ERVA 1Y6EA 3GKKA 2FLSA 1SK0A 3C8EA 3SBCA 1TI3A 3IOSA 1Z7PA 3APQA 6GSUA 2YCDA 4OFNA 5IMZA 1GSYA 4ZB6A 4J2FA 4EDYA 3K8NA 3FHKA 3P8WA 4K0NA 3FZ4A 1K0NA 5ECRB 1OKTA 4FH8A 3EYTA 1XPVA 4GF0A 1ZOFA 4E8EA 1LBKA 1R4WA 5HFGA 2B1KA 2F51A 3BOAA 2M72A 1OC8A 2HSHA 14GSA 4TKYA 2AJQB 2OBKA 5IMCA 17GSA 5J9CA 4L8EA 1GUMA 1Z7RA 3L4NA 1A23A 4KCEA 1PA3A 3HVVA 1WMJA 3I43A 4DSQA 1AUCA 3IR4A 4DEJA 3H4KA 5C04A 2FGXA 1PRXA 1AIUA 2X8CA 5F8BA 4MDCA 3IXRA 3MWHA 4GSNA 4EKZA 1HD2A 1MDIA 2EIRA 4EE0A 5FWGA 1H75A 5J5NA 1A8LA 3ZL5A 5CRHA 4MP4A 2GSRA 4EUYA 5J41A 1TTZA 5J3RA 2V32A 3SWLA 3TUEA 4PX1A 1RW1A 3C73A 2ES7A 2VD0A 3IPZA 2B7KA 2OA7A 3HY2A 3TCOA 3QCPA 1AW9A 1EEMA 1AXDA 3NZNA 2H70A 4IGJA 1TRSA 2JZRA 5IQYA 2QGVA 4OO5A 1OE7A 1QFNA 3LGCA 4PNGA 2GSSA 2H1DA 1B4QA 4DSSB 1FAAA 3A2XA 4MA9A 4ZB8A 4MJEA 1ERWA 3RAZA 4ML6A 4RQXA 1YJ6A 2VUPA 5KN1A 4K9ZA 1VF4A 4Q5FA 2OADA 3LSZA 1J9BA 2ALBA 2C80A 2YWIA 3IK7A 3ZRDA 1ST9A 4ZBAA 4IS0A 4WR5A 1GNEA 4RI6A 3QFBC 2C0EA 5G31A 4G2EA 1SK2A 1C72A 4ZBBA 2WB9A 5DDLA 1YY7A 3PH9A 5IMAA 3GFKA 3TRPA 2WFCA 3H93A 5ECPB 2I81A 1N2AA 4MMMA 2WZ9A 3DXBA 3A2VA 2GSQA 2DJ3A 5HR1A 2J23A 1THOA 4MPGA 2AUVA 3D4TA 5LCZA 4WXTA 2N5AA 1WJKA 5F07A 1YQ1A 4I5QA 5F06A 5JWRB 2HE3A 2DBCA 1EZKA 4MJBA 3UEMA 3IRAA 3EU3A 1QXHA 2BMXA 2HLSA 2H72A 2DIYA 1OC9A 4BVYA 3LYPA 2L6DA 4RQRA 4ECCA 2HXKA 5INYA 3V1WA 4XS1A 3EC3A 5EL8A 4V1Ag 4KAEA 2A4VA 1ZGNA 3GH6A 4CHSA 5CRWA 3CMIA 1VF3A 6GSWA 5GAPD 1BX9A 5G2ZA 1BJXA 4BVXA 5KN3A 2O7KA 3GH9A 4PNFA 4TRXA 2PVQA 1EOHA 5AISA 4Q5RA 1HYUA 4AF2A 1K0CA 1GSFA 4WETA 4ULXA 4Q5NA 1SYXA 2LNSA 2G0FA 4KDUA 5CP1A 4YH2A 4V2LA 3LEFA 3CBUA 4Z7XA 16GSA 4HOJA 2REMA 3GN3A 4O5RA 2KOKA 4HUAA 4ZIJA 2OBIA 3M9JA 2B7JA 2V1MA 3FY7A 3O6TA 3RPNA 4LLRA 4HZ4A 5ECNB 1PL1A 1WPIA 2ON5A 3ERWA 3ED3A 2E2MA 2H76A 1EP7A 2K9FA 3G7IA 4YQVA 1OAZA 4F0CA 3FW2A 4JBBA 2N5BA 5HR0A 3F0IA 1A0RP 1OYJA 3O76A 5IO0A 4QL9A 4JR6A 5CAXA 1DBYA 1M7TA 4HZ2A 2IMDA 2MMNA 1G0TA 1GUHA 4KGIA 1T8EB 2FA4A 1TRVA 5GZZB 5DAKB 1SKRB 1AQXA 1YEXA 2IIYA 1PX7A 3KP9A 1EOGA 2OE1A 2WDUA 2LQQA 4NHZA 3F4RA 5IMDA 1WP0A 4NAXA 1HNAA 2YWNA 3GV1A 2XBIA 4I2TA 4XIHA 2B1LA 2ZUPA 4K7NA 5G30A 3VI7A 2LRCA 1F2EA 5G1KA 4WBJA 1U87A 4YAVA 3RHCA 1THXA 2VL3A 2AV4A 3HD5A 2CVKA 1S3CA 2GQKA 2O85A 3HVXA 1XOAA 2H71A 2DJ1A 1GSQA 2M80A 4NXIA 3QOUA 2YWMA 1LJRA 4XTSA 2GLRA 2LJKA 5EPFA 1N8JA 2CX4A 5ECIB 5ELAA 4D73A 2I3YA 1TI1A 1S3DA 2O8VB 2KP2A 4IJIA 3APSA 3KH7A 8GSSA 5CRDA 2DLXA 4I2UA 4ZXGA 1PX6A 1XWBA 5D93A 2LSTA 1O7UA 4ACSA 1PMTA 4N10A 2X8GA 2XPDA 1WRYA 2C3QA 1SJIA 4POMA 2YNXA 1UC7A 4WBRD 2CA8A 1PQNA 5B8AA 1GSDA 3H79A 5ECSA 4N11A 3KEBA 3M1GA 2YP6A 1ML6A 5ECMB 3N9JA 4EDZA 1B4PA 1Z6MA 3HVSA 3H1NA 5C00A 4EL1A 7GSSA 1YEPA 3HXSA 4JEDA 5HR3A 1XCCA 1UN2A 2CX3A 3JCML 2HYXA 5DBQA 2VM2A 3FZ5A 4KCAA 4ID0A 5CO3A 4POLA 2RM5A 5IMVA 2YJ7A 2CT6A 3GTUA 4K8MA 4L5OA 4XHMA 4EC0A 3DYRA 5D73A 1V2AA 3FEUA 4Q5QA 2DJ0A 3DWVA 1XWCA 4ECIA 2RIIA 1TU7A 4MLYA 3FR3A 1OC3A 1Z9HA 3DIEA 1W89A 3IAS2 1M0UA 1GTUA 1F37A 5ABRA 2VL2A 3DRNA 1M2DA 4X0XA 2IFQA 1XIYA 2IPAA 3FZAA 10GSA 4I97A 4K7IA 1SL2B 3OR5A 3ZTLA 4PUAA 2H1GA 1MDKA 4EVMA 2FHEA 2H1BA 2O87A 4OMVA 5AIVA 2X64A 4JE1A 3ME7A 5B8BA 5D8IA 1EP8A 4AGSA 2LV3A 2H30A 4OCFA 4HU9A 5CRGA 9GSSA 4GXZA 1QGVA 3TOUA 2JL4A 1K0BA 4JR4A 4ECJA 5CREA 2H0GA 1PSQA 2F3MA 2ZNMA 1V58A 4HJ2A 4WR4A 3LORA 1XOBA 3BCKA 5D96A 4EO3A 2RUEA 4QL7A 3QR6A 4MPFA 2CVBA 2L6CA 3LWAA 1XW6A 1H4OA 4IW9A 3CRUA 2KP1A 2KUCA 5ECOB 4OO4A 4KDXA 3U6VA 1ZCPA 3AY8A 2GGTA 1ZYEA 1U6TA 1NHYA 1KTEA 5EVOA 2VLTA 3GX8A 1VRSD 4LMVA 4OD7A 20GSA 2WJUA 1EGRA 4TN8A 2KHPA 1BG5A 1UA5A 2HZEA 4BWQA 1GTIA 3D5JA 4MK3A 1EV9A 1DE1A 3VK9A 4HEA2 4MF7A 4MZBA 3WGEA 1R7HA 2MZCA 4V1Ap 4ILFA 3VI5A 2AHEA 4MZWA 2MYGA 2VOCA 2PUKC 4TXOA 3ZVJD 3LXTA 4MJAA 2H66A 1GLPA 1OC9B 3APOA 2I1UA 5B6MA 2IMKA 1O85A 1M9BA 2VCQA 3HZ8A 1NW2A 3H8QA 1GH2A 3MSZA 1F3AA 1R5PA 1EGOA 2M46A 2D2ZA 4LL1B 2DSAA 2FUG2 2XHFA 3PR8A 1ZL9A 1JZWA 4MH2A 2C0GA 2H74A 1XZOA 1BEDA 3CYNA 2JADA 4G10A 4MF5A 3MAKA 3KP8A 2K8VA 3GSSA 4G19A 3EWLA 1U88A 1BYEA 4ML1A 3A5WA 3F3QA 3EVIA 1T4ZA 3GYKA 2MMZA 1VGLA 2FA8A 4OFMA 3L78A 1RQMA 1X5CA 2EIQA 4NMUA 4WKWA 2LJRA 3CTFA 3HJOA 3IV4A 2BTOT 2DC5A 2OE0A 3FZ9A 3RHBA 5CNWA 1NHOA 3ZZXA 2DJJA 4OFTA 3HA9A 3FRCA 3DVWA 1FB0A 4TVEA 1SJZA 1OVNA 1V57A 3M3MA 5HR2A 1SD9A 2CQ9A 5DQSA 1T3BA 5ID2A 3GSTA 2FWFA 5IIZA 2WS2A 2XBQA 4MH3A 4XS4A 1M99A 5ELGA 4L0WA 2V41A 1XBSA 2X99A 2JSYA 4AJ6A 3KTLA 3GL5A 2GTUA 3P90A 4XRDA 1EWXA 3QFAC 5DJMA 2IMEA 4K1FA 4NPBA 3W8SA 1FVKA 1CQHA 2PGTA 3BJ5A 5H5QA 3D6IA 3TKSA 4HU7A 4KUNA 1O81A 3KMNA 3UBLA 5DALA 5D9TA 3IA1A 3EU4A 4IQAA 5CYYA 4MCUA 1SYRA 1JLVA 4TOPA 2K18A 2LRTA 3HCZA 1V9WA 1VF2A 3KIJA 3ZIVA 4F9ZA 1A0FA 3TJBA 1SKWB 4TR1B 4YQMA 1A2JA 3PINA 5HFKA 1PKZA 4DSSA 3D22A 4BA7A 3DKSA 3TKQA 1F6MC 2H0HA 2PVOC 4L5LA 2DJKA 1SENA 4HQZA 2GQMA 2KLXA 3HJPA 1X5EA 1GTBA 2GZYA 4O7HA 3UARA 1TU8A 1YZXA 2R2JA 6GSSA 2C3TA 1K0AA 1B9XC 1G6WA 3BBYA 1K3OA 1TW9A 2MMOA 3VWWA 3TRXA 4P3YB 2WCIA 5DCGA 3DVXA 3M0FA 1AQVA 1YF0A 3I69A 4GSTA 1KEBA 3VWXA 4RI7A 2E2GA 1QMVA 5F0GA 1USBA 1NM3A 5G1LA 2AAWA 3KCMA 4DVCA 3TKPA 1XXUA 4FYCA 4F0BA 5GSTA 4TW5A 5B7CA 5J4UA 2V6KA 4XRAA 3G7JA 4LMWA 3GX0A 2LTKA 4ECBA 4V2NA 5F05A 2C3NA 3US3A 2OJLA 1TK0B 3KH9A 3RDWA 2VLVA 3G9BA 4WF4A 3L9UA 3LG6A 1SJ6A 2L57A 3KD0A 2I9HA 1SL0B 2R3XA 3QD9A 3LJRA 4X1UA 1I9DA 5IMFA 2H0IA 1TP9A 2FY6A 3CSJA 4WF5A 1E2YA 2RUFA 3VWUA 2H6XA 3WGDA 3S9FA 4G9HA 4IELA 5EY6A 2LS5A 2MMAA 5JCGA 2R5GA 3KMOA 1FW1A 5J9BA 4LA1A 3F6DA 1FG4A 2VAFA 2H19A 3ZVJA 5GAND 5A4WA 4LL4B 2L59A 2DJ2A 1TKDB 1DUGA 4FYBA 3TDGA 2H6YA 1LU4A 4MABA 2NVLA 2P5QA 4EXJA 2ZCTA 1J08A 5IPGA 3EE2A 1HQOA 6GSVA 4BWSA 2VLUA 4FIWA 2JACA 2J9HA 5COHA 1HNBA 1ON4A 1YKAA 2YZUA 1BQ7A 2GQLA 4ZILA 5HFIA 5FT3A 2IL3A 4PGTA 5E59A 1K3LA 4JU5A 1A8YA 5G5EA 2FNOA 2OKAA 3C7MA 2HT9A 1X5DA 1PGTA 2IJYA 4NWYA 5GSSA 4TR0A 4GTUA 1GULA 2YPMA 4MZCA 3FKFA 1UVZA 2FCHA 4IHUA 2RLIA 2FWEA 3HDCA 2N5FA 4N0VA 4O92A 3WGXA 3VFIA 1O8XA 2MBSA 3LYKA 3ZFLA 1PD21 2VIMA 3IE3A 5LD0A 1S3AA 2IMIA 3KTBA 1FVJA 2H73A 2K8SA 2JU5A 5IO2A 5JWOB 2GZZA 2PERA 2MBTA 2A2RA 2FD3A 3CTGA 2YV7A 2OE3A 3F4SA 4KH7A 2YN1A 2GZPA 4E8HA 3ZREA 3GKNA 3GUSA 5ENUA 1DSBA 3UBKA 3GKMA 4GRFA 2FWHA 3TKSE 1ILOA 1F3BA 1Q98A 18GSA 2I4AA 2HZEB 4ZBDA 1K0MA 1ERTA 5ECLB 3TRQA 1RK4A 1PL2A 3UAPA 3TGZA 3TOTA 4L0UA 2E7PA 5L71A 1E6BA 1SKSB 4F82A 2G2QA 4IP6A 2IMFA 4PXOA 4GLTA 3KJYA 3IHQA 1BAYA 3F9UA 1Z5YE 5JCUA 2VM1A 3TKSC 1KBNA 2R4VA 4GQFA 1JLWA 3ERGA 4AJ8A 3TJGA 1QK8A 2L4CA 5JCWA 3TJFA 3Q19A 2VO4A 2VD1A 2L5OA 1XFLA 3NOFA 1XVQA 2VCZA 2LEGA 3IAM2 3RPPA 2WULA 1FOVA 2F8AA 3M9KA 5ECHB 5IOWA 2JSZA 1Q4JA 2L5LA 1GWCA 4GCIA 4OCEA 1GTAA 5H5SA 5H5RA 1GP1A 3Q6OA 3UOMA 2B5XA 1GUKA 5D9WA 1M9AA 2A2SA 1TDIA 2NTOA 19GSA 3BD2A 1GRXA 5B6NA 1ERUA 3CXGA 1V98A 3TJJA 4IP1A 5ID2B 4FYUA 4XS4B 2PBJA 4TR3A 3CSIA 2VCVA 3ZYWA 3O3TA 2EC4A 4PUFC 2WRTA 1TRUA 1Y25A 3J7Yb 5DJLA 1QQ2A 4HDEA 2K6VA 4KX4A 5A5KA 4O32A 1GL8A 1R5AA 4TR4A 3ZFBA 3QDNA 3TB2A 3MNGA 6GSTA 3VPTA 3FR6A 5A4UA 1PN9A 1AQWA 4MJCA 5DALB 4KSMA 3QPMA 2CZ3A 2HRFA 3ZITA 3IC4A 2AB6A 3W6GA 2CAQA 2P31A 1WOUA 4CW9A 3GMFA 1R26A 4GSSA 2X8HA 2AYTA 1OKDA 3F6FA 2HZFA 1A2MA 3F3RA 2L4QA 5AIXA 3KXOA 2E0QA 2R37A 1NSWA 3WT1A 3BCIA 4KSOA 5HQPA 2PWJA 3ZLPA 3HJMA 1URMA 3A3TA 4HI7A 4K6XA 4K0GA 3UVTA 4BPYA 4IBPA 3GURA 2LRNA 3EURA 4V2MA 3P2AA 3GKXA 2H1AA 2NPBA 3UVHA 2O89A 22GSA 3LXZA 2LNTA 1WE0A 1T1VA 1XWKA 1YDKA 2GT6A 1HNCA 3L9SA 1FB6A 3TKRA 2QKEA 3WD6A 1EEJA 2GS3A 1XVWA 3EMPA 1GNWA 2JZSA 2VCWA 4KW6A 6GSYA 3GL3A 2P5RA 1K0DA 2V2GA 1G6YA 3QMXA 3ZMLA 1U3IA 3VLNA 3VWVA 1B48A 5KEJA 1ZMAA 1Z3EA 1CQGA 1JFUA 4F2IA 1G7OA 2YWOA 1O73A 1VF1A 2GDRA 2VL9A 2OACA 1V40A 1TK8B 1SU9A 2LJAA 3L9VA 2C1YA 4POBA 1GSEA 3CRTA 4ISDA 5D9VA 1YKCA 3LFLA 1I5GA 3GHAA 1X9SB 5FHIA 1T00A 1K3YA 5LNKe 3IBHA 1QUWA 4IJ3A 4ZL8A 2WGRA 3D4MA 1U3AA 4FO5A 3W8JA 1M2AA 1B9YC 3LQ7A 2GSTA 5KN2A 4D73B 5AGYA 2C0DA 2VL2C 4GQCA 4IKHA 4ZL7A 3EMXA 4YQUA 4N30A 2B3SA 4OWYA 2VCXA 2CAIA 4HS1A 1DE2A 2LUSA 2QSIA 3R2QA 3F4TA 4NV2A 1JHBA 3M8NA 1EV4A 1ZYQB 4HJMA 3Q74A 1ACVA 2R6KA 2F9SA 2LQOA 3HKRA 2GVPA 1TK5B 3UMAA 4K2DA 4PQ1A 3EINA 3KZQA 5IPHA 3L0HA 1B8XA 4J57E 5JWQB 4JZQA 1GLQA 3J7Yk 5G5FA 4ZB9A 4JRRA 1GSUA 4MF6A 3CSHA 3F8UA 4IVFA 4HQSA 5ECQB 1FO5A 1X0RA 1O6JA 5A4VA 2YZHA 3FR9A 4RUVA 3MDKA 3P7XA 4K7OA 4GWRA 3ZIJA 5ECKB 4AJ7A 1A24A 1TXXA 4NHWA 3QAGA 4CDOA 3GTUB 12GSA 3I6AA 3NIVA 2B5YA 2DIZA 3N5OA 3KGKA 1PKWA 1WIKA 1XW9A 2HNLA 4KE3A 1AC1A 3A2WA 4POKA 3ISOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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