2NPBA

Nmr solution structure of mouse selw
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
88
structure length
88
Chain Sequence
MALAVRVVYSGACGYKPKYLQLKEKLEHEFPGCLDICGEGTPQVTGFFEVTVAGKLVHSKKRGDGYVDTESKFRKLVTAIKAALAQCQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution structure of selenoprotein W and NMR analysis of its interaction with 14-3-3 proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords Selenoprotein W
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
total genus 24
structure length 88
sequence length 88
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10262 Rdx Rdx family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2npbA00
2GQKA 4EKZA 2ON5A 1K3LA 5B6NA 3FKFA 5IPGA 4GCIA 4POKA 1IYIA 4X43A 1X5DA 3WYWA 1R5AA 2FY6A 1VGLA 1DSBA 1XZOA 4IKHA 3D5JA 2H01A 5JCGA 2H73A 2HXKA 3CSJA 4MZBA 4KW6A 1TK0B 2ES7A 4EVMA 1M2BA 2GSQA 3WGXA 1V58A 2DJKA 1TP9A 5DAKB 1GL8A 5AIXA 4ZL7A 1HNBA 2ZNMA 3BCIA 2E2MA 1RK4A 4XS4A 2HYXA 3A5WA 2H1GA 4I8BA 4AF2A 2MMZA 6GSUA 1AW9A 1FOVA 4Z7XA 3BD2A 4FO5A 2HZEB 3D4TA 3IV4A 1A0FA 1WWJA 2YWNA 3DYRA 5G5FA 5D9VA 1B8XA 4ZL9A 3PGTA 1TTZA 3DIEA 3TUEA 3EINA 2B5EA 2R3XA 1X9WB 4GQFA 3Q19A 4OO4A 2DBCA 2H71A 3IDVA 1WPIA 1NHOA 1UVZA 1LU4A 2YNXA 4WETA 2LJAA 3H79A 1OE8A 3C7MA 2CAIA 4OFTA 1A2JA 1GRXA 2H6XA 3KH7A 1GTIA 5IO0A 4NHZA 5A4UA 1PKWA 3C1RA 5H5QA 3W8SA 3DXBA 1OC9A 2IMDA 4XIHA 1X9SB 1MD4A 4IP6A 4TKYA 2IL3A 3KGKA 3C73A 4MP4A 3VPTA 1O6JA 1U3AA 2CX3A 4DVCA 5IMFA 1DE1A 2OA7A 3TDGA 3APSA 3FY7A 4FH8A 3N5OA 2VCZA 4PQIA 2HRFA 3M1GA 4MK3A 2ON7A 1A23A 5ECHB 3Q6OA 3TRPA 3TJKA 3APOA 1CQGA 1ML6A 2OADA 1WIKA 6GSYA 3FR3A 2FA8A 3F4RA 4IN0A 1JHBA 4HZ4A 3DRNA 3DEXA 4K1FA 4FIWA 4WF5A 1XVWA 2YN1A 1MDJA 4HEA2 6GSXA 3ZYWA 5HR0A 3KIJA 2FWFA 3EYTA 4FYUA 2IMKA 2IMFA 2L5OA 2GTUA 1Z7RA 4ZBBA 3ZFBA 1K0BA 3UBLA 3IXRA 2PERA 4L0WA 3ME7A 4I5QA 1M2DA 1T1VA 3FZ9A 2B7KA 2XPEA 4J56E 2H0IA 4FYCA 5HR1A 4MJEA 4TXOA 4P3YB 13GSA 1ZYQB 4MPFA 4TW5A 3LORA 3DWVA 2WZ9A 1GUHA 2YZUA 4KH7A 4PX1A 5KN2A 3HVSA 5ECOB 3TKQA 2H1AA 2CQ9A 3FZ5A 2YWMA 4CDOA 3VI7A 2OJLA 1V98A 2YWIA 2PMTA 4ZXGA 4J57E 2QC7A 1BX9A 3K8NA 3KZQA 3HYPA 1G7EA 1TOFA 3DMLA 4ML1A 4IQAA 2IFQB 3HJOA 3DVWA 3CTGA 4L5LA 4I97A 4JR4A 1TK8B 2DLXA 5ECRB 5CNWA 2LJKA 2GSRA 3P90A 2FWHA 3TRXA 3F0IA 4HU7A 2DJ1A 4TVEA 3VWWA 10GSA 2O85A 1XPVA 3UOMA 1S3DA 2GQLA 1NM3A 4OFMA 5DJMA 3QD9A 4MH2A 1G7OA 3NIVA 3HZ8A 1BYEA 3D22A 3IK9A 3G7JA 4K0GA 1ZMAA 3GKMA 1SK0A 3EC3A 1Z3EA 2LKUA 1MEKA 3L9SA 1Z5YE 3GKKA 3GN3A 2DIYA 1I5GA 5KN0A 2KOKA 5IOWA 4MZWA 3VPQA 3ZLPA 3GH6A 4MJBA 3RBTA 3M0FA 1BG5A 5IM9A 1ZL9A 1YQ1A 20GSA 2ALBA 3PH9A 3D4MA 1M0UA 4ML6A 4YH2A 1TJDA 1EEMA 3CMIA 4ZB9A 3ZVJA 1LBKA 2KP2A 3EMPA 5ENUA 1THOA 4MDCA 4LLRA 3KMNA 2IN3A 1J0FA 3EWLA 4V1Ap 2H72A 1SKRB 5ECSA 2CVDA 1SL1B 4I2UA 4LL4B 4E8HA 6GSVA 2AHEA 4FYBA 3ZZXA 5EVOA 4GSSA 4DSRA 5LNKe 2DSAA 1KTEA 2H70A 4BVXA 1ACVA 4O92A 3UAPA 5COHA 2L59A 1OYJA 1HNAA 4YQMA 5HR2A 2F51A 1PX7A 3HVVA 12GSA 3F9UA 1X5CA 2K8SA 3L4NA 4EDZA 4I2TA 4NXIA 4AGSA 2VL9A 4HQSA 1VF4A 4EC0A 4Q5QA 2V41A 2OKAA 4JR6A 3I6AA 2PVQA 4ECIA 16GSA 4OCEA 1RW1A 2H1BA 1QFNA 5A4VA 3UJ1A 2GZZA 1X5EA 3F3RA 2JZRA 4WR4A 4QL9A 3RHBA 1C72A 1GP1A 1WE0A 1ZGNA 2PU9C 3N9JA 1HD2A 1O8WA 2H8LA 2WB9A 4YQVA 1IYHA 1TW9A 2V1MA 2R37A 3HHVA 1TRUA 4ID0A 3CSHA 3PINA 1EOHA 5HQPA 3CRUA 1GULA 5H5RA 1PSQA 3IA1A 4F03A 4OWYA 2ZUPA 4JEDA 1EP8A 1M9AA 3I9V2 4EF0A 1K0MA 1OC9B 2IMEA 4WBJA 5DALA 5JCWA 4G2EA 4EO3A 2N5AA 5FT3A 1Z6MA 1EZKA 3UL3A 1AQXA 2BTOT 5DQYA 2I3YA 1H4OA 3IBHA 3F6FA 2P31A 3L9UA 5C00A 3TCOA 4KDYA 3IAS2 3F6DA 2MMOA 1M9BA 5A5KA 1O7UA 4HS1A 1F3BA 2H0HA 4KNDA 2TRXA 5E59A 5EL8A 2DJ3A 2LUSA 1GUMA 2LRNA 4WEYA 4HJ2A 5HFKA 4GTUA 4XS1A 2X8GA 2H6YA 1Y6EA 3UBKA 1PN9A 3LXTA 1TI1A 4GSNA 1SKSB 1AQVA 4Q5RA 18GSA 1K0NA 2WJUA 4OMVA 1XWCA 4PQHA 3IHQA 2AV4A 4KDUA 2MMNA 2M46A 4L0UA 2H74A 2K6VA 3GH9A 3M9JA 3D21A 3DKSA 5E4WA 2DJ0A 2B3SA 1AQWA 1OE7A 3IPZA 1GLQA 2VLUA 5GZZB 2C1YA 3CBUA 4LMWA 4QQ7A 1FW1A 4RUVA 3VI5A 1AIUA 2V32A 3E3EA 4O32A 1TI3A 3KP9A 1FO5A 3Q74A 1U87A 1PD21 1TRSA 3MAKA 4IGJA 5CRWA 1EV4A 3FEUA 2IIYA 3GTUB 4IVFA 3EU4A 2VO4A 2C8UA 5ID2B 1XCCA 4X1UA 1HQOA 1XW6A 3KEBA 3GMFA 4XHMA 3HXSA 1KEBA 2VCTA 2ZCTA 1K0AA 2CVKA 3ZVJD 2JSYA 3GYKA 4YAPA 3HA9A 4DSSB 1JZRA 4HJMA 4RI6A 3FR6A 5HFGA 5GAPD 2TIRA 1MTCA 1VF2A 1HNCA 2CZ2A 3QAWA 2VCQA 3LYPA 4KSOA 2D2ZA 2XC2A 3RAZA 5B6MA 2JU5A 3IRAA 3QMXA 2NDOA 5JCUA 3GUSA 2FGXA 3KTBA 4NV2A 5HFIA 2A4VA 5A4WA 4ULXA 5D8IA 1MDKA 4G10A 3E0UA 4ISDA 3UIWA 2R2JA 2MBSA 2QKEA 3LFLA 2FLSA 2MMAA 1SL2B 2LNSA 5GSTA 3JCML 1PQNA 4AJ6A 1Z6NA 5FWGA 1GTBA 1R26A 5ECIB 3HZ4A 4KX4A 1GLPA 1HYUA 4TR1A 3VWVA 1UN2A 2F8AA 5DJLA 2C80A 1BAYA 5G2ZA 1M7TA 2LSTA 2GZYA 3M9KA 4L8EA 1B9XC 5HR3A 3ZIJA 4IS0A 3W6GA 1SJZA 4KB3A 2L6CA 4NAXA 4F0CA 4GLTA 3EE2A 1Q98A 1PKZA 4NV5A 4E8EA 4D73B 3ISOA 4HI7A 3LG6A 2I4AA 1CQHA 6GSSA 4POMA 2TRCP 1ST9A 3NOFA 4F9ZA 1XOAA 3TB2A 11GSA 2CAQA 1YKAA 4KE3A 4NPBA 3U5RE 1QGVA 19GSA 3L78A 3PR8A 4F2IA 4KGIA 5B8BA 4JZQA 1JLWA 1SYRA 4K0NA 4PUAA 1R4WA 4Q5NA 1V40A 4LMVA 2HZFA 4HDEA 2B5XA 4TR4A 1T8EB 5ECPB 3GA4A 4XRAA 2OACA 1PA3A 5J4UA 1JFUA 3ZITA 2VCVA 3ERFA 2PGTA 2EIQA 2HSHA 1AXDA 1GTAA 3L0HA 3F4SA 3G7YA 5J9CA 3LWAA 2RM5A 3KXOA 4LA1A 4LL1B 2GZPA 2CVBA 5GSSA 4CW9A 3SWLA 4EDYA 3ZIVA 2VD0A 4G9HA 1ERUA 1M2AA 3WD6A 3WGEA 5CREA 4ECJA 5J9BA 2H6ZA 1OKTA 5F05A 3ZL5A 4TR3A 5D9WA 1SKWB 4TRXA 3VFIA 1F2EA 5D9XA 4TR0A 4ZB6A 1SD8A 2L4QA 5DCGA 1T7PB 3FZAA 2H76A 3QR6A 4N10A 2C0EA 5CRGA 3HCZA 2P5QA 4KCEA 1XIYA 2YWOA 4MF5A 2HLSA 3TKSE 1EEJA 4MABA 5EPFA 1PGTA 1RQMA 4MF7A 4O5RA 3UEMA 3QFBC 5DAKA 4MZCA 6GSWA 1V2AA 4WR5A 1GWCA 1OC8A 1YF0A 4GQCA 1SJIA 2X99A 1NSWA 5G31A 4BPYA 2WFCA 4V1Ag 17GSA 2H75A 4OD7A 1G6WA 1TKDB 2VUPA 2CZ3A 5IMZA 2G0FA 2LTKA 2GVPA 2JACA 1UA5A 2BMXA 3C71A 4J2FA 5ELAA 2C0GA 4JU5A 2HI7A 5ECMB 2HZEA 4IP1A 4N0ZA 2DMMA 4X0XA 1FVJA 2E0QA 1DE2A 3VK9A 3MSZA 3Q18A 1YY7A 3ED3A 1U3IA 2E7PA 1YEXA 3KM6A 3F3QA 2LNTA 1K0CA 5JWOB 3GL3A 4OO5A 1GSFA 2KUCA 1GSSA 2O87A 5G1LA 3P8WA 7GSSA 2JZTA 2OBKA 4K7OA 2IMIA 2LRTA 5F06A 5IOXA 4IW9A 2EC4A 2K18A 1E2YA 5ELGA 1URMA 2YANA 1SK1A 3CRTA 2IJYA 2J9HA 4RQRA 3IOSA 4XS4B 3CYNA 1U6TA 5B8AA 2C3NA 5D9TA 1G0TA 1YEPA 5J41A 3LQ7A 3GKXA 4RI7A 2LS5A 3I43A 2NBSA 3HDCA 2FUG2 3IE3A 1XVQA 5DVBA 2G2QA 22GSA 2N5FA 1V57A 2FWEA 1DUGA 2M72A 3IAM2 5FHIA 3ZTLA 1ZOFA 2WGRA 4N11A 4OFNA 1TU7A 1EOGA 2JZSA 5DBQA 3F63A 1KBNA 3GKNA 1OKDA 1FAAA 2JADA 1QK8A 1UC7A 3TJGA 1BJXA 2JL4A 1TDIA 2X8CA 4K8MA 3QPMA 3WT1A 2P0GA 4MLYA 4WXTA 3J7Yk 1F3AA 1GSYA 2LJRA 1QMVA 1YDKA 2WRTA 3QCPA 2L57A 1GNWA 3FR9A 5EY6A 2XBIA 4XCSA 1PL2A 1GNEA 3F8UA 4YAVA 1A24A 3ZRDA 1EP7A 2IFQA 1XFLA 4ZIJA 3H1NA 5IIZA 3LXZA 5DCHA 2VD1A 3SBCA 2RUEA 2F9SA 3FRCA 3G9BA 1GSEA 1BEDA 4POBA 3W8JA 1F9MA 2L4CA 3A3TA 3UVHA 3NZNA 3TGZA 4KA0A 4MCUA 2I1UA 1BQ7A 2C4JA 2H66A 5B7CA 2YV9A 2O89A 3FZ4A 1W4VA 4O7HA 4POLA 5LCZA 2V2GA 3ERWA 3GX0A 2NVLA 1MDIA 2C3TA 3CTFA 9GSSA 3DVXA 1J08A 3AY8A 1ZYEA 3IC4A 4EXJA 4MF6A 4TXOB 5J5NA 2C3QA 3ERGA 4MJCA 4F0BA 4ACSA 1JZOA 5ECNB 1DBYA 3EVIA 3HY2A 1X9MB 2B1KA 1A2LA 5IMDA 3J7Yb 1N8JA 2B6MA 2J23A 3HD5A 3QAVA 1A2MA 1VRSD 1VF1A 4BVYA 3LJRA 4KSMA 4N30A 3GURA 3CSIA 3S9FA 3HVXA 4KCAA 4GF0A 2B7JA 1PMTA 2RUFA 4XRDA 1R7HA 3VURA 2X8HA 1MD3A 3QFAC 4ZBDA 1XWBA 3TRQA 4GWRA 4L5OA 3GV1A 1XWAA 1NHYA 1YZXA 4OCFA 1XWKA 2N5BA 2CV4A 1VF3A 3LSZA 5AIVA 1O85A 1XBSA 1WMJA 3M8NA 4IJIA 5D96A 2VL2A 2FNOA 1WJKA 2VLVA 1K3OA 2NPBA 5CP1A 3KTLA 3P7XA 4IQ1A 3RHCA 4PURA 5JWRB 2C0FA 5DQSA 1O8XA 2PVOC 2PWJA 3EURA 1AAZA 5G5EA 3D6IA 1XW9A 4F82A 2I9HA 2EIRA 4WBRD 2VM1A 4RQXA 5JWQB 3KCMA 1ABAA 5KN1A 4XTSA 4HU9A 2VCWA 1H75A 4PUFC 1EV9A 2GDRA 2QGVA 2VLTA 4JRRA 4ZL8A 5C04A 4K9ZA 1T4ZA 1TXXA 2XBQA 2HE3A 5CO3A 2YJ7A 2F8FA 1YF1A 1PL1A 4MMMA 5F07A 3KH9A 4BA7A 1E6BA 1EGRA 2O7KA 4WF4A 1F37A 2FA4A 3FK8A 3RPPA 5IMAA 2RLIA 2X64A 3E9JB 1XW5A 4MJAA 2HFDA 4V2MA 5D93A 3FYGA 4K7NA 2DJ2A 2P5RA 1Z9HA 3TJJA 14GSA 3A2VA 1A0RP 2XHFA 3EU3A 2PUKC 3HJMA 2R6KA 4HZ2A 2WCIA 1A8LA 2DC5A 5F0GA 3VLNA 4NHWA 1SL0B 3KMOA 1JZDA 5ECLB 2H0GA 1FB0A 1B48A 4PNFA 1JLVA 3OR5A 3I69A 3HJPA 1USBA 3BBYA 1LJRA 2VAFA 1XXUA 2AUVA 4HOJA 3ZMKA 1SK2A 2DJJA 2H19A 3MNGA 2WULA 2HRNA 4WKWA 2VOCA 2F3MA 5KN3A 3GRXA 4QL7A 5G30A 2E2GA 1SU9A 3LEFA 1OAZA 3MDKA 1Z7PA 1K3YA 3P2AA 5DALB 1F6MC 2GS3A 5CRHA 1W89A 4KDXA 1SYXA 4TOPA 6GSTA 1J9BA 3IR4A 1GH2A 2AB6A 1GSQA 3MWHA 4ZILA 3RDWA 1TU8A 1TRVA 4I6XA 4BWQA 4MA9A 2B5YA 1KNGA 4PGTA 2HNLA 1SD9A 5ECKB 2FCHA 3ZREA 3EMXA 1K0OA 1SJ6A 5J3RA 1GSDA 3TKSA 5GAND 1ZZYA 2FD3A 4K6XA 3LYKA 2YPMA 1T00A 1Y25A 2WS2A 3GTUA 2VL3A 5ID2A 3BOAA 3O3TA 1JZWA 2O8VB 1GTUA 3C1SA 3UMAA 4TXVA 2I81A 2YJHA 4CHSA 4BWSA 1R5PA 2HT9A 3GNJA 8GSSA 4YQUA 3H4KA 1ON4A 1T3BA 3IK7A 4DSSA 3DGQA 4ILFA 2YV7A 4HUAA 2VL2C 3KJYA 1TK5B 4Q5FA 4IJ3A 1XWGA 5AISA 2R4VA 3A2WA 2CA8A 4BL7A 1FHEA 2YZHA 1EGOA 1U88A 1GSUA 2B1LA 5F8BA 4K2DA 2M80A 5CRDA 3ZMLA 1EWXA 3L9VA 1V9WA 1PRXA 4G19A 2RIIA 5D73A 3UARA 3FHKA 4PNGA 2R5GA 1SENA 1TRWA 3TJFA 2QSIA 4NWYA 2REMA 2K9FA 4JE1A 2OBIA 2YCDA 4GXZA 2AJQB 1WRYA 4TN8A 3GSTA 4V2NA 4MH3A 4ZB8A 2CT6A 4H86A 2AYTA 3DD3A 2OE0A 2FWGA 1QXHA 3TOTA 1FG4A 2L6DA 3H8QA 1YJ6A 3ME8A 4NMUA 3WGDA 2VIMA 5ECQB 3US3A 4HQZA 2WDUA 3KP8A 5ABRA 1FVKA 4D73A 3GX8A 2DIZA 3A2XA 1AUCA 2GT6A 5L71A 2GSSA 2NTOA 2LRCA 2GLRA 1GUKA 1K0DA 3GHAA 3V1WA 2XPDA 3O6TA 5H5SA 3BCKA 2IWTA 4KUNA 1PX6A 2RM6A 4GSTA 3O76A 4ECBA 3ZFLA 3R2QA 2OE3A 1S3CA 3D0ZA 1ZCPA 1B4PA 1ERVA 2A2SA 2EIOA 4JBBA 2LQOA 3CXGA 4TR1B 5CAXA 2LQQA 3GFKA 3TKRA 4EL1A 1FB6A 1A8YA 2PN8A 2PBJA 5LD0A 2H1DA 3UVTA 2Z9SA 3GIXA 1OVNA 4MPGA 1G6YA 1QUWA 2BJXA 3RPNA 4EUYA 1X0RA 4N0VA 1S3AA 2GT5A 1M99A 2LEGA 2PPTA 5KEJA 5CYYA 2H30A 4DEJA 2GQMA 1WOUA 2HSYA 4XS6A 4KAEA 1XOBA 1N2AA 2FHEA 3QDNA 1O73A 1Q4JA 2VCXA 5IQYA 5AN1A 1ERWA 5IPHA 1ERTA 3G7IA 3QAGA 2V6KA 3TJBA 1NW2A 2KHPA 5AGYA 1ILOA 5IMVA 2L5LA 3H93A 4GRFA 2GGTA 3VWUA 1B9YC 1OC3A 4DSQA 2YOIA 4IHUA 1O81A 2DMLA 4IBPA 3F4TA 4PXOA 2OE1A 4IELA 1T4YA 4ZBAA 1WP0A 2MBTA 3GSSA 3TKPA 3U6VA 3WT2A 3TKSC 3APQA 2LV3A 2MZCA 2YP6A 4PQ1A 2CX4A 5G1KA 3TOUA 3KD0A 2KLXA 4ECCA 2V6OA 3GL5A 2C0DA 3C8EA 1THXA 3QOUA 1AC1A 3BJ5A 5DDLA 3LGCA 3VWXA 2MYGA 4AJ7A 1I9DA 2KP1A 2AAWA 3M3MA 2K8VA 5INYA 4EE0A 3HKRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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