2O7KA

S. aureus thioredoxin
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
AIVKVTDADFDSKVESGVQLVDFWATWCGPCKMIAPVLEELAADYEGKADILKLDVDENPSTAAKYEVMSIPTLIVFKDGQPVDKVVGFQPKENLAEVLDKHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The conserved active site proline determines the reducing power of Staphylococcus aureus thioredoxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Staphylococcus aureus
total genus 29
structure length 103
sequence length 103
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2o7kA00
3GYKA 5HR1A 4YQVA 4F0BA 2K9FA 4TXOA 1TRWA 2H1AA 3RHCA 2R6KA 4MDCA 1H4OA 3APSA 3IC4A 4LMWA 5C04A 3VWVA 4HDEA 1BG5A 3FRCA 3C1RA 2EIOA 4RI6A 3F6FA 4MF7A 2H71A 2GQLA 1FG4A 1XVWA 4POMA 1GL8A 3QCPA 2YJ7A 2O7KA 2LRNA 1B9XC 3TKRA 5IMVA 1WJKA 1SL2B 3G7JA 4O7HA 3NIVA 3D4TA 4HU7A 1MTCA 4XIHA 5CRHA 2MMAA 1OAZA 2OBKA 4YH2A 4I97A 4E8HA 4ILFA 4MJEA 3D4MA 4IN0A 2DSAA 3HKRA 1U3AA 3TKSE 3UIWA 3L0HA 4L5LA 2CQ9A 2MMNA 3E3EA 2B3SA 4PX1A 1OE7A 3CSJA 2DJ0A 2OE0A 2KOKA 3M9JA 1B48A 4KE3A 3KCMA 1H75A 1TJDA 2VL9A 4EL1A 3LG6A 5ECLB 5GAPD 4WBJA 2CX3A 5IQYA 1UA5A 4EF0A 3VI5A 2R37A 1XIYA 5DCGA 1SK2A 5KN3A 2GZZA 1ABAA 5EL8A 3GUSA 2KP2A 4NWYA 2C1YA 3KMOA 2NTOA 5A4WA 2CVDA 4V1Ag 2JSZA 3DWVA 2RM6A 3TKQA 1QFNA 5FWGA 5IMCA 3U5RE 2X8GA 17GSA 2WS2A 3D5JA 3GTUA 1X9MB 4IW9A 5IPHA 1RW1A 2TRCP 4KCAA 1F3AA 3J7Yb 5FT3A 1SJ6A 3W6GA 1ZYQB 1JZWA 1SKWB 3KJYA 4BL7A 1J0FA 2H76A 4IGJA 1ZL9A 3G7IA 1YKAA 5GZZB 2LQOA 2PMTA 3BD2A 2BJXA 1O8WA 4D73A 3HDCA 1BEDA 2B6MA 4O5RA 3IA1A 1LU4A 1O6JA 1YEXA 2R4VA 3QD9A 2LQQA 3P2AA 4MJCA 1AW9A 1PL2A 2GZYA 2TIRA 4MABA 1V40A 2Z9SA 3O76A 2C0FA 3FR6A 4FIWA 5A4UA 1DUGA 1ILOA 1Z9HA 2C0EA 3IK7A 5HR3A 2EIQA 5JCUA 2H6ZA 1QQ2A 1PN9A 3IV4A 2ZNMA 3VFIA 3LEFA 4ZB9A 2ZCTA 2K8SA 2VAFA 3GKMA 3ZIVA 4EE0A 4MPFA 2OJLA 3RDWA 2A2SA 4Q5RA 5ECQB 2KLXA 2N5FA 5AIXA 4J57E 2AB6A 3DYRA 2HSHA 2HRNA 4BWQA 3TKSA 3KMNA 2I1UA 5ECRB 5IMFA 3LJRA 4KB3A 3ZVJA 4BPYA 3HHVA 3O6TA 3VI7A 3IAM2 1FO5A 2I9HA 4V2NA 4OFTA 1JHBA 1XWKA 3RAZA 2WDUA 3GL3A 3DVWA 3RPPA 2YV9A 1V58A 4KGIA 1SKRB 2M80A 2KUCA 4LMVA 3DVXA 2V6OA 3HZ8A 1QUWA 3FYGA 1FOVA 2PU9C 1A8LA 4KNDA 2FCHA 2VCZA 5G1LA 2LRCA 1K0NA 5KN0A 2JL4A 1EP8A 5DDLA 2VM1A 3GHAA 1EWXA 2H72A 10GSA 1K3OA 4J56E 1THOA 3FR3A 5DBQA 4ISDA 5JCWA 4L8EA 4HUAA 5B7CA 2HZFA 2X99A 3ZTLA 4IJIA 4TR1B 2MZCA 2P0GA 2KP1A 4MH2A 9GSSA 4PGTA 1G7EA 3GH9A 1F2EA 2GQMA 4MPGA 4IKHA 4KAEA 3BBYA 2LRTA 5FHIA 3TRQA 5HR0A 4ZBBA 5F8BA 1ERUA 1OE8A 1M9AA 14GSA 1KBNA 3UEMA 4LL1B 4YAVA 3LYPA 3K8NA 1VF1A 5CREA 1GNEA 3A2WA 3RPNA 2RM5A 2OE1A 2WCIA 1EOGA 2HSYA 4PUFC 2OACA 5DAKA 3FY7A 1I5GA 4OWYA 3PH9A 3MNGA 1AQXA 1URMA 2V1MA 2PBJA 4L0WA 3PINA 1U87A 1QXHA 3C1SA 5F0GA 1T1VA 5D9TA 3KH9A 3A3TA 2LTKA 6GSWA 1JZDA 4EC0A 3KEBA 4I8BA 4MZBA 6GSVA 3EWLA 3I9V2 3TJJA 1JLVA 2H8LA 2FWHA 2CV4A 2M72A 1M0UA 5IMZA 1MDKA 2VLUA 3Q19A 5F05A 1NSWA 3KD0A 3ZFLA 2GSSA 1O85A 1JLWA 4WKWA 1VRSD 22GSA 3GKXA 12GSA 4JE1A 3WD6A 4I5QA 5JWQB 2WZ9A 2JZSA 2YWIA 2AJQB 2OE3A 4MP4A 1PGTA 1T8EB 2X8HA 2CT6A 5D9VA 3HVXA 1U88A 3DXBA 1EV9A 2L6DA 3HVSA 4DEJA 2V6KA 3HY2A 1EEMA 2I4AA 2CX4A 4BWSA 5DCHA 2J9HA 3IR4A 5HQPA 3GA4A 1HYUA 5IO0A 3QDNA 4LA1A 2TRXA 4MZWA 2DJJA 3H79A 4XS4B 5JWOB 2AV4A 1DSBA 4AJ8A 1YY7A 5D96A 1Y6EA 2YZHA 1TRVA 2ON5A 1FW1A 4OD7A 1UVZA 2QKEA 3G7YA 2MYGA 5G5FA 1FAAA 4EKZA 3KH7A 1GLPA 2LEGA 1YF0A 2GLRA 4MJBA 2H70A 5CRDA 1YZXA 1CQGA 1PKWA 2MMZA 1WOUA 3F8UA 5AIVA 2K18A 3ZREA 5AISA 2F8FA 1FVKA 3D22A 4GSSA 3ZL5A 4F03A 2P5RA 4JR4A 4XS6A 1TK0B 1V2AA 4AGSA 1ERTA 3PGTA 2DMMA 1GP1A 4NV5A 1IYIA 2KHPA 4F2IA 4I2UA 1S3AA 1W4VA 3CSHA 4DSQA 2HNLA 2P5QA 19GSA 2VUPA 3P7XA 1TTZA 3GSTA 5ECSA 2VCTA 3TKSC 4ECBA 2OADA 4ZILA 2PN8A 2OBIA 3EURA 3BJ5A 2DJ3A 3H8QA 1GWCA 4IVFA 5CRWA 5HFGA 4HJ2A 3F63A 3EC3A 1A0RP 1XXUA 4GRFA 2DJ1A 3M0FA 3L9VA 4V1Ap 4IQ1A 4MCUA 3Q6OA 4PQ1A 1TI3A 1ERWA 2C80A 2GTUA 3KP8A 1R5PA 3QFAC 2PPTA 2IN3A 5AGYA 4EDYA 1THXA 1FB6A 5J9BA 3TDGA 5DJLA 3EYTA 4TR4A 3IBHA 4LLRA 1VF3A 2LUSA 4G19A 3ERWA 3O3TA 5B8BA 1TRSA 2DIZA 1VF4A 3GRXA 2NPBA 5CNWA 3IK9A 5CO3A 1A2JA 4D73B 1E2YA 3VURA 3TJBA 3F3QA 3BCKA 2H74A 4MZCA 3ME8A 5E59A 1YF1A 2B1KA 1PRXA 4NPBA 4XCSA 2XBIA 1TKDB 1TRUA 2FWFA 4ZL9A 4DSRA 5ECPB 4POBA 2REMA 1T7PB 3F6DA 4QQ7A 1B8XA 1SENA 3G9BA 2H19A 4K7NA 3TUEA 2DIYA 1PL1A 1ZOFA 5F07A 3QAGA 6GSYA 3UAPA 1AXDA 4KDXA 1AQVA 6GSSA 3CRTA 3WGEA 1WE0A 3N9JA 1BX9A 4ZXGA 5HFKA 2DJKA 5ECKB 4MH3A 3APQA 3LFLA 1WP0A 2VCXA 5IMDA 3N5OA 5G31A 1Z6MA 1GUHA 2LSTA 3D0ZA 2RLIA 1Z7PA 5CAXA 1BAYA 3ISOA 1AAZA 4BA7A 1WWJA 3WGXA 3HJOA 5JWRB 2IFQA 3FK8A 3ZMLA 2V2GA 4BVYA 1A2MA 2HRFA 2C0GA 3ZYWA 2IMKA 1GTIA 4DSSA 1MD4A 1Z3EA 1J9BA 4HJMA 1HNBA 1XPVA 2HLSA 2NBSA 5DVBA 5GAND 2LKUA 4TVEA 2GVPA 5KN2A 1LBKA 2GGTA 1M2AA 1UC7A 2K6VA 2GQKA 4GF0A 2DC5A 1XOBA 3GKNA 1NHYA 4K1FA 1M2DA 4XTSA 5H5RA 4PNGA 1ST9A 1SYRA 4NMUA 2WJUA 1S3DA 1MDIA 1R5AA 1TW9A 5D73A 2R5GA 3KZQA 1SD8A 1S3CA 3MAKA 5IIZA 4EVMA 2H0GA 4XHMA 5CYYA 3C73A 3MSZA 5G2ZA 5COHA 2NVLA 1UN2A 3F9UA 3ERGA 3DGQA 1K0BA 4TKYA 2L57A 2ZUPA 4Q5NA 3W8JA 3FKFA 1YKCA 3IRAA 4NHZA 4PUAA 4TXVA 3L78A 1R7HA 2A4VA 4RUVA 3KM6A 5JCGA 2PVQA 2XC2A 2VIMA 5KN1A 4PXOA 3RHBA 2VL2C 4PURA 1XFLA 1N2AA 5ID2A 3ZMKA 2NDOA 3GSSA 5IPGA 5J5NA 3U6VA 1K3LA 4PQIA 4G10A 1E6BA 3UL3A 1X9WB 3IE3A 3TJGA 1LJRA 1NW2A 5ECNB 1PX6A 2GSTA 1M2BA 3HYPA 4V2LA 20GSA 4IJ3A 4O32A 5G30A 1X5EA 2AYTA 4FYBA 3IAS2 3QOUA 5HFIA 1ZZYA 3FHKA 3P90A 1GTBA 2C0DA 1TU8A 3GKKA 11GSA 1JFUA 2C3QA 1MEKA 3TOTA 2H73A 1A2LA 4K7IA 3US3A 5E4WA 2L59A 4ZB8A 3Q74A 3KXOA 3GL5A 1K0MA 1J08A 1U3IA 1V9WA 4X1UA 3RBTA 3WGDA 1Y25A 3M1GA 5H5SA 1GUMA 1OC9A 2PWJA 4CDOA 2H75A 1OC8A 3D21A 2FD3A 4IQAA 5AN1A 2C3NA 4ECCA 1HNAA 1XWCA 1I9DA 4JEDA 3QMXA 3IHQA 3CMIA 1HQOA 3MDKA 2IJYA 2VCVA 1N8JA 1XVQA 1AUCA 5DALB 1GLQA 4K6XA 1O8XA 2DBCA 4K0GA 1SJZA 1ML6A 3LORA 3A2VA 13GSA 4OCEA 5B6NA 5G1KA 4IS0A 3L9SA 1F9MA 1TK5B 4GCIA 2YPMA 2G2QA 3GMFA 1WPIA 3ZLPA 1O73A 1YEPA 3AY8A 2GSRA 2R3XA 1SU9A 2FWEA 4KSMA 4ZL7A 4IP1A 3LXTA 1TXXA 3GNJA 1TDIA 2LJAA 3CTFA 1M7TA 4KCEA 2FY6A 3KIJA 2X64A 2HE3A 1BQ7A 1MDJA 3TGZA 3EMPA 5DJMA 4WEYA 4KDYA 4L0UA 4N11A 1WRYA 4HS1A 4KDUA 5J4UA 3EINA 4IELA 4RQRA 4V2MA 3VWXA 3GH6A 3ME7A 4TR1A 2YWMA 3F4SA 3QPMA 2JZTA 1SYXA 2JACA 4EUYA 3TRXA 1XCCA 1B4PA 1PKZA 3WT1A 1BYEA 1EGOA 1C72A 3V1WA 3ERFA 1IYHA 3F4TA 2QGVA 5LD0A 3LSZA 2L5OA 3KP9A 5ENUA 2N5AA 3GN3A 4TXOB 3TRPA 3TB2A 4TRXA 2N5BA 3S9FA 3FW2A 3E9JB 1G6WA 3GV1A 2L4QA 2G0FA 2P31A 4QL7A 5C00A 1TU7A 2C8UA 4EO3A 2CVBA 2VD0A 1OYJA 4HI7A 3VLNA 2XBQA 1T4YA 4F9ZA 2RUFA 2F51A 1GULA 4Z7XA 4ID0A 1CQHA 2FA8A 1GH2A 2B5YA 3DKSA 1GSSA 4ZBDA 2CAQA 4ECJA 4GQCA 2GT6A 3WYWA 1RK4A 3R2QA 5J41A 4O92A 3CRUA 2H6YA 4Q5FA 1U6TA 1A23A 2VLTA 3DIEA 2RIIA 1KEBA 3VPTA 5CP1A 2YWOA 4ZB6A 5EPFA 1TI1A 4CHSA 3C7MA 1GSYA 1MD3A 2PVOC 5D9XA 2ES7A 2XHFA 3EMXA 1RQMA 2YP6A 3GURA 4HZ2A 4IP6A 5ECIB 5EVOA 4HEA2 1ON4A 5A4VA 2H6XA 3QR6A 4J2FA 3APOA 3C8EA 3H1NA 2ALBA 1EGRA 5ECHB 3L9UA 5D9WA 3TCOA 4P3YB 1QK8A 2IMIA 4OO5A 5CRGA 3ZVJD 3KGKA 5ECMB 4EXJA 2GS3A 3I43A 1EZKA 3GX8A 4TW5A 1SL1B 3HCZA 1B4QA 3HXSA 4XS4A 4TR3A 2L4CA 4GWRA 7GSSA 4MJAA 2OA7A 2K8VA 1V57A 1AQWA 4WETA 4WXTA 1AC1A 2YZUA 2DMLA 1SJIA 2HT9A 4PQHA 3FZAA 2O8VB 1K3YA 2LJKA 2X8CA 3UMAA 2YOIA 5IOXA 3GTUB 5DQSA 3WT2A 1DE2A 2JZRA 3FZ4A 3D6IA 3DMLA 2B7KA 4WF5A 2XPEA 4KW6A 4HOJA 3LGCA 6GSUA 3TOUA 2OKAA 2HFDA 3ZRDA 4FO5A 1VGLA 2IFQB 4ULXA 4GSTA 5ECOB 2HZEA 1WIKA 1YJ6A 3ZIJA 3ZZXA 2LJRA 4DSSB 1W89A 5IO2A 2QC7A 1FHEA 4DVCA 3DEXA 2H1DA 2VCWA 4GLTA 1OVNA 2H30A 4OFNA 3LWAA 1K0OA 2IMEA 1GSFA 2WB9A 5A5KA 1HD2A 4RI7A 4JZQA 2GDRA 4GQFA 3M3MA 3VWWA 4MLYA 1WMJA 1DE1A 2GZPA 1QGVA 4WF4A 4AF2A 3BOAA 2LV3A 4ACSA 1XWGA 4AJ6A 1K0DA 5D93A 4OMVA 3HA9A 1YDKA 4ML6A 2JSYA 5IMAA 3BCIA 3UJ1A 2GT5A 2H0HA 2HXKA 2VD1A 5LCZA 2L6CA 3FZ9A 2FLSA 5ABRA 1T00A 4ZL8A 3GFKA 4KSOA 1X9SB 2VLVA 1G0TA 1XZOA 6GSTA 2IPAA 1OKDA 3E0UA 6GSXA 2B5EA 3CBUA 1PQNA 1Q98A 4JBBA 3KTLA 2VO4A 2MMOA 2VOCA 3P8WA 1O81A 4HQZA 2V41A 2VM2A 1G7OA 2YJHA 3GX0A 2PGTA 4K0NA 4MMMA 5ID2B 2B5XA 2D2ZA 1SL0B 1XW6A 4ZIJA 4HU9A 2R2JA 3M9KA 4HQSA 2WFCA 1G6YA 1SK0A 3LQ7A 4KA0A 3CTGA 4POLA 2H66A 4K7OA 5INYA 2ON7A 4OFMA 2FUG2 3FR9A 4FYUA 4GXZA 1KNGA 2YWNA 4POKA 4MF5A 4KX4A 3OR5A 4ZBAA 3FZ5A 3TJFA 1T4ZA 4YQUA 1GNWA 4YQMA 3ZFBA 2B7JA 3I6AA 4F82A 3QAWA 2EIRA 4K2DA 1PD21 1V98A 2A2RA 3L4NA 2IMFA 1FB0A 4K9ZA 1GRXA 4XRAA 4KUNA 2CVKA 3JCML 1OC9B 2FWGA 5ELAA 2V32A 3VWUA 2FGXA 3ZITA 1ZMAA 1DBYA 2AUVA 2YV7A 1ZCPA 5J9CA 4JR6A 2LNTA 1XWBA 1ZGNA 3HVVA 4I2TA 2AAWA 3A2XA 4MA9A 4G9HA 1USBA 2C3TA 2C4JA 3GIXA 5D8IA 3KTBA 4NV2A 1OKTA 2FA4A 2JU5A 4CW9A 1PX7A 3HJPA 3EU4A 4H86A 3HD5A 5DAKB 3FEUA 4GSNA 4PNFA 4NHWA 5L71A 2O85A 1B9YC 1EEJA 2M46A 2IMDA 2JADA 5KEJA 2F3MA 3EU3A 1O7UA 1XOAA 1T3BA 3PR8A 5GSSA 1Q4JA 5H5QA 1GTUA 2PERA 1GSEA 1XBSA 4JU5A 2LNSA 1X5CA 3HZ4A 3W8SA 3QFBC 5G5EA 1M9BA 2FNOA 5EY6A 1X5DA 3ED3A 3IXRA 4BVXA 3DRNA 2E2GA 3LYKA 2YCDA 1FVJA 2DLXA 1NHOA 1EOHA 3H4KA 2H0IA 4N0ZA 1R4WA 8GSSA 1KTEA 3LXZA 2HYXA 1GUKA 4AJ7A 3C71A 1TOFA 4RQXA 2PUKC 4K8MA 1AIUA 1ERVA 3CXGA 1PMTA 4ECIA 2DJ2A 1GTAA 3VPQA 1EP7A 4YAPA 1GSUA 4Q5QA 2BMXA 2XPDA 3UVTA 2QSIA 1X0RA 18GSA 1Z7RA 2F9SA 3SBCA 2E7PA 4E8EA 3IOSA 2IL3A 2FHEA 4I6XA 3I69A 1SK1A 1QMVA 1PA3A 3SWLA 4ML1A 5IM9A 2WRTA 3CYNA 1M99A 4NXIA 3VK9A 3NZNA 4HZ4A 1BJXA 2WULA 4MF6A 4WBRD 3UARA 1ZYEA 4WR4A 2L5LA 1JZOA 2F8AA 3QAVA 4OO4A 2LS5A 5GSTA 2IWTA 4L5OA 2O89A 2MBSA 4IBPA 3IPZA 3J7Yk 4F0CA 2YN1A 2AHEA 4X0XA 4N10A 4QL9A 3F3RA 2RUEA 3CSIA 4XRDA 3Q18A 5DALA 5B6MA 2GSQA 5J3RA 4FYCA 1A8YA 1SKSB 1K0CA 3TKPA 2WGRA 2H1BA 2H01A 2H1GA 2BTOT 2O87A 16GSA 2I3YA 3MWHA 1SD9A 3H93A 2B1LA 2E0QA 3TJKA 2IIYA 3HJMA 3EE2A 3DD3A 2HI7A 1EV4A 4N0VA 3UOMA 1YQ1A 1HNCA 5B8AA 3UVHA 4MK3A 3NOFA 4LL4B 4JRRA 2VL2A 1Z5YE 4FH8A 4TR0A 1VF2A 2E2MA 4EDZA 4N30A 3F4RA 3M8NA 2VCQA 1ACVA 1OC3A 5ELGA 5IOWA 2CAIA 1A24A 2EC4A 4X43A 2I81A 3EVIA 3UBLA 5LNKe 4GTUA 3A5WA 1NM3A 1F37A 4IHUA 1K0AA 1Z6NA 1TK8B 1XWAA 4XS1A 2CZ2A 5DQYA 5HR2A 4OCFA 1JZRA 1GSQA 2HZEB 4KH7A 2YANA 3F0IA 4TOPA 2CA8A 1R26A 4NAXA 1XW9A 1F6MC 1TP9A 2J23A 1A0FA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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