2O87A

S. aureus thioredoxin p31s mutant
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
103
structure length
103
Chain Sequence
AIVKVTDADFDSKVESGVQLVDFWATWCGSCKMIAPVLEELAADYEGKADILKLDVDENPSTAAKYEVMSIPTLIVFKDGQPVDKVVGFQPKENLAEVLDKHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The conserved active site proline determines the reducing power of Staphylococcus aureus thioredoxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Staphylococcus aureus
total genus 27
structure length 103
sequence length 103
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2o87A00
1M9BA 3GTUA 1I5GA 1X5EA 5J41A 4IELA 1KEBA 2YJ7A 3IBHA 4EF0A 5ECLB 1J9BA 5COHA 2CT6A 1GNWA 1XW9A 4YH2A 3R2QA 1A2LA 4ZB9A 4O5RA 4N10A 3VFIA 2OADA 3H1NA 2OE3A 3LJRA 3OR5A 3FZAA 4P3YB 3VLNA 4H86A 3TKSA 3TRPA 4PUFC 3ZRDA 4POKA 2OKAA 2FNOA 3N5OA 4MMMA 3NIVA 4J2FA 2H75A 3BCIA 3CSHA 2PVOC 3MAKA 2REMA 2L57A 3WGDA 3GNJA 5DALB 1FVKA 4G19A 2FWFA 2XBQA 1ML6A 1YJ6A 3VWUA 5JWOB 5B7CA 3IDVA 2B1KA 4IGJA 2H71A 4IJ3A 2LJRA 3ZZXA 2ON7A 4OFTA 5ELAA 1TRWA 4MDCA 3H4KA 1NW2A 4TKYA 1SKWB 1SL2B 3RHCA 2H76A 4IVFA 2FLSA 1PKWA 3EURA 1H4OA 3TKRA 1BEDA 3CSIA 1BG5A 1Z7RA 4ECCA 3LSZA 3TGZA 5AISA 1EOHA 4KDYA 2EC4A 2WRTA 1U3IA 1WPIA 4Q5NA 4KE3A 2EIRA 2GSSA 4K9ZA 5CO3A 2M72A 2YWOA 2KLXA 4I2TA 4RI7A 4FYCA 3DWVA 4TVEA 5ECRB 1TK0B 4MJBA 4WF5A 2VCVA 1TP9A 1EP8A 2OACA 1PL1A 1NM3A 3IHQA 4PNGA 4E8HA 2B6MA 4CDOA 1K0DA 1OE8A 3I43A 5AIXA 4KX4A 3MSZA 2WS2A 4V2NA 4KSOA 4YAPA 2DJ2A 5FWGA 1JZWA 5JCWA 4WBJA 4JU5A 4G10A 2PMTA 1GSSA 4BVXA 1FB6A 2H0GA 2I81A 3GX0A 4MA9A 4ZL9A 4IJIA 5DAKA 4JZQA 1XW5A 1FG4A 1SJZA 4HQZA 3HJPA 2CX3A 3EMXA 5CYYA 2HNLA 4ZL8A 3M0FA 2DBCA 5D9VA 5JCUA 3APOA 4YAVA 2YOIA 1BAYA 3HJOA 3Q18A 1K0AA 1V58A 2ES7A 2HZEB 5EL8A 3UVHA 3M9JA 4E8EA 1GSYA 4GLTA 5HFKA 5AN1A 5ECKB 2IMFA 4MZWA 4ZB6A 3KZQA 4G2EA 1TU7A 5FHIA 4NHWA 1PX6A 2YN1A 3HJMA 3ZLPA 3LYPA 3HVSA 10GSA 2BTOT 2LV3A 7GSSA 5G1KA 3FEUA 3ERGA 2VL2C 2P5RA 4KCEA 5CREA 14GSA 2IMEA 1BQ7A 5G2ZA 3TUEA 1T7PB 1XOAA 5F05A 5INYA 5DJMA 4PXOA 1GULA 2M80A 1XBSA 1M7TA 1HQOA 4XS6A 4N11A 2IMIA 4YQUA 2XC2A 1GSDA 4KH7A 3CBUA 3KH7A 2GSRA 4HS1A 2WGRA 3F63A 3QDNA 4NPBA 3AY8A 3BD2A 3GRXA 4V1Ap 3UJ1A 5G30A 2ZUPA 3C73A 5LNKe 3E9JB 3GSSA 3VPQA 1B9YC 4EKZA 4Q5FA 5AGYA 1GUHA 4NHZA 1K0MA 3ZL5A 3DGQA 5F06A 1EV4A 4ZL7A 3CTFA 2DC5A 5ID2A 2YCDA 4MCUA 5IMZA 3GYKA 4WXTA 2VCQA 2L4CA 5HFIA 1QFNA 1YQ1A 6GSVA 5DQSA 4HOJA 3GSTA 5EPFA 4KSMA 2LTKA 1WRYA 1ZYQB 2KUCA 5E4WA 4PUAA 3GH9A 3C1SA 4PX1A 4KAEA 1Z5YE 6GSSA 1O81A 3BBYA 3FYGA 4TOPA 3IK7A 5ENUA 3TJJA 2OJLA 4KDUA 1ON4A 3HHVA 3HKRA 3S9FA 5A5KA 3IPZA 3G9BA 3CYNA 3LQ7A 2V41A 4O7HA 1DUGA 1O8XA 2P5QA 5KN0A 1OC9B 3A3TA 1SL0B 1BX9A 4HDEA 1WWJA 4PQIA 9GSSA 1EOGA 4GSSA 1M2DA 3PGTA 1PKZA 6GSTA 4LA1A 5GAPD 3WD6A 4IW9A 2VAFA 3IK9A 3G7IA 2OE0A 2DJKA 3GMFA 2YV7A 2C3QA 4Q5RA 1W4VA 2VL9A 1S3DA 1M99A 2WULA 3EWLA 2H1GA 3RBTA 5B6NA 1ST9A 2GTUA 3GV1A 2K8SA 5KN1A 4K7OA 3EMPA 3KJYA 3APQA 1SYRA 1DE2A 1MDIA 1TJDA 1EEMA 1YDKA 3ZVJA 3M1GA 4JEDA 4N30A 2H19A 3DVWA 1Z6NA 4BWQA 4FIWA 2C0FA 4LL4B 5IPGA 2H01A 2YP6A 5IMDA 2B5YA 4I97A 4GXZA 3WYWA 4TN8A 1AW9A 5D93A 1UA5A 2H66A 1M9AA 1A23A 11GSA 5EVOA 1FB0A 3G7YA 3HA9A 4TXOA 4EVMA 3EYTA 3KD0A 4HU9A 5ABRA 2HLSA 2H6XA 3D5JA 2I4AA 2LUSA 3L4NA 3TOUA 5CRDA 3DD3A 2IMDA 1TW9A 2TRCP 3O3TA 2MMAA 4MK3A 4DSRA 3V1WA 4GQFA 1TI1A 3TJBA 4GF0A 2IFQA 1X5CA 1UN2A 2VUPA 1A2MA 1QMVA 4WR5A 1PN9A 2L59A 3EE2A 1XIYA 2DJJA 4TXVA 3UARA 4IBPA 3C71A 1SKSB 4LMWA 2HRFA 1T4ZA 2V1MA 4MF6A 3VURA 1XWGA 2F51A 2X64A 1NHOA 2GT6A 3LGCA 5IPHA 2QSIA 4PGTA 4Q5QA 3IOSA 2MMNA 3LXTA 4GWRA 1THXA 4L5OA 2IFQB 1EWXA 1YKCA 2AAWA 4K8MA 2XHFA 2GVPA 3ZYWA 4AJ6A 1M2AA 2H73A 5G1LA 1G6WA 3BJ5A 4HQSA 2K6VA 2R3XA 2FA4A 2DJ3A 4NV2A 3IE3A 5J9BA 4ECJA 3TKSE 1ZCPA 1GP1A 4EUYA 13GSA 3O76A 1JLWA 6GSWA 4ISDA 3ME8A 2BJXA 4X0XA 1A8LA 2LRTA 1AAZA 1M0UA 1J08A 1U6TA 5CRHA 5FT3A 1Q4JA 2AHEA 3D22A 2E2GA 1A24A 5F8BA 4F0BA 4XHMA 2ON5A 4F03A 2VCWA 3H8QA 3TKSC 4ACSA 1WIKA 2HZFA 4QQ7A 3KTBA 2X99A 5ECSA 22GSA 2N5AA 1X9MB 2LJAA 3ED3A 4ZBDA 1EGRA 2DIYA 4WF4A 4QL7A 1AQVA 5D96A 4K0GA 1A2JA 4PURA 2HI7A 2L5OA 3A2VA 2AJQB 4MP4A 4YQVA 2IMKA 3WT1A 3LG6A 6GSXA 1MDKA 1F9MA 4QL9A 3GTUB 2PU9C 4MZBA 1KNGA 1XVQA 1ACVA 1FW1A 2YZHA 5J9CA 5IQYA 2H1AA 3BOAA 4OO5A 2CVBA 3ERWA 3WGXA 5A4UA 3WGEA 3IC4A 3W8SA 1TI3A 1S3AA 5ECIB 1AQXA 1B9XC 3KP9A 1E6BA 2OBIA 1FVJA 1SD9A 1FOVA 2O85A 3TJGA 3P8WA 4ECBA 2PBJA 2NPBA 1OC3A 3KMOA 3QCPA 1GWCA 3KXOA 4RQRA 1CQHA 4DEJA 1TRVA 1MD3A 1G0TA 2XPDA 4ZBBA 3IXRA 3IRAA 2VIMA 4RUVA 2VD1A 1USBA 12GSA 2LRCA 1SENA 1EZKA 1Z3EA 2C0GA 2O7KA 5IOXA 3F0IA 1G7OA 1R5PA 1EP7A 2LSTA 1TXXA 2G0FA 3F3QA 1M2BA 3LORA 1Q98A 3VWXA 1GSUA 2GZYA 3VWWA 4IHUA 3FY7A 3FKFA 2H74A 1ERWA 3LYKA 5HR0A 3ZMLA 2GLRA 2CZ2A 1YKAA 4OD7A 1X9SB 3HVXA 1VF3A 3NOFA 2RUFA 2KHPA 2BMXA 5D73A 3KGKA 1GTBA 3TOTA 1G7EA 1JHBA 2LNSA 4MF7A 3P7XA 1XFLA 4BPYA 2C8UA 2B5EA 1O73A 3HZ8A 4NV5A 2CVDA 3GUSA 1PL2A 3LFLA 4KGIA 4K6XA 1SU9A 3VI5A 1VRSD 3LWAA 3ZFLA 2TRXA 2IWTA 4IS0A 2R6KA 3I69A 2H1DA 2D2ZA 1JLVA 5ECQB 1N2AA 4GCIA 1JFUA 5DAKB 1K0CA 2DJ1A 4HJ2A 2H72A 3ZIVA 8GSSA 2J23A 3TJFA 5KEJA 3TDGA 5CRGA 2CQ9A 4D73A 1EV9A 1I9DA 3F8UA 1AIUA 2VCZA 3TJKA 4DSSA 3RPNA 2MZCA 4EDYA 3GA4A 4HZ2A 5GSTA 1NHYA 4ILFA 1KBNA 5IOWA 3E0UA 4HEA2 3CXGA 1K3LA 2GQKA 5H5SA 4KA0A 5J5NA 1XWCA 1PA3A 4TR3A 5IMCA 3EU4A 4DSSB 4EL1A 4WEYA 1GSFA 3F4SA 3FRCA 3HXSA 4POBA 3Q6OA 1ZMAA 2HT9A 1Y6EA 2X8CA 2JSZA 3GHAA 4OMVA 3F3RA 2GDRA 2ALBA 3TCOA 3PR8A 2C4JA 3KCMA 3C8EA 2YWIA 1XWKA 2VL2A 2H1BA 3I9V2 3UIWA 2VO4A 4JE1A 4DVCA 2N5FA 1YF1A 4HZ4A 2MYGA 2DMLA 2GQMA 1YY7A 3E3EA 1R4WA 1A0RP 1ABAA 1IYHA 1WE0A 1IYIA 2L6CA 4OO4A 5ID2B 4DSQA 2PUKC 2A2SA 3F6FA 4MPGA 4IN0A 17GSA 5B6MA 4XCSA 5ECNB 2GS3A 3PH9A 4K7NA 2MBSA 5A4WA 4FYUA 3DVXA 3D21A 1THOA 3H79A 2H6ZA 5IO0A 5DQYA 5IO2A 2B7JA 1FO5A 1LJRA 2H8LA 3D0ZA 1TRSA 1OAZA 5CP1A 1K0BA 4AJ8A 1AC1A 1XPVA 4I8BA 1TK5B 2FGXA 2C0EA 3CRTA 1GUKA 1LBKA 3M9KA 4TR1A 5LD0A 5D8IA 1OC8A 1WMJA 5GSSA 1SK2A 2GT5A 2HYXA 5JWQB 1TRUA 3J7Yb 1B8XA 2A2RA 3UMAA 2H0IA 3KH9A 1URMA 3HDCA 4MABA 3IA1A 4KCAA 2F8FA 4F82A 2CX4A 2DMMA 1V9WA 5C00A 3M3MA 4LL1B 3HVVA 2PN8A 3FZ9A 3LEFA 4ZB8A 2JSYA 1GTIA 3FK8A 2VCXA 5J4UA 1K3YA 3US3A 2VOCA 1UC7A 4OCEA 2AUVA 5G5FA 4TR4A 3H93A 1X5DA 3FR9A 1TTZA 3MNGA 1MTCA 2O8VB 4L0WA 5HR1A 1F3BA 2JU5A 5KN2A 2WCIA 5L71A 1GUMA 3FZ5A 2C80A 2GSQA 1X0RA 3RPPA 4K2DA 1QK8A 3QD9A 4TRXA 3RAZA 4MH2A 2C3TA 2PGTA 5IMFA 1GL8A 3TRXA 3FR6A 2L6DA 2C1YA 1PX7A 3VWVA 4XRDA 4X43A 1WJKA 2DLXA 3PINA 1F3AA 5JWRB 5A4VA 4GQCA 1QUWA 1GRXA 4WBRD 3LXZA 3CTGA 4EDZA 3DIEA 3QOUA 3TKQA 4CHSA 1T3BA 4TXOB 1B48A 1YF0A 5B8BA 4L8EA 4MLYA 3GKXA 3MWHA 4G9HA 2AYTA 2PVQA 2MBTA 1WP0A 5CAXA 1XWBA 4EXJA 5EY6A 3W6GA 1OKTA 3GKKA 4WETA 4XTSA 1Z9HA 4POLA 1GNEA 2OE1A 2NDOA 5DCGA 2NVLA 4RQXA 3A2WA 4K1FA 2ZNMA 2VLUA 3GKNA 4BA7A 1F6MC 2GZPA 5DVBA 2V2GA 5HR2A 4EE0A 1S3CA 2E7PA 2V6KA 18GSA 3UVTA 2PPTA 2YWMA 1YEPA 2IJYA 3SBCA 1OVNA 3KTLA 1OE7A 2CVKA 4KDXA 1H75A 4ID0A 2OBKA 2HE3A 3L9VA 4MH3A 2R2JA 2R37A 2RUEA 2XBIA 3QPMA 4FH8A 3IAS2 1B4QA 3GN3A 3NZNA 3UOMA 1T4YA 2VM1A 3EINA 3W8JA 2B7KA 3QAWA 3JCML 4MJEA 3APSA 2XPEA 2I1UA 2P0GA 1TOFA 2LQQA 2YPMA 1SJ6A 4EC0A 2F9SA 2K18A 2OA7A 4I5QA 1U87A 1SKRB 1R26A 2HSHA 3BCKA 4NMUA 1HNBA 4GSTA 4ML1A 3VI7A 4K7IA 2QGVA 1GSEA 5DALA 1A0FA 5ECMB 4HJMA 3L0HA 1RW1A 5GAND 1V98A 2FHEA 2LRNA 4GTUA 3FHKA 4MF5A 5CNWA 2VD0A 1XZOA 5JCGA 1X9WB 1J0FA 2DIZA 3L9SA 3QAVA 5HR3A 5KN3A 2MMOA 3D4MA 4IQ1A 2WFCA 1V57A 3GL5A 2JL4A 1SYXA 1O8WA 1PQNA 2B5XA 4MJAA 6GSUA 4N0ZA 1Y25A 1DSBA 4K0NA 3Q74A 3N9JA 4XS4A 3QR6A 4NXIA 1VGLA 5D9TA 5AIVA 5D9XA 1O7UA 1TDIA 4IP6A 3RDWA 3U5RE 1ILOA 2RIIA 1XW6A 1DE1A 4AGSA 4HUAA 3ZREA 5IM9A 2H30A 4F2IA 2FWEA 4ULXA 4XRAA 5E59A 1Z7PA 3ERFA 4ML6A 5H5QA 4WKWA 3ZITA 3C7MA 2O89A 4NAXA 2JZTA 4XS4B 1CQGA 4J56E 2FY6A 1SJIA 3Q19A 2ZCTA 2FUG2 3CSJA 3IR4A 2EIOA 1BJXA 20GSA 4GSNA 2F8AA 4ZIJA 4KUNA 4BVYA 1ZZYA 2DJ0A 2QC7A 5LCZA 3CRUA 2F3MA 5IMVA 5ELGA 1GSQA 3L78A 1OYJA 1U88A 3DMLA 2HRNA 3TB2A 3MDKA 2HFDA 4O92A 2IPAA 2FA8A 4YQMA 4CW9A 3GKMA 3M8NA 3WT2A 3HD5A 2YANA 4OCFA 2HZEA 1JZDA 2YV9A 5F07A 2JZRA 4F0CA 5J3RA 3J7Yk 4N0VA 2H6YA 3TKPA 3FR3A 4EO3A 2RM5A 5B8AA 1TK8B 4IKHA 1DBYA 3KP8A 1XXUA 1ZL9A 3L9UA 3ZFBA 4F9ZA 1SK1A 4OFNA 1LU4A 1AXDA 2IL3A 3ZIJA 1U3AA 3F6DA 4KNDA 1T00A 2VCTA 4ZXGA 3ZMKA 1GTAA 2RM6A 4ZBAA 4L0UA 1PSQA 1VF1A 1PMTA 4V2MA 3P90A 1GLQA 4OFMA 1ERVA 2LQOA 3IV4A 3DKSA 2H0HA 2WZ9A 3DYRA 2LEGA 3KIJA 4IQAA 3SWLA 3C1RA 3GIXA 1PD21 2FD3A 5HFGA 3VK9A 1B4PA 3F4TA 3KMNA 4X1UA 2VM2A 1T1VA 4D73B 1T8EB 19GSA 2YNXA 2E0QA 2O87A 1QGVA 4JRRA 1N8JA 4KB3A 1TU8A 2AV4A 1EEJA 5G5EA 1WOUA 3VPTA 4MPFA 2HSYA 3P2AA 2QKEA 2PWJA 4O32A 2NTOA 1RQMA 1MD4A 2IIYA 3QFBC 1HNAA 1MEKA 1GLPA 2GGTA 2TIRA 2AB6A 4FO5A 1RK4A 2R4VA 2V32A 3ZTLA 3QMXA 2VLTA 4KW6A 2V6OA 5IMAA 2PERA 3EU3A 1PGTA 2CAIA 2M46A 1NSWA 1BYEA 1G6YA 5ECPB 3A2XA 2CZ3A 4GRFA 3DXBA 4ZILA 1TKDB 3GL3A 2L4QA 1AQWA 2CA8A 2GZZA 2FCHA 5DJLA 2JADA 1A8YA 4PQ1A 2B1LA 2EIQA 1OC9A 4OWYA 4MJCA 1FHEA 2GQLA 3A5WA 3UBKA 5CRWA 3HCZA 3HYPA 4L5LA 2X8HA 2YZUA 4J57E 1YZXA 2JZSA 1JZOA 1QQ2A 4JR4A 3GURA 2KP1A 5IIZA 3CMIA 1JZRA 2L5LA 4XIHA 2B3SA 3DRNA 3UL3A 2C0DA 1XOBA 2LS5A 4AJ7A 2LNTA 4V2LA 3D4TA 1O85A 4JR6A 1EGOA 3RHBA 1K0NA 1F2EA 4V1Ag 4TR0A 1FAAA 4TW5A 5DBQA 1W89A 2WB9A 4HU7A 2NBSA 4TR1B 2VLVA 2MMZA 4MZCA 1O6JA 2C3NA 1SL1B 5C04A 1UVZA 1ZGNA 4I6XA 2E2MA 1R5AA 2N5BA 3ME7A 2X8GA 5F0GA 2G2QA 2VL3A 4BWSA 3FZ4A 2LKUA 4AF2A 3IAM2 4I2UA 3HY2A 3FW2A 2J9HA 3UBLA 5D9WA 2YJHA 2FWHA 1Z6MA 1XWAA 3KM6A 1ERTA 3QFAC 4IP1A 4FYBA 4BL7A 4ECIA 1C72A 1XCCA 3ISOA 2RLIA 3UAPA 3U6VA 2K9FA 1ZYEA 3G7JA 2KOKA 4Z7XA 1AUCA 2R5GA 2Z9SA 1SK0A 3UEMA 1K0OA 2I9HA 6GSYA 4PQHA 5HQPA 1K3OA 1ERUA 2DSAA 1XVWA 1GH2A 2A4VA 3EC3A 2P31A 4JBBA 4LMVA 3GX8A 3DEXA 1SD8A 1V2AA 1HNCA 3QAGA 2FWGA 2H70A 1R7HA 1V40A 4NWYA 3F9UA 5ECHB 3D6IA 4WR4A 1E2YA 2LJKA 1VF2A 2YWNA 2GSTA 1F37A 1KTEA 1PRXA 1OKDA 1VF4A 3O6TA 2HXKA 1MDJA 2CAQA 4POMA 3HZ4A 3I6AA 3TRQA 4LLRA 5G31A 2I3YA 2K8VA 2KP2A 5H5RA 3F4RA 1HD2A 3KEBA 2CV4A 5ECOB 4RI6A 1QXHA 2WJUA 4HI7A 1HYUA 5GZZB 2IN3A 5DCHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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