2OJLA

Crystal structure of q7waf1_borpa from bordetella parapertussis. northeast structural genomics target bpr68.
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
79
structure length
79
Chain Sequence
HPPRIAIQYCTQCQWLLRAAWMAQELLSTFGADLGEVALVPGTGGVFRIHYNGAPLWDREVDGGFPEAKVLKQRVRDHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bordetella parapertussis
publication title Crystal structure of Q7WAF1_BORPA from Bordetella parapertussis
rcsb
molecule keywords Hypothetical protein
total genus 22
structure length 79
sequence length 79
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10262 Rdx Rdx family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ojlA00
4RI6A 1SD8A 3ZZXA 4MJEA 2LJKA 3GKKA 1WE0A 4EXJA 3I43A 3Q74A 3MNGA 3P2AA 4GCIA 3IE3A 4OFTA 1ILOA 1TU8A 2HRFA 1SYRA 4TXOA 3FZ9A 2FNOA 2P5QA 2LJAA 2FWGA 2X64A 2AUVA 4FO5A 5HR0A 3KIJA 1PL1A 1O6JA 1V58A 2PWJA 5ELAA 2F9SA 3F3QA 1GLQA 2LRTA 1GH2A 5H5RA 4WR5A 4WBRD 4X0XA 3G7JA 1FHEA 2V32A 1HQOA 2JU5A 3KM6A 3QMXA 3KMNA 2N5FA 5GAND 1EZKA 1GULA 3D6IA 4AJ8A 2QKEA 3TRXA 3GKMA 3D4MA 2CV4A 2FWFA 2B5XA 3P7XA 2O8VB 1K3LA 3MAKA 1ABAA 1DBYA 3ZMKA 5AIVA 4JU5A 2YZUA 4ZB8A 4K9ZA 1OC9B 4EL1A 4EDZA 2XHFA 1R26A 4FYBA 2BJXA 4KSOA 1TU7A 1WWJA 1PD21 2LV3A 1M2BA 2NBSA 3F4RA 3M9JA 4RQRA 2R6KA 1X5EA 2C3NA 1OC8A 6GSVA 2V6OA 4OD7A 3EWLA 10GSA 3GA4A 3EURA 2DJ1A 4G2EA 2O85A 2YANA 3W8SA 3RDWA 2PUKC 3GMFA 1XBSA 2VUPA 2DIZA 5GAPD 5CAXA 3MDKA 4LA1A 3ZYWA 2IJYA 1U87A 3WT1A 1GTIA 2B1LA 2PVOC 5ECLB 3IAS2 2A2SA 1QGVA 4MF6A 4L5OA 1A0FA 4IKHA 1PKZA 2H19A 1HYUA 3BCIA 1DSBA 1N2AA 2GSSA 4K0GA 2VAFA 2H0HA 3CXGA 1TOFA 4BVXA 3HVSA 1XVQA 1Z5YE 5DDLA 2GLRA 2HZEB 1TRVA 3LXTA 4K1FA 4MF5A 1GNWA 4BWSA 2VCTA 5JWQB 4LMVA 2R4VA 3N5OA 1XOAA 4IGJA 3PR8A 2HLSA 1UN2A 2L6CA 1K0AA 1AIUA 8GSSA 3TRPA 3QAWA 5G1KA 2I1UA 1FVJA 5DQSA 5A4VA 2O7KA 3QR6A 5B6MA 5CP1A 3APSA 4K0NA 2H0IA 2WULA 1EV9A 1FB0A 1PQNA 2VL3A 5KEJA 1SJZA 2PPTA 2DBCA 1K3YA 5IIZA 4MZCA 4L0WA 3TKSE 3C71A 3UL3A 1AQXA 1YF0A 5JWRB 1Y25A 3EE2A 4EC0A 4I6XA 4HZ4A 5IMCA 3O76A 1JLVA 1K0BA 4GXZA 4OCFA 3ME8A 4DSSA 4POMA 2VM1A 4O32A 5J41A 4POLA 3P90A 1XWGA 4JEDA 3BCKA 4EF0A 4IELA 4KX4A 3R2QA 3RPPA 3KJYA 5G1LA 1XCCA 3CYNA 2L59A 2R37A 4MJCA 4L8EA 3GUSA 4G9HA 4EDYA 2ZNMA 3APQA 2R3XA 4F9ZA 5IOWA 3US3A 2H71A 5A4WA 3HZ8A 3KXOA 3AY8A 1EGRA 2X8HA 2VM2A 2WJUA 4KAEA 3GTUB 2E2GA 4OCEA 5ECRB 1JZOA 4E8HA 2MMAA 1F37A 1K0DA 1YEXA 4PQIA 2C3QA 2EC4A 1B4QA 1MD3A 3C73A 3TKSC 5AN1A 3ZITA 1W89A 1WJKA 5HFIA 5IPGA 5E4WA 1RQMA 3HKRA 1CQHA 3IOSA 1GSFA 4GQCA 5J5NA 5KN1A 3ZIJA 1FAAA 1TI3A 3CBUA 2WFCA 3FZ4A 2WS2A 1WMJA 3EVIA 4V1Ap 3W8JA 2GS3A 4DEJA 2VCQA 2XBIA 3L78A 1QUWA 1ERWA 2HYXA 1AQWA 2DC5A 4G19A 2K18A 2IIYA 3TGZA 3UJ1A 4IP6A 3ZREA 4MA9A 1X0RA 1TI1A 3GL5A 3GRXA 1J9BA 3ISOA 3KD0A 1X5DA 4ZB9A 2OKAA 2LEGA 2V6KA 2HRNA 1K0OA 1ST9A 1XW6A 1NM3A 1ML6A 3VI5A 2H01A 4XIHA 3RPNA 3M8NA 3LJRA 3G7YA 1ZL9A 2L5OA 1BX9A 4MLYA 1GSEA 1B8XA 1KNGA 2YZHA 4AJ7A 1T7PB 1X9MB 1SJIA 2LRNA 4YH2A 1F3BA 3QCPA 1LBKA 2PERA 3A3TA 1J0FA 1ZOFA 1R5AA 1RW1A 1SL1B 1OE7A 1TRUA 4P3YB 1MDIA 1DE1A 4DSRA 2H76A 2ZUPA 2QGVA 4V2NA 3L9VA 4EUYA 1T1VA 4ZB6A 1EV4A 3DGQA 2CZ2A 3HJMA 3CSJA 3ZVJD 1TRWA 2WDUA 1SYXA 2PU9C 1GSSA 3FZ5A 3LYPA 1TK5B 1VRSD 2C8UA 2R5GA 3WGXA 1T3BA 3HHVA 2VCVA 5LD0A 3VLNA 1XVWA 1WRYA 3LGCA 1TJDA 3HY2A 5IMVA 5D9XA 4XS1A 2HZFA 3QAVA 3H4KA 3LFLA 5FWGA 4DSQA 1HD2A 4ML1A 2AJQB 3APOA 3E9JB 4PNFA 1JLWA 4K8MA 1Z9HA 1OAZA 2GT6A 2C3TA 1PSQA 4HUAA 1XXUA 4GQFA 4MZBA 3GKXA 1VF3A 3CSIA 2DJ0A 3IRAA 2LNSA 4WETA 2ON7A 1EOHA 2KP2A 1WOUA 3UBLA 3VPQA 1XW9A 4MDCA 2C0GA 1XPVA 1XWBA 2VLUA 5GSSA 1GTBA 3V1WA 2GQLA 2YV7A 3KZQA 4XS4A 3RAZA 1GL8A 2HNLA 4NHZA 1MDJA 3QDNA 3ZIVA 3KP9A 3KTLA 5ECHB 2HE3A 4ECBA 3DWVA 1SJ6A 1BEDA 4FYUA 5IMDA 2YV9A 1XOBA 1U6TA 2R2JA 2X8GA 3DVXA 3ME7A 2J23A 4YAPA 3FYGA 1SL0B 1C72A 4HQSA 4N0VA 2IFQA 2VD1A 1VGLA 1O8XA 4KB3A 5F06A 5H5SA 2JACA 2AV4A 1SKWB 22GSA 2XPDA 4PNGA 3VWXA 2OE1A 1X9WB 3PINA 5DAKB 2P31A 3TJGA 1ZMAA 4KCAA 1A8YA 2JSZA 2B1KA 4WF4A 3VPTA 4NV2A 3D21A 2I9HA 4TW5A 1YKAA 5FHIA 5CRHA 2VO4A 4IVFA 5IMZA 4TOPA 1T4YA 3QFBC 5F07A 4MMMA 3FKFA 4JR6A 5EVOA 3OR5A 2HSHA 4ZL9A 2Z9SA 1XWAA 1G7OA 3FHKA 3GL3A 2GSTA 11GSA 4HS1A 4K7OA 3P8WA 1PN9A 5IO0A 3LXZA 1TDIA 4X43A 3IR4A 3RBTA 4XCSA 3HD5A 5FT3A 3UMAA 1B9YC 2C0EA 14GSA 4IP1A 2VLTA 3FR9A 2FY6A 5KN3A 4DVCA 1ZCPA 3F4TA 4EKZA 1O81A 1BQ7A 5DALB 4ECIA 1I9DA 4OO4A 2CAQA 2ES7A 2I4AA 1TTZA 3CTFA 1PGTA 3FR6A 1EWXA 3Q19A 3F4SA 3QPMA 3IV4A 1BAYA 2HFDA 2B7JA 2VIMA 2CAIA 4O5RA 2CVKA 1OKTA 1K0NA 16GSA 5D93A 2VL2A 1OVNA 3LYKA 2X8CA 3NIVA 1QFNA 5EL8A 4K2DA 3KMOA 4J57E 1A23A 4ISDA 3GHAA 12GSA 2LQOA 3CMIA 2FCHA 4QQ7A 2OBIA 19GSA 2G2QA 3IBHA 4Q5FA 5J4UA 4JBBA 2C0DA 4DSSB 4LLRA 2M72A 1Z7PA 1BYEA 2PMTA 2LTKA 1M0UA 4ZL8A 3LSZA 3F0IA 1BG5A 3GNJA 3VFIA 4CHSA 2WB9A 1M9AA 5C04A 5GZZB 1PRXA 3BJ5A 3Q18A 4X1UA 4XRDA 2TRCP 3ZFBA 1NHYA 3KH9A 2DJ3A 1JZWA 4MABA 2E7PA 4TR1B 1MD4A 3PH9A 1ERTA 3G9BA 3EMPA 7GSSA 4E8EA 1H4OA 4ECCA 2IWTA 1FVKA 1LU4A 3IC4A 1TP9A 1EOGA 1YQ1A 5ECPB 1M99A 1OC9A 4EE0A 1YY7A 2PVQA 1O8WA 4HEA2 5ECNB 4Q5RA 3ZLPA 4WR4A 3HVXA 3M9KA 2H75A 2CQ9A 3C1RA 1PKWA 3K8NA 2P5RA 3TOUA 1HNCA 2B3SA 3HXSA 2N5BA 2KP1A 2NTOA 4PXOA 3F63A 4MZWA 3D4TA 3H8QA 1A0RP 4HI7A 2C4JA 1MTCA 2AHEA 1E6BA 3QFAC 3CTGA 2YOIA 1H75A 2C1YA 3EU3A 1X5CA 3TKQA 4IQAA 4POKA 1DUGA 2IPAA 2V41A 3SWLA 2GSRA 5KN0A 1E2YA 4EO3A 2WCIA 3E3EA 3WYWA 2IMKA 5AGYA 4YQMA 5CYYA 1FO5A 1F3AA 4JE1A 3KP8A 4GSSA 3J7Yk 3D0ZA 2HT9A 1THOA 1AQVA 2HZEA 2FA8A 4MCUA 1QMVA 2JZTA 1GWCA 1WIKA 2N5AA 2VL9A 4ZILA 1G6WA 5A4UA 1N8JA 3EINA 1JZRA 4J2FA 4H86A 2BMXA 4IS0A 3DVWA 2RUEA 2YWMA 2OBKA 2H0GA 2V1MA 2IL3A 2YWIA 3DYRA 2IMDA 2IMFA 3JCML 2B7KA 2PGTA 2MMOA 1U3IA 4F2IA 2LSTA 3HYPA 1M2DA 1S3DA 3A2XA 2GGTA 1NW2A 1GNEA 2YP6A 1A2MA 1G6YA 4CW9A 4KUNA 5IM9A 2PN8A 3W6GA 1A8LA 4I5QA 2C80A 4K6XA 3H79A 3L0HA 3CRTA 2AYTA 3LQ7A 3FW2A 5L71A 2I3YA 3C8EA 5B7CA 1V2AA 1AUCA 4WEYA 2MBSA 3I69A 3HA9A 2L4QA 4I8BA 3ZL5A 3Q6OA 2YCDA 5ECQB 2ON5A 1SK2A 3GV1A 2H6XA 5IQYA 4NHWA 1USBA 2A4VA 4K7IA 4TXVA 1YJ6A 3UARA 3VURA 2EIRA 4HOJA 3IK7A 2GQMA 3QD9A 1TXXA 5J3RA 2PBJA 5ELGA 4PUAA 4HU7A 1KTEA 1AW9A 5CRDA 1XIYA 2GTUA 2H72A 1EGOA 5HFKA 5IO2A 3G7IA 3GSTA 4NAXA 3GURA 3VWUA 3UVHA 1I5GA 1GSDA 3NOFA 3D22A 4F0BA 2CX3A 2VOCA 3LWAA 5ECOB 5CO3A 1K0MA 2I81A 3GKNA 4GTUA 2JSYA 1FW1A 4CDOA 4XS4B 20GSA 3GX8A 1Z6NA 4RQXA 3RHCA 2MBTA 4Z7XA 2FWHA 13GSA 2P0GA 1BJXA 4KSMA 2H1AA 2LJRA 3ZMLA 1O73A 3EU4A 5IPHA 2GT5A 2H74A 3HZ4A 5IMFA 3VK9A 4HJMA 1AC1A 5D9VA 5DJLA 4RI7A 4IQ1A 4YQUA 4D73A 5IOXA 6GSUA 3UIWA 4MK3A 2FHEA 3UOMA 1TW9A 2FD3A 4HZ2A 1ERUA 1K3OA 6GSXA 2DLXA 2H73A 4OWYA 3EC3A 3U5RE 5F0GA 1SK0A 3ZFLA 4ULXA 1ZYQB 3TKPA 4XS6A 2DMLA 1AXDA 4GSNA 3ZVJA 4POBA 4TXOB 4MH2A 5ECIB 5A5KA 3TJBA 1OYJA 1VF4A 2OE0A 2VLVA 3DRNA 5EY6A 4HU9A 2IN3A 1SKSB 5IMAA 4Q5QA 2DSAA 3A2VA 3FY7A 4NV5A 1KBNA 2F8AA 2LNTA 2V2GA 3TB2A 9GSSA 4ZBDA 2MYGA 2VD0A 4MPGA 3I6AA 4IBPA 5AISA 2HI7A 1S3AA 4AF2A 2HSYA 3UVTA 2H66A 2L5LA 4V1Ag 2CT6A 2M46A 5HFGA 4F03A 3GH6A 1GSUA 5HR3A 3GFKA 3TJJA 2MMZA 4BPYA 3FRCA 3IAM2 4I97A 3TDGA 4TN8A 4GLTA 5DJMA 2JZRA 3CSHA 2GZYA 1M9BA 1QQ2A 2VCWA 3QOUA 4MH3A 1ZGNA 1ACVA 5DVBA 1XWCA 1RK4A 2FA4A 3BBYA 3GYKA 2CA8A 2FLSA 1GUHA 4N0ZA 3HVVA 1G0TA 3L9SA 2K9FA 4FH8A 4L0UA 1UA5A 3IPZA 2WZ9A 3IA1A 5HR1A 2BTOT 5CRWA 6GSYA 1JHBA 2VCZA 1OC3A 3HJOA 4ZXGA 3IHQA 4YAVA 1ZZYA 3DKSA 1TK0B 2DIYA 2OJLA 4K7NA 2DMMA 2H1BA 4PQHA 3UEMA 2JADA 4LMWA 3MSZA 3O6TA 2L57A 5F05A 1V9WA 3EMXA 1B48A 3KH7A 2RIIA 5B8BA 1AAZA 4L5LA 2FGXA 4IJIA 1JFUA 1MDKA 1T4ZA 2RUFA 2O87A 2LKUA 4LL4B 3UBKA 2QC7A 2XPEA 1Z7RA 2GZZA 1V57A 3ERGA 1G7EA 2KLXA 1O7UA 4JR4A 4ID0A 1GTAA 2WRTA 1S3CA 3DEXA 5G5FA 2OADA 3DD3A 5ID2A 2TRXA 1XFLA 4NXIA 4IW9A 2CX4A 1A24A 4TVEA 5COHA 5E59A 3WT2A 3F6DA 5HQPA 1VF1A 3FR3A 2NPBA 2GVPA 1TKDB 5LCZA 1KEBA 2DJ2A 3SBCA 5G2ZA 5D8IA 4KDUA 1O85A 3WGEA 5JWOB 1X9SB 4GSTA 4OMVA 2H1DA 5DAKA 4WKWA 3S9FA 4GF0A 2RM5A 2WGRA 3ERFA 2DJJA 2CVBA 1B4PA 3H1NA 4KGIA 4KE3A 1EP7A 4NMUA 3KCMA 4OO5A 3F6FA 1FB6A 1SU9A 5CNWA 3PGTA 1Z6MA 1K0CA 3ED3A 2H70A 4ECJA 2F3MA 3KTBA 3TJFA 4PGTA 4OFNA 2LUSA 3WGDA 1SKRB 4PURA 4RUVA 5JCGA 2L6DA 6GSWA 4F82A 2E2MA 1R4WA 3EYTA 5GSTA 2ZCTA 2KUCA 2YJ7A 1NHOA 4XRAA 2DJKA 5INYA 2B5EA 1PX7A 1QK8A 3F9UA 5DALA 4YQVA 3M3MA 1Z3EA 5HR2A 3FK8A 4OFMA 3QAGA 4MPFA 2LS5A 3LG6A 4I2UA 2NVLA 3FZAA 1OKDA 1PMTA 4PX1A 1R7HA 1GLPA 1A2LA 5H5QA 4TKYA 3L4NA 3TCOA 2A2RA 4WF5A 3A2WA 1YKCA 3GN3A 5C00A 1Q98A 3RHBA 3CRUA 3GH9A 2ALBA 3VWWA 2YNXA 3VWVA 1FG4A 1YDKA 2O89A 1U3AA 4FYCA 1FOVA 2D2ZA 1XW5A 4KH7A 4WXTA 2F8FA 5LNKe 1M2AA 4GWRA 5D73A 2B5YA 3D5JA 4O92A 4V2MA 2EIQA 4IHUA 4BVYA 4N10A 4NPBA 4ZIJA 1Q4JA 1TK8B 1MEKA 4QL7A 3TOTA 4TR1A 3ERWA 3F8UA 3DIEA 5AIXA 1F9MA 1THXA 2LRCA 2RM6A 2OA7A 1U88A 4HJ2A 4XHMA 1PL2A 1OE8A 4FIWA 1PX6A 4JRRA 4IN0A 5ECMB 3LEFA 6GSTA 1DE2A 6GSSA 3HCZA 2H6ZA 1SD9A 1YZXA 4LL1B 2F51A 2OACA 1T8EB 1M7TA 5DCGA 4KNDA 2MZCA 4G10A 5J9BA 2EIOA 2H1GA 4HDEA 3ZTLA 2JL4A 1UC7A 1GUKA 1YEPA 3HDCA 3N9JA 5CRGA 2AAWA 2AB6A 1TRSA 1YF1A 2HXKA 4KDYA 4D73B 2JZSA 2YWOA 1SK1A 4KW6A 3DMLA 5ECSA 3J7Yb 2KHPA 2XBQA 17GSA 5DQYA 4F0CA 2XC2A 1J08A 3U6VA 2QSIA 4TR3A 4IJ3A 1LJRA 5ECKB 1ERVA 4ZL7A 1ZYEA 2C0FA 2YPMA 2K8SA 4Q5NA 2L4CA 2CZ3A 2YWNA 4WBJA 2K6VA 1WP0A 4BWQA 5DCHA 4JZQA 4KCEA 2YN1A 4AGSA 4ML6A 1R5PA 4HQZA 2GDRA 2YJHA 3NZNA 3GTUA 3IXRA 2G0FA 1V98A 3TUEA 5B6NA 3HJPA 3IK9A 1GP1A 1GSQA 2GZPA 5ENUA 3LORA 4ILFA 3WD6A 1V40A 18GSA 4TR0A 5CREA 5G5EA 2J9HA 1IYIA 4PQ1A 3O3TA 2FUG2 1ON4A 4MP4A 4KA0A 1EEMA 2K8VA 1T00A 1NSWA 1HNBA 4ZBBA 3C7MA 1GRXA 4V2LA 2IFQB 2LQQA 5B8AA 5EPFA 2CVDA 4J56E 3BD2A 4XTSA 3IDVA 5G30A 2IMEA 1F6MC 4GRFA 3TKSA 3H93A 1F2EA 4O7HA 3M1GA 1IYHA 5G31A 4TR4A 2E0QA 1CQGA 2M80A 3MWHA 2FWEA 1XWKA 1UVZA 4N30A 5F8BA 5JCWA 1URMA 4BL7A 5D9TA 2TIRA 2H30A 3E0UA 1QXHA 1GTUA 2B6MA 1GSYA 5JCUA 1HNAA 3I9V2 4ACSA 3KEBA 4PUFC 4MJAA 5J9CA 3C1SA 1WPIA 3BOAA 3A5WA 1EP8A 2OE3A 5D96A 3FEUA 3TJKA 1PA3A 1A2JA 5ABRA 1JZDA 3TRQA 2VCXA 2VL2C 1W4VA 5DBQA 2X99A 4TRXA 4QL9A 3ZRDA 3TKRA 1GUMA 1XZOA 1EEJA 4NWYA 5KN2A 2NDOA 2KOKA 4I2TA 4AJ6A 3GIXA 3L9UA 2GQKA 4MF7A 2RLIA 4EVMA 2H8LA 4BA7A 3KGKA 2REMA 3UAPA 2MMNA 3GSSA 3VI7A 3F3RA 3M0FA 3GX0A 1VF2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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